5KHWA

Crystal structure of jak1 in complex with adp
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
287
structure length
276
Chain Sequence
PTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTENGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKETVKDDRDSPVFWYAPECLMQSKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSNRTSFQNLIEGFEALL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Tyrosine-protein kinase JAK1
publication title Development of a high-throughput crystal structure-determination platform for JAK1 using a novel metal-chelator soaking system.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 276
sequence length 287
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-06-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5khwA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5khwA01
2YLFA 3A4OX 3EFLA 2BZHB 2JLDA 4IX4A 5L2QA 5AP5A 3CY2A 3TNHA 4GYGA 4AW2A 2F9GA 4DA5A 2R3PA 2UW7A 2FYSA 4RRVA 4UMTA 1PY5A 2XVDA 1NA7A 3R73A 1NVRA 4J7BA 5CU6A 4YJQA 2YM6A 3RPSA 5CEMA 3NUUA 3PJ2A 1MRUA 4XNEA 3MVLA 2XF0A 2XIKA 3ZHPC 2PUIA 1U54A 4NUSA 4H3QA 2YJRA 4FKOA 4YP8A 4AZVA 5FTGA 2EXCX 4CTCA 2WQBA 4LI5A 2F49A 3PP1A 2GSFA 3D7TA 2C6EA 3GQIA 4M84A 5J9YA 5KKRB 3P7CA 3BEGA 2IVSA 4ZTLA 1OIQA 2YAKA 4O6EA 1B39A 1OIRA 5HD7A 2G2IA 1YDRE 2YA9A 5BVKA 3VBTA 5A4LA 4F99A 1SNXA 4FNWA 2WQNA 4Y73A 5HIDA 3DGKA 3F66A 5C1QB 2OJGA 2OJJA 4C59A 2WTKC 2PMIA 3R7EA 1FMOE 3V8TA 2ITVA 3POZA 3U87A 2CDZA 3ERKA 4FKLA 5CS6A 4ZS4A 4GT5A 2AC3A 2B1PA 5CAUA 1IAHA 1VYZA 3DBDA 3LFQA 3O8UA 1OPLA 3C4WA 4R1VA 5CT7A 2P4IA 3W2CA 4IFGA 5DFPA 2QD9A 4YNEA 5DT3A 3LCKA 3ZRMA 4QNAA 3WIKA 3VQHA 4YJTA 1H07A 4P5ZA 4EI4A 3FE3A 3FYJX 5H2UA 2ZV9A 1M17A 3OFMA 3U4UA 3VJNA 4ACCA 3K2LA 5IUHA 2ITTA 3DAJA 4FVQA 2ZM4A 4MNEB 5CQWA 3MTLA 3G51A 3BYSA 1K3AA 1GJOA 2YCRA 1DAWA 5IU2A 5FWKK 5J79A 3BLQA 4PMTA 3VUMA 3EYGA 2HAKA 4MXCA 5CF4A 3TDWA 2KTYA 4AFEA 3QC9A 2ZB1A 2ZJWA 3B2TA 2PMOX 2F7XE 1U5QA 3HMPA 4F7JA 2RFEA 4AE6A 1OKYA 2QVSE 3KL8A 4E7WA 5IPJA 5LWMA 4APCA 4OTIA 5M57A 3CR0A 1H1PA 2JDVA 4FSWA 