The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Towards protein-crystal centering using second-harmonic generation (SHG) microscopy.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Myoglobin
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| molecule tags |
Oxygen storage
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| total genus |
62
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1V75 B; 4XS0 A; 110M A; 4DWU A; 1IOP A; 4O1T A; 1GBU A; 3ZJN A; 3OO4 A; 1A3N B; 5E6E A; 5C6E A; 2V1K A; 104M A; 4SDH A; 1CLS A; 4MQJ B; 3GQP B; 1XYE B; 2HBD A; 2ZS0 B; 1JF3 A; 1MYG A; 1HBA B; 1YGD A; 4NI1 A; 3QM9 A; 2NSR A; 1SI4 A; 2M6Z A; 6HBW B; 1Y4Q A; 4UUR A; 1QI8 B; 1O1N A; 3E5I A; 1MLH A; 3TM3 A; 4PQ6 A; 1Y0W A; 3PI8 B; 4FWZ A; 3WR1 B; 3S66 A; 1UX9 A; 1YIH A; 1IT2 A; 1SDK B; 1DXU B; 3ONZ B; 1HBS B; 3UHQ A; 1MWB A; 1YVQ A; 3VRE A; 3NFE A; 1MLR A; 2D2M A; 3DUT A; 2MYE A; 1A0U A; 111M A; 3OO5 B; 4MXK A; 1V4W B; 1Q1F A; 1Y8K B; 1DTI A; 1X46 A; 1IBE B; 2ZT1 A; 1J3F A; 1BIN A; 1UX8 A; 1ECD A; 4HRT B; 4F68 A; 1DUK A; 1NXF A; 2ZLW A; 3G4U A; 2LH6 A; 1S0H A; 2MGA A; 1MLS A; 2HBF B; 1IWH B; 2DN2 B; 3FS4 A; 2G3H A; 3UHE A; 1FN3 A; 1MYI A; 1MYT A; 3WCT C; 1XZU A; 2QFN A; 1G0A A; 4ODC B; 4PNJ A; 4JYQ A; 1LFQ B; 4N7N A; 1CMY A; 4HSW A; 3W4U B; 1W92 A; 3OJ1 A; 3AQ8 A; 3GQR A; 1DUO A; 3O89 A; 4YU3 A; 3ODQ A; 1BAB B; 5CNC A; 3ORD A; 3LR9 A; 5ILE A; 5CN6 A; 1HGA A; 1Y4F B; 2C0K A; 1AJH A; 1UFP A; 1ITH A; 1O16 A; 3UHT A; 1YDZ B; 5JGG B; 5EE4 C; 3WCW A; 3HRW B; 3ZJJ A; 1NZ2 A; 1GZX B; 1FAW B; 1Y0D A; 1Y35 A; 1MBD A; 1NWN A; 3ASE A; 1Y01 B; 1YEO A; 3HHB A; 1DXV B; 3S65 A; 1NQP A; 2HBE A; 3IC0 B; 5HLQ A; 2QLS B; 3NML A; 4MQC B; 3LB3 A; 1LFT A; 5CN4 A; 3HXN A; 1COH A; 3LR7 A; 2FRF A; 1YEN A; 1ECN A; 1YEV B; 3PI9 A; 1CBL A; 5EOH A; 3WCV A; 2BW9 M; 1X9F A; 2ZSO A; 1MDN A; 1Y83 B; 1Y31 B; 1Y4R B; 2QSP A; 3ARJ A; 4ROM A; 5HAV A; 3UHX A; 2MGG A; 4H2L B; 2W72 A; 1HDS A; 1MYF A; 4OOD A; 1J41 A; 4KMW A; 1Y5K A; 3BJ2 B; 1GBV B; 3UHK A; 1Y0C B; 4N8T B; 3S1J A; 1J7Y A; 3A0G A; 3D17 A; 5IKS A; 1A6N A; 5KER A; 2RI4 B; 1URY A; 1EBC A; 1BZ1 B; 1MWD A; 1RQ4 A; 3UHD A; 1Y22 A; 1YFF B; 4YU4 B; 1YIE A; 1S69 