5K5NA

Crystal structure of gsk-3beta complexed with pf-04802367, a highly selective brain-penetrant kinase inhibitor
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
347
structure length
331
Chain Sequence
KVTTVVATPGDRPQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glycogen synthase kinase-3 beta
publication title Discovery of a Highly Selective Glycogen Synthase Kinase-3 Inhibitor (PF-04802367) That Modulates Tau Phosphorylation in the Brain: Translation for PET Neuroimaging.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 98
structure length 331
sequence length 347
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-05-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5k5nA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5k5nA01
3VS1A 4YUQA 2ITUA 3FXXA 1SVGA 4RJ3A 4U0IA 5LVLA 4M3QA 2PZRA 3GCQA 3ZO1A 5KMLA 4G9RA 5ANEA 3PPZA 3P1AA 5AA8A 4FI1A 3PLSA 2HK5A 4JX7A 4BICA 4ZTQA 4YJSA 5FEEA 4FKIA 2QCSA 2XNGA 5M4FA 4P5QA 4QNYA 1YWVA 4FSMA 3DXQA 3UGCA 1H01A 3TDWA 4U45A 1H1SA 4G5PA 2IJMA 2LAVA 4IX5A 3R9HA 5BVOA 5CTPA 3I7BA 4D2SA 5H8EA 3AD4A 5IMXA 4UYAA 3WYXA 2PY3A 2ZV7A 3E3BX 1O6KA 1IA8A 2JKMA 2IN6A 2ZDTA 3QCXA 4FK6A 4L3LA 4RC4A 5C01A 5HX6A 4FKUA 3LAUA 2C3LA 4MXXA 3GU7A 2QKRA 4AF3A 4Q9SA 4UWBA 5IUGA 4ZTRA 3EL8A 1H1PA 5HNIX 3BYOA 1Q8YA 4O7WA 3PJCA 1ZWSA 2KTYA 3CP9A 4QOXA 1S9IA 1FGIA 1W0XC 3ZLYA 3TTIA 2F7XE 3TN8A 4AGCA 1IAJA 4LOQA 4BCQA 3NPCA 4FTTA 5CF5A 1JSTA 4XNEA 3II5A 5HE0A 4QQTA 1XWSA 2PUUA 1FVVA 4U40A 5E90A 3BEGA 3KXZA 1I09A 2BTSA 3PY1A 4E4LA 5IEYA 4IX6A 4RIOA 3L9NA 5FXSA 1MRYA 5H8GA 4ZJJA 3R1NA 3G5DA 3LFQA 3DBDA 3QU0A 3OUNB 3HMOA 4OLIA 4CMTA 5HEZA 3ET7A 3UZPA 3C0GA 3R71A 4MXYA 5DR9A 3OC1A 5IZFA 3VN9A 2R7IA 4RA5A 4EK5A 2BZHB 2OF2A 3WOWA 3I6WA 4IB0A 3S1HA 3C7QA 4QMPA 4YGAA 4S33A 3NAXA 2HY81 3QA0A 3FC2A 3BHTA 4IFCA 2VWXA 