The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
54
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sequence length |
140
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structure length |
140
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of Aquomet Hemoglobin Bristol-Alesha alphawtbetaV67M
rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| molecule tags |
Oxygen transport
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
54
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| structure length |
140
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| sequence length |
140
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-09-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NPG A; 1G9V B; 1S0H B; 1LJW B; 2MGJ A; 5CNG A; 1X46 A; 106M A; 3B75 B; 1H97 A; 1FSL A; 1YMC A; 2QFK A; 3EU1 A; 3PI9 B; 3WCW D; 1CQX A; 1YGF B; 1VXF A; 1MLJ A; 1DLW A; 4C44 A; 1VXE A; 3DHR A; 3GKV A; 1J7W A; 2OH8 A; 2R4X A; 2NRM A; 1Y4G B; 1O1K B; 1XY0 B; 2H8D B; 3TLD A; 1YEV A; 2GRZ A; 2HBC B; 4MQK A; 3HYU B; 4U8U A; 111M A; 1ABS A; 3CY5 B; 1QPW A; 2MYB A; 1MOB A; 1ABW A; 1A6M A; 4F4O A; 2YRS A; 4F69 A; 1A3N B; 4HSW A; 1SDK B; 1Y0W A; 2Z8A A; 1BJE A; 1V4U B; 1YVQ A; 4MU5 A; 2O5O X; 3ZJP A; 1COH B; 1G08 B; 1XZV A; 1MYM A; 1CH5 A; 2Z6T A; 2R80 A; 5CHQ A; 1HBR B; 4N7O A; 1O1I B; 1IBE A; 1I3D A; 1HGC B; 1IDR A; 4MQG A; 2HHE A; 1LH5 A; 1YE2 A; 2AV3 A; 3GYS B; 3QJC B; 3BA2 A; 1A0Z A; 5D1V A; 1BZ0 B; 5EET A; 4N7N B; 5B85 A; 2AA1 A; 3GQG B; 1YG5 A; 1JY7 A; 1V4X B; 5HLQ A; 1NPF A; 1RPS A; 4UZV A; 3SDH A; 1F63 A; 4F6D A; 2QSS B; 1FDH A; 3W4U B; 1A3O B; 1NWI A; 2DN2 B; 4NXC A; 2SPN A; 1MYH A; 2ZT4 A; 2NRL A; 2LH2 A; 2VRY A; 1V07 A; 1LFZ B; 1CP0 A; 1MDN A; 1MLN A; 5JDO F; 1BZ1 B; 1LH3 A; 1JZK A; 1CLS B; 1FCS A; 1JP9 A; 1Y4R B; 1Y09 A; 1JZM A; 3BJ2 A; 3R0G A; 1GDL A; 3HHB B; 1Y46 B; 5M3S A; 3ZJN A; 1BZ6 A; 2H8F B; 3P5Q A; 1YIE A; 4PQ6 A; 1GDI A; 1ECD A; 1QXD B; 2GL3 A; 1K1K A; 3PIA A; 1O1L A; 1CG8 B; 2D2N C; 2QMB B; 1NZ2 A; 3BOM A; 3SDN A; 1ABY B; 4TWU A; 1HV4 A; 2DXM A; 1C40 A; 3ZJM A; 3MKB A; 1JZL A; 4NI1 B; 1YIH A; 3QJD A; 3BJ3 B; 2VLY A; 3ONZ A; 1MOC A; 1NXF A; 1RQA A; 1YEQ A; 1FLP A; 1RQ4 A; 1LTW A; 1NEJ B; 3G4U A; 3QZX A; 3GQR B; 1FAW A; 3QM8 A; 3D7O