5J9LA

Crystal structure of cpt1691 bound to tak1-tab1
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
306
structure length
286
Chain Sequence
SLHMIDYKEIEVEEVVGRGGVVCKAWRADVAIKQIESESERKAFIVELRQLSRVNHPNIVKLYCLNPVCLVMEYAEGGSLYNVLHGAEPLPYYTAAHAMSWCLQCSQGVAYLHSMQPKALIHRDLKPPNLLLVAGGTVLKICDFGSAAWMAPEVFEGSNYSEKCDVFSWGIILWEVITRRKPFDEIGGPAFRIMWAVHNGTRPPLIKNLPKPIESLMTRCWSKDPSQRPSMEEIVKIMTHLMRYFPGADEPLQYPCQHSLPPGEDGRVEPYVDFAEFYRLWSVDHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7,TGF-beta-ac
publication title Structure-guided development of covalent TAK1 inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 286
sequence length 306
ec nomenclature ec 2.7.11.25: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase.
pdb deposition date 2016-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5j9lA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5j9lA01
3KEXA 3KXZA 1B6CB 4FNYA 2UVXA 3WZJA 3ZOSA 3WF5A 4ZY5A 4WRSA 3CGOA 1OMWA 5FXSA 1ZZLA 3COKA 3DKCA 4F9YA 4DE4A 2W1HA 3E63A 3NAXA 5JKGA 4PDYA 4DH7A 3MFTA 3R1SA 2R3MA 3IDBA 4YHJA 2W1GA 4EL9A 4O7VA 5HZNA 4E5BA 2J4ZA 4FT9A 4O0TA 3OCTA 5F1ZA 1W83A 4FV0A 3FMDA 2B52A 5D12A 5LARA 4FA2A 3KRLA 3NSZA 2B53A 4LGGA 4HVGA 2CLQA 2C5VA 3LFQA 2XK9A 3PSBA 4ACMA 1OKWA 4G3EA 4QMNA 3Q96A 3Q4CA 3R83A 2B4SB 1PMVA 2J0MB 4I0TA 3OTUA 4XG2A 5CU6A 5HLPA 4DH1A 5IQHA 4QP6A 3BYVA 3F2RA 3N4TA 1G5SA 3CD3A 4I93A 4YJNA 3TXOA 2G15A 2QG7A 5EQYA 2VTSA 3D5XA 3F66A 4YPSA 4KKGA 3SAYA 3HV4A 2CLXA 5ETCA 4FTIA 4D0WA 1U59A 3MJ1A 4G9RA 2CNUA 5HE2A 3CLYA 4AXAA 2BRNA 2WU7A 3FV8A 4EYJA 4QQCA 2EXCX 5KUPA 2JIIA 3MFUA 3DK6A 4G3GA 5DT4A 4DEDA 3RNIA 4PNIA 4E5WA 3C4ZA 3LJ1A 4H3PA 3OXIA 3PJ8A 1VZOA 2X8DA 4RIYA 3FXXA 3BV2A 3LM5A 4BKZA 3HGKA 4MQ2A 4X6RA 4YZ9A 3VS4A 3I7CA 3D2IA 1JPAA 3IPHA 1ZXEA 2GTNA 4O0WA 5LVLA 3ZRMA 4X7QA 2PUPA 1TQMA 4QOXA 4B8LA 1ZMWA 3ERKA 4FKOA 