5EM8A 4I6BA 1U4DA 5AR4A 4HYUA 2W99B 2J5EA 2HWPA 2J0MB 4YZDA 1U54B 4M97A 5GNKA 4FEUA 4YZBA 4U7ZA 5E8TA 4OAUC 2PUNA 3SV0A 4F9AA 5EKOA 4AG8A 3FXZA 1ZOHA 2DQ7X 1IR3A 2VX3A 3OW4A 2XKCA 4I24A 3QRJA 3GC8A 4JG6A 1JPAA 3MA3A 4FSTA 4MX9A 3MB6A 4OBOA 4CXAA 1KOBA 2VGPA 3R1QA 4FT5A 2BFYA 4ASEA 4S34A 3VUKA 3LXLA 3TIYA 4FKQA 5KMIA 4ACMA 4R3PA 3AT4A 4XUFA 3OWJA 5L2SA 1JSUA 4JLCA 4G6NA 4PNKA 4YU2A 4F70A 1VYWA 3SC1A 3MSSA 4DFBA 4FTCA 3TKHA 3MDYA 4A4OA 1CDKA 2E9UA 3TKIA 3D15A 2OJFE 3EN7A 4I6FA 4NJ3A 2QG5A 2IZTA 3V04A 3NDMA 3PXYA 4RFMA 4C61A 5IDNA 3KXXA 4E20A 2I0EA 2UUEA 4NT4A 3SKCA 3LQ5A 3PWDA 1IA9A 1P5EA 4EBVA 2JIUA 3KREA 3DXNA 2HWOA 3CS9A 3OF0A 4L68A 4DITA 3FY0A 3UZRA 2OIQA 2XKEA 3DV3A 4MBIA 4B0GA 2X7FA 4OR5A 4KRCA 4TWPA 4IZAA 3H0ZA 4QMOA 5DMZA 3UO6A 3H9RA 4IIRA 4L43A 4FX3A 2PVYA 4NWMA 3QC4A 1CKIA 4AWIA 4RX7A 3DDQA 4IAYA 4YBJA 3C5IA 1Q8TA 2PU8A 3V5JA 4YO6A 5I4NA 3EQCA 4FC0A 4GFGA 4GK3A 4H36A 4EOJA 3D94A 5DR6A 4II5A 3CQWA 1H0WA 4PUZA 3RAWA 4ALVA 3LCOA 3UP2A 2XS0A 4DAWA 4FTNA 3LOKA 1BKXA 1PYEA 2EXMA 4PTCA 4ZMFA 2FSLX 4I1ZA 2XK7A 4O81A 2IO6A 5CEOA 4H58A 5J5SA 3PIZA 3SGCA 1XR1A 4F0GA 4DH1A 5HG5A 5C9CA 3R28A 4CFVA 1YHWA 3PJ3A 3VUMA 2Y6OA 4EUUA 2YM8A 2NNWB 3UG2A 5IA5A 1J1CA 3O7LD 5IUIA 2AC5A 3W2OA 3U8WA 5CI7A 3K5VA 2VO0A 1XO2B 4XG6A 4CKRA 3PLAE 2BRBA 5BUEA 3C4ZA 1Q61A 4M69A 1RW8A 2OJ9A 3KC3A 4M0ZA 3KRWA 3PVWA 2GNLA 2UVZA 5I3OA 5KMNA 5EM7A 2WQBA 3W16A 2B1PA 2XF0A 1YI3A 1BL7A 4LQMA 4FVRA 2C6MA 5M56A 3Q3BA 1H27A 3T3UA 2W9FB 2OBJA 3M1SA 4FKRA 3ZC6A 4WSQA 2HYYA 4CFXA 4DLIA 3R9NA 4IWOA 2OFVA 4AXAA 1W83A 2WTCA 4C4FA 4AA4A 5A4LA 4EH2A 2BPMA 4GFOA 3ZHPC 2H34A 5FBNC 4ALWA 4QTBA 5ANKA 2PZYA 4XH6A 4WOVA 3UQCA 3RAHA 2C1BA 2Y4IB 4B9DA 4YJPA 5HVJA 5J9YA 2P33A 3EFKA 2QLQA 3HV4A 2X4FA 3KK8A 2XZSA 3EMGA 4I6QA 4RLKA 4CKJA 3PZEA 4TYJA 4JQ8A 1O6YA 2Y7JA 4ZZMA 3VUGA 1XH8A 1STCE 1JKSA 