3W0RA

Crystal structure of a thermostable mutant of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia (n202a), ternary complex with amp-pnp and hygromycin b
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
TSVEKFLIEKFGSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEVMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSANVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDPLYEVANIFFWRPWLACMEQQARYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/antibiotic
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
publication title Crystal structures of the ternary complex of APH(4)-Ia/Hph with hygromycin B and an ATP analog using a thermostable mutant.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 89
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3w0rA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3w0rA02
3TDWA 4O7OA 4CGAA 3W0RA 3W0QA 2OLCA 4DFBA 2PUPA 5EQYA 4DTBA 3ATSA 4O7PA 1J7UA 4DBXA 3ZM9A 2PPQA 4FEXA 4ORKA 2I7QA 1NW1A 5IQIA 3W0NA 4FEWA 4DA5A 3N4UA 3W0PA 2PU8A 1L8TA 3W0MA 2PULA 5BYLA 5C4LA 2B0QA 2CKQA 3G15A 4DTAA 3MESA 3LQ3A 4BR3A 4CG8A 2PUIA 3TYKA 5AFVA 3F2RA 3SG8A 4EJ7A 3TM0A 4DT9A 2PUNA 3DXPA 3ATTA 5EQPA 4CG9A 5FTGA 4FEUA 4GKIA 3UZRA 2CKOA 4DCAA 5C4KA 3W0OA 3DXQA 3SG9A 4PDYA 3N4VA 3C5IA 3Q2JA 4R77A 3N4TA 2IG7A 5IQGA 4GKHA 4U98A 4WZYA 4FEVA 3HAVA 4R78A 3FEGA 3JR1A 5IQHA 3W0SA 1ND4A 5IQBA 5FUTA 3SGCA 4H05A 2QG7A 3CSVA 5IQDA 2CKPA 5IQEA 5IQFA 1J7LA 3HAMA 5IQAA 4DE4A 4DT8A 3FI8A 3TDVA 4N57A 1J7IA 4U94A 2Q83A 5EQEA 5IQCA 4R7BA 2PYWA 2BKKA 4DFUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AGWA 3WE4A 3UO4A 2OJIA 3GQLA 1E1XA 4OTWA 3W0RA 4QP6A 4FNYA 4L8MA 4I6FA 2VWIA 4YLJA 4GYIA 1SNUA 4IAKA 1HOWA 1WBTA 4L9IA 5AADA 4DFBA 5A46A 3P7AA 3TJCA 4BZDA 5C8KA 1WBNA 