The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
146
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structure length |
121
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Chain Sequence |
NLDDTLDVLNDLLQTSKDGEAGFHACAEDLRDPQLKAAMLEQSRDCAAAADELERIVLELGGKPEEAVLNECERGEDVAKHRYQAALEKSLPAEIHQVIERQYQGVLRHHDRVRALRDARA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The AEROPATH project targeting Pseudomonas aeruginosa: crystallographic studies for assessment of potential targets in early-stage drug discovery.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Putative uncharacterized protein
|
| molecule tags |
Unknown function
|
| source organism |
Pseudomonas aeruginosa
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| total genus |
57
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| structure length |
121
|
| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-04-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF09537 | DUF2383 | Domain of unknown function (DUF2383) |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Ferritin | Ferritin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1R03 A; 2GYD A; 5GU0 X; 3FSE A; 4DYX A; 1NF6 A; 2V2M A; 1JGC A; 1IES A; 5JKM G; 1S2Z A; 1B71 A; 4DYY A; 3NOZ X; 3F39 A; 1UMN A; 3BVL A; 3PVY A; 2ZG7 X; 2JD7 0; 5FEJ A; 4MN9 A; 4KVR A; 5FFE A; 5LG2 A; 2Z5Q A; 4Z5S A; 2YW6 A; 4TOA A; 2V15 A; 2Z5P A; 1F30 A; 2CF7 A; 3AF8 X; 1L8I A; 1AEW A; 3EZ0 A; 4DAS A; 3E6S A; 3BKN A; 3BVK A; 2V2N A; 4PGI A; 1TJO A; 1Z6O M; 1NF4 A; 1RCC A; 5K53 A; 3H7G A; 2Z90 A; 1RCI A; 1RCG A; 2QQY A; 2ZA6 A; 2VXI A; 2XJN A; 3PW8 A; 2W0O A; 1QYB A; 2FHA A; 4A25 A; 3PVY B; 4LYX A; 5K52 A; 4PG0 A; 1BG7 A; 3KA3 A; 2ITB A; 4ZL5 A; 4MY7 A; 4AM5 A; 1TKP A; 2C2F A; 2C2U A; 4DYU A; 4M32 A; 2RBD A; 3T9J A; 5E1U A; 5GN8 B; 1JIG A; 3O7S A; 1BCF A; 2Z6M A; 3BVE A; 1TK6 A; 3BT5 A; 3SH6 A; 2C6R A; 5J93 A; 1DVB A; 2V2L A; 1IER A; 4TW3 A; 3ES3 A; 1HRS A; 5LS9 A; 4OYN A; 4CY9 A; 2IB0 A; 4ERU A; 1DAT A; 2FG4 A; 1VJX A; 2XKQ A; 5GOU A; 3E1J A; 1SQ3 A; 2G4H A; 2FKZ A; 4IWK A; 5LBH