A; 4ROL A; 3UHV A; 2ZFO D; 4NI0 A; 2OIF A; 1MOC A; 4G1B A; 1K1K B; 1KD2 A; 1GLI B; 2QFK A; 2R80 B; 2MBW A; 2VEB A; 3H58 A; 4NXC A; 1UIW A; 4N7O B; 4HRT A; 3A2G A; 1HLM A; 2H35 B; 3B75 A; 1LFL A; 5C6Y A; 4FC3 B; 1Y8I B; 3NG6 A; 1A4F A; 2HBF A; 2DN2 A; 5AZR A; 2QU0 A; 3EU1 B; 3HYU B; 3FH9 B; 1HAB A; 2GKN A; 1JZM A; 2D2M C; 3G4W A; 3D1K A; 3UBC A; 1WLA A; 3QJB B; 3AQ7 A; 2HCO B; 1F5P A; 1B86 A; 1S5Y B; 5EYS A; 1MWC A; 1CG5 B; 1YG5 A; 3UHB A; 2FRI X; 3GKT A; 1FSX B; 1LH5 A; 3HRW A; 2EF2 A; 1Y5F B; 1YHU B; 5D5R A; 2ZSQ A; 2E2Y A; 1MLJ A; 1O1J A; 3D4X B; 2QMB B; 4IT8 A; 3LQD A; 1CH5 A; 1QXE A; 3UH5 A; 2HHD B; 3EOK B; 1C40 B; 2D2N C; 3IC0 A; 1Y0A A; 1A0Z A; 3MYN A; 2VRY A; 3EDB A; 2W31 A; 3GDJ B; 3AT6 B; 4FWY A; 1HDB B; 5CNB A; 4WJG 1; 3CY5 B; 1O1L A; 5EQM A; 1RQA A; 1J7W B; 1WVP A; 1Y83 A; 5HY8 B; 3ZJO A; 1Y7C A; 1HHO A; 107M A; 1RSE A; 4NXA A; 2R4X A; 1ABY B; 4F6I A; 1XZ4 A; 1GBV A; 3HC9 A; 1BBB B; 1DXT B; 2G12 A; 3M3A A; 5HBI A; 1YEQ A; 1JP8 A; 1O1I B; 4NK1 A; 1THB A; 4O4Z A; 2GTL D; 1GDL A; 1V9Q A; 5F0B A; 1R1Y B; 5CND A; 1SWM A; 2W6V B; 5E29 B; 4U8U D; 3WI8 A; 3WCU C; 5EU2 A; 3BJ3 B; 1MBA A; 4QAU A; 1S5X B; 1XXT B; 3A59 A; 3MJP B; 4PQB A; 1XY0 B; 1LFV A; 3PEL B; 2FRK X; 101M A; 2EVK A; 1HCO A; 1VXF A; 1RVW B; 1BZZ B; 3QJE A; 4OF9 A; 5CNE A; 1JY7 B; 2O5L X; 5KDQ B; 1G09 B; 3OVU C; 4MQG B; 1TU9 A; 2AUP A; 1HRM A; 1CH4 A; 1GDJ A; 5CNG A; 4MQI A; 2HBS B; 1O1K B; 103M A; 5E83 B; 2GKM A; 2ZSP A; 2ZFO A; 2ZSS A; 1QPW B; 2MHB A; 1L2K A; 1QXD A; 1V4U B; 4PQC A; 2MGK A; 2HHE B; 2WTH A; 4KJT A; 1FSX A; 1VXC A; 1O1P A; 4FH7 A; 2H8D B; 2V1E A; 1LFZ B; 1LA6 B; 1JZL A; 2LH2 A; 4N7P A; 1HSY A; 3LB1 A; 4MQH B; 2GNW A; 1OBM A; 1XZ5 A; 1DM1 A; 2Z6N B; 1HBI A; 3SZK B; 2ZST A; 1N9I A; 1EW6 A; 1T1N A; 3HEO A; 3BJ1 B; 4XDI A; 3P5Q B; 3QQR A; 2LH7 A; 1QSH B; 1YVT A; 4C44 A; 1UMO A; 1Y85 A; 3UHY A; 1LH6 A; 1XZ7 A; 3ZJS A; 3UHZ A; 3VAU A; 5CNF A; 4G51 B; 2R4W A; 2EB9 A; 3QJC A; 1V4X B; 1Y5J A; 3NMM A; 1BIJ B; 2HHB A; 4X0L A; 5AB8 A; 2AV3 A; 1X9F D; 2BWH A; 3PT7 B; 1XZ2 A; 1HAC A; 4H0B A; 5F2A A; 3PI4 A; 2FAL A; 4ZVA A; 4IRO B; 5EUI B; 4ESA A; 1Y4B B; 1NS9 A; 1X3K A; 2D2N B; 1U7S A; 3KMF A; 1FDH A; 1Y46 A; 