The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
137
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structure length |
137
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Chain Sequence |
GFKQDIATIRGDLRTYAQDIFLAFLNKYPDERRYFKNYVGKSDQELKSMAKFGDHTEKVFNLMMEVADRATDCVPLASDANTLVQMKQHSSLTTGNFEKLFVALVEYMRASGQSFDSQSWDRFGKNLVSALSSAGMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| molecule keywords |
Dehaloperoxidase A
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| publication title |
A unique role for the distal histidine observed in carbonmonoxy dehaloperoxidase-hemoglobin A structures
rcsb |
| source organism |
Amphitrite ornata
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| total genus |
55
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| structure length |
137
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| sequence length |
137
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
1.11.-.-: |
| pdb deposition date | 2012-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1RPS B; 4MXL A; 3G4W A; 1B86 A; 1HBB A; 3HHB A; 1Y31 A; 1Y8I A; 2Z6N B; 1BJE A; 1O1L A; 4U8U A; 3PI4 A; 1Y7G A; 3OZU A; 1JZK A; 2NX0 A; 3LQD B; 1G9V A; 1MLS A; 1J3F A; 3WCW C; 1YGF B; 1J40 B; 1HV4 A; 5SW7 B; 1HAC B; 1V75 B; 2LH5 A; 1O1M B; 1Y4F A; 2HCO B; 5E29 B; 2VM0 A; 1SI4 A; 1RQ3 B; 4F4O A; 1RVW B; 4MAX A; 1HDS B; 1O1J B; 1UX8 A; 1A6N A; 3UHV A; 107M A; 3DHR A; 3CY5 A; 1SPG A; 1SDL A; 1YGD A; 1A01 A; 3DHT B; 1NIH A; 2ZS0 D; 1XZU B; 2DN3 A; 1S0H A; 1LH6 A; 3RJ6 A; 3S1I A; 3WI8 A; 3UHN A; 1YEQ A; 1IT3 A; 3AQ8 A; 3M38 A; 1XZ5 A; 2V1H A; 3G4R A; 2BKM A; 3WCW B; 1CIK A; 3WTG A; 1J41 B; 5HLX A; 1NZ5 A; 4LPI A; 1FLP A; 2LH1 A; 4ESA A; 2D5Z A; 2HBF B; 4L7Y B; 1LA6 A; 3MJU B; 3BA2 A; 5AZR A; 1DXU A; 1Y0W A; 2SPM A; 3D7O A; 1LH2 A; 3FH9 B; 3LHB A; 2D2M A; 3ZJH A; 4G51 B; 109M A; 1A3N B; 1K1K B; 2G0S A; 4WCH D; 3OZW A; 1CH1 A; 1HAB A; 1DWT A; 1CH3 A; 1MWB A; 3ECZ A; 1Y85 A; 3OVU C; 1BUW B; 4HBI A; 2MHB A; 1B86 B; 3MN0 A; 4U8U D; 2ZT0 A; 1Y31 B; 1JEB B; 4FWZ A; 1MLO A; 4NK1 A; 4N7O A; 3OO4 A; 1RTE A; 1YOH A; 1MOH A; 4MQC A; 1S56 A; 1V4U A; 3NG6 A; 4DC7 A; 1MBD A; 1Y0A B; 2HZ2 A; 1DWS A; 1QSH B; 4HRT A; 3ONZ B; 4WJG 1; 1DXV A; 2QU0 A; 3DHR B; 3QJE A; 1MOC A; 1A01 B; 1G09 A; 3VHB A; 1NIH B; 4MPM A; 3EOK B; 5EUI A; 1GDJ A; 2ZT3 