5M08A

Crystal structure of mycobacterium tuberculosis pkni kinase domain, c20a_r136a double mutant
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
256
structure length
247
Chain Sequence
MALASGVTFAGYTVVRMLGASAMGEVYLVQHPGFPGWQALKVLSPAMAADDEFRRRFQRETEVAARLFHPHILEVHDRGEFDGQLWIAMDYVDGIDATQHMADRFPAVLPVGEVLAIVTAVAGALDYAHQRGLLHADVNPANVVLTSQDQRILLADFGIASQPSYPAPELSAGADVDGRADQYALALTAIHLFAGAPPVDRQPPKLSAFRPDLARLDGVLSRALATAPADRFGSCREFADAMNEQAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PknI
publication title The crystal structure of PknI from Mycobacterium tuberculosis shows an inactive, pseudokinase-like conformation.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis (strain atcc 25618 / h37rv)
total genus 71
structure length 247
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5m08A01
2QR8A 1XH6A 3QAME 2R3QA 5DFPA 2VO6A 4LMNA 2JGZA 3FYKX 2XIYA 2IG7A 4RJ6A 1PKGA 1WCCA 3QQKA 4FIJA 1RJBA 5DG5A 5J95A 4QMWA 4S30A 2W17A 4OTHA 2F7ZE 1H00A 4Y85A 4FG9A 4DLJA 1H24A 3BYOA 4DAWA 3C50A 3OW4A 2XRWA 3OD6X 1IG1A 4P2KA 2R3KA 2GNGA 4FUYA 2JKQA 3SLSA 3IS5A 2XNBA 3ENMA 1T46A 4XP3A 2YA9A 2KULA 4J7BA 2GS7A 1J7LA 3HNGA 2OXXA 2XZSA 3PXFA 4IB0A 4QP3A 2XNOA 3BHHA 2DWBA 3FEGA 3FV8A 3WZJA 2ITQA 4CG8A 2CGXA 5M53A 4X21A 3R8LA 4C59A 4CQEA 5IA0A 3Q2MA 2QLUA 3WZEA 3F2NA 2YFXA 1R78A 2BDWA 5AMNA 3VS2A 5M4FA 3R63A 4R78A 3HMOA 4B8MA 4G9RA 1M7NA 2WQOA 3ALNA 3PJ2A 5CT7A 4BRXA 4M0ZA 3JY9A 5EI8A 4PNKA 5IUGA 3HMMA 1WAKA 2C3JA 2WQMA 2QONA 2V22A 3QCYA 4MD9E 4HVHA 3R2YA 4H58A 5EG3A 1GIJA 3EQGA 4FV8A 2ZB1A 4EOSA 4GV1A 2BTRA 4UXLA 1YDSE 1R3CA 3AC5A 4AP7A 2F49A 3GQIA 1PY5A 1PXPA 1DI9A 3PSDA 4IB1A 3UP2A 2RF9A 4DBXA 4CFUA 4I6HA 1K3AA 3ORMA 4K11A 4BI2A 2BHEA 1OL6A 3UYTA 1J7IA 3EQHA 4DGGA 2WTCA 3DGKA 3Q4ZA 4HNFA 4Y72A 5E8VA 4WNKA 3GC9A 3W32A 5EYMA 2JDRA 3MIYA 2W5BA 4ACDA 5FXQA 4C2WA 3NMUF 1B38A 4FTOA 