1FVTA 1ZXEA 2R2PA 2PVNA 4M12A 4A07A 5BNJA 2WQMA 3PUFC 4YC6A 4DBXA 5HIEA 4MXYA 1F0QA 3Q6WA 3NIEA 1OUKA 3SRVA 2PY3A 1XBBA 3H0YA 4L53A 4EH5A 2VU3A 4DC2A 2FSMX 3A7FA 4O0WA 2PU8A 4G9CA 4FC0A 3RAIA 2BIKB 2QURA 4DH5A 4QQ5A 2H6DA 2OXYA 4CRSA 4WG3A 3LJ2A 5EI2A 5IPJA 5HBJA 2JD5A 4U44A 4AGDA 3F5UA 3MPTA 3S4QA 1H07A 5FM3A 3SOCA 4MNFA 4A9YA 5JGDA 1PXKA 4YJSA 4EH6A 1ZMVA 5T68A 5E1SA 4O96A 2BFYA 3LQ3A 3ERKA 4EC8A 3QX2A 3IK3A 4WOVA 4UV0A 3FQSA 1V0BA 3AC3A 3QCXA 3OTVA 4PMTA 4MXZA 5FEQA 3RCJA 3LCTA 5HX6A 5IA0A 3CD8A 2B9JA 3CQWA 3FMLA 3FJQE 1GZNA 3EFLA 4GJ2A 1WFCA 3KXNA 3AD6A 1GY3A 3MTLA 4EOQA 2WMQA 3FSKA 4HGLA 4D0WA 4QP3A 3EMGA 2J5EA 3PJ8A 5AWMA 3DAEA 4M68A 3FWQA 3B2WA 3K2LA 5HESA 3LCOA 2P2HA 3QRUA 3P4KA 3R83A 3ULIA 1OVEA 3ZLXA 4IZAA 2PZYA 3S1HA 5DNRA 1XBCA 2BZIB 2QOHA 4QMXA 5CENA 2ACXA 4WA9A 3R22A 2W0JA 3A7HA 5ETFA 5EOBA 4JX3A 5ANKA 3NUSA 1FMOE 3LCDA 3PP0A 4OTDA 4EZ5A 4U9AA 4UWCA 3QXPA 2YN8A 3NDMA 4B0GA 5E92A 3P7BA 3TUDA 4YHFA 2C4GA 4YLKA 4QEBA 4YJOA 2R3FA 3EFJA 3CR0A 4IB1A 3GEQA 2Y4IC 4ZS0A 3OS3A 5IQHA 3FLZA 4U3ZA 3VUIA 3HRCA 3ORKA 4BTKA 3KRJA 3EQDA 1OL5A 3QC9A 5CS6A 4IWOA 4H05A 4DG3E 4Y72A 4YPSA 5BVNA 2QR8A 4HVGA 1XH5A 1ZLTA 4X2FA 4YR8A 3PA4A 4PDOA 3KQ7A 1UV5A 3ZZEA 4EWQA 2CKPA 2WIHA 4E4LA 2I6LA 2RG5A 3KU2A 5JFSA 3II5A 3EYGA 4GUBA 5CSPA 1YXUA 4IJ9A 4WT6A 1PHKA 4TYHB 3AC2A 4OT5A 5D7AA 5J9LA 4ZP5A 3C5UA 4KBKA 4YBJA 1YDRE 5DIAA 4I22A 5IA3A 3P7CA 3QTSA 2G01A 3QLFA 5CXHA 3REPA 1XH4A 2BRNA 4AOJA 3VBQA 2IW8A 3HX4A 3NUPA 4EOJA 1K2PA 3ORLA 1R39A 3I7BA 5M06A 2H9VA 4BTFA 3NMUF 3KREA 4FR4A 2YAKA 3W2OA 2CCHA 3DNEA 3QC4A 3CPCA 3OWKA 4DTBA 1HCLA 4D5KA 1J7UA 5AM7A 4EJNA 1B6CB 5DN3A 3P0MA 1JPAA 4A4XA 3G6GA 4YGAA 2WMSA 4AA4A 4FSWA 3OEZA 1IASA 2BILB 4E26A 2R3KA 2Z7QA 2JKMA 3NFGB 2GMXA 3KY2A 1L8TA 4UB7A 4MD7E 4USDA 2JDSA 3MB6A 1M2PA 