4TN6A

Ck1d in complex with inhibitor
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
292
structure length
292
Chain Sequence
ELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNML
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Casein kinase I isoform delta
publication title CK1D IN COMPLEX WITH inhibitor
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 98
structure length 292
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4tn6A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4tn6A01
1E1VA 5AV1A 4A9UA 2Y9QA 3LCDA 3ULZA 2EU9A 3R8ZA 1FVVA 2WMSA 2W1DA 2G2IA 3Q53A 3FV8A 3DA6A 4XX9A 2YN8A 4FKGA 4MF1A 4GFOA 1XO2B 4F7NA 5T3QA 2YLEA 3PVWA 3OXTA 3UO6A 3RK5A 4OTDA 2UVYA 5G6VA 3SKCA 4B9DA 5GINE 2UW7A 4QQCA 4DH8A 1UU7A 5J5SA 2C1AA 4CMUA 3HMIA 4EOPA 4IBMA 4U44A 4PQNA 1DS5A 2OJFE 3FMNA 2P55A 4M69B 2VTHA 3T3VA 5JRSA 2OICA 4QQ5A 4RIYB 2JITA 3KQ7A 4AW1A 4BCFA 2CJMA 4Q9SA 4RIWB 4UXQA 3EMGA 2ITWA 3HMMA 4MD8E 1IR3A 2QOQA 2YAKA 4J8NA 3IOKA 3LCTA 4TWPA 3RPVA 2XRUA 4X2KA 2BHEA 5AIRA 4PX6A 4F1OA 3T8OA 3UP7A 5LXMA 5IQHA 4FKSA 1RDQE 2QO9A 3HVCA 4YZMA 2CNUA 5M51A 2WMXA 3QTRA 3IW6A 4IVDA 4O96A 3R7GA 1OL2A 5DE2A 3D7TB 3H10A 3MFUA 3F9NA 2A27A 1UWJA 3BX5A 5CXHA 4ACCA 2B9FA 3F69A 2EXMA 5LMBA 4CKIA 4RQKA 3PIYA 5M56A 4J99A 3FEGA 3KF7A 1JSUA 3DQXA 4FV3A 4IX5A 3WE8A 4JQ7A 4QP2A 4QYYA 2YACA 3NW7A 4Y85A 4P90A 3RGFA 5DBXA 4C8BA 4E5AX 2BZIB 5LVPA 5FDXA 1Q97A 3TTIA 2W5HA 1U54B 5EH0A 3D94A 4B8LA 3FSFA 2YZLA 1U46A 1R78A 3RAIA 3WE4A 4FX3A 4W8EA 2VX3A 4JIAA 3TI1A 1O9UA 4EC8A 3F3WA 1B39A 4BI2A 5E8XA 3CP9A 4DGOA 5AR5A 1W98A 4G1WA 1Z57A 1H4LA 4TY1A 3G9NA 5KNJA 3MPTA 3RINA 4IX4A 4BDGA 2UUEA 2XK3A 3D9VA 1T45A 2VO6A 3RKBA 4BWPA 3A4PA 3GXLA 4AW5A 4YO4A 3AT2A 3A8WA 2OW3A 3O7LD 3OROA 4L52A 5CALA 4MQ1A 1V1KA 5JMSA 4IC7A 3QU0A 3ELJA 4D1ZA 2ZM3A 3DXPA 4PNIA 4FKIA 2QOHA 3B8RA 5ACBC 3NX8A 3UIMA 4V04A 4F0GA 1WMKA 2GHLA 3SXRA 3EYGA 5BPYA 3TKUA 3ID6C 5C8MA 2HOGA 2WELA 3DLSA 4L3JA 3R9OA 4PP7A 3C4FA 