The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
60
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Distal pocket control of nitrite binding in myoglobin
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Myoglobin
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| molecule tags |
Transport protein
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| total genus |
60
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-12-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1A3N B; 1ABW A; 2FAL A; 1XYE A; 1Y0T B; 1OUT B; 1Y8W B; 4MQJ B; 2ZLV B; 3LB1 A; 1MOB A; 2BMM A; 3M3B A; 1SPG A; 1JZM A; 4NK1 A; 2LHB A; 5EYS A; 3HF4 A; 3GKT A; 4MU5 A; 1NAZ A; 1Y5J B; 3LQD A; 3WTG A; 3QJD A; 1YHU D; 2W6Y A; 1V5H A; 1QSI A; 1X9F B; 1YVT A; 1GDI A; 3SDH A; 1RVW B; 1CLS A; 3ZJP A; 4MQK B; 2GTL C; 4QAU A; 1O1K B; 3FS4 B; 2GLN A; 2W6V A; 3WCV A; 1YE2 B; 4ROL B; 3D17 A; 2R4X A; 3OVU C; 5KER B; 3NFE A; 3S66 B; 1A00 A; 1FCS A; 1S56 A; 1HCO B; 2HBS A; 1J41 A; 3UH3 A; 5MBN A; 1MBC A; 1A6M A; 2EF2 A; 1HBS A; 1VWT A; 3UH6 A; 1Y4G B; 1HBH A; 3UH5 A; 2BNL A; 1LFL B; 1MLR A; 2H35 A; 2HHD B; 1MOH A; 2KSC A; 4H2L A; 2GNV A; 1Y45 A; 1MOC A; 2ZFO B; 3A59 B; 2D60 B; 1CG8 A; 2G3H A; 1FAW A; 3PI8 B; 4X0L A; 2DHB A; 5HLX A; 2QU0 B; 1K1K A; 1IRD B; 3ZJQ A; 3KMF C; 1JY7 B; 5D1V A; 1O1O A; 4M4B A; 3MOU A; 2HZ2 A; 1R1Y B; 3UHQ A; 1Y0C A; 2HBS B; 1CH2 A; 3ED9 A; 1NZ5 A; 3HRW B; 5CN9 A; 1OUU A; 4OF9 A; 3V2Z A; 1Y83 A; 3UHT A; 1A0Z A; 3ONZ B; 2W6W A; 1S5X A; 1O1P A; 3ZOL A; 4G1B A; 1QXD A; 1YDZ A; 3M38 A; 3DUT A; 1G0B B; 3G53 A; 2HBC B; 1Y45 B; 3O89 A; 3WCT A; 3IC2 A; 5KDQ A; 1CG8 B; 1WMU A; 2VEE A; 1C40 B; 1FAW B; 2MB5 A; 3WCW C; 5EV5 A; 1PBX A; 1V07 A; 2BLI A; 3AQ5 A; 1XZ4 A; 3UBV A; 1FN3 B; 1Y4Q B; 1MYI A; 1FDH A; 4O35 A; 2GDM A; 1V75 B; 3NL7 B; 2HHB A; 2O5S X; 1CH1 A; 1Y83 B; 2HBD A; 3WFU A; 1A0Z B; 2HBF A; 1JF3 A; 3K8B A; 4HRT B; 5EYJ A; 3UGY A; 1Y4B A; 1HAB B; 105M A; 3BOM B; 5JGG A; 2BK9 A; 1HDA A; 1J3F A; 1O1P B; 3A0G A; 1A3O B; 3OGB A; 3UGZ A; 3DUT B; 2MYB A; 5AZQ A; 2NRL A; 2RI4 B; 1I3E A; 2D2N C; 3PT8 B; 4IRO B; 1YE0 B; 1CO8 A; 1MTI A; 5ILP A; 1DWT A; 1XZ4 B; 3WFX A; 4JAC A; 1C7B B; 1UC3 A; 1Y2Z A; 3A9M A; 4ESA