4OTPA 2NP8A 4BR3A 2ZM3A 4EK4A 4LUDA 3R1QA 4PTGA 4CRLA 1H08A 5BVFA 3ZM4A 5FBOA 2O2UA 3BV2A 3GT8A 4RFMA 3ZLXA 5AUZA 4Q5EA 1UKHA 5CU4A 3WI6A 3SRVB 3ZRKA 3ZM9A 3S00A 4GVJA 4O7NA 4EOKA 1DM2A 5HG8A 5AFVA 1OZ1A 4G9RA 5HESA 3BWFA 2QO2A 4YZ9A 5IQFA 4LMNA 4EHEA 5I9VA 1G8AA 4Y85A 3QA8A 2I0HA 4BDJA 1AQ1A 2QOHA 1JWHA 2J5EA 2XNGA 3LXNA 4IW0A 3V04A 2YFXA 3TKHA 4EYMA 5HGIA 4M97A 2UW8A 4BDHA 5M09A 2ITWA 3S1HA 4FV3A 3R7IA 3TN8A 4ZY5A 4L7SA 4K2RA 4M0ZA 2F57A 2OF4A 3IDPA 3ORXA 3HDMA 1SYKA 2BPMA 3A61A 1HCKA 4H58A 1FMKA 2B4SB 4FTRA 4L9IA 4D1XA 1PHKA 5FGKA 3N9XA 1XBCA 2BRBA 2IW9A 2CKOA 5GJGA 3BE9A 2PZRA 2DUVA 3PIXA 5AJQA 2OGVA 4MD9E 5HU9A 1U5RA 4RIYA 3RNIA 4BCIA 5B2LA 3ZDUA 4F7LA 2J0JA 3W8QA 4KSPA 2XIZA 3PJ1A 1MRYA 4J95A 1E9HA 4OAUC 4ZOGA 3UIXA 3BHUA 2HY0A 3HRCA 3QZHA 4NT4A 3UOLA 1JBPE 1Q8UA 4QT1A 2QKRA 4TYEA 3CJGA 4IM2A 2OZOA 3AG9A 4FTTA 2UZLA 1LP4A 4EH8A 5EQEA 1LEZA 2B9HA 3V8SA 4AGCA 2XEYA 3L8PA 2R5TA 3NYOA 1BL7A 3TJCA 2WELA 5IQCA 3SG9A 3SD0A 5IA1A 1HCLA 1PXLA 5IDPA 4RIWB 5IQGA 3QAME 2IO6A 4AZSA 4D0WA 3SXSA 3Q5ZA 4XV1A 5DEWA 1GZOA 4UMQA 5DOSA 5I9WA 3NNUA 4E73A 4YJOA 1YXXA 2BFYA 4HGTA 3ZO3A 4FKPA 3PWYA 2CLXA 2O65A 3WE4A 1CKJA 2QQ7A 3UVPA 4EH2A 5HTBA 3VF8A 4YZDA 1TQMA 2VO0A 3MYGA 4FTMA 2FSMX 3QHRA 3VW8A 5JN2A 3ZYAA 3FI4A 3AC5A 1UV5A 4BHNA 3QCYA 2R7BA 2BUJA 4MNFA 4QQJA 4QPMA 5CF5A 2ZDUA 4GFOA 2RFNA 2J7TA 4V01A 3RAKA 1H0VA 3RHKA 4YMJA 5AAEA 4DT8A 2R3RA 1H1SA 3PXYA 3Q2MA 4ZSLA 4DH5A 2E9VA 3C4CA 4G3FA 4R78A 1J3HA 4YTCA 3LOKA 2ZV2A 5B2MA 4ZP5A 3QYZA 3O2MA 3NVKI 2C0OA 4FV9A 1PMNA 2BHHA 3UMXA 2W1ZA 3DS6A 5G1XA 3DY7A 4CLJA 5J8IA 3D5WA 2P2HA 2B53A 4B0GA 1F0QA 1MUOA 1PF8A 3RGFA 2BHEA 1A48A 5KMIA 5B7VA 2I7QA 5L2SA 4BCOA 2HIWA 2YIWA 4WHZA 4X0MA 3ZOSA 4QYEA 2QOKA 3HVCA 4O82A 5M06A 3W2OA 5DG5A 5ANIA 5I3RA 3RWPA 2FO0A 4CEGA 1O6KA 4YNOA 4YZCA 3ZONA 3BHVA 4BWXA 4G6OA 2ITXA 1V1KA 4S33A 4HJOA 5A3XA 5E8SA 3FXXA 3QU0A 4H36A 3R9DA 2XRUA 4Q5HA 5AMNA 4DG0E 3M2WA 4N0SA 5GNKA 5JSMA 3PXRA 4NJDA 4J8NA 4HVHA 5L2TA 2WMVA 4TYIA 4BI0A 5BNJA 5KCVA 3UQCA 4DH1A 5CU3A 3WF7A 2CPKE 4HNFA 4XLVA 4Z7GA 