5M06A

Crystal structure of mycobacterium tuberculosis pkni kinase domain
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
255
structure length
245
Chain Sequence
MALASGVTFAGYTVVRMLGCSAMGEVYLVQHPGFPGWQALKVLSPAMAADDEFRRRFQRETEVAARLFHPHILEVHDRGEFDGQLWIAMDYVDGIDATQHMADRFPAVLPVGEVLAIVTAVAGALDYAHQRGLLHRDVNPANVVLTSRILLADFGIASQPSYPAPELSAGADVDGRADQYALALTAIHLFAGAPPVDRSLQPPKLSAFRPDLARLDGVLSRALATAPADRFGSCREFADAMNEQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PknI
publication title The crystal structure of PknI from Mycobacterium tuberculosis shows an inactive, pseudokinase-like conformation.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis (strain atcc 25618 / h37rv)
total genus 75
structure length 245
sequence length 255
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5m06A01
4FTRA 5A6OA 2WEVA 4YPSA 1PXNA 2WMWA 5L6PA 3LZBA 4GK4A 2Z7LA 3AT3A 4LGGA 4ZSEA 4RQVA 2P0CA 4KSQA 4FTKA 1YKRA 5HNIX 5JFVA 4B99A 1GY3A 1UWHA 4WHZA 4H39A 4ZSJA 5K9IA 4O7TA 5E8XA 3QUEA 2PZPA 5CLPA 5AAFA 1I09A 3DV3A 3ZS5A 4CNHA 4LUEA 3TV6A 2VV9A 3AMYA 3CQUA 4S34A 4C4GA 5BVOA 3OY1A 3BV3A 5HG5A 2BTRA 3KULB 4ZEGA 3R9NA 3TI1A 4FEXA 4XV1A 5KO1A 1OL1A 2XKCA 2I40A 3GEQA 1ZOEA 4O86A 4USDA 4C7TA 4HOKA 5CQWA 3DBCA 4K9YA 4DG3E 2XNMA 3BU6A 3LAUA 4JI9A 2OSCA 4FNXA 5BPYA 5DVRA 5CU0A 3JS2A 4EKKA 4XG9A 2VNYA 4JT3A 2C3KA 3MPMA 1OKVA 3RI1A 2PMNX 1K9AA 1WBOA 4FV0A 5LVNA 5C1QB 4EOMA 1WBTA 4AXAA 4J98A 2G15A 3DZOA 3S2PA 3C1XA 1U54B 3F2RA 4QYFA 4IANA 4I92A 3PG1A 1MRUA 2XBAA 1YWVA 4NW5A 3RK5A 2X7FA 4ID7A 3RHXA 4Z9LA 3ENMA 3COIA 3OCSA 3WYYA 4PDPA 4AF3A 3FHRA 1W98A 3NZ0A 3FI8A 1VR2A 4FV9A 3VUMA 4UALA 4NIFB 4AG8A 1UWJA 2GNHA 3U6IA 3F88A 2XM8A 2YM3A 4DFZE 3VS4A 2WEIA 4ZY6A 4NL0A 4F09A 3QHWA 2I0YA 4X6RA 2W1CA 1MQ4A 3EKNA 2C6LA 4RBLA 5I9XA 1OGUA 5ETIA 1H1WA 2BIKB 1OKYA 3W10A 1OBGA 4IB0A 1M7QA 2XP2A 3VIDA 4LV8A 5HU3A 3ZH8A 