The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
111
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structure length |
93
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Chain Sequence |
NSEVIKDLYEYLCNVRVHKSYSGLWFDISQGTYSIMDYKLGFVEVIYAPVLKQRSTEELYSLQSKLPEYMFETLSFPLSSLNQFYNKIAKSLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The Monopolin Complex Crosslinks Kinetochore Components to Regulate Chromosome-Microtubule Attachments.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Monopolin complex subunit CSM1
|
| molecule tags |
Replication
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
20
|
| structure length |
93
|
| sequence length |
111
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-05-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF12539 | Csm1 | Chromosome segregation protein Csm1/Pcs1 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Alpha-Beta Complex | Aspartate Aminotransferase, domain 1 | Aspartate Aminotransferase, domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5KTB A; 3N7N A; 3N4X A; 3N4R A; 3N4S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1CZE A; 1ASC A; 1IVR A; 4WB0 A; 4ITX A; 3JTX A; 2VMY A; 1D7V A; 4U2H A; 3ZZK A; 3NYU A; 3QM2 A; 1S0A A; 1UU2 A; 3W1J A; 2A1V A; 2Z61 A; 4IXO A; 2HOX A; 2VI8 A; 1IAX A; 2JJH A; 1TOI A; 4E3Q A; 4F5G A; 5C6U A; 4MSO A; 3EI9 A; 4BA5 A; 4CXR A; 2AY6 A; 3FD0 A; 4K2M A; 1LC7 A; 1AMR A; 2PO3 A; 4J8L A; 4A0F A; 1D7S A; 2HOY A; 2X3L A; 2DGM A; 4PFN A; 3WKR A; 4JEV A; 4XJP A; 2ZJG A; 3G7Q A; 4A0R A; 4MY5 A; 1AAW A; 1AJS A; 3I5T A; 1QIR A; 1AHG A; 1VJO A; 1KL1 A; 4WYC A; 4OYT A; 3DR7 A; 2VLH A; 4DQ6 A; 3WZF A; 2NMP A; 2ZUK A; 2DGK A; 3BV0 A; 4UOY A; 1V2F A; 1UU0 A; 5D5S A; 4WXF A; 1M0O A; 4ATP A; 1E5E A; 5DB5 A; 2D7Y A; 1G4X A; 4BQ0 A; 1TAT A; 4OBU A; 1SPA A; 2EZ1 A; 2Z1Y A; 1YJY A; 1MDO A; 1QIT A; 2JIS A; 2CH1 A; 1QGN A; 1YAA A; 4A0G A; 1RV4 A; 5G4J A; 1MDX A; 3AEN A; 3MKJ A; 2HP2 A; 3JW9 A; 3A8U X; 4W1W A; 4WLJ A; 2Z9W A; 5G2Q A; 4QGR A; 3CQ6 A; 1SZS A; 1AJR A; 2XH1 A; 3NYS A; 2R2N