4DITA

Crystal structure of gsk3beta in complex with a imidazopyridine inhibitor
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
353
structure length
328
Chain Sequence
SKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Glycogen synthase kinase-3 beta
publication title Crystal Structure of GSK3beta in complex with a Imidazolopyridine inhibitor
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 328
sequence length 353
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ditA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ditA01
2LAVA 1BL6A 2RSVA 4JBPA 3QC9A 4FL2A 3WILA 3QLGA 5A6OA 4ID7A 3C4CA 5HE1A 5JRSA 3TI1A 4ZXTA 3RAHA 3NS9A 3EFWA 4KBKA 3DGKA 4AWIA 4EH5A 5L8KA 4F6SA 4ZLOA 3EQGA 3ATSA 5FM2A 2O0UA 5J87A 2BZKB 5LWMA 4FZAB 3NNUA 2QR8A 4QP4A 4BGHA 2WQEA 1YDSE 1B38A 1OVEA 2R3PA 3COIA 4FVQA 1XKKA 4PP9A 3SVVA 4UWCA 3ZUUA 5BYZA 4FEQA 4YC8A 1SVHA 3UPXA 2YABA 2VTAA 2A4LA 5EDRA 5HE0A 3NW6A 4DBNA 5HBEA 3CCNA 3FY2A 2R0IA 5AV1A 2WEVA 1GZ8A 3ZM9A 4LL5A 3LCTA 2XH5A 1ZWSA 3L9LA 3NUAA 3MWUA 1WBPA 4RLKA 1YRPA 3PVGA 3MJ1A 5FBNC 4W4VA 4XYFA 3QYZA 3REPA 4PMMA 4X7QA 1UVRA 5IA3A 2ZMCA 4C3PA 4BCFA 3IECA 3ULZA 3MVLA 4WRGA 3WZKA 4BDGA 3DLSA 3ANRA 4FV8A 1GIIA 4XG3A 2IVTA 2OJFE 2YM6A 5IG1A 3KXMA 2HCKA 2IW6A 5HCXA 2O3PA 3AQVA 4IVAA 3WOWA 3HRCA 4ERKA 3BKBA 4H3BA 2VGPA 5TO8A 3EZVA 5TF9A 3RI1A 3TXOA 3QX4A 3VJOA 3PDTA 4L52A 4ANSA 2P2HA 3QYWA 2ZV2A 3D9VA 5CAPA 2OBJA 4BI0A 1P5EA 2EXEA 3DZQA 4CZUA 5AP0A 2HZIA 4NCTA 5IUIA 2I1MA 4C2WA 4F0GA 3TCPA 1M7QA 2DWBA 4ZMFA 4CV8A 1CM8A 3E87A 2RGPA 2YZLA 2J51A 2Z02A 1O6YA 2X0GA 4QTDA 3C0HA 2WPAA 3ZXZA 2OH4A 4YTHA 3LFDA 4CKIA 3SX9A 4IC7A 3ZO3A 3PPKA 4DLIA 4FZDB 4DE4A 1PKDA 3RWQA 3E8EA 3E92A 4FKPA 2RFEA 4RIXB 4UZHA 3UNJA 5I3OA 3GQLA 2XIXA 3O51A 4I5HA 5FUTA 2CGWA 2PVJA 5CEMA 2YCSA 1JLUE 4MBLA 3QZGA 4G31A 2PULA 4RX9A 2ETKA 3SDJA 2XRWA 3UZPA 1JKSA 4I6FA 3TJCA 5C1QB 3IO7A 2EUFB 3BWFA 3MYGA 4IFGA 3UIMA 5DT3A 1E9HA 5LOHA 5KKRC 4D2WA 3RJCA 4MQ1A 2RFNA 3GCSA 3GQIA 