3QQHA 3PJ2A 4DFYA 3UNZA 4L7FA 3T9IA 1UV5A 2QVSE 4I4EA 4DGLC 4V04A 2YIQA 3ZO4A 1OKZA 2F4JA 1PJKA 3V51A 3UVPA 3FLNC 3UO4A 4FICA 4EL9A 1GJOA 4PDYA 4CFWA 4YHJA 4PX6A 3NVKI 4FTKA 3UZTA 3TUDA 3EFLA 3C4CA 5JGBA 3EQGA 1CM8A 3TV4A 3UIBA 4ZJIA 3QCQA 3EQPA 5AFVA 2EXCX 3GOPA 5AUUA 2CLXA 5E1SA 2WTWA 1E1VA 4WT6A 5J5TA 4YTIA 3GCSA 4QP4A 4CSVA 4AA5A 2G2IA 4IAZA 2XIYA 3OWPA 4IZ5A 2YDJA 2ZB1A 4O91A 1JKTA 4KIPA 5BYZA 4IAKA 5CLPA 4OBQA 2W0JA 2P4IA 4RSSA 5H3QA 3OEZA 5CAQA 5AIKA 1BLXA 2OF4A 2YAKA 2Z7SA 5L8KA 4WNPA 3NS9A 4ARKA 4CMOA 5HG7A 1XBAA 4X2KA 1SYKA 4EZ7A 4LRKA 4BIEA 4X3FC 4MD9E 2WTKC 4ZXTA 4R7BA 2BALA 3QHRA 5DEYA 4WBBB 4QP3A 3UYTA 1IEPA 3P7BA 3BGZA 3Q52A 1OPLA 3JPVA 3PFQA 5CSHA 4BDJA 1FVTA 3SA0A 4Q5HA 2J0KA 5J95A 4IM2A 4C38A 4X0MA 1PF8A 4PNIA 4RC3A 4KIQA 4UMPA 1WBWA 4K6ZA 3WBLA 4Z16A 2G01A 2UZNA 3HUBA 3O7LB 3QUEA 4X2GA 4NK9A 4S30A 2P55A 3FMMA 5AP5A 1FBNA 3G6HA 2IVTA 3HP2A 5HBHA 4UMQA 3E7OA 3C4WA 2C69A 2IW6A 3CPBA 5GJGA 4FIJA 4NZWB 1WZYA 5ETCA 3TJDA 4RJ6A 4G9CA 5LQFA 4F99A 2OGVA 2WQOA 1PKDA 2VD5A 4RJ8A 3VUIA 2J0JA 4G5JA 4G3CA 3D5VA 3DQXA 5BPYA 5T3QA 4PL5A 4MD7E 4OUCA 5JFSA 2LGCA 3FLWA 1YVJA 3PP0A 3L8VA 2ETRA 3QRTA 3QUPA 3UMXA 2YIWA 3NNWA 2VWBA 4QYFA 3UVRA 5HE3A 4RQVA 3GT8A 3VHEA 4G17A 4YZNA 3LMIA 2WZJA 3TJCA 4MYGA 3BHUA 4BGGA 4UY9A 5A46A 3UVQA 3ZRMA 2I0YA 1U46A 3MIYA 4BKYA 2V7AA 4FVQA 2C6DA 5DN3A 5CALA 4MQ2A 4EOOA 4F7SA 5I9XA 1JSVA 4KB8A 4KWPA 4FKVA 3N51A 5A4CA 1O9UA 4FKGA 3QTUA 5AUTA 3KF7A 2X4ZA 4G16A 2C47A 2X2MA 3OHTA 2E9PA 2JDSA 3ULIA 3ZCLA 4HPTE 1H0VA 3UDBA 2C5OA 2WPAA 2QOQA 4N6ZA 2VTMA 4L45A 4ZSAA 5AM7A 3ZSIA 5LCJA 4R5SA 5HD4A 2ITPA 4O7ZA 2O65A 4FV7A 3LMHA 1YQJA 4G31A 4GEOA 5JT2A 4QMYA 5LMKC 1JWHA 1FINA 3QAME 5EYMA 4O0XA 1CTPE 4FSWA 4JG8A 2ZVAA 4ENXA 2I7QA 2Z02A 5FWKK 2XIKA 3DAKA 2C5XA 3PXRA 5HX8A 1TQIA 4U41A 4FKOA 4QMTA 4XEYA 4CT1A 1OPJA 2VTRA 3VWAA 