The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
129
|
sequence length |
303
|
structure length |
303
|
Chain Sequence |
GHMVTRIENLENAKKLWDNANSMLEKGNISGYLKAANELHKFMKEKNLKEDDLRPELSDKTISPKGYAILQSLWGAASDYSRAAATLTESTVEPGLVSAVNKMSAFFMDCKLSPNERATPDPDFKVGKSKILVGIMQFIKDVADPTSKIWMHNTKALMNHKIAAIQKLERSNNVNDETLESVLSSKGENLSEYLSYKYATKDEGREHRYTASTENFKNVKEKYQQMRGDALKTEILADFKDKLAEATDEQSLKQIVAELKSKDEYRILAKGQGLTTQLLGLKTSSVSSFEKMVEETRESIKSQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High-affinity binding of phosphatidylinositol 4-phosphate by Legionella pneumophila DrrA.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
guanine nucleotide exchange factor
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Legionella pneumophila
|
| total genus |
129
|
| structure length |
303
|
| sequence length |
303
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.7.n1: Protein adenylyltransferase. |
| pdb deposition date | 2010-05-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14860 | DrrA_P4M | DrrA phosphatidylinositol 4-phosphate binding domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Ferritin | Ferritin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4MXP A; 3JZ9 A; 3JZA B; 3N6O A; 3L0M A; 2WWX B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3BVI A; 5C6F A; 4DYX A; 4CY9 A; 4LYU A; 1F33 A; 3KA6 A; 3PZA A; 2IB0 A; 4CVS A; 2GYD A; 3F37 A; 3QZ3 A; 2C41 A; 4ERU A; 5FFD A; 3GGY A; 1JKU A; 3W54 A; 4CMY V; 3IS8 A; 1RYT A; 3E1O A; 3RAV A; 5D8Q A; 1NF4 A; 3KXU A; 2XJO A; 4RC6 A; 4ISP A; 4LQN A; 2V2R A; 5D8S A; 4PG1 A; 1S2Z A; 1O9I A; 5GU3 X; 1R03 A; 4P18 A; 5J93 A; 2YW7 A; 1XZ3 A; 1Z6O M; 1ZUJ A; 4Z5S A; 4RC7 B; 4XKU A; 3PWQ A; 1RCC A; 3PWQ C; 1BCF A; 1MOJ A; 3Q4Q A; 2XJN A; 3GGZ A; 1JKV A; 3F39 A; 2W0O A; 3KX9 A; 3IQ1 A; 4KVS A; 2Z5P A; 1TK6 A; 3RGD A; 4KVQ A; 3KA9 A; 4REU A; 3SH6 A; 4TW3 A; 3F35 A; 1DVB A; 3LKD A; 1VJX A; 