4LI5A 3Q5IA 4OLIA 5DIAA 1OBDA 3CIKA 3QCSA 5E8WA 3VIDA 2C0TA 3HECA 3W2CA 2BR1A 4BN1A 5DYJA 3E93A 4TTHB 5DBXA 3HNGA 5EM7A 5HI2A 2X9EA 4FSNA 4EYJA 2BKZA 2W5HA 4XMOA 3SLSA 3BHUA 3RP9A 1U5QA 5J7BA 3I79A 5T3QA 5HQ0A 2QU6A 2HYYA 1PMVA 4NIFA 2W1IA 5AP2A 2REIA 4IB3A 5M53A 4EUTA 4CVAA 2PZPA 4GK2A 1QPJA 4MK0A 3ZOSA 2QLUA 4BYJA 5E1EA 2IVVA 2CCIA 4LV5A 4CFFA 1SZMA 5EM5A 5EK7A 3B8QA 3LMHA 2RG5A 3U4WA 5A4EA 1VJYA 2F4JA 4FIHA 4F0FA 5LQFA 3FI8A 4QO9A 3DXPA 2BUJA 5HVKA 4E3CA 1G5SA 2GTMA 2OIBA 4DT9A 2CN8A 3OOGA 3LW0A 3R7IA 1DS5A 2YDJA 4IWOA 1IG1A 4EH3A 3VBXA 3T9IA 5KHXA 2XCKA 3UC4A 3QXOA 3EQCA 3C5UA 3TZMA 4OTGA 4IAKA 4L68A 4FV1A 3EFLA 2J0KA 1UWJA 2WMBA 2G1TA 2YN8A 4F1TA 4ACHA 4IFCA 3QQFA 5FEDA 3TZ8A 1UNHA 2XK9A 4NFMA 4FIIA 4TY1A 4A9RA 2UW8A 1IA9A 4TYHB 1RQQA 3EQFA 2BAKA 2CKEA 3KB7A 4JG6A 4MD7E 4S33A 3ZBFA 3BU3A 3OBGA 2UW4A 5AJQA 5DR2A 3CGOA 3VC4A 3CY2A 3K5UA 4D2SA 3GC8A 4GMYA 4CSVA 2JGZA 3NYNA 3NYXA 1W8CA 4V0GA 3UNZA 4QQCA 4XJ0A 3QGYA 1XH8A 2ITVA 2J0IA 2C3IB 3QTQA 4MHAA 3UOHA 3ZHPC 3EN9A 1URCA 4N70A 2IZUA 3PSCA 2YM8A 5AAGA 3GU4A 3EQRA 1JOWB 4L46A 3HDNA 4DH7A 2EB2A 4C4HA 3L8SA 2WFYA 1PMEA 4IM0A 4O7TA 3IQ7A 2WMAA 1TQPA 4NKSA 4AG8A 5H8EA 4D4SA 2W1CA 3MY1A 5FG8A 5EW8A 4O1PA 1SVEA 1U59A 2C0IA 3QCYA 2GS2A 3Q4TA 2VU3A 4PX6A 3LXLA 5JGAA 4UX9A 3LFSA 3F66A 1SYKA 3DTCA 2YHVA 1OPLA 3DK6A 5BUJA 1V1KA 3OWPA 4HPTE 3BIZA 4KRCA 5FXRA 1XH5A 3UGCA 3FDNA 3PYYA 5KMJA 1K3AA 4M69B 4L3PA 2FSTX 2R2PA 3EMGA 5TT7A 4DH3A 5IA2A 3CP9A 3EN6A 4GJ3A 3ZONA 2XNEA 3BGZA 4YNEA 4WNOA 3OF0A 3FMMA 4GFOA 3V8SA 5AV4A 2WELA 3A4PA 1H8FA 4DH5A 3MS9A 3L9PA 4A7CA 4FKSA 3IOKA 4O7YA 5EDPA 4FTJA 4QP8A 4PDSA 3FV8A 4FTIA 4ZSLA 1ZOHA 4FKIA 3KU2A 3SXSA 3C4WA 4BI2A 3FWQA 5HLWA 5EYMA 4S2ZA 3D0EA 3NNXA 3FXZA 4M0YA 1IA8A 4IW0A 4DEIA 3M11A 4YLLA 4CRSA 4EHVA 5AIKA 5ETAA 3LZBA 2OF4A 4JI9A 3ODZX 5AAEA 4UN0C 3LXPA 1PXOA 4PWNA 4CT2A 4EH9A 2UVZA 5L2WA 5EI6A 3QTSA 2C1BA 4FX3A 4X2FA 3VUMA 4ASDA 3CJGA 4HGEA 2AC3A 3FMEA 2H96A 3U55A 1PXLA 4QYGA 2P55A 2GNJA 4P7EA 