The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
54
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sequence length |
136
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structure length |
136
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Chain Sequence |
MTREEIKMIQKSWLRVIDKMDEAGLLFYRRLFDVEPKVRPLFKIDIEKQGRKLMDVLNWIVLNLQDIDAALDAARELARRHVKYGVKAEHYPVVGHTLIWTLRKMIGSEWTKQLEQLWTQAYEALAQVMIEEHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of a Novel Site-Swapped Globin: Proximal and Distal Sites Constituted by Two Separate Subunits
rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin-like flavoprotein fused to Roadblock/LC7 domain
|
| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Methylacidiphilum infernorum
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| total genus |
54
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| structure length |
136
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| sequence length |
136
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-07-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SHR B; 1NZ2 A; 1YH9 A; 2ZS0 D; 4MBA A; 1Y31 A; 1DUO A; 2D2N A; 1YEO B; 2GTL B; 1NS9 B; 3NMM A; 5CN5 A; 2MYD A; 2NRL A; 1Y0D A; 2HBS A; 1CH5 A; 2H35 B; 1JEB B; 3MJU A; 3GDJ B; 2HHD A; 2QSP B; 4UZV A; 1N9H A; 1V4W B; 2GRF A; 1J3F A; 2GKM A; 2D60 B; 3WCW C; 1A3O B; 4MQK A; 1YIE A; 3UHC A; 5EYS A; 2H8D A; 5EE4 C; 2ZLT A; 2EKT A; 3HEO A; 3QJC A; 3SDN A; 1S61 A; 1UIW B; 4HRR A; 1S69 A; 1HLB A; 1GLI B; 3K3U A; 1BZ1 A; 2VEB A; 3G53 A; 3V2Z A; 2V1H A; 1AJG A; 2Z6S A; 1DWT A; 1HBR B; 1Y4P A; 4B4Y A; 5CN7 A; 1MLH A; 4MPM A; 1BZ0 A; 5B85 A; 1L2K A; 1AJ9 A; 1Y83 B; 2R80 A; 4FC3 B; 1A4F B; 3BJ3 B; 1BJE A; 3UHY A; 1JWN A; 1MLO A; 3FS4 A; 1NS6 A; 1M6C A; 3SDH A; 1Y0T B; 2ZS0 C; 1Y2Z A; 1A6G A; 1HBB B; 1LJW A; 4M4A B; 1LFL A; 3OO5 A; 1LHT A; 1YGD A; 3WCW A; 1S5Y B; 1OUU A; 1LHS A; 3EDA A; 1BZZ A; 3B75 A; 1VXH A; 1NXF A; 4X0L A; 1OUT B; 1MYZ A; 2O5L X; 1R1Y B; 5CND A; 1RQ3 A; 1DO1 A; 3DHR B; 1YGF A; 1LH3 A; 4F68 A; 1Y4B A; 1BVD A; 