3W0QA

Crystal structure of a thermostable mutant of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia (n203a), ternary complex with amp-pnp and hygromycin b
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
ATSVEKFLIEKFGSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEVMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNAVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDPLYEVANIFFWRPWLACMEQQARYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/antibiotic
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
publication title Crystal structures of the ternary complex of APH(4)-Ia/Hph with hygromycin B and an ATP analog using a thermostable mutant.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 90
structure length 296
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3w0qA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3w0qA02
5IQDA 5AFVA 3G15A 1J7IA 2PUPA 4PDYA 2PPQA 4DFUA 3W0OA 4DA5A 4DTBA 5EQYA 2IG7A 3N4VA 4GKIA 5FUTA 3C5IA 4DE4A 4DTAA 2I7QA 1J7LA 4CGAA 4DBXA 4DFBA 3W0NA 3MESA 5FTGA 2PUIA 2PYWA 4CG9A 3W0PA 3N4UA 2CKQA 3W0QA 3JR1A 1ND4A 4ORKA 5IQCA 5IQBA 5IQAA 5IQHA 3TYKA 3DXQA 4BR3A 4O7OA 3DXPA 3TM0A 3SG9A 3FI8A 5IQFA 3Q2JA 4FEXA 4O7PA 4FEVA 2CKOA 4R7BA 3ATTA 1J7UA 3W0MA 5C4LA 3FEGA 4N57A 5BYLA 4DCAA 3UZRA 1L8TA 3W0RA 3LQ3A 4EJ7A 3ATSA 4CG8A 4DT9A 5C4KA 3SGCA 2QG7A 4U94A 5IQGA 4WZYA 5IQEA 4FEUA 3W0SA 2PUNA 2OLCA 3F2RA 3HAVA 3TDWA 4R77A 4GKHA 4DT8A 2B0QA 5EQEA 3ZM9A 2PU8A 1NW1A 2Q83A 5EQPA 4FEWA 4H05A 2BKKA 3N4TA 3HAMA 3SG8A 2CKPA 4U98A 3TDVA 3CSVA 5IQIA 4R78A 2PULA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IB3A 4WNKA 2X1NA 3DJ6A 3NRMA 4V04A 5KUPA 3UNKA 3UOHA 2HAKA 4HNIA 4KABA 5FBNC 5JGAA 2GQSA 4RT7A 3V01A 1H0WA 2X8IA 5HKMA 2R3OA 2B9IA 1PY5A 2GNGA 1U54A 