A; 1BJN A; 3PDB B; 1ARG A; 3MBB A; 3RBF A; 4CVQ A; 1CL2 A; 3BCX A; 3ELE A; 1EJI A; 1C0N A; 4KYO A; 4MQQ A; 4OTL A; 5FT8 A; 2VGS A; 3DZZ A; 3ISL A; 1AIA A; 1QJ3 A; 1B8G A; 4OCA A; 1KMK A; 4F5L A; 1W3U A; 4RM1 A; 3E6G A; 1M6S A; 2VMQ A; 3B1C A; 4N0W A; 1LW4 A; 2AY3 A; 3D6K A; 4I8A A; 4RAE A; 2W7L A; 4OMA A; 1TOK A; 4XJL A; 3PJ0 A; 1PG8 A; 4WBT A; 1ASD A; 4ISY A; 3N5M A; 1BS0 A; 4ZAS A; 3WCN A; 3QBO A; 4WYA A; 1XEY A; 4UHN A; 2FQ6 A; 4F5I A; 2C44 A; 1V2E A; 2CJD A; 2WK7 A; 3CQ4 A; 2BYJ A; 2V1P A; 3R9A A; 2VI9 A; 2YCN A; 3EI8 A; 3LVM A; 3NRA A; 3AEM C; 1IBJ A; 3DC1 A; 1O62 A; 5IWQ A; 4EU1 A; 2FNU A; 2Z1Z A; 1B5P A; 4JEW A; 4B98 A; 4ADC A; 1DJU A; 3I16 A; 3L8A A; 4XQ2 A; 1C7G A; 2DGL A; 1ZOB A; 4GDY A; 3RQ1 A; 1TOJ A; 3TFT A; 1AHX A; 1IX6 A; 1V72 A; 4AO9 A; 1J04 A; 1GEX A; 4AZK A; 4HVK A; 1MDZ A; 2VGV A; 2YCP A; 1YIY A; 4CBS A; 2O0R A; 2PB0 A; 1EG5 A; 2W7M A; 4E1O A; 1CQ6 A; 1B4X A; 3W1H A; 5HHY A; 1BJO B; 1BQA A; 1DTY A; 3FVU A; 4P3M A; 4R5Z A; 2GQN A; 2FYF A; 2OAT A; 3ZRQ A; 1SF2 A; 3Q8N A; 1AIC A; 2CAN A; 4Y0I A; 5M4D A; 2HP1 A; 2D66 A; 1Y4I A; 1FC4 A; 2GSA A; 3ZRR A; 3BB8 A; 3FFR A; 2VIB A; 3ELP A; 3P1T A; 3PIU A; 1GC0 A; 5M49 A; 2EYQ A; 3ZZJ A; 3LWS A; 4RJY A; 3BWN C; 3GZD A; 9AAT A; 4PIW A; 5EIG B; 1VP4 A; 5EFS A; 1CL1 A; 3GR9 A; 4XEW A; 2OQX A; 4F5M A; 1FG7 A; 3N7N A; 2DKJ A; 1AHE A; 4WXG A; 4GE7 A; 2QB2 A; 4OT8 A; 4RJ0 A; 3MEB A; 3JWB A; 2YOB A; 2BI9 A; 4P7Y A; 3DRD A; 4W5K A; 3EUC A; 1WYT A; 1GEY A; 4B9B A; 1FG3 A; 4TMR A; 2CJH A; 1I41 A; 1CQ7 A; 1ASG A; 1I48 A; 1S07 A; 2YCT A; 1LK9 A; 1RV3 A; 5F8V A; 1M0N A; 1T3I A; 2D63 A; 3ASA A; 1Z7D A; 3FVX A; 1M7Y A; 3GWP A; 3UAK A; 4JF0 A; 1KKJ A; 1TOE A; 1EQB A; 4MKJ A; 1OHY A; 1O61 A; 3I4J A; 3LG0 A; 2VIA A; 1C7N A; 2VMO A; 3LY1 A; 2EGY A; 4IXZ A; 1N8P A; 2AY5 A; 1DGE A; 4RIT A; 3FZ8 A; 4LW2 A; 2HUF A; 3VK3 A; 3QGU A; 4IW7 A; 1O69 A; 4ZAH A; 5FT4 A; 2BWP A; 3WGC A; 1SVV A; 2YKU A; 1GCK A; 4A6R A; 5BJ3 A; 1BQD A; 3B1E A; 2C81 A; 4ADB A; 3VP6 A; 3WKS A; 3PA9 A; 3WGB A; 3VAX A; 4WYG A; 1PFF A; 1GC4 A; 4ZLV A; 2R5C B; 1ASE A; 1AY4 A; 