1J7Y B; 3ZJN A; 2V1F A; 1HGC B; 105M A; 2MGJ A; 3OO4 A; 1YHR B; 4F6J A; 2O5T X; 2W72 C; 2D6C A; 2ZSO A; 1MLJ A; 3BA2 A; 4OOD A; 3DHT A; 1IDR A; 1QSI A; 3GKV B; 3W4U A; 3BOM A; 1NWN A; 6HBI A; 2EF2 A; 3LR7 A; 1C7D A; 2HCO A; 1YH9 B; 3UHZ A; 2ZS0 A; 3QZZ A; 1HBG A; 1Y31 B; 1CIO A; 1HAC A; 2D2N B; 3NMM B; 1Y0D B; 2HBS B; 2O5B X; 1DM1 A; 2HBF A; 5HAV A; 1JL7 A; 3VRG B; 2R50 A; 1C7B A; 4O1T A; 1VXA A; 1URV A; 1GDK A; 3MJU B; 1J41 A; 1JP6 A; 2HHD B; 5CHR A; 1YMB A; 4U8U D; 1MLR A; 2ZLU B; 1VRE A; 1XZ4 A; 4MQK B; 2FAM A; 2MB5 A; 1YIE B; 2BLJ M; 2ZS1 D; 2OHA A; 1MLN A; 1A3N A; 2ZLT B; 2NX0 A; 3GQR A; 5C6E A; 3QJC B; 1CH3 A; 3KUN A; 4HRR B; 3ECL A; 1YDZ A; 2MGC A; 3LB3 A; 1RPS A; 2W72 A; 4PQB A; 3R5I A; 1NZ3 A; 1Y7Z A; 2VLX A; 1BZ1 B; 2VM0 A; 3KMF C; 1OFJ A; 2ZLW B; 1ITH A; 1QPW B; 1BZ0 B; 5EOH A; 1AJH A; 3M3B A; 1FAW A; 104M A; 3A5B A; 4PQC A; 2R80 B; 1QXE A; 106M A; 1FDH G; 1JP8 A; 2BLI A; 1YVT A; 2VLY A; 4O4Z A; 1IOP A; 1Y4G A; 4C44 A; 4GZG A; 1DO3 A; 1Y2Z B; 1Y01 B; 2G14 A; 1LJW B; 3WCP A; 3OO5 B; 4ODC A; 1IBE A; 2G12 A; 1YGD B; 1MBC A; 2ZSN A; 4G51 A; 2WTH A; 2ZSZ A; 2R4Y A; 1HHO A; 1MLK A; 1DLY A; 1G9V A; 3PI3 A; 1BZZ B; 1NPG A; 3B75 B; 4X0L B; 3A5A A; 1RTE A; 1YG5 A; 3O7N A; 3H58 A; 1KFR A; 3VAU A; 4U8U C; 2W31 A; 1G08 A; 1B0B A; 2DC3 A; 2IG3 A; 3PT8 A; 3WI8 A; 4L7Y A; 1LH5 A; 2O5O X; 3G4R A; 3KMF A; 1WLA A; 2GNW A; 2LH5 A; 1O1O A; 1Y4B B; 1MLM A; 3PI1 A; 1CLS A; 1RSE A; 2MGK A; 1YHU A; 1ABS A; 3OO4 B; 3S1I A; 3BJ2 A; 1MYI A; 2ZWJ A; 3ARK A; 3DHT B; 3LB2 A; 1QSI B; 3UHV A; 3W4U B; 2XKI A; 4LPI A; 2HZ2 A; 3M3A A; 5HLX A; 1NQP A; 2HCO B; 5KKK A; 1LFV A; 3MBA A; 2ZS0 B; 1HAC B; 3KUO A; 5HU6 A; 3S65 A; 3PI8 A; 2FAL A; 2WY4 A; 4MQJ A; 5KER A; 2HBF B; 3WCU B; 3IC2 B; 3WCT D; 5CHQ A; 3ZOM A; 4NXA A; 2W6W A; 1B86 A; 2IN4 A; 2W6V A; 1D8U A; 2ZSX A; 1BUW A; 3GLN A; 4U8U A; 1CPW A; 4F6D A; 1YZI A; 5EET A; 1A0Z A; 2ZS1 A; 2ZSY A; 5JDO E; 3PI4 A; 3GQR B; 1XZ2 B; 5C6E B; 2D5X A; 1YDZ B; 4F6B A; 1MOC A; 3R5I B; 3WFX A; 5EYJ A; 1Y7Z B; 2DXM B; 2EB8 A; 1GZX A; 3H57 A; 4MAX A; 4TWU A; 5ILM A; 1N9I A; 