The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
154
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structure length |
154
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Chain Sequence |
MVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHTVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Complex of myoglobin with phenol bound in a proximal cavity.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Physeter catodon
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| total genus |
63
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| structure length |
154
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| sequence length |
154
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-09-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4N7N B; 2R80 A; 1FDH G; 3IC0 A; 2V1F A; 4MQI A; 1R1Y B; 2HBE A; 4JYQ A; 3D17 B; 4O4T A; 1J40 A; 2DC3 A; 1HDS A; 1J7Y B; 1QXD A; 3BJ1 B; 1LFQ B; 1MLH A; 1Y7G A; 2V1H A; 1AJ9 B; 1NQP B; 1WLA A; 3D4X B; 3M3A A; 1BZR A; 1A6M A; 1YFF A; 1LFY B; 1A6K A; 1HAB A; 3B75 A; 3UGY A; 3GQR A; 4ODC A; 3ODQ B; 4OOD A; 4PNJ A; 2HHE B; 7HBI A; 4F4O A; 3OO5 A; 1QI8 A; 1G0B B; 1NAZ A; 3E5I A; 1X9F D; 1H1X A; 1SPG B; 4YU4 A; 5CN4 A; 2MGB A; 2AV0 A; 4O2G A; 2ZLT B; 3HEO A; 1BIJ B; 108M A; 4MQG B; 2NX0 A; 1YDZ A; 2EF2 A; 2QSP A; 1H97 A; 3VRE B; 1MLN A; 2Z85 A; 1DKE A; 2WTH A; 3BCQ B; 3UHE A; 1XZ5 B; 3MVC A; 3UH3 A; 4NI0 A; 1MKO B; 3TM9 A; 2HHD A; 2DN3 A; 1YHU C; 1YOH A; 2QU0 B; 6HBW B; 1RQA B; 3DHR A; 2V1E A; 4N8T B; 3WCT D; 1MZ0 A; 3ZJO A; 1O1L B; 4PQB A; 1A6G A; 2XKG A; 3WFW A; 2VYY A; 1Y7Z B; 3VRG A; 3TLD A; 109M A; 1MLF A; 1IOP A; 1ABY B; 3GLN A; 2R4Y A; 5AB8 A; 2GRH A; 2FRK X; 1WMU B; 2XKH A; 1O1J A; 5HY8 A; 1JPB A; 1BUW A; 1C7B B; 4PQ6 A; 5HU6 B; 1N9X A; 4C0N A; 1GCV A; 3WCV C; 1V4U A; 2R1H B; 2PEG A; 3FS4 B; 1A01 A; 2HZ2 A; 1Y4P B; 3ONZ A; 3QMA A; 1OUU A; 3E5O A; 3AQ9 A; 2G0V A; 3O7N A; 1AJG A; 1J52 A; 2BWH A; 4MQJ B; 2DXM A; 2RAO A; 2ZT2 A; 2DN1 B; 2SPM A; 3E55 A; 2H8F B; 2YRS A; 4H2L B; 1D8U A; 1IBE A; 2ZT0 A; 104M A; 5ILE A; 3BJ3 B; 1O1M A; 3UHI A; 2IN4 A; 1CMY A; 1GDL A; 1SDK B; 2CMM A; 3OGB A; 3S66 B; 5KER B; 1LFL B; 1BZ0 B; 2D6C A; 2XYK A; 5F2A A; 1J7W A; 1HRM A; 1U7R A; 1MWB A; 5EQM A; 1F65 A; 1LFV B; 2HBC A; 