A; 1MYJ A; 1Y09 B; 3EU1 B; 2MGL A; 5JDO F; 1M9P A; 5ILR A; 1IWH A; 2ZLT A; 2GNW A; 4AVD A; 2QSS A; 3DUT A; 1CH9 A; 1SWM A; 2MGA A; 2ZSR A; 1MTK A; 1LFT A; 3CIU B; 1RQ4 B; 1CG5 A; 1Y7C A; 2D5Z B; 2ZFO A; 1OBM A; 2FAM A; 1SPE A; 3WCV A; 2VYZ A; 4NI0 B; 1MTJ A; 1DXU B; 1Y4V A; 2ZT1 A; 3ASE A; 1JL6 A; 1CQ2 A; 1YE2 B; 3RJN B; 1SDK A; 1GBU A; 4PQ6 A; 2D2M D; 1CO8 A; 2MYB A; 1DLY A; 3UHH A; 2OH9 A; 5CN6 A; 2NSS A; 3BCQ A; 5CN9 A; 1XZV B; 1Y0C B; 2LH3 A; 1ECA A; 4KJT A; 3BJ3 B; 1IOP A; 4DWU A; 3E5I A; 3BJ1 A; 3GKV B; 2ZSY A; 2H8D B; 3QZX A; 1CO9 A; 4ROM A; 3S65 B; 1CBM A; 1NS6 A; 3NG6 B; 1A0Z A; 1LH7 A; 7HBI A; 2NRM A; 2RI4 A; 3NMM A; 1YEU B; 1Y4R A; 3AQ5 A; 1JF3 A; 3M39 A; 3MYN A; 1CG8 B; 4HRT B; 3DR9 A; 3PI9 A; 1DXV B; 4NI1 B; 1Y8H A; 4F6D A; 1N9X A; 4TWU A; 2G0Z A; 1YMC A; 5JOM A; 1S5Y A; 3ARK A; 3WFX A; 1MKO B; 1V4W A; 2E2Y A; 1EW6 A; 1O1K B; 5EE4 C; 1MLK A; 1LHS A; 1S6A A; 2NSR A; 5CN8 A; 1VXG A; 5EV5 A; 2G10 A; 3A0G A; 2D2N C; 1X9F C; 3WCT A; 1GLI A; 3E4N A; 1Y8K B; 1K0Y A; 3ZOM A; 1TES A; 3QJD A; 2ZFO D; 1GBV A; 1TU9 A; 2ZT2 A; 1MLG A; 1Y46 A; 2IN4 A; 5M3S A; 1UMO A; 3ODQ B; 1PBX A; 2MBW A; 3WCV D; 1V9Q A; 1W92 A; 2R80 A; 3QM5 A; 2Z6T A; 4H2L A; 1DO3 A; 3NFE B; 1QXD A; 1NPG A; 2VEB A; 1YHU A; 4VHB A; 1GCV B; 3BCQ B; 1CH2 A; 2D2N B; 1CLS A; 1X9F B; 1M6M A; 3ZOL A; 3A59 A; 3P5Q B; 2VLY A; 2QLS A; 1O1P B; 3FS4 B; 1YFF A; 4YU3 A; 2ZSP A; 3SDH A; 1QI8 A; 3IC2 A; 3UH6 A; 2MGD A; 1NQP B; 2BLI A; 1A0Z B; 1J7Y A; 1Y5F A; 1YVQ B; 1Y5K B; 2ZSZ A; 1UIW B; 1VXA A; 4HHB B; 3LR7 A; 3H58 A; 2O5T X; 5KKK A; 2EB9 A; 4SDH A; 2AUQ A; 3GLN A; 2FRK X; 1J3Y B; 1HLM A; 1J3Z B; 2W72 A; 4FH7 A; 3HF4 A; 1LFZ A; 2XKH A; 1KD2 A; 1MYH A; 1DXT B; 3WHM B; 1QPW A; 1O1N A; 3ARJ A; 3D17 B; 1YHR A; 2ZLX A; 2ZSN A; 3A0G B; 3WCT D; 3SZK A; 1YIH A; 2PEG B; 1GLI B; 1THB B; 1GJN A; 1ECN A; 1BZ0 A; 1UFP A; 1AJ9 A; 1HHO B; 1MLR A; 4O2G A; 3G4U A; 4HRR A; 1GBV B; 1GZX B; 3ORD A; 2ZFB B; 2PGH A; 3NL7 B; 3IC0 B; 2H35 A; 1Y2Z A; 1HDB B; 3WR1 B; 1JPB A; 2ZLW A; 2D60 A; 1D8U A; 3UHX A; 1YVT B; 1Y0D A; 4XS0 B; 2QSP A; 1RPS A; 2V1G A; 2HBG A; 4PQC A; 3MBA A; 2Z6N A; 1Q1F A; 1YHU D; 1NWI A; 3LQD A; 1A6M A; 1YZI B; 1YGF A; 1F63 A; 1J40 A; 2HHE B; 5AZQ A; 4JAC A; 1RTX A; 5SW7 A; 1MYF A; 2W6W A; 1HAC A; 3MVC A; 1O1M A; 2HCO A; 2WTH A; 1Y4B A; 2AV0 A; 5E29 A; 3HRW B; 1RVW A; 1HDS A; 