3WF7A 4PNKA 2CGUA 5KUPA 4DFNA 5EW8A 3FZTA 4TWNA 3WZJA 5EYDA 5DGZA 4BZNA 4KKGA 3GC8A 3SV0A 4BHNA 4EKLA 2W1HA 3ROYA 3VBVA 4DH3A 3SA0A 1KE5A 1JSTA 1URCA 4IACA 2OKRA 3ZH8A 4M0YA 3BELA 5LVNA 4DAWA 4AXAA 3UVRA 3PZEA 4FEUA 4ONAA 4G3CA 4O1PA 4EH2A 4DBNA 5J9ZA 1STCE 2OJIA 3MESA 5GJFA 4Z7GA 2C6TA 3L8VA 4LM5A 4FSRA 2EXCX 3RHXA 3OCSA 4EL9A 4OTRA 4YUQA 5M4FA 3FC1X 4FKVA 4FTLA 3D4QA 3DV3A 3WI6A 1GZNA 4PP9A 3ZDUA 3O96A 4UV0A 2FUMA 3THBA 3SGCA 2DQ7X 3QF9A 4IB0A 4D2RA 1LP4A 3DDPA 3DK3A 3P9JA 3CPCA 4CKJA 2X7GA 4WG5A 3A7JA 4LI5A 2F2UA 3FKNA 3L9NA 2OIQA 2XBJA 3OWPA 1YDTE 2XKCA 4ANOA 5DWRA 2YJSA 2VX0A 3V5TA 2UZBA 1UU8A 3EQRA 2R3IA 5A6NA 2R3RA 5C8KA 2DWBA 3NAYA 4TL0A 4S30A 1UKHA 4I1ZA 4L44A 4L7SA 4FTTA 4LUDA 5DIAA 1APME 4FV1A 3F7WA 1JBPE 4YLKA 3IGGA 3EB0A 4RVTA 2I0YA 5EW9A 5HBJA 1XWSA 4CLIA 3R7OA 2VU3A 4U9AA 3C5IA 3FMHA 5JZJA 3R1YA 4GK4A 3NYOA 4A4XA 2J9MA 4D4SA 4KUJA 3EN6A 5TE0A 2IJMA 1GIHA 1TQIA 1HCLA 2Y6MA 1Q8UA 5AM6A 2OJ9A 4EJ7A 2YM5A 4YU2A 4HYSA 4YURA 3MFTA 3EJ1A 1YDSE 2GQRA 4ZMEA 3QKKA 1YXXA 1KOBA 1JPAA 1CTPE 4X2FA 4X6RA 3UG2A 4F09A 4PMPA 4CG9A 2ZV7A 3BEAA 1QMZA 1ATPE 5HI2A 1JKLA 5HTIA 4HGEA 4GSBA 4EYJA 5CU6A 1Q5KA 4NJDA 3NNVA 5DLSA 5KX8A 3KXHA 3ORMA 3Q9WA 3CCNA 2CNVA 2JFLA 3OP5A 4XMOA 4BIBA 4ZSLA 4E93A 1PXOA 4R7BA 5L8JA 3QQGA 4IJPA 3VVHA 3D0EA 4MBLA 2QOCA 3IONA 3VULA 2B53A 3BYSA 4IJ9A 5DFPA 1O6LA 4EQCA 3CSVA 4X0MA 1OVEA 3O17A 3BRBA 4EZ5A 3BE9A 1H1RA 4E6QA 2WMWA 5EFQA 4A9RA 4I24A 3I60A 2HIWA 4DFXE 4BWKA 3PJ2A 4NM3A 5J95A 1ZZ2A 3DJ5A 4JRNA 3AOXA 2UZUE 3NUAA 1OGUA 4CYIA 4K77A 4ERKA 4PDYA 1ZYDA 3PVGA 4FYNA 3V8TA 4KWPA 4YR8A 2VNYA 3HP2A 4AA4A 1JKKA 3LKMA 3DKFA 3GCQA 4PMMA 4I4EA 4MD9E 5C27A 5A9UA 3QQLA 3C0IA 3FI3A 2F57A 3UZPA 2V55A 2R5TA 5E8TA 5D9HA 5CEPA 4NL0A 3MS9A 3KGAA 3GNIB 1LEWA 3EZRA 2HWOA 2UZWE 3R28A 3SG9A 5D11A 1P2AA 2YISA 5AR2A 2UVZA 1FQ1B 5CEKA 2VWXA 3R63A 4YPDA 4IANA 2O64A 3AC8A 3D14A 2RL5A 3RAHA 5FBNC 4JG7A 2PMNX 3FXZA 2OU7A 4IZ5A 2ZOQA 5EI8A 1Q8ZA 1BI8A 3BWFA 4BDJA 3DNDA 