The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
60
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Distal pocket control of nitrite binding in myoglobin
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Myoglobin
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| molecule tags |
Transport protein
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| total genus |
60
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-12-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3OO5 B; 1HCO B; 3KUO A; 3LB3 A; 4MBN A; 1JL7 A; 1Y5F B; 1EW6 A; 2R1H A; 1MLM A; 1WLA A; 3ARK A; 2V1G A; 2VLZ A; 1GJN A; 2ZFO A; 1S61 A; 1C7D A; 3GQG B; 1MYI A; 4MQJ B; 1RQ4 A; 1R1Y A; 2HBC B; 4F6G A; 2ZT3 A; 1LFV A; 1MTJ A; 2QLS A; 5CHQ A; 1J7Y A; 3ZH0 A; 3K3U A; 3DR9 A; 3MJU A; 4NK1 A; 4OOD A; 3A2G A; 1BVD A; 1S5X B; 5CNG A; 2ZT0 A; 5CN6 A; 3BJ2 A; 2FRK X; 5CN8 A; 4UUR A; 1YHR A; 3HC9 A; 3NL7 B; 1XZ2 A; 1NZ2 A; 2VLX A; 1Y4F A; 3QJE B; 1YE2 B; 2Z85 A; 1JP8 A; 3IXF A; 5B85 A; 5KER A; 1FN3 A; 2XKH A; 3BJ1 B; 1HBH A; 1XYE B; 2SPO A; 1Y0T B; 3WFT A; 1V4W B; 1DXT B; 3O7N A; 1G0A A; 3GKT A; 1DXC A; 1DLY A; 3A5G A; 1CH1 A; 4AVD A; 1YDZ A; 3UHE A; 3HRW A; 1ECA A; 3U3E A; 2BW9 M; 1YMB A; 3WCU C; 2D2M C; 2HBD A; 3OZW A; 101M A; 1MLU A; 1XCH A; 1CP0 A; 1HBB A; 1HBG A; 2ZFO B; 3UHK A; 2R50 A; 2VYZ A; 2ZS1 C; 1C7D B; 5HBI A; 1RQ4 B; 1R1Y B; 1HGC B; 3QM8 A; 1LFV B; 2GDM A; 2QLS B; 1MKO A; 4KMV A; 1MTI A; 3MJU B; 3PI8 A; 1HJT A; 1X9F D; 3BJ2 B; 1YHR B; 3V2Z A; 1XZ2 B; 3ZJH A; 1Y4F B; 3H58 A; 3TM9 A; 1LH3 A; 1OUT A; 3WCU A; 2MYD A; 2D2M A; 1JP6 A; 3DUT A; 3WFU A; 5KER B; 4C0N A; 3MBA A; 1RTE A; 3SZK A; 2XKG A; 4LPI A; 1HBH B; 3ZHW A; 2MGH A; 4M4A A; 3QM9 A; 3PI2 A; 1CH2 A; 4UZV A; 5JGG B; 3LB4 A; 2W6V A; 1G0A B; 1HLM A; 3UHZ A; 1YDZ B; 1SHR A; 1JZM A; 3HRW B; 3ZOL A; 5EE4 D; 1UVX A; 4WJG A; 2BWH A; 3ZJS A; 1LJW A; 1M6M A; 2HBD B; 3R0G A; 2DXM A; 1DKE A; 3QM5 A; 1DO3 A; 2FAL A; 1HBB B; 3NML A; 4SDH A; 5CNF A; 3S48 C; 1YFF A; 1VXC A; 1YHU C; 1HAB A; 1J41 A; 1MKO B; 4TYX A; 1A6N A; 2ZSN A; 2BNL A; 3MYN A; 2D6C A; 4N7N A; 1DWR A; 1BIJ A; 3PI8 B; 2VYY A; 2EVK A; 1QSI A; 1GDL A; 2H35 A; 2AUP A; 5CN9 A; 3R5I A; 2EKU A; 1MBD A; 4ZVA A; 1GDI A; 3CY5 A; 1Y4R A; 2ZT2 A; 1OUT B; 1Y7C A; 3WCU B; 3M39 A; 3UGZ A; 3D4X A; 1GBU A; 1MTK A; 1AJH A; 1QSH A; 3SZK B; 1MLN A; 1MLH A; 3GK9 A; 5D5R A; 1LH1 A; 2LHB A; 1YCB A; 1VXG A; 4M4A B; 1MLS A; 2AUQ A; 2H8F B; 4MQG A; 2ZWJ A; 1MBS A; 2W6V B; 1CMY A; 4TWV A; 1SHR B; 2VEE A; 4PQB A; 1EBC A; 1LJW B; 2DXM B; 1DKE B; 5CNB A; 1CH9 A; 1N9F A; 4HRR A; 1V07 A; 1G0B A; 2NSS A; 1YFF B; 1HAB B; 1J41 B; 2GRZ A; 103M A; 1O1J A; 2IG3 A; 1OUU A; 1FLP A; 1YOI A; 4N7P A; 1Y8K A; 4N7N B; 1BIJ B; 1MOB A; 3UHD A; 3SDN A; 3QJD A; 2VHB A; 3S66 A; 5EOH A; 1Y4B A; 3WCV C; 1QSI B; 2ZLV A; 1LA6 A; 2H35 B; 4ESA A; 1YGD A; 4YU3 A; 1BUW A; 3R5I B; 1URY A; 3CY5 B; 2B7H A; 1Y4R B; 3GKV A; 2O58 X; 1Y7C B; 3AT5 B; 1YIH A; 2G0V A; 2W6W A; 1GBU B; 1SDL A; 1Y0C A; 3ARL A; 5ILP A; 3UHV A; 3WFW A; 1QSH B; 3QZZ A; 3VRG A; 2Z8A A; 4M4B A; 1CQ2 A; 1C7B A; 1Y0D A; 1CP5 A; 1MWD A; 4MQG B; 1GDK A; 1CMY B; 3ORD A; 1CH5 A; 2RAO A; 2H8D A; 1MYZ A; 2OH8 A; 2G3H A; 3GQR A; 5HU6 A; 2QFN A; 1A9W E; 2MGI A; 2W72 C; 1WVP A; 1MYG A; 3PIA A; 5JOM A; 1LFT A; 1GCW A; 2FAM A; 2DN2 A; 4HRR B; 1RQA A; 1G0B B; 4H0B A; 2V1H A; 1Y4Q A; 2D2N B; 2V1F A; 4VHB A; 1A0Z A; 3PT7 A; 3EDA A; 3D1A A; 3HYU B; 1CH3 A; 3HXN A; 2MGA A; 2O5Q X; 1O1J B; 3WCT C; 1OUU B; 1YMA A; 4F6J A; 4N7P B; 1Y8K B; 1UFP A; 4IRO B; 1MCY A; 1OFJ A; 3QJD B; 1RTX A; 3S66 B; 1Y4B B; 2ZLV B; 1LA6 B; 4WJG 1; 4ESA B; 1YGD B; 3E4N A; 2GTL C; 4YU3 B; 2HHB A; 1GLI A; 4HBI A; 1GVH A; 1DO4 A; 2G11 A; 3RJ6 A; 4MQI A; 1MLF A; 3GKV B; 2B7H B; 4KN3 A; 2MHB A; 2MGB A; 1HBS A; 3LQD A; 1YIH B; 1Y8I A; 1SDL B; 1TES A; 1NS6 B; 1Y0C B; 4H07 A; 3OVU C; 2GNV A; 3VRG B; 3QZX A; 3UBC A; 3UH5 A; 3UHI A; 4M4B B; 1H97 A; 1HAC A; 3RJN B; 1A6G A; 1X46 A; 1C7B B; 1JY7 A; 1Y0D B; 3OZV A; 4JYQ A; 3K8B A; 3HEP A; 2RAO B; 2EB8 A; 1CLS B; 2H8D B; 1LHS A; 3GQR B; 5HU6 B; 1A00 A; 2NRM A; 3G4V A; 3G4R A; 7HBI A; 4HSW A; 104M A; 3FS4 A; 2DC3 A; 1DM1 A; 3MOU A; 1LFT B; 1GCW B; 1LFL A; 2DN1 A; 1GBV A; 3UHW A; 1SPE A; 2DN2 B; 1MLJ A; 2ZS0 D; 1RQA B; 1NGK A; 5EV5 A; 1HDB A; 2ZSY A; 1Y4Q B; 2QSS A; 1A0Z B; 3PT7 B; 3S1J A; 1YE0 B; 4FC3 A; 3AT6 A; 2AV0 A; 3D1A B; 4FH6 A; 1O1P A; 3HXN B; 3PI4 A; 3S65 A; 2ZT4 A; 1V75 A; 4QAU A; 3HEO