3MIYA 4ZTRA 1ZARA 3WF8A 5FXSA 2CJMA 2FUMA 3W16A 4U3ZA 4FIFA 4NU1A 4ZTMA 4CG9A 4IAAA 4FL1A 3EQDA 2QOBA 4OGRA 4DTBA 2E9NA 2FYSA 5CI7A 4AGCA 3F7WA 4G6LA 4I22A 2GS6A 5JFSA 3VW6A 5IU2A 4AT4A 1M14A 4IB5A 4BGQA 1JKKA 3SW4A 2OIQA 4HGTA 4ZJVA 1R78A 5DFPA 2CGUA 4YBKA 4YGAA 5DMZA 2GNFA 2ITYA 3LCOA 4XG8A 3R30A 3ZRKA 3UOJA 4DEBA 5HIEA 4AS0A 3BYVA 4FA2A 1STCE 1W83A 3F61A 1B6CB 3FXWA 3PUPA 4W8DA 4XV9A 4Y5QA 2ZJWA 3CJFA 3R2BA 4RPVA 4LRKA 3MH1A 3BYOA 4JLCA 3DB8A 5GIPE 4XP2A 2G15A 3E5AA 2Q0BA 3W8QA 2HW7A 4YJPA 5EYDA 2IPXA 3V3VA 3PWDA 2SRCA 3BYSA 3QKLA 2W1GA 2CNVA 3GCUA 5HBHA 1G3NA 3VO3A 3GUBA 4DCAA 2XM9A 2R3RA 5EHYA 2J2IB 2VWVA 4R1YA 4YU2A 5CF8A 2XF0A 5I3RA 3RPYA 3QRIA 5HG9A 2Y6OA 5C8MA 3NNVA 1KV1A 3HMPA 2JIIA 4FGBA 2KULA 3PXYA 4YO6A 5JK3A 4IAIA 1T46A 1KE5A 2QOCA 5K5XA 2HXQA 4O0XA 1WBSA 4YNOA 1KOBA 1YQJA 3LQ8A 3PG1A 4YJQA 5KUPA 5AP7A 2G9XA 5L8LA 2PUNA 3E63A 4R77A 5EHLA 2JC6A 3MA6A 3TKUA 3S00A 3UIXA 3EFJA 2ONLC 4QP2A 4AUAA 3AMBA 5H3QA 4EQUA 3GFEA 3DK3A 3V04A 2UZTA 2C6EA 4DG0E 5HX8A 3N4TA 4TKSA 2E9PA 4BCPA 4FZ7A 3QTZA 4DGOA 2B0QA 2YCQA 4ZY4A 5CT0A 2QLQA 4PPBA 3FSKA 4CYJA 3DTWA 3E8NA 1J1CA 4JAIA 4TYJA 3LM0A 3JY9A 3KF7A 3VS4A 4EBWA 2C6OA 3R8VA 4EH7A 3DBQA 1WBTA 3UYSA 2XIKA 3FLWA 2BKKA 4ZS4A 3FEGA 3Q52A 4BZOA 3U6JA 4G9CA 3G0FA 4TL0A 2DYLA 2R3QA 3GGFA 2WMRA 3KRJA 1BYGA 4FIGA 4ITJA 2NRUA 5HG5A 3SGCA 3DY7A 2UZUE 3FLSA 4WOVA 2YERA 4O21A 4BCMA 2WNTA 2YCRA 5C8KA 2C5NA 2PVKA 2HOGA 3NZ0A 3PVWA 2UZNA 2XKEA 3F7ZA 4I4EA 5D7AA 3I6WA 4FV5A 3RHXA 3VS7A 4BTJA 4CMUA 5IQEA 5IKWA 4XG6A 3U6HA 4GEOA 3AC4A 4U8ZA 4LGDA 1L8TA 4WUAA 4I5PA 5IUGA 4YTIA 1ZMWA 1GZOA 2QHNA 4GG7A 4A9YA 4CMTA 4B6LA 2Q0NA 1CKIA 4IIRA 3AD6A 3TWJA 5A4QA 2BIKB 1YOJA 4CLJA 3ZO1A 1OUYA 5HO7A 3A61A 4FTOA 2VTLA 4IADA 2PZ5A 3D7TA 3JPVA 3POZA 4NIFB 4CKRA 5BVWA 5IPJA 4FTAA 1KWPA 5K4IA 4AZSA 4BKZA 5LVMA 2ZB0A 4DC2A 5J7HA 5CU3A 3DKOA 4IAZA 1UNGA 3OVVA 3HDMA 5HE3A 3SV0A 5CF5A 4G6OA 4L7FA 4NZWB 4APCA 4FV4A 4EEVA 3HX4A 2PUPA 5T6KA 2IZTA 4EC8A 4JRVA 1Q62A 3BEAA 