5IH5A

Human casein kinase 1 isoform delta (kinase domain) in complex with epiblastin a
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
293
structure length
286
Chain Sequence
ELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLQKYERISEKKMSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Casein kinase I isoform delta
publication title Epiblastin A Induces Reprogramming of Epiblast Stem Cells Into Embryonic Stem Cells by Inhibition of Casein Kinase 1.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 286
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ih5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5ih5A01
4FT3A 4XV3A 3CR0A 4QTCA 3LFFA 4F65A 3SAYA 5AUVA 3QA0A 5CEMA 2NNWB 4D0WA 3CPCA 1Q41A 4W9WA 1BX6A 3FMNA 5E92A 4BN1A 2G2FA 4JVGA 2BRMA 5HCZA 3H10A 4ZTHA 3LE6A 4RX5A 4ACMA 5CQUA 4DBNA 2OZAA 4LFIA 3GCVA 5FEQA 3QCQA 4FSUA 5CNNA 3BE2A 3PVGA 4L7SA 2WTJA 4BTKA 2XB7A 4FL1A 3V5PA 4EYJA 2EXCX 5A46A 3DJ6A 1FOTA 5HBJA 4LRMA 4DLJA 5IH5A 1YRPA 2UW0A 4W9XA 4O6LA 3QHWA 4RIYB 3VJNA 1YVJA 1QPCA 3Q2MA 3ZDIA 1WBOA 5KMKA 1Q8YA 3QC4A 4WBOA 2F57A 3ZLYA 3VNTA 3I6UA 4FEUA 3EKNA 3Q4UA 3I4BA 3DLZA 3EN7A 3LOKA 4BCPA 4BICA 4CD0A 2OJJA 1SYKA 4QYYA 4BI1A 4DTBA 2UW9A 4FKRA 3TKHA 2R3RA 3R02A 5CT0A 2Z02A 5JQ5A 4EK8A 3AC2A 3PE1A 3R7IA 3GOKA 4X6RA 5EKOA 2R3PA 3QF9A 3EWHA 4E6AA 3IG7A 3NYOA 4GUBA 1FBNA 3A60A 3PUPA 2XS0A 2GS6A 5IZFA 4EZ3A 3GC9A 4RX7A 3MH0A 4AT4A 3DZOA 2O2UA 1Q4LA 2OFVA 4FIHA 3QUPA 4TYIA 3W2CA 1GAGA 3PVUA 4WO5A 4ZZNA 3PLAE 4YLLA 3I5NA 4U97A 3EZVA 4AA0A 3FMEA 4LV8A 4CFMA 2LGCA 3RGFA 3NUSA 2WQOA 5C8MA 4X2JA 4RC2A 3DBEA 3QKMA 3IQ7A 3SOCA 4EH7A 1GZKA 3CSVA 5HE2A 3S1HA 2WHBA 3RNIA 5FTOA 4V05A 3PJ2A 3ID6C 2C6KA 5J9YA 4NW5A 4BHZA 4EH3A 3VRZA 4ZLOA 1V0PA 2ZB0A 4B4LA 5BMSA 1UV5A 1WVYA 3FMHA 1GZNA 2X8EA 3PWDA 2OF4A 4CYIA 3SVVA 2CDZA 5AIRA 1XO2B 4CKJA 1WZYA 4GL9A 3QL8A 3K5VA 5K0XA 3AXWA 5JQ8A 3PJ8A 3MPTA 2XJ0A 2PZYA 4E73A 4EKKA 4CG9A 4Y95A 4LQMA 5IISA 1A06A 2OWBA 5HNIX 2KTYA 4IFGA 1BLXA 5ICPA 1WBSA 