A; 3PI4 A; 2M6Z A; 1Y31 A; 4HBI A; 1C7B B; 5EUI B; 1J52 A; 1Y7C A; 4XS0 A; 3M39 A; 1HBB A; 3WCV A; 1F65 A; 3EDA A; 1Y5J B; 2O5L X; 2AUQ A; 3PT7 A; 1Y45 B; 1VXB A; 3MYM A; 1DXU A; 1V4W B; 1HGA A; 2BK9 A; 1MLL A; 1XZ4 B; 109M A; 1GCV A; 4H07 A; 1G0B A; 2VEE A; 3LHB A; 2D5X A; 1WLA A; 3D17 B; 1MLS A; 2QRW A; 4L7Y A; 3S1I A; 2G0Z A; 3BJ1 B; 1Y4F B; 1IRD A; 1EBC A; 1JEB B; 1QXE A; 3G4V A; 1GBU A; 1LA6 B; 1BZZ A; 1C7C A; 5HU6 A; 1XZU A; 1M9P A; 1ECO A; 3WI8 A; 4ESA B; 3K3U A; 3UHZ A; 1YZI B; 1YEN A; 2W6X A; 3GDJ A; 3WCT A; 3AG0 A; 1VXD A; 1HBI A; 1G09 B; 4PNJ A; 2DN1 A; 1QSH A; 1JP6 A; 1BBB A; 3LR9 A; 1MGN A; 3HEO A; 3ECZ A; 3PI3 A; 1Y7G A; 3ED9 A; 1YCB A; 5ILP A; 1GBV B; 1N9F A; 1HBA A; 3QM6 A; 2LH6 A; 1R1X A; 3AT6 B; 1M6C A; 4ROM A; 3FS4 A; 1Y4B B; 3GOU A; 1HDA B; 5ILR A; 4H0B A; 2MBW A; 3UHK A; 1FSX B; 1V9Q A; 1ASH A; 2Z6N A; 3K8B B; 4GZG A; 1Y7D A; 3ARL A; 3OZW A; 2LH5 A; 2FRI X; 3WCU A; 2MGK A; 3LQD B; 5CNE A; 1UIW B; 4ODC B; 2D2M A; 5JDO D; 3VRF B; 2QSP B; 2C0K A; 1A9W E; 1RVW B; 3D1A A; 2HCO A; 2BLI A; 2H35 B; 5EV5 A; 1OFJ A; 1VWT B; 3BCQ B; 2HBE A; 1W92 A; 3WCW C; 6HBI A; 1EMY A; 2W72 B; 3UHT A; 1XZ5 A; 4N7P A; 4MBA A; 3WFT A; 3R5I B; 3GLN A; 1MNJ A; 2ZST A; 1DLY A; 1Y0T B; 1MYZ A; 3UBV A; 3OVU C; 2QU0 B; 1A0U A; 1A4F B; 2G14 A; 5E6E A; 1Y4Q A; 1GCW B; 2ZFB B; 4AVD A; 2ZS0 A; 2ZS1 A; 2O58 X; 2BLH A; 2EVK A; 2HZ1 A; 2KSC A; 3CIU B; 1YH9 A; 5CMV A; 1CG5 A; 1LHT A; 3A5B A; 4MQH B; 2GLN A; 4MBN A; 3EDB A; 3VRG B; 1A9W A; 1BVC A; 3E5I A; 2ZT0 A; 4SDH A; 3IC0 B; 2GNV A; 2QFN A; 5SW7 B; 1LFV B; 2ZT3 A; 1DXV B; 1Y83 A; 2D5Z A; 1QI8 A; 1BAB B; 3IC2 A; 1J41 B; 2FRF A; 1K0Y A; 1Y2Z B; 5C6E A; 3QJE A; 1NS9 B; 4O2G A; 3ZOL A; 1TU9 A; 3KUN A; 3UHQ A; 2O5T X; 2OIF A; 3PI1 A; 1SDL A; 4MPM A; 1X9F A; 3HRW B; 3DHT A; 1NQP A; 1OUU A; 1JF3 A; 2ZT2 A; 6HBW B; 1O1M A; 1NIH B; 5JGG A; 1EW6 A; 3HXN A; 3D1K A; 1NZ5 A; 3PI8 A; 1CBL A; 1HCO A; 5EYJ A; 3MJP B; 3WFX A; 1A01 B; 3G4R A; 1LFL A; 2PEG B; 2HBF B; 5E83 B; 4ZVA A; 2Z6S A; 108M A; 1HHO A; 1LHS A; 1V5H A; 1O1N B; 2W6V A; 3G53 A; 2FAM A; 1DUK A; 2V1K A; 4G51 A; 1CH2 A; 3S65 A; 1EWA A; 2B7H A; 1RTX A; 2FAL A; 2OHB A; 1ITH A; 1XYE B; 3UHN A; 2G3H A; 1HAB B; 4PQC A; 1YEU A; 1HAC A; 4PQB A; 2EKT A; 4F6J A; 3MJU A; 2V1E A; 4H2L