The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
145
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structure length |
145
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Chain Sequence |
MLTAEEKAAVTAFWGKVKVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTADAVMNNPKVKAHGKKVLDSFSNGMKHLDDLKGTFAALSELHCDKLHVDPENFKLLGNVLVVVLARNFGKEFTPVLQADFQKVVAGVANALAHRYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| molecule tags |
Transport protein
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| total genus |
57
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| structure length |
145
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| sequence length |
145
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-11-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2MGJ A; 3S66 A; 2BLJ M; 3VRF B; 2QMB B; 5EYS A; 3NFE B; 1MWD A; 2D2N D; 2MGG A; 1OUT A; 1Y4Q B; 2MYA A; 3GDJ B; 1DLW A; 4ILZ A; 4ESA A; 1KD2 B; 107M A; 3ZJQ A; 3SZK A; 1XZU B; 1NS9 B; 1YCB A; 5HY8 B; 1DTI A; 3ASE A; 4MQH B; 1Y5K B; 2ZLX B; 1IOP A; 3UHZ A; 3PI1 A; 2HBE B; 1LJW B; 1HDS B; 5KKK A; 1F5O A; 1GLI B; 3ED9 A; 1JY7 B; 1GJN A; 2Z6N A; 1G08 B; 1QI8 B; 2W6Y A; 1RQ4 A; 2AA1 B; 4ROM A; 3WCV C; 4MAX A; 1LFQ A; 4UZV A; 3CY5 B; 4N8T A; 1MOA A; 1BJE A; 3S1I A; 2HBS A; 1Y7C A; 2NRL A; 2ZT0 A; 2G3H A; 1DXV B; 1O1L A; 4GZG A; 1O16 A; 2H35 B; 1XZ7 B; 1S6A A; 4FC3 B; 1Y8I B; 1OFK A; 2ZSQ A; 1CG5 B; 3HXN A; 2D2N A; 1O1I A; 1HBA A; 1FSX A; 1YIE B; 2RAO B; 1CH1 A; 3DHR A; 2BW9 M; 1HLM A; 3PT8 B; 2G0V A; 4QAU A; 1NS6 B; 1LH3 A; 1A3N A; 1XY0 A; 3UGY A; 3WCU C; 2PGH B; 2ZLU B; 1T1N A; 1A9W E; 1CH7 A; 1YH9 A; 1FHJ B; 3WCT D; 1BZ0 A; 1J7W B; 1MLN A; 1CQ2 A; 3PI8 B; 1NIH B; 1PBX A; 1N9F A; 3DHT A; 1Y8H B; 2ZS1 C; 2G10 A; 4MQC B; 1MYH A; 2DN3 B; 3BJ2 A; 5CHR A; 1Y09 A; 1YIH B; 1C40 A; 1Y4G B; 1MBA A; 1JPB A; 1ABY A; 2ZFO B; 4PNJ A; 2W6V A; 1HJT A; 2QSS A; 1COH A; 1LFT B; 1BZ6 A; 1DWR A; 5JDO D; 3MJP B; 1K0Y B; 4SDH A; 4JAC A; 5E29 B; 1CIK A; 3B75 A; 3UBC A; 3UBV A; 3ZOL A; 5JGG B; 3QJE B; 4FWX A; 1UIW B; 1HBG A; 1Y85 B; 3D1K B; 4IRO A; 5D1V A; 5CN7 A; 3DR9 A; 4O35 A; 2VM0 A; 3EDA A; 5CN4 A; 4KMV A; 1A0Z A; 4X0L A; 1Y45 A; 1A4F B; 2B7H B; 4HSX A; 3VRG A; 1A6N A; 3LQD B; 1YEU B; 1IDR A; 3UHQ A; 2V1E A; 4JYQ A; 3S66 B; 1VXB A; 1LFZ A; 3QJB A; 3WCT A; 1DXC A; 1OUT B; 1MLO A; 1QPW A; 3BJ1 A; 3DUT A; 2WTG A; 4ESA B; 3WCV D; 1RTX A; 3SZK B; 5KER A; 1MTK A; 2DN2 A; 4H2L A; 4NXC A; 1JZL A; 3ARK A; 1U7R A; 3A2G A; 1VXE A; 4M4B A; 2HZ2 A; 3LB1 A; 3VRE A; 1YE2 A; 2R1H A; 3UHX A; 3ZJJ A; 3UGZ A; 2JHO A; 2QSP A; 2Z6N B; 1FSL A; 1RQ4 B; 2QFK A; 4ROM B; 1LFQ B; 3ZJS A; 2SPO A; 4N8T B; 4UIQ A; 2HBS B; 1Y7C B; 3K8B A; 3G4W A; 1MBS A; 1O1L B; 3WCU D; 1JZM A; 3R5I A; 2FRI X; 3OO5 A; 3QM7 A; 5CNE A; 3NG6 A; 1CH9 A; 2EVK A; 1RSE A; 3UHH A; 3LB3 A; 3HXN B; 1HBH A; 5HLQ A; 2ZS1 D; 2D2N B; 1O1I B; 1HBA B; 1FSX B; 1LA6 A; 1JEB A; 3DHR B; 4N7N A; 1SPE A; 1A3N B; 1JL6 A; 2BLI A; 2IG3 A; 1LFL A; 2ZFB A; 1XY0 B; 1DO7 A; 3MOU A; 1T1N B; 1NZ4 A; 4F68 A; 3FS4 A; 2QU0 A; 1BZ0 B; 1VXD A; 1PBX B; 3DHT B; 1IT2 A; 4YU3 A; 3WCP A; 102M A; 3BJ2 B; 1C40 B; 1YFF A; 1O1P A; 1IT3 A; 3A5B A; 4MQJ A; 1ABY B; 1MLG A; 1UX9 A; 2W6V B; 1J7S A; 2QSS B; 1COH B; 4MQK A; 1JP8 A; 3AQ7 A; 1IRC A; 3UHT A; 4HRT A; 1RPS B; 1OBM A; 4HBI A; 3OO4 A; 1S0H A; 1O1N A; 1ECA A; 3B75 B; 4BJA A; 1CPW A; 3D17 A; 3ARL A; 2ZS1 A; 1MYM A; 4IRO B; 2GTL D; 4VHB A; 1Y4V B; 1MLK A; 2D6C A; 1M6C A; 4X0L B; 1Y45 B; 1SDK A; 1YHE A; 2HBF A; 4DC8 A; 3VRG B; 1JP6 A; 1MLJ A; 3WI8 A; 3V2Z A; 3ZJN A; 1LFZ B; 3QJB B; 3WCT B; 1Y0W A; 1EWA A; 1QPW B; 1XCH A; 3BJ1 B; 3DUT B; 2HBE A; 2ZSN A; 5KER B; 1KFR A; 2EB9 A; 2DN2 B; 2XKH A; 1HDA A; 4H2L B; 1K1K A; 4NXA A; 4UUR A; 1CMY A; 1G09 A; 1THB A; 1Y83 A; 1J3Z A; 1DTM A; 4M4B B; 3VRE B; 2NSR A; 2XKI A; 1GCV A; 5CNG A; 3AQ5 A; 1YCA A; 2OHA A; 1YE2 B; 2VYW A; 5EYJ A; 7HBI A; 2R1H B; 2QSP B; 3UHD A; 3TM3 A; 1SWM A; 1B0B A; 4PQB A; 5EET A; 3HYU A; 3GQG A; 1XZ7 A; 3ZJI A; 2GTL A; 2BMM A; 3K8B B; 1YGD A; 5IKS A; 1Y0T A; 1CQX A; 2ZWJ A; 3R5I B; 3OO5 B; 3G4Q A; 2MYD A; 1Y8K A; 3H57 A; 1QXD A; 2LH7 A; 3NG6 B; 1J52 A; 1CH5 A; 1MNJ A; 3UHS A; 3EOK A; 1SDL A; 1Y7D A; 3BJ3 A; 1HBH B; 1DO1 A; 2MYC A; 2VYY A; 1YMA A; 1L2K A; 1LA6 B; 1JEB B; 4WCH D; 1M9P A; 4N7N B; 3QZZ A; 4MBN A; 1NQP A; 105M A; 1HV4 A; 1LFL B; 2ZFB B; 5EU2 A; 3FS4 B; 3AT6 A; 1DO3 A; 4YU3 B; 1BAB A; 3WCP B; 1MCY A; 3H58 A; 4G1B A; 1MLM A; 1YFF B; 1O1P B; 4MQJ B; 1CBM A; 4O2G A; 3QM6 A; 1J7S B; 4MQK B; 1CH3 A; 3TM9 A; 2OH9 A; 3E5I A; 1NWN A; 2BNL A; 1HGA A; 3ECZ A; 