The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
137
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structure length |
137
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Chain Sequence |
GFKQDIATIRGDLRTYAQDIFLAFLNKYPDERRYFKNYVGKSDQELKSMAKFGDHTEKVFNLMMEVADRATDCVPLASDANTLVQEKQHSSLTTGNFEKLFVALVEYMRASGQSFDSQSWDRFGKNLVSALSSAGMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mutation of Methionine-86 in Dehaloperoxidase-hemoglobin: Effects of the Asp-His-Fe Triad in a 3/3 Globin
rcsb |
| molecule keywords |
Dehaloperoxidase A
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| molecule tags |
Oxidoreductase
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| source organism |
Amphitrite ornata
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| total genus |
55
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| structure length |
137
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| sequence length |
137
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-05-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3DHR B; 1QSI A; 1EW6 A; 1BZ6 A; 1MYI A; 1SDK B; 2SPN A; 4JAC A; 3AT6 B; 3WCT A; 2QFN A; 2NX0 A; 2AUO A; 3S1I A; 5AB8 A; 1CQ2 A; 1NWI A; 2C0K A; 4U8U C; 1DWR A; 3KUO A; 1MOH A; 1YGD A; 3QJD B; 1BZ1 B; 1YOI A; 3WCV C; 3ARK A; 4O35 A; 2ZSY A; 2D2M B; 5B84 A; 3GLN A; 3K9Z A; 4ROM B; 3VRF A; 4M4B A; 1XY0 A; 5JDO D; 1FN3 A; 1YVQ B; 1LHT A; 3WCU A; 1DUO A; 4HHB A; 1HGB B; 1UFP A; 1JP8 A; 1A6K A; 1MGN A; 2GRF A; 3AQ6 A; 1N9I A; 1N9X A; 3R5I B; 4N7N B; 2CMM A; 1NGK A; 2AV3 A; 3DHR A; 1YGF A; 1DWT A; 4G51 B; 3AT6 A; 1WVP A; 1HGA B; 5HLX A; 2VLZ A; 1VXF A; 2GDM A; 3A2G A; 2D2N C; 1O1K A; 2DC3 A; 3QJE A; 2DN2 A; 1GCV A; 1UVY A; 2O5O X; 4ZVA A; 3QJD A; 5C6Y A; 2ZFO A; 1BZ1 A; 2HCO B; 1CO8 A; 4B3W A; 1NAZ A; 1RTX A; 1YEU B; 2NSR A; 4YU3 B; 1X9F B; 1MOC A; 1Y0A A; 1Z8U B; 1NZ2 A; 3HRW A; 1MOD A; 2OIF A; 1Y01 B; 1S0H B; 2OHB A; 3BJ3 B; 4UIQ A; 2W72 B; 6HBW B; 3WFW A; 4F6D A; 3ECX A; 2R4W A; 2ZLW B; 4NI1 B; 1HGB A; 1CMY A; 4DC8 A; 3R5I A; 3VRE A; 3PI8 B; 4IT8 A; 2GNW A; 4FWX A; 1Q1F A; 2VM0 A; 3LR9 A; 3EOK B; 2V1I A; 4ESA B; 3G4Q A; 4NZI A; 2LH7 A; 1LH7 A; 1Y2Z A; 1DXD A; 3WTG A; 1DXV A; 5M3S A; 1V5H A; 5ILR A; 1GVH A; 2GRH A; 1KD2 B; 2FRI X; 1J40 A; 1YOH A; 3ZOL A; 3G53 A; 2HBC B; 4O1T A; 1B0B A; 1D8U A; 1A01 