A; 4RC6 A; 2CHP A; 4XKU A; 1YUX A; 4AM2 A; 4U3G A; 2CEI A; 5JKL A; 3KA9 A; 1KRQ A; 4ZKW A; 4RC5 A; 2ZUR X; 5J9V A; 2CN7 A; 1RCD A; 4CVR A; 4LPM A; 4KVQ A; 2ZA8 A; 1LKM A; 3ERZ A; 4CVS A; 5J8W A; 2Y3Q A; 4DYZ A; 4REU A; 3QHC A; 3NP2 X; 4LQH A; 1YV1 A; 1JKU A; 1H96 A; 1Z6O A; 2Z5R A; 4CMY A; 5E2D A; 3WVW A; 1N1Q A; 4II4 A; 4TOB A; 5JKL G; 3OJ5 A; 1VEI A; 3E1M A; 1TKO A; 3R2O A; 3HIU A; 2YJK A; 2GS4 A; 4RC6 B; 3RBC A; 1NNQ A; 4EVB A; 2FG8 A; 3BVF A; 3F37 A; 1MOJ A; 2IY4 A; 3ISF A; 4RC5 B; 1QGH A; 4Z3B A; 4ISM A; 4RC8 A; 5D8O A; 3PWQ C; 2C41 A; 2BK6 A; 4IXK A; 5IX6 A; 5CMR A; 3PVT A; 2XJM A; 1JI5 A; 5GU2 X; 4RC7 B; 4TOF A; 3E1Q A; 1FHA A; 3GHQ A; 1YUZ A; 4ZKX A; 3IQ1 A; 4XKT A; 3PW1 A; 4II4 B; 2WTL A; 3UNO A; 5ERJ A; 1OTK A; 3AK9 A; 1MFR A; 3Q4R A; 1LB3 A; 3AF7 X; 3F32 A; 4TOD A; 3PW8 C; 5JAC A; 2JD6 0; 2JD8 0; 3F35 A; 3F36 A; 3QB9 A; 2FJC A; 3R2R A; 5C6F A; 4CMY V; 2VZB A; 1S3Q A; 5FFA A; 4MUD A; 2ZA7 A; 5D8Y A; 1LKP A; 4LPN A; 3Q4N A; 4XKS A; 3WVU A; 2X17 0; 4DE6 A; 3R2H A; 5D8X A; 1VEQ A; 2V2P A; 3A9Q A; 1F33 A; 2XJO A; 4TOE A; 3KA8 A; 2ZG9 X; 1RCE A; 4MJY A; 4ZJK A; 2YJJ A; 3VNX A; 4Y08 A; 4YKH A; 1VEL A; 2CLB A; 5GU1 X; 4M35 A; 4ISP A; 3OGH A; 5HQO A; 4CYA A; 1JI4 A; 3AJP A; 5FFC A; 1SOF A; 2BKC A; 3F33 A; 3IS8 A; 3RD0 A; 5AXS A; 4LPJ A; 4PG1 A; 4TOH A; 5J8S A; 2FZF A; 2UX1 A; 4R42 A; 4LYU A; 2BJY A; 5D8R A; 5HJH A; 3PWF A; 2WLU A; 1J30 A; 4LQN A; 2FFX J; 2OC5 A; 2VXX A; 3AJO A; 3QZ3 A; 3UOI A; 4ZKH A; 3GVY A; 5LG8 A; 1S30 A; 3R2S A; 1JTS A; 5D8Q A; 3GE4 A; 2HR5 A; 1JYB A; 3EZU A; 4XGS A; 2CIH A; 2GYQ A; 3BVI A; 2YW7 A; 1EUM A; 3E6R A; 3EGM A; 1O9I A; 3RE7 A; 4ETR A; 4DZ0 A; 3KA6 A; 2OH3 A; 2ZG8 X; 4KVS A; 3RAV A; 1NFV A; 3E1N A; 3R2M A; 5CMQ A; 3WNW A; 4TOC A; 4EVD A; 4PGK A; 3PZA A; 2BW1 A; 3U90 A; 3ISE A; 4CVT A; 4QUW A; 3PWQ A; 5GN8 A; 3R2L A; 5FFD A; 4ZMC A; 1JKV A; 3Q4O A; 3Q4Q A; 4IWJ A; 1XZ3 A; 4M33 A; 5GU3 X; 3KWO A; 4ITW A; 3E2C A; 3E1P A; 4M34 A; 5D8S A; 3FI6 A; 3QD8 A; 4MKU A; 4CYB A; 3AJQ A; 4E6K A; 4DI0 A; 1LKO A; 5HJF A; 2V2O A; 2CN6 A; 3HL1 A; 3PVT B; 3KA4 A; 5D8P A; 3TA8 A; 4LQV A; 