The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
151
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structure length |
151
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Chain Sequence |
TTLTNPQKAAIRSSWSKFMDNGVSNGQGFYMDLFKAHPETLTPFKSLFGGLTLAQLQDNPKMKAQSLVFCNGMSSFVDHLDDNDMLVVLIQKMAKLHNNRGIRASDLRTAYDILIHYMEDHNHMVGGAKDAWEVFVGFICKTLGDYMKELS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
pH-dependence crystallographic studies of the oxygen carrier hemoglobin II from Lucina pectinata
rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin II
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| total genus |
63
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| structure length |
151
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| sequence length |
151
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-11-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4KMW A; 3PI1 A; 4HSX A; 1O1N B; 4TYX A; 1MLG A; 2HBG A; 1A6G A; 1MWB A; 1YIE B; 1Y5K A; 3GQP A; 1JP6 A; 1URV A; 2QSP B; 7HBI A; 3VRE B; 1MLS A; 3WCW D; 1XY0 A; 2GTL A; 2R80 B; 1Y8H A; 3UHW A; 1MWC A; 2V1E A; 3ECL A; 2ZLW B; 3WCU C; 2VEE A; 1Z8U B; 1ECA A; 4NXC A; 1MTK A; 1CBL A; 3AQ9 A; 1CBM A; 1X9F B; 4NI1 B; 1GBV A; 1HGB A; 1UFJ A; 1NWN A; 1HV4 B; 1Y4F A; 5EET A; 2HBE A; 1LFZ A; 1BBB A; 1Y22 A; 1QI8 A; 4YU4 A; 2W72 C; 1KR7 A; 1LFL B; 1Y4P A; 3A59 B; 3WCP B; 1T1N A; 3WHM A; 5CMV A; 1LH6 A; 5ILP A; 1Y2Z B; 1MBO A; 2BWH A; 5JDO E; 1FSX A; 4L7Y A; 1CLS A; 2R50 A; 1BZ1 B; 1KD2 B; 3UHZ A; 1YZI A; 2V1F A; 4PQB A; 3K8B B; 1QSH B; 1JP9 A; 1UIW B; 1XZ4 B; 2ZFB B; 3ZJO A; 1K1K A; 1Y09 A; 2W72 A; 5CHQ A; 1BJE A; 1NGK A; 1R1Y B; 1O1M B; 2ZSZ A; 1JY7 A; 1EWA A; 4PQC A; 1FHJ B; 102M A; 3G46 A; 2GTL D; 2C0K A; 2ZLT A; 2AUQ A; 2HBC B; 1BZ6 A; 2G0R A; 1YVQ A; 3SDN A; 1FCS A; 1DWT A; 2W6W A; 2HBD B; 4X0L B; 1Y83 A; 5C6E A; 1EBC A; 3UHB A; 1Y8W B; 4M4B A; 4MQG A; 1HDA A; 3ECX A; 1IRC A; 2EF2 A; 3QQR A; 2FAL A; 1ECN A; 5EU2 A; 3UBC A; 2ZSN A; 1CH5 A; 1NEJ A; 1YGF B; 3WI8 A; 5D5R A; 1MLO A; 3NMM A; 2ZS0 C; 1BZZ B; 1EW6 A; 2FRI X; 4U8U B; 1YOI A; 2QU0 B; 1HDS A; 5EV5 A; 2ZLX A; 3WCV C; 5B84 A; 1Y7Z A; 3UH5 A; 1A01 B; 1MNO A; 1XXT A; 1BZP A; 2W31 A; 1X3K A; 1FDH A; 1WMU B; 1CMY A; 1G08 B; 1MLU A; 1SDL B; 1WVP A; 5E6E B; 1XZV A; 1BIJ A; 3ORD A; 1MTI A; 3PT7 B; 2W6X A; 3AQ7 A; 1LJW A; 2VLY A; 1GCW B; 1O1I B; 1JZL A; 3WFW A; 3QZZ A; 2FRJ X; 1GZX A; 1Y5K B; 1YEU A; 1ITH A; 4AVE A; 3UH6 A; 5ILR A; 3D1K A; 3UH3 A; 5CN9 A; 1YEV A; 3ZJJ A; 1JPB A; 2DHB A; 1O1P A; 1MNK A; 1NS9 A; 4AVD A; 3DUT B; 2MHB A; 1HAB B; 1YHU B; 2QLS A; 2RI4 B; 3IC2 B; 1LFY A; 1L2K A; 1J7Y B; 1HGC A; 1MYF A; 3E4N A; 4LPI A; 1MZ0 A; 1GBV B; 1DLW A; 1TU9 A; 2GRZ A; 1UVY A; 1Y4F B; 4QAU A; 4MQK A; 2HBE B; 1BBB B; 1LFZ B; 1N9I A; 2LH1 A; 1JL6 A; 3LR7 A; 1GDL A; 3OGB A; 1QI8 B; 2G0S A; 1JZK A; 3LB4 A; 3QJC B; 3MJU B; 2DN3 B; 3OZU A; 1XYE B; 3QQQ A; 1YH9 B; 5CNB A; 1IWH B; 2HHB A; 1GLI B; 5EYJ A; 3FS4 A; 1BVD A; 3A2G A; 3QJB B; 2W6V B; 4B3W A; 1OBM A; 1H1X A; 3PT8 A; 1DWS A; 1HBH B; 4N7P B; 2R1H B; 1JF4 A; 1YEO B; 2ZS0 D; 3EDB A; 3AT6 A; 3S66 A; 2MGA A; 1GVH A; 1Y09 B; 3IA3 B; 5EUI A; 3ZH0 A; 3DR9 A; 3DHR B; 1JY7 B; 1Y4R A; 2ZSQ A; 2R4Y A; 5B85 A; 2ZSS A; 4HHB A; 3UHE A; 1DLY A; 2EVP A; 4HBI A; 4WJG 1; 1YEN A; 2PEG A; 3FH9 A; 2ZSX A; 2LH3 A; 1V4W A; 1O1O A; 1Y83 B; 2G3H A; 1V75 B; 1MKO A; 111M A; 3UH7 A; 3MOU A; 1Y4Q A; 4M4B B; 1MYZ A; 1HDA B; 1HRM A; 1JP8 A; 1UVX A; 2ZSY A; 1A6K A; 1OUT A; 1YEQ A; 3PI3 A; 1NEJ B; 3TM9 A; 1FAW A; 1C7D B; 3S1I A; 1G0A A; 5KDQ B; 3D17 B; 112M A; 3GOU B; 4VHB A; 5HAV A; 1J3Y A; 1J7W B; 3BOM B; 3GDJ B; 3HRW B; 1QSI A; 4UZV A; 3R5I A; 2G11 A; 3PI8 A; 1Q1F A; 1A0U B; 4H2L A; 1A9W A; 1B0B A; 1Y46 A; 1MLK A; 3CY5 A; 3UHC A; 1MLL A; 1CMY B; 1YFF A; 1X9F C; 2QFN A; 3QJE B; 2BLJ M; 3UHU A; 1GCV B; 3BJ1 B; 2G12 A; 1O1N A; 2D2N B; 1BIJ B; 1UC3 A; 4ILZ A; 1YIE A; 1LHS A; 3UHX A; 1NIH B; 3VRE A; 2Z6T A; 3UHK A; 1MDN A; 1GZX B; 3LB3 A; 2R80 A; 5CNC A; 2QFK A; 2MBW A; 1YCB A; 2AV3 A; 1HBA B; 5HLX A; 2HZ1 A; 1YEV B; 1HGA B; 2ZLW A; 1O1P B; 1D8U A; 1OR4 A; 1Y31 B; 4O1T A; 2MHB B; 1LFV B; 4NI1 A; 2IN4 A; 2MGH A; 1LFY B; 1HV4 A; 5CNF A; 4OF9 A; 1BZ0 B; 4MBA A; 1MOC A; 3UHR A; 3VAU A; 1LFL A; 4ZVA A; 3U3E A; 3A59 A; 3WCP A; 3V2V A; 1ASH A; 1CIO A; 3S48 C; 3SDH A; 2BK9 A; 1Y2Z A; 3OO5 B; 3E5O A; 1RQA B; 3FS4 B; 2ZS1 A; 1BZ1 A; 1THB A; 1KD2 A; 3NL7 B; 1I3E A; 2ZT0 A; 3IC0 A; 1HBG A; 3LQD B; 1QSH A; 1UIW A; 2ZFB A; 1ABY B; 1R1Y A; 1MYI A; 2XKI A; 2VLX A; 1FHJ A; 1J40 B; 2EVK A; 2HBC A; 2NSS A; 4U8U C; 2EKT A; 4IRO B; 2HBD A; 3HYU B; 1A3N B; 2MGL A; 4X0L A; 1SPE