1O1J A; 3WCU D; 5CN4 A; 3QZZ A; 1VRE A; 1HBS B; 3DHT A; 1AJG A; 5C6E B; 2GTL C; 2OLP A; 5HAV A; 2G11 A; 1XZU A; 1Y01 B; 1DO4 A; 5JDO D; 2BLH A; 2QMB B; 2MGH A; 1CH4 A; 1BZZ B; 3S66 A; 2ZLU B; 3WCW A; 1AZI A; 1ECD A; 6HBI A; 1J41 A; 1MBI A; 2HBF A; 3UHE A; 1VXD A; 1Y4G B; 3MJU A; 3PI8 B; 1YHR B; 3K9Z A; 1J7S B; 1Y22 B; 3BJ2 B; 3TLD A; 1BZ0 B; 3UHG A; 2GTL B; 1MNO A; 2HBE B; 3ZJN A; 3VRF B; 1CQX A; 1C7B B; 3MOU A; 2HBS B; 2PGH B; 5JGG B; 3O89 A; 1Y2Z B; 3A5A A; 3PI1 A; 1A3N A; 1UX9 A; 3OO5 A; 1BUW A; 1Y45 B; 1MLQ A; 1H1X A; 1N9H A; 4XDI A; 1RSE A; 1JEB A; 3QM7 A; 3VRE A; 1HRM A; 3PEL B; 3D1A B; 1GVH A; 1Y0A A; 2D6C A; 1Y4B B; 1CH5 A; 1MBA A; 5AB8 A; 1QSH A; 3AQ9 A; 2FRI X; 3GQR B; 1VRF A; 3G52 A; 1S61 A; 3ONZ A; 5F0B A; 2MGM A; 1LFL A; 2MB5 A; 1VXC A; 1HBA A; 1ASH A; 1V5H A; 2MGG A; 2CMM A; 2LH2 A; 3EOK A; 1HBH B; 1JDO A; 1XXT B; 1Y09 A; 3EU1 A; 1R1Y A; 1G0A A; 2ZSX A; 2GKM A; 1C40 B; 5ILM A; 1YIE B; 2MGC A; 3A2G A; 3R0G A; 4KMV A; 2ZSS A; 1UC3 A; 1ABW B; 3S66 B; 1MLM A; 2VEE A; 3CIU A; 4NS2 A; 1RQ4 A; 2GRH A; 3LB1 A; 3UHT A; 1MBO A; 2M6Z B; 1S5X B; 1OJ6 A; 4NI0 A; 4MQJ B; 1YE2 A; 3S1J A; 1FSL A; 5CNB A; 1YDZ A; 3UGY A; 2Z85 A; 1MWD A; 1XZV A; 4MQI B; 1Y0C A; 1YMA A; 3BOM A; 3BJ3 A; 3OO5 B; 4MBA A; 2LHB A; 1O1I B; 3GKV A; 4TWV A; 1Y8W B; 2H8D A; 3TM3 A; 1AJH A; 3S48 C; 2BMM A; 3VRE B; 3HEO A; 3S65 A; 2V1E A; 3KMF C; 1YEU A; 1HGB B; 4QAU A; 1VHB A; 2D5X A; 2HBD B; 1NS9 B; 1CG8 A; 1B0B A; 5B85 A; 106M A; 4NI1 A; 3AQ7 A; 3V2Z A; 1IRC A; 1LFL B; 4YU4 B; 1HBA B; 4TYX A; 3MJP B; 4F6F A; 5MBA A; 2DHB B; 1HLB A; 5EYS A; 1MKO A; 1O1K A; 1ECO A; 1R1Y B; 1G0A B; 2DXM A; 2QFK A; 1Y7D B; 2HHB B; 1XQ5 A; 3V2V A; 1Y8K A; 3KUN A; 1UVX A; 4NXC A; 2W6V B; 2XYK A; 3ODQ A; 4DWT A; 1CP5 A; 1JZM A; 1MLN A; 1MOA A; 3D1K B; 3NFE A; 1MLF A; 1V4X B; 101M A; 3QJC B; 2VYY A; 4NZI A; 3GYS B; 5ILE A; 1HBR B; 1IT2 A; 1YDZ B; 1GCV A; 3M3B A; 4MBN A; 2D2N A; 3ECX A; 1X9F A; 1RQA B; 1XY0 B; 3BOM B; 4ODC B; 2H8F B; 3GK9 A; 3P5Q A; 1O1P A; 3FS4 A; 3HEP A; 3VRG B; 1EBC A; 1X3K A; 1T1N B; 1OR4 A; 5CNC A; 1NQP A; 3GOU B; 1HSY A; 1HCO B; 1YVQ A; 1Y5K A; 4PNJ A; 1UIW A; 4HHB A; 4M4A B; 5CNF A; 3ZJO A; 2OHB A; 1DKE A; 1VXB A; 2EF2 A; 1MDN A; 2D5X B; 5E83 B; 1FN3 B; 2B7H B; 1LTW A; 1J3Y A; 1J3Z A; 4UUR A; 1MCY A; 2GNV A; 1DXT A; 3WHM A; 1CMY B; 5HU6 B; 4O4Z A; 1YCB A; 3WFU A; 