3AKKA

Crystal structure of a helicobacter pylori proinflammatory kinase ctka
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
PTIDFTFCEINPKKGFGGANGNKISLFYNNELYMVKFPPKPSTHKEMSYTNGCFSEYVACHIVNSLGLKVQETLLGTYKNKIVVACKDFTTHQYELVDFLSLKNTMIELEKSGKDTNLNDVLYAIDNQHFIEPKVLKCFFWDMFVADTLLGNFDRHNGNWGFLRASNSKEYQIAPIFDCGSCLYPQADDVVCQKVLSNIDELNARIYNFPQSILKDDNDKKINYYDFLTQTNNKDCLDALLRIYPRIDMNKIHSIIDNTPFMSEIHKEFLHTMLDERKSKIIDVAHTRAIELSLQH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords CtkA
publication title Helicobacter pylori proinflammatory protein up-regulates NF-kappaB as a cell-translocating Ser/Thr kinase
pubmed doi rcsb
source organism Helicobacter pylori
total genus 102
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07804 HipA_C HipA-like C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.1070.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, Domain 5 Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, Domain 5 3akkA02
3.30.200.120 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3akkA01
3AKLA 3AKKA 3AKJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4L42A 4H1MA 4AW2A 5FQDC 3S1HA 4I6LA 2CCIA 5JHAA 5CAQA 3A7GA 4IX4A 5LCJA 2VWYA 3ROCA 3BHYA 5K4IA 1YWRA 4AA0A 4FX3A 3ML8A 4ENYA 3RTPA 1P14A 2WTDA 4FV7A 4M69B 4MBIA 3E64A 1OM1A 4BYJA 4CKJA 2QG7A 4LUEA 3HMIA 4O84A 5GJDA 2C6LA 5K3YA 1G8JA 5A6OA 3QJZA 3EB0A 3FUPA 3O2MA 4QYGA 3WZDA 4TL0A 4YR8A 3ZCLA 5M06A 4TWOA 3DBDA 4MNEA 3BU6A 3R00A 2CN8A 3ZHPC 2I1MA 4E4XA 4PTCA 1YW2A 3PG3A 3I0OA 4OT5A 2ITQA 4ZTLA 1GZKA 1URWA 3O51A 3VRZA 2CPKE 4BY9E 3HL7A 2XNPA 3GQLA 3HUCA 4FKTA 2JDTA 4CT1A 2J0MB 3SQQA 4FKRA 3F9NA 3NNWA 4IC7A 4TZRA 2G2HA 1Y8GA 4G31A 4A9TA 4BJJB 3Q6WA 4UWHA 4EOKA 4FKPA 4DT8A 4ZP5A 4J8MA 4MCVA 3ZO4A 4PH4B 4QMVA 2X8EA 4IW0A 3LXLA 3C4WA 4OLIA 4TNDA 4EHEA 4J99A 4NKSA 3HUBA 5EQPA 3T9IA 5E8WA 3SX9A 5CEOA 4NJ3A 5AV4A 4P7EA 3PJ1A 2NRYA 2QOIA 4C61A 2WIHA 3ZW3A 3BL9A 3OHTA 3PY0A 4ALVA 2E9VA 5L2SA 2O63A 4FIFA 2XZSA 3EMGA 3HKOA 4AGUA 3G6HA 4IM3A 4WNMA 3ORNA 3UE4A 4EOQA 3PG1A 3MY5A 4RJ7A 2OF4A 3MESA 3MJ1A 4G6NA 3R8ZA 2DQ7X 5I9WA 3KXZA 3LFDA 3BBTB 4ASZA 4QQCA 4RQVA 1KE6A 2W9ZB 3E92A 4D0WA 3N4TA 1WAKA 4A9UA 5HQ0A 1E8ZA 4HNIA 2Z7RA 4NCTC 4IZYA 4OBPA 5CXHA 1XO2B 2EU9A 3HP5A 4M0ZA 3DDQA 5CVGA 2PL0A 2ONLC 4O83A 3VS4A 3W0PA 1Q8UA 3BU3A 3TUBA 3BEGA 3KVXA 4DEGA 2HYYA 1Q8TA 4F7NA 3Q4ZA 4KZCA 4QYFA 2RF9A 3BLQA 1KSWA 3RM6A 4IWOA 4FLHA 4C37A 1H1QA 4LM5A 4PMPA 2FO0A 4PS3A 1FMOE 2VX0A 3C0GA 1UNGA 3E5AA 4BHZA 3ROYA 4FI1A 5HEZA 2QHNA 1P2AA 5HBHA 4HCUA 4HVDA 4KSQA 5DNRA 3D94A 4M97A 3ORKA 3KCKA 3Q4TA 4BBMA 2FUMA 4DH1A 1JOWB 1GOLA 2DWBA 3NFFB 4RVLA 4AT5A 1JSVA 4MHAA 4Q9SA 2B55A 4HVBA 2W0JA 2WMVA 2WTKC 2PMIA 4C38A 3DZQA 5CQUA 2FSMX 3QWKA 2QVSE 3CTQA 1BL6A 3QQUA 4FV3A 3V3VA 4BIEA 2W9FB 4JQEA 5HZNA 4K18A 2YCSA 3MH1A 4C4FA 2X4ZA 4F64A 2HCKA 3FXZA 5IMXA 1OPJA 3QC9A 1OPLA 5CWZA 3W32A 3RM7A 2BPMA 4G5JA 2RFNA 4U42A 2ONLA 4FTQA 4PTGA 3S2PA 3W0MA 3SA0A 2OW3A 3IOKA 4ZAUA 5JGDA 3PLSA 1M2PA 3ZXZA 4WRSA 4EH7A 2WXGA 5IA2A 3D7ZA 2I6LA 2WMUA 2EB2A 3FEGA 3KK8A 4XBRA 4MNEB 4PRJA 2PHKA 2RFDA 3R8UA 4ANBA 2JFMA 2WXLA 3FPMA 2UVXA 2XRWA 2VU3A 4GSBA 4I4FA 4IACA 3KXNA 3VRYA 5L3AA 2UZOA 2JBOA 4B9DA 2NO3A 1J91A 2OK1A 5LVLA 1UKHA 5F1ZA 1NVRA 3VJNA 1XBAA 4GKHA 1IAHA 3D15A 4GCJA 2RG5A 3P0MA 1O6YA 3VJOA 5HICA 1YOLA 4PDPA 2XP2A 3BELA 5TKDA 2UZDA 1PY5A 5BUJA 2W5AA 1H1WA 3BX5A 3FV8A 5AP7A 4AUAA 4BDFA 4BI0A 2QQ7A 4C59A 3E8DA 1MUOA 3RAKA 3TV6A 3UZRA 4BDBA 4B7TA 2Y9QA 2C5XA 3HGKA 3EQBA 4DH8A 3ZEWA 5F4NA 4EQMA 5IMEA 2DUVA 4IB0A 2H96A 3BHTA 5AP2A 3FYKX 2DS1A 4FTNA 4ZTSA 2BAKA 5CY3A 5DBXA 3DK7A 5M56A 3PE1A 3I5NA 3COHA 5DN3A 1JKTA 2BROA 4I21A 4NL0A 1H25A 4FSWA 3ZONA 4ITIA 4C35A 2YABA 4NKAA 4CMOA 5IU2A 2AUHA 4DTBA 3D5WA 5CU2A 3APDA 5HNGA 2J6MA 5DFPA 4ZTQA 2A19B 4JLCA 3G0EA 4AZSA 4BIDA 4CRSA 1ST0A 2BCJA 3JXWA 1R0PA 4O21A 4F99A 2VO0A 3QRIA 3ZM4A 4WBOA 2XK6A 3Q4UA 