1A06A 3EQHA 2UV2A 5AP2A 5C03A 5CEOA 4NFNA 4KINA 3H4JA 4D9TA 4JXFA 5GIOE 4CMUA 1KE9A 4JR7A 3T3UA 4ANBA 3DDPA 5IA5A 1J91A 4F9AA 4B4LA 3EQBA 2IZSA 4TYHB 5L3AA 5E1EA 3TCPA 5KZ0A 4I24A 2BTSA 3LVPA 1PYEA 1I09A 1TQPA 5H8GA 2XJ2A 3FLWA 3KKVA 4WSYA 3PWDA 2XCKA 4PP9A 3F82A 2QU6A 3L8XA 2JDRA 4NWMA 4CKRA 2HZ0A 3RK9A 3KF4A 1XR1A 5KMNA 2W99B 4TKSA 3LJ1A 4IB5A 3QWKA 4PDOA 1UU3A 2VTQA 2Z7SA 3F3WA 3KRRA 5HZNA 5K4JA 1CDKA 4LQMA 3ZUUA 2Z8CA 3LW0A 3HECA 4YBKA 3JPVA 5HE0A 4APPA 1QMZA 4TPTA 5E8YA 3PXZA 3S95A 2UW4A 4IHPA 2XCHA 3MJ1A 4IQ6A 3ORTA 4PRJA 5HTIA 3UIMA 4U81A 4F64A 2PVYA 1O6LA 1QPCA 3FZPA 4ORKA 4E4LA 3QQKA 4RQVA 4CMOA 4E8AA 5LCKA 4DEDA 3R7VA 4EHGA 3QUPA 2C3KA 4P90A 3ODZX 3HP2A 5D10A 4G3GA 2RFDA 4U45A 4U0IA 4BCGA 2UZDA 4FX3A 1BYGA 4IVDA 3UYTA 4R5SA 2PVLA 4P4CA 5CAPA 5FG8A 4OUCA 1SM2A 2PVJA 4IM3A 1ZYJA 3MS9A 3PY1A 3QHWA 3R6XA 1YVJA 1JPAA 2R9SA 5E91A 4GS6A 3NUYA 4FEXA 4WNPA 2E9NA 1CKPA 4I6BA 4FA2A 5HTCA 3HMNA 4BIEA 2WQMA 2C5XA 4S31A 3CLYA 4WO5A 5J95A 2WTJA 3TKUA 4E6CA 3FV8A 1DI9A 3PXQA 4KWPA 4EOQA 5IEYA 3NWWA 3QRIA 4CTBA 1KUTA 2A2AA 2O64A 3DK3A 1PJKA 2RG5A 3QLGA 5D7VA 5FP5A 4NW6A 4QTAA 4JBPA 3TACA 5JT2A 4FTIA 3HX4A 3D5UA 5J9ZA 4BKJA 5A9UA 3KY2A 4J71A 1UWJA 3SDJA 3UC4A 1VYWA 5DA3A 1IAJA 5IQEA 4HGLA 2E2BA 4EOOA 4CFNA 2SRCA 4EH9A 2YDIA 4QP2A 1ZXEA 1Q62A 5ACKA 4GKIA 2YABA 3BYOA 3LMGA 3GNIB 5CEIA 3W2RA 2VWIA 2R0IA 4H3BA 1ZZ2A 4RX5A 2O0UA 2V7AA 2AYPA 2GNJA 4BDEA 2FA2A 3F61A 4FSUA 2GHMA 3MFRA 2ZVAA 3O7LB 4Q9SA 3NS9A 4ITHA 3PPZA 5FXQA 4A9YA 2WHBA 3BYVA 5EM6A 3MSSA 4LL5A 3RINA 4XP3A 4CZTA 1NXKA 3BBTB 1ZZLA 4CZUA 3COHA 4O38A 4GT4A 2ERKA 4LRMA 3U54A 4BCHA 3RALA 4ZZNA 5K4IA 3RPRA 4EOIA 2RGPA 2WQOA 4AFJA 2C1BA 4I22A 3KA0A 5DN3A 5K5XA 1GAGA 4D2TA 3G0EA 4FL1A 2AUHA 5AR8A 4UMPA 2FB8A 3CKXA 3Q6UA 4CG9A 4WRGA 4KBKA 3V5WA 4Q2AA 4IVCA 2UUEA 1URCA 3FZTA 3ENHA 3VRYA 5JZNA 2QONA 3DXNA 4JIAA 2IVVA 4IANA 5JFVA 3KVWA 4EHVA 2C30A 4JG6A 4BDIA 2C3LA 3B2WA 3MFTA 4JJRA 4JQEA 1JSTA 1SMHA 4JVGA 2IVTA 1W83A 4KRDA 3GU6A 4GG7A 3R8UA 4CD0A 2C6DA 4C33A 2J0MB 5HLPA 5L2IA 3RM7A 4IDTA 2ETRA 4JAJA 4XBUA 