A; 1IOP A; 1DWR A; 1XZ2 B; 4ZVB A; 3H58 A; 1PBX A; 4HHB A; 1HDS A; 5CN9 A; 1BIJ A; 3ECX A; 4FWZ A; 2O5B X; 1YHU A; 5E29 A; 1DKE A; 1HSY A; 1Y7Z A; 5D5R A; 1MLR A; 4U8U D; 2ZSS A; 2HHB A; 3A59 A; 4JYQ A; 1H1X A; 3WCP A; 2XKI A; 5JOM A; 3GKV B; 3UHG A; 2AUO A; 4NXA A; 1XXT B; 4NS2 A; 3OO5 A; 3WR1 A; 3VAU A; 2MHB B; 4MQK B; 4U8U B; 2EVP A; 3UGY A; 2ZLV A; 1QPW B; 2ZSQ A; 2MGF A; 1ABW B; 4G1V A; 3A0G A; 5CN8 A; 2YRS B; 1GZX B; 4OF9 A; 1LFY B; 3O89 A; 1G9V A; 3WCW B; 1LJW A; 1YVQ B; 1IWH A; 3O7N A; 3NG6 A; 3WHM A; 2HBS A; 5KDQ B; 3B75 A; 1UVY A; 1XZV B; 1J40 A; 1MOA A; 1GDJ A; 1YFF B; 3LB3 A; 4M4B B; 2ZWJ A; 5CNB A; 3MYN A; 1Y4P B; 3OGB A; 1HLM A; 2MGA A; 2RI4 B; 3VRE B; 2XKG A; 4N7O B; 1Y8K A; 2DHB A; 102M A; 2EB8 A; 2OLP A; 1O1P A; 1IBE B; 2ZSR A; 3UHV A; 1Y0C B; 2VLX A; 4MQG B; 1BZR A; 2HHE B; 1Y4G A; 1Y35 B; 1XY0 A; 1YE2 B; 1Y0A A; 3V2V A; 5MBA A; 1SI4 B; 1A0Z B; 3WCU C; 1LH6 A; 3MVC A; 3OZU A; 1LH2 A; 4NI0 A; 1A3N A; 2AA1 B; 4FH7 A; 1C7D A; 2V1H A; 1V4U A; 4F68 A; 1J3Y A; 3G52 A; 2WTH A; 1RPS B; 1YCA A; 1OR6 A; 3RJ6 A; 5KER B; 3ZHW A; 3PT8 A; 3UHH A; 1FDH G; 1XZ7 A; 4N8T B; 1YOI A; 3A2G A; 1HDB A; 5CHR A; 1DXT A; 3ASE A; 1Z8U B; 1HGC A; 1J3Z A; 2HBD A; 4YU3 B; 2VYZ A; 5CND A; 2ZLW B; 2W72 C; 1Y09 B; 3S1J A; 5JDO C; 3QJC A; 2EKU A; 2VM0 A; 3P5Q B; 1YIE B; 2ZS0 C; 1Y5F A; 4N7N A; 1O1L B; 1N9H A; 3GQG A; 1Y22 B; 4FWY A; 1V4X A; 3AQ8 A; 1HBS A; 1MBA A; 1HV4 B; 4MXL A; 1BVD A; 1MBD A; 4FWX A; 3MKB B; 1YOG A; 1A3O A; 1YDZ A; 5AZR A; 1YIH B; 1CP5 A; 104M A; 1GJN A; 1QSI B; 3HEN A; 1OR4 A; 3WCV D; 1MYJ A; 4XDI A; 1YEQ B; 1LFZ A; 5HAV A; 4YU4 B; 1XCH A; 2MB5 A; 2NX0 A; 1LH1 A; 1J7S B; 4OOD A; 2BLJ M; 2PGH A; 5HY8 A; 1Y7C B; 1RQ3 A; 2GRF A; 2GTL C; 2GDM A; 1GDK A; 1HBB B; 1GVH A; 1KFR A; 4MAX A; 3HHB A; 1Y46 A; 4TYX A; 5F2A A; 2DN3 B; 3WCV B; 1XQ5 B; 1JP8 A; 1MNI A; 2R4W A; 1DXU B; 1QXD A; 1MLO A; 3E55 A; 4NK2 A; 1HGA B; 1DXD A; 2QMB A; 1ABY A; 5IKS A; 1YVT B; 4HSX A; 4M4A A; 1GCV B; 4O4Z A; 1WVP A; 2W6Y A; 4F6I A; 1HLB A; 1AJG A; 1THB B; 5EOH A; 3BJ3 A; 1J7Y A; 3WCT D; 1F5P A; 5AZQ A; 4L7Y B; 3WTG A; 3G4W A; 4O4T A; 1OUT A; 1NEJ A; 3GQR A; 3G4Y A; 5MBN A; 1MWB A; 1C7C B; 5HU6 B; 5EUI A; 1M9P B; 1EBT A; 2MYA A; 3OO4 B; 2AUR A; 1DWS A; 2AV0 A; 1LFT B; 3GQP A; 3NMM A; 