6HBI A; 3P5Q A; 1A3O A; 1MNH A; 3SDH A; 4MQI A; 3UH5 A; 3UI0 A; 1S0H B; 1O1N B; 1ABS A; 2R50 A; 3D17 B; 2ZS1 B; 3VHB A; 5JDO F; 2WTH A; 3KUN A; 1QXE A; 3UHK A; 2M6Z A; 3ZJP A; 2FAL A; 2SPL A; 1X9F C; 2VEB A; 2VYZ A; 2QRW A; 1MLR A; 1SDK B; 1YHE B; 1NZ5 A; 1Y4P B; 1S5X A; 2HBF B; 1BZZ A; 3K3U A; 1JZK A; 4N7O A; 1MYJ A; 1VXF A; 1CIO A; 1HDB A; 1Y0W B; 3UH3 A; 1NAZ A; 1CO9 A; 2MGL A; 3G52 A; 3UHE A; 1JWN A; 1HBB A; 1EMY A; 1HDA B; 1K1K B; 1CMY B; 1BZR A; 4MXL A; 1HLB A; 1G09 B; 1THB B; 3E55 A; 1Y83 B; 3QJD A; 1J3Z B; 5EOH A; 1Y4R A; 1OFJ A; 2E2Y A; 5EQM A; 1GCV B; 3D7O A; 1GDJ A; 1CLS A; 5ILP A; 2WY4 A; 5F2A A; 5E83 A; 3A59 A; 1MNO A; 2GDM A; 3D1A A; 2VRY A; 3O89 A; 2D2M C; 3QM8 A; 3GYS A; 3HYU B; 1CG8 A; 3GQG B; 5KDQ A; 2EVP A; 1Y31 A; 3A5G A; 2GTL B; 4F69 A; 3AQ6 A; 1OUU A; 4F6B A; 2VLZ A; 1YGD B; 1Y0T B; 2AV0 A; 3VAU A; 1Y8K B; 1O1K A; 1QXD B; 5C6E A; 1A6G A; 3EOK B; 1SDL B; 3HEO A; 3SDN A; 2H8D A; 1Y7D B; 4KMW A; 3BJ3 B; 1Y35 A; 104M A; 2R4Z A; 1VRF A; 1M9P B; 1NQP B; 2HZ1 A; 2HHD A; 1HV4 B; 4F6G A; 2MB5 A; 1GZX A; 3RGK A; 1FDH A; 1M6M A; 1NEJ A; 2MGC A; 1VXH A; 3AT6 B; 1S69 A; 4MBA A; 2EKT A; 1BAB B; 1JF4 A; 5CN5 A; 3A0G A; 1RPS A; 2MGA A; 1YZI A; 3AQ9 A; 3GOU B; 3ZHW A; 1Y22 A; 1JDO A; 1HBR A; 1O1J B; 4FH6 A; 3G4R A; 3GQR A; 3WHM A; 3UHU A; 3RJN B; 1N9I A; 3PI2 A; 1HGA B; 1Y0C B; 3P5Q B; 1A3O B; 2FRJ X; 1VWT A; 4MQI B; 1Y4V A; 3MJU A; 1LHT A; 1Z8U B; 2H8F A; 1XZ4 A; 3NMM A; 1IRD A; 2O58 X; 3M3B A; 3QQR A; 4HSW A; 2ZT3 A; 4G1V A; 4WJG A; 1NWI A; 1QXE B; 1NGK A; 5CNB A; 2M6Z B; 1HBS A; 2W72 A; 3AG0 A; 1WVP A; 3BA2 A; 2GNW A; 3S65 A; 4YU4 A; 3CIU A; 110M A; 3GK9 A; 1S5X B; 1BZZ B; 2R80 A; 1G9V A; 1Q1F A; 4N7O B; 3BOM A; 1HDB B; 1MBO A; 3PI4 A; 1Y2Z A; 2C0K A; 1Y46 A; 4ODC A; 2D2M D; 1TU9 A; 3OK5 A; 4NK2 A; 2ZSR A; 1HBB B; 1TES A; 1MKO A; 1I3E A; 3QJD B; 1YG5 A; 2OIF A; 5CMV A; 1Y4R B; 2NSS A; 3D7O B; 3HF4 A; 2GLN A; 1O1M A; 4L2M A; 1CLS B; 1CBL A; 1D8U A; 5B85 A; 2ZSO A; 5E83 B; 3A59 B; 4XS0 A; 3D1A B; 3UH6 A; 3GYS B; 1CG8 B; 1CP5 A; 5KDQ B; 2LH1 A; 2ZSS A; 1Y31 B; 1OUU B; 2VLY A; 3V2V A; 2V1G A; 1MOC A; 3G4U A; 2ZSY A; 1LH5 A; 2AUQ A; 1O1K B; 4F4O A; 2ZFO C; 3WCV A; 5C6E B; 3AT5 A; 2H8D B; 1N9X A; 1A0U A; 1Y35 B; 2MGM A; 2D2M A; 2HHD B; 3M39 A; 1YHU C; 1MBN A; 1HRM A; 4F6D