1VLG A; 2V2J A; 2CLU A; 2FL0 A; 3MPS A; 2V2S A; 2V2I A; 4TO9 A; 2CHI A; 3QVD A; 3R2K A; 1DPS A; 3PW1 B; 4ITT A; 3E1L A; 2HTN A; 4EVC A; 3PVR A; 3KX9 A; 3FVB A; 3KXU A; 3A68 A; 3SID A; 1Z4A A; 1BFR A; 3F38 A; 3QHB A; 4ZTT A; 5I4J A; 2XGW A; 4P18 A; 3RGD A; 2QF9 A; 4EVE A; 3SE1 A; 3NP0 X; 4CVP A; 1ZS3 A; 4LQJ A; 3AK8 A; 3F34 A; 3O7R A; 2F7N A; 2D5K A; 5ERK A; 1UVH A; 4ZL6 A; 2PYB A; 2IU2 A; 1O9R A; 1RYT A; 4ML5 A; 3AF9 X; 4ZLW A; 5JKM A; 1ZUJ A; 2C2J A; 1L8H A; 2V2R A; 3SHX A; 5FFB A; 1GWG A; 4AM4 A; 3E1O A; 3UOF A; 2WLA A; 1XZ1 A; 4RC7 A; 4TOG A; 3PVR B; 1JRE A; 5CZU A; 3WVV A; 3IS7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1R03 A; 2GYD A; 5GU0 X; 3FSE A; 4DYX A; 1NF6 A; 2V2M A; 4W4L B; 1JGC A; 1IES A; 5JKM G; 1S2Z A; 1B71 A; 4DYY A; 3NOZ X; 3F39 A; 1UMN A; 3BVL A; 3PVY A; 2ZG7 X; 2JD7 0; 4WJG 4; 5FEJ A; 4MN9 A; 4KVR A; 5FFE A; 5LG2 A; 2Z5Q A; 4Z5S A; 2YW6 A; 4TOA A; 2V15 A; 2Z5P A; 1F30 A; 2CF7 A; 3AF8 X; 1L8I A; 1AEW A; 3EZ0 A; 3GGY A; 4DAS A; 3E6S A; 3BKN A; 3BVK A; 2V2N A; 4PGI A; 1TJO A; 1Z6O M; 1NF4 A; 1RCC A; 5JDO B; 4YXJ A; 5K53 A; 3H7G A; 2Z90 A; 3UFB A; 1RCI A; 1RCG A; 2QQY A; 2ZA6 A; 2VXI A; 2XJN A; 3PW8 A; 2W0O A; 3GGZ A; 1QYB A; 2FHA A; 4A25 A; 3PVY B; 4LYX A; 5K52 A; 4PG0 A; 1BG7 A; 3KA3 A; 2ITB A; 4ZL5 A; 4MY7 A; 4AM5 A; 1TKP A; 2C2F A; 2C2U A; 4DYU A; 4M32 A; 2RBD A; 3T9J A; 5E1U A; 5GN8 B; 1JIG A; 3O7S A; 1BCF A; 2Z6M A; 3BVE A; 1TK6 A; 3BT5 A; 3SH6 A; 3D19 A; 2C6R A; 5J93 A; 1DVB A; 2V2L A; 1IER A; 4TW3 A; 3ES3 A; 1HRS A; 3C1Y A; 5LS9 A; 4OYN A; 4CY9 A; 3FRS A; 2IB0 A; 4ERU A; 1DAT A; 2FG4 A; 1VJX A; 2XKQ A; 3VV9 A; 3N6O A; 5GOU A; 3E1J A; 1SQ3 A; 2G4H A; 2FKZ A; 4IWK A; 5LBH A; 4RC6 A; 2CHP A; 4XKU A; 1YUX A; 4AM2 A; 4U3G A; 2CEI A; 5JKL A; 3KA9 A; 1KRQ A; 4ZKW A; 4RC5 A; 2ZUR X; 5J9V A; 2CN7 A; 1RCD A; 4CVR A; 4LPM A; 4KVQ A; 2ZA8 A; 1LKM A; 3ERZ A; 4CVS A; 3L0M A; 4YVZ A; 5J8W A; 2Y3Q A; 4DYZ A; 4REU A; 3QHC A; 3NP2 X; 4LQH A; 1YV1 A; 1JKU A; 1H96 A; 1Z6O A; 2Z5R A; 4CMY A; 5E2D A; 3WVW A; 1N1Q A; 4II4 A; 4TOB A; 5JKL G; 3OJ5 A; 1VEI A; 3E1M A; 1TKO A; 3R2O A; 3HIU A; 