B; 1IWH A; 1NPF A; 2MGE A; 4B4Y A; 1X3K A; 2ZT1 A; 1MBN A; 2D5X A; 2HBD B; 3OZV A; 4YU3 A; 3D1K B; 2DC3 A; 5HY8 A; 3LB3 A; 3FH9 B; 1HDA B; 1R1X A; 1NEJ A; 1JP6 A; 1CO9 A; 2PGH A; 3A0G B; 2MGL A; 3UHV A; 5ILE A; 2GTL D; 1N9F A; 4HBI A; 2OHA A; 4PQB A; 1AZI A; 3QJC A; 1O1J B; 1HBA B; 3S65 A; 2QLS A; 1SHR A; 4N7N A; 1QI8 A; 3MVC A; 4NI1 B; 1XZU A; 2BWH A; 2LH5 A; 3GYS A; 4ROM B; 1I3D A; 1QSH A; 3GDJ A; 1V4W A; 2AV0 A; 2V1J A; 1MLM A; 3G4Q A; 4N7P A; 3PI9 A; 1RQ4 B; 4MQG A; 3UHN A; 1A01 A; 1YGD B; 1LFT A; 3PT7 A; 1FHJ B; 1HBR B; 1YHU C; 2HHE B; 3OK5 A; 1CH5 A; 2O5L X; 2HCO A; 1CG5 B; 3GQG A; 1YFF B; 5HY8 B; 1MBO A; 1XQ5 A; 1Y4R B; 2G0Z A; 3PI1 A; 4DWT A; 4AVD A; 3HC9 A; 5C6E B; 4MAX A; 1A0U A; 1JDO A; 3UH7 A; 1XZ2 A; 3E5O A; 1LFQ B; 3QJB A; 3UHR A; 4XS0 A; 1YZI B; 2ZS0 D; 3NG6 B; 3EU1 A; 5CN5 A; 4IT8 A; 1VXG A; 4N7N B; 1HBG A; 1Y0W A; 1QI8 B; 4AVE A; 2R4W A; 4GZG A; 3OZU A; 1HGB A; 2BKM A; 1YEO A; 5EQM A; 1HDB B; 1BZ6 A; 4PQ6 A; 4U8U B; 1MYT A; 1MTK A; 2NSS A; 2ZSQ A; 1OJ6 A; 2NRM A; 3AQ9 A; 3OO5 A; 4G1V A; 1MTJ A; 1LFV A; 3WR1 A; 4FWX A; 3AT5 A; 1ECD A; 3E5I A; 3HYU B; 1W92 A; 4N7O A; 3ODQ A; 1QPW A; 3UHB A; 4UZV A; 1HBB B; 1D8U A; 3QM6 A; 2AUO A; 3SZK B; 3VRG A; 1Y31 A; 4DWU A; 2GRZ A; 4BJA A; 3EDB A; 3ECZ A; 2PEG A; 3GQR B; 3WFT A; 3PI2 A; 1U7R A; 2WTG A; 1G09 A; 1YIE A; 1GLI B; 3GQP A; 4O1T A; 2ZFB B; 3WCW D; 1O1L A; 1YVQ B; 2ZSN A; 4O2G A; 3QJB B; 1DTI A; 2GNW A; 1B86 A; 3ZJI A; 2ZLU B; 4B3W A; 1IT3 A; 3D4X A; 3HHB A; 3EU1 B; 4L7Y B; 3S48 C; 1UMO A; 2D2M B; 3MJU A; 1NZ2 A; 1CP5 A; 1MLS A; 4DC7 A; 3A2G A; 2AA1 B; 1DXT A; 2ZLT B; 1RTE A; 1CQX A; 1Y5F B; 2MGG A; 1LH2 A; 3OO5 B; 1DO3 A; 1YH9 A; 2H8F B; 2V1K A; 1QXE B; 1K0Y A; 3UHZ A; 3ZH0 A; 1LFV B; 3MKB B; 2ZS1 A; 1VXD A; 1O1I B; 1MOA A; 1YEQ A; 1Y35 A; 1HGC B; 1S0H B; 2ZSP A; 1JZK A; 2PEG B; 2MGK A; 2ZT2 A; 3WCU A; 1MYH A; 1G09 B; 4YU4 B; 1VXF A; 6HBW A; 1NQP B; 3R0G A; 1ECA A; 1DUO A; 1PMB A; 1J52 A; 1Y0T A; 1OUT A; 1B86 B; 2ZLV A; 1YHE B; 1UFJ A; 2DN3 B; 2OLP A; 2MGC A; 3MJU B; 2MYE A; 1UFP A; 3WHM A; 1DXT B; 1Y22 B; 5JDO D; 2EVP A; 1LHT A; 1CPW A; 1X9F A; 1KD2 A; 2MHB B; 2MYD A; 1NS6 B; 1X46 A; 2D6C A; 2VRY A; 1LH5 A; 1Y8H A; 1RVW A; 4MQK A; 1VXA