2ZSY A; 3A5A A; 2HZ3 A; 2GRF A; 3ORD A; 4FC3 A; 1Y8K A; 1GDK A; 2NRM A; 1FSX A; 1X9F C; 3UHC A; 5E29 B; 3UH5 A; 4MQC B; 2Z6N B; 1YMC A; 2MYE A; 2ZS0 B; 1F5P A; 1YVT B; 5HBI A; 3WCW A; 2ZS1 D; 3ED9 A; 2GKM A; 1Y46 A; 2MBW A; 3QJB B; 3S65 A; 1L2K A; 2H8D B; 3A9M A; 1YMA A; 2D5X A; 3PI8 B; 4HRR A; 3D7O B; 3WFX A; 111M A; 1BBB B; 1C7C B; 1J3Y B; 1YH9 A; 2ZT1 A; 2O5L X; 1A00 B; 3M3B A; 4M4B B; 4YU3 B; 3WCU D; 1Y22 A; 4KJT A; 1GCW B; 1VWT A; 3BJ2 A; 2LH6 A; 3WCT C; 1YVQ B; 1DTM A; 1YEO A; 1U7S A; 2LH7 A; 1UVY A; 1G08 A; 1RSE A; 3UGZ A; 3GK9 A; 1RVW A; 3GQG B; 2D60 A; 3AT6 A; 2SPL A; 3QZZ A; 2V1G A; 1RQ3 B; 2BKM A; 2MGF A; 2AUO A; 4ROL B; 1PBX B; 1XQ5 B; 3LR7 A; 1YIH B; 1HGC B; 1M6C A; 4MQK A; 1QSH B; 3LB4 A; 1OUT A; 3PEL B; 5EU2 A; 3EU1 B; 2W72 B; 1O1P B; 1V75 B; 3A2G A; 2O5M X; 2R80 B; 3IC0 B; 1ASH A; 5HLX A; 1MBC A; 2VRY A; 1CH9 A; 2EKU A; 4SDH A; 1J40 B; 1A0U A; 1SI4 B; 1JW8 A; 3UHH A; 1HDS B; 1N9I A; 4GZG A; 1EBT A; 1QXD B; 2ZFB A; 2HBG A; 5E83 A; 2GLN A; 1Y85 A; 1Y7G B; 3P5Q B; 1JY7 A; 1A9W E; 3B75 B; 1HAB B; 1HBR A; 3GQR B; 4ODC B; 2G3H A; 1QPW A; 1DM1 A; 1Y01 B; 1BVC A; 3OO5 B; 1QI8 B; 2QFN A; 3HEN A; 5CNC A; 1MLU A; 4YU4 B; 2O5Q X; 4ZVA A; 3UHV A; 2R4X A; 3S1J A; 3OK5 A; 2G11 A; 1MYZ A; 1YDZ B; 4H0B A; 2V1I A; 4L7Y A; 2FAM A; 1DKE B; 5CN5 A; 3KMF C; 5EUI A; 3PT7 A; 1IRD A; 1JZL A; 4NI0 B; 4AVE A; 3AQ7 A; 1Y31 A; 2ZS1 C; 3KUN A; 1YZI A; 2HHD B; 2DN3 B; 5CHQ A; 1Y83 A; 3EDB A; 3DHR B; 2FRI X; 3ECZ A; 4DWT A; 2D2N D; 3SZK A; 2GTL A; 3UHU A; 3PI9 A; 2R50 A; 1M9P B; 1JZK A; 1LFZ A; 1MTJ A; 2ZSP A; 1B86 A; 2OHB A; 2VYW A; 3QJD A; 1G9V A; 3WCU C; 5CN6 A; 5JDO D; 1O1J B; 1O1N A; 1YGF A; 4FH7 A; 3WR1 A; 3OZW A; 4MAX A; 1DUO A; 1YMB A; 3CY5 A; 1GCV B; 1HLB A; 1M6M A; 1V4U B; 2PEG B; 4F6I A; 2LHB A; 1MYJ A; 1MWD A; 2GRZ A; 1MYF A; 3ONZ B; 1OUU B; 3ECX A; 5F0B A; 3OO4 A; 1SPE A; 1DXC A; 2DXM B; 2RAO B; 5KDQ A; 1Z8U B; 1JL7 A; 1UX9 A; 4TWU A; 1Y7D A; 4F6G A; 1QXE A; 2YRS B; 1VXD A; 1IBE B; 2HBS B; 1UIW A; 1VXE A; 1O1M B; 1HBH A; 2DHB A; 1CMY B; 1MBA A; 3QM8 A; 1HHO A; 1NEJ A; 2ZFO D; 4U8U D; 3MYN A; 4G1B A; 2EB9 A; 5C6E A; 2W6X A; 1Y4G A; 2ZLX A; 1K1K A; 1DTI A; 2O5B X; 1OJ6 A; 4NK2 A; 1XY0 A; 1NXF A; 4KN3 A; 1RTX A; 3GKV B; 1MDN A; 1MNO A; 1LH7 A; 2HZ1 A; 1R1X A; 1S5X A; 4FC3 B; 