1V4W A; 1NS6 A; 2E2Y A; 1S5Y B; 2DN1 B; 1V75 A; 1YOH A; 1BBB B; 2IN4 A; 1ECA A; 3ZJS A; 3WCU D; 2QLS B; 5B84 A; 1YHE A; 5ILM A; 3LR7 A; 1XZ4 A; 1Y7G B; 1SHR A; 2GRH A; 2G12 A; 1MTJ A; 4FH6 A; 1O1J B; 1R1X B; 1VXH A; 3NFE A; 1Y8W B; 3PI2 A; 3NL7 A; 3NML A; 1DO7 A; 1CMY B; 3GOU B; 3A9M A; 3RGK A; 3AT5 A; 3BJ1 A; 1MTI A; 3WCU B; 2G10 A; 4HRT B; 2CMM A; 3WFU A; 1MYG A; 4ESA A; 2HCO B; 2ZLT B; 1Y8I B; 1MBN A; 103M A; 3M38 A; 3QZZ A; 3KUO A; 1Q1F A; 3SZK A; 4U8U C; 2ZS0 D; 2ZS1 D; 1IT3 A; 1GBV A; 4X0L B; 1MCY A; 1MLK A; 2RAO B; 3AT6 A; 3ODQ A; 1CH9 A; 1YGD B; 1WMU A; 3ZJL A; 2O5S X; 4KMV A; 1JPB A; 1Y4B A; 5CNF A; 2LH3 A; 1FSX A; 3QQR A; 1MLG A; 1HGB A; 1A0U B; 1D8U A; 5E6E B; 3K8B A; 1UX9 A; 4MQJ A; 3LQD A; 1RSE A; 2ZS0 B; 2ZS1 B; 4WJG 1; 1UIW A; 2NSS A; 1S5X A; 2GNW A; 2QSP A; 1GLI B; 1YH9 B; 1CG5 B; 3ECL A; 1HJT A; 3G4Q A; 3UHY A; 3S66 B; 1VWT A; 3GKT A; 4ROL B; 2GTL D; 4FC3 A; 3UBC A; 1HBG A; 1YE0 A; 2D5Z B; 4HRR B; 3EOK A; 3ZJI A; 3ARJ A; 2V1F A; 1QI8 B; 1AZI A; 1VRF A; 2LHB A; 3IC2 B; 2MYD A; 1YMA A; 1K0Y B; 2GKN A; 2G0R A; 1HBH B; 4O35 A; 1NQP B; 1OUU B; 1IRC A; 2LH1 A; 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1MKO A; 2VYW A; 1XZ2 A; 1MWD A; 1G0A A; 1Y4V A; 3DHR B; 1BUW A; 1JF4 A; 2ZT1 A; 1OFK A; 1J7W B; 105M A; 2O5M X; 1YEV B; 1R1Y A; 2ZSO A; 3M3A A; 3ZJO A; 1X3K A; 3QJB A; 3UHR A; 1IWH B; 3NG6 B; 3WHM B; 2HBS B; 2BW9 M; 1J40 B; 1Y85 A; 4F4O B; 1Y0W B; 1LH7 A; 1S0H A; 3QM7 A; 2ZSZ A; 1TES A; 1Y8K B; 2DHB B; 2SPM A; 1O1P B; 3WCT C; 3PI9 A; 1YGF A; 3M3B A; 2R80 B; 1MOH A; 1XXT A; 2EF2 A; 2MHB A; 1Y0A B; 2FRK X; 2R4Z A; 7HBI A; 3U3E A; 2ZSY A; 1CO8 A; 2VHB A; 1J3F A; 3UH5 A; 4F6F A; 1VXG A; 1GZX A; 1LFY A; 1JL6 A; 4NI0 B; 1O1K A; 2H8D A; 1C7D B; 3WCW A; 2HBC A; 1J3Y B; 3UHS A; 1MBO A; 3HYU A; 3OK5 A; 3CY5 A; 5KDQ A; 4VHB A; 5EYS A; 3UHU A; 2HZ3 A; 1YFF A; 1JL7 A; 3ZOM A; 3PT8 B; 4M4B A; 2D2M C; 1Y4P A; 1XZ7 B; 1SDK A; 1YG5 B; 1JY7 B; 1MLQ A; 1CO9 A; 3HEP A; 2RI4 A; 3VRE A; 1HDB B; 3KMF A; 2DC3 A; 1COH A; 1G08 A; 3TM9 A; 3VHB A; 3LB1 A; 1DXT B; 1Y0C A; 1J3Z B; 3E4N A; 2HBD B; 1Y35 A; 1CPW A; 1HBR A; 1A6N A; 4C0N A; 1O1I A; 1DXC A; 1CQ2 A; 4KJT A; 1SI4 A; 3UHI A; 1L2K A; 4UUR A; 1Y5F B; 3QM9 A; 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