A; 3MYN A; 2ZT4 A; 3WCV D; 1O1K A; 3FS4 A; 4JYQ A; 1YHR A; 2FRI X; 3G4R A; 2GKM A; 2RAO B; 3QJE B; 4ROL A; 1LH1 A; 1SI4 B; 2GRF A; 5KER A; 1A9W E; 1G9V B; 3S66 A; 3UHX A; 1J3Y B; 4MXL A; 1YOI A; 1OBM A; 1U7S A; 1S61 A; 1DXD A; 1XZV B; 1Y4G A; 1GVH A; 2V1G A; 1DUK A; 1J7Y B; 2R50 A; 1VXE A; 1LFL A; 3IXF A; 3WHM B; 1LJW B; 2HHD A; 3GOU A; 1URY A; 1KD2 B; 1JL7 A; 1VRF A; 2EB8 A; 2ZFO A; 1RPS B; 1Y8H B; 3A59 A; 2D60 A; 1Y4V B; 3E55 A; 5CNE A; 1A4F B; 1DLY A; 1YHR B; 1XZ5 A; 3PI8 A; 1VXB A; 1Y0A B; 3K9Z A; 2QU0 A; 1GJN A; 1IRD A; 1KFR A; 1JY7 A; 3B75 B; 4NXC A; 3CIU B; 1CH7 A; 1MKO B; 1J3Z B; 1R1Y A; 5CN8 A; 3ZOM A; 4MBA A; 1Y5K B; 3HRW A; 1XXT A; 3P5Q A; 3A5G A; 5E83 B; 3TM9 A; 3G4V A; 4HRR B; 3ONZ A; 1CP0 A; 2QMB B; 2D2N B; 4NI0 B; 3GOU B; 2ZSS A; 3ECX A; 3VHB A; 1LFZ B; 1GCV B; 1GCW B; 1G0B A; 3WCT D; 1MLU A; 2HBC A; 4ZVA A; 5MBA A; 3MJP B; 5JDO E; 3PI3 A; 2VHB A; 1V9Q A; 2ZLW B; 3QZX A; 1JEB B; 2BLH A; 2GKN A; 1C40 A; 1MWC A; 1XZ5 B; 4F6G A; 2BLJ M; 1DTM A; 1S5Y A; 2GL3 A; 3UHS A; 2ZS0 C; 1FN3 A; 3MYM A; 1RQA A; 3H57 A; 1Y4Q A; 3VAU A; 2MYC A; 2W72 C; 1BZZ B; 1YEV B; 1V75 A; 1CBL A; 3NL7 A; 2Z85 A; 5CHR A; 1XXT B; 1YMA A; 3P5Q B; 2V1E A; 2O5Q X; 1UX8 A; 1BUW A; 1MWD A; 2MGB A; 1MBA A; 5CND A; 2AUR A; 4HRT A; 3TLD A; 1MLK A; 1HAB A; 1XCH A; 3BOM A; 1Y09 B; 2E2Y A; 1SDK B; 2QRW A; 3H58 A; 4ODC B; 3ZJL A; 1A3O A; 1WVP A; 4KN3 A; 3WCU C; 1F65 A; 4HHB A; 3ARK A; 3NMM B; 1NWI A; 4KMW A; 2RI4 A; 3PT8 A; 3M3A A; 5ILR A; 1LUE A; 2DN1 B; 1BIN A; 4IRO A; 1YE0 A; 1UVY A; 1FLP A; 1YHU B; 1YOG A; 1DWR A; 3ZJJ A; 1S5Y B; 1NXF A; 1J7S A; 2G12 A; 1C7B A; 5SW7 B; 1RQA B; 3UI0 A; 4MQH B; 1IRC A; 4ESA A; 1G08 A; 1X9F C; 2QFK A; 1F63 A; 3AT6 A; 3KUN A; 3QMA A; 3D1K A; 2AUQ A; 1BUW B; 1LH7 A; 4F4O B; 3VRF B; 1MBI A; 4VHB A; 3FH9 A; 1BBB B; 2W31 A; 4XDI A; 4H07 A; 4HHB B; 5IKS A; 1DXU B; 1VXC A; 2B7H B; 2OH8 A; 3A5A A; 1UIW B; 2WY4 A; 1O1J A; 1HBA A; 4MQI A; 1Y8K A; 4HSX A; 1H1X A; 3ZJH A; 4N8T A; 4NI1 A; 4ZVB A; 1MLN A; 4ROM A; 2NSR A; 1J7S B; 1Q1F A; 1HV4 A; 3UHE A; 1CMY B; 3OO4 B; 4TWV A; 1RQ4 A; 2ZSZ A; 1YGD A; 1G08 B; 1FHJ A; 4ILZ A; 1HBR A; 5JDO C; 2HHE A; 3AT6 B; 2VYY A; 2ZFO C; 1CG5 A; 2MGH A; 2XKG A; 1EBT A; 1YFF A; 