3LQD A; 1F5O A; 5JDO D; 2QFK A; 2MBW A; 3UHG A; 1MBI A; 1A0U A; 1A01 B; 2DN3 A; 3WFW A; 1UVY A; 3GK9 A; 5AB8 A; 1CBM A; 1XZV B; 3QJD B; 1QXE B; 2KSC A; 1COH A; 1OJ6 A; 1LFZ B; 1FN3 A; 2LH2 A; 5HLU A; 3UHI A; 5IKS A; 2D2M A; 1VXF A; 1Y4G B; 3S48 C; 1O1L A; 1GCW A; 1DXT A; 1Y0W A; 3AT5 B; 3SZK A; 1ABY B; 1HLM A; 5CMV A; 3ZJR A; 1HAB B; 3WCP B; 4ODC B; 1SI4 A; 1IBE B; 2O5Q X; 1IRC A; 4ROL B; 4G51 B; 3UHN A; 1G9V B; 1ABW A; 1H97 A; 2ZSR A; 3VHB A; 3WCT C; 5JGG A; 3UHW A; 3BCQ A; 3QMA A; 2QFN A; 3E55 A; 2HBD A; 2VLZ A; 2MGD A; 3OGB A; 2LH1 A; 1YG5 B; 2SPO A; 1CG8 A; 1PMB A; 2VRY A; 4C0N A; 3DR9 A; 2O5M X; 1G08 B; 3PT8 B; 1YFF A; 4UIQ A; 1DKE A; 3ZJH A; 1O1O B; 3MYM A; 1BIJ B; 1SDL A; 1FSX A; 1CLS B; 1OR6 A; 1Y7D A; 1YHU B; 1MKO A; 3MJP A; 4M4B A; 5JDO F; 1LH1 A; 2MYB A; 1WMU A; 2BKM A; 2MHB A; 1BZR A; 2V1E A; 1MOD A; 1K0Y B; 5JDO C; 2ZLV A; 1MTI A; 1HGB A; 3ZHW A; 1NQP B; 1W92 A; 5M3S A; 1LFV B; 1GJN A; 2SPL A; 4UUR A; 3HEN A; 1JZL A; 1X9F D; 3S65 B; 2VEE A; 5HU6 B; 1YIH A; 3QJB A; 1MCY A; 3PI8 B; 2AUR A; 3K8B A; 1YEV B; 3ARJ A; 4MQJ B; 3QJE A; 4OF9 A; 1YEN B; 3A5G A; 111M A; 4F6F A; 1BZ6 A; 1B86 B; 4YU3 A; 4MQG B; 2NRM A; 1TES A; 4F6G A; 1YZI B; 4NI0 A; 1Y85 A; 4ROM A; 2ZS1 B; 1GDJ A; 3ARL A; 1HV4 A; 3G4Q A; 2D5X B; 1GBU A; 2PEG A; 1HJT A; 1MNH A; 3D17 A; 1A9W E; 1TU9 A; 1GZX B; 3GQP B; 1YEU B; 4F69 A; 3LQD B; 3QM5 A; 2WTG A; 1Y4V A; 3IXF A; 3A0G A; 1A0U B; 2DN3 B; 3ZJP A; 1THB B; 1HCO B; 1MOA A; 4KMW A; 3OJ1 A; 2ZT2 A; 1XZ7 A; 1COH B; 1GBV A; 4FWZ A; 1FN3 B; 1J7S A; 3QQR A; 2D2M B; 3ZH0 A; 1CO9 A; 2HHB A; 1V07 A; 1LTW A; 1Y09 A; 1KD2 A; 1O1L B; 1GCW B; 1Y0W B; 3SZK B; 4O4T A; 1Y8W A; 4MQC B; 1X9F C; 1NAZ A; 1SI4 B; 2Z6N A; 4AVE A; 1SPE A; 2NSS A; 3G4W A; 1OBM A; 1NZ5 A; 1NEJ A; 1ABW B; 3D4X A; 5JGG B; 3BCQ B; 3OK5 A; 1H1X A; 2FRI X; 2AA1 A; 1LFQ A; 1MYJ A; 5CNC A; 1CG8 B; 1Y8H A; 1UC3 A; 3QM6 A; 5ILP A; 3LB1 A; 2R1H A; 4FH6 A; 1BIN A; 1DKE B; 3WTG A; 3MOU A; 2ZFO B; 1C40 B; 3K9Z A; 3OVU C; 110M A; 1FSX B; 2RAO A; 3ODQ A; 1LA6 A; 1XZ5 A; 1MKO B; 2G10 A; 1MLF A; 5F0B A; 3MJP B; 3UH3 A; 4M4B