4WBBB 3CQEA 3QZFA 4DEIA 2ZV8A 5F9EA 4O0SA 4J96A 4QMZA 4KSQA 2HY0A 3NCZA 4OTRA 5E92A 2E9NA 4APCA 3OWJA 2J4ZA 4NSTA 3FMDA 3DNDA 3OG7A 4JVGA 3SG9A 3ZXZA 3MI9A 5HG8A 2IVVA 4ERKA 5LMBA 1W84A 2YIXA 2OXDA 3I4BA 1JKSA 3DNEA 4KIQA 3VIDA 4D55A 4E20A 2V7OA 2WIPA 3HX4A 4MXZA 1U5QA 3QU0A 2XK9A 3JR1A 5H8EA 3ORNA 1K2PA 3BYMA 4LM5A 3EFKA 5HD4A 4QP6A 4GK4A 2G2HA 4FT9A 1FQ1B 2J5FA 4ZMEA 5FXSA 4CVAA 4OTQA 1J1CA 1JSUA 3OCSA 4TW9A 3U8WA 4GK3A 4JDJA 5HU3A 2C5XA 2QOFA 3WOWA 4U3ZA 1Q5KA 4AGWA 1FVRA 3QRIA 4HPTE 4QTDA 4XG3A 3EFWA 3F5XA 3G0FA 3GGFA 4MCVA 3RAIA 4TWNA 5LMKA 2WO6A 1P2AA 2VTTA 5AIKA 5CNOA 2XIXA 1PXLA 4RRVA 3D94A 3NIZA 4IANA 4XG8A 3FWQA 3IKAA 4FODA 4QNAA 3CKXA 4DCEA 1PMUA 1UNLA 3ORZA 4KUJA 2ZJWA 5EI6A 3MESA 1XH9A 1QPCA 2LAVA 5BYZA 4IB3A 1ZAOA 2OJGA 4BCMA 4DG3E 4S32A 4XV2A 3COMA 2YERA 1UV5A 4EZ5A 3R73A 3EQRA 3PA5A 3RAHA 5AUUA 2C0TA 4MNEB 4TYEA 4FZ6A 4U97A 1Y57A 2IVTA 3PY3A 3LHJA 5I9ZA 1Y91A 3OROA 4U79A 4O27B 4WG3A 3WBLA 2PSQA 4KD1A 2CJMA 2WTWA 2G01A 2XK7A 3JS2A 4R3CA 3W8LA 2C6OA 4HYIA 4JRVA 4RZWA 1Q3DA 4APPA 2J0JA 5LVLA 4EWHA 2OSCA 1F5QA 4QNYA 3H9RA 4YHTA 1H0VA 5ANOA 2JAVA 2EVAA 3DB8A 3L8VA 3QCXA 1VYZA 4ZIMA 1PYEA 4FSTA 3NUUA 1G3NA 3TV7A 5D12A 3EL7A 3KRLA 3QYZA 2IZTA 3EHAA 2PWLA 1QL6A 4J71A 5ETIA 5KHXA 4ZTHA 3QXPA 4IWDA 3BGPA 3B8RA 1H07A 2WD1A 2YM7A 3FPMA 2QU5A 2UVXA 3HUBA 4ZY6A 3FZ1A 2FSOX 4V0GB 5LQFA 4XLVA 3ZFMA 2PMOX 2QQ7A 4DGLC 3NIEA 4IAFA 2WMXA 2XNNA 2V0DA 2XKCA 3I79A 3RPSA 2WELA 3IG7A 4CEGA 3IQ7A 3GU6A 4KKEA 4E1ZA 4I1ZA 3UPXA 2XM9A 5DRBA 3QALE 3Q5ZA 3CJGA 3PRIA 3UE4A 5I9VA 2J50A 2WKMA 2PVMA 3ZZEA 4FTLA 1KSWA 4GMYA 5I0BA 4I5PA 5HE1A 5HHWA 5IUIA 3MWUA 2RL5A 2YEXA 5CVHA 4D4VA 2XIKA 3DBEA 4D0WA 2CKPA 4IDTA 4L45A 4HVGA 2X39A 3OF0A 4G5PA 4UWCA 4AXAA 3LMHA 4ZTMA 1PMNA 4EKLA 5A14A 4HNIA 5CAOA 3BHVA 2EU9A 4IC7A 4CKIA 1H26A 2C6KA 1WBWA 2HZIA 3E8CA 3FHRA 4I4EA 3F5PA 5ANKA 2ZYBA 5KHWA 