2FG4 A; 3PVT A; 1L8H A; 2XKQ A; 3FVB A; 1QYB A; 4M34 A; 2ZUR X; 4WJG 4; 3SID A; 3R2K A; 5LG8 A; 3O7S A; 4EVD A; 3R2S A; 1AEW A; 1J30 A; 2FG8 A; 5HU6 D; 3AF7 X; 2MGY A; 2ZG8 X; 4DZ0 A; 3N6O A; 3E2C A; 3RE7 A; 3GHQ A; 1NFV A; 4EVE A; 2FJC A; 5JKL A; 4LQV A; 5D8Y A; 4X0J A; 3BVF A; 2CHP A; 3QVD A; 4II4 A; 5D8P A; 4RC5 B; 4IWK A; 1DPS A; 3AJO A; 1VLG A; 4DAS A; 5JKM A; 1VEL A; 5J8S A; 4OYN A; 2JD6 0; 5FFB A; 2V8T A; 3H7G A; 4ZLW A; 5J8W A; 4M33 A; 4EVB A; 2V2M A; 5GU1 X; 2OKC A; 3R2M A; 2CIH A; 4W4L B; 2OH3 A; 3BVE A; 2CLB A; 4IXK A; 4RC7 A; 3VVA A; 5ERK A; 4AM5 A; 4PGK A; 4E40 A; 3OJ5 A; 1F30 A; 3KA8 A; 2CN7 A; 3KA3 A; 3UOF A; 4XKS A; 4IWJ A; 1RCG A; 2BK6 A; 4LPN A; 3F32 A; 3AF9 X; 3ES3 A; 2YJJ A; 3UFB A; 3E1J A; 2V8U A; 3GVY A; 2V2P A; 4II4 B; 5CZU A; 1BFR A; 3JZA B; 3E1N A; 3ERZ A; 1KRQ A; 5E2D A; 1NF6 A; 3WVW A; 3EGM A; 4LPM A; 5FFC A; 3HIU A; 3Q4N A; 4TOB A; 3V3K B; 2AR0 A; 2ZA6 A; 3AJQ A; 3A68 A; 2BJY A; 5I4J A; 4DYZ A; 1RCE A; 1FHA A; 4EVC A; 1SOF A; 4YKH A; 2CLU A; 1BG7 A; 3VNX A; 3M6J A; 4RC5 A; 2G4H A; 5GU2 X; 5J9V A; 2WWX B; 3BVL A; 4TOD A; 1QGH A; 1GWG A; 1S30 A; 4AM4 A; 2XGW A; 3VV9 A; 3C1Z A; 3FSE A; 4Y08 A; 3IS7 A; 2Z6M A; 5FEJ A; 2C6R A; 3PWF A; 2JD8 0; 2Z5R A; 3GE4 A; 1IES A; 4DI0 A; 4TOG A; 5ERJ A; 3AK8 A; 3O7R A; 5GN8 B; 3OGH A; 2V2L A; 3NOZ X; 4ZKX A; 1RCD A; 4MJY A; 5JDO B; 4QUW A; 3U90 A; 2ZA7 A; 4LPJ A; 4MXP A; 5D8X A; 2V2O A; 1YUX A; 3FRS A; 3QHB A; 1H96 A; 4KVR A; 4A25 A; 3WVU A; 5GOU A; 1HRS A; 3AF8 X; 4ZJK A; 3R2O A; 1LKO A; 1XZ1 A; 1VEQ A; 1JYB A; 1JRE A; 1TJO A; 2CWL A; 3E6S A; 4MY7 A; 5LBH A; 4TOE A; 3RBC A; 1S3Q A; 3UNO A; 3SHX A; 5D8O A; 2WLU A; 1JI4 A; 4ML5 A; 2ITB A; 4W4K B; 1JI5 A; 4PGI A; 5LS9 A; 2Y44 A; 2CEI A; 1UVH A; 2G38 B; 4DYU A; 2V2S A; 4TO9 A; 3E1L A; 4YVZ A; 4TOH A; 5IX6 A; 3NP2 X; 2V2N A; 2V2I A; 3R2L A; 2FL0 A; 2FZF A; 3HL1 A; 4CVP A; 1UMN A; 3E1M A; 3PVR B; 1SQ3 A; 4M35 A; 2VXI A; 4DE6 A; 1RCI