The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
140
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structure length |
140
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Heme-binding protein
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Crowning Proteins: Modulating the Protein Surface Properties using Crown Ethers.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
57
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| structure length |
140
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| sequence length |
140
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| chains with identical sequence |
E
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-08-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3QZZ A; 5CHQ A; 2GRH A; 3SDN A; 1A4F B; 4OOD A; 1SPG A; 3AT6 B; 1CQ2 A; 3WCV B; 3K3U A; 3KUO A; 2ZFB B; 5EE4 C; 3V2V A; 1H97 A; 4O4T A; 5EUI B; 2GLN A; 3QQQ A; 2OHB A; 3EDA A; 3VRE A; 3ONZ A; 4LPI A; 2ZLT B; 2D5Z A; 3WCT B; 1R1X A; 1I3D A; 3UHU A; 3QJE A; 1A0U A; 2DHB A; 1XQ5 A; 1BZZ A; 2ZLW A; 3EU1 B; 4G1B A; 4X0L B; 1WVP A; 1IT3 A; 1YEU B; 2H8F A; 1Y0A B; 2O5L X; 3MJP B; 3CIU B; 1MTI A; 2HBE B; 1YOI A; 1A9W E; 3GLN A; 1ABS A; 1J7Y B; 2BNL A; 2MGH A; 1IOP A; 3TM3 A; 4C0N A; 1O1L A; 2V1H A; 1NIH A; 5JDO C; 1V4W A; 3K8B A; 4N7N B; 1RVW A; 4ZVA A; 5HBI A; 3HRW A; 3QMA A; 1K0Y A; 3ARK A; 1YIE A; 1HGC A; 1MLU A; 3HEP A; 1A3N A; 1EMY A; 3UHN A; 1U7R A; 1CBL A; 3UGZ A; 1O16 A; 2G0X A; 1WLA A; 1YE0 A; 3GYS A; 4HRR A; 3D1K A; 1A6G A; 3QM9 A; 3ARJ A; 1C7D B; 4H2L B; 3ZJI A; 4NK1 A; 1XXT A; 1QXD B; 3R5I A; 3GKV B; 2EKT A; 1N9I A; 1Y8H A; 1IWH A; 1MNI A; 3WFU A; 1CG5 A; 2Z6S A; 1Y4F A; 1Y2Z A; 1QPW A; 3UHC A; 1X46 A; 5HLQ A; 2B7H B; 1QSH B; 5CNG A; 1FAW B; 2W72 B; 3QM5 A; 4U8U A; 1GCV A; 2BKM A; 104M A; 3NML A; 3G53 A; 1SI4 A; 5B85 A; 2ZLU B; 1O1P A; 5ILE A; 2O5S X; 1MOB A; 1UX8 A; 5ILR A; 4FH7 A; 4NXA A; 1A00 A; 2R4Z A; 3NG6 A; 1MZ0 A; 4KMW A; 1OUT B; 1AJH A; 1CLS B; 1S5Y A; 1JP8 A; 1Y83 B; 3MN0 A; 4F68 A; 1YVQ A; 1Y4G A; 2IN4 A; 1HBI A; 2D6C A; 3BJ1 B; 2H35 A; 1YZI B; 1YEQ A; 3RJ6 A; 1KD2 A; 2H8D A; 4IT8 A; 2EB9 A; 3MVC A; 3A0G B; 1NS9 B; 1Y0C B; 1MKO A; 1Y8K A; 1ABW A; 1EW6 A; 1J3F A; 1BUW B; 5CN8 A; 1X9F B; 3IC0 B; 1Y7Z B; 2GRZ A; 5E29 A; 2QSP A; 3U3E A; 4JYQ A; 4B4Y A; 4O35 A; 3PI9 B; 4G51 B; 3MJU A; 1GBU B; 1MDN A; 1VRE A; 1LFZ A; 2ZFO B; 1A01 A; 1DO3 A; 1Q1F A; 1DXU B; 1GJN A; 1Y35 A; 2XKI A; 3MBA A; 1GLI A; 1LH5 A; 109M A; 2DC3 A; 1J7W A; 1HDA A; 1LJW A; 1HV4 B; 1IBE A; 4M4B B; 1CH4 A; 1MLK A; 1O1K B; 1J40 B; 3O7N A; 1GVH A; 1VXD A; 1BZ0 B; 4AVE A; 2V1K A; 2D2M A; 2SPO A; 1RQ3 B; 4VHB A; 2Z8A A; 1VXE A; 3WCW A; 3OO5 A; 1Y31 B; 1Y8W A; 4F6B A; 1NEJ A; 1MLO A; 3ARL A; 2O5Q X; 2RI4 B; 1YGF B; 1CP0 A; 3HF4 B; 1XY0 B; 1ECO A; 2AUO A; 3EDB A; 1M9P A; 1N9H A; 1Y5F B; 2ZSX A; 3SZK B; 4MBN A; 1M6M A; 1HBR A; 2PGH B; 1BBB A; 1ECA A; 3PT8 B; 2HZ3 A; 4N7P B; 1CG8 B; 1MLQ A; 3AT5 A; 1MCY A; 1Y4P A; 5HY8 A; 1LH2 A; 1IRD A; 1BAB B; 1MBI A; 1HAB B; 1XZU B; 1T1N B; 2MGI A; 1JP6 A; 4N7O A; 1NWI A; 1O1N B; 1MBO A; 3W4U B; 1Y0T B; 5C6E A; 1XCH A; 1MBA A; 1LFV B; 1DKE A; 2D60 A; 1LHS A; 3D7O A; 2ZT1 A; 3UHQ A; 1R1Y B; 3GDJ A; 1I3E A; 3UHV A; 2MGG A; 1XZ5 B; 1ITH A; 2G0R A; 2R1H B; 1COH B; 4ROM A; 105M A; 1LA6 B; 3HHB A; 3S1I A; 1LH3 A; 1LFY A; 1NGK A; 2MGC A; 3OO4 B; 2GRF A; 4UIQ A; 1UMO A; 1JDO A; 1NS6 A; 1F65 A; 1G9V A; 1BJE A; 3IC2 B; 4XS0 A; 3UBC A; 3VRF A; 1A6K A; 1YEN A; 3BCQ B; 5CN5 A; 1MWD A; 1MLF A; 1HGB B; 2EVP A; 3O89 A; 4FC3 A; 3ZOM A; 5E6E B; 1MYI A; 1KR7 A; 1JY7 A; 1YMB A; 1Y45 B; 1J3Z B; 2RAO A; 3H58 A; 4NS2 A; 4MQG A; 1JF4 A; 2MYE A; 1B0B A; 1FHJ A; 1G0B B; 1F63 A; 1Y4Q B; 2MYA A; 3QQR A; 4NK2 A; 1HGA B; 5CHR A; 1LFT A; 4BJA A; 1QXE A; 2FRI X; 3LB2 A; 1DO7 A; 2ZS1 B; 2BWH A; 3GQR A; 2R80 A; 1JPB A; 3LB1 A; 1BVD A; 2ZSN A; 2M6Z B; 5HU6 A; 3S65 B; 1Y46 A; 1YHE A; 3PT7 A; 5MBA A; 1CH3 A; 4ILZ A; 1DXC A; 1XZ7 A; 2FAM A; 2DN1 B; 1GCW A; 1LFL A; 4M4A B; 3NMM B; 3ASE A; 1YG5 B; 1MLH A; 1MNO A; 1UIW B; 1AJ9 B; 2NX0 A; 4MQK A; 3DUT A; 1J3Y B; 1DTM A; 1GBV A; 3ZJL A; 4ROL B; 1Y4B B; 1KFR A; 2GDM A; 3WCP B; 1YDZ A; 4MQC B; 2MYD A; 6HBW B; 3ODQ A; 1Y7D A; 2ZT2 A; 2G3H A; 1JZM A; 3G4Y A; 2EB8 A; 1FN3 B; 2ZSO A; 1YH9 B; 3P5Q A; 1HAC B; 1BZ1 B; 3PI8 A; 3HXN B; 2LH7 A; 1ECN A; 1DXV B; 1Z8U B; 1O1O A; 3HEN A; 1YE2 A; 1SHR B; 1VXG A; 2DN2 B; 1CP5 A; 3WHM A; 3D4X B; 1MYG A; 4FH6 A; 3A5G A; 1V4X B; 2NSS A; 3HC9 A; 1YFF B; 1RTX A; 5EUI A; 1Y7G B; 1NQP A; 1NZ4 A; 2QFK A; 4HHB B; 3G4W A; 1SDK B; 2ZLX B; 3WCT A; 