2R3IA 4RFYA 3UYTA 3BHHA 3FV8A 2WOUA 2VWBA 2IZRA 5BYLA 1OGYA 4QTAA 4F6UA 4J99A 4MF1A 4NUSA 3PSDA 4FSYA 3D4QA 3SHEA 4RLKA 4AW0A 3DXNA 4YMJA 4YU2A 3U55A 1CKPA 4FTQA 3V8WA 1CDKA 4E6DA 5AM6A 1G3NA 4F63A 5AFVA 1QPDA 4KINA 2OSCA 4L46A 3SG8A 3KF7A 1OGUA 4QO9A 3TM0A 4O7ZA 4DHZA 3QRTA 3BEGA 4C3PA 3BGPA 3NYVA 3OCGA 4L67A 5FBOA 4ZSAA 3IOPA 1OB3A 4IX4A 3NYXA 4R3RA 3PIZA 4QMVA 4BZNA 4RA5A 3OY3A 2IVTA 3RM7A 1FVRA 4PF4A 1XMMA 3KF4A 4U79A 3W32A 2A27A 5KKRC 3OD6X 5LMKA 3EL8A 4IAIA 2NP8A 3GC7A 2O65A 2W17A 3MS9A 4CQEA 4GL9A 2VTTA 4IAFA 3LFQA 1OBDA 3TNHA 4CFXA 5A4CA 3CQUA 3N4VA 5DT0A 3S0OA 4RC2A 5LWNA 2XRUA 2VAGA 3Q2JA 3JVRA 3Q60A 4ZSGA 3DV3A 4UWYA 4G3EA 2ZYBA 2J51A 2JDRA 4OW8A 3VW8A 3R71A 4XOZA 4OBOA 4AXEA 4C33A 4U98A 1PXLA 2IN6A 4OUCA 3BYSA 5JZJA 2O8YA 3PY1A 5ETIA 4QYGA 4KB8A 1G8JA 1Q5KA 5FUTA 4NM0A 4Q5EA 4X3FC 3VS7A 3QLGA 4MBLA 2O2UA 3PXRA 4JMQA 3E63A 4MCVA 3TV7A 3MDYA 3NNVA 4TYIA 4AE9A 3JY9A 3E88A 4FKLA 3LKMA 2WFYA 4Z55A 5FM2A 4I41A 5CEOA 3SAYA 2UZLA 3DB8A 4DH1A 5HU3A 3UNKA 4DLJA 4C4HA 2HY0A 4FMQA 5HCXA 1KUTA 2GS7A 2ZDUA 3VS6A 4ACMA 5JGAA 1ZWSA 2EXCX 2PVFA 2G2FA 4FTCA 5KMMA 5LCJA 2VWYA 2Y4PA 5HVYA 5FDXA 4GK3A 5E8XA 4F7SA 3QQKA 3NRMA 3QQHA 4FBXA 4RWLA 4X2JA 3H9RA 2FUMA 3SW7A 5IU2A 2PE0A 1YWNA 1UU9A 1BLXA 3PJ3A 3PPZA 2QCSA 4HPUE 4O83A 4YTHA 3Q3BA 4GVJA 2EUFB 1Q8TA 4G6LA 5CEQA 3SQQA 4E8AA 4YURA 3F3VA 4FA2A 5JMSA 2X2MA 2W1ZA 3CTQA 3W2PA 4GG7A 3SXFA 5EDQA 4YZBA 5CEIA 1FGKA 3ZM9A 3L8PA 4TL0A 2JC6A 4I4FA 4DGMA 4FTTA 2I7QA 4M97A 5CNOA 2GPHA 5E8SA 3V5PA 3BBWA 3QFVA 4IB0A 4XG3A 5DT3A 3A7JA 5EK7A 1YRPA 4RJ7A 3W2SA 4F4PA 3TACA 1M17A 3Q2MA 2HZIA 4RJ8A 3AMYA 4CMOA 4LI5A 1G8SA 3QD4A 4G5PA 3QTUA 3UP7A 4RX7A 4U0IA 3JY0A 2OW3A 4BDDA 2B0QA 4FG7A 1IAHA 3IPHA 4DTAA 3I7CA 4BCMA 4C0TA 4NJDA 2VWXA 4C2VA 3DFAA 3L8SA 3K3JA 2JDVA 3R7OA 2JIIA 