1GZX B; 3V2V A; 4MXK A; 1Y4R A; 3BCQ B; 2HBG A; 1DO4 A; 1LH3 A; 5C6E A; 1YGF B; 1YEU B; 3WCV C; 4TYX A; 5CN7 A; 1LFQ A; 1NZ4 A; 4M4A B; 3CY5 B; 1YZI A; 1YG5 B; 5CN6 A; 4MQI B; 3NG6 A; 1Y8K B; 4O4Z A; 4N8T B; 3AG0 A; 1HDB A; 4U8U A; 2ZST A; 1HV4 B; 3MN0 A; 2R1H B; 1NGK A; 1HRM A; 101M A; 1BZ0 B; 1HHO B; 3ZJM A; 3HYU A; 2MGI A; 1NZ3 A; 1HBB A; 3DHR B; 3SZK A; 1MLL A; 1O1M B; 2HBE B; 3UHY A; 4F6I A; 2MBW A; 4FC3 B; 1Y0D B; 3GQR A; 1CIO A; 1DXC A; 2ZLX B; 5EET A; 1GLI A; 3HXN A; 2ZFB A; 1BIJ A; 1Y7C B; 1YVQ A; 2G10 A; 1Y46 B; 1EW6 A; 2EB9 A; 2ZLU A; 1LFY B; 4L7Y A; 1JW8 A; 2D2M A; 6HBI A; 2V1F A; 1OFJ A; 2AA1 A; 1AJ9 A; 2G0S A; 2ZLT A; 3R5I B; 2QFN A; 1Y5F A; 2EKU A; 5EE4 D; 1M9P B; 2H8F A; 1QXE A; 2ZS1 D; 1GBV B; 3G46 A; 3MKB A; 5EOH A; 3ORD A; 3G4W A; 3BA2 A; 4F69 A; 1O1I A; 3IC0 B; 1HGC A; 2M6Z A; 3WCT C; 3WCU D; 1S0H A; 1IOP A; 1B0B A; 5F0B A; 4WCH D; 4NXA A; 4YU4 A; 2ZSR A; 1NQP A; 1Y7G B; 4DC8 A; 1L2K A; 3PEL B; 3HXN B; 5AB8 A; 1BIJ B; 2MYA A; 1MBD A; 1DM1 A; 1EMY A; 2W6X A; 3UHH A; 1YHE A; 2DN3 A; 4H0B A; 1THB B; 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3WCW B; 1GCV A; 1GCW A; 3ZJS A; 2C0K A; 1DO1 A; 3MJP A; 1UVX A; 2QSS A; 4G51 B; 1MLG A; 3WCP B; 2AUP A; 2ZLW A; 1H97 A; 2D5Z B; 1JEB A; 3D1A B; 3LHB A; 2H8D B; 2R4Z A; 1UX9 A; 2Z6N A; 2DN2 B; 2D2M C; 3U3E A; 3BJ2 B; 1JZL A; 1BAB A; 2DXM B; 3G52 A; 1A6N A; 1ABS A; 1DO7 A; 3O7N A; 1CH3 A; 3HEP A; 1BZZ A; 1YEV A; 3AQ7 A; 5E6E B; 1G0A B; 1AJG A; 1Y4P B; 1CQ2 A; 2CMM A; 2R80 B; 3S1I A; 2LH6 A; 2YRS A; 1Y09 A; 2VLZ A; 1SDK A; 4ODC A; 1Y7D A; 1ABW B; 1KR7 A; 4OOD A; 1XYE B; 2LH2 A; 3NMM A; 1A6G A; 5D5R A; 1SPG B; 3ASE A; 2QSS B; 3QM8 A; 3HF4 B; 2G0R A; 1SWM A; 2DN1 A; 3WTG B; 3LQD B; 3QJD B; 1QSI B; 1YVT B; 1EWA A; 1NWN A; 1YHU A; 2Z6N B; 2G11 A; 5SW7 A; 4FH7 A; 1CLS B; 1BAB B; 4MQH A; 1RTX A; 5B84 A; 2O58 X; 4MBN A; 2W6V B; 5JOM A; 1BZ1 A; 1FSX A; 3WCV B; 2ZSX A; 3GK9 A; 5EE4 C; 3D17 B; 3OJ1 A; 4F4O A; 2ZS1 C; 2FRJ X; 3LR9 A; 3VRF A; 1HAC A; 3NFE B; 1A00 B; 2YRS B; 1BBB A; 1T1N A; 1J41 B; 2SPN A; 1Y7D B; 1HBS B; 1VWT B; 1DXU A; 1WLA A; 2B7H A; 1HBH B; 3D7O A; 1UIW A; 4FWZ A; 1OFK A; 4C44 A; 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