5E4HA 4E4LA 3R6XA 4FEQA 3FDNA 3QCSA 5HLNA 5IISA 4O6EA 1BUHA 2YIRA 4YR8A 1OIRA 2R3JA 3NNVA 3R00A 4L01A 4B8LA 3MN3A 2JAVA 3H0ZA 5J87A 4RRVA 5EQYA 3V5PA 3GUBA 2X7OA 3QTIA 4KWPA 1PY5A 3I7BA 3WI6A 1AD5A 2X8EA 3N9XA 4C33A 4BIBA 3TJCA 3FZSA 1K2PA 2HXLA 2QHMA 3BYSA 4RX8A 5DBXA 2BMCA 3HYHA 3AC1A 3PPKA 4HVDA 3FHIA 4JG8A 4D0WA 2WNTA 2P2IA 3OW4A 2ZB0A 4FZ6A 4R5YA 1JVPP 1U5RA 4HGLA 3BYVA 3LMGA 4IW0A 5F4NA 3BWJA 1VYZA 3R2YA 2NO3A 2J4ZA 1BLXA 3W55A 4CXAA 3DS6A 1WVXA 2GNLA 3BKBA 4MEDA 5CAOA 1PXLA 4F63A 3DNDA 1T45A 4EZ7A 1KOBA 3UIMA 3PE2A 3DKCA 3QX2A 4OTWA 4QO9A 3QZHA 4BZNA 3U4UA 2YDKA 3CTJA 1GAGA 3F61A 4I3ZA 3Q4ZA 2PE2A 2C47A 3ENHA 3IOKA 3PPZA 5ANOA 3V5WA 5HNGA 4AOJA 4DITA 5J9LA 4PMMA 2A2AA 4ZTLA 4BDCA 2PVRA 5EHLA 5M55A 3ZC5A 4CG8A 4TXCA 5EM7A 2RFNA 5AEPA 2QU6A 2Y4IC 3A61A 3QQUA 2FVDA 5LXMA 1WZYA 2WKMA 4NK9A 5F20A 3FLYA 2QNJA 2BZKB 5AUUA 5CF8A 1XO2B 4ONAA 3N4TA 4O7LA 3UC3A 1MUOA 3PP0A 4P5ZA 3W18A 2YAKA 3FZRA 3ORMA 3O2MA 3Q6WA 4YJTA 3TCPA 3CS9A 4B6LA 3BV2A 2JFLA 4WD5A 2O63A 3FI3A 2NPQA 2QU5A 1Y57A 2BPMA 4CLJA 2VX3A 2XRWA 4YTCA 4WT6A 4OTDA 4AN2A 3W2OA 2YM5A 2YWVA 5AP6A 1H25A 2EXCX 3MH3A 2J0LA 4TT7A 4LI5A 4XG7A 4U79A 4K77A 4XMOA 4DFNA 3BWFA 3ZSHA 4DC2A 4EORA 4EOPA 4FZDB 2J6MA 4U8ZA 2HZIA 5A9UA 3P7AA 1KUTA 4H3QA 2QI8A 3I7CA 4FKUA 3BYMA 3NUYA 3OY3A 2CNVA 3E7VA 4CFMA 4QTEA 4N0SA 3P1AA 5AM6A 2YM4A 3ZDUA 1YRPA 3IDBA 4MXCA 2X1NA 4XLVA 4B7TA 3BE9A 5FXSA 5FUTA 3G5DA 2P33A 4ZS4A 3PA3A 4WRGA 5BYYA 2YA9A 1ZMVA 3VF8A 4PX6A 2BIYA 3DOGA 4I41A 3IW8A 4PV0A 4F6WA 3UO6A 4NZWB 4C62A 5KZIA 3BHVA 1IAHA 3P23A 2ESMA 4QMOA 2CHLA 4RZWA 4ZS0A 3S0OA 4GL9A 1PXMA 4JJRA 3EN9A 3LFFA 5F95A 4FUYA 4YHJA 3OXZA 5K3YA 4QTAA 1S9JA 2PZ5A 1O6LA 3IW7A 4FSZA 4CRLA 1Q8TA 3G33A 3HZTA 3WOWA 4ERWA 4O7SA 4YJOA 3VS5A 1E9HA 4HYHA 5LCKA 2GSFA 2GTNA 2ITWA 4QP6A 4E6DA 4FTMA 4U40A 4BDJA 5KMLA 5EW8A 3OROA 3REPA 4A9YA 3TNHA 4N70A 5DE2A 3FKOA 