A; 110M A; 3UHN A; 3PEL A; 5HLU A; 2HHB B; 4NZI A; 1GLI B; 4F68 A; 3A59 B; 4NI0 A; 4MQI B; 5EUI A; 3QM6 A; 3UHU A; 2MHB B; 1HBS B; 1NZ3 A; 2ZST A; 3LQD B; 1Y8I B; 1MLG A; 1FSL A; 1Y8W A; 5CHR A; 1HV4 A; 3VRE A; 2MYE A; 1O1I A; 5JDO D; 1HAC B; 3IC2 A; 1JY7 B; 2R4W A; 2D5X A; 1COH A; 3AG0 A; 1S0H B; 3K8B B; 3WCP A; 3MJP A; 4DWT A; 1A00 B; 4U8U A; 4NXA A; 3FS4 B; 1O1O A; 1IRC A; 4OF9 A; 2HZ2 A; 1LFL B; 1MNJ A; 1CQX A; 1S69 A; 2DN1 B; 1A9W A; 1DO1 A; 1GBV B; 4WCH D; 3G4W A; 3AQ9 A; 1PMB A; 3OZU A; 1YG5 A; 1CPW A; 4PQC A; 1IT2 A; 3UHY A; 2QSS B; 2GL3 A; 4FC3 B; 1BJE A; 3AT6 B; 2GRF A; 1O1P B; 2SPL A; 3GOU A; 3S65 B; 1V75 B; 3DHR A; 1A01 A; 5CN4 A; 1A6K A; 5M3S A; 2LH6 A; 3KMF C; 1B86 A; 1Y22 A; 3ZJR A; 4X0L A; 4NI0 B; 5EUI B; 1HHO A; 1X9F C; 2R4X A; 1RVW A; 1DUO A; 1Y8W B; 3S1I A; 1HV4 B; 3VRE B; 1YOG A; 1O1I B; 3ZOM A; 1MLK A; 2O5T X; 4H2L A; 3IC2 B; 1M6C A; 2D5X B; 1Y8H B; 1COH B; 1FAW A; 1OBM A; 5KDQ A; 2BLI A; 3MJP B; 3QMA A; 5CN5 A; 2MYA A; 1MZ0 A; 2HBF A; 2ZFO D; 3A0G A; 3ARJ A; 1K1K A; 6HBI A; 1J3Z A; 4U8U B; 3WFX A; 1NS9 A; 3OO4 A; 2G0Z A; 1RPS A; 1O1O B; 1V9Q A; 3ZJN A; 1OR4 A; 1G09 A; 1PBX A; 1NZ5 A; 3QJC A; 5EE4 C; 2VEB A; 3KMF A; 3P5Q A; 4F6I A; 1YG5 B; 1UMO A; 2XKI A; 2R1H B; 1B0B A; 2V1I A; 3DHR B; 4B3W A; 1DWS A; 4NXC A; 1A01 B; 1MOC A; 1KR7 A; 5C6E A; 1O1K A; 1IBE A; 1J7Y B; 1S5Y A; 1MNI A; 1B86 B; 1Y22 B; 1LH7 A; 4X0L B; 1HHO B; 2G0R A; 5E6E A; 1HLB A; 1RVW B; 1J7W A; 1KD2 A; 2W31 A; 3GYS A; 1VRE A; 4H2L B; 3OGB A; 1HRM A; 1FN3 B; 2WTH A; 1FAW B; 2LH3 A; 1BBB A; 2YRS A; 2HBF B; 3A0G B; 1K1K B; 1J3Z B; 2M6Z A; 2MGJ A; 1NS9 B; 2ZS1 A; 3M3A A; 1RPS B; 2EVP A; 3OJ1 A; 1PBX B; 3QJC B; 1I3E A; 1Y4V A; 3EDB A; 2FRI X; 111M A; 3M3B A; 1AZI A; 3WTG A; 4ZVB A; 2MGD A; 2V1K A; 3MVC A; 2NSR A; 5AB8 A; 4FWZ A; 3UHR A; 3LR9 A; 5C6E B; 1O1K B; 1S5Y B; 2OLP A; 2ZSQ A; 105M A; 1NZ4 A; 2ZT1 A; 4GZG A; 1ASH A; 1YMC A; 2GKN A; 5E6E B; 3UGY A; 1J7W B; 1KD2 B; 3UHX A; 5SW7 A; 3QQR A; 1UVY A; 2OHB A; 3GYS B; 1YGF A; 2D2M B; 3DUT B; 3WHM A; 1XY0 A; 1R1X A; 1BBB B; 3DHT A; 3WR1 A; 2YRS B; 1OJ6 A; 112M A; 2M6Z B; 1XZ5 A; 2GKM A; 2ZS1 B; 3NMM A; 1MYT A; 1YHU A; 4BJA A; 1NPF A; 2QU0 A; 3BA2 A; 1BZP A; 5EYS A; 2Z6S A; 