5EDQA 4IEBA 2X2KA 3G33A 2OH0E 2YZLA 2Q83A 3BYOA 4RJ3A 1R39A 4C33A 4CKRA 1MRYA 3GQIA 1BX6A 4ACMA 2O64A 4O38A 4FUYA 4DH3A 3KB7A 4A07A 4GFOA 3IW7A 4H05A 2X8DA 4RX7A 4O0WA 5DYJA 3UVPA 3WIGA 1LR4A 1MRUA 4UWFA 1WBOA 3P79A 1M7QA 2X6IA 1Q8YA 2OWBA 2ZM4A 3R9HA 3ZXTA 2E9UA 4F7SA 2XNMA 2JKOA 4OTHA 3COKA 2BILB 4C58A 4YTCA 3OY1A 5JQ5A 2YCRA 2IW9A 3PREA 5EKOA 3TACA 2VO7A 2J2IB 2XKEA 4ITJA 2X6HA 1YOJA 2PE2A 5DE2A 2PVRA 3IECA 3KIOC 1ZY4A 3EFWA 1XBBA 2R64A 1FOTA 3BI6A 3L9NA 3O5AA 1VZOA 3FC1X 4UYNA 3RK7A 3TJDA 4BDAA 4BRXA 2HXQA 3DAKA 3B8RA 5B2KA 3UDZA 3ZM9A 5HX8A 5DPVA 4UWYA 4YC3A 1YQJA 3TNPC 2XYUA 4OGRA 4O7WA 3FMLA 4E6QA 5TF9A 3LE6A 2XNBA 3PXRA 4BCIA 4F1OA 2BZKB 2QLQA 3HX4A 4W4VA 3EN6A 4WUNA 1JKLA 3C4ZA 4M67A 3A2CA 4I0RA 1KUTA 2B9IA 3R21A 3G90X 2NYAA 4RJ5A 4AQKA 3ZH8A 3MVMA 5AAEA 1H01A 3IDPA 4GVAA 3PXKA 2QOQA 4FTKA 4RFYA 3HAVA 3FLSA 4FSTA 2GS6A 5FRIA 3F88A 5M4CA 3AKLA 3RNYA 5LMBA 2FSLX 3NVMB 1IRKA 4YMJA 2C47A 2WIPA 4XNEA 4AF3A 1E1VA 3O7LD 1DI8A 3IW8A 4JIKA 3S00A 3AMAA 1CM8A 2XKFA 5LARA 3E8NA 3KMUA 1UU3A 3RAHA 3C0IA 1YVJA 3LLTA 4ANVA 3GU4A 4A4LA 5KMKA 4KNBA 3ZOSA 3GUBA 4NTSA 4Y5QA 5HNBA 4FEQA 3WF5A 4FT5A 2OJIA 5FEDA 3S3IA 2GNJA 3RHXA 2OJ9A 3QQHA 3FZPA 2XBAA 4P4CA 3R7OA 4R3CA 2PZ5A 1ZOHA 1V0OA 1YXUA 4IJPA 5KKRB 3ORIA 2VWIA 3GCVA 3WBLA 2R3IA 2YIWA 3BGQA 3ANQA 5HG7A 2PU8A 2WHBA 3W2QA 2A0CX 2QOCA 3N4UA 1DAYA 4KINA 2CHZA 4YZ9A 3RPVA 3TWJA 3HMPA 2PZPA 3UC4A 4M3QA 4C2VA 4AOTA 2AC3A 4FKGA 1WVYA 5D12A 3UDTA 2YDKA 3S0OA 5D1JA 4UBAA 3DKGA 3LW0A 3KXGA 4DLJA 2A27A 1WBNA 3NW6A 5ETIA 4QP1A 2B52A 4KBKA 5IQAA 3GOKA 3AT3A 3NYVA 4FTOA 3DTWA 4C4JA 2PVJA 3DLZA 2GS7A 5H9BA 3CJGA 2V0DA 4I5CA 4BFRA 3MTLA 3APFA 3QQGA 3FI8A 4IWPA 4QMZA 3ZZWA 3N4VA 4DEHA 1U54B 2R9SA 4S2ZA 4NFNA 3MA6A 4HGSA 4GFGA 5EYKA 3V5PA 4LRJA 3DJ6A 2UUEA 4HZRA 1F0QA 4X21A 4TW9A 3U54A 4ENXA 3P1AA 1HCKA 4NFMA 3TNIA 5L6OA 2XJ1A 2JAVA 4BGHA 5HO8A 3BRBA 4EI4A 5CEPA 3U87A 5C9CA 2QOLA 4YUQA 3PP0A 4L2YA 5H3QA 3V8WA 