The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
66
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sequence length |
148
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structure length |
148
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Chain Sequence |
AKTNQTLVENSLNTQLSNWFLLYSKLHRFHWYVKGPHFFTLHEKFEELYDHAAETVDTIAERLLAIGGQPVATVKEYTEHASITDGGNETSASEMVQALVNDYKQISSESKFVIGLAEENQDNATADLFVGLIEEVEKQVWMLSSYLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
METALLOREGULATION DNA-BINDING STRESS PROTEIN
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| publication title |
Morphology of Dry Solid-Supported Protein Monolayers Dependent on the Substrate and Protein Surface Properties.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168
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| molecule tags |
Dna binding protein
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| total genus |
66
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| structure length |
148
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| sequence length |
148
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-03-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00210 | Ferritin | Ferritin-like domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Ferritin | Ferritin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4YKH A; 1S3Q A; 4ZMC A; 2XJN A; 1VEQ A; 3U90 A; 3PW1 B; 5E1U A; 5FFA A; 1KRQ A; 5GU1 X; 4ZLW A; 5GN8 A; 1YV1 A; 4CY9 A; 2WLU A; 5ERJ A; 1XZ3 A; 3UOI A; 1IES A; 5CZU A; 4U3G A; 3MPS A; 2GYD A; 2IY4 A; 3KA4 A; 4Y08 A; 2QQY A; 2C2J A; 2ZG7 X; 3VNX A; 3O7R A; 4RC7 A; 3AF8 X; 5J93 A; 2YW6 A; 3SH6 A; 3KWO A; 2BW1 A; 3IQ1 A; 2CLU A; 4DE6 A; 4DI0 A; 1NFV A; 3IS8 A; 3FSE A; 4P18 A; 1YUZ A; 3PVT B; 4RC6 A; 3F39 A; 2HTN A; 2X17 0; 4DYZ A; 2CIH A; 2Z5P A; 3E1O A; 4ITT A; 5FFE A; 3RBC A; 3QVD A; 3F35 A; 5FEJ A; 2QF9 A; 3BVK A; 3RGD A; 1JRE A; 1S2Z A; 5GN8 B; 3PZA A; 3TA8 A; 1Z6O A; 1RYT A; 1Z6O M; 1JYB A; 1F33 A; 2CLB A; 2IU2 A; 3KA8 A; 3PVY A; 4PG1 A; 3OJ5 A; 5FFD A; 2Z6M A; 2XKQ A; 2V2M A; 3Q4O A; 4KVR A; 3E6S A; 4A25 A; 4MN9 A; 