The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
65
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
LSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKHDRFKHLKTEAEMKASEDLKKAGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Regulating the nitrite reductase activity of myoglobin by redesigning the heme active center
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Myoglobin
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| molecule tags |
Oxygen storage
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| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
65
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-01-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4F6J A; 1Y09 A; 3NMM A; 2V1F A; 1Y2Z A; 1CH2 A; 1Y35 B; 1OR4 A; 1GZX B; 1IBE B; 3SDN A; 1XZ5 A; 3AQ7 A; 2ZS1 C; 2D2M A; 1Y31 A; 3R0G A; 3NL7 B; 4ZVA A; 3UHU A; 1LH1 A; 4PQ6 A; 1SPG A; 1ABW A; 1UFJ A; 1Y83 B; 3S48 C; 2OH9 A; 1MYG A; 3KMF A; 1Y45 A; 1YDZ B; 2ZLW A; 2GTL D; 2ZT0 A; 5ILE A; 1CBL A; 3D4X A; 3D1K A; 1XQ5 A; 1HBB B; 1CLS B; 2ZT4 A; 4YU3 A; 3GQG B; 1YHR B; 3QJC B; 1S6A A; 2QLS B; 3OZV A; 4MPM A; 1VWT A; 1ECD A; 5M3S A; 2MYC A; 6HBW A; 2DHB A; 1XCH A; 1HGA A; 3OVU C; 1LUE A; 2D2N D; 1V75 A; 2GRH A; 1MYZ A; 3D7O A; 5CNF A; 1VHB A; 3QQQ A; 1MTI A; 3GQP B; 2R1H A; 3SDH A; 1HAC B; 5F0B A; 2HBD B; 1A01 A; 3E5O A; 1BZ1 B; 3G46 A; 3GDJ A; 4NI1 A; 1YGD B; 1JP8 A; 2C0K A; 4TWV A; 1Y4R A; 1MLK A; 4FC3 B; 3PIA B; 4NK2 A; 5ILP A; 2R4X A; 5E29 A; 3MYN A; 3HEO A; 2RAO B; 1SDL A; 5ILM A; 1EMY A; 1NZ4 A; 3G4Y A; 2BLJ M; 4G1B A; 5JDO F; 3VAU A; 1FDH A; 1YEU A; 2AUQ A; 4DWT A; 1EBT A; 1A6N A; 3MKB A; 3BJ2 B; 3KMF C; 2ZLT A; 3WCU D; 1A9W A; 3QZZ A; 5HU6 B; 3PI9 A; 4N7O A; 1RQ3 A; 3IXF A; 3BOM B; 2XYK A; 2ZFO D; 3A0G A; 1UIW A; 2H8F B; 2VLY A; 3UHE A; 1BAB B; 2NSS A; 4MQJ B; 1C7D A; 3WR1 A; 1S5Y A; 1RSE A; 1URY A; 1Y8W B; 1CP0 A; 1V4W B; 1Y46 B; 3A5G A; 2MGK A; 2W72 A; 1YEO A; 1A3N A; 1SDK A; 4H2L A; 2YRS B; 4N7N B; 2MYA A; 4AVE A; 1MBI A; 1NS6 A; 4M4B B; 3BCQ B; 2D2N B; 4HSW A; 4OF9 A; 1XZ2 A; 1A0U B; 1HBA B; 2XKG A; 103M A; 1Y8I A; 1MTJ A; 1C40 B; 5EOH A; 2WY4 A; 2B7H A; 1DXC A; 5CN7 A; 1XZ4 B; 2O5Q X; 5HLU A; 4TYX A; 1J7Y A; 5AZR A; 1JF3 A; 4HRT A; 4N8T B; 3PI3 A; 