The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
145
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structure length |
144
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Chain Sequence |
ADFDAVLKCWGPVEADYTTIGGLVLTRLFKEHPETQLFPKFAGIAQADIAGNAAVSAHGATVLKKLGELLKAKGSHAAILKPLANSHATKHKIPINNFKLISEVLVKVMQEKAGLDAGGQTALRNVMGIIIADLEANYKELGFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High Resolution Structures of Blackfin Tuna Myoglobin
rcsb |
| molecule keywords |
Myoglobin
|
| molecule tags |
Transport protein
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| total genus |
57
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| structure length |
144
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| sequence length |
145
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-02-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YRS A; 1G09 A; 2MGE A; 4N7N B; 3ASE A; 1OFJ A; 1Y35 B; 3IC2 B; 2AUQ A; 3DR9 A; 6HBI A; 3LR7 A; 4DC8 A; 5B84 A; 5D1V A; 2AV0 A; 4F69 A; 2AV3 A; 1NAZ A; 2GRH A; 1HBR B; 1LFZ B; 1CH7 A; 3ZH0 A; 2ZS0 C; 4F6G A; 5HLQ A; 2VRY A; 3QJE B; 4G1B A; 1NZ3 A; 1HDS B; 3AT6 B; 1NGK A; 1EWA A; 1Y7D A; 3WTG B; 2GTL C; 3WCW D; 1JZK A; 107M A; 5IKS A; 1Y5F B; 1DO7 A; 1NPG A; 1K1K A; 1C7D A; 2OHB A; 2WY4 A; 4YU4 A; 1HBS A; 3GOU A; 4HHB A; 5KKK A; 4UUR A; 4ROM B; 5EE4 D; 1IWH A; 1XZU B; 1V75 A; 1BVD A; 1MNK A; 2VLX A; 1LFQ B; 2ZT4 A; 4F6I A; 1LHT A; 2ZS0 D; 2V1G A; 1I3D A; 6HBW B; 3ZJQ A; 1NXF A; 4HRT B; 3D1K A; 2NRM A; 2ZT2 A; 3ONZ A; 3VHB A; 1M6C A; 1S56 A; 1HV4 B; 2ZST A; 1CQ2 A; 3ECX A; 1O16 A; 1YCB A; 2B7H A; 2GTL D; 5C6E A; 3WCW A; 1SDK B; 1Y4Q A; 2ZFO C; 3D1A A; 3EDB A; 2AUR A; 1YGF B; 3GLN A; 4JAC A; 1XZ2 B; 2HBE A; 2IG3 A; 4QAU A; 3S1I A; 3EU1 A; 1SDL A; 1BZ6 A; 1QSH B; 1MYZ A; 2G0X A; 1G08 B; 103M A; 2SPM A; 3OGB A; 4KMW A; 1FSX A; 1CMY A; 3ZOL A; 3DHR B; 2ZSO A; 3GYS B; 2QSP B; 1VXH A; 4XS0 A; 3S65 A; 4TWV A; 1J7S A; 1O1K B; 1LH2 A; 1Y8I A; 1CH3 A; 1QPW A; 2GTL A; 3PI1 A; 1YIH B; 2ZFO D; 2HHB B; 2D5Z B; 2LH5 A; 2RI4 A; 2MGM A; 1DTI A; 2ZS1 B; 1QI8 B; 2D2M C; 4X0L A; 2MHB A; 1HBH B; 4MU5 A; 1Y0A B; 2GL3 A; 1X46 A; 2QLS B; 3IA3 B; 1FHJ B; 3VRG B; 1YZI A; 1R1Y B; 1JW8 A; 1DUK A; 2G0Z A; 2AUP A; 1OR6 A; 1Y4B B; 3S66 B; 3D17 A; 4NZI A; 3PI4 A; 1JZM A; 