4DWT A; 1FSL A; 2ZSY A; 3RGK A; 3PT8 B; 1J3Z A; 1YE0 A; 1YMC A; 4M4A B; 2Z6T A; 3UHU A; 1EBT A; 4L7Y B; 3ZJL A; 1A00 B; 1VXG A; 3BJ3 A; 1VRE A; 2R1H B; 1MOA A; 1SPG B; 2PEG A; 1OUT B; 1MOD A; 1Y7D A; 1DWT A; 3A9M A; 1V07 A; 3IC2 B; 1CH2 A; 2D6C A; 1KR7 A; 1O1O B; 3ARK A; 1K0Y B; 4TWV A; 1Y2Z B; 1JW8 A; 1YHE B; 2DN3 B; 2GTL A; 1J40 B; 1HGC B; 1LJW B; 2O5M X; 1YEU A; 1Y4V A; 5CHQ A; 1V4U A; 1RQ3 B; 1R1X A; 3WHM A; 1YOH A; 2DXM A; 1MLM A; 3UI0 A; 4U8U A; 2D5X A; 2H8D A; 5ILR A; 1Y8W B; 1Y7G A; 3WCU B; 5JOM A; 2ZS1 A; 3QZX A; 1H97 A; 1C7D A; 2ZLU B; 3G4R A; 1NIH B; 2D60 B; 3R5I A; 2ZLV A; 1IRC A; 2AA1 B; 2B7H B; 4WCH D; 2YRS B; 3VRF B; 1J7S A; 3PIA A; 2DN1 A; 1MZ0 A; 1YZI B; 1MNJ A; 4NK2 A; 2ZFO C; 3GOU B; 1A01 A; 2AUO A; 3A5A A; 1WMU B; 4MBA A; 2OHA A; 4HHB B; 1N9F A; 4KN3 A; 1JDO A; 1HBB B; 1JEB A; 1JP6 A; 2ZFB A; 1JP9 A; 1YE2 A; 1DKE A; 1SDL B; 2JHO A; 1NEJ A; 1FCS A; 2PGH B; 1GCW A; 3MVC A; 1URV A; 2HZ3 A; 3HF4 B; 1MBO A; 1Y09 B; 3VRG A; 1MNO A; 1YGF A; 5SW7 A; 1C7B B; 3ZJM A; 3AT5 B; 3OGB A; 2Z85 A; 2ZLX A; 1Y8H A; 3G4Y A; 2R50 A; 1ASH A; 3BOM B; 3UGZ A; 1A6K A; 1NS6 B; 2D5Z A; 2MGC A; 1G9V A; 2ZSR A; 1CP0 A; 1YH9 B; 1V75 A; 1A6M A; 2G0R A; 2G14 A; 2LH3 A; 4F4O B; 1MYJ A; 1MLO A; 1Y7Z B; 3QM7 A; 1GVH A; 1RPS B; 1A3N A; 1F65 A; 4MBN A; 5MBA A; 5HLU A; 2O5B X; 4ZVB A; 1HV4 B; 4MQJ A; 4B4Y A; 3GQP A; 1XYE A; 5HU6 B; 1Y45 B; 2WTG A; 2ZS0 A; 2GL3 A; 1HBA A; 3LHB A; 1S61 A; 4JAC A; 6HBW A; 2VHB A; 3A5B A; 2LH1 A; 1QI8 A; 5EET A; 2BMM A; 1EMY A; 3GQG B; 2EKT A; 3PI8 A; 3WTG B; 3WR1 A; 5JDO E; 2W6W A; 5JDO F; 1TES A; 1SDK A; 2MYB A; 1DXU A; 2SPL A; 3ONZ A; 1HBS A; 2DHB B; 2NRM A; 1VXB A; 2HBC B; 2ZSN A; 1BZ0 B; 2ZLU A; 3GYS B; 1G08 B; 3OO5 A; 6HBI A; 1V4W A; 3MKB B; 1Y8K A; 1HBR B; 1YHU D; 1DWR A; 1IBE A; 1AJG A; 3UH6 A; 3TLD A; 2GTL C; 3MJU B; 1VXE A; 1IWH A; 1ECA A; 1SHR B; 3LB4 A; 4MAX A; 4ODC A; 1S6A A; 3CIU B; 1LFQ A; 3W4U A; 1MKO B; 1DXC A; 1H1X A; 1VRF A; 2MYC A; 1G0B B; 1BAB A; 1IRD B; 1UC3 A; 1VWT B; 1MTI A; 1MGN A; 3ZJR A; 109M A; 3ECX A; 1N9H A; 2QSS B; 1Y4F A; 1MBI A; 4F6J A; 1NAZ A; 1YDZ A; 1DXD A; 5JGG A; 1MYM A; 2ZT4 A; 4WJG A; 5EE4 D; 3G4Q A; 1GZX A; 1FAW A; 1C7C B; 1VXA