3RK9A 3FKNA 2B9JA 3TL8A 4OR5A 4XP0A 2ZDTA 3DBFA 3VUIA 4FSRA 4USEA 2IG7A 4L53A 5JFXA 4QMQA 4YR8A 3AD4A 3IO7A 4GKIA 1UV5A 4QPSA 4ZS0A 5FRIA 3PG1A 4FIGA 4AZWA 5A46A 3E7VA 3UVQA 2WTCA 3FHIA 3OWKA 2VU3A 5F94A 3IW6A 3RJCA 5KMKA 4U8ZA 2WTVA 5KMIA 3HA8A 3W0NA 3EHAA 3KK8A 5HZNA 3QRTA 5DFPA 5BPYA 3CQEA 4B99A 1A06A 3W16A 4USDA 2LGCA 4E26A 3Q3BA 3ZC6A 2CNUA 4CZTA 3SX9A 4C59A 4IJPA 4CFXA 4O7ZA 4E4MA 3LM0A 3MIYA 4LGGA 4FZ6A 2BRHA 4OTIA 3SLSA 1PXJA 3VW8A 4EQUA 5L8KA 2WTKB 2C0TA 1XWSA 3KVXA 1IAHA 4RIXA 3KXHA 4ZTNA 3AKKA 2IVVA 2BFYA 5HVJA 3R7YA 4H3PA 5E4HA 3ATTA 3POZA 1UVRA 4E7WA 3LCSA 3LLAA 3LQ8A 1PF8A 5AP0A 5GINE 3FEGA 2A19B 1FVRA 4FK3A 4J8NA 3AGMA 3R1QA 3AC5A 4KKHA 5AV2A 1M17A 4PF4A 3M2WA 5BYZA 4EOPA 4GFGA 2HY0A 4FV7A 4WO5A 5AIKA 4O7YA 3EH9A 3R1YA 5CX9A 3WIKA 3WF8A 5J9YA 1SVHA 4X2KA 3U4WA 4L44A 4DTKA 3DA6A 3UJGA 4RX9A 4NCTC 4ENYA 1ZOHA 5CU6A 4AQKA 5BVOA 2HOGA 3HRFA 3GI3A 3P7BA 3A99A 1IG1A 3PXQA 1LEWA 2GFCA 4K6ZA 4HW7A 3SQQA 1Q3WA 1SNUA 2P0CA 2PUNA 1OPJA 3A7IA 3LJ2A 5KMLA 1UWJA 3F3WA 3BHYA 3ZUVA 2XANA 2JIUA 4O2ZA 4P7EA 4QMPA 3OF0A 3R00A 4CVAA 1UNGA 4JI9A 4NTSA 2FVDA 4XS2A 1TQPA 2C6MA 3GCPA 3V8SA 3RCJA 1Q8YA 4EOOA 2YITA 4YJQA 3LPBA 1OBGA 3DZQA 3WZDA 3C9WA 4IAYA 5AMNA 5F4NA 3ZRKA 4AXDA 3T9IA 2X7FA 3HV6A 4QMLA 4L00A 5CNOA 2Q0NA 3UZPA 4N6ZA 2JITA 2XBAA 3R7IA 4KIPA 1B39A 4CRLA 4DN5A 3PJ8A 3TDVA 4IM2A 1WZYA 2PE1A 2J50A 5IQIA 1VJYA 4GVJA 5HE1A 2XNOA 1MRUA 4RMZA 4XOZA 4YZCA 4AFEA 5KHXA 3G15A 4Y46A 2BKZA 5AP4A 3VJNA 4RVLA 1XKKA 1URWA 3PSBA 3CQWA 3VUDA 2XKEA 3OWJA 3W0OA 3P08A 5CSPA 3GU7A 3GP0A 4Y83A 3PE1A 3ROCA 4DGGA 1IR3A 4NU1A 1YXXA 4B9DA 4BGQA 2GHGA 1VR2A 2CGUA 3F7WA 4Y73A 3C4CA 3AMAA 1PYEA 2A1AB 3BIZA 2JAMA 2YACA 4GU9A 4TYGA 3V5LA 4AT4A 2WGJA 3NNXA 4RFMA 2JLDA 2WEIA 3MPAA 5LQFA 5L3AA 2OIBA 3PRFA 4F0IA 3CY2A 2YJSA 3UIUA 