3VAU A; 1CMY B; 1YHR B; 1HCO A; 1J7S A; 5JDO D; 3D17 B; 3EU1 A; 2D5X A; 3GQG B; 3S66 A; 2ZST A; 2D2M D; 2HZ2 A; 5CN4 A; 1YEU A; 3GQP B; 1K1K A; 4YU3 A; 1V4U A; 2W6V A; 2HHD B; 3WCW D; 3NL7 B; 1G08 B; 3WFW A; 1HBA A; 3DHR B; 4MXL A; 2V1J A; 5E83 A; 2HBD A; 2MGM A; 4F6D A; 2HBF B; 5JGG A; 3BJ2 B; 2NRM A; 1BIN A; 1BIJ B; 3E55 A; 3S1J A; 1Y5J A; 1MYJ A; 2QU0 A; 1Y85 B; 1Y0W B; 1B86 B; 3LB3 A; 1UT0 A; 3UI0 A; 3KUN A; 4MQJ A; 4G1V A; 1A3O A; 4N8T A; 3OZU A; 3EOK B; 2ZLV A; 2V1F A; 1YGD B; 4KMV A; 4F4O B; 3MOU A; 1MLG A; 1YVT A; 2HBC A; 1VXH A; 3OJ1 A; 3TM9 A; 2G0Z A; 3GKV A; 1HBS B; 1MTK A; 2LH2 A; 2ZS1 D; 2HCO B; 1VWT A; 1FSX B; 1ABY B; 2LH1 A; 4MQH B; 3G4Q A; 1MYM A; 3G52 A; 1OR6 A; 1NAZ A; 2QRW A; 1OUU A; 1SPG B; 3WCU A; 2D2M C; 1TES A; 1QSH A; 3D1A A; 2VEE A; 5CNE A; 1RPS A; 3WCW C; 3WR1 A; 2D2N A; 3R0G A; 3KMF A; 2XYK A; 1WMU B; 2OHA A; 3BJ3 A; 1EWA A; 2ZT3 A; 2G0V A; 4MQI A; 2MBW A; 4ZVB A; 3VRE B; 3ONZ B; 1HDB A; 1CO8 A; 2D5Z B; 3A59 A; 3E5I A; 1G0A A; 1MBS A; 3M38 A; 3QJE B; 1A0U B; 2DHB B; 1S69 A; 1BZZ B; 3LQD A; 2ZLW B; 2OIF A; 2QMB A; 1L2K A; 2H8F B; 4NXC A; 4O1T A; 1A6M A; 1XZV A; 2MYB A; 1YHU A; 5EET A; 2KSC A; 1O1M A; 1J41 A; 3QJB A; 2SPN A; 1YMC A; 3OZV A; 1Y0C A; 1NIH B; 1YEV A; 1BUW A; 2ZS1 C; 5CN7 A; 2NRL A; 1V4W B; 3K8B B; 1MOD A; 3IC0 A; 3HEO A; 3HRW B; 3ECL A; 4XDI A; 3ZJR A; 1K0Y B; 2MHB A; 4FWX A; 4MAX A; 3FH9 A; 1PBX B; 1THB B; 4AVD A; 1YIE B; 1DTI A; 1HGC B; 1A3N B; 2G0S A; 2EVK A; 2GKN A; 5EYJ A; 3PEL B; 110M A; 2ZFO A; 1O1J A; 1NZ2 A; 3VRG A; 2Z85 A; 1YE0 B; 4HRR B; 1A0Z A; 4NZI A; 1HV4 A; 1XYE A; 3MYM A; 1J40 A; 1Y09 A; 1W92 A; 1XXT B; 5D5R A; 3R5I B; 4IRO A; 1Y5K A; 1MLS A; 3WTG A; 1DWS A; 1Y8H B; 3GOU A; 1MLJ A; 2GKM A; 1IWH B; 1MNJ A; 1CG5 B; 3OK5 A; 1Y4F B; 1Y31 A; 3ZJN A; 2BLI A; 1JZL A; 3BOM A; 1DLW A; 3A5B A; 4KJT A; 1FSL A; 1EBT A; 1DM1 A; 3PI3 A; 4F6F A; 5JOM A; 4PQB A; 102M A; 1ASH A; 4U8U B; 1HLM A; 1GCV B; 2GTL A; 3AG0 A; 1XY0 A; 4UZV A; 1SI4 B; 1PMB A; 3ZJQ A; 1FCS A; 2ZSQ A; 4DC8 A; 2ZS0 A; 2HBG A; 4L7Y B; 3FS4 A; 1A00 B; 3NG6 B; 1MWC A; 1MLN A; 1S5Y B; 1YVQ B; 1Y4G B; 4WCH D; 3UHH A; 4UUR A; 1HBB A; 2XKG A; 111M A; 2JHO A; 5CNF A; 1Y8I B; 2QLS A; 2LH6 A; 1YEQ B; 1CIO A; 1KD2 B; 2R1H A; 2H8D B; 3G4R A; 5CMV A; 5ILM A; 2V1G A; 