2MGC A; 3QJB A; 5HY8 B; 2MGH A; 1HBH A; 4KMW A; 3TM3 A; 1LFY B; 2FRF A; 2G14 A; 4FWX A; 4L7Y A; 1SI4 A; 3A59 A; 4IRO B; 1D8U A; 3ZJP A; 1PBX B; 1DXT A; 3UHX A; 4ROM A; 1Y7D A; 1DO7 A; 2DN1 A; 4O35 A; 1DXU B; 1DKE B; 4F68 A; 5CHR A; 2HBF A; 2ZFO B; 2ZSR A; 5EE4 C; 3ONZ A; 3MVC A; 1LFZ B; 1HDB A; 1YEN A; 2W72 C; 3G53 A; 3PT7 A; 3NFE B; 4MQI A; 2LH5 A; 2V1I A; 3OZW A; 1HAB A; 1OUT A; 1N9X A; 3MYM A; 1CH9 A; 1O1N A; 2AV0 A; 2HBE B; 1A3O A; 1LHT A; 2G0X A; 1A0Z B; 2VEE A; 2QSS A; 1O1J A; 5HAV A; 1O1P A; 3AQ5 A; 3UHR A; 1Y4Q B; 1FDH G; 1HLM A; 2O58 X; 3G52 A; 4NXC A; 1Y35 A; 2MHB A; 1BUW A; 4F69 A; 1IBE A; 2W6X A; 1A6K A; 5JOM A; 1RPS B; 5CN8 A; 4N7P B; 5EET A; 3AQ9 A; 4HSX A; 1J41 B; 3NL7 A; 1JEB A; 3K8B A; 4SDH A; 2E2Y A; 4O1T A; 4YU4 B; 107M A; 106M A; 1CH4 A; 1YMC A; 4LPI A; 3QM8 A; 1CLS A; 2EKT A; 1V07 A; 1N9F A; 3GQG A; 1YHR A; 5D5R A; 3QJC A; 1S69 A; 1MLH A; 1MCY A; 2W31 A; 3UGY A; 2D5Z B; 1Y09 B; 3NMM B; 1Y2Z B; 2ZS0 D; 1IOP A; 3NG6 A; 3GOU A; 1OR6 A; 5AZQ A; 3WCW C; 2Z85 A; 1YG5 A; 2FRK X; 2ZLU A; 3A5B A; 1MYM A; 1LHS A; 1Y4V B; 1HAC A; 1SPG B; 1ABW B; 1Y45 B; 2ZLW B; 1YHE A; 1BZ1 A; 3GKT A; 1F63 A; 3D1K B; 1I3D A; 2ZLX B; 2GL3 A; 3PIA A; 3HXN A; 2ZSP A; 5B84 A; 1RQ4 A; 3UHV A; 1FSL A; 2RAO A; 2DHB B; 1LH7 A; 1HGA B; 2VEB A; 3UHI A; 1C7C B; 3GYS A; 5ILR A; 1V75 B; 3BA2 A; 1NIH B; 5HU6 A; 2LHB A; 3WI8 A; 3MN0 A; 1A01 B; 1J3Z B; 2GTL A; 3BOM A; 3RJ6 A; 1AZI A; 3NML A; 2H8F A; 3PI2 A; 2MYD A; 5CND A; 1BAB A; 3GDJ B; 4NI0 A; 1EWA A; 3ZHW A; 1Y4B A; 1ABY B; 1LFL A; 1M6M A; 1Y46 A; 5E29 B; 1Y7C A; 1WLA A; 2D5X B; 1SDL B; 2Z6N A; 3UBC A; 2YRS A; 1YOG A; 4N7N A; 3QZX A; 3WCT D; 3BCQ A; 1MNH A; 1YEU B; 2D2N A; 2LH2 A; 3MKB B; 2ZLT B; 1HBA A; 2R4Y A; 4N7O B; 1DO4 A; 5HLX A; 1YMB A; 1RQ3 B; 3G4Q A; 2MBW A; 1C40 A; 1Y0T B; 3QJE B; 1SHR B; 2HZ1 A; 104M A; 1UIW B; 2G3H A; 3QQR A; 1MWC A; 1HV4 B; 1XZ4 A; 2MGB A; 4QAU A; 5CNC A; 1DXD A; 1ECA A; 4HHB A; 1S5Y B; 1X9F A; 5HY8 A; 1NWN A; 1M9P B; 1LFT A; 1LFY A; 2JHO A; 3HF4 A; 6HBI A; 3UHG A; 3V2V A; 3E55 A; 1YEO B; 3QJD B; 1OUU B; 1Y8K B; 1LJW A; 1A3N B; 3PI8 B; 1Q1F A; 1PBX A; 3WCU A; 1JP6 A; 4ESA A; 1MWD A; 1DXU A; 3UH3 A; 2HHD B; 4B3W A; 2AV3 A; 1NZ2 A; 1S5X B; 2R4W A; 3A9M A; 2B7H B; 3OGB A; 108M A; 2O5M X; 1J7Y