3AG9A 4HYSA 3VS2A 5JFSA 2FSTX 2PVLA 5HCYA 4XP2A 4OW8A 3VS1A 4FL3A 4KIOA 4FSUA 3RNYA 5CALA 4R6VA 2XKDA 3PVWA 3AC1A 2GFSA 3OZ6A 4QDVA 2XJ2A 2X4ZA 3R8VA 4R1VA 4DCEA 3MV5A 5HNBA 2C1BA 4EH9A 4EQCA 5JN2A 5AV0A 1YOJA 2X7OA 4BCJA 5H3QA 4AZSA 3SG9A 3PSCA 1FVTA 4MWHA 3WE8A 2OJGA 4V01A 4ZLYA 4B6LA 4BVUA 4F65A 1XH6A 2ITNA 5ANOA 3EMGA 3BGQA 2OKRA 3OC1A 4GG7A 3I60A 5DLSA 2ITWA 1Q99A 1CKIA 2HXLA 2CN8A 2RKUA 5CSVA 3ZHPC 4D4VA 5KHWA 3LKMA 5ACKA 3LXKA 5KBRA 4NJ3A 3AKJA 4O0RA 4XCUA 4IE9A 4JDJA 2H96A 1OKWA 3DOGA 3PP0A 4ERWA 5C8NA 1FBNA 4K2RA 3KCFA 3B8QA 2NP8A 1RQQA 4G6LA 2BIYA 3H9RA 3PJCA 3O2MA 4G3GA 3O71A 3ZO2A 3FJQE 3B2TA 5BVKA 5AA9A 5IQEA 4J53A 3QYWA 3R1NA 4QTAA 5L6WL 5A4EA 4GYIA 5DR2A 4DEIA 4UWBA 4XG7A 3WF5A 2BCJA 5LXMA 2E9OA 2YIYA 3K2LA 1B6CB 3OY3A 2CGWA 4QP2A 4DDGA 2GNHA 3TV7A 3T3UA 4M8TA 4DFYA 1W82A 3AKLA 1YWNA 3ZONA 3ZXTA 2YDJA 3OW3A 4WA9A 4XEYA 4NCTA 2I1MA 2QQ7A 3MI9A 4C4JA 5CYIA 4FTMA 4KRCA 2VTQA 4NK9A 1KE6A 4ZSGA 2RGPA 3NUAA 3F3TA 3BGPA 4DGLC 3RTPA 4NSTA 4NM5A 4APCA 2ZV2A 4AE6A 4QMNA 1ST4A 2VX0A 3ID6C 4QT1A 3RALA 3WZJA 4NKSA 4F1OA 2OZAA 1H08A 5EHYA 2F2UA 3DDQA 3BPRA 5A4QA 1GZ8A 4NWMA 4RX7A 1BUHA 2X8EA 3GCSA 4RJ5A 2HWPA 2PUPA 2GMXA 3R30A 4BDHA 2XNNA 3NYVA 4NT4A 5AAGA 2WMRA 1LR4A 3A7GA 4DHJA 4BDDA 3VBXA 3CCNA 3QTXA 2KTYA 4RLKA 5TT7A 4DHZA 5IPJA 3HDNA 3LQ5A 3BCEA 2XAOA 4P4CA 3DS6A 4YJOA 5AUYA 1OECA 3V8TA 4KBKA 4DHIB 2FYSA 1H26A 3R83A 4FZ7A 3W10A 2G2FA 3OS3A 4E5AX 3RAHA 3OXZA 3LXPA 3HMIA 2UZVA 3HV4A 4KNBA 3EZVA 3QD4A 5TO8A 1PXLA 2R3HA 2XIZA 3D5UA 3O17A 1ZZLA 2I7QA 2C3IB 2UVYA 3JYAA 4IFCA 2UW4A 2QONA 3CGFA 3LJ1A 4DBXA 3QL8A 5L6OA 4Y5HA 1Q8TA 1FPUA 3FMNA 3O0GA 2C1AA 4LDTA 4X6RA 4DEDA 5T68A 4R3RA 3ZXZA 5DT3A 2E2BA 1ATPE 4L8MA 3II5A 4UV0A 2CKQA 4H36A 2W1CA 3FMEA 1SM2A 4W4XA 3DBEA 5EK7A 4FG7A 2CKEA 1AGWA 2BRGA 3NUXA 4FTAA 