5CMQ A; 3KA9 A; 1AEW A; 4LQV A; 1F30 A; 3Q4R A; 2BKC A; 5D8Y A; 4RC6 B; 3E2C A; 2C2U A; 4XKT A; 4IWK A; 2BJY A; 3ISF A; 2V2S A; 2YJK A; 3AK8 A; 1GWG A; 2FHA A; 3BVL A; 4EVC A; 3GVY A; 5K53 A; 3PVR B; 3KA6 A; 1JKU A; 1SQ3 A; 1QYB A; 2F7N A; 2BK6 A; 4TOG A; 3Q4Q A; 4TW3 A; 4CVR A; 2JD6 0; 4QUW A; 1L8H A; 5C6F A; 4TOA A; 4IXK A; 4CVP A; 2JD7 0; 4Z3B A; 3A9Q A; 2ZA8 A; 4DZ0 A; 1ZS3 A; 1OTK A; 1YUX A; 1TKO A; 4M34 A; 1J30 A; 2GS4 A; 3EZ0 A; 3F32 A; 2W0O A; 1RCI A; 2V2J A; 2VZB A; 3GE4 A; 4TOD A; 4TOF A; 1Z4A A; 4M33 A; 4XGS A; 5JAC A; 3FVB A; 1L8I A; 2FFX J; 4RC5 A; 5D8O A; 1HRS A; 3IS7 A; 4ZKW A; 5I4J A; 2XJO A; 5IX6 A; 3SID A; 2XJM A; 1B71 A; 3E1P A; 1TK6 A; 2Y3Q A; 1N1Q A; 4ITW A; 2V2N A; 3KX9 A; 4MUD A; 2ITB A; 2C41 A; 5D8P A; 3WVU A; 4LQN A; 2IB0 A; 4ZJK A; 1FHA A; 3E1N A; 2JD8 0; 2V2R A; 5HJF A; 4LYU A; 3AF9 X; 1H96 A; 3HL1 A; 2ZG9 X; 4LPN A; 3RD0 A; 3AF7 X; 4DYU A; 4ZKH A; 1VEL A; 1DAT A; 5ERK A; 5J8W A; 4II4 A; 3NP2 X; 2G4H A; 4REU A; 3PWF A; 4ZKX A; 1O9I A; 4AM4 A; 3QD8 A; 2V2L A; 4DYY A; 3R2K A; 3QHB A; 4RC5 B; 2CHI A; 2OH3 A; 2FJC A; 2V2O A; 1JIG A; 4ISM A; 4ERU A; 4LYX A; 4RC7 B; 2C2F A; 2VXX A; 5GU0 X; 5D8X A; 5JKL A; 3F34 A; 4DYX A; 3PWQ C; 5JKL G; 3F33 A; 2OC5 A; 3AK9 A; 3F37 A; 3NOZ X; 4PG0 A; 4EVE A; 5FFB A; 4II4 B; 3PW8 C; 1RCG A; 1NNQ A; 1NF6 A; 4KVQ A; 4M35 A; 3AJQ A; 2XGW A; 2Z5Q A; 1JI5 A; 4AM5 A; 1RCC A; 2ZA7 A; 2D5K A; 4CVT A; 2RBD A; 3R2H A; 5E2D A; 3PVY B; 3HIU A; 1RCE A; 1LKO A; 1BFR A; 4CVS A; 2FKZ A; 1DPS A; 2FG8 A; 4LQJ A; 1MOJ A; 1LKM A; 4XKS A; 4MKU A; 3BT5 A; 4EVB A; 3R2O A; 3RE7 A; 2VXI A; 3OGH A; 1VJX A; 1BG7 A; 3GHQ A; 1JKV A; 1TJO A; 4CYB A; 1NF4 A; 3EGM A; 4PGK A; 2FG4 A; 2FL0 A; 4ML5 A; 1LKP A; 3E1M A; 3O7S A; 5J8S A; 3RAV A; 3Q4N A; 4IWJ A; 5HQO A; 1UVH A; 3A68 A; 5JKM G; 4LPM A; 2ZG8 X; 3F36 A; 2V2I A; 1ZUJ A; 4OYN A; 3NP0 X; 3AJP A; 5LS9 A; 1JTS A; 1O9R A; 2WTL A; 3PWQ A; 2V15 A; 1EUM A; 3EZU A; 3H7G A; 3BVF A; 3R2S A; 4TOC A; 4Z5S A; 2PYB A; 2WLA A; 5LBH A; 3ES3 A; 4CMY V; 3PW8 A; 4TOB A; 5CMR A; 2V2P A; 3ISE A; 3QHC A; 1UMN A; 1JI4 A; 4MY7 A; 1XZ1 A; 2CHP A; 2FZF A; 4TOE A; 5GOU A; 4DAS A; 4R42 A; 3E1Q A; 4E6K A; 3T9J