A; 3UHH A; 4G1V A; 1QSI B; 1Y4G B; 1HBH B; 3V2V A; 1DXV A; 1A3O B; 2QLS A; 1MBC A; 3TM9 A; 4MQC A; 3WCT B; 1HGB B; 1O1M B; 2BLI A; 4HSX A; 1XQ5 B; 5EYJ A; 1M9P B; 3KUN A; 1I3E A; 1YEV A; 1CG8 B; 1M6C A; 1MCY A; 2GDM A; 3WCW C; 1UVX A; 1Y31 A; 1Y4R A; 2BNL A; 1MTJ A; 3QZZ A; 3K8B B; 1FHJ B; 1MTK A; 4H2L A; 102M A; 3UHI A; 3BJ2 A; 2O5T X; 3WTG A; 7HBI A; 1Y0C A; 4N8T A; 3GKV B; 1ECO A; 3DHT B; 1Y4P B; 1CIO A; 2RI4 A; 1D8U A; 1JL7 A; 1BZ1 A; 1LH1 A; 2EKU A; 1MLF A; 2H8F B; 1MNK A; 1YFF A; 4YU4 A; 1BZ0 A; 1YCB A; 2LHB A; 3GYS A; 3WCV C; 1XZV B; 2V1G A; 1X9F C; 1HDA B; 1K1K A; 1GLI A; 2R80 A; 2RAO B; 4UIQ A; 1JF4 A; 2NX0 A; 4N7O A; 1YOI A; 2W72 C; 1YMA A; 4C0N A; 2CMM A; 2H35 A; 2ZS1 D; 4FC3 A; 1Y8I A; 1CP5 A; 3QM5 A; 2ZWJ A; 1Y0T B; 1OJ6 A; 1AJ9 B; 2ZLT B; 3EU1 A; 3HYU A; 1LUE A; 1OUU B; 1XCH A; 3FH9 A; 4MQK B; 4KMV A; 2OH9 A; 2FRJ X; 4XS0 B; 3SDH A; 1MLG A; 1GBU B; 4MPM A; 3OO4 B; 3QJB A; 5E6E B; 5C6E B; 1IDR A; 2O5S X; 2V1J A; 1CLS B; 2HBD B; 2HCO A; 1S5Y A; 2V1I A; 1SPE A; 1CG5 A; 3RJ6 A; 1SI4 B; 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1RVW A; 5CMV A; 3S65 B; 1BZZ A; 1NQP B; 2HBE B; 4F6F A; 1JY7 A; 5KDQ A; 1G09 A; 2XYK A; 4MQG A; 106M A; 5MBN A; 2G11 A; 2HBS A; 1LFT B; 1O1K A; 5E83 A; 3HXN B; 1COH B; 1QPW A; 1YEN B; 3PI9 B; 3WCV B; 1X9F B; 1UFJ A; 2HHE A; 2QSP B; 2W6X A; 4ROM B; 4F6G A; 5CN7 A; 1LFZ A; 1LA6 A; 2W72 B; 1HDS B; 1J41 B; 1Y5K B; 1GDI A; 3AQ6 A; 4HRR B; 1J7Y B; 3A0G B; 3VHB A; 3D17 B; 4MQH A; 2Z6N A; 4MXL A; 3SZK A; 1DO4 A; 5KER B; 2XKI A; 2OLP A; 3BCQ A; 3BJ1 A; 1RQ4 B; 3UH3 A; 3PI3 A; 3P5Q A; 1Y22 B; 1QSH A; 1ABS A; 1PBX A; 1Z8U B; 1YIE B; 3G4V A; 4ROL B; 2OH8 A; 4NI0 B; 2MGF A; 3UHC A; 1YOG A; 1KD2 B; 2MYD A; 1JZK A; 1BZ6 A; 1YHU C; 3OZW A; 1UIW B; 4F6D A; 2MGL A; 4M4B A; 4G51 A; 1J52 A; 3D1A B; 3B75 B; 1LFL B; 1GCV A; 1V4X A; 5CN8 A; 1CIK A; 1N9X A; 3NG6 B; 1BIJ A; 5JDO D; 1A4F B; 2QU0 B; 3S1I A; 1VHB A; 2AUR A; 3PT7 A; 3UHN A; 5CHR A; 2MGH A; 3UGY A; 1FLP A; 1HAB B; 2FAM A; 3IXF A; 5KKK A; 4IRO A; 5EUI A; 4DC7 A; 3OZV A; 1Y4B A; 3D1K B; 2D2N A; 1A6G A; 2G10 A; 3ZHW A; 3E4N A; 3O7N A; 3HEP A; 3GLN A; 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