5M4IA

Complex structure of human protein kinase ck2 catalytic subunit with the inhibitor 4'-carboxy-6,8-chloro-flavonol (flc21) crystallized under high-salt conditions
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
GPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
publication title Structural Hypervariability of the Two Human Protein Kinase CK2 Catalytic Subunit Paralogs Revealed by Complex Structures with a Flavonol- and a Thieno[2,3-d]pyrimidine-Based Inhibitor.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 331
sequence length 331
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5m4iA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5m4iA02
5LCJA 5GZ9A 4TZRA 3VN9A 4M0YA 1OM1A 4O0UA 2F49A 2YM6A 4PY1A 4EK5A 3GEQA 4GT4A 3W8LA 4JG8A 5JRQA 2QU6A 3BX5A 2C3KA 2G15A 5F1ZA 1XH9A 5FWKK 1URWA 3R8MA 4WA9A 5E7RA 2ZOQA 3NPCA 4IXPA 2GNIA 4O0YA 2ERKA 4EEVA 2W1FA 3GCPA 2VTMA 3M42A 3OOMA 4WOVA 1NW1A 3EFJA 1Q5KA 2W1GA 4JQEA 5GJDA 1TQIA 4G3CA 3E8EA 4PMTA 2B4SB 4MD7E 4JBQA 2PVFA 5BUJA 1SVGA 4LOOA 2P2IA 4FGBA 4IB3A 4EYJA 2PUIA 4NFMA 5HIDA 4RMZA 1XH7A 3PYYA 2G2HA 4JDJA 4U79A 4XRJA 5HTBA 4YPDA 2VTSA 3K3IA 4CFMA 4AFEA 2R9SA 3PZEA 4MNEA 2VNWA 2WTWA 3R2BA 4MTAA 4XG9A 5K5XA 2GHMA 4RIYB 4FGRA 2RFSA 4TYIA 2J5FA 4R5SA 4C4HA 4UBAA 4YC3A 4NM5A 3FMKA 3E63A 1YXXA 2CCIA 3K2LA 3MH3A 4LMNA 3RPVA 5A3XA 3UOKA 4QQTA 4U6RA 3UC3A 1YHVA 3ZU7A 3MESA 2VTHA 4NT4A 4HVGA 4E26A 4LUDA 4II5A 4R7HA 4CTCA 3KMWA 3SW4A 4MQ1A 3CR0A 3L9PA 1H0VA 2IZSA 2RGPA 3LQ3A 1B38A 4DG2E 1OKZA 2ZB0A 3KF7A 2QKWB 3BHYA 2HAKA 2VWXA 3FLSA 3FLWA 4YZMA 4U8ZA 1K2PA 3I79A 5HX8A 3UZTA 3II5A 1YXTA 5I3RA 3FV8A 2HZ4A 2VNYA 4E7WA 5E8WA 5HQ0A 2FSLX 4PV0A 3Q9XA 4D28A 2QOHA 2PL0A 4L7FA 4NM7A 1ZZLA 3QZGA 4AW1A 4BL1A 4HOKA 4NEUA 2PZRA 2WTVA 3KULA 4XS2A 2UZVA 2WTJA 3KA0A 4ZJIA 3CY3A 4ZSJA 3OY3A 1KE8A 5FDPA 1K9AA 3O8PA 4PTEA 1AQ1A 4WSYA 4O7VA 5GZ8A 3UO4A 3KCFA 4NTTA 5FDXA 1ZYLA 3FI8A 5GJGA 2XRWA 1IEPA 3PY0A 5HCYA 2ITNA 4I0TA 3RK7A 4D1XA 2XNOA 4DLIA 2OICA 5T3QA 4CRLA 