2OIDA 2WZJA 3HV6A 3R1QA 3MH1A 4PY1A 1UU8A 3F7ZA 3W1FA 5M4UA 1Y8GA 4FNZA 4ERKA 2YCSA 5IDNA 1WBWA 3PYYA 3MY1A 5FXRA 2WMRA 5CQWA 2PVYA 4DFYA 1SM2A 2ZVAA 3FKNA 3H4JA 5HE0A 3ZU7A 3KRWA 4PUZA 2HYYA 2OK1A 5A4EA 5M08A 2BRNA 5L2TA 2YIRA 4RFZA 1IG1A 5LMKC 2YZAA 4JLCA 1H1QA 5CWZA 4O0UA 5DMZA 4HGLA 2QO9A 3MGYA 4L46A 3WZEA 4E3CA 3NW5A 2FSLX 5FBOA 5AUYA 4AQCA 4BKZA 5A4TA 4KSPA 3FHIA 3QXPA 5IUIA 3L9LA 2WU6A 3I1AA 3BIZA 2XJ2A 5IF1A 4CRSA 4U8ZA 2JC6A 3GQLA 3F2AA 4L7FA 2YA9A 5AEPA 3AT3A 4O83A 4IBMA 3FI3A 4AUAA 4RGJA 3RMFA 2ITVA 2CKPA 3M1SA 4AN3A 2ZM1A 3UIXA 2QODA 3WI6A 3FPMA 1R1WA 1V1KA 1YI6A 3QQHA 3GP0A 4XRJA 3ZO3A 4ZMEA 4IM3A 2J6MA 4CFUA 3NLBA 3OVVA 3PXZA 5HU9A 4P5QA 4ITIA 3PP0A 3HUBA 3QHRA 5HU3A 2BDJA 4FTRA 3NSZA 4QMXA 1URWA 3F69A 3RAIA 1PKGA 3EKKA 2YZLA 3R71A 4GS6A 1UA2A 4FG7A 1WFCA 5KMOA 4R7IA 2X81A 1JLUE 4KBCA 2XYUA 3QKKA 1P4OA 2JDOA 3O51A 4ZJJA 4U40A 5CTPA 3RWPA 4DH3A 2O3PA 4XV2A 3PZHA 4FTIA 1YDTE 4EL9A 1YDSE 2REIA 5H8GA 2QKWB 4Y72A 4H1JA 4ERWA 4YU2A 1OZ1A 3EN9A 3JPVA 4DGOA 4DGNA 3QTWA 5F1ZA 3VUIA 3BI6A 4NW6A 3DBCA 3U8WA 2PYWA 5KX8A 2CKQA 2YABA 2VWYA 4O86A 3DZQA 4HPTE 3FHRA 4AU8A 2PVFA 2W17A 2VGOA 3IOKA 3VHKA 3E88A 3WZKA 2C5YA 5L6OA 1UNLA 4FNYA 5ACKA 4AA4A 2WTVA 2UZEA 3EHAA 3QRIA 4YJSA 3TWJA 3AG9A 2ITQA 1BUHA 2R7BA 3AD5A 3VQHA 4AE9A 5HNGA 3ULZA 4J95A 5J1VA 3VS5A 3FXWA 4IJPA 4UX9A 2C5OA 3QCXA 3PA5A 4DH5A 5CNOA 4HGEA 4XNEA 4IB3A 3BYUA 2QURA 3G2FA 5CLPA 5KUPA 1LUFA 2C6LA 4FIIA 3ZUTA 5DGZA 4FF8A 3KULB 2W96B 3C51A 4IM2A 4J99A 2R9SA 4MQ2A 4E4MA 5BYZA 2VTSA 4YZNA 3NYVA 4J52A 4ONAA 2VWIA 5DWRA 4TT7A 4GK3A 2X6DA 1J7UA 3COHA 2VTQA 1RQQA 1ZYSA 3NCGA 3Q4TA 1JWHA 4DAWA 2Y4PA 4F9BA 3F6XA 3B2WA 4BGGA 5C8NA 3EL8A 5KHXA 4RIYA 2HWOA 4U9AA 4RJ8A 2UVZA 3CGOA 4GK2A 4QMZA 5C26A 4O91A 4GFGA 4IX4A 3EL7A 4S34A 4CZUA 4JG6A 4L3LA 2BZHB 4XH6A 3COIA 3UNZA 4RC4A 1LPUA 2ITXA 5E91A 1OB3A 1NXKA 5HD7A 1OIQA 2O64A 4G31A 4JBPA 5DBXA 5FP5A 2J7TA 3V8WA 3V6RA 2HWPA 3SKCA 3C4FA 5JFVA 2C5NA 4M13A 4EBVA 2ESMA 1BL7A 2BTSA 4O21A 3A7JA 4O7YA 4ARKA 5TE0A 