B; 2GLN A; 3BCQ A; 2QLS A; 3S1J A; 1THB B; 1YEU A; 4YU3 A; 1V75 A; 1MWD A; 3UHQ A; 2E2Y A; 1Y0T B; 2W72 A; 1S61 A; 3E5O A; 1BZP A; 2NRL A; 3SDH A; 3QM8 A; 1Y5F B; 3WCW A; 1ECN A; 3ONZ A; 4L7Y B; 4F6I A; 1A3N A; 1Y8I A; 3FS4 B; 3HEO A; 1MWC A; 1YE0 B; 2ZS1 C; 1YHU B; 1LUE A; 2R50 A; 4X0L B; 3UHV A; 4MQJ A; 1NXF A; 1MKO B; 3ZJR A; 1MTI A; 1FCS A; 3ZJO A; 2MGM A; 1KFR A; 1DXT A; 1H97 A; 1OR4 A; 1OUU B; 2MYB A; 1LFL B; 4N8T B; 4MQG B; 4FH7 A; 3D17 B; 3NL7 B; 1XZ4 A; 2GTL B; 4GZG A; 1THB A; 4WJG A; 3BJ1 A; 2D5Z B; 4PQC A; 5JDO F; 1Y0D B; 2VEB A; 1Y46 B; 1Y0T A; 3QJC A; 1Y7Z B; 4C44 A; 2PGH B; 1DTI A; 2H35 B; 1COH B; 2DN1 B; 3PT8 B; 1YHU A; 2ZWJ A; 1UC3 A; 2EKT A; 1C40 B; 105M A; 1Y45 A; 1YIH B; 2DN3 B; 1TU9 A; 1W92 A; 1MKO A; 4TWU A; 1MYH A; 3OO4 B; 1CG5 A; 1Y8H B; 3W4U A; 5KKK A; 1J3Z B; 3ZJP A; 3BA2 A; 1Y7G B; 1DKE B; 2Z8A A; 2EKU A; 3ZJS A; 1MYT A; 2QU0 A; 1Y8K A; 1BZR A; 2OLP A; 3QQR A; 2AUR A; 2AUQ A; 3UHG A; 1XQ5 B; 1MTJ A; 1Y0D A; 1CIK A; 2VYW A; 1Y46 A; 1OFJ A; 1Y4V B; 1YH9 B; 4H2L A; 3UHZ A; 3ZJI A; 2H8D A; 4KJT A; 1SI4 B; 1VXE A; 3A0G A; 1C7C B; 1ECA A; 1V9Q A; 3AT5 B; 4N7O B; 5MBN A; 4N7P B; 2HZ1 A; 1NZ4 A; 1NIH A; 1LFV B; 3UHT A; 2D2N D; 4H07 A; 1J3Z A; 2HHE A; 3ED9 A; 3GKV A; 1DKE A; 2ZT3 A; 3HXN B; 3ZJL A; 3G46 A; 1VHB A; 3QM5 A; 1MLL A; 2MB5 A; 3LQD B; 2FAM A; 1YDZ B; 2MGE A; 1MNI A; 1JWN A; 1IT2 A; 2MYE A; 5JDO C; 3SDN A; 1M6C A; 1CG8 B; 1MYZ A; 1HDA A; 3GDJ B; 1Y4V A; 4F6B A; 5CHQ A; 4C0N A; 2BMM A; 4KN3 A; 3PIA A; 1SI4 A; 1LHS A; 1BZZ B; 3GOU A; 2WTG A; 3AT5 A; 2MGB A; 3UHW A; 1JZM A; 2XKH A; 2MGJ A; 5D5R A; 1DXU A; 1O1I B; 4AVE A; 2MGF A; 4PNJ A; 1LH5 A; 1GZX B; 1O1J B; 4AVD A; 2VHB A; 2M6Z B; 3MN0 A; 1XZV A; 5ILE A; 2HZ3 A; 1LFY A; 3D7O B; 2VLY A; 1RQA A; 1LFZ A; 1O1P B; 3GDJ A; 1IBE A; 1QXD A; 2H8F B; 2G0Z A; 1GBV A; 5CN9 A; 3QM9 A; 3QZZ A; 2MYD A; 3A59 A; 2Z6T A; 1MNK A; 1BZZ A; 3MOU A; 2ZS1 D; 4OOD A; 3PI9 A; 1Y22 B; 2D2M C; 4O4T A; 1SPE A; 2QSS B; 1GDJ A; 1LFT A; 1VXH A; 1GDI A; 1O1I A; 4MU5 A; 1VWT B; 4M4A B; 3UHB A; 1S69 A; 1NEJ A; 2GKN A; 3EDB A; 1MBO A; 3FH9 B; 2BK9 A; 3DUT B; 1HDS B; 5IKS A; 110M A; 1QSH B; 1MCY A; 3A5B A; 1YFF B; 1B86 A; 2ZLU B; 2FAL A; 4MQC B; 2G14 A; 3KMF C; 1J41 A; 1HV4 B; 1O1N A; 2BWH A; 3D1K A; 3TM9 A; 3D7O A; 1YZI B; 1AZI A; 2QSP A; 1JP6 A; 1A4F B; 2LH3 A; 1XZ2 B; 1FHJ B; 1XYE B; 2RI4 A; 1HAC