A; 2ZUR X; 1MFR A; 5D8S A; 3KXU A; 1RCD A; 1JGC A; 1QGH A; 1DVB A; 1VEI A; 3F38 A; 3KA3 A; 4RC8 A; 4TO9 A; 2UX1 A; 3QZ3 A; 3BVI A; 4EVD A; 5K52 A; 3UNO A; 4KVS A; 2GYQ A; 4TOH A; 3WVV A; 1IER A; 5AXS A; 3PVR A; 2YW7 A; 3UOF A; 4ISP A; 3E6R A; 5HJH A; 4M32 A; 2CF7 A; 3FI6 A; 2HR5 A; 1SOF A; 5FFC A; 4MJY A; 4ZL5 A; 3R2R A; 5D8R A; 4AM2 A; 3E1J A; 2CN7 A; 4ZTT A; 5LG8 A; 3PW1 A; 2C6R A; 4XKU A; 4ZL6 A; 4CMY A; 3BKN A; 3R2L A; 1S30 A; 3SHX A; 4LQH A; 1LB3 A; 1VLG A; 3SE1 A; 2CN6 A; 4ETR A; 1TKP A; 5LG2 A; 2Z90 A; 2Z5R A; 5D8Q A; 3AJO A; 1BCF A; 3ERZ A; 4PGI A; 3QB9 A; 5J9V A; 3R2M A; 3WNW A; 2YJJ A; 4CYA A; 2CEI A; 4LPJ A; 5GU3 X; 3BVE A; 3WVW A; 3PVT A; 2ZA6 A; 3E1L A; 5GU2 X; 5JKM A; 1R03 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4YKH A; 1S3Q A; 4ZMC A; 2XJN A; 1VEQ A; 3U90 A; 3PW1 B; 5E1U A; 5FFA A; 1KRQ A; 5GU1 X; 4ZLW A; 5GN8 A; 1YV1 A; 4CY9 A; 2WLU A; 5ERJ A; 1XZ3 A; 3UOI A; 1IES A; 5CZU A; 4U3G A; 3MPS A; 2GYD A; 2IY4 A; 3KA4 A; 4Y08 A; 2QQY A; 2C2J A; 4E40 A; 2ZG7 X; 2V8T A; 3VNX A; 3O7R A; 3C1Y A; 4RC7 A; 3AF8 X; 4WJG 4; 5J93 A; 2YW6 A; 3SH6 A; 3KWO A; 2BW1 A; 3IQ1 A; 2CLU A; 4DE6 A; 4DI0 A; 1NFV A; 3IS8 A; 3FSE A; 4P18 A; 1YUZ A; 3PVT B; 4RC6 A; 3F39 A; 3VVA A; 2HTN A; 2X17 0; 4DYZ A; 2CIH A; 2Z5P A; 3E1O A; 4ITT A; 5FFE A; 3RBC A; 3QVD A; 3F35 A; 5FEJ A; 4YXJ A; 2QF9 A; 3BVK A; 3RGD A; 1JRE A; 1S2Z A; 5GN8 B; 3PZA A; 3TA8 A; 1Z6O A; 1RYT A; 1Z6O M; 1JYB A; 1F33 A; 2CLB A; 2IU2 A; 3KA8 A; 3PVY A; 4PG1 A; 3KHK A; 3JZ9 A; 3KDQ A; 3OJ5 A; 5FFD A; 2Z6M A; 2XKQ A; 2V2M A; 3Q4O A; 4KVR A; 3E6S A; 4A25 A; 4MN9 A; 5CMQ A; 3KA9 A; 1AEW A; 4LQV A; 1F30 A; 3Q4R A; 2BKC A; 5D8Y A; 2G38 B; 4RC6 B; 2V8U A; 3E2C A; 2C2U A; 4XKT A; 4IWK A; 2BJY A; 3ISF A; 2V2S A; 2YJK A; 3AK8 A; 1GWG A; 2FHA A; 3BVL A; 4EVC A; 3GVY A; 5K53 A; 3PVR B; 3KA6 A; 1JKU A; 1SQ3 A; 1QYB A; 2F7N A; 2BK6 A; 4TOG A; 3Q4Q A; 4TW3 A; 4CVR A; 2JD6 0; 4QUW A; 1L8H A; 5C6F A; 4TOA A; 4IXK A; 4CVP A; 2JD7 0; 4Z3B A; 3A9Q A; 2ZA8 A; 4DZ0 A; 1ZS3 A; 1OTK A; 1YUX A; 1TKO A; 1J30 A; 2GS4 A; 3EZ0 A; 3F32 A; 4M34 A; 2W0O A; 1RCI A; 2V2J A; 2VZB A; 3GE4 A; 4TOD A; 4TOF A; 1Z4A A; 4M33 A; 4XGS