5HVYA 4EI4A 1J7LA 3MH0A 2UZOA 5HLPA 4DT9A 3F5XA 4FUXA 3Q6WA 3AC5A 3D2IA 3OVVA 3SC1A 1H26A 3RP9A 2PVKA 4EH8A 4F6SA 5GHVA 3M2WA 5I9UA 3BEGA 3SW7A 3KN5A 3NMUF 1YVJA 3D2KA 2X2MA 4I5HA 4ZSEA 3S95A 4KBCA 2OWBA 4FF8A 4H36A 4V01A 5KBRA 3PP1A 4IB3A 3PXYA 3VAPA 3AT3A 2YWPA 3D5UA 5ANIA 4GRBA 4IWPA 3R1NA 4JX7A 4RWJA 2NNWB 4D9UA 3ZO4A 4C62A 4XJ0A 1YXTA 2XNNA 1FGIA 2B7AA 3UMXA 5KKRB 4C4GA 2CDZA 2R4BA 2RG5A 2QD9A 3A60A 3PXKA 3TZMA 4C4IA 4MXOA 2DUVA 2C6EA 3A61A 2QLUA 3BV2A 3MY1A 4FK3A 4K0YA 3IS5A 3LFAA 3OBJA 4NW5A 3COKA 5F1ZA 4PY1A 5F95A 1YXVA 3EQFA 4P4CA 4NWMA 4EK6A 4I6FA 2F4JA 3TIZA 3DAEA 4I23A 2V7OA 3Q60A 2C4GA 3KXXA 2WGJA 3RHKA 3VW8A 4U3YA 4Z3VA 4ZJIA 1XH6A 4GYIA 1NVSA 2WMUA 3DKGA 3H9RA 1YKRA 2BCJA 4GKHA 4CTCA 3ZO2A 4KIKB 1OI9A 1KV1A 4R3RA 4W8DA 3MH2A 5DT4A 3CS9A 5JGDA 3U8WA 5J7HA 3KFAA 1JOWB 1XH9A 4M14A 3UPXA 4G9CA 3QQFA 2PYWA 3CEKA 2GNLA 4PPBA 2C6IA 2W06A 3DBFA 5ETFA 3R1SA 5ETCA 3GU5A 3UGCA 4AGCA 4EH5A 5I9YA 1ZY4A 4J7BA 1OECA 4EOLA 3ATTA 3VUTA 1ZMVA 2ONLC 5CX9A 3PJ8A 5FQDC 2R0IA 4GK2A 5CI7A 4BI0A 4HPUE 2KTYA 2OBJA 1GIJA 3P7AA 3AC3A 3H9OA 5E90A 4FIHA 3DS6A 4AAAA 4E20A 4BGGA 4C2WA 3QD3A 4A4OA 2YITA 1YRPA 4C4EA 4XV3A 3MYGA 2QCSA 2UW6A 2GNGA 5E8VA 4FV6A 4XNEA 2C69A 3BYMA 4FC0A 2A1AB 5AR7A 5FGKA 4JQEA 3MVMA 4LRMA 2W5AA 4DFBA 3ZOSA 2BVAA 4YZCA 2BAJA 3F3ZA 4DEAA 1M17A 1R0PA 2JKQA 4JIKA 3AD5A 4MXCA 3C4XA 2JKMA 4HVHA 2R3KA 3FLSA 5CF6A 5GIPE 3MTFA 2QVSE 4AG8A 2RFDA 3Q9XA 2PWLA 3G0EA 2GFCA 4K33A 5IMEA 2IWIA 4RLLA 4DFYA 2JDRA 4AE6A 4FNZA 2X4FA 4WSYA 3OTVA 4BZOA 4F9BA 1W7HA 4ID7A 1WAKA 1ZYCA 3D15A 5IG1A 5HICA 2GQGA 4ALVA 2IVUA 2PVYA 4WNMA 2XK7A 3DBEA 1K2PA 3F82A 3QZHA 4K9YA 4LFIA 2I6LA 3Q4UA 4QTEA 4GVJA 4LL5A 3RPRA 5J87A 2XUUA 3KK9A 4O0SA 3GBZA 3TXOA 4CFNA 3FKLA 3PY1A 2QHMA 2PSQA 2BTSA 4LV8A 4BVUA 3FE3A 4QOXA 1IRKA 2OH0E 4PDSA 2OK1A 5EM8A 4J97A 3RMFA 3VUGA 3RM6A 4OTPA 3VS5A 3W8LA 4DYMA 2HELA 4B8MA 3MBLA 3BYOA 4F6UA 5A4EA 1E1XA 2KULA 1TKIA 3QTZA 4TNBA 4DE4A 5L6WL 3FI8A 5T6KA 3L8SA 3BLRA 3RJCA 