1Y8K B; 1CH5 A; 2VYZ A; 4NK1 A; 3ZOM A; 4HHB A; 1LA6 A; 3QZX A; 2VLX A; 3HEP A; 1GBV A; 1J7S A; 3WCW B; 1EMY A; 3FH9 A; 1NZ4 A; 3ZJL A; 3R5I B; 1Y46 B; 1MOD A; 4WCH D; 3S65 B; 3UHX A; 3A5G A; 2GKN A; 2PGH A; 1VXC A; 2D5X B; 2O5T X; 4X0L A; 4HRR B; 3A5B A; 2M6Z A; 3GQP A; 1MBS A; 1YH9 B; 3WTG A; 4LPI A; 2ZSZ A; 5HAV A; 1YHU A; 5JDO E; 3HHB A; 1Y22 B; 1Y8W A; 3D1K A; 3BJ2 B; 112M A; 1C40 A; 2AA1 A; 2D2N C; 2W6Y A; 5MBN A; 2HCO A; 1S61 A; 3G4U A; 1CH2 A; 1JL6 A; 1YGD A; 1XCH A; 1O1O A; 1G08 B; 5HLU A; 2WY4 A; 1A6N A; 1RVW B; 2D60 B; 3AT6 B; 3UHN A; 1EBC A; 5JDO C; 2QLS A; 1DXD A; 4C44 A; 1XZ7 A; 2MB5 A; 3ZHW A; 3G4Q A; 2MGG A; 4MQK B; 3WCV A; 1YOG A; 5HLQ A; 1OUT B; 3OVU C; 3VHB A; 3OJ1 A; 1JEB A; 3TM3 A; 5ILP A; 1HV4 A; 3WHM A; 1Y2Z A; 2MHB A; 1QSI A; 3AT5 B; 1G0A A; 1YG5 A; 4UZV A; 1A0U B; 2E2Y A; 2W6V B; 2BLJ M; 2ZFB B; 5E83 B; 1CG8 B; 1YHR A; 1Y85 B; 3NFE A; 1O1K A; 1A3N A; 1ECD A; 3ZJM A; 3UHZ A; 1JY7 B; 1O1I A; 1V07 A; 3ZOL A; 1Y4Q B; 2ZFO C; 4U8U C; 3AQ6 A; 1HBR B; 101M A; 2W31 A; 1DWS A; 1QPW B; 4MXK A; 1IT3 A; 2LH3 A; 3GOU A; 2IG3 A; 4TYX A; 5CNF A; 1DO3 A; 3LHB A; 4M4A A; 1J3Z B; 2ZSQ A; 4L7Y B; 4B4Y A; 1MYI A; 1K0Y A; 2OH8 A; 3ZJS A; 1HGB A; 1IRC A; 1X9F A; 1GDJ A; 2BW9 M; 4O35 A; 4IRO B; 4HRT A; 5EUI B; 3DR9 A; 3PT7 B; 1IRD B; 4DC7 A; 4ILZ A; 1Y31 B; 1F5O A; 1YZI B; 1BZP A; 1Y09 B; 2B7H A; 1MLM A; 1Y83 B; 1GBU A; 1Q1F A; 2C0K A; 1BVD A; 3SZK B; 1HSY A; 2GTL B; 3ZH0 A; 3K3U A; 3PI9 B; 1LFZ B; 1B86 B; 3PI4 A; 3QJD B; 3WFT A; 1UX8 A; 1O1N B; 3WCT A; 1CQ2 A; 1YGF B; 3WR1 B; 1A3O A; 1HDB A; 1Y0C A; 4ESA A; 2MGD A; 2GDM A; 3CY5 B; 3PIA A; 5E6E A; 5KKK A; 4PQC A; 1ECN A; 1IWH A; 1B0B A; 3QM5 A; 4XDI A; 1SDL A; 4F69 A; 2GNV A; 3OO4 B; 1CP0 A; 1Y8I A; 1LH2 A; 1ECO A; 1CLS A; 1JDO A; 3AQ8 A; 3PT8 A; 5KDQ B; 1A4F A; 1OFJ A; 4N7O A; 4NXC A; 1ECA A; 2MGH A; 1Y7D B; 1NZ3 A; 1QXE B; 2MYB A; 1MBD A; 1NIH A; 5AZQ A; 1UIW B; 2ZLW B; 3CIU A; 1HBH B; 1YEN A; 2DHB B; 1EW6 A; 1YE0 A; 5ILR A; 1HDA A; 1DXV A; 1HHO B; 1NEJ B; 3GDJ B; 3QM7 A; 5C6E B; 3IC2 A; 1Y4G B; 5B85 A; 1K1K B; 1BZZ A; 3OZV A; 1FDH A; 2GL3 A; 1XY0 B; 2QRW A; 4WJG 1; 3PI2 A; 2D2M D; 3RJN B; 1GLI A; 1UVX A; 2FRF A; 1R1X B; 4NI1 A; 3HXN A; 1VRE A; 105M A; 1KD2 A; 1MYH A; 4HHB B; 1YCA A; 2MGC A; 1LA6 B; 3DHT A; 1MCY A; 