A; 2ZG9 X; 2Y3Q A; 2BW1 A; 4Z3B A; 2CF7 A; 3D19 A; 4ZL6 A; 1LKM A; 5E1U A; 1JGC A; 5LG2 A; 4E6K A; 3FRR A; 3TA8 A; 3E1P A; 2IU2 A; 5D8R A; 3F34 A; 1B71 A; 1YUZ A; 3UOI A; 4CYA A; 1DAT A; 1Z4A A; 4YXM A; 4ETR A; 1ZS3 A; 2PYB A; 4TOA A; 4KXR B; 5GN8 A; 3ISF A; 4PG0 A; 1TKO A; 3F33 A; 2C2F A; 2RBD A; 3EZU A; 1YV1 A; 2X17 0; 3QD8 A; 2CHI A; 4ITT A; 4LYX A; 1L8I A; 5JDO A; 2WTL A; 4YXJ A; 3AK9 A; 2C2J A; 1JIG A; 1MFR A; 4CVT A; 1NNQ A; 3BT5 A; 2UX1 A; 2HTN A; 5AXS A; 3C1Y A; 5JAC A; 4ZKH A; 5K53 A; 1VEI A; 3JZ9 A; 1O9R A; 2Z90 A; 2FHA A; 4TOF A; 3SE1 A; 1JTS A; 4ZTT A; 4MKU A; 2JD7 0; 4CMY A; 5JKL G; 3T9J A; 3PW1 B; 5K52 A; 3RD0 A; 3L0M A; 2FKZ A; 4ITW A; 5CMR A; 3R2H A; 3KA4 A; 4CVR A; 5FFA A; 3F36 A; 4ZL5 A; 2IY4 A; 4U3G A; 5JKM G; 3E1Q A; 1Z6O A; 1TKP A; 3PVY A; 3PW8 A; 3PW8 C; 4ISM A; 2F7N A; 3Q4R A; 2HR5 A; 3C21 A; 3E6R A; 4ZKW A; 4RC8 A; 3AJP A; 3PVR A; 2C2U A; 2XJM A; 2GS4 A; 1LB3 A; 5HJF A; 3BKN A; 2OC5 A; 2Z5Q A; 3WNW A; 4XKT A; 1LKP A; 3MPS A; 2VXX A; 4MUD A; 4RC6 B; 3QB9 A; 4MN9 A; 2WLA A; 2YJK A; 2BKC A; 3NP0 X; 2GYQ A; 2QF9 A; 3EZ0 A; 2ZG7 X; 1IER A; 4TOC A; 3ISE A; 3FI6 A; 5FFE A; 2V15 A; 4CYB A; 5HJH A; 5CMQ A; 2CN6 A; 2VZB A; 3F38 A; 1OTK A; 4R42 A; 1EUM A; 4AM2 A; 4LQH A; 3WVV A; 4DYY A; 3A9Q A; 3PVY B; 2QQY A; 4XGS A; 1N1Q A; 3Q4O A; 3KWO A; 3R2R A; 3PVT B; 5HQO A; 2ZA8 A; 3QHC A; 2YW6 A; 3KHK A; 3C23 A; 2V2J A; 3BVK A; 4LQJ A; 4ZMC A; 3KDQ A; 5GU0 X; 2N02 A; 3PW1 A; 4M32 A; 2D5K A; 2FFX J; 3DBY A; #chains in the Genus database with same CATH homology 3BVI A; 5C6F A; 4DYX A; 4CY9 A; 4LYU A; 1F33 A; 3KA6 A; 3PZA A; 2IB0 A; 4CVS A; 2GYD A; 3F37 A; 3QZ3 A; 2C41 A; 4ERU A; 5FFD A; 3GGY A; 1JKU A; 3W54 A; 4CMY V; 3IS8 A; 1RYT A; 3E1O A; 3RAV A; 5D8Q A; 1NF4 A; 3KXU A; 2XJO A; 4RC6 A; 4ISP A; 4LQN A; 2V2R A; 5D8S A; 4PG1 A; 1S2Z A; 1O9I A; 5GU3 X; 1R03 A; 4P18 A; 5J93 A; 2YW7 A; 1XZ3 A; 1Z6O M; 1ZUJ A; 4Z5S A; 4RC7 B; 4XKU A; 3PWQ A; 1RCC A; 3PWQ C; 1BCF A; 1MOJ A; 3Q4Q A; 2XJN A; 3GGZ A; 1JKV A; 3F39 A; 2W0O A; 3KX9 A; 3IQ1 A; 4KVS A; 2Z5P A; 1TK6 A; 3RGD A; 4KVQ A; 3KA9 A; 4REU A; 3SH6 A; 4TW3 A; 3F35 A; 1DVB A; 3LKD A; 1VJX A; 2FG4 A; 3PVT A; 1L8H A; 2XKQ A; 3FVB A; 1QYB A; 4M34 A; 2ZUR X; 4WJG 4; 3SID A; 3R2K A; 5LG8 A; 3O7S A; 4EVD A; 3R2S A; 1AEW A; 1J30 A; 2FG8 A; 5HU6 D; 3AF7 X; 2MGY A; 2ZG8 X; 4DZ0 A; 3N6O A; 3E2C A; 3RE7 A; 3GHQ A; 1NFV A; 4EVE A; 2FJC A; 5JKL A; 4LQV A; 5D8Y A; 4X0J A; 3BVF A; 2CHP A; 3QVD A; 4II4 A; 5D8P A; 4RC5 B; 4IWK A; 1DPS A; 3AJO A; 1VLG A; 4DAS A; 5JKM A; 1VEL A; 5J8S A; 4OYN A; 2JD6 0; 5FFB A; 2V8T A; 3H7G A; 4ZLW A; 5J8W A; 4M33 A; 4EVB A; 2V2M A; 5GU1 X; 2OKC A; 3R2M A; 2CIH A; 4W4L B; 2OH3 A; 3BVE A; 2CLB A; 4IXK A; 4RC7 A; 3VVA A; 5ERK A; 4AM5 A; 4PGK A; 4E40 A; 3OJ5 A; 1F30 A; 3KA8 A; 2CN7 A; 3KA3 A; 3UOF A; 4XKS A; 4IWJ A; 1RCG A; 2BK6 A; 4LPN A; 3F32 A; 3AF9 X; 3ES3 A; 2YJJ A; 3UFB A; 3E1J A; 2V8U A; 3GVY A; 2V2P A; 4II4 B; 5CZU A; 1BFR A; 3JZA B; 3E1N A; 3ERZ A; 1KRQ A; 5E2D A; 1NF6 A; 3WVW A; 3EGM A; 4LPM A; 5FFC A; 3HIU A; 3Q4N A; 4TOB A; 3V3K B; 2AR0 A; 2ZA6 A; 3AJQ A; 3A68 A; 2BJY A; 5I4J A; 4DYZ A; 1RCE A; 1FHA A; 4EVC A; 1SOF A; 4YKH A; 2CLU A; 1BG7 A; 3VNX A; 3M6J A; 4RC5 A; 2G4H A; 5GU2 X; 5J9V A; 2WWX B; 3BVL A; 4TOD A; 1QGH A; 1GWG A; 1S30 A; 4AM4 A; 2XGW A; 3VV9 A; 3C1Z A; 3FSE A; 4Y08 A; 3IS7 A; 2Z6M A; 5FEJ A; 2C6R A; 3PWF A; 2JD8 0; 2Z5R A; 3GE4 A; 1IES A; 4DI0 A; 4TOG A; 5ERJ A; 3AK8 A; 3O7R A; 5GN8 B; 3OGH A; 2V2L A; 3NOZ X; 4ZKX A; 1RCD A; 4MJY A; 5JDO B; 4QUW A; 3U90 A; 2ZA7 A; 4LPJ A; 4MXP A; 5D8X A; 2V2O A; 1YUX A; 3FRS A; 3QHB A; 1H96 A; 4KVR A; 4A25 A; 3WVU A; 5GOU A; 1HRS A; 3AF8 X; 4ZJK A; 3R2O A; 1LKO A; 1XZ1 A; 1VEQ A; 1JYB A; 1JRE A; 1TJO A; 2CWL A; 3E6S A; 4MY7 A; 5LBH A; 4TOE A; 3RBC A; 1S3Q A; 3UNO A; 3SHX A; 5D8O A; 2WLU A; 1JI4 A; 4ML5 A; 2ITB A; 4W4K B; 1JI5 A; 4PGI A; 5LS9 A; 2Y44 A; 