4DC2A 1UU3A 3DDPA 4DGGA 1XH7A 4ACHA 2XBAA 3OZ6A 4W4WA 2O2UA 3HRCA 3ZUUA 4FSUA 5LVOA 2VTOA 1KE9A 5FTQA 2EU9A 5K4JA 4Y95A 1UNLA 2IWIA 3C0HA 4NJDA 4KBKA 3HKOA 5F95A 1OL1A 4IJ9A 1H4LA 3SD0A 2BKKA 1GNGA 2ZMDA 3IW8A 3NLBA 1H1WA 1V0PA 4AT4A 1H08A 1OL5A 2PMOX 2BAJA 3C4XA 1YXUA 3MY0A 4ZTLA 3LW0A 4X2FA 3KN5A 2XMYA 2OIBA 1WVWA 2JBOA 2B9HA 3IW4A 3SAYA 3WZEA 4BYIA 4C4EA 2WQMA 4EHGA 2NP8A 3KRLA 3CQEA 3GFWA 4AN3A 3HRBA 2WGJA 3MS9A 3R73A 5IH5A 1PMNA 4FV0A 4EHVA 3DFCB 2YHVA 2UZEA 4XP2A 3LQ8A 2CGUA 4BDGA 4BF2A 4QP7A 4UYNA 5LVPA 3ORMA 4O6EA 3BHYA 3CJGA 5HTIA 1ZYJA 4J98A 4M13A 4BDFA 1Q3WA 4RJ7A 2O63A 1Y57A 3QTIA 3OWKA 4K33A 3MTLA 4A7CA 4I6HA 4GVAA 4A9YA 3MBLA 4ZIMA 5D41A 4XYFA 5I9YA 4FIHA 2ZM1A 4WBOA 4MQ1A 4ZY4A 3VRYA 5LARA 3O71A 1ZZ2A 3KXHA 3VS7A 5M07A 1SVHA 5F9EA 4WIHA 2GCDA 3KL8A 3TACA 3HGKA 2ZM4A 4IDVA 3FZOA 4IWPA 4NEUA 4RVMA 3COKA 3UC4A 3HDMA 4RC2A 2OXYA 4I0SA 3F5UA 4ZK5A 4DEBA 2VNYA 4FYOA 1KWPA 3Q96A 4FR4A 4JOAA 2VU3A 4JQ7A 3U4UA 4L44A 3LE6A 2ETMA 3RVGA 4O1OA 4FEVA 5AIRA 3SVVA 4CVAA 2XK4A 2J6MA 2XYUA 3F2NA 3OVVA 4FTOA 2Y0AA 4FZAB 3UO5A 3FI8A 4J71A 3P0MA 4NSTA 3GI3A 3EQHA 4GKIA 3MESA 1YDTE 3EJ1A 1GAGA 1H25A 3PA3A 5FQDC 4A9SA 3VNTA 3RBWA 3E93A 5ITAA 3R22A 3PG3A 4JR7A 1JNKA 5DH3A 5ANIA 2IW9A 2FSTX 4Z7HA 4AZTA 1ZZLA 2DS1A 3I0OA 4OAVB 3KXMA 3TG1A 3MA6A 4UXLA 3R7IA 3MB7A 4GCJA 4R3CA 3UNJA 1Z5MA 4DN5A 4FEXA 4HCUA 1H00A 2XBJA 5KMOA 4W8EA 2VZ6A 2VTQA 1OB3A 3D5UA 2O5KA 3AC2A 5DNRA 4EI4A 4BCIA 4EH8A 2XEZA 4G3EA 3KEXA 3FL4A 3BZ3A 4YZCA 3ANRA 5HVKA 1GY3A 3ZLWA 2CNVA 4J95A 4BWPA 4BDAA 3ZBFA 4J7BA 3EN5A 2BZKB 4YZMA 4OBPA 2X8IA 4WG5A 4EHZA 3C1XA 4BBMA 4HYHA 4IEBA 5FUTA 3Q9YA 3EH9A 3WZUA 4ASXA 4XRLA 5GHVA 5AP1A 3JYAA 4FT0A 4E6AA 2R3MA 4ZSLA 3SDJA 3QUDA 5I9WA 4FT7A 4IQ6A 3RPSA 4ZLZA 2RGPA 5CF6A 5EM6A 2WXVA 2YISA 5FTOA 1DS5A 3M2WA 2OJJA 4O7TA 3H9OA 2ITQA 2ITTA 4IMYA 2C5NA 