B; 2WTH A; 1PBX A; 2O5M X; 2YRS B; 1HGC A; 2G3H A; 1G9V A; 1QSI B; 1MOB A; 1IWH B; 2HBG A; 1ECO A; 5E83 A; 1FDH A; 6HBI A; 1X9F C; 2G10 A; 2HBF A; 3WCT B; 1G09 B; 3ASE A; 3GQG A; 3KUN A; 1I3E A; 2QSS A; 1A6N A; 2GRZ A; 3DHT A; 4NK1 A; 3WHM A; 3RJN B; 1VWT A; 3U3E A; 1RSE A; 5HU6 A; 3MYM A; 1Y7C A; 3CIU A; 1FSX A; 4DWT A; 104M A; 1YGD B; 3DUT A; 3RGK A; 1CH4 A; 4WCH D; 4YU4 A; 2VRY A; 2ZFB A; 1EBC A; 2BNL A; 2O5T X; 1HV4 A; 4M4B B; 1XY0 B; 3UGY A; 3WFX A; 1YZI A; 4KMW A; 3WCU B; 1MLM A; 1A4F A; 1J52 A; 1DTM A; 5F0B A; 2GKM A; 1XYE A; 5HY8 A; 3MYN A; 3OO5 B; 1V07 A; 3OK5 A; 1IRD A; 1A3O B; 1JF4 A; 1IWH A; 1M9P A; 1YGF B; 1ECD A; 3BOM B; 1G09 A; 3AQ9 A; 1J7Y A; 1O1K B; 1FLP A; 1DO4 A; 3QJE B; 2DN2 B; 1GCV B; 2BLJ M; 2MHB B; 2ZFO B; 2ZS0 A; 3UHS A; 1ABW A; 1XZ7 B; 1IOP A; 2ZT0 A; 3QM6 A; 4MBN A; 1Y0A B; 1LH2 A; 2G0R A; 5JOM A; 1O1O A; 4FWY A; 3HRW B; 3IC2 B; 1K0Y A; 1J7W B; 1BVC A; 1LTW A; 2O5Q X; 3WCT D; 2RAO A; 1V4U A; 1YIE A; 1CMY B; 2W6W A; 3VRE B; 3GYS A; 3UHK A; 4F6F A; 3OO5 A; 1A3O A; 4XDI A; 1DO7 A; 1V4W A; 2GTL C; 1YMA A; 1Y2Z B; 3WTG B; 3BOM A; 1DXV B; 1X3K A; 1HLM A; 1J40 B; 1Y09 A; 3H57 A; 3WCU D; 1A9W A; 3QJB A; 1JL7 A; 1HBA A; 1JEB B; 2MHB A; 3BCQ B; 1J3Y B; 1YEO A; 1CH9 A; 5CN5 A; 2QLS B; 1XZ7 A; 3MVC A; 1DM1 A; 1V75 B; 1LJW A; 1MWB A; 1MZ0 A; 1A6G A; 3IC2 A; 1J7W A; 2MYA A; 4MQI B; 3MJP B; 1HAB A; 2W6Y A; 4DWU A; 4MXL A; 2XYK A; 4ROL A; 1JZL A; 1YCA A; 3WR1 B; 3M39 A; 5SW7 B; 1RVW A; 3WCW B; 3ONZ B; 1Y4F B; 1WMU A; 1A3N B; 4QAU A; 1Y8I B; 1URY A; 106M A; 2AA1 A; 4PQ6 A; 2W31 A; 3PI4 A; 2BLI A; 2D2M D; 1KR7 A; 1ABS A; 3HEN A; 4MQJ B; 1QXE A; 5EV5 A; 3MKB B; 5KDQ A; 1DXT B; 103M A; 1JEB A; 4BJA A; 1MNO A; 1J3Y A; 1G0A B; 1XZ4 B; 3B75 A; 1U7R A; 1MLK A; 2ZT2 A; 3BJ1 B; 1G0B B; 2EVK A; 4MQI A; 3QJC B; 3WCP A; 1CP5 A; 3MJP A; 2ZLX A; 1YMC A; 1LH3 A; 2Z85 A; 5CN4 A; 2FRK X; 3GQP A; 3A5G A; 3WR1 A; 5SW7 A; 2ZSQ A; 1Y0C B; 1Y4F A; 1J3F A; 3SZK A; 2Z6S A; 1Y4B A; 1O1M A; 2D60 B; 1BIJ A; 3AG0 A; 1MBS A; 2D5X A; 3E55 A; 4U8U B; 3EDA A; 1X9F D; 4F68 A; 4MXK A; 1AJ9 A; 1Y45 B; 3A9M A; 1UVX A; 3WCV B; 1CG5 B; 3O89 A; 3W4U B; 3MKB A; 3PT7 A; 4NXC A; 1ABY A; 3V2Z A; 1G0A A; 3E4N A; 2QRW A; 2QU0 B; 2V1E A; 1Y8K B; 1HBH B; 1LH1 A; 2IN4 A; 1G0B A; 1YG5 A; 1NS6 A; 1EMY A; 1JDO A; 1OUT A; 1DO3 A; 2FRF A; 4H2L B; 1YHE A; 3ZH0 A; 3E5I A; 2ZSR A; 3NMM