5CHQ A; 3WR1 B; 2Z6N A; 1WLA A; 4ODC A; 2RAO A; 1ABY B; 2HBG A; 1UVX A; 4N7P A; 1MOH A; 4HRR A; 1J7W A; 3WHM B; 4F6J A; 3K9Z A; 1NPF A; 1O1M A; 1VRF A; 1HGA B; 1S5Y B; 2Z8A A; 3WCT B; 1QXE A; 3PI2 A; 2ZLU A; 2ZFO A; 1J40 B; 1DXT B; 4M4A B; 1A4F A; 2D2M D; 2AA1 B; 1A0U B; 3UHZ A; 4C0N A; 112M A; 1A3O A; 3NML A; 1Y45 B; 3UHE A; 2FRK X; 3ZJR A; 2MBW A; 3AQ8 A; 1A01 A; 1H1X A; 1MBS A; 2DN3 B; 2XKG A; 1GBU B; 2MGH A; 3E55 A; 4O1T A; 2DHB B; 1Y4R B; 1BBB B; 2MGK A; 1A9W A; 3MJP A; 5EV5 A; 2W6Y A; 1XY0 B; 4U8U B; 1FN3 A; 4O4T A; 2LH2 A; 1F5O A; 1CO8 A; 1GCV B; 1O1P A; 1OUU A; 1S0H B; 1Y0D A; 2R50 A; 1MWB A; 1S61 A; 1MTJ A; 1NQP B; 3OO4 A; 1Y8K B; 4F4O B; 1MYJ A; 2MGL A; 5HLU A; 1ITH A; 1Y22 A; 2QFN A; 1YCA A; 2DC3 A; 1FDH A; 1MLF A; 1NZ4 A; 5CNF A; 2D2M A; 2W6V B; 4MQK B; 2BLI A; 3A59 A; 3PEL A; 3K8B B; 3R5I A; 2O5B X; 2D6C A; 5SW7 B; 1NS9 A; 1Y2Z A; 3HXN B; 1Y8W A; 1BZ1 B; 5E29 A; 5F0B A; 2ZLT B; 1YHU B; 1J7Y B; 4M4B B; 1SPG A; 3ARK A; 1MYM A; 1NEJ A; 1CH9 A; 1FCS A; 1LH1 A; 1GCW B; 4OOD A; 3E5O A; 5HU6 B; 2R1H A; 1Y83 A; 5JOM A; 1HJT A; 2ZLX A; 1UC3 A; 3CY5 A; 2H8F A; 1MKO B; 5EET A; 5CMV A; 3PIA B; 5JDO C; 3O89 A; 2VLY A; 1G9V A; 1MYG A; 2HBF A; 3P5Q B; 3NMM A; 4MQJ A; 4FC3 A; 1COH A; 2HBC A; 1G0A B; 3ODQ B; 1CPW A; 3FS4 A; 1RQ3 B; 2D2N B; 1UIW B; 3E4N A; 1VHB A; 1PBX A; 2V1F A; 5F2A A; 3UH6 A; 3VRE A; 1YEO B; 3GQP B; 104M A; 2MGG A; 3GKT A; 1BZ0 A; 1KR7 A; 4H2L A; 2SPO A; 4NI1 A; 2AUO A; 1ECO A; 1J41 B; 3WCV D; 1CG5 B; 3W4U A; 1SI4 A; 1LFL A; 1X9F B; 5KDQ B; 1O1O A; 3MYM A; 3ZJL A; 1HDB A; 4SDH A; 3GQR A; 1MZ0 A; 1YFF B; 1IOP A; 2MGD A; 1HBI A; 1K0Y B; 2EB9 A; 2D60 B; 3UHT A; 1AZI A; 1MDN A; 2PGH B; 3LB3 A; 5JDO D; 2OH8 A; 4DWT A; 2VEB A; 1WMU B; 2XYK A; 1BUW B; 1JP8 A; 1A0Z A; 3GQG B; 2JHO A; 3NG6 A; 4HSX A; 3KUN A; 3IC2 A; 4F6F A; 1HBG A; 1LJW B; 2LHB A; 3UGY A; 2O5L X; 1JY7 B; 2W72 A; 4FWY A; 1JL6 A; 4O4Z A; 1Y8H A; 1JF4 A; 1HBR A; 1DKE B; 1LFZ A; 3NFE B; 3WCV A; 5C6Y A; 4MQG B; 3HYU B; 1LTW A; 2MYC A; 2MGF A; 1O1J B; 1MLS A; 3BA2 A; 2HHD B; 1YHR B; 1YMB A; 2OHA A; 3SZK B; 1MCY A; 1YOG A; 1G0B B; 4DC7 A; 2SPL A; 2ZSY A; 3LB2 A; 3PT8 B; 2BKM A; 2ZS1 C; 3MJU B; 3HEN A; 3QJD A; 1Y7C B; 1IBE B; 2DN2 B; 1QXD A; 4AVD A; 4ROM A; 5KER B; 1YEU B; 3GKV A; 2VYY A; 1OUT A; 1XZU A; 4MQH B; 4LPI A; 1CH5 