3F2RA 3V5TA 4RX5A 3Q9YA 3NYNA 1PJKA 4L68A 2XJ2A 5G1XA 3R7EA 4ZLOA 3QUDA 4WG5A 5D7VA 5IMEA 4M0YA 2I0HA 4EZ3A 3R8VA 3QZHA 1V0OA 2A2AA 4FTUA 2GS2A 3TTJA 4O7RA 2ZB0A 3PFQA 4D1XA 1GAGA 3UIBA 4EOLA 5LMBA 2QOBA 4FV2A 5L3AA 2FSTX 3AQVA 4AXCA 3PWDA 1CM8A 2UZVA 2OF4A 4RSSA 5FRIA 2YCRA 3KC3A 3TG1A 4S34A 3AXWA 4X2GA 5HKMA 4O86A 5EYMA 3LE6A 2YIYA 5AUWA 3RCDA 3S00A 3O8TA 1U4DA 4MK0A 2OIBA 2Y0AA 5GIOE 3O8UA 4ZZNA 3RPSA 3UJGA 3E8DA 5KMLA 1SVHA 3TL8A 3O7LD 3ZSIA 4FGBA 4WIHA 5C27A 5DFPA 3D7TB 4PUZA 5J7HA 3DK6A 3QTWA 4O0YA 5HG7A 1Q99A 4PMSA 2GQSA 2EVAA 3QKKA 3GCSA 1E9HA 4GCJA 3QQJA 5L8KA 5AV4A 2W1HA 4O0UA 3OWPA 3HMNA 1UWHA 3FDNA 4QYEA 5KE0A 5AP5A 4EUUA 3EQBA 3GQIA 1KV1A 2E9PA 4PDPA 4RMZA 4D5HA 5CF6A 4HZRA 3DTWA 2J7TA 4ZTHA 5EHLA 2J2IB 2WMXA 4RFMA 4A4OA 2OK1A 1RE8A 4FV0A 3HAMA 3TZ7A 3L9PA 4O81A 2ESMA 1WBWA 4G3GA 4IWQA 4XNEA 1CTPE 3NVMB 3G2FA 5EW8A 4FKPA 2O0UA 5I4NA 2CMWA 3ZLWA 4QQCA 3LOKA 3G90X 4ZJVA 2PYWA 3R01A 3FI4A 5AUTA 5C8NA 3OXIA 1H00A 3JYAA 4JIAA 4FSTA 1DS5A 3FQEA 5BVDA 2CN8A 2CGXA 3C0HA 3VAPA 4W4VA 4FODA 4A9RA 2CNVA 2OLCA 1YI6A 2AC3A 1Q97A 5JN2A 5C01A 4IX5A 2PUPA 5HD4A 5JEBA 3V6RA 4AXFA 3WARA 5IA1A 4KS7A 5EQYA 4KRDA 3DS6A 5CY3A 1WBOA 4ANBA 3EWHA 3TNIA 4AN2A 2WAJA 4N6ZA 5A54A 3GU8A 5EYCA 4EWHA 3ZRMA 2ZV2A 1NA7A 4U7ZA 5KZIA 4WG4A 3AKKA 5BMMA 4G1WA 2CLXA 3RPRA 3PXQA 3MY0A 2ITWA 4NK9A 4AAYA 1UWJA 1DI9A 4UBAA 4DN5A 4G17A 2YHVA 5LVLA 4XP3A 3PLSA 4RG0A 2XKDA 4BBMA 3HKOA 4KKHA 3Q9ZA 5C8MA 3HV5A 2I0EA 3MH0A 3CD3A 1B39A 4EORA 4ASXA 4K11A 3TUCA 2CHLA 3FZTA 4D4VA 3PPJA 5C03A 5D12A 4XBRA 1W82A 5CVHA 4JBVA 1OI9A 3W8LA 2BRGA 2X8EA 3VBWA 3UQGA 3OY1A 1M2RA 1W8CA 4F70A 4TXCA 3FBVA 5EH0A 4PTCA 4KKGA 4PL3A 4UX9A 4FKOA 2WPAA 3FSFA 3ZXZA 3DZOA 1P5EA 2BHHA 2H34A 3EQFA 5E91A 3ROYA 3T3VA 4CG9A 1H0WA 5IUIA 2QOKA 3DJ7A 2GDOA 2ITNA 