2W05A 4EORA 5JZJA 4ZTRA 3UMXA 3MJ2A 5IEVA 3LVPA 3RHXA 1WFCA 5CYIA 4CFMA 5CEKA 5BYLA 1AGWA 3P23A 3FPQA 4P7EA 2GMXA 5HBJA 5HVYA 4OTDA 1JVPP 4G6OA 4RJ3A 2UUEA 2GNIA 4IVCA 1H01A 3VQHA 3OBGA 4OT6A 3WF7A 4NJ3A 3P5KA 4ZTNA 4Q5HA 1U46A 4GG7A 3QCSA 4BCFA 1H28A 3G51A 4YJOA 5C01A 4F9AA 1SNXA 1KE5A 3KF7A 4DN5A 2I1MA 2QI8A 4DHFA 2GQRA 2GTNA 3LPBA 3F2RA 2B1PA 5IZFA 3ALOA 1OIUA 5TOZA 4F6SA 5KMMA 3KXGA 2R0UA 3NW6A 5EW8A 4Z7GA 3TTIA 4WD5A 3P78A 2OH0E 3H9FA 4K1BA 4DEAA 1B39A 3AC2A 5DA3A 2BZHB 2UW9A 4AA5A 4ALUA 3ZC5A 4LG4A 4YBJA 3FI8A 3QTZA 3W16A 4F9YA 2O63A 4BHZA 3TN8A 3G90X 4DFXE 3AGLA 1HCLA 3BYSA 3TACA 2ITVA 2OFVA 1XO2B 3E63A 3ZUVA 1PYXA 3FI4A 4FZDB 4IX4A 4KA3A 4X0MA 2E9PA 2PVFA 5KCVA 4ASDA 3K3IA 5A46A 4OBPA 4DEBA 1JAMA 1IASA 5GNKA 4AW0A 1GZOA 3EQIA 2X7FA 3SQQA 1PJKA 2VNYA 2WHBA 4EC8A 5L6OA 3HV7A 4PRJA 5CASA 2BFYA 3KGAA 4NM5A 3ZEWA 4CZUA 2PE1A 4FKVA 3V8WA 3QHWA 3QWJA 1OVEA 4O96A 4RLLA 4CTCA 1ZXEA 4R5YA 5LARA 1DAYA 3G33A 2X1NA 2EXMA 3DDQA 4BDHA 1FINA 3D5UA 4UY9A 5FM2A 3VBWA 3PXQA 4AAAA 4EYMA 5IQDA 1XWSA 4ANMA 3HA6A 4FIFA 4BBMA 4TL0A 1KV1A 3O7LB 4IAYA 3AC1A 2PVYA 2IWIA 3A62A 3A8WA 3GENA 4MKCA 3C51A 4RLKA 5I9YA 3G6GA 2UZOA 1JPAA 2VV9A 2JIIA 3L1SA 1M2QA 2OXYA 4I5HA 3W55A 3WE8A 4H1MA 4DF3A 3UNZA 1CM8A 3Q53A 3UVPA 3AGMA 4ZXTA 4ZZOA 5IA3A 4QMTA 3MH1A 1LEWA 3F3VA 3OCTA 2JDSA 3VUMA 5J5SA 3FXXA 3HVCA 4JQ7A 4AG8A 2CKQA 4PTEA 1ND4A 4TZRA 5D7AA 5IA5A 2J51A 5J87A 3UIUA 5HNGA 1U54A 4ZLOA 3MVLA 3P79A 4PNIA 3RNIA 5A4QA 2QG5A 3JY0A 1PXNA 3IDBA 4MBJA 2ZVAA 5K4IA 3PLSA 5B2LA 1S9JA 4FTAA 4I5MA 1Z9XA 4E5WA 4QMUA 1AD5A 1Q41A 3ROYA 3AT2A 4RJ4A 1G8AA 4FIHA 3UOHA 2OIQA 4GKHA 3FMNA 5K4JA 2WEIA 4DT8A 2WFYA 4O7ZA 4RBLA 1UA2A 4PWNA 4R5SA 5JH6A 2PUIA 3EYGA 3BRBA 4CFFA 3AC8A 5EFQA 4C35A 3LXKA 4CRSA 5CXZA 3ZXTA 3DKCA 2FSTX 2QOCA 4K77A 4KRCA 3ZRLA 3ZHPC 2GQGA 2Y9QA 3R8VA 3DQWA 5C8MA 4A9YA 1UNHA 4PL4A 4QMOA 5HCZA 