A; 2H8D B; 1BAB A; 1CH1 A; 1HSY A; 1BJE A; 3S65 A; 3NML A; 1OR6 A; 1Y0C A; 1YEN B; 2JHO A; 1A0Z A; 1VXC A; 2O5L X; 3A0G B; 2D60 A; 4IRO A; 4MQH A; 3HEP A; 1JZK A; 4U8U A; 1Y4G A; 1NWN A; 1MLO A; 1YEQ A; 3S66 B; 4ODC B; 1NIH B; 3WCV A; 1O1L A; 1X46 A; 3ARL A; 2HHE B; 3ZOM A; 3GKV B; 1YVT A; 4NI0 A; 1RQ3 A; 1HBH A; 3OZU A; 4SDH A; 1Y5K B; 2ZT4 A; 3ODQ A; 1LA6 A; 1AJH A; 7HBI A; 1G08 A; 1YHU D; 1IDR A; 1GDL A; 2ZSP A; 2ZLV A; 1URV A; 1HDA B; 1R1X B; 5CHR A; 2WY4 A; 1LFQ A; 4FH6 A; 3HF4 A; 1QI8 A; 1IT3 A; 3PIA B; 1YEN A; 3ZJN A; 5EU2 A; 1MYJ A; 2D2N A; 3GOU B; 1DLW A; 1VXB A; 2GTL D; 5EYJ A; 1CH7 A; 2R80 A; 1MLR A; 2B7H A; 1NZ5 A; 3G4V A; 3HYU B; 1CP0 A; 2QMB A; 3PI3 A; 3WFU A; 5EYS A; 3S66 A; 4ODC A; 1DXU B; 1VXG A; 1GCW A; 4VHB A; 4G1B A; 1MLQ A; 4MQK A; 108M A; 107M A; 1NPF A; 1Y5K A; 1XZV B; 2MBW A; 2LH2 A; 1LFY B; 1CBL A; 3CY5 A; 1RQA B; 1NQP B; 3WCT C; 1LFZ B; 3UHI A; 1R1X A; 1IBE B; 1QXD B; 1UIW B; 1GBV B; 5EUI A; 1OBM A; 3UHR A; 3A59 B; 2VEE A; 3UHN A; 1Y0W A; 1Y8W B; 1T1N A; 3HHB A; 1MLG A; 3PI9 B; 4HRR A; 3HYU A; 1RQ4 B; 2G12 A; 4LPI A; 4JYQ A; 1LFT B; 1CQX A; 3G4Y A; 3WCU C; 1NEJ B; 2R4X A; 1VRE A; 1SPG B; 2R4Z A; 3UI0 A; 2MGD A; 1B86 B; 1EWA A; 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1GBU B; 3A5A A; 3GYS B; 1ASH A; 1Y83 B; 1RPS B; 1YE2 B; 1YHR A; 3ORD A; 1HBS A; 1HDB A; 1HBB A; 1A00 A; 1V4W B; 1L2K A; 1SHR A; 2AV0 A; 1Y09 B; 1MBI A; 5E6E A; 3QJB B; 1HBA B; 5AZR A; 3QZX A; 2NSS A; 3VRG A; 1YEO B; 1J7S A; 1MDN A; 1HBI A; 1N9F A; 1XXT B; 4TWV A; 4NS2 A; 1LJW B; 1Y31 B; 1IRC A; 1YHU C; 3K3U A; 4NK2 A; 1JP9 A; 3D1A A; 1HAB B; 112M A; 1UFJ A; 4H0B A; 5F2A A; 4ROL B; 1MBA A; 3D4X A; 1RVW B; 1GBU A; 109M A; 1RPS A; 1WMU B; 1Y83 A; 1YE2 A; 5JGG A; 3NG6 A; 1ITH A; 1A9W E; 1Y4P A; 2AA1 B; 3UHU A; 1YEV A; 2ZS0 D; 1MBD A; 2DXM B; 5AZQ A; 1MOA A; 1S5X A; 1QXE B; 4FC3 A; 2HHB A; 3OVU C; 5KDQ B; 2W6V A; 3ZHW A; 3EU1 B; 111M A; 1JPB A; 5CND A; 1XZU B; 1SDK A; 1S56 A; 3M3B A; 3VAU A; 3QQQ A; 4B4Y A; 3B75 B; 1XXT A; 3VHB A; 102M A; 3IXF A; 3UHD A; 5EOH A; 1Y31 A; 3UH6 A; 3WCP B; 2ZLX B; 3LB4 A; 5MBA A; 1SDL B; 3GQP B; 4UUR A; 5HBI A; 3R0G A; 2D2M A; 3SZK B; 4ROM A; 1Y4B B; 1O1M B; 1OFK A; 1BIJ B; 2ZFO D; 2ZST A; 1YVQ A; 4ILZ A; 2D5X B; 1GDK A; 4F6G A; 2DXM A; 2MYC A; 1AJ9 B; 2G0S A; 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