A; 1UFP A; 108M A; 2QMB B; 3PT7 A; 1HGC A; 1MWD A; 4ZVA A; 1Y0C B; 1YMC A; 3GK9 A; 2HBD A; 3QQR A; 5MBN A; 1SPE A; 1QSI B; 1MLQ A; 1VXC A; 1VXG A; 1YG5 B; 1AJ9 B; 4HRT A; 3UHC A; 1ECN A; 1VWT A; 5M3S A; 1HV4 A; 1BVC A; 5CNB A; 1CBM A; 1XYE A; 1THB B; 1I3E A; 2XKH A; 1DXU A; 1SDK A; 1J3Y B; 3WCT C; 1C7C A; 2V1J A; 3O7N A; 1Y5J A; 3G4W A; 1Y46 B; 2DXM B; 2MB5 A; 2ZS1 D; 3QJC A; 4N7O B; 3BJ3 A; 3ZJN A; 2VYW A; 1MTI A; 1YGF A; 1XZ2 A; 4MAX A; 2ZSN A; 2QSS B; 4UZV A; 5JGG B; 1CIO A; 1LH6 A; 1RPS B; 3UHV A; 3ZJP A; 2OH9 A; 1GLI B; 2M6Z A; 1NS6 B; 1YVT B; 4FH6 A; 1HBA B; 1O1N B; 4YU3 B; 3MN0 A; 1TES A; 5CN5 A; 1M9P A; 1MYT A; 1JP9 A; 4N8T B; 4NI0 A; 2C0K A; 2IN4 A; 3S1J A; 3GYS A; 2ZLV A; 4U8U C; 3AQ5 A; 4IRO A; 1KFR A; 3WCU C; 5JDO F; 2GDM A; 3G4U A; 105M A; 1MYH A; 3OO5 B; 1B86 B; 3HRW A; 5E83 B; 2BMM A; 1LH3 A; 1RVW A; 1YE2 A; 1IRD B; 3WCT D; 3PI8 A; 1YIH A; 1XZ7 B; 1VXF A; 3BJ1 B; 5CN4 A; 2D5Z A; 1DWS A; 2ZS1 A; 1CH1 A; 1JF3 A; 3G46 A; 1OBM A; 1N9X A; 3WCP B; 1RQA B; 3UHQ A; 1NWN A; 1HGB A; 1YHU C; 2G10 A; 2R80 A; 3VRG A; 1WVP A; 1XZ5 A; 1KD2 B; 1Y4B A; 1YIE A; 3UHB A; 1DXC A; 1A9W E; 3ED9 A; 4ESA B; 4MPM A; 2ZT0 A; 1Y0W A; 4U8U D; 4TYX A; 3WR1 A; 3WCU D; 1LFT B; 2BW9 M; 2ZWJ A; 2G3H A; 1JWN A; 1YGD B; 1ABY A; 1R1X B; 2HHE B; 4MQI B; 1Y4P B; 3MKB A; 1HRM A; 5CN6 A; 1YEQ B; 3DUT B; 3WCT A; 2QU0 A; 3FH9 B; 3BOM B; 4M4A A; 5E6E B; 3ZJI A; 2AA1 A; 1A0U A; 1A3N B; 2HZ2 A; 1Z8U B; 4AVE A; 1Y45 A; 3EOK B; 1MYF A; 1YHU D; 2ZSZ A; 1GDL A; 1X9F C; 1J52 A; 2VHB A; 5CNG A; 4WCH D; 1CO9 A; 1OR4 A; 2ZSX A; 1GZX B; 1O1I B; 3BCQ B; 1XXT A; 3TLD A; 2DN3 A; 3DHT A; 1C7B A; 1GBU A; 3MVC A; 2DHB A; 1Y4R A; 4ROL B; 1XY0 A; 2PEG B; 2ZS0 A; 1S5X A; 1X3K A; 3WCU A; 1GCV A; 1RQ4 B; 1Y7G B; 4HBI A; 1Y5K B; 3PI9 B; 1HBB B; 4F4O A; 3LB4 A; 5ILM A; 1MBI A; 1HAC B; 4IT8 A; 2O5M X; 3CIU B; 3G52 A; 1SHR B; 3K8B A; 5SW7 A; 1CP5 A; 1BZ1 A; 5HY8 A; 1LA6 B; 3HHB A; 1YHU A; 1X9F D; 1J7Y A; 4M4B A; 1Y7D B; 1M6M A; 1GCW A; 3G4V A; 3A0G A; 1K1K B; 1V4X B; 2BLH A; 1HBS B; 4HHB B; 3GOU B; 1V4U B; 3LQD B; 1Y85 B; 3PIA A; 3P5Q A; 5ILE A; 4G51 A; 1MLL A; 1YHE B; 1G0A A; 3ODQ A; 1RQ3 A; 1CLS B; 1UIW A; 3E5I A; 3R0G A; 3KUO A; 3U3E A; 3HEO A; 1UT0 A; 4JYQ A; 2ZLW A; 1YEO A; 1CIK A; 1H97 A; 3UHS A; 5CND A; 3D1K B; 3ARL A; 3G4Q A; 3ORD A; 3VRF