1GBV B; 1Y0T A; 2QMB A; 1J7S B; 3FH9 B; 3UHY A; 4KMW A; 1A9W A; 1J7Y A; 1W92 A; 1LH5 A; 3ZJI A; 1YHE A; 1Y5J A; 1AJ9 A; 3QJC A; 1MNK A; 4L2M A; 2PGH B; 2MGL A; 1TES A; 3KMF A; 1SHR A; 1LFY A; 4X0L B; 1AJH A; 1FLP A; 3QQQ A; 1HBA A; 2M6Z B; 3QJE A; 2AUQ A; 2ZS1 A; 3WTG B; 4MQI B; 1YHU B; 1G0B A; 3HHB B; 1MOA A; 2OH9 A; 2HBE B; 1Y8W B; 3LQD A; 3D1K B; 1C40 B; 2AA1 B; 1JP9 A; 2ZLT A; 2HCO B; 1MOB A; 4MBN A; 2AV3 A; 1YGD B; 1N9H A; 1F63 A; 4O1T A; 1O1O B; 1MLS A; 4TWV A; 1V5H A; 1MLJ A; 1BZ1 A; 1VXG A; 3VAU A; 1YFF B; 5ILM A; 3WCU A; 1S0H A; 3ZJR A; 2QLS B; 1ABW A; 3G46 A; 5EE4 D; 1VXA A; 1MKO A; 3RGK A; 1MOC A; 1XZ7 B; 1MWC A; 4F4O B; 2D2M A; 2ZLV A; 3UHB A; 2HBD A; 3WCV B; 1RQA A; 3SDN A; 2QSS A; 1JEB B; 1AZI A; 5CNE A; 1HV4 B; 2QSP B; 1CPW A; 5CND A; 3WHM B; 1Y2Z B; 2MHB B; 1DWT A; 1QSI B; 4AVD A; 1HBI A; 1Y0D A; 2MGI A; 2JHO A; 2R4W A; 1Y8H A; 3ZJN A; 3UHW A; 3NMM A; 3UHK A; 2LH5 A; 2O58 X; 1G0A B; 1YG5 B; 5MBA A; 1XZV A; 1MBI A; 1Y4F A; 2Z6T A; 4F6F A; 5JOM A; 1YHR B; 1CO9 A; 3NFE B; 1O1K B; 1MLQ A; 1A3N B; 1O1I B; 4FWY A; 3RJ6 A; 1J3F A; 2EVP A; 2ZS0 D; 1JF4 A; 2ZLU A; 1Y5F A; 3WCP A; 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1EWA A; 1NZ2 A; 3EOK A; 4XS0 A; 1HDA B; 3ZJH A; 1DXV B; 3SDH A; 1HBS A; 3QQR A; 3IXF A; 4BJA A; 1LH1 A; 1BIN A; 1BZZ B; 1I3D A; 2HBF A; 1RQ4 A; 1HGC A; 1OFK A; 3MBA A; 1VWT B; 1XYE A; 1VXF A; 1YOI A; 2ZS0 C; 2ZFO A; 4U8U A; 2WTG A; 3EU1 A; 1YEO B; 1GLI B; 1CG5 A; 2HHB A; 4NI1 B; 3ZJJ A; 1S6A A; 3HXN B; 3S48 C; 1CQX A; 1KD2 B; 5EET A; 1YEQ A; 3DHT B; 1SI4 A; 1Y0T B; 2QMB B; 4FWZ A; 1C7D A; 4KMV A; 1FCS A; 1OR6 A; 1YHE B; 3P5Q A; 3HF4 A; 1VHB A; 1Y4R A; 1Y5J B; 2D5Z A; 2G0S A; 3QJC B; 3AQ5 A; 4N7P A; 3A59 A; 1MBO A; 1SHR B; 3ASE A; 3ZJQ A; 1YEV A; 2G12 A; 1HBA B; 1JP8 A; 4NZI A; 3QJE B; 3M38 A; 2QFK A; 2ZS1 B; 3G4W A; 1X46 A; 2BK9 A; 4B3W A; 3LQD B; 3MN0 A; 2RI4 A; 1MTK A; 2GNW A; 5B84 A; 1BZ1 B; 2AUP A; 1Y5K A; 3WCU B; 1S0H B; 2BNL A; 2W72 C; 1ABW B; 3U3E A; 2ZWJ A; 1Y0W A; 4O4Z A; 5JDO F; 2D2M B; 2ZLV B; 1CH4 A; 2HBD B; 2ZT3 A; 3H57 A; 2ZSO A; 1V4X A; 2QSS B; 3OZU A; 3R0G A; 1Y4V A; 1YE2 A; 1VRF A; 1Y0D B; 1M9P A; 1Y8H B; 5EOH A; 2V1K A; 3NMM B; 1XZV B; 1CP5 A; 1Y7C A; 1DXT A; 3DUT A; 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