4B6LA 4BIBA 5FDXA 3FSFA 3JVRA 1Q97A 4G31A 4I92A 5AEPA 4ZJVA 3BPRA 3OT8A 2C6IA 4FEWA 1KOAA 5L6PA 3KK8A 1LUFA 3I7CA 3CS9A 1VYWA 4F0IA 1IAJA 5AAEA 5M4UA 4WSYA 2GHMA 3MY0A 3L9NA 1W98A 2OZOA 5JFVA 4LGGA 3HRBA 3V51A 4BGQA 4EC9A 4NW5A 2IZRA 3B8QA 2R5TA 2G2FA 5EM6A 2XYNA 3F5GA 4HYUA 4F9CA 3ZSIA 4NK9A 4FKTA 4FT3A 4G9CA 4V04A 4E6CA 4ASEA 4LRJA 1SNUA 2B9JA 2I6LA 3L8XA 3KULA 5CXHA 3NGAA 3Q6UA 2FYSA 4PDSA 3ZUUA 4YU2A 3CJFA 5C4LA 5CY3A 4I0RA 2G15A 3Q6WA 2EB2A 5E1SA 3LM5A 3R7IA 3ZC6A 3HUCA 4E4NA 4NZWB 5CWZA 3C5UA 3ZO2A 2FA2A 5A9UA 3NUXA 3ZS5A 4IZYA 4R1YA 3GFEA 4AOJA 4GVJA 3BGZA 3QGWA 1BL6A 4LL5A 4L7SA 2I0EA 3C4ZA 3UC3A 2YWPA 4DFUA 3AMBA 3LLTA 4X3FC 5HCXA 5E8SA 1O6KA 4FG7A 3Q04A 4U5JA 3BWFA 2PZIA 3PY1A 3CSVA 4FNYA 4ACGA 4H39A 4G34A 3R00A 4F7SA 2Z2WA 4F08A 3V5WA 4D5KA 3HA8A 2ZM4A 3UIBA 1YI3A 2YIRA 4JBQA 4YC3A 4MYGA 4XUFA 1BL7A 2W1ZA 1ZARA 2OO8X 3W8QA 4II5A 1YWRA 2UVYA 4OTFA 2H8HA 4QMPA 4JS8A 4LV5A 2BRNA 4J53A 4ONAA 3M2WA 3SDJA 3PSBA 4RQVA 4J98A 5ETCA 4ZTQA 2YWVA 1PMEA 4PL3A 4BBFA 4XG7A 2F2CB 4W4WA 4CTBA 3FY2A 2VX0A 1KOBA 2PUNA 2GFSA 4IX3A 1ZWSA 3FLNC 4GW8A 4IVDA 5DT3A 3CC6A 4DBNA 3W2SA 3KFAA 3PZHA 5GIPE 3MJ1A 3NR9A 3EQFA 2GNHA 3KVWA 2GHGA 4U7ZA 2VWXA 4LUDA 3U4WA 4ALVA 3LFAA 3OEFX 4F0GA 3D7ZA 3D14A 2X4ZA 2HAKA 4AZTA 2ZV7A 4O38A 2ITZA 2DQ7X 3TZ7A 3QZHA 2CPKE 2C6MA 2BROA 4X2FA 3OVVA 4GJ2A 4JRNA 4J52A 4XOZA 5M4CA 3TUDA 2X6EA 1W83A 3O8PA 5CAUA 2VWBA 2R3NA 4ZSLA 3ZZWA 2XM8A 3LCKA 3LCSA 4C2VA 4NCTC 5E8ZA 4EOPA 2NRYA 4U45A 1XBBA 3OHTA 5IDNA 4ID7A 4J99A 2R7BA 5HE2A 5CEQA 4CKJA 3PFQA 4ZOGA 3K5UA 2VO0A 5AUZA 3HLLA 1QPJA 3QZIA 3ZU7A 5HORA 2VGOA 3A60A 1A9UA 3HV4A 4N4SA 3TTJA 3BHTA 5DT0A 4I41A 4DEGA 2R3OA 4O7VA 4HW7A 4QP4A 3BE2A 5LMAA 3S0OA 3RHKA 3VBQA 1PRYA 4JT3A 4F99A 5IU2A 2PUUA 2JC6A 4FNXA 2PY3A 4B8LA 1ZMVA 3QZGA 4EH9A 3QTIA 2H34A 4M97A 3DK6A 4F1OA 2WTJA 5LCKA 4FTMA 3DDPA 5HLPA 2YCFA 4BC6A 