1MKO B; 1Y8K B; 1ABW B; 1MBN A; 1Y4V A; 1Y7C A; 6HBI A; 4NI1 B; 1Y4R B; 2VYY A; 1RQ4 B; 1JEB A; 3B75 B; 5E29 B; 2QSP B; 107M A; 4YU4 A; 3HYU A; 5CNB A; 3QJD B; 1UVX A; 5SW7 B; 3MJU B; 1HGB A; 4MPM A; 1GDJ A; 1A01 B; 1G09 B; 2AV3 A; 5E6E A; 2G10 A; 1OR4 A; 1QI8 A; 2MGB A; 1GLI B; 1GZX A; 3G4U A; 1Y45 A; 1J7W B; 3S48 C; 1HDA B; 1C7C B; 1IBE B; 1DUK A; 1EBC A; 1O1I B; 1HHO A; 1JZK A; 1G0B A; 3ECZ A; 2ZT4 A; 2D2M B; 4WJG A; 4GZG A; 1GDK A; 3WCW B; 1LFQ B; 1OJ6 A; 3OO5 B; 2BW9 M; 1XZ2 A; 1CH1 A; 1NEJ B; 2YRS B; 3PI1 A; 2ZSP A; 3LB4 A; 2FRF A; 2HBS B; 1YEO A; 1JL7 A; 1VXF A; 2Z6N A; 1M9P B; 5EQM A; 3RGK A; 3WCU D; 1HBR B; 3E4N A; 1BBB B; 1F5O A; 1MWB A; 1S5X A; 2DN1 A; 2HHB B; 3AT5 B; 3UHG A; 1Y4P B; 2VEB A; 5HY8 B; 1YOG A; 1YIH A; 1LH6 A; 2D2N D; 2QSS A; 1YOH A; 1HBH A; 1DO4 A; 2DXM A; 4ODC A; 1DWT A; 3PI2 A; 4N7O B; 2AUP A; 5D1V A; 2O5B X; 5C6E B; 1DKE B; 1Y4B A; 2D60 B; 3D7O B; 1NPF A; 4F6I A; 3GDJ B; 3ZH0 A; 1DXT A; 2MGL A; 2IG3 A; 1C7B A; 1JWN A; 1MYH A; 1VXA A; 4NI0 A; 1HDS A; 3HHB B; 4HSW A; 1RQA A; 3TLD A; 3QJC B; 4MXK A; 1V75 A; 1LFY B; 3HXN A; 1CIK A; 3AQ5 A; 1UVY A; 1V5H A; 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1J7Y A; 3MKB B; 1O1O B; 5HLU A; 3G4V A; 5KKK A; 1AZI A; 1CH9 A; 2G12 A; 1YE2 B; 4L2M A; 1NZ3 A; 1DXD A; 2HZ1 A; 4N7N A; 2WTH A; 3OVU C; 1UFJ A; 1IT2 A; 1JW8 A; 3ZJO A; 3WHM B; 1N9F A; 1SWM A; 1OFJ A; 2EF2 A; 1WMU A; 1MYF A; 4F6G A; 1S61 A; 1NQP B; 2GTL C; 1C7D A; 4FWZ A; 4H2L A; 1MYZ A; 1MGN A; 2W6W A; 2WY4 A; 1HCO B; 2MGE A; 1J7S B; 1QXD A; 1BZ6 A; 1HJT A; 2ZS0 C; 2D5X B; 3S66 B; 3RJN B; 5EU2 A; 1K1K B; 4YU3 B; 1V4U B; 2W6V B; 2B7H A; 2LH3 A; 1FAW A; 2MGA A; 1HBA B; 3E5O A; 2W72 A; 5CND A; 5E83 B; 3AQ9 A; 2HBD B; 4SDH A; 1VHB A; 3ED9 A; 5JGG B; 2ZLU A; 2BLH A; 1Y5J B; 2MB5 A; 2Z6T A; 2ZSZ A; 1PBX A; 1THB A; 2QU0 B; 3UHT A; 1FLP A; 3IXF A; 1LHT A; 1R1X B; 4MQJ B; 1YCB A; 1OUT A; 3UHK A; 2GNV A; 1CLS A; 7HBI A; 1A3O B; 3PEL A; 1XQ5 B; 4N8T B; 1Y83 A; 2OH8 A; 4HSX A; 2LH5 A; 2ZLV B; 3WFT A; 3A5A A; 4KN3 A; 2VM0 A; 1HRM A; 3BJ1 A; 1YVT B; 108M A; 2HBC B; 1YZI A; 1FDH A; 2ZWJ A; 1VWT B; 2MGJ A; 3A0G A; 1NS9 A; 1O1L B; 4DWT A; 4TWU A; 3ZHW A; 1X9F A; 1OUU B; 1Y7Z A; 1RVW B; 3WCU B; 2AUR A; 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