1X0M A; 2AY2 A; 2DKB A; 2HOZ A; 3CBF A; 4IYO B; 3E9K A; 4O6Z A; 5HXX A; 1PMO A; 1PMM A; 3AAT A; 3R4T A; 1M0P A; 2V0Y A; 3BN1 A; 3RCH B; 4ZSY A; 1BJO A; 2FKI A; 4ZM3 A; 5EUD A; 1YIZ A; 1ARI A; 2D65 A; 1BKG A; 3JZL A; 2X5F A; 4ZDL A; 2R5E A; 1M0Q A; 4AO4 A; 1ASF A; 1KMJ A; 3PDX A; 1IAY A; 1W7N A; 2HUI A; 3NU8 A; 3NUB A; 2W7I A; 4RLG A; 2AEU A; 2D7Z A; 5EQC A; 5E5I A; 1M4N A; 3WLX A; 1MGV A; 4OBV A; 2QA3 A; 3ECD A; 5BJ4 A; 4Q76 A; 3A2B A; 3WCO A; 4PVF A; 3E2Z B; 2O7C A; 5EIG A; 3VK2 A; 4A0H A; 3K40 A; 1AMQ A; 1UKJ A; 1ARH A; 3CQ5 A; 2ZSL A; 3MAU A; 2Z9U A; 1CZC A; 1YNU A; 3AV7 A; 2CST A; 4K05 A; 1B9I A; 2W7E A; 2GMU A; 2BI2 A; 3AOV A; 4AZJ A; 1GDE A; 3F9T A; 1S09 A; 1RVY A; 4KXK A; 4R8D A; 1DJ9 A; 4BHD A; 2ZY3 A; 1S06 A; 3AEM A; 3BC8 A; 5D95 A; 3UE8 A; 3LVL B; 3HMU A; 4UHM A; 1S08 A; 1WKH A; 2KFP A; 2D5Y A; 1AIB A; 4PFF A; 4W8I A; 3PD6 B; 2E54 A; 4FFC A; 3HLM A; 4NOG A; 2YKX A; 2BI5 A; 4WYD A; 4XJO A; 2BYL A; 1JG8 A; 3DOD A; 4MQP A; 1AHY A; 3AEJ A; 4XJM A; 4MKK A; 2AY4 A; 4W91 A; 4CXQ A; 4Y0D A; 1KKP A; 1ELU A; 1WYU B; 2BIG A; 3FQA A; 5KTB A; 3QI6 A; 2CIN A; 3LVK A; 2CH2 A; 1CS1 A; 2CY8 A; 2YKV A; 3B8X A; 3NUI A; 3TQX A; 4ZWM A; 4DBC A; 1ART A; 3HQT A; 3QN6 A; 1P3W A; 3F0H A; 1OAT A; 3FZ7 A; 4EB5 A; 2R5C A; 2ORD A; 3BWN A; 3USF A; 3DR4 A; 2QBT A; 4H63 Q; 3N4R A; 1AKA A; 4IY7 A; 1H0C A; 2Z9X A; 3A9X A; 1D2F A; 1JS6 A; 2W8U A; 2C7T A; 2AY1 A; 3GZC A; 3EI6 A; 4WB0 B; 1X28 A; 1SFF A; 5EAV A; 2Z20 A; 3MAF B; 4Q6R A; 5AX8 A; 4HF8 A; 4DGT A; 1OHW A; 2O1B A; 1O4S A; 3TAT A; 4ZDP A; 3N0L A; 5FT6 A; 3E2Z A; 1MAP A; 3FQ7 A; 4W1V A; 1QZ9 A; 1GD9 A; 2CTZ A; 3ASB A; 1LC5 A; 5EAA A; 1U08 A; 1DKA A; 1B5O A; 1JF9 A; 1G7W A; 1YOO A; 2W7K A; 4WP0 A; 5DX5 A; 1AJS B; 3PDB A; 2VMS A; 3A9Z A; 1C9C A; 1E5F A; 4AH3 A; 5G09 A; 4LC3 A; 2DOU A; 3K7Y A; 4FL0 A; 4M2J A; 4JEZ A; 3DU4 A; 3KE3 A; 3MC6 C; 3W1I A; 2YRR A; 2BI3 A; 1LW5 A; 2VGW A; 4A6U A; 1I43 A; 2YKY A; 1CJ0 A; 1AHF A; 4RKC A; 4WYE A; 2AEV A; 3BS8 A; 3HBX A; 3PD6 A; 2WK8 A; 5DJ1 A; 2E7I A; 2JJG A; 3G0T A; 5F9S A; 5K8B A; 3G8M A; 2D61 A; 2JJE A; 2ZC0 A; 