2GNIA 1KV1A 3HLLA 1Q61A 1U5QA 5AV3A 1YXVA 2IW8A 3LCKA 3LIJA 3R21A 4M69B 3QD0A 5AIKA 2ZYBA 2YJRA 3SXFA 3DK6A 2UZLA 5HICA 2C3LA 2JDVA 5CNOA 4AOIA 4EK4A 2OLCA 4NT4A 2QR7A 5BYZA 4DEBA 4KUJA 4O82A 3EB0A 3O96A 2PY3A 3Q9ZA 2QG5A 4ZZMA 1ERKA 1SZMA 3RJCA 3KQ7A 4O83A 5CI7A 5AP4A 3UOLA 2JDTA 4RLKA 3E8NA 1BMKA 4M7IA 3TKIA 4ZTMA 3GP0A 4YTHA 2XMYA 3MJ2A 4ZZNA 2YM6A 3C5IA 4X3FA 2FO0A 2CGVA 4P4CA 3CJFA 3OVVA 5HBJA 3QD2B 1VEBA 1H0VA 4IDVA 2CCHA 2J0KA 4R6VA 2B9JA 4G3FA 2YIWA 4JBQA 4XP2A 4AZFA 3EOCA 2CKQA 5CALA 3RAWA 4G2FA 2IPXA 3CD8A 2VTOA 3HA8A 2C5OA 2E9PA 4MD9E 4R7IA 4JR7A 3C4FA 4NFMA 4NM3A 5C8KA 3L9NA 4KRDA 4EK8A 1KE9A 4FUXA 2XIZA 1WAKA 4IB3A 2B9HA 3ZFYA 1GIJA 2UZDA 2P4IA 4E7WA 1V0OA 1CKPA 3NYOA 4FV4A 4YNEA 1XJDA 5LMAA 4C58A 4EOJA 5K4IA 4EHEA 4ACMA 2LAVA 4QRCA 3IQ7A 3HRCA 3OS3A 3ATTA 1J91A 4GSBA 3VS6A 4GV1A 2CGXA 1LP4A 1YI3A 4NYEA 4OLIA 4V01A 4YLJA 5JRSA 5BVFA 2W4KA 4GEOA 1NVSA 4USEA 3MH0A 4YJUA 1WCCA 4UY9A 3VUKA 5KMKA 4EK5A 2QONA 5FDXA 3SV0A 2VTLA 3LCTA 3C0IA 4XRLA 3UPXA 4QMSA 5J5SA 4KD1A 3E8DA 3NNXA 4HNFA 3NYXA 5AMNA 2HK5A 4BCHA 1XH5A 2YIYA 3LJ2A 3GU8A 4FTTA 2UW6A 4L9IA 3OHTA 4AP7A 4X3JA 1TKIA 2X4ZA 2WIPA 3ZUUA 4ERKA 2EU9A 4DTBA 1T46A 2B7AA 3GXLA 1RQQA 4IZAA 2YM7A 1IR3A 2F57A 2HY0A 1YI6A 2XS0A 2ITZA 3QZGA 4TN6A 3SOCA 4AN3A 5BVNA 4E4MA 4Y83A 2OIDA 4QTCA 4FTNA 3GB2A 2CKEA 4MWIA 2QOQA 4BF2A 3KK9A 3QQKA 4C4JA 5I0BA 2ZB1A 4EQMA 2UW3A 3IDCA 4GJ2A 5IUIA 5LQFA 3R8PA 2E2BA 5DRBA 4KSPA 4L00A 4JS8A 3QC4A 2WB8A 4G9CA 4KBAA 4NH1A 3ZRLA 4ZMEA 4BTKA 3N4VA 4PUZA 5A14A 3M2WA 4E1ZA 5DT0A 4L3PA 5JFSA 5AV4A 2J51A 3DLSA 1PKDA 3QA8A 3A4OX 5C03A 3UP2A 2OJIA 4LRKA 4XP0A 5FEQA 2YM8A 3G90X 5IUGA 1XBAA 5JFXA 4XX9A 4A9SA 1CSNA 4DE4A 3FV8A 3NAYA 5FXRA 1R78A 1PXKA 4DG0E 3DAEA 3OOGA 3GFEA 3MVHA 4EOKA 1SM2A 5AA8A 4DH1A 4M8TA 4ACDA 2ZJWA 3VBQA 3ORKA 3DQXA 2J90A 2X6DA 2W1HA 3AQVA 4G17A 3DAKA 4GU6A 4R1VA 3VBTA 4AU8A 1R0EA 