A; 1HAB A; 2WTH A; 1J41 A; 3ZJM A; 1CG8 A; 1CG5 A; 1X9F A; 2B7H B; 1J3Z B; 5KDQ A; 1Y4G B; 5C6E B; 2DN1 B; 106M A; 3LR9 A; 1XZV A; 1Y4Q B; 1Y7Z A; 2VEE A; 3ECL A; 1LFY B; 1YFF A; 2D60 A; 4PNJ A; 5JDO E; 2V1H A; 1OFK A; 1WMU A; 1O1L B; 1BUW A; 3GQG A; 5ILR A; 1BJE A; 3EU1 B; 3A5A A; 1DXV B; 2QRW A; 3ARJ A; 1BZZ A; 1LJW A; 1GDK A; 1ABS A; 2W6W A; 1CMY B; 3A2G A; 1MLG A; 2G0S A; 1CBL A; 2R4Y A; 3B75 B; 3D4X A; 3M39 A; 4XS0 B; 3S65 B; 2SPN A; 3OJ1 A; 1J7S B; 1HHO B; 1Y0T B; 4MQG A; 3HYU A; 2NSR A; 3QQQ A; 1VXE A; 1LFV B; 1CP0 A; 3NL7 A; 3AG0 A; 1DWR A; 5HBI A; 2RI4 B; 3SZK A; 1AJG A; 1YEN B; 4G1V A; 1YMA A; 3RJN B; 4X0L B; 2NRL A; 1VXD A; 2HZ1 A; 3PT8 A; 3M3A A; 1BZR A; 2ZFB A; 3MJU A; 1HLB A; 1JEB A; 4FWZ A; 1YDZ B; 4NS2 A; 1Y7C A; 1YZI B; 4HSW A; 2H35 B; 3UHH A; 3OK5 A; 3D17 B; 1BIN A; 2EKU A; 2QMB A; 3UBC A; 2O5S X; 1FAW A; 2Z6N B; 1ECA A; 4PQC A; 1YOH A; 3QJB B; 1V4W B; 2O5O X; 1QSI A; 3BJ2 A; 3IXF A; 1ECD A; 3IC0 A; 4N7P B; 4HRR B; 1T1N B; 1J7W B; 1C40 B; 1EW6 A; 3AT5 B; 4L7Y B; 1MOC A; 2HCO A; 1IT2 A; 2ZLU B; 2ZFO B; 3QMA A; 1Y4V B; 1UVY A; 1A4F B; 2FAM A; 2MYB A; 1JPB A; 111M A; 1URV A; 1A3O B; 1D8U A; 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1NWI A; 4PQB A; 3HF4 B; 1A0Z B; 3NG6 B; 4ROL A; 5ILP A; 4ZVB A; 3DHR A; 2PEG A; 1Y31 B; 2BLJ M; 2QSP A; 1RQ4 A; 1Y7G A; 3ZJS A; 5EE4 C; 1MLN A; 1O1K A; 1Y5K A; 4L2M A; 3PI9 A; 1HBB A; 2W72 B; 1B0B A; 3UHI A; 1DLY A; 1LH5 A; 1Y8H B; 1TU9 A; 1Y09 B; 2MYE A; 2HBS B; 3UHN A; 1HAC A; 2HHB A; 3WCV B; 3CIU A; 1SHR A; 1QI8 A; 1HBH A; 1EMY A; 1LA6 A; 3ZJH A; 1Y0A A; 1VXA A; 3QM5 A; 3WFU A; 2QLS A; 3KMF C; 1F65 A; 1FHJ A; 4MBN A; 3UH3 A; 1DUO A; 4B3W A; 2NSS A; 1R1Y A; 3QM8 A; 109M A; 1A6M A; 3S66 A; 1V4X A; 2HZ3 A; 3QJD B; 4O2G A; 1S69 A; 1V4U A; 3LQD A; 5D5R A; 1Y85 A; 1QXD B; 102M A; 3AQ7 A; 1VXB A; 1MLO A; 4NXA A; 3GKV B; 1OUT B; 2ZSS A; 1ABW B; 5EYJ A; 1YHE A; 1V9Q A; 1XQ5 B; 3PT7 B; 1HGC B; 1CLS A; 3UHK A; 2D2N C; 2D5X B; 3WHM A; 2HBD B; 1HGA A; 1S5Y A; 1VRE A; 2KSC A; 4UIQ A; 1YVQ B; 1J40 A; 3QZZ A; 1DXT A; 1Y4F B; 1VWT B; 3UHG A; 1DXD A; 2E2Y A; 1DTM A; 1XYE B; 4XDI A; 3QZX A; 1J3Z A; 3VAU A; 1Y4G A; 1U7R A; 3SDN A; 2DN1 A; 2FRF A; 1DXU B; 3G4R A; 3G53 A; 2W6X A; 2GNV A; 1MTK A; 1C7C B; 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