5CS6A 1J1BA 3ORPA 5HBEA 3RKBA 4BCFA 2PWLA 2WMTA 3L8PA 4J8MA 5KMKA 2PE1A 3FHIA 3BQRA 3EQDA 4LOQA 4EWQA 4OR5A 4U80A 4BICA 3HMIA 4MWIA 3DBFA 4PUZA 2UW3A 4JBQA 2QU5A 4OBOA 3QX4A 3CKWA 3KGAA 1JKKA 3MPTA 1F0QA 4BWXA 3U87A 3PSDA 1H1QA 4CD0A 4M8TA 4F9AA 5AP1A 4ZSGA 2QNJA 4UEUA 4CV8A 3SA0A 4IVDA 3FLWA 3ZRLA 3HRBA 1YWRA 4BGGA 4IX4A 3CQEA 4Y8DA 4O21A 2YM5A 4FKQA 3ZC5A 3G5DA 3LFAA 1Q99A 4FT0A 2ZYBA 4XOYA 3FYJX 3ZH8A 5LOHA 4QMVA 3VRYA 4K0YA 5KMOA 3DFAA 3ZM4A 3MPAA 2J2IB 4D9UA 2WTWA 4CCBA 3NUNA 5DHJA 1Q4LA 4BI2A 5HQ0A 5E4HA 2QOLA 1KOBA 2VX0A 2BIYA 2WIHA 4F6SA 2JDTA 5CSHA 3CKXA 4XV3A 3KC3A 2IW6A 2OWBA 5HIDA 1WBPA 4IZ5A 4NSTA 5DIAA 3U8WA 2RSVA 4GIIA 3LCSA 4CTBA 3MH2A 4C4EA 4H05A 3SOAA 4ZTHA 4QMTA 5GINE 3L9PA 3QRJA 4YTFA 3P7CA 5EYCA 1IEPA 4HNFA 4C4JA 4YP8A 3TUDA 1Y57A 2R0UA 4JDHA 3MTLA 3QTWA 2J5FA 4WO5A 5AR3A 4ZIMA 5C03A 4DEBA 1Q41A 2O3PA 4PDOA 2F57A 5I5ZA 5JH6A 4UWCA 3BU3A 4XBUA 3NUUA 2P55A 4DFXE 2WELA 3FSFA 5FP6A 4ZLOA 4LGHA 3ZCLA 3UQGA 4TZRA 4ACDA 5CVFA 3L9NA 4DITA 1NY3A 2A2AA 4YLJA 1DI9A 2OXXA 3ACJA 3G9NA 4CMUA 4EZ5A 4L42A 2Z7QA 4XG9A 5IISA 3E93A 3EQIA 5B2KA 2PUUA 1J91A 4TYIA 4NL0A 4DBXA 3FI8A 1JKLA 4PV0A 2UW9A 3NNWA 5ANIA 3PLSA 2OZAB 2C68A 5CENA 5BVKA 4DG0E 2Q0BA 4FTKA 4M69A 3IG7A 3C0GA 2C4GA 3Q04A 4FK6A 5I3OA 1PMNA 5GJDA 3U4UA 5AUYA 4L3PA 3R7GA 4QP2A 3GC0A 2DYLA 5EYDA 3WZDA 3ULIA 4MXZA 2A0CX 4M13A 5HKMA 3ZMMA 4BY9E 4EOPA 3IOPA 4Z7GA 2IW8A 2J0JA 2FSLX 4AP7A 2QCSA 4F4PA 3DJ6A 5IG1A 1OECA 4R77A 5M4IA 3AMYA 2IG7A 2BPMA 4PMSA 1K9AA 5LWMA 4EC8A 2YWPA 4JBOA 2WMVA 4UV0A 4Y46A 4BZOA 3NNXA 4WT6A 2BAJA 5AJQA 3IDCA 2ITVA 3KRWA 4LYNA 4Q9ZA 4FT5A 2YEXA 4PMMA 3FMKA 1YWNA 4RIXB 3LFEA 3EB0A 5H8GA 3QALE 4J99A 3VW8A 3UDBA 5FBOA 2R3GA 3RK9A 3P7AA 4BHNA 2CNQA 5CAOA 5GZ8A 2YN8A 4HYUA 3DKFA 4NK9A 5DE2A 2YIYA 4QYHA 1ATPE 4FTNA 3BBTB 3OUKA 4O7NA 3PXQA 4XP2A 3D83A 4C35A 3L8SA 5BYLA 3EN7A 4IB0A 