A; 1MLH A; 3WFX A; 1H1X A; 1GZX B; 1MBD A; 1V4W A; 1A6M A; 1YMB A; 1NEJ B; 1BIJ A; 3OZV A; 2MGD A; 1DXU A; 2O5Q X; 1V4X A; 1AJH A; 1X3K A; 1LFV A; 3EDB A; 1R1Y A; 3A0G B; 1LH7 A; 3WCU A; 1JP9 A; 3ZH0 A; 1MYG A; 1YZI B; 3ECX A; 1DXT A; 1Y22 B; 3AQ8 A; 1HBR B; 3GQR B; 3WHM B; 5EE4 C; 4NI0 A; 2HHB A; 1AJ9 A; 101M A; 1VWT B; 3D4X A; 1ECO A; 1I3D A; 1V07 A; 1MWC A; 2V1J A; 3MJU B; 1UFP A; 3PI9 A; 2H8F B; 3ZJM A; 1XZ4 B; 5JDO E; 3LHB A; 1DKE A; 1ASH A; 1IRD B; 2CMM A; 1Y4P A; 2MGI A; 3NMM B; 3GQP A; 4DC7 A; 1HGB A; 3G4Y A; 3OZW A; 5CHQ A; 2HCO A; 1GVH A; 1HBS B; 2W72 B; 3OGB A; 4M4A A; 4OF9 A; 2Z85 A; 1A6K A; 1EBC A; 2EB8 A; 4O4T A; 3PI3 A; 4G51 A; 3S65 B; 4YU4 B; 3CIU B; 1V4U A; 2R80 B; 3LB4 A; 1G9V B; 1FN3 A; 3BOM B; 3QJC A; 3PEL A; 2MYE A; 3IXF A; 5SW7 A; 1Y2Z B; 2DXM A; 3HRW A; 1Y46 B; 2O5T X; 2OLP A; 4ODC B; 3WR1 A; 4FWY A; 5CNF A; 3UHR A; 1MOD A; 2VHB A; 1MKO B; 3IC0 A; 4O1T A; 2V1H A; 5CNC A; 1YG5 B; 3EU1 A; 3KMF C; 3TLD A; 2LH6 A; 1NZ2 A; 2ZFO D; 3PT7 A; 3HF4 B; 1O1M B; 2LH5 A; 1UVX A; 1RQA A; 2VEE A; 1MTI A; 1VXC A; 4XS0 B; 1FCS A; 4DWT A; 1YEV A; 1YEO A; 4FWZ A; 2ZT1 A; 3WFT A; 1N9H A; 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5SW7 B; 3NL7 A; 1Y5J A; 1NZ3 A; 2DXM B; 3HRW B; 1FAW A; 3WFU A; 2ZLV A; 5B84 A; 2HZ3 A; 3UHW A; 3WR1 B; 1YE0 A; 3M3A A; 1CP0 A; 1RQ3 B; 1A00 A; 1KR7 A; 1DLY A; 1XYE A; 4PQC A; 1J3Y A; 4U8U D; 3K9Z A; 3IC0 B; 3EU1 B; 4B3W A; 2EKU A; 1JW8 A; 3PT7 B; 1V75 B; 2R4Y A; 3PIA A; 1MWB A; 2G0S A; 1UT0 A; 2ZS0 C; 2FRF A; 1RQA B; 1UX8 A; 1BUW A; 2D5X A; 1J40 A; 2GKM A; 2LHB A; 1YEV B; 1S5Y A; 1YEO B; 3A5A A; 1SPG A; 3BCQ A; 2V1I A; 1U7S A; 4ROL A; 3KMF A; 2D5Z B; 2AUP A; 2BKM A; 4NI1 A; 2FRK X; 3W4U A; 112M A; 1QSH A; 1ABW A; 106M A; 1Y0D A; 4XDI A; 1V5H A; 1DM1 A; 3MBA A; 4L7Y A; 4U8U A; 2LH2 A; 4MQG A; 5CND A; 1S56 A; 4MPM A; 1RVW A; 1J7Y B; 3ONZ A; 2BWH A; 5HU6 A; 3RJ6 A; 1YVT B; 5E6E B; 1X9F D; 1VHB A; 3S48 C; 3ZJL A; 1ECN A; 3ARJ A; 5MBN A; 2RI4 A; 1Y4B A; 1A01 B; 3MKB A; 1MYT A; 1BVD A; 3HC9 A; 1MYZ A; 1MZ0 A; 2DHB B; 1IBE B; 2QLS A; 1MDN A; 4NZI A; 1XQ5 B; 1YHU B; 3WCW D; 3HHB B; 1WMU A; 1HAB A; 1C7C A; 2MGB A; 5EUI A; 1YEN B; 1SHR A; 1MNI A; 1XZ5 A; 2O5L X; 3ODQ A; 6HBW A; 2ZLT A; 3G4V A; 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