A; 3TLD A; 5D1V A; 3FH9 B; 1LHT A; 3O89 A; 1X9F D; 1IOP A; 1Y8W A; 3NG6 B; 4G1V A; 1Y4Q B; 1A6N A; 1Y4B B; 1YGF A; 1QXE B; 1J41 B; 1IDR A; 5E83 B; 1F5O A; 1BZZ A; 4U8U A; 4ODC A; 1VXB A; 3D4X A; 1QSI B; 2AA1 B; 3R5I B; 1CH4 A; 2ZS1 D; 1A01 A; 2MYD A; 3LHB A; 4M4A A; 5HBI A; 1CH2 A; 2V1J A; 2ZFO A; 4DC8 A; 1WMU A; 4NXA A; 2H8D A; 3NFE A; 4H2L B; 1YHU C; 2GNW A; 3ONZ A; 4JYQ A; 1SHR A; 1SDL A; 1RQ4 B; 1YFF B; 5E6E A; 1Y7G A; 1Y01 B; 3PT7 A; 1FLP A; 4F6D A; 1TES A; 1SDK A; 1B86 A; 1GCW A; 1O1I A; 4C0N A; 1Y0A B; 1AJG A; 2O5L X; 3WFX A; 1CIK A; 1JDO A; 1S5Y A; 1Y4G B; 1Y5F B; 3DUT A; 4IT8 A; 1HAB A; 1YHE B; 4HRR B; 1A6M A; 1YHU A; 2RI4 A; 5HU6 A; 3IC2 A; 1HBS A; 3M3B A; 2D60 B; 1J7Y A; 4NK1 A; 1YIH B; 4L2M A; 3ECZ A; 1YOH A; 3WTG A; 4MXL A; 1Y0D B; 2MGD A; 1URY A; 1DM1 A; 4U8U D; 3WR1 B; 2MGK A; 4MPM A; 3QJC A; 3MJU A; 1A9W E; 2DN3 A; 1XYE A; 1YH9 A; 3HEN A; 1MLQ A; 3QMA A; 2ZFO D; 2HCO B; 3HF4 B; 1IWH A; 1GLI A; 1CG5 A; 3AG0 A; 3QJB A; 1O1J B; 1J7S A; 1HCO B; 2W6V A; 2DC3 A; 3VRF A; 2ZS1 B; 4F6J A; 1HBH A; 2LH2 A; 1CO9 A; 4N7P A; 2MGB A; 2PGH B; 1THB B; 2R1H A; 5ILE A; 3UGZ A; 108M A; 1YEO A; 3IC0 B; 1NZ2 A; 2MGG A; 1NZ5 A; 2EB8 A; 1C7B A; 1DO1 A; 1MBD A; 3DHR A; 3PI4 A; 5E29 B; 3UHH A; 1YG5 A; 2MYB A; 3EU1 B; 1COH A; 3OVU C; 2ZSO A; 1YHU D; 1A4F A; 3VRG B; 2LH7 A; 1V75 A; 6HBI A; 3WCT B; 1S56 A; 3ARK A; 2KSC A; 1SI4 A; 3LB1 A; 2M6Z A; 1CG8 B; 1C7D A; 2D2N C; 1IRD B; 1M6C A; 5KDQ A; 2SPL A; 3D17 A; 1CPW A; 3GOU A; 3UHV A; 2MYA A; 1BAB A; 3QZX A; 1J7W A; 3BOM A; 3GDJ A; 3HRW A; 1RQ3 B; 2QRW A; 4ODC B; 3UHQ A; 1LH5 A; 1YMB A; 1A0U A; 3D4X B; 3M38 A; 3GQR B; 4KN3 A; 4M4A B; 1N9F A; 5IKS A; 2ZFO B; 1Y45 B; 3GLN A; 1YMC A; 2H8D B; 3NFE B; 3QJE A; 2HHD B; 4F4O A; 1GCV A; 3BJ1 A; 3ONZ B; 5MBA A; 2D2N A; 1S61 A; 1SHR B; 107M A; 2MYC A; 109M A; 2BW9 M; 2O5B X; 1Y7G B; 3S65 B; 1M9P B; 1SDK B; 1B86 B; 1NIH A; 1ECD A; 1IBE A; 1HBA A; 5CND A; 4DWT A; 1S5Y B; 1HGA A; 2SPO A; 1Y31 A; 3UHT A; 1YDZ B; 1F5P A; 1N9H A; 1LFV A; 1NXF A; 5HU6 B; 1MLR A; 2NRM A; 1HBS B; 1JEB B; 2O5M X; 1BZ0 A; 2MGF A; 1S0H A; 2AV0 A; 4MQH A; 3HHB B; 3WTG B; 4ROL B; 3UBV A; 2O5O X; 2R4W A; 2HBF B; 1LFQ B; 4TWU A; 5HY8 B; 3OO5 A; 1Y4V B; 1YMA A; 4UUR A; 1RQA A; 1CG5 B; 2MGI A; 4FH7 A; 1J7S B; 1XZ7 B; 2FAM A; 3VRF B; 3NL7 A; 1QXD A; 2D2N D; 3QM5 