3BLQA 4B8LA 4CV9A 3AGLA 3VS3A 4BVUA 3R02A 3QQGA 4GVJA 2VO6A 3EL8A 3PTGA 3A60A 4EH4A 3DFCB 1OIQA 5ETFA 4FSWA 1YXTA 3A7IA 5AR8A 5AUVA 4BKJA 4QYYA 5C01A 3DB6A 3I0QA 4JBVA 4YUQA 3P78A 2J90A 2JEDA 2JITA 4Y83A 4M67A 5DT4A 3BEGA 3DBFA 3FI4A 2F7XE 4KA3A 2PUIA 3GOPA 4KKEA 2OG8A 4BDCA 2PWLA 2I0EA 5EKOA 1FOTA 3RCDA 5T68A 3R7OA 1H08A 3UQCA 2VTSA 3ZLYA 4A06A 3RPVA 2WMWA 3PZHA 2YIQA 4I0SA 4K77A 4TWPA 1ZY4A 2QONA 5D1JA 5GNKA 4DT8A 5LVOA 4KBAA 5DEYA 2YCFA 3TNWA 3CQUA 2PUUA 2C69A 3ROCA 4EOOA 4O82A 2ZM3A 4YC3A 4FKTA 2B1PA 4K33A 4ZK5A 1PKGA 5CSWA 4V0GB 5E8YA 1Y6BA 5E8UA 3RBWA 1I09A 3QZIA 4TYGA 3VUGA 4F0IA 1H25A 3G33A 3GC0A 3QD4A 4QT1A 4BCIA 2BDFA 3HRFA 5CSVA 2EU9A 2F7EE 5IA0A 3F69A 2ZM1A 4O96A 3EKNA 4D5HA 1PY5A 2ZV7A 4PUZA 2B9HA 2UVYA 3BYUA 5DH3A 2QOHA 5JH6A 4HCTA 5KO1A 3WF6A 2F2CB 2V5QA 4KSQA 4BWPA 3VHKA 3QX2A 4RWLA 3Q96A 1PF8A 4FSQA 3OXIA 4GG5A 1JVPP 4BCQA 4F64A 2ESMA 4MAOA 3R8ZA 4C35A 3EIDA 5BMMA 4F63A 4GUBA 4C61A 3L8PA 2PVRA 5LVPA 1BX6A 1U54A 4ZIMA 4L42A 3ENHA 1ZYLA 1VZOA 4PDOA 4MF0A 3E8DA 2YIRA 3DT1A 4QTBA 1H27A 4X2JA 4YJNA 5DA3A 2ITQA 5IQHA 5DRDA 4QP1A 4MEDA 1WVYA 3BGQA 4NM0A 5BVOA 4IACA 2C6MA 1VEBA 5LWNA 3G0EA 4YZ9A 2GHMA 3BE9A 3G2FA 3T3UA 5E90A 3GCPA 4GFMA 4IB1A 1IASA 1WBNA 1YOLA 3O23A 3TV6A 3KMWA 1KUTA 5AR2A 4AA5A 2JFLA 3ELJA 4CD0A 1BL7A 2ITWA 4USFA 1M2RA 3HYHA 4MBIA 3MN3A 3EYHA 4NEUA 4O6EA 3RPSA 4WG4A 2Y8OA 3ZSHA 5TKDA 1VR2A 5ACBC 5K4JA 4LGGA 3OTVA 4I5MA 5CU0A 3COMA 4UBAA 3CBLA 4KIOA 4KKGA 4BHNA 5DT0A 3SC1A 4FTQA 2VTOA 4CG8A 4DFXE 2YIYA 3PG3A 4FEVA 3ZBXA 4FODA 1WMKA 2X1NA 4EUUA 4BGGA 5EHOA 4DAWA 4F7SA 3C9WA 4DCEA 3WIGA 3EQHA 3R1SA 5KMKA 4YLJA 4WT6A 3T9TA 4EWQA 2R3HA 4IDVA 1XBAA 4TZRA 3QRTA 3QWJA 4KBCA 2PK9A 4O86A 3RAWA 3DKCA 4D5KA 4RJ6A 4C62A 1OIYA 4IZAA 2X9FA 3D83A 4Y73A 3R7UA 5I9VA 4H39A 4BTFA 3PP0A 4MXZA 3BPRA 4F9BA 4PQNA 2W4JA 4CCBA 4GS6A 2XNNA 2QURA 3PIYA 4JS8A 5AX3A 3IW7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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