2CEI A; 1UVH A; 2G38 B; 4DYU A; 2V2S A; 4TO9 A; 3E1L A; 4YVZ A; 4TOH A; 5IX6 A; 3NP2 X; 2V2N A; 2V2I A; 3R2L A; 2FL0 A; 2FZF A; 3HL1 A; 4CVP A; 1UMN A; 3E1M A; 3PVR B; 1SQ3 A; 4M35 A; 2VXI A; 4DE6 A; 1RCI A; 2ZG9 X; 2Y3Q A; 2BW1 A; 4Z3B A; 2CF7 A; 3D19 A; 4ZL6 A; 1LKM A; 5E1U A; 1JGC A; 5LG2 A; 4E6K A; 3FRR A; 3TA8 A; 3E1P A; 2IU2 A; 5D8R A; 3F34 A; 1B71 A; 1YUZ A; 3UOI A; 4CYA A; 1DAT A; 1Z4A A; 4YXM A; 4ETR A; 1ZS3 A; 2PYB A; 4TOA A; 4KXR B; 5GN8 A; 3ISF A; 4PG0 A; 1TKO A; 3F33 A; 2C2F A; 2RBD A; 3EZU A; 1YV1 A; 2X17 0; 3QD8 A; 2CHI A; 4ITT A; 4LYX A; 1L8I A; 5JDO A; 2WTL A; 4YXJ A; 3AK9 A; 2C2J A; 1JIG A; 1MFR A; 4CVT A; 1NNQ A; 3BT5 A; 2UX1 A; 2HTN A; 5AXS A; 3C1Y A; 5JAC A; 4ZKH A; 5K53 A; 1VEI A; 3JZ9 A; 1O9R A; 2Z90 A; 2FHA A; 4TOF A; 3SE1 A; 1JTS A; 4ZTT A; 4MKU A; 2JD7 0; 4CMY A; 5JKL G; 3T9J A; 3PW1 B; 5K52 A; 3RD0 A; 3L0M A; 2FKZ A; 4ITW A; 5CMR A; 3R2H A; 3KA4 A; 4CVR A; 5FFA A; 3F36 A; 4ZL5 A; 2IY4 A; 4U3G A; 5JKM G; 3E1Q A; 1Z6O A; 1TKP A; 3PVY A; 3PW8 A; 3PW8 C; 4ISM A; 2F7N A; 3Q4R A; 2HR5 A; 3C21 A; 3E6R A; 4ZKW A; 4RC8 A; 3AJP A; 3PVR A; 2C2U A; 2XJM A; 2GS4 A; 1LB3 A; 5HJF A; 3BKN A; 2OC5 A; 2Z5Q A; 3WNW A; 4XKT A; 1LKP A; 3MPS A; 2VXX A; 4MUD A; 4RC6 B; 3QB9 A; 4MN9 A; 2WLA A; 2YJK A; 2BKC A; 3NP0 X; 2GYQ A; 2QF9 A; 3EZ0 A; 2ZG7 X; 1IER A; 4TOC A; 3ISE A; 3FI6 A; 5FFE A; 2V15 A; 4CYB A; 5HJH A; 5CMQ A; 2CN6 A; 2VZB A; 3F38 A; 1OTK A; 4R42 A; 1EUM A; 4AM2 A; 4LQH A; 3WVV A; 4DYY A; 3A9Q A; 3PVY B; 2QQY A; 4XGS A; 1N1Q A; 3Q4O A; 3KWO A; 3R2R A; 3PVT B; 5HQO A; 2ZA8 A; 3QHC A; 2YW6 A; 3KHK A; 3C23 A; 2V2J A; 3BVK A; 4LQJ A; 4ZMC A; 3KDQ A; 5GU0 X; 2N02 A; 3PW1 A; 4M32 A; 2D5K A; 2FFX J; 3DBY A;
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait... #similar chains, but unknotted ...loading similar chains, please wait... #similar chains in the pdb database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait...