1BUHA 3VS0A 5EHYA 4ANBA 1FVTA 4S34A 1GZOA 2XK3A 2BILB 3GBZA 1MUOA 4RSSA 2WMAA 3HMPA 2R9SA 3A61A 3PJ2A 2VU3A 4DFZE 4EQUA 5DA3A 4KS7A 3H4JA 2J5EA 4IANA 1P4OA 2CCIA 3TIYA 3V5WA 4FG9A 4LUEA 3LCOA 4Y73A 2PVNA 1SVHA 5AIRA 4O84A 3NUXA 5TOZA 2YLEA 3DLZA 2NNWB 3EKNA 5EM7A 4ZMEA 1S9JA 1ZMVA 4XBRA 3LQ5A 4EK8A 3COIA 5HG8A 3COMA 4XV9A 4KINA 4QYYA 4X2GA 3O96A 4ZJVA 3NIZA 1S9IA 2VX3A 3UYTA 4AT4A 3FXWA 4OTWA 3C4CA 4Q2AA 5HORA 5JT2A 4EH5A 2H96A 2ITNA 4BDFA 2W96B 2X1NA 5JSMA 3BBWA 4DA5A 1CDKA 4E73A 5ACKA 1QMZA 4MBLA 4QMPA 4X3FB 2F7XE 4L7FA 3MDYA 3DBQA 3JS2A 4FGRA 2P0CA 2OJIA 4IWDA 4L3JA 2HXLA 4XOZA 2I1MA 1DI8A 1V0BA 4LV8A 3MTFA 4NFMA 2XK4A 3KXHA 1MRUA 3PXRA 4CKJA 4YZDA 5L8KA 3QX2A 2JFLA 4JG6A 4D58A 5J79A 3QBNA 3PA5A 3CP9A 3QLGA 3R73A 1KWPA 2HWOA 4CXAA 4D5KA 4ENXA 2PZYA 3RK5A 1M2QA 4QNAA 3OEZA 5FEQA 5EDQA 4IM2A 2PVKA 2PY3A 3PIXA 4F0FA 5AUUA 2C3LA 4BZNA 2XEYA 2PHKA 5TT7A 5D7VA 3FHRA 2HW7A 4USDA 4EOJA 2OKRA 4MK0A 3R01A 3DXQA 2FUMA 4PPCA 5HHWA 2XIYA 5C4LA 3U51A 2HCKA 4TWPA 2ZOQA 5EK7A 3PJCA 4L9IA 4CZUA 1QCFA 1AQ1A 4QRCA 4RJ6A 5JGAA 5E8WA 5JRQA 4BCHA 3HAMA 3O2MA 5HU3A 3T9IA 4EEVA 3ZZEA 2OO8X 2VTMA 3FE3A 2W1EA 4YR8A 5IH4A 1R3CA 3QTZA 2QO2A 3MFRA 4QMSA 3H30A 4TT7A 4EOMA 5HG5A 3UIMA 1LPUA 3Q6WA 5J9YA 4QP8A 2UZVA 3D15A 2WEVA 3UNZA 3OBJA 1OI9A 5HD4A 3UQFA 4JS8A 4K2RA 2DUVA 3NUSA 3O7LB 3KCFA 1OBGA 4BZDA 1UU8A 5DRBA 4UALA 4RJ7A 2F2CB 3BPRA 3PUPA 5H9BA 4R7IA 2VGOA 4V05A 3KMWA 5TO8A 2XKDA 5HE1A 2FVDA 4FZAB 2ZVAA 2YJSA 3GU5A 4LMUA 3RHXA 2O63A 2XH5A 1VJYA 1APME 2J0LA 4M66A 1JSVA 5E91A 1BMKA 4O0XA 3UJGA 2OLCA 4QTCA 4I20A 4R6VA 1GZKA 2EXMA 5ACBC 3CQUA 2J0KA 3O8UA 2X7FA 4CVAA 4FEVA 4IIRA 5EHLA 4NM7A 5CWZA 5IPJA 3Q2JA 4R78A 4LL5A 4L53A 3DLSA 4W9WA 5ETIA 4ZLZA 3VC4A 3HZTA 4DGLC 3QD2B 4OAVB 2OJ9A 4CLIA 3I5NA 3SXSA 5EDPA 3AT3A 4EH7A 5A4CA 2WZJA 1FVVA 5IU2A 4S32A 4LV5A 4JQEA 1V0OA 3FMLA 5CF5A 4BDJA 3JYAA 