5A46A 3AMBA 5H3QA 1DI9A 3NW7A 4M69A 3TZ8A 3FI4A 3OY1A 3GBZA 4D0XA 1W98A 3UQFA 3QWJA 2ZAZA 4DTBA 1PW2A 3F7WA 4TXCA 5L6OA 4WBBB 3WIKA 4FZDB 3EKKA 3QTWA 5CF5A 5IUGA 2E9NA 4RWKA 5B7VA 4ANBA 3UOLA 5D7AA 3EKNA 2I1MA 4C35A 2VTQA 3I1AA 3TNWA 5AAGA 1IASA 2AUHA 4PP9A 4JIKA 3F61A 3UPZA 4MHAA 5HG8A 5HLWA 2FH9A 1XBBA 3NW6A 2C5VA 5HVJA 1S9JA 5FLFA 2E2BA 2BVAA 2PE2A 1QPCA 4DG3E 5C1QB 2B1PA 3K54A 4JDIA 4AN3A 4FT0A 4HNIA 3HVCA 4HJOA 1L3RE 4ZZNA 3NZ0A 2J5EA 3WZKA 1A48A 2UZEA 4FEXA 3BLHA 3BV3A 1ZOHA 4EC8A 4C62A 1RQQA 4CXAA 5CU3A 2C6KA 3B8QA 5I5ZA 3MN3A 4TYJA 5CEMA 2X1NA 4DTKA 3ZOSA 3VAPA 4RC2A 3PXRA 5HNIX 2ITOA 3NMUF 3NUPA 2UZBA 1WBSA 4FTJA 4RVMA 5CSHA 3IECA 3SX9A 3O17A 4BGHA 1OKVA 3PVUA 4KIOA 5BVNA 3ORZA 4UN0C 2RFDA 4UZDA 4QTAA 1E1XA 4AT5A 1YDSE 4KA3A 3WI6A 2OSCA 3WF8A 4H58A 3RALA 3W16A 4DG0E 1PXOA 3OXTA 3VBYA 5TF9A 2PSQA 3I7CA 5DT3A 3GT8A 1ZLTA 2XMYA 3ZH8A 5HZNA 3D94A 3P1AA 3VJOA 4FG9A 4HYSA 4O2ZA 3HV5A 3DZQA 2WIPA 3ID6C 4QP9A 2OZOA 1Q8UA 2X6DA 4MH7A 5CTPA 5KUPA 2ITVA 4IAAA 5AP4A 3PJ3A 3ENMA 3A60A 3T3UA 4R1YA 4I6BA 2G2FA 3V8TA 4GUBA 5HO8A 4RJ6A 4OLIA 3OTVA 5HO7A 1WBWA 1KOAA 5DMZA 3MPTA 3GC7A 5ANGA 4D5KA 4DEHA 4BF2A 5C03A 1UNGA 5FEDA 3LJ0A 4FKQA 1I09A 2VWVA 1H07A 4HVSA 1GJOA 2XKCA 2W4JA 4JBPA 5KHXA 2QO9A 5AWMA 4BCNA 3F6XA 1U54A 3BWJA 3TTIA 1SVHA 4TNBA 4FTOA 4AE6A 2YLFA 4YUQA 4E20A 5IF1A 3S1HA 3E3PA 4OTHA 2BALA 3W55A 1XBAA 4AT4A 3NIZA 3V5WA 2W7XA 1YVJA 3PZHA 3REPA 4BR3A 3N51A 3WZUA 3MJ1A 4W8EA 5DNRA 3HDNA 5FTQA 5DG5A 4WG4A 4W4XA 2PUNA 2JKMA 5BMSA 1X8BA 3EQBA 2WQNA 3PIZA 3RWQA 1H1WA 4CFNA 1ZYCA 2Z7QA 3NUUA 2R3GA 3ZXTA 4RVTA 2B7AA 4TT7A 3UC4A 2Z2WA 3DKGA 4A06A 3VW8A 4BDAA 4X2KA 4BFMA 5HEZA 3VULA 1RW8A 4D1SA 4E1ZA 4EL9A 3FL4A 2GS2A 4PF4A 1FMKA 2R7BA 3GXLA 3QKMA 2DQ7X 1OBGA 3TZ7A 5CI6A 2FUMA 2H34A 4IJPA 1XR1A 1KSWA 3C4WA 4KKEA 1XH4A 4PTGA 3U55A 1PXMA 3ZFMA 4BN1A 4EH5A 1DI8A 1JKLA 4XCUA 3WYXA 3ZMMA 2ZV9A 4MXOA 4QT1A 5IH6A 4E4MA 3AC8A 4KINA 2CGWA 4F70A 5L8KA 3V5TA 5T68A 3UG2A 4HYHA 4RZWA 3RZFA 5IQGA 3UDBA 2QCSA 5IQCA 3HX4A 3ZEPA 