1NPG A; 1UX9 A; 3WI8 A; 1Y4V B; 1YEV A; 2G10 A; 1D8U A; 2BLJ M; 2VYW A; 4ILZ A; 4F4O A; 3WTG B; 1BIN A; 5CNE A; 5D1V A; 1HDS A; 1S56 A; 3O89 A; 4O1T A; 1BZ0 A; 1XZ7 A; 1RSE A; 2PEG A; 1LH5 A; 3BCQ A; 1BZR A; 2O5M X; 2EKT A; 2GLN A; 1ABW A; 1HSY A; 1HDA A; 3UBV A; 2G0S A; 2C0K A; 2ZLU A; 1BZ6 A; 3WCW D; 1JZK A; 1MWB A; 1C40 A; 1LFZ A; 5ILR A; 1JZL A; 1LHT A; 5SW7 B; 1YGF B; 4HHB A; 3D4X B; 1ABS A; 1S6A A; 3WHM B; 1U7S A; 1XY0 B; 2MGE A; 3DHT B; 3WR1 B; 2MGK A; 2VLY A; 4O2G A; 3UHG A; 107M A; 1XZ5 B; 2D2N D; 3B75 A; 1HBR A; 3NMM B; 3MYM A; 1YH9 A; 2LH7 A; 1YHU B; 1JDO A; 2QU0 B; 1YEV B; 3GDJ A; 2LH1 A; 1J52 A; 1MLO A; 2PGH A; 1RQ3 A; 3HF4 A; 4F4O B; 3WCV A; 4MQC A; 4ODC A; 3LB1 A; 1HDS B; 1F5P A; 2ZS0 C; 1BZ0 B; 4NI1 A; 1XZ7 B; 4UIQ A; 2FRJ X; 3ZJI A; 1VXH A; 2PEG B; 1M9P A; 1YZI A; 1LFQ A; 3BCQ B; 1SI4 A; 1ABW B; 1YOH A; 2BLH A; 1HDA B; 3D7O A; 2ZLU B; 1NAZ A; 2HBS A; 1A3N A; 3LR7 A; 3AQ5 A; 1MBA A; 1BUW B; 5C6Y A; 1C40 B; 3ZJQ A; 1LFZ B; 4PNJ A; 1CH4 A; 3ASE A; 2W72 A; 4O4Z A; 1EBT A; 1NWN A; 1MOH A; 1MYH A; 3D1K A; 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1DTM A; 1IOP A; 3G46 A; 1DWT A; 2QMB A; 2WTG A; 4L2M A; 4XDI A; 4ROM B; 2HBE B; 2GTL B; 1QPW A; 2ZLW B; 1Y0A A; 1HDB B; 1IRD A; 3HHB B; 1DXT A; 1T1N B; 2HHD A; 1OFK A; 2QSP A; 1VXB A; 1YCA A; 3PI9 B; 3IA3 B; 1Y31 B; 1MNO A; 1XZ4 A; 5AZR A; 1YEN A; 1XQ5 B; 3RGK A; 1YIE B; 3PEL B; 1VXE A; 1NWI A; 1AJ9 B; 1MLQ A; 1MNH A; 1Y7G B; 4U8U D; 5CN7 A; 1XXT A; 4XS0 A; 1MYJ A; 1VWT A; 1HGC A; 1V5H A; 1A3O A; 3ONZ B; 3G4Y A; 1QI8 A; 2D5Z A; 2MGF A; 1Y5K A; 3A5B A; 4NK2 A; 1AJG A; 1X3K A; 2VRY A; 3GQP B; 1HBI A; 1YEO A; 3WCP B; 3A5A A; 1UIW B; 2ZFB A; 4O35 A; 1YHE B; 1V4U B; 3QQQ A; 1N9H A; 2WY4 A; 3E5O A; 2RI4 B; 1GCV A; 1Y83 A; 2LH5 A; 2QMB B; 1N9X A; 3EOK A; 1QPW B; 3UHQ A; 1Y85 A; 2O5L X; 1Y0A B; 1U7R A; 1IRD B; 2G14 A; 1JEB A; 3PI3 A; 1MBN A; 2HHD B; 5JGG A; 3M38 A; 1X9F A; 4HRT A; 2QSP B; 3CIU A; 1LH2 A; 3BJ3 A; 3GOU B; 3IC0 A; 2ZLT A; 1XZ4 B; 3D17 A; 1YEN B; 2AV3 A; 1UX8 A; 2VM0 A; 1CO8 A; 1CIK A; 5E29 A; 4DWU A; 3G4U A; 1YVT A; 1JF3 A; 1XXT B; 4XS0 B; 2ZSX A; 5EQM A; 1VWT B; 1CG8 A; 1FSX A; 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