4DG2E 4FVPA 4IIRA 4AT4A 4HW7A 5BUJA 1Q62A 2C68A 1S9IA 4FOCA 4R5SA 3CD8A 3PRFA 3QCQA 2PUNA 2Z7SA 2ACXA 4FE2A 2PMOX 3DFAA 4PPAA 4F9AA 1ZOGA 4FSTA 2OXYA 4YGAA 4B4LA 5DRBA 3GCSA 4AN3A 3SOAA 2XIXA 2GFSA 3Q3BA 5IA1A 2XJ2A 3A7GA 3QTSA 3RK7A 4LRKA 3O0GA 5JK3A 3OUNB 4F7LA 3BYUA 3V6RA 1M2RA 4K1BA 2O3PA 3Q2JA 4EEVA 3TL8A 2XJ1A 3NIEA 4JXFA 4AE9A 5HHWA 4BZDA 4CQEA 2W1CA 2JBPA 5G1XA 5M07A 4O82A 3EZVA 2OSCA 3KEXA 4MWHA 2IW9A 3B2WA 2VWYA 1BL7A 2YIYA 5DI1A 4PL4A 4A06A 3R9DA 4TYHA 4XLIA 3VS2A 2IG7A 3LM5A 2GCDA 3ZCLA 3BHVA 4YC8A 3QTXA 2RKUA 1VR2A 3PWDA 3RK9A 4O7TA 3F5GA 4USFA 5AUZA 5I3RA 3DFCB 3CJFA 4ZOGA 3VS6A 2W7XA 3DXNA 3FLNC 4EKKA 3NDMA 1GZOA 5L8LA 2XP2A 5FG8A 1IAHA 3LFDA 2I0HA 4TWOA 1CKIA 3DB6A 1O6KA 4GIHA 4KNBA 4U5JA 2E9NA 3HDMA 5JH6A 3DCVA 4U6RA 4ALWA 3FHRA 5E1SA 3UJGA 3NUUA 4ENXA 3P7BA 2VTJA 5AV0A 2EVAA 5DEYA 1SYKA 4BTFA 5EKOA 2GNHA 4DEDA 2OZOA 3ATSA 2PY3A 3IOPA 4YJNA 3BHUA 4C3PA 2HY0A 1PYXA 3OCBA 2XF0A 2HK5A 3I0OA 3LM0A 3MIYA 5BVOA 4AGDA 4GCJA 4AT5A 4JDIA 5CANA 4XUFA 2ZJWA 4XG7A 4BRXA 4RJ7A 5HIDA 5E7RA 4BWXA 3PXZA 2GSFA 3ORNA 4JDHA 4YZBA 4D2TA 3PSDA 5AAGA 3P78A 3U6JA 3WZKA 4BR3A 4TYIA 2XYNA 5CEIA 3UBDA 2XJ0A 1B38A 1OM1A 2PVFA 1BX6A 1J3HA 4GKIA 3UNZA 3CY2A 4CKRA 3TZ9A 3GCUA 3VUKA 4BFMA 4E6AA 3FLQA 2YM3A 5IDNA 3PPJA 4G9RA 2X8EA 4XG3A 1JQHA 4YSMA 4FODA 4ZTLA 4XV1A 3C51A 2W0JA 2QURA 4L7FA 1UNLA 3FUPA 4ZXTA 3SRVA 2O5KA 2H34A 3C4EA 5BVNA 3UO5A 2PZYA 4O7LA 3WIGA 3WF8A 2Y7JA 4IAAA 1I09A 3PLSA 2JDOA 3K2LA 2XCKA 5L2SA 3DOGA 4I92A 4RX5A 5TO8A 4E6DA 4NYEA 2UW9A 3DKCA 3LLAA 4CZTA 2VTLA 4ANBA 4HGTA 4D2VA 4C57A 4E73A 2VWWA 4MCVA 2WTKC 4EOSA 3OZ6A 3RTPA 4GJ2A 2J5FA 2ONLA 4YJVA 3POZA 4ZTMA 3LIJA 3UQFA 4BN1A 4L3PA 5AWMA 1VYZA 5GZAA 4FTNA 3R8UA 4EHGA 2YJRA 4FKPA 2E9OA 5KMOA 4ORKA 2WMVA 5ICPA 4ZS4A 2C5NA 3PUPA 1LPUA 1Q41A 4FIFA 4IWQA 4MAOA 1HOWA 4IAKA 4UB7A 4WNPA 2FGIA 3S4QA 1J1CA 2W05A 3E64A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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