3ZZWA 4RJ5A 4PPAA 2VWZA 4Y73A 5HI2A 4ASDA 4J96A 5EHOA 4AGUA 5I9ZA 3KK9A 3L8PA 4KKGA 3IW5A 4NKAA 2PVJA 4GFGA 4N4SA 4V0GB 4HZRA 5CWZA 3O7LB 4UMUA 3PJ2A 4JX7A 3NW5A 5AR8A 2LGCA 5AP6A 3R7UA 5AFVA 3HAMA 4JG6A 3SOAA 2NP8A 2BDJA 3VBQA 3TDVA 1Q41A 2QHNA 3DA6A 4ID7A 5AADA 2BTSA 4C4IA 2YERA 3EQCA 1OGUA 5EDRA 3D2KA 1ZY5A 4AX8A 1OZ1A 2XKDA 5M4FA 4MK0A 5AUUA 2H8HA 2YDIA 3OT3A 4JDHA 3PJ1A 3DXPA 3FZOA 3JVRA 1XWSA 3LZBA 1MP8A 4LRMA 4X0MA 4CKIA 5EG3A 4DHFA 4FKWA 5AIKA 4KBKA 1T45A 3PSCA 1NVRA 3OBJA 4MCVA 4ZXTA 4YJSA 2Y8OA 2GTNA 4AGDA 4FTLA 3A2CA 3UG1A 4QP8A 3TNIA 4O81A 4J98A 4QPSA 3ZEWA 4JR7A 4XH6A 4FBXA 4LG4A 3UIBA 2GNGA 3BZ3A 3EIDA 4LRKA 4FEQA 3TN8A 5IA5A 4UX9A 4F0GA 1J1BA 2BHHA 5ETCA 3NLBA 3DTCA 1UV5A 4X2GA 3RCJA 3H0ZA 4LGGA 3VRYA 2C5XA 4O21A 1OKYA 4NH1A 4DC2A 1M17A 2BMCA 1APME 4TW9A 4BDFA 3MV5A 5BUEA 4G9CA 3VS3A 5IUHA 3QQFA 5K0XA 5JZJA 4G3FA 1ZY4A 3SW7A 5GNKA 5JFWA 3W2SA 4FSNA 3ZRMA 2XM8A 4IWPA 3R8UA 2GHLA 3R1YA 4YHTA 1YQJA 1ZMWA 4Z55A 4E6CA 3Q4UA 3TCPA 1OL2A 4FTTA 1XQZA 5JFSA 1YXVA 3TJCA 3NAXA 1JLUE 3UE4A 3EQRA 3TNQB 5FM3A 2OJ9A 4TYGA 4XLIA 4B0GA 4WUAA 2QNJA 2X6EA 2V7OA 4L42A 3NRMA 2HWPA 5A14A 4R1VA 1MQ4A 4OT6A 3E87A 4B8LA 3PY1A 4FOCA 3D5UA 3JY9A 4CFUA 2BDFA 4M8TA 2ZV2A 3PTGA 1OIRA 3LW0A 4PL5A 3DJ7A 3HMPA 2UW5A 4G31A 5AUWA 2CKPA 3AMAA 4E5BA 4WG5A 4EHEA 5AA8A 4ALUA 5J9ZA 3D5WA 3QXOA 1YXSA 3SVVA 1A9UA 5KBRA 4TTHB 2GQGA 3G6GA 3POOA 3CE3A 3F2AA 3SHEA 3IW6A 4F0IA 1P4OA 1GIJA 3G9LX 4CGAA 3R2YA 4GRBA 3TUBA 3LFBA 2IVSA 4QPMA 2YJRA 3Q04A 3PPKA 4GVJA 2CMWA 2X39A 2O8YA 3U6IA 4HGEA 4GU9A 4C3RA 4FVRA 5BYYA 2OW3A 3DFCB 4U0IA 3TWJA 4KIQA 4C34A 4XV1A 3D5XA 2VGOA 4QQJA 4CFVA 4EZ3A 5ANKA 3PY3A 4USEA 1H1QA 1YHSA 3BU6A 3NEWA 3PIYA 1U5QA 3FXXA 3VF8A 3KRLA 1AGWA 2HOGA 3RHXA 4PUZA 5HHWA 2C3JA 4GKIA 3OROA 4DH5A 1UU3A 3AMYA 4FV8A 4RBLA 4XBRA 2YA9A 3ERKA 3UO6A 1U54B 2JLDA 4FF8A 3ZSIA 3OC1A 3RJCA 5IMXA 3F5GA 5DA3A 5LVOA 4O82A 3HDMA 5IDPA 2F4JA 2WOUA 3DKOA 3QYZA 5L2IA 1AD5A 4QTDA 3WYYA 4XJ0A 5AP3A 2W5BA 4A4LA 2R3MA 4P4CA 4U45A 5ANDA 4J53A 4XV9A 