3G9NA 2PVMA 1RE8A 3DBFA 4CV9A 1VR2A 5L8LA 4FE2A 4R7HA 2JD5A 5CAUA 3K3JA 3B8RA 4C35A 2YJRA 1PRYA 3ORXA 3SW4A 4BCGA 4EKLA 2XP2A 4GK2A 3WI6A 4BCNA 5BVEA 1BMKA 5GZ8A 3OBGA 4BCMA 3CEKA 4GG7A 5AV1A 2WMRA 3V01A 3RCDA 3ZDUA 5JGAA 4AW1A 4O1PA 4RJ5A 2GTNA 5BMSA 5AV4A 3BU3A 3U54A 4C59A 3TV7A 3EFWA 3ZM4A 4J8MA 3SQQA 4D2RA 3V8SA 4JNWA 1QPJA 4D4RA 3PIXA 2UW8A 2GTMA 4QMWA 3IQ7A 3N4VA 3COHA 3FL5A 2XH5A 2JAVA 4MXAA 5A4QA 1Q99A 2X9EA 4KABA 3HV3A 2UZUE 2E9VA 2CGVA 2B9JA 3EZVA 3GEQA 3F3UA 2UW5A 5AP0A 3TM0A 2J4ZA 5CZIA 4JBVA 5EW3A 4PQNA 3I81A 4EQMA 3QBNA 2IVVA 4XG2A 2BHEA 1IG1A 4MAOA 4QP2A 4F1TA 3MVJA 4QYYA 5CEKA 4YURA 3OCBA 3QCSA 5JZNA 4U80A 2GNJA 4EONA 2R7BA 3E3PA 4YZ9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VS1 A;  4YUQ A;  2ITU A;  3FXX A;  1SVG A;  4RJ3 A;  4U0I A;  5LVL A;  4M3Q A;  2PZR A;  3GCQ A;  3ZO1 A;  5KML A;  4G9R A;  5ANE A;  3PPZ A;  3P1A A;  5AA8 A;  4FI1 A;  3PLS A;  2HK5 A;  4JX7 A;  4BIC A;  4ZTQ A;  4YJS A;  5FEE A;  4FKI A;  2QCS A;  2XNG A;  5M4F A;  4P5Q A;  4QNY A;  1YWV A;  4FSM A;  3DXQ A;  3UGC A;  1H01 A;  3TDW A;  4U45 A;  1H1S A;  4G5P A;  2IJM A;  2LAV A;  4IX5 A;  3R9H A;  5BVO A;  5CTP A;  3I7B A;  4D2S A;  5H8E A;  3AD4 A;  5IMX A;  4UYA A;  3WYX A;  2PY3 A;  2ZV7 A;  3E3B X;  1O6K A;  1IA8 A;  2JKM A;  2IN6 A;  2ZDT A;  3QCX A;  4FK6 A;  4L3L A;  4RC4 A;  5C01 A;  5HX6 A;  4FKU A;  3LAU A;  2C3L A;  4MXX A;  3GU7 A;  2QKR A;  4AF3 A;  4Q9S A;  4UWB A;  5IUG A;  4ZTR A;  3EL8 A;  1H1P A;  5HNI X;  3BYO A;  1Q8Y A;  4O7W A;  3PJC A;  1ZWS A;  2KTY A;  3CP9 A;  4QOX A;  1S9I A;  1FGI A;  1W0X C;  3ZLY A;  3TTI A;  2F7X E;  3TN8 A;  4AGC A;  1IAJ A;  4LOQ A;  4BCQ A;  3NPC A;  4FTT A;  5CF5 A;  1JST A;  4XNE A;  3II5 A;  5HE0 A;  4QQT A;  1XWS A;  2PUU A;  1FVV A; 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