2YJK A; 2GS4 A; 4RC6 B; 3RBC A; 1NNQ A; 4EVB A; 2FG8 A; 3BVF A; 3F37 A; 1MOJ A; 2IY4 A; 3ISF A; 4RC5 B; 1QGH A; 4Z3B A; 4ISM A; 4RC8 A; 5D8O A; 3PWQ C; 2C41 A; 2BK6 A; 4IXK A; 5IX6 A; 5CMR A; 4MXP A; 3PVT A; 2XJM A; 1JI5 A; 5GU2 X; 4RC7 B; 4TOF A; 3E1Q A; 1FHA A; 3GHQ A; 1YUZ A; 4ZKX A; 5HU6 D; 3IQ1 A; 4XKT A; 3PW1 A; 4II4 B; 2WTL A; 3UNO A; 5ERJ A; 1OTK A; 4X0J A; 3AK9 A; 1MFR A; 3Q4R A; 1LB3 A; 3AF7 X; 3F32 A; 4TOD A; 3PW8 C; 5JAC A; 2JD6 0; 2JD8 0; 3F35 A; 3F36 A; 3V3K B; 3QB9 A; 2FJC A; 3R2R A; 5C6F A; 4CMY V; 2VZB A; 1S3Q A; 5FFA A; 4MUD A; 4KXR B; 2ZA7 A; 5D8Y A; 1LKP A; 4LPN A; 3Q4N A; 4XKS A; 3WVU A; 2X17 0; 4DE6 A; 3R2H A; 5D8X A; 1VEQ A; 2V2P A; 3A9Q A; 1F33 A; 2XJO A; 4TOE A; 3KA8 A; 2ZG9 X; 2AR0 A; 2CWL A; 1RCE A; 4MJY A; 4YXM A; 4ZJK A; 2YJJ A; 3VNX A; 4Y08 A; 4YKH A; 1VEL A; 2CLB A; 5GU1 X; 3DBY A; 4M35 A; 4ISP A; 3OGH A; 5HQO A; 4CYA A; 1JI4 A; 3AJP A; 5FFC A; 1SOF A; 2BKC A; 3F33 A; 3W54 A; 3IS8 A; 3RD0 A; 5AXS A; 3KDQ A; 4LPJ A; 4PG1 A; 4TOH A; 5J8S A; 2FZF A; 2UX1 A; 4R42 A; 4LYU A; 2BJY A; 5D8R A; 5HJH A; 3PWF A; 2WLU A; 1J30 A; 4LQN A; 2FFX J; 2OC5 A; 2VXX A; 3AJO A; 3QZ3 A; 3UOI A; 4ZKH A; 3GVY A; 3C21 A; 5LG8 A; 1S30 A; 3R2S A; 2G38 B; 1JTS A; 5D8Q A; 3GE4 A; 2HR5 A; 1JYB A; 3EZU A; 4XGS A; 2CIH A; 2GYQ A; 3BVI A; 2YW7 A; 1EUM A; 3E6R A; 3EGM A; 1O9I A; 3RE7 A; 4ETR A; 4DZ0 A; 3KA6 A; 4E40 A; 2OH3 A; 2ZG8 X; 4KVS A; 3RAV A; 5JDO A; 1NFV A; 3JZA B; 3E1N A; 3R2M A; 5CMQ A; 3WNW A; 4TOC A; 4EVD A; 3M6J A; 4PGK A; 3PZA A; 2BW1 A; 3U90 A; 3ISE A; 4CVT A; 4QUW A; 3PWQ A; 5GN8 A; 3R2L A; 3VVA A; 5FFD A; 4ZMC A; 1JKV A; 3Q4O A; 3Q4Q A; 4IWJ A; 1XZ3 A; 4M33 A; 5GU3 X; 3KHK A; 3KWO A; 3C23 A; 4ITW A; 3E2C A; 3JZ9 A; 3E1P A; 4M34 A; 5D8S A; 3FI6 A; 3QD8 A; 4MKU A; 2Y44 A; 3LKD A; 4CYB A; 3AJQ A; 2V8U A; 4E6K A; 4DI0 A; 1LKO A; 5HJF A; 2V2O A; 2CN6 A; 3HL1 A; 3PVT B; 3KA4 A; 5D8P A; 3TA8 A; 4LQV A; 1VLG A; 2V2J A; 2CLU A; 2FL0 A; 3MPS A; 4W4K B; 2V2S A; 2V2I A; 4TO9 A; 2CHI A; 3QVD A; 3R2K A; 1DPS A; 3PW1 B; 2OKC A; 4ITT A; 3E1L A; 3FRR A; 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