2C0OA 4DFYA 5HU9A 5AP4A 1ZY5A 4GUEA 2H8HA 2W17A 3FJQE 4RIYA 2FB8A 5DLSA 4G16A 4I4EA 4N6YA 4QT1A 5E90A 2YACA 3A4OX 3AD6A 1FBNA 3NUYA 4XG7A 4RWJA 4AT3A 3SXFA 3R9NA 4ITHA 4QMUA 2JEDA 4F08A 3I81A 5IA3A 3OW3A 3E8EA 5M53A 3EN9A 1VLRA 4L7FA 4WG5A 4FZFB 2CGXA 2X6FA 1PJKA 2NRUA 1ZZLA 3PTGA 4X3JA 5ANDA 4ZZMA 3ZU7A 2BAJA 2XKCA 1ZYDA 4BKJA 4A4XA 4FSYA 4B0GA 3L54A 4FTTA 2BZHB 3DPKA 5AX3A 3COIA 2RKUA 3MI9A 4YJQA 1NA7A 3UQCA 1SYKA 4FV0A 3FY2A 4AAYA 5JGBA 3SG9A 3U6IA 4FTIA 1W8CA 1W83A 4IAZA 4RLLA 2O8YA 2OJGA 3OW4A 5CEIA 3NCZA 1FVVA 4J96A 3GCUA 4KD1A 4XCUA 1OPKA 2UW7A 3QD4A 4AZEA 1F5QA 4NYEA 1W0XC 1YXSA 2WMXA 2QODA 3ZDUA 2WXNA 2GQGA 3KRLA 3R7EA 2X81A 3NUSA 2CNVA 2YIXA 4AE6A 4ACCA 4D1XA 2HIWA 5CF5A 3QC4A 3FZ1A 3QKMA 4GJ3A 4XV1A 2BTSA 3CC6A 1Q3DA 2CKQA 4MAOA 2VZ6A 4WNOA 4Z7GA 2C6MA 3QRKA 5JT2A 3ZFXA 4FJZA 2WTCA 3QZGA 2H34A 1YXVA 2I0HA 4FEVA 4AW0A 2QNJA 3U4UA 1U59A 3U6JA 2UV2A 3OD6X 3LS8A 5ETCA 4BZDA 4DGGA 1KV2A 4DTKA 3V8TA 1UWJA 4O6LA 3MY1A 5HU3A 1FVRA 5CEQA 3CKXA 4NK9A 4D2RA 4QMXA 1RDQE 1IEPA 4ZJIA 4IB5A 1WZYA 1PXMA 5AIKA 4F0GA 1FINA 2A2AA 4KS8A 3DJ5A 3FAAA 4HCVA 4OR5A 3DJ7A 3QUEA 4RWLA 4W8DA 4I6FA 3QAME 2OLCA 4AW5A 3L9LA 2ZB0A 4FJVA 2W4JA 3MYGA 4MQ2A 4U44A 5AV3A 4CTBA 2W05A 4MD8E 5CS6A 2XF0A 3NZ0A 3R1NA 3ZRKA 1Q24A 5F95A 3WI6A 4ZTRA 2PUPA 4HGLA 3E8CA 4H39A 3VC4A 3LXKA 5I5ZA 2F49A 3P7CA 2VTIA 4QP2A 1V0BA 4MD7E 4G3EA 2ITUA 2QURA 2ETMA 3ORZA 2ZV2A 3VBWA 3EKNA 3H9FA 3RK9A 1H0VA 5H8BA 4BYIA 1APME 5AUYA 3QZFA 4ZZNA 1VEBA 4TT7A 4ZMEA 5CF4A 1PXPA 4EC8A 3WF9A 3HEGA 4RIWA 3ID6C 1OGYA 2FA2A 2X2LA 2C30A 2GS2A 4PDOA 1JBPE 3PXQA 3L13A 1RQQA 3R02A 5IDPA 4XV2A 1ND4A 4ZMFA 1KOBA 5DR2A 3ZBXA 2A4ZA 4DFNA 4O7TA 3LFQA 1REJA 3FKOA 4WNPA 4FZ7A 5M4UA 3NNUA 4CZUA 5KZIA 4YZNA 4IHPA 4N6ZA 3OBGA 2X6KA 2VO3A 4UXLA 5EW8A 4P90A 2PVKA 3GXLA 3MSSA 4O96A 3VUMA 3OC1A 5CEMA 2UZUE 3AC5A 3RKBA 2QONA 2VGOA 4X7QA 4PDSA 4CFXA 2O5KA 4C3RA 3FLZA 5CASA 5A4QA 1TQPA 3K5UA 5HVJA 3VN9A 3W1FA 