B; 3OO5 B; 3QJB B; 1CP5 A; 1HBH B; 3WCV D; 2ZT3 A; 1VXD A; 2HBE A; 3UHN A; 1VXH A; 1A0Z A; 2EB8 A; 1SI4 B; 1GCV B; 4MQC B; 2ZSZ A; 1YIE A; 101M A; 3HRW B; 1Y7D B; 2VLZ A; 4MQK B; 1MLR A; 1QSI A; 2MB5 A; 1G08 A; 2DN2 A; 1JZM A; 2ZWJ A; 5EYJ A; 3ONZ B; 1HDB B; 1YEN B; 1G0A A; 2BNL A; 4MQI B; 4L2M A; 1OUT B; 3M3A A; 1QXE B; 1O1N B; 1V4X A; 3LR7 A; 1A3O B; 4YU4 A; 4B4Y A; 1QI8 A; 2OIF A; 2QSS B; 5B85 A; 1YZI B; 1BBB A; 3E4N A; 1CH3 A; 2ZFO C; 2WTH A; 1Y0A B; 1JF4 A; 2MHB B; 1BUW B; 3PEL B; 3FS4 B; 4FWZ A; 109M A; 2QRW A; 1Y7G B; 1GCW B; 2MGE A; 4DC7 A; 1JEB B; 1GDL A; 1Y4V A; 3K8B B; 3O7N A; 3WCV B; 1YOI A; 1VRF A; 1Y5F B; 1LTW A; 3GK9 A; 4PQC A; 3B75 B; 3UHW A; 2QFN A; 5JDO E; 1MYF A; 2ZLX A; 3ASE A; 1URV A; 5CNG A; 2AUR A; 3RJN B; 1NEJ A; 4HBI A; 1YE2 B; 1A4F B; 1MNI A; 1THB B; 1MZ0 A; 3NG6 B; 3CIU B; 3GOU B; 1A00 B; 1CBM A; 4X0L A; 3OO4 A; 1C7C A; 1MLS A; 3UHT A; 1YG5 B; 1OFJ A; 2ZLU B; 1NIH A; 1IT2 A; 4DC8 A; 3M38 A; 1YCA A; 1RTE A; 1JY7 A; 1J3Z A; 1OJ6 A; 4F6F A; 1YHE B; 1JL7 A; 4MQG A; 5CHQ A; 2WTG A; 3HYU B; 1KFR A; 2HHB B; 2NRL A; 4F6D A; 1CQX A; 2ZSY A; 1X9F D; 3HXN B; 4KMV A; 1ABY A; 1HSY A; 1RQ4 B; 2XKI A; 2ZS0 A; 2D5X A; 2D2M C; 1PMB A; 1F5P A; 1DTI A; 3GYS B; 1DWR A; 102M A; 1IWH B; 3QMA A; 1XXT B; 1NQP A; 1MLG A; 2NX0 A; 3UHQ A; 1DLW A; 2GTL B; 1L2K A; 1Y0T A; 3QJE A; 1SHR A; 3H58 A; 1KR7 A; 1HV4 A; 3CY5 A; 3KUN A; 2D60 B; 4NI0 B; 5F2A A; 4MAX A; 3UHK A; 2GNW A; 3AQ8 A; 5IKS A; 3LR9 A; 1H97 A; 1M9P A; 2DC3 A; 1Y4B B; 2MGD A; 1LFL B; 1HGB B; 5D1V A; 2VLX A; 3QJD A; 1Y7C B; 1OUU A; 1Y8K A; 4WJG A; 1NPG A; 1HHO A; 5HBI A; 1CO8 A; 2BWH A; 3PI8 A; 2CMM A; 2Z6N B; 2DN3 A; 3UGZ A; 2MGF A; 1BZ0 A; 1B0B A; 2R80 B; 2HHD A; 1C7B B; 1S5X A; 5CN4 A; 2VM0 A; 1YH9 A; 4OOD A; 2O5L X; 2SPL A; 3OO5 A; 2GNV A; 4HHB B; 1X9F B; 2VYY A; 1LFT B; 3UHC A; 1BIJ B; 1CH7 A; 5MBA A; 5AB8 A; 3HF4 B; 1Y8H A; 3ZJH A; 3MOU A; 2EB9 A; 2V1J A; 1LJW B; 1VXB A; 1Y0C A; 1GCV A; 3WCT A; 4MQC A; 2G11 A; 1CMY B; 1J40 B; 3HRW A; 3WCU B; 3VRG A; 4ESA B; 3WHM B; 4MQK A; 1DWS A; 2EKU A; 5C6Y A; 2Z6T A; 3ZJM A; 4H07 A; 2QMB A; 1UMO A; 2ZSN A; 3A5A A; 4MBN A; 2VYW A; 2G0V A; 1DO1 A; 1QXE A; 1UVY A; 1VXC A; 3V2Z A; 1Y7Z B; 1O1L B; 1GLI B; 1U7R A; 1R1Y B; 1SPE A; 2DXM A; 1YZI A; 1YOH A; 3GKV