A; 3G4W A; 3LQD A; 1EMY A; 2ZLU B; 1ABY A; 1ECO A; 1IT3 A; 2D5Z A; 1J40 A; 1V9Q A; 1C7B B; 1Y35 A; 4IRO A; 3OK5 A; 3HYU A; 1A3N A; 1YG5 B; 3AQ5 A; 1QPW A; 1COH B; 3PI9 A; 4PNJ A; 2O58 X; 3D1A B; 1A4F B; 2AUR A; 2Z6N A; 2BNL A; 1XCH A; 2SPN A; 3NG6 A; 2AUP A; 5AB8 A; 1Y4B A; 1QXE A; 2OH8 A; 1HBI A; 4MQC B; 3PIA A; 1SI4 B; 1J41 A; 1YE0 B; 2M6Z B; 1YHR A; 2B7H B; 1BVC A; 5E83 A; 1CH3 A; 3B75 A; 1LH1 A; 2GDM A; 1DTM A; 3G52 A; 3D7O B; 3M39 A; 2OLP A; 1J3F A; 1AJ9 B; 1BAB B; 2AA1 A; 3AQ6 A; 1DXV B; 1BUW A; 1A0Z A; 1JWN A; 2GNV A; 4FC3 B; 1HDB B; 1MLF A; 3MN0 A; 4F6F A; 1JF3 A; 2WTG A; 3K9Z A; 1RQ4 A; 4YU3 B; 1OFJ A; 1YE2 A; 1GDK A; 4F4O B; 1XZ5 B; 2VEB A; 3MKB B; 1XZU B; 1Y0A A; 4ESA B; 1GDJ A; 1NWI A; 6HBW B; 1IBE B; 1DTI A; 1MYJ A; 1RPS A; 4GZG A; 1VWT A; 2G14 A; 3AQ8 A; 1HHO B; 1Y4G A; 1Y5F A; 3M3A A; 1UX8 A; 1YHE A; 4HRR A; 3ASE A; 3ZJN A; 3QM6 A; 1Y5J B; 2HHE B; 2VRY A; 2R4Z A; 1CQ2 A; 2D60 A; 2ZS1 C; 4N8T B; 1YIH A; 1RTX A; 2GKM A; 5F0B A; 4DWU A; 1AZI A; 1YCA A; 2V1K A; 1Y0D A; 5SW7 B; 1Y85 A; 4O4Z A; 1S0H B; 3WR1 A; 5CN7 A; 3OO4 B; 1DO3 A; 4HSW A; 4HRT B; 4MQH B; 3ZJS A; 3EOK B; 2GL3 A; 2VYZ A; 5MBN A; 110M A; 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3WCT D; 1RPS B; 1VWT B; 1YDZ A; 4XDI A; 3KUO A; 2DXM A; 5JOM A; 3WFU A; 2D2M D; 2MGJ A; 1HLM A; 2G0Z A; 2QSS A; 3G4Y A; 1JEB A; 1ABS A; 3HXN A; 3KMF A; 3ZJQ A; 1J3Z B; 1JZM A; 3ZHW A; 3HHB A; 3ZJP A; 4ROL A; 1Y8K A; 1GBU B; 1Y85 B; 1DXD A; 2HBF A; 2ZT3 A; 1YGD A; 2OHB A; 2XKH A; 2MB5 A; 1K0Y B; 1LFQ A; 1XQ5 A; 3UGY A; 2E2Y A; 5HY8 A; 5KER B; 3RJN B; 1Y4V A; 2VHB A; 2NRL A; 3KUN A; 4C44 A; 3EDA A; 3G4R A; 1S5X B; 3GQG B; 2VYY A; 1XZ7 A; 3BJ2 B; 1DUK A; 3UHN A; 2ZLV A; 3SZK A; 3R0G A; 2BMM A; 3ZJM A; 5HLU A; 2ZLU A; 3TM3 A; 1VHB A; 105M A; 1EBT A; 2ZT1 A; 5EE4 C; 3P5Q B; 3GKT A; 2HZ3 A; 3WCU A; 3UHI A; 2OHA A; 2R4X A; 1C40 B; 1PBX A; 1UFP A; 2MGC A; 3LB2 A; 3AT5 B; 2HBS B; 1NAZ A; 2V1H A; 3MJP B; 5CNG A; 4MQI B; 3D1A A; 1DKE A; 1OUU B; 1NQP B; 1CH1 A; 1LH2 A; 1V4U A; 2V1I A; 4MQC A; 4NS2 A; 1YE0 A; 3BJ3 B; 1Y0C B; 2QMB A; 2B7H A; 1V07 A; 2D2M B; 1XZ2 B; 5EYS A; 1Y7C B; 3H58 A; 1Y0W A; 3D7O A; 1A3O B; 1S6A A; 1F65 A; 3WCW B; 1AJ9 A; 1DXV A; 3H57 A; 5CN8 A; 4O35 A; 3ODQ B; 1MOA A; 1HAC B; 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