B; 1V75 A; 2QSS A; 1MTJ A; 1M9P A; 4H2L B; 1Y5J A; 1WMU B; 2MHB B; 1O1J A; 1J3Y A; 1IRD B; 3A2G A; 2MGG A; 1V4X A; 3WCV B; 3WR1 A; 1HGB B; 4IRO A; 4HRT A; 1IWH A; 4O2G A; 107M A; 1X9F A; 1YIH B; 3QJB B; 4N7O A; 2ZT1 A; 1LH7 A; 3K8B B; 3RJ6 A; 1Y0C A; 4YU3 B; 1RQA A; 3ECZ A; 5E29 A; 1CMY A; 2GTL D; 4MQH A; 1K1K A; 2G0Z A; 4ROM B; 1DUK A; 1MNO A; 2H8D B; 3HC9 A; 1YCA A; 1HV4 B; 3M39 A; 3HXN A; 2EVP A; 1GBU B; 2PEG B; 1Y35 A; 3D17 B; 4MQI A; 3GKT A; 2XYK A; 3PEL A; 1Y4P B; 1O1N A; 2D5Z A; 2HBE A; 1MBO A; 3A0G B; 1F5P A; 3TLD A; 1Y8K A; 1ECN A; 5CNF A; 3ZJL A; 1AJ9 B; 1XZ7 B; 1EW6 A; 1I3E A; 1MBD A; 3UGY A; 1MYF A; 1HBS A; 1A9W A; 1MLU A; 1V9Q A; 1J7S B; 1C7C A; 1T1N A; 3NFE A; 1QXD A; 1JL6 A; 2HHB B; 1YHE A; 3FS4 B; 1Y09 B; 2MGE A; 3UHE A; 1KD2 B; 1UMO A; 3GOU A; 1NS6 B; 1JP9 A; 5E83 A; 1LH2 A; 1Y8W B; 2ZFB A; 2ZLX A; 1A00 A; 1EMY A; 1G0A A; 1LFL B; 1QSH A; 2GLN A; 1NZ4 A; 2G0X A; 3WCW B; 2QLS A; 1OUU B; 1YOG A; 4KJT A; 3A59 A; 3D4X B; 2ZST A; 2HBC A; 1SPG A; 2AUO A; 4DWT A; 1LFQ B; 3PIA A; 3NL7 A; 1BBB A; 2BNL A; 2PGH A; 1Y8H B; 1I3D A; 2V1J A; 2GTL C; 2R1H B; 1RQ3 B; 5AZR A; 2DHB A; 1OR4 A; 2E2Y A; 5AZQ A; 1V5H A; 2EB9 A; 3MKB A; 1YOI A; 1WVP A; 3P5Q A; 1YGF B; 1YMA A; 1YE0 A; 2RAO B; 2GRH A; 3ODQ B; 1LA6 B; 1XZ5 B; 1JF3 A; 1XQ5 A; 3UH7 A; 1M9P B; 1Y4Q A; 3UHB A; 1URY A; 1Y5J B; 5ILE A; 4DC8 A; 1O1J B; 3NG6 A; 2AUP A; 1O1M A; 2C0K A; 1V4X B; 1RTX A; 1UVX A; 5ILR A; 1Y4F A; 3BOM B; 4IRO B; 5SW7 A; 5CN9 A; 1C7D B; 4HRT B; 1IWH B; 1O1K A; 2QU0 A; 1GDI A; 1O1I A; 1N9X A; 1X9F B; 1EBT A; 4N7O B; 3HHB A; 1Y0C B; 1DXC A; 1YE2 A; 3HEP A; 3CIU A; 1O16 A; 2MYC A; 2HZ3 A; 4N7P A; 2GDM A; 4AVD A; 1NIH A; 1C7B B; 2GL3 A; 1BZP A; 1MOH A; 1FCS A; 1OFK A; 1RQA B; 2G3H A; 1J41 B; 3AQ9 A; 1HDB A; 6HBW A; 5CNB A; 5E29 B; 1CMY B; 1Y46 A; 4SDH A; 4MQH B; 4TYX A; 4DC7 A; 1DXV A; 1XZ4 B; 3MYN A; 5CN4 A; 1A3N B; 1ECO A; 2H35 A; 1HBH A; 3PT7 A; 112M A; 1Y7G A; 3HXN B; 2Z8A A; 2W6Y A; 1CH4 A; 1QI8 A; 3RGK A; 3ONZ A; 3UH5 A; 1DWR A; 1RPS B; 2W72 B; 1A3O A; 4MQI B; 3D7O A; 1IT3 A; 4MU5 A; 3PEL B; 1MLQ A; 3HYU