A; 3S1I A; 1YIE B; 1IRD B; 3ECZ A; 1Y0A A; 3ZJR A; 1VRE A; 3G4R A; 1B86 A; 1QSI B; 3DR9 A; 3PEL A; 1DUK A; 1G08 B; 1LH2 A; 3FS4 A; 2DN2 B; 1O1M B; 1F5O A; 1Y7G A; 2O5O X; 1GCW A; 1G0A B; 3ECL A; 1J3F A; 2G12 A; 4NS2 A; 3ZOL A; 3WCV A; 1H1X A; 4C44 A; 3ED9 A; 1Y5F A; 1Y5K A; 1V4X B; 3S65 A; 3B75 A; 1QI8 B; 2GKM A; 4KJT A; 2LH6 A; 1FHJ B; 1G0B B; 4VHB A; 1BBB B; 1LFV B; 1RQA A; 1LH5 A; 1MLQ A; 1YE2 A; 1MLO A; 3S1J A; 3K3U A; 1A4F A; 1FAW B; 1THB A; 3CIU A; 1A00 A; 2SPM A; 5EYS A; 1Y0W A; 2QSP A; 2OLP A; 1MYJ A; 2MYE A; 4XDI A; 2W6Y A; 1VXF A; 3IC2 B; 4HRR B; 1J52 A; 1MLJ A; 2IN4 A; 1SWM A; 5E83 B; 4G51 A; 1BZP A; 3HYU A; 2HHB A; 4U8U D; 5C6E B; 3EDA A; 4O4T A; 1NEJ B; 2FRI X; 1V4U A; 3ARJ A; 2HHE B; 1M6C A; 3QM5 A; 2H35 A; 4XS0 A; 3ZJQ A; 3WCV C; 4X0L B; 2ZFB A; 3OO4 B; 1V5H A; 2G0Z A; 5EE4 D; 3MJP B; 1J7W A; 1IWH A; 1XXT A; 1N9H A; 1JY7 B; 2VRY A; 1WVP A; 2ZSO A; 1J7S B; 4MQG B; 5KKK A; 2D60 A; 3OZU A; 1NS9 B; 1Y0D A; 1OBM A; 2QU0 A; 1YMA A; 1JZK A; 2HBS B; 1HGB A; 2ZS0 B; 2BW9 M; 3HC9 A; 1CG8 B; 1EBC A; 1XYE B; 3LB1 A; 3WFU A; 4M4A A; 1IRC A; 1CH5 A; 3GLN A; 4PNJ A; 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1CO9 A; 1Y5J B; 3ECX A; 3LB4 A; 2HZ3 A; 1YE0 A; 3IC2 A; 2ZT2 A; 4HRR A; 1Y5K B; 110M A; 3S65 B; 5E83 A; 1HBR B; 3ZJI A; 2ZLV B; 3AT6 B; 3R5I B; 3WCP A; 1YHU D; 2FAM A; 5C6E A; 1IT3 A; 1RQA B; 3MJU B; 1MBO A; 2HHE A; 2Z8A A; 2G0S A; 5CNB A; 1Y0W B; 1K1K B; 2QSP B; 1MKO B; 112M A; 1CPW A; 3MJP A; 4ODC A; 3VRF A; 1J7S A; 4G51 B; 2GDM A; 1NS9 A; 2BKM A; 1QSH B; 1YEV B; 1RVW A; 1LH3 A; 1YVQ A; 2HBS A; 1COH A; 3UHS A; 1V4U B; 1R1X A; 1CG8 A; 1KD2 B; 1NZ5 A; 3E5I A; 1XYE A; 2G10 A; 2H35 B; 4XS0 B; 1FN3 B; 2AUP A; 1G09 A; 2ZFB B; 3S66 B; 5SW7 B; 3DHT B; 3PI1 A; 2V1E A; 1VXA A; 3EOK A; 3HHB B; 1HCO B; 1JW8 A; 1JWN A; 1J7W B; 1I3E A; 3MBA A; 3BJ1 A; 1O1I A; 2RI4 A; 3LQD B; 5KDQ B; 3UH5 A; 1O16 A; 3EU1 A; 2VYZ A; 1GBV B; 1MBC A; 4U8U A; 1Y0D B; 2QU0 B; 3PT8 A; 1YHU B; 1Y4P A; 3P5Q A; 3W4U B; 3ZJS A; 1DWT A; 1NXF A; 1K0Y A; 2HBG A; 1IDR A; 1UT0 A; 5MBN A; 2GRF A; 2AA1 A; 1LFQ A; 1YEQ A; 4M4A B; 2HCO B; 4ILZ A; 2ZT1 A; 1XY0 A; 3AT5 B; 1QXD A; 1MOD A; 3HEN A; 5JGG A; 1Y85 A; 4JYQ A; 2ZS1 D; 1GBU A; 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