5HOAA 3W10A 3EN4A 2YM6A 3IK3A 3UOLA 4XLIA 2ZM4A 5AM6A 2VAGA 2XCHA 5DG5A 5J7BA 2RFEA 3POZA 3QAME 4FEUA 4P90A 3NW5A 1WBOA 2C6EA 5KMNA 3PXKA 3AC8A 3HMNA 4KWPA 4GEOA 1ZOHA 5DFPA 4F09A 5HNGA 3C4FA 1JNKA 5AADA 2QO7A 2B55A 5BX0A 4GT4A 1DM2A 4AU8A 3FKNA 4O86A 4KIKA 1JWHA 5DYJA 2C3KA 3TN8A 2J9MA 2C5XA 1XH6A 5L6PA 4KD1A 3VS6A 4FIJA 4EK5A 3CY3A 4I5CA 4MQ1A 5K4IA 3ZHPC 3KK8A 2CKQA 5E92A 1OPKA 3AGLA 4M97A 5CSWA 3UOKA 3R8LA 2PVHA 4M68A 4FSRA 2R5TA 3ZEPA 2CN8A 2W06A 2QC6A 5DI1A 4EOLA 1OKYA 3K5UA 3GCUA 4DINA 3VHKA 5AV4A 2CKEA 3BGZA 3DY7A 3Q5IA 3PIZA 4JQ7A 1M52A 1YRPA 4LUDA 5EQPA 4FKWA 4QYGA 3FPMA 2H34A 3NYVA 4UZDA 5TR6A 3QGYA 3CPBA 3DK7A 3SKCA 3Q9YA 3DT1A 4DAWA 2W9FB 4U9AA 1K2PA 3O0GA 3BYUA 2CMWA 4GK4A 3NYOA 2Y4IB 4FKGA 2RIOA 3LVPA 3ZEWA 3ZUTA 4L7SA 1IG1A 3UQCA 5I9VA 2C6KA 3RZBA 3H10A 3RPYA 4IADA 4S2ZA 1SNUA 3LMHA 2XNEA 4Y95A 2C30A 4RX7A 3E62A 1I44A 4TW9A 3ZU7A 3BEGA 3PA4A 3PFQA 4CG9A 2XYUA 1M7NA 2P2HA 3EYGA 3QQLA 3HMMA 4CRSA 2HIWA 4U79A 4DGOA 3TTIA 2WMWA 4QPAA 3HECA 3W2PA 3KB7A 5JQ8A 3QHWA 4NEUA 5I4NA 3JXWA 3RJCA 4FL2A 5HIEA 4L6QA 1YW2A 2XIRA 4UN0C 5B2MA 2BZJA 1OIYA 4D4VA 4ONAA 1XWSA 1Z9XA 4N57A 4NTSA 4MYGA 3PXFA 5HBHA 4GG7A 1PMEA 4BI1A 4J95A 4FE2A 3MVHA 5HCXA 4NKAA 2FSOX 4GFGA 2R3HA 3W2RA 3G15A 2CGWA 2WFYA 3Q5ZA 4Z9LA 2UV2A 2X0GA 5FBNC 4BI0A 4B8MA 3R8ZA 5DMZA 4AGWA 1FVRA 1YOMA 2BUJA 1JKSA 2XNOA 3UNKA 4QQTA 4GUBA 3DZOA 4CFVA 2AC3A 4RMZA 4ZMFA 2V0DA 5CAPA 2B7AA 1IA8A 2BVAA 4PP7A 4I94A 1BI8A 3TV7A 3DAEA 3VO3A 4ZY6A 4YU2A 2BR1A 2C5YA 1SVEA 3R04A 4EUTA 2VTIA 1M17A 3VBVA 4BDAA 4D1SA 4FT3A 5GNKA 4L45A 3C4EA 3JVSA 2IVUA 1HCLA 1XHAA 3FZ1A 3G9LX 3V8WA 4YC3A 4EONA 3OBGA 5ANKA 3VW6A 4C3FA 4IQ6A 4MVFA 1YKRA 4I5PA 3VVHA 4AOJA 4K9YA 5IMXA 3LXLA 3ATSA 5IUHA 4M67A 3VS5A 4BC6A 4NM0A 1URWA 4GK3A 3NNVA 1XBCA 4G5PA 2BIKB 2YA9A 3EFLA 3TTJA 5EKOA 1XH7A 4FOCA 3UE4A 3UVRA 1V0PA 2QQ7A 3U6HA 5AM7A 1WVXA 