1ZY5A 2PVKA 2NO3A 4GG7A 2X1NA 2R3IA 4KRDA 2DYLA 3VBXA 1L8TA 4E6CA 4QQCA 1PRYA 2JDRA 2YERA 3ETAA 4GIIA 4BZDA 3GU8A 4CMUA 5GJFA 4YHJA 1W83A 3O96A 4GH2A 3IDCA 2VTIA 5I9XA 2CCHA 3OEFX 3KXMA 3R1SA 3UOHA 3BQCA 3OHTA 4C3PA 4BDBA 2H34A 3G90X 2QI8A 3NCZA 4GSBA 2XNMA 5ANGA 4E4XA 2PHKA 5IUHA 3NDMA 3S00A 4DH8A 2VO3A 1IR3A 2A19B 2GHLA 2XNBA 3AQVA 4HNIA 4EKLA 4PV0A 4DCAA 4QP9A 4Z16A 2AC3A 2WO6A 3CC6A 4FEXA 3MPAA 4CLIA 2PULA 2OSCA 2VTTA 3FLNC 4XHKB 2VD5A 3LMIA 4U81A 1PXMA 2V5QA 4BDEA 2XEYA 2ETKA 3FQHA 2VX0A 4RVMA 4F6UA 3COMA 3I81A 2QHMA 2X7FA 3VVHA 4F70A 2QC6A 5AP0A 5E9EA 4CFWA 3SG8A 4PF4A 4ACGA 5EKNA 4USEA 4DT9A 4D2PA 5LWMA 1OL6A 1ZRZA 4W4YA 5HNBA 4DITA 2WEIA 5EQEA 4PL3A 3F88A 1PXLA 3CIKA 3CP9A 3GCPA 4JI9A 2C0OA 3BYVA 5EYDA 3W8LA 3ZXTA 1Y57A 3C0HA 4ZSGA 3QA8A 4BGQA 3UMWA 3CEKA 3NAYA 4G3EA 4I92A 5AV0A 3KXGA 2XM8A 4O84A 1OL1A 3DU8A 3QLFA 5J7HA 5IMEA 3ZLWA 5JGBA 4A9SA 2PZRA 4TXCA 3HKOA 3WIGA 2PUUA 3RHXA 3W10A 3BHHA 4M97A 5M51A 4FTKA 3JR1A 4FUXA 3RPYA 2X39A 3RAHA 1XH8A 3D7TB 3QXOA 2C3JA 2C6OA 5CU2A 3EQHA 4JDHA 4MEDA 4WBBB 4XRLA 1VR2A 3SXSA 3BEGA 4FX3A 2IPXA 1O6YA 3NR9A 2P0CA 3NWWA 2C3KA 5CAUA 4JBVA 3V8SA 3BHUA 1H08A 3JY9A 4LOQA 3UO6A 1ZYCA 2C6TA 2IVUA 2CGWA 2GSFA 5L8JA 5IA4A 1R0EA 4WD5A 3IW6A 4PQNA 2B54A 2IZUA 5BUEA 4XBUA 3QX4A 5IA0A 3SG9A 4IZ5A 1MP8A 3K3IA 3P78A 4G5JA 2G01A 3SD0A 3BU5A 4F7LA 1ZMUA 5AADA 3FI2A 4JIKA 3VAPA 2NP8A 1XH7A 5GZAA 3R01A 5FLFA 4RQKA 1M7QA 5LARA 3R7OA 4LM5A 4XG2A 4X3FC 3II5A 1YOJA 4Z7HA 3OXZA 5AUWA 4U42A 5EOBA 4MHAA 2W5HA 2Y4IB 2IW6A 3GC0A 4RG0A 4X3JA 3E92A 4O0YA 4IANA 4N70A 4FV5A 5L8KA 5IQGA 4G3DA 3FI4A 4H3PA 4ID7A 2R4BA 4UB7A 4J8NA 5DT0A 4X0MA 2PUPA 3DKGA 2ITWA 3FL4A 4O38A 3LXPA 1KUTA 2XRWA 4BI2A 3UYTA 3EMGA 5LMBA 4QYEA 4JRVA 1XR1A 3HZTA 4FSQA 4L67A 5CF6A 4PX6A 3QKLA 4GRBA 4FEVA 1ZARA 2VNYA 1WMKA 3ZRMA 3C4XA 4PTCA 2RF9A 2C5VA 1OBDA 3GUBA 3KK9A 4I22A 5DIAA 4O81A 4NFNA 1J7LA 4UBAA 4R7BA 3R2YA 2FH9A 1H01A 3L8PA 1H25A 1WBVA 3CD3A 3CTJA 5JRSA 2EVAA 2IVSA 4FZFB 2GTNA 3VF9A 4RZWA 4EQUA 3GU5A 3FSKA 