4YJTA 4XX9A 5CYIA 4ZSAA 5HCXA 5JKGA 3G90X 4I6QA 4E93A 2J7TA 3D15A 3E3BX 3TNHA 4E5WA 4RRVA 3AD6A 3I4BA 2QOLA 4QMLA 2J50A 3WZJA 4C02A 3FAAA 5EKOA 3FLYA 2AC3A 2PVNA 3GFWA 3LLAA 2I0EA 2XUUA 2ZDUA 4ITHA 3KRRA 4EKKA 5J5SA 2Z02A 2VWUA 4K9YA 5DPVA 3NVMB 5KO1A 2Z7RA 4UWCA 4BRXA 2GQRA 3O96A 2I0YA 2FA2A 3C4XA 1BI7A 3HRCA 3R9HA 2YISA 3I6UA 4QNYA 3RPRA 3DLSA 4RJ7A 3MGYA 5J8IA 5GJFA 4AZSA 4KNBA 3OWPA 4FUXA 3AT3A 1JKTA 3AD4A 3KRXA 1FVRA 3DB8A 3FBVA 4EOPA 4W4YA 3VBXA 4IM2A 2W5HA 2XYNA 4FV7A 4QMPA 4DAWA 3H10A 5L6PA 1YRPA 4O1PA 4MXZA 4OTGA 4GT5A 2RIOA 3ZDIA 4A7CA 2WTDA 4FIFA 4UMQA 5AUXA 1CTPE 2UZDA 2J4ZA 3EL7A 4TRLA 2C69A 4JT3A 3U4UA 4MX9A 5GHVA 1SZMA 3SXFA 4PMPA 5BNJA 2EVAA 4DEDA 3MWUA 3ORXA 4IAYA 3PIXA 1HCKA 3FZTA 4AA5A 3D83A 4AU8A 4K18A 3ORLA 4O1OA 4RFZA 4ZEGA 3ROCA 4WNPA 3OZ6A 4BCIA 5DRDA 3FLZA 3PE2A 4EHGA 3MVMA 2PU8A 2FSTX 5KHWA 2B52A 4A9RA 3D7TA 5FXSA 3NCZA 3ODZX 3WZDA 3MIYA 1O6KA 2NRUA 3FKNA 4XP2A 5JH6A 2BKKA 3PDTA 4L52A 5AR3A 3QTIA 2VZ6A 2BIYA 3DNEA 4L3JA 4RIYA 4RZVA 5EYCA 3RZBA 3W2QA 4ANNA 4XLVA 4KUJA 3AC3A 3EB0A 4O0TA 5J7BA 2OBJA 4BWXA 5KE0A 1H24A 4QTEA 4O84A 3Q4TA 4Y5HA 4BBMA 4D9TA 3DGKA 4X3FC 4DEBA 4EOQA 3NDMA 4Z9LA 3IGOA 3GCVA 5AV4A 4PL4A 3ULIA 1JPAA 3Q53A 2Y4IC 1H25A 4RA5A 5ETFA 1WMKA 2ZM1A 3P7BA 3D14A 3ZUUA 3I5ZA 1W0XC 3CEKA 4L45A 3S95A 5E91A 1Q97A 3BGZA 4BBFA 3LFDA 1ZAOA 2BTRA 4K1BA 4HW7A 1REJA 4F0FA 3R8PA 5IISA 4UWYA 3LFEA 4EH7A 3KL8A 4D4SA 2PMLX 5BVWA 3GENA 4AA4A 2X4ZA 3DK3A 2A2AA 4GL9A 3I7BA 2PK9A 5J87A 4IJ9A 3V3VA 3FXWA 1GY3A 3EQFA 2J0KA 4WRSA 4RX9A 4IANA 3QUEA 4ZS0A 2XYUA 5C01A 5J9LA 3N4TA 1TQMA 3HP5A 2F7ZE 4G6LA 3GQLA 1MRVA 2E9VA 4J97A 5LCKA 4C0TA 2UVYA 4F7JA 1O9UA 1UWJA 2YHVA 3ANQA 3ZZEA 3L8SA 2VTTA 3O51A 2O65A 4RX7A 4BCKA 1GIHA 3CTQA 3TV6A 3UNJA 4FYOA 3IG7A 4QYEA 1MRUA 5DFPA 1SYKA 3QTXA 1WVYA 3BELA 4JRNA 5TKDA 4IQ6A 3QAME 4AA0A 3BHTA 3PWDA 4U40A 3CCNA 5E92A 3ELJA 2HYYA 4USDA 2HY0A 1M7QA 4ZZOA 5AP1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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