4IM3A 4V01A 3UP7A 2CKOA 3BLHA 4GCJA 4FA2A 4RVKA 4PDPA 4KAOA 3UOKA 1IR3A 2HXLA 4GKIA 4R1VA 3UO4A 1BX6A 2BIKB 2C6EA 2R3MA 3H30A 3CGFA 2CN5A 3MB7A 4MXCA 4TNBA 5AP7A 5KMJA 4Z9LA 4AZSA 1FBNA 4QMMA 4C4GA 5L2TA 2UW5A 2ONLA 5ACKA 3VQUA 4BICA 4K33A 3CCNA 4YJSA 4RFYA 3VUGA 4E93A 3PJ8A 3P7AA 2E9UA 3PUPA 1LP4A 4PMSA 1J1BA 4YTIA 3NRMA 3W2RA 1FVVA 3N4UA 2B4SB 2VD5A 3D2KA 3EN7A 3OUNB 2OWBA 2CNUA 3NX8A 4FICA 3MB6A 3TUBA 5B2KA 5CSVA 2OJJA 4JJRA 5AADA 5BVDA 5IA1A 5M44A 3OWPA 3HP2A 3WF9A 4AN9A 5I5ZA 2WTDA 4MBLA 5EOLA 3T9TA 3S1HA 2UW7A 3RPRA 1U54B 2W99B 2X9EA 2QCSA 2WGJA 4IAKA 2G2IA 4LGHA 4XNEA 5FBNC 3UODA 1H25A 2WQBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5AAF A;  2W1D A;  5JQ5 A;  4MH7 A;  4DE4 A;  2ZB0 A;  2IW9 A;  4FVP A;  4JDI A;  3PXY A;  3SXS A;  3TZM A;  3AD4 A;  2WQN A;  3GCQ A;  3HKO A;  2UZB A;  3HYH A;  3OXZ A;  4H3P A;  3VJO A;  1ZY5 A;  3E8D A;  3EN5 A;  4ANS A;  4EUU A;  4V0G A;  4NUS A;  4ZP5 A;  4QMQ A;  4G5J A;  5L2W A;  3RAK A;  2FSL X;  3MPT A;  5AV2 A;  4KBK A;  5FBO A;  2GPH A;  3MN3 A;  3ANR A;  1Q24 A;  4CT1 A;  4MQ2 A;  3OMV A;  1U59 A;  4DFZ E;  4YTC A;  3KA0 A;  4Y83 A;  1YWN A;  5EYK A;  4ZY4 A;  3I6W A;  2A0C X;  3OT3 A;  5HTC A;  4AA0 A;  3QX4 A;  4JG7 A;  5ANI A;  4RX5 A;  3SXR A;  4BI1 A;  4UYN A;  2CDZ A;  4O0V A;  3AKJ A;  4XBU A;  3UTO A;  4WUA A;  3ION A;  4PDO A;  2AYP A;  3GI3 A;  3C0H A;  3TZ9 A;  2B55 A;  4ZS4 A;  4FKJ A;  4WG5 A;  5AUX A;  4QML A;  3BYU A;  3EID A;  3P4K A;  3RAL A;  2YAA A;  3QYW A;  3V5J A;  3NW5 A;  4OGR A;  5AP0 A;  5CF6 A;  2UW0 A;  3DLS A;  3ORL A;  4BBE A;  1UWH A;  2BIY A;  3ULI A;  3D5W A;  4BCQ A;  3R8P A;  3BQC A;  2CGW A;  2PTK A;  2XB7 A;  3Q9X A;  4FEX A;  5AM7 A;  1ZY4 A;  2GS6 A;  3P9J A;  5HIC A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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