3G90X 4M67A 2B0QA 4F1MA 1S9JA 4F7SA 1NVQA 3C4XA 3MW1A 2VTRA 2WMSA 3FC2A 3KB7A 4FSQA 3BGQA 5E8WA 3ORZA 3UODA 3FLZA 2A4LA 3F7ZA 3GFEA 1XJDA 5HE3A 4ZJJA 4IE9A 3PSCA 3BLRA 3BGZA 4AS0A 4F9BA 1GZKA 4FICA 2RG6A 4G5PA 4NSTA 2EB3A 4EH6A 1M52A 2GHGA 2QODA 2WEVA 2PMLX 3AD6A 2PWLA 2W1FA 3DZQA 4GL9A 5CEKA 4U40A 5CYIA 4E5WA 1M7QA 4TL0A 2W1DA 2JFLA 2QOOA 3BQCA 2VO6A 2X0GA 3TTIA 4EZ3A 5I9XA 2XK4A 4U3YA 5AR2A 2IWIA 1Z5MA 3R8VA 3ZEPA 3N4VA 4JX7A 3AC4A 3GCQA 4E1ZA 4CG8A 5CSWA 3UVQA 3COIA 2ITQA 3HRBA 3C5IA 1K2PA 2WFYA 4YJSA 4WRSA 3MH1A 4DCEA 5JZJA 3MFSA 1XH6A 3AD4A 4F9WA 3E88A 1VR2A 2WOUA 4HPUE 5DT4A 5A14A 5EDQA 3U6IA 4R1YA 2R3HA 4PY1A 2G2HA 3K3IA 5HE1A 4C02A 4EHZA 2YJSA 3NPCA 2XB7A 3WILA 2UZWE 4FV0A 3R1YA 3RK7A 2BMCA 3C50A 3GOPA 4M14A 2VWUA 3TKIA 3LFAA 2VZ6A 4I4FA 2VUWA 4LM5A 3QQLA 3C1XA 5DBXA 4ACHA 3QTXA 1H8FA 3KK9A 5HO6A 5TOZA 3E63A 3EQRA 2B9FA 2V0DA 3EIDA 3F3UA 3FSFA 4HCVA 5DEYA 3U9NA 3W32A 4ARKA 5KKRC 3EFWA 5CXHA 5C4KA 2VTNA 4IAZA 4AOIA 5IG1A 3U9CA 4NKAA 4J53A 3Q9XA 3T8OA 4U80A 4LOPA 2QOFA 2UZTA 3W18A 2VRXA 3U4WA 5DR2A 2Y9QA 2BRMA 4EKLA 3VUIA 1SVHA 1R0EA 3AT3A 3GUBA 3HZTA 5CTPA 4RX7A 5J1WA 2GTNA 3R0TA 3VNTA 4GJ2A 2W1GA 2UZEA 5AAGA 4YTFA 3SXFA 3TUCA 4QPSA 4U44A 3LQ5A 3IQ7A 4O0TA 4AGWA 4FT9A 5IMEA 5JFSA 4FV4A 5DVRA 5EG3A 3BPRA 4U79A 3TZ8A 5IMXA 1FGIA 4MWIA 4O6LA 4AA4A 2O8YA 3CQEA 5E8TA 4NM7A 4K11A 5AUVA 4G9CA 5EM5A 3AQVA 3HMOA 3TV7A 3WYXA 2GQGA 2J90A 4X2JA 2XBAA 2RSVA 1FVRA 3IECA 3UQFA 3ZLYA 4IEBA 2IW6A 3BYMA 4G2FA 5LXMA 4BI1A 1BKXA 3RPYA 3MA6A 2QOBA 4DN5A 2GU8A 2B55A 1H25A 5H8EA 2J2IB 3KULA 2G1TA 5E8ZA 3BHTA 2VWYA 3BHYA 4I6QA 1FINA 4RZWA 3V6RA 4PDYA 2EXEA 4TWNA 2J4ZA 4BL1A 2YEXA 2OBJA 4BDFA 2WMRA 5AR3A 1FVVA 3FJQE 3HLLA 4FTCA 5L6WL 2QOCA 5AV3A 1OB3A 1JLUE 1AD5A 3F2RA 3O51A 3FUPA 2PMNX 4A9RA 4NIFB 4O96A 4QNYA 1ZY5A 3R04A 2VTTA 3UO5A 2WNTA 1ZAOA 3C4ZA 3ZLWA 1OL6A 3QTRA 4FTAA 5LMAA 4C58A 4BKZA 5I4NA 2V22A 2BRHA 3QKKA 4RC2A 3V8WA 3NUAA 2OKRA 4GT3A 2HZ4A 4O0WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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