4AA4A 2QO7A 4K77A 2R3PA 1UVRA 5BVEA 4KIQA 5C01A 1IA9A 4ID7A 3FI2A 4FZAB 5CYIA 2GNHA 4RFMA 2CGUA 2F4JA 1YKRA 2WXRA 3F3TA 4G6LA 4GV1A 5LVMA 5LVNA 3QUDA 4AG8A 4K0YA 3M1SA 1K3AA 4RWIA 2YJSA 3CGOA 3FMKA 4KRCA 3OXZA 2HAKA 4R6VA 2EWAA 4DTAA 3OWKA 1R1WA 2J0KA 2UZTA 3LJ2A 4GKIA 3TMOA 3CKWA 3BLAA 3BYUA 3GBZA 2GHGA 5HHWA 3SKCA 5J1VA 3DFAA 4O0TA 2ITYA 4EK8A 4U40A 1OITA 5DWRA 1BMKA 3F3VA 4RZWA 5HBJA 5KMNA 4FVPA 4UWCA 4XRJA 5KUPA 2J9MA 5AMNA 4DFXE 1YI3A 5FP5A 1P4OA 3R9RA 3SRVA 2EUFB 3AMBA 4HPTE 4D2SA 4YSJA 5C1QB 4F9YA 1J1BA 2KULA 3R01A 1YWNA 4EOMA 3TNWA 2PE1A 2BALA 3KXXA 4ANSA 3H10A 4FK6A 4DBNA 5ANOA 1P5EA 3G15A 4ZSLA 4DFLA 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 3AKL A;  3AKK A;  3AKJ A; 
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 4L42 A;  4H1M A;  4AW2 A;  5FQD C;  3S1H A;  4I6L A;  2CCI A;  5JHA A;  5CAQ A;  3A7G A;  4IX4 A;  5LCJ A;  2VWY A;  3ROC A;  3BHY A;  5K4I A;  1YWR A;  4AA0 A;  4FX3 A;  3ML8 A;  4ENY A;  3RTP A;  1P14 A;  2WTD A;  4FV7 A;  4M69 B;  4MBI A;  3E64 A;  1OM1 A;  4BYJ A;  4CKJ A;  2QG7 A;  4LUE A;  3HMI A;  4O84 A;  5GJD A;  2C6L A;  5K3Y A;  1G8J A;  5A6O A;  3QJZ A;  3EB0 A;  3FUP A;  3O2M A;  4QYG A;  3WZD A;  4TL0 A;  4YR8 A;  3ZCL A;  5M06 A;  4TWO A;  3DBD A;  4MNE A;  3BU6 A;  3R00 A;  2CN8 A;  3ZHP C;  2I1M A;  4E4X A;  4PTC A;  1YW2 A;  3PG3 A;  3I0O A;  4OT5 A;  2ITQ A;  4ZTL A;  1GZK A;  1URW A;  3O51 A;  3VRZ A;  2CPK E;  4BY9 E;  3HL7 A;  2XNP A;  3GQL A;  3HUC A;  4FKT A;  2JDT A;  4CT1 A;  2J0M B;  3SQQ A;  4FKR A;  3F9N A;  3NNW A;  4IC7 A;  4TZR A;  2G2H A;  1Y8G A;  4G31 A;  4A9T A;  4BJJ B;  3Q6W A;  4UWH A;  4EOK A;  4FKP A;  4DT8 A;  4ZP5 A;  4J8M A;  4MCV A;  3ZO4 A;  4PH4 B;  4QMV A;  2X8E A;  4IW0 A;  3LXL A;  3C4W A;  4OLI A;  4TND A;  4EHE A;  4J99 A;  4NKS A;  3HUB A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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