1FAW A; 3D17 A; 3G4Q A; 4X0L B; 3GDJ B; 2VYW A; 1R1X B; 2DXM B; 2BLJ M; 1FDH G; 1THB A; 2PEG A; 3E55 A; 1MLH A; 1XQ5 B; 1SHR B; 4F69 A; 2KSC A; 1XZ2 B; 5MBN A; 1C7C B; 1HHO A; 3QM6 A; 1DLW A; 3ARL A; 1XCH A; 3GQG B; 3IXF A; 1GZX A; 2ZFB A; 3NL7 A; 3IC0 A; 1HDB A; 3WR1 A; 1M6C A; 3UBC A; 1JW8 A; 1JF4 A; 3UHR A; 1YVT A; 105M A; 4XS0 A; 1YEV A; 1LJW B; 1L2K A; 2G3H A; 3UHB A; 2R1H B; 2LH7 A; 3UI0 A; 2V1J A; 2WY4 A; 1YZI A; 5JDO E; 2R4X A; 2HHE A; 1YEN B; 2D2N D; 1OR6 A; 2ZWJ A; 1X9F D; 4KMW A; 1MYG A; 2ZS1 C; 1HBG A; 2AUR A; 1MNH A; 2Z8A A; 1IBE B; 3HRW A; 3U3E A; 4IRO B; 5D1V A; 1XZ4 B; 1DXC A; 1HBS A; 2HBC B; 1DXD A; 2O5B X; 5CNG A; 5C6E A; 1BZ6 A; 1FSX B; 3HXN B; 3PT7 A; 1DKE B; 1A9W A; 3ZJM A; 3OZV A; 2JHO A; 1MYM A; 4MQK B; 1YHE B; 1NZ2 A; 1CIO A; 2QMB A; 1BZZ A; 1G08 A; 5HLQ A; 2ZLU A; 4G1V A; 1A0U B; 1F5O A; 1I3E A; 5C6Y A; 2ZS1 B; 4NK2 A; 3ZJL A; 1I3D A; 1Y4G A; 3AT5 B; 1FAW B; 3ZJR A; 3PI8 A; 1JP9 A; 2IG3 A; 1JP6 A; 1J7S A; 3WFT A; 1Y22 A; 3BJ2 A; 2ZT4 A; 1J52 A; 2GTL A; 2HBE A; 3VRF A; 2VHB A; 1C7B A; 1N9I A; 2HBS A; 3A9M A; 1VXF A; 5JGG A; 2BW9 M; 1X46 A; 2YRS B; 5CMV A; 1YG5 B; 1Y4P B; 2QFN A; 1YEV B; 1Y45 A; 5KER A; 1OUU B; 1VXH A; 1URY A; 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2DN2 B; 1A6G A; 1DTI A; 4C0N A; 3AT6 B; 3K8B B; 1GDL A; 5KDQ A; 4G1B A; 1XZ7 A; 3TM9 A; 4UZV A; 1YEO B; 1Y7D A; 1YE0 B; 2HHB A; 3QQQ A; 4MQG B; 3WCW D; 2FRF A; 1GCW B; 1Y0T B; 1HGA A; 3KMF A; 2ZS0 B; 3QJB B; 4O35 A; 1Y4Q B; 5E6E B; 1V07 A; 1A00 B; 2W6V A; 3WFW A; 1C7D B; 4MQH B; 3UHK A; 4JYQ A; 1U7S A; 3KUO A; 4B4Y A; 2VLZ A; 3O7N A; 3R5I B; 3D1K A; 1V4X A; 4OF9 A; 2FRJ X; 3PIA B; 1LH5 A; 3QM8 A; 2O5S X; 3QJC A; 4U8U C; 5CN5 A; 3GYS A; 1OFJ A; 2C0K A; 4H0B A; 1Y5J A; 1HBR A; 1LH1 A; 3AG0 A; 5HY8 B; 1MBS A; 1BZR A; 4FWX A; 2V1F A; 2HHD B; 2GLN A; 2XKI A; 1RQA A; 1XY0 A; 3UHI A; 4ODC A; 2H8F A; 1YCA A; 4HSW A; 1CP0 A; 2R50 A; 3VRG A; 1NEJ B; 1T1N A; 4C44 A; 3UH7 A; 5ILP A; 3GOU A; 3ZJJ A; 2RAO B; 1JL7 A; 1HCO A; 4M4A A; 1EWA A; 1HDA B; 1J7Y B; 5EU2 A; 1A6K A; 5E83 A; 1NXF A; 1HBB B; 1FN3 A; 3HHB B; 1Y8I B; 4U8U B; 1O1L B; 1Y7G B; 2B7H A; 1JZL A; 1G9V B; 3W4U B; 103M A; 1HV4 B; 1DUO A; 4N7P B; 1Y4F B; 2AV3 A; 3LB2 A; 2GDM A; 2W31 A; 3ZH0 A; 1BVD A; 1CMY A; 5HU6 A; 3OK5 A; 4F6G A; 1SI4 B; 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