2IWIA 1OL5A 4ZSAA 2IW9A 1UNLA 1OZ1A 4O91A 4PWNA 5IA5A 4FIHA 5EM5A 4X0MA 1JNKA 3E88A 2XVDA 5ACKA 4MXAA 2A0CX 4IC8A 2OWBA 3FI2A 4FKWA 4CFFA 5TOZA 4H1MA 3EN4A 2VTIA 2QOCA 3HX4A 4FV7A 4RGJA 5AX9A 4C3FA 5CWZA 4TZRA 1SYKA 2OZOA 3FKNA 3FYJX 3Q96A 5AA9A 4CTBA 3U6HA 2R3NA 2XB7A 4FI1A 1P14A 4Y72A 5EFQA 4DCAA 4Z3VA 5CSVA 3AC8A 1DS5A 1ZMWA 2UW0A 2XM9A 2A27A 3D83A 3EYGA 2OXXA 4NTSA 1GIHA 2V7AA 2XK6A 4KRCA 4I6FA 2A1AB 4MNFA 4X2NA 4HGEA 3VHKA 2AC3A 3N51A 4EH5A 5IEXA 5LWNA 4HCTA 4RJ8A 2QKWB 3E3PA 2V22A 4AA4A 4XUFA 3E92A 3VBWA 3RCDA 3OEZA 3A62A 3LLAA 4GK2A 4XEYA 2WMBA 4UYAA 2RIOA 4ZLOA 4FNYA 4P7EA 2Y7JA 3HAMA 3RPYA 3EQRA 2YACA 5KHWA 2W99B 5IH4A 3D94A 3PY0A 5FTQA 3M1SA 4QP4A 3Q53A 3R30A 5FTGA 4D4VA 2X81A 3C4CA 3A7HA 3CQWA 4DA5A 2QKRA 4GKIA 5HIEA 3IGOA 2H8HA 4HVGA 4UWYA 1OB3A 2PVFA 5EQPA 3UNZA 4DH5A 2OH4A 2FGIA 4UBAA 3FWQA 1MQBA 4RFMA 4TRLA 4WBOA 1KWPA 1SMHA 2GCDA 4D1SA 4CMTA 4AGWA 3WZUA 3U9CA 4BTJA 2BUJA 2R3LA 1YXXA 4K2RA 4O6LA 4RMZA 5HG7A 4G9RA 3F3TA 4O0VA 5HORA 5DG5A 4EZ3A 3UOJA 4D58A 1JBPE 5C9CA 3NVKI 3EZVA 5LWMA 4FL3A 4AE9A 5BNJA 3DJ6A 3ZUVA 1PHKA 3NW5A 2W1EA 3O0GA 4D4SA 4M97A 4YLLA 4IZ7A 3PXFA 3QRUA 4FEWA 4RC2A 3TDWA 3NDMA 2R5TA 3GQLA 1BYGA 4FT0A 4YSJA 1CTPE 3EQBA 2XIKA 4IMYA 2BAJA 2XKFA 4PMSA 2WZJA 2ZV8A 2R0UA 3QGYA 4IE9A 3BRBA 3JVSA 5A3XA 5ICPA 2PVMA 3KXGA 4CFVA 2G9XA 2ZM3A 1H07A 1PYXA 3F2AA 4XG8A 3NUXA 5EKNA 3MB6A 3QQHA 4RIWB 4NWMA 1JQHA 3AD4A 4QNYA 3DXPA 4FTQA 4CMOA 3I0OA 1O6KA 3D5WA 3UNJA 1IAJA 1JWHA 2BZJA 4YZCA 5FBOA 1CKJA 5FG8A 5HU9A 5JGBA 1U59A 3S3IA 4Q9ZA 4FSMA 4IAFA 2W1DA 4Y73A 3NNWA 5HE0A 4AZVA 2FA2A 4ANSA 2X6EA 3D7TB 2R0IA 2C6DA 3BE2A 3DKFA 4U97A 4BCPA 3IPHA 4FTOA 4ZXTA 4ARKA 4MNEA 5CZHA 2C5VA 5HE1A 3HA6A 1WFCA 2R3IA 3H4JA 2C3JA 3D2IA 4QYYA 1W8CA 2VD5A 3GU7A 4G6OA 3SRVA 5DR9A 3KY2A 3TZ9A 3RM6A 4G3EA 3QA0A 3VNTA 2FSOX 4DGOA 5B2MA 5JK3A 4E6AA 4XJ0A 2UZUE 1ZYDA 2X2MA 3MIAA 