4Q9SA 3A8XA 3H9FA 4FV4A 5H8EA 4YTIA 4CFUA 4DCAA 1ATPE 4YNOA 5EDPA 1H4LA 2QG5A 5HU9A 4FSQA 2C6IA 4M14A 4BDFA 3PY0A 2F7XE 3ZFYA 2R9SA 4IEBA 1FGIA 4KIPA 2JDOA 4DF3A 3BLRA 4E4XA 3A61A 3ZC5A 4O0VA 5HO7A 4MBIA 3KULA 2VTSA 3E8CA 3PDTA 5AUZA 3SXRA 1KE6A 2X81A 2B4SB 4IMYA 4I6LA 4NM5A 3TWJA 3VS5A 2GQRA 4AOTA 1LP4A 3C4FA 1REKA 2VTQA 4XCUA 2ERZE 3GFEA 5CT7A 4ZY6A 2IW9A 1JOWB 3ZU7A 4QRCA 3PJ1A 5I9ZA 4LM5A 1UKIA 4R3PA 1WVXA 2AUHA 4BCHA 4FV7A 4EQUA 2WTWA 3NSZA 3NR9A 2WHBA 3AD5A 3CBLA 4KKEA 3UVQA 3CJGA 3ZHPC 3D2KA 3SXSA 3CCNA 4FKGA 2WTDA 4C4JA 3A60A 4FIGA 5TKDA 2J9MA 4HNFA 4RJ3A 5L2WA 3D0EA 2BAJA 3NFFB 4RBLA 2OGVA 3AMAA 3QD3A 3QUPA 4OGRA 4QP8A 2Y6MA 2Q83A 5E8YA 5AUXA 4FKUA 4ZS4A 4IFCA 4W4XA 5HCYA 2E9VA 3G0FA 4FSUA 3ZBFA 5I9XA 1OUYA 5ICPA 5CQWA 3ZO3A 3LZBA 4RIXA 4IACA 3CS9A 2OJGA 4RVTA 4FYOA 5JKGA 3I0OA 4YTFA 4RGJA 1O6LA 4JBPA 2B7AA 3COKA 1ST4A 3EN9A 3KA0A 2QOOA 3O5AA 2EWAA 3RJCA 3ZFMA 4GYGA 2XM9A 5HTBA 5IH6A 2V7AA 4ZJIA 3FMDA 3H9OA 3OHTA 3PJ2A 4FK3A 4L42A 3FC2A 3R7YA 4WNKA 3NUXA 4I3ZA 3UIXA 4FEXA 5CU0A 1CMKE 1IG1A 1Y8GA 4DA5A 4H39A 3R9HA 3WIKA 3FLYA 4D4YA 4FV3A 2RKUA 2XIYA 2ITPA 1YDTE 2C6DA 3BWFA 3NEWA 3RALA 3DFCB 4ANSA 4PY1A 4FT9A 1OKVA 2ZV9A 4IVDA 2PMLX 2YIQA 2YIXA 4XRJA 3IW5A 3P08A 4B8LA 3MIYA 4GSBA 3FLNC 3FXZA 4BN1A 1YHVA 2R5TA 2CLQA 2DQ7X 4IVAA 4QMQA 3CP9A 3MV5A 2GNLA 5CVFA 1PMVA 2VO0A 5EM5A 5CANA 1OECA 2NRUA 3FE3A 4K77A 1FBNA 2XF0A 2VWWA 3F2NA 1SMHA 5AP1A 4ERWA 2XARA 2W06A 4G31A 1V1KA 4TT7A 4FIHA 3HL7A 4ALVA 4IX6A 4NKSA 2C6OA 3H0ZA 3Q52A 4TWPA 1H25A 2Z7SA 4NIFB 4A9UA 1KSWA 2HWPA 4F0GA 4MUQA 4AN3A 4AQCA 1GIIA 3W8QA 3ZFXA 3F3UA 3KRLA 4FTAA 2QONA 4J96A 4NKAA 4ZJJA 2W4JA 5LJJA 4YJQA 3FMHA 4TWCA 4RVKA 4GH2A 3NNUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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