A; 5JAC A; 3FVB A; 1L8I A; 4MXP A; 2FFX J; 4RC5 A; 5D8O A; 1HRS A; 3IS7 A; 4ZKW A; 5I4J A; 2XJO A; 5IX6 A; 3SID A; 2XJM A; 1B71 A; 3E1P A; 1TK6 A; 2Y3Q A; 1N1Q A; 4ITW A; 2V2N A; 3KX9 A; 4MUD A; 2ITB A; 2C41 A; 3FRS A; 5D8P A; 3WVU A; 4LQN A; 2IB0 A; 4ZJK A; 5HU6 D; 1FHA A; 3E1N A; 2JD8 0; 3C21 A; 2V2R A; 5HJF A; 4LYU A; 3AF9 X; 1H96 A; 3HL1 A; 2ZG9 X; 4LPN A; 3RD0 A; 3AF7 X; 4DYU A; 4ZKH A; 1VEL A; 1DAT A; 5ERK A; 5J8W A; 4II4 A; 3NP2 X; 2G4H A; 4REU A; 3PWF A; 4ZKX A; 5JDO A; 1O9I A; 4AM4 A; 3QD8 A; 2V2L A; 4DYY A; 3R2K A; 3QHB A; 4RC5 B; 2CHI A; 2OH3 A; 2OKC A; 2FJC A; 2CWL A; 2V2O A; 1JIG A; 2AR0 A; 4ISM A; 4ERU A; 4LYX A; 4KXR B; 4RC7 B; 2C2F A; 2VXX A; 5GU0 X; 5D8X A; 5JKL A; 3F34 A; 4DYX A; 3PWQ C; 5JKL G; 3F33 A; 3N6O A; 2OC5 A; 3C1Z A; 3AK9 A; 3F37 A; 3NOZ X; 4PG0 A; 4EVE A; 5FFB A; 4II4 B; 4YVZ A; 3PW8 C; 1RCG A; 1NNQ A; 1NF6 A; 4KVQ A; 4M35 A; 3AJQ A; 2XGW A; 5JDO B; 2Z5Q A; 1JI5 A; 4AM5 A; 1RCC A; 2ZA7 A; 2D5K A; 4CVT A; 2RBD A; 3R2H A; 5E2D A; 3PVY B; 3HIU A; 1RCE A; 1LKO A; 1BFR A; 4CVS A; 2FKZ A; 1DPS A; 2FG8 A; 4LQJ A; 1MOJ A; 1LKM A; 4XKS A; 4MKU A; 3BT5 A; 4EVB A; 3R2O A; 3RE7 A; 2VXI A; 3VV9 A; 3UFB A; 3D19 A; 3GGZ A; 3OGH A; 1VJX A; 1BG7 A; 3GHQ A; 1JKV A; 1TJO A; 4CYB A; 1NF4 A; 3EGM A; 4PGK A; 2FG4 A; 2FL0 A; 3FRR A; 4ML5 A; 1LKP A; 3E1M A; 3O7S A; 5J8S A; 3RAV A; 3Q4N A; 4IWJ A; 5HQO A; 1UVH A; 3A68 A; 5JKM G; 4LPM A; 2ZG8 X; 3F36 A; 4W4L B; 2V2I A; 1ZUJ A; 4OYN A; 3NP0 X; 3AJP A; 5LS9 A; 1JTS A; 1O9R A; 2WTL A; 3PWQ A; 2V15 A; 1EUM A; 3M6J A; 3EZU A; 3DBY A; 3H7G A; 3BVF A; 3R2S A; 4TOC A; 4Z5S A; 2PYB A; 2WLA A; 5LBH A; 3ES3 A; 2WWX B; 4CMY V; 3PW8 A; 4TOB A; 5CMR A; 2V2P A; 3ISE A; 3QHC A; 1UMN A; 1JI4 A; 4MY7 A; 1XZ1 A; 2CHP A; 2FZF A; 3W54 A; 4TOE A; 5GOU A; 4DAS A; 4R42 A; 3E1Q A; 4E6K A; 3T9J A; 2ZUR X; 1MFR A; 4YXM A; 5D8S A; 3KXU A; 1RCD A; 1JGC A; 1QGH A; 1DVB A; 1VEI A; 4X0J A; 3F38 A; 3KA3 A; 4RC8 A; 4TO9 A; 3L0M A; 2UX1 A; 3QZ3 A; 3BVI A; 4EVD A; 5K52 A; 3UNO A; 4KVS A; 2GYQ A; 3GGY A; 4TOH A; 3WVV A; 1IER A; 5AXS A; 3PVR A; 2YW7 A; 3UOF A; 4ISP A; 3JZA B; 3E6R A; 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