4IACA 1L3RE 2I0YA 4LOOA 1FOTA 2FA2A 4L7SA 3OP5A 5IQCA 3D7TA 5FXQA 1Y8YA 3LMHA 3VNTA 3IQ7A 2PL0A 5CAVA 4O0XA 4RFZA 3KMWA 4WIHA 4JX3A 4WNOA 2J5FA 4QP1A 4BYJA 1OBDA 3WE4A 4IVDA 3UDTA 3KF4A 1BMKA 2O5KA 4DEAA 1H07A 1H24A 2R0IA 4AFJA 5EDRA 1OZ1A 3HRBA 4ZTHA 4KBAA 4H39A 2F9GA 1KE8A 2XK7A 3B8RA 3UO5A 3PA5A 4FC0A 4X3JA 3VN9A 3VBTA 1JKLA 4OTQA 4EZ5A 1YQJA 3BLQA 3H9FA 4MYGA 4A9UA 5JMSA 1REKA 3DZOA 2JDSA 1YXTA 3K3JA 3MY5A 5T3QA 4ZY5A 2YAKA 4YJTA 3MH1A 3FMKA 3CE3A 5CEMA 3BHTA 5D41A 3QA0A 3PUPA 1YHWA 4RFYA 4B7TA 4U94A 4ZTRA 2O8YA 3A60A 3PSDA 3GBZA 3L9MA 5B2KA 4DEBA 3L9NA 4XLIA 5A14A 4ZP5A 4GCJA 3EQPA 2GPHA 5HNGA 5KMOA 4XG3A 2C6TA 5FXRA 3P7CA 4E5WA 4C35A 1LUFA 5L8JA 4G31A 4BHZA 5ACBC 2QOCA 2ZYBA 3F2AA 3UGCA 4U80A 3L8PA 2WHBA 2JAVA 4MEDA 4JMQA 2XNPA 1X8BA 2ETKA 1OITA 2XIKA 1Q8ZA 1FMOE 4H05A 4QYFA 2WTIA 3ROYA 5HE3A 5K4IA 4FODA 2R3MA 3CTHA 4B4LA 5HU3A 3R9DA 4EZ7A 5AEPA 4DITA 4IIRA 1GIHA 5CY3A 4JDHA 2XKFA 1ZRZA 5LJJA 3KXGA 1Y57A 5DNRA 3U87A 2QU5A 2BRMA 1H27A 3PJ3A 4QP9A 2GQGA 3EQFA 3LW0A 4AAYA 5FDPA 3C7QA 4K9YA 4C7TA 2W5AA 4XV1A 4JT3A 4IH8A 5J9ZA 3GC0A 5K9IA 3EIDA 2F7XE 3V5WA 2C3JA 1YXVA 2YIWA 2PMLX 3QLGA 5LOHA 1BI8A 4EUUA 1P5EA 2GS2A 2AEGA 3U6HA 2QO2A 1QPCA 2J0KA 2VTNA 4FTJA 1XR1A 3IOKA 5H8GA 4I0SA 4DF3A 2DS1A 2QC6A 3IPHA 5EQYA 3ZUUA 5E92A 1BI7A 4YJUA 2UUEA 5HX8A 2GNLA 1WBPA 3SDJA 4EH6A 5FUTA 3CQUA 5CZIA 2PE0A 3FE3A 4U7ZA 3AC3A 2C30A 5CAUA 5IUGA 4O6EA 4FVQA 4S30A 2OBJA 5EM6A 3ZRLA 2NRYA 4ANLA 4CGAA 4AUAA 3QD2B 3GFEA 2RG5A 4IWQA 5CEOA 3CR0A 4TYIA 3ITZA 3RWPA 4TPTA 2I6LA 5J5SA 1YRPA 2UW8A 4TYHA 3D94A 2PUIA 5LWNA 3TV4A 2HELA 2BDJA 5AUVA 3KEXA 4HVGA 4JQ8A 4GJ3A 5CXZA 2J90A 1H0VA 4QO9A 3EKNA 3DV3A 5CI6A 1PJKA 3UMWA 4E73A 5A9UA 1KOBA 2BAJA 1WMKA 2OIDA 2VWBA 1DI9A 2W1FA 2ZOQA 3DXQA 4XLVA 3TNQB 1H25A 4G34A 4C4HA 4CTBA 4TN6A 5JSMA 