4CFNA 2FB8A 4RX9A 5FD2A 2UW8A 4EK4A 3ITZA 3K54A 4FSMA 4YJQA 3L9MA 4FIGA 3CY2A 1PKGA 4B7TA 4CKIA 3U9NA 4RLKA 2YDKA 3QQHA 4YBJA 3WF7A 3FMMA 3HV3A 3GC9A 2YLFA 3W55A 3ZSHA 2GS7A 3FWQA 3F5XA 1H8FA 4AOTA 4CQEA 5M44A 3H9FA 3VUGA 4W9XA 3C0IA 4BTKA 2XIZA 2QOBA 5E8SA 4F65A 5IA3A 3ZXTA 4E4XA 4IFCA 2GQRA 3A7JA 4K18A 1YWVA 3UTOA 4UWBA 2Y6MA 3PE2A 2OH4A 2GNHA 2YITA 4RIYB 2XNMA 3RP9A 2WTKC 4QMXA 3RM6A 3D4QA 3PRIA 3H3CA 2WMRA 2X7OA 4BGQA 1Q3WA 4FIEA 4PX6A 2IZUA 3GQIA 3DBDA 2J51A 3GU7A 3UVQA 2XMYA 4RVMA 2YM8A 4CZTA 3S00A 3LQ8A 5DR2A 4HVDA 1PHKA 2GPHA 2HAKA 3S0OA 3W2OA 4A4OA 2HWPA 1NVQA 4JL9A 5ITAA 2AC5A 4EC9A 3H9OA 4WSQA 1OUKA 5AUXA 4A9SA 3Q6UA 3AD4A 2Z8CA 4CFMA 4FL1A 3E7VA 1WBVA 2P3GX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3KEX A;  3KXZ A;  1B6C B;  4FNY A;  2UVX A;  3WZJ A;  3ZOS A;  3WF5 A;  4ZY5 A;  4WRS A;  3CGO A;  1OMW A;  5FXS A;  1ZZL A;  3COK A;  3DKC A;  4F9Y A;  4DE4 A;  2W1H A;  3E63 A;  3NAX A;  5JKG A;  4PDY A;  4DH7 A;  3MFT A;  3R1S A;  2R3M A;  3IDB A;  4YHJ A;  3BL7 A;  2W1G A;  4EL9 A;  4O7V A;  5HZN A;  4E5B A;  2J4Z A;  4FT9 A;  4O0T A;  3OCT A;  5F1Z A;  1W83 A;  4FV0 A;  3FMD A;  2B52 A;  5D12 A;  5LAR A;  4FA2 A;  3KRL A;  3NSZ A;  2B53 A;  4LGG A;  4HVG A;  2CLQ A;  2C5V A;  3LFQ A;  2XK9 A;  3PSB A;  4ACM A;  1OKW A;  4G3E A;  4QMN A;  3Q96 A;  3Q4C A;  3R83 A;  2B4S B;  1PMV A;  2J0M B;  4I0T A;  3OTU A;  4XG2 A;  5CU6 A;  5HLP A;  4DH1 A;  5IQH A;  4QP6 A;  3BYV A;  3F2R A;  3N4T A;  1G5S A;  3CD3 A;  4I93 A;  4YJN A;  3TXO A;  2G15 A;  2QG7 A;  5EQY A;  2VTS A;  3D5X A;  3F66 A;  4YPS A;  4KKG A;  3SAY A;  3HV4 A;  2CLX A;  5ETC A;  4FTI A;  4D0W A;  1U59 A;  3MJ1 A;  4G9R A;  2CNU A;  5HE2 A;  3CLY A;  4AXA A;  2BRN A;  2WU7 A;  3FV8 A;  3W0P A;  4EYJ A;  4QQC A;  2EXC X;  5KUP A; 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