4CZTA 4J97A 4FIJA 3NEWA 2REIA 3DT1A 1YWRA 5DEWA 1NA7A 2UW5A 3CPBA 3LXPA 3OP5A 4B8MA 4MVFA 2W4JA 2VGOA 1QPJA 3W2PA 2J2IB 3UPZA 2BDWA 3TTJA 1MP8A 1PXPA 3MY5A 4OT6A 4DN5A 1OI9A 2W9ZB 4BI0A 4NUSA 4CFUA 4I5MA 4ALVA 2IW6A 4W4XA 3JXWA 3TXOA 3G6GA 2PK9A 4DGLC 3A7FA 2BRMA 1M2QA 4QMWA 1APME 1IA9A 1WVWA 4MTAA 4WNOA 3PFQA 4L53A 2QOKA 3S95A 5C4LA 2NP8A 4D9UA 2Y8OA 2G2HA 2WMAA 3OG7A 4IC7A 4BC6A 5BUIA 4FGRA 5A6NA 2OK1A 4R3CA 2HW6A 5EM8A 3W8QA 4MAOA 4NJ3A 1BI7A 2VWXA 4I1ZA 4IAYA 3EQHA 1Q8YA 4KIPA 5DRDA 3R9HA 5JGAA 4YZMA 2BHEA 2F7XE 4IM0A 2WHBA 2OXYA 1H4LA 3RK9A 3WF6A 3LQ3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1OZ1 A;  4O91 A;  4PWN A;  5IA5 A;  4FIH A;  5EM5 A;  4X0M A;  1JNK A;  3E88 A;  2XVD A;  5ACK A;  4MXA A;  2A0C X;  4IC8 A;  2OWB A;  3FI2 A;  4FKW A;  4CFF A;  5TOZ A;  4H1M A;  3EN4 A;  2VTI A;  2QOC A;  3HX4 A;  4FV7 A;  4RGJ A;  5AX9 A;  4C3F A;  5CWZ A;  4TZR A;  1SYK A;  2OZO A;  3FKN A;  3FYJ X;  3Q96 A;  5AA9 A;  4CTB A;  3U6H A;  2R3N A;  2XB7 A;  4FI1 A;  1P14 A;  4Y72 A;  5EFQ A;  4DCA A;  4Z3V A;  5CSV A;  3AC8 A;  1DS5 A;  1ZMW A;  2UW0 A;  2XM9 A;  2A27 A;  3D83 A;  3EYG A;  2OXX A;  4NTS A;  1GIH A;  2V7A A;  2XK6 A;  4KRC A;  4I6F A;  2A1A B;  4MNF A;  4X2N A;  4HGE A;  3VHK A;  2AC3 A;  3N51 A;  4EH5 A;  5IEX A;  5LWN A;  4HCT A;  4RJ8 A;  2QKW B;  3E3P A;  2V22 A;  4AA4 A;  4XUF A;  3E92 A;  3VBW A;  3RCD A;  3OEZ A;  3A62 A;  3LLA A;  4GK2 A;  4XEY A;  2WMB A;  4UYA A;  2RIO A;  4ZLO A;  4FNY A;  4P7E A;  2Y7J A;  3HAM A;  3RPY A;  3EQR A;  2YAC A;  5KHW A;  2W99 B;  5IH4 A;  3D94 A;  3PY0 A;  5FTQ A;  3M1S A;  4QP4 A;  3Q53 A;  3R30 A;  5FTG A;  4D4V A;  2X81 A;  3C4C A; 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 4FV6 A;  5I9V A;  5KZ0 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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