A; 1Y8K B; 2GKN A; 1FAW B; 5CN8 A; 1U7R A; 2MGI A; 2V1I A; 1HBS B; 5MBN A; 1C7C B; 1T1N B; 3DUT A; 3NFE B; 1VRF A; 1YVT B; 5E6E A; 1LFT A; 1HBR A; 1CP0 A; 1YHE B; 3S1J A; 2OH8 A; 3GOU B; 1Y5K A; 2QMB A; 1Y45 A; 2R4Z A; 2DN1 A; 2ZFB B; 2ZLX B; 1X46 A; 1Y83 A; 2OLP A; 1G0A B; 1VXE A; 2QRW A; 1QSH B; 2R4W A; 2QLS B; 1HHO B; 4VHB A; 1GVH A; 1SPG B; 2ZT3 A; 1G0B A; 1DXU A; 1CO8 A; 1VXC A; 3UHK A; 1BBB B; 2G0R A; 3LR9 A; 1G09 A; 1HBB A; 2PGH B; 3ZJO A; 1MBS A; 3WHM A; 2SPN A; 4L7Y B; 3MKB B; 3OZU A; 3D1A A; 1YE0 B; 3E4N A; 2MGF A; 1FDH A; 2ZT4 A; 1XQ5 B; 1Y4Q B; 1MWC A; 3BJ2 B; 2O5S X; 3AQ6 A; 4KN3 A; 3NG6 B; 1DXD A; 1O1M B; 1S6A A; 3NML A; 4L2M A; 3AQ5 A; 4MBN A; 4ESA A; 1O1K B; 1UFP A; 2QU0 B; 1YHR A; 1CG5 A; 1HDA A; 4ZVA A; 1FLP A; 1S0H A; 3AT6 A; 2Z6T A; 2HHE A; 4HSX A; 3HHB B; 1LH6 A; 1YE2 B; 2OH9 A; 1MOB A; 3GKV A; 1BVC A; 2AV0 A; 4N7P B; 5KER B; 2HBG A; 1NIH B; 4H0B A; 3WCT A; 1NPF A; 3EDB A; 3VRE A; 2V1G A; 1HDB B; 5HY8 A; 6HBW B; 1Z8U B; 1Y46 B; 1MNJ A; 2YRS A; 2W6V B; 1BUW B; 4U8U B; 1DXV B; 1BAB A; 1A0Z B; 4N7N A; 1GCV A; 2CMM A; 3WCU D; 3VRG A; 1HBH B; 3PT7 B; 1Y7G B; 2V1K A; 3R0G A; 1CQ2 A; 1J40 A; 1QI8 B; 4JYQ A; 1XYE A; 2W6X A; 3ONZ B; 2MGL A; 2AV3 A; 1XZU A; 1YMC A; 2ZLU A; 3QQQ A; 2FRF A; 2ZSQ A; 2MYA A; 4BJA A; 3D7O B; 3IA3 B; 4NK1 A; 1F65 A; 2SPM A; 5EQM A; 4KMV A; 1LFY A; 1MNI A; 3IC0 A; 3HYU B; 2FRJ X; 1HRM A; 1MNK A; 3PI9 A; 1YEQ A; 3QM9 A; 3UHD A; 4HSW A; 5C6Y A; 3HRW A; 4FWX A; 1MYH A; 3UHX A; 1V4U A; 1ASH A; 3DUT B; 7HBI A; 5CNE A; 1LFT B; 5E6E B; 1VWT A; 2ZLW A; 1VHB A; 1QPW A; 1Y5K B; 2QMB B; 1Y45 B; 3UI0 A; 2BK9 A; 2DN1 B; 2Z85 A; 1DXT B; 1RVW A; 3AG0 A; 3PI2 A; 5EU2 A; 2BW9 M; 1XXT A; 1N9F A; 5KDQ A; 1Y5F A; 1JPB A; 1J7W A; 2H8F A; 2M6Z A; 4NK2 A; 4FWY A; 1EWA A; 1G0B B; 4HBI A; 1SWM A; 1DXU B; 1CH1 A; 1SDK A; 4G1V A; 1RQ4 A; 1G09 B; 2HBD B; 1J3Z A; 2LH3 A; 3ZOL A; 2LH7 A; 1DO4 A; 3AQ7 A; 3ORD A; 3UHS A; 3WHM B; 2DN2 A; 4NS2 A; 3D1K A; 1YFF B; 3D1A B; 2VYY A; 3WCU C; 1CH2 A; 3E5O A; 4FH7 A; 1SDL B; 1CQX A; 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