5FDPA 5FM2A 3CJFA 1XBAA 3DB8A 4K2RA 3PRIA 2XP2A 1SZMA 3L9NA 2XNEA 3KXNA 4NT4A 4I21A 4BRXA 1XWSA 1KSWA 3DKFA 4EZ5A 1OL7A 5C4KA 4MF0A 4WNMA 4M14A 5AUZA 3DJ5A 3RHKA 1UU7A 2VTOA 2YN8A 4X2NA 4ZTSA 4BCNA 3LFNA 4BBMA 5CF5A 2ZOQA 4FKVA 3KULA 4RVKA 3QTIA 1DI8A 4OBQA 1Y8YA 4D58A 4EZ7A 5CY3A 2FA2A 3VQUA 3QGWA 4CZTA 3NW6A 4EOQA 2V7OA 5EG3A 3EQFA 4QD6A 4AGCA 2ONLA 4JBOA 4IWOA 3TDVA 3RK5A 1J1BA 3LCDA 2C4GA 3PDTA 2UVXA 3T9IA 1XH6A 4EHEA 3D7ZA 4DA5A 5CANA 1PJKA 4AZEA 1PXPA 2CMWA 4ZS4A 1GZOA 3E64A 5JH6A 3IPHA 3BBTB 4PMMA 4QMLA 1H27A 3HGKA 3ROCA 4ANBA 4QMMA 3PXFA 3G15A 3LFCA 5IA2A 4ZAUA 5IG1A 4FZ7A 3V5WA 2R3KA 4MYGA 4FTQA 3WZUA 4EOLA 4FTNA 2CGXA 3OC1A 5AV3A 4LOPA 4NWMA 1STCE 3DFAA 3MH2A 5H8BA 4CSVA 3QAME 3LFQA 4M0ZA 3MSSA 3CBLA 3CS9A 4GVJA 2W1CA 2GQRA 4J97A 4PNKA 1YWVA 3PXYA 4O7RA 3HRCA 1AD5A 5DRBA 2QOIA 2BZIB 2XBAA 3DTCA 1KV1A 4FEQA 4MXCA 4QYHA 2CLQA 4FV7A 4OAUC 2I0YA 2PZPA 4CCUA 4GT3A 3G33A 2C6DA 2UZNA 4KS7A 2CNUA 2JKKA 3VIDA 2OICA 2Y8OA 3C0IA 1GJOA 3MVHA 3ZSIA 4X2FA 2JBOA 2DQ7X 4O7SA 5CYIA 3S2PA 3QZIA 3LPBA 3UOKA 4A9YA 4FE2A 4C02A 5T6KA 5HQ0A 4FKPA 4UV0A 4HVHA 2GU8A 5DEWA 4RMZA 5DT4A 4A7CA 2YM4A 3HV4A 4ZY5A 3U54A 4C0TA 3QZGA 5BVEA 1REJA 3FZRA 3MVLA 2ITUA 4YLJA 3AT2A 3FYJX 5KKRC 1QMZA 3D4QA 3AD6A 5FG8A 4QYFA 3VBTA 4ZY4A 1TQIA 1YHWA 3HDMA 5ETFA 3TZ8A 2JDTA 4FV0A 4B99A 4UWBA 2OI4X 3KEXA 2HW6A 4R6VA 2X6EA 2QOLA 4I5MA 4ANMA 2J90A 1P2AA 2HIWA 4O1PA 4Y5HA 2VWZA 4MCVA 2ITTA 3GI3A 3ERKA 4WKQA 4JDKA 3TTJA 2OW3A 3Q2JA 2XEZA 3KC3A 2GS2A 5IQHA 4IHPA 3L9PA 5IA3A 2V7AA 1M7NA 5KMLA 1YHSA 3E93A 3EJ1A 4XG3A 1EH4A 1H1RA 3CXWA 3DFCB 1JKLA 1IAJA 2V0DA 4QMVA 1UWJA 2KULA 5EW3A 1YW2A 4BBFA 5CEPA 5KKRB 2UZDA 2V55A 2XIZA 3K2LA 3P7CA 3FY2A 3FYKX 5HESA 4S32A 5CZIA 1CDKA 2WD1A 2JAMA 5IH4A 4G6NA 5I9VA 5L6WL 2CGVA 1A9UA 4LGHA 3LFDA 2GNJA 4F1MA 2QO7A 5CU0A 3TKIA 4QRCA 1YXUA 2IW9A 2XNGA 4BYIA 4N6YA 3REPA 4EBWA 2X4ZA 3PTGA 3CLYA 3QX2A 4G3GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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