3E3PA 4CLIA 5CAQA 1JVPP 3BHHA 3CXWA 2Y8OA 4FEXA 3L8XA 1GIJA 4FT5A 2C6LA 3QU0A 1KV1A 1Q3DA 3G90X 4ACGA 1SZMA 2XCHA 3QQKA 2QR7A 5CQUA 1CM8A 2GNIA 4N57A 3Q5IA 4EQMA 4BJJA 4U79A 2OW3A 1NVQA 1MQ4A 2EU9A 1PXIA 2W96B 3RP9A 5DRDA 4F9AA 3CC6A 5AJQA 4DFXE 2YCFA 3EZRA 4IWDA 4RWIA 1J91A 1R0PA 3LFEA 4XMOA 3D4QA 3TMOA 4E4LA 5JEBA 3I5ZA 2O65A 1MRYA 1O6LA 4JG8A 5BVWA 2ITPA 4I41A 3LFCA 3NR9A 4BTJA 5IA3A 4KKGA 3OY1A 4QPAA 3C4EA 3PXFA 4WRGA 5AP3A 1O6YA 4PDOA 3TZMA 4AGDA 3NYNA 1Q61A 4IHPA 2FO0A 2ETMA 3GCVA 3KY2A 1Q8WA 1R0EA 3MY1A 3V8WA 4C34A 5HBEA 3NFFB 3VUGA 1UKHA 5BUIA 4U97A 3F69A 2C68A 4ZMFA 1KSWA 5DEWA 4FSZA 3W2CA 2XM8A 3K5VA 4X7QA 2XUUA 1H8FA 3AQVA 5IA5A 3UNJA 5KO1A 4LUEA 3VS7A 2F49A 3EQHA 4O7SA 3C0HA 5HQ0A 3UIMA 1YI4A 2P2HA 3REPA 4ZZMA 5E8ZA 2OU7A 2QOKA 4O7NA 4QQTA 2YA9A 5B7VA 5HVYA 3M11A 3FXZA 1V0OA 3KA0A 3I1AA 3BBWA 3E8NA 3OCSA 4NFNA 4XRLA 3NCZA 5DGZA 5DN3A 2V7OA 5E8SA 2R3LA 4RWJA 5EOLA 1ZZ2A 4QMVA 4CFUA 3QCYA 2OJJA 4G17A 4WOVA 2QD9A 4M68A 3F5GA 1YKRA 3BYUA 3F66A 2J2IB 4HPUE 4F7LA 1OIQA 1Y6BA 3E64A 5IUIA 5ETIA 2WMVA 3U9CA 2W17A 5ETCA 2YM7A 3P1AA 3ZFXA 4P5ZA 3PYYA 4M69B 2ERZE 2YHVA 4O27B 1A48A 3BEAA 3QZIA 4IW0A 2NYAA 1GAGA 3F6XA 4IC7A 4PMSA 2EB3A 3WOWA 4BYIA 4UZDA 1IAJA 2J6MA 3A4PA 2HXQA 4R5YA 2ITOA 3WF7A 3HZTA 4IVAA 3PVUA 3OMVA 3T9TA 5BQ0A 1SYKA 4L01A 5CU2A 4QNYA 1U4DA 4XHKB 5ANEA 4DFLA 5DI1A 5LCJA 2OJIA 1YDTE 2PYWA 4AOJA 4D9UA 3HRCA 2YFXA 2PZPA 1QPDA 3FXWA 3NNVA 3DB6A 3QZHA 3HA6A 3K5UA 3MFUA 3H10A 4O96A 4EKLA 3VHKA 3NUSA 3R6XA 5IQBA 4GIHA 2YAAA 4EOMA 4MCVA 1Y91A 3PVGA 4OGRA 3ZO1A 2PVJA 4TNDA 2HZIA 1YDSE 1BX6A 4PTGA 5J8IA 3EN6A 3VO3A 4MXYA 1OL7A 2XMYA 4IM0A 3F2NA 5IISA 1E1VA 1ZYLA 3I6UA 2O3PA 4FV4A 4UWCA 3ORIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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