4IX8 A; 3AEN B; 4ZDO A; 3FSL A; 4KAM A; 1OXP A; 1DJE A; 4WD2 A; 3FVS A; 1YJZ A; 3TFU A; 4J5U A; 1BW0 A; 2G7J A; 5JAY A; 3II0 A; 1WYU A; 4GRX A; 1XI9 A; 4U1T A; 4WYF A; 1QJ5 A; 2CFB A; 5E3K A; 1N31 A; 3RUY A; 2YHK A; 4LNJ A; 3HT4 A; 2VYC A; 1UU1 A; 3KGX A; 1G7X A; 4TN4 A; 5TF5 A; 2W7D A; 4JEX A; 5G2P A; 3GET A; 3KGW A; 4M2M A; 3NNK A; 1TAS A; 4L0O A; 2W7G A; 1ELQ A; 3N75 A; 3TCM A; 1N2T A; 4Q75 A; 1LKC A; 1LC8 A; 5EUE A; 5G0A A; 3MAF A; 4RIZ A; 3B1D A; 1JS3 A; 2RFV A; 1WKG A; 4JEY A; 2W8V A; 3EIA A; 1WYV B; 5FT5 A; 2JG2 A; 2EPJ A; 2W7H A; 2ZP7 A; 2PB2 A; 1IUG A; 2W8J A; 4UQV A; 2BHX A; 2VGU A; 4K2I A; 3N4X A; 4CBR A; 1IX8 A; 3ACZ A; 1B9H A; 1AAM A; 1I29 A; 2OGA A; 2VMZ A; 1KL2 A; 1AKC A; 2VMU A; 3ATH A; 3FRK A; 4K2B A; 1ASM A; 4ATQ A; 4F5J A; 1AKB A; 1BJ4 A; 1C7O A; 1TOG A; 3EI7 A; 5M46 A; 4F4E A; 4GE4 A; 1ASL A; 4LNL A; 1GC2 A; 3FTB A; 3L44 A; 5HDM A; 2BIE A; 2W7J A; 4GEB A; 3WX9 A; 4A6T A; 4XAU A; 2VMV A; 3DYD A; 5E4Z A; 1MLY A; 4ZSW A; 2E7U A; 2VMN A; 3F6T A; 3OKS A; 2VMX A; 2W8W A; 1SZK A; 4E77 A; 2BWO A; 2ZYJ A; 3H9X A; 4F5H A; 2QMA A; 3RBL A; 2JGT A; 2BWN A; 3HVY A; 4H51 A; 3VOM A; 1M32 A; 3M5U A; 2Q7W A; 1AMS A; 1BT4 A; 4ADE A; 1MLZ A; 1G4V A; 2QSR A; 3IHJ A; 3QPG A; 4LNM A; 4R2N A; 4BA4 A; 4EFF A; 1J32 A; 1IJI A; 3EI5 A; 1GEW A; 4A00 A; 3K28 A; 2AY9 A; 3N4S A; 2QLR A; 1X2A A; 2VGT A; 4XK1 A; 1DGD A; 2EH6 A; 1MAQ A; 4ZM4 A; 2XBN A; 2ZY5 A; 1D7R A; 1AX4 A; 2GB3 A; 3KKI A; 1WYT B; 5J8Q A; 2G6W A; 3BWO A; 3EIB A; 3FDD A; 2FNI A; 3MAD A; 3FKD A; 3OP7 A; 2OKJ A; 4ADD A; 1AY5 A; 1ZC9 A; 2VMP A; 2R0T A; 3AEO A; 3FCR A; 3FQ8 A; 4IYO A; 1WST A; 2DR1 A; 2VMT A; 1CQ8 A; 2ZSM A; 2EZ2 A; 4IXS A; 1D7U A; 1IX7 A; 3BCA A; 3RCH A; 2C0R A; 3LVJ A; 2HOR A; 3LV2 A; 4ITG A; 4RKD A; 2GMS A; 8AAT A; 1WYV A; 2BIA A; 3MC6 A; 2VLF A; 3FZ6 A; 4Y0H A; 2YRI A; 2OKK A; 3A9Y A; 2W8T A; 3PAA A; 3EZ1 A; 3QHX A; 4OC9 A; 3E2Y A; 1ASA A; 1SZU A; 1Z3Z A; 2CB1 A; 3FDB A; 3PPL A; 2FM1 A; 4LW4 A; 4R5F A; 4F5F A; 2WK9 A; 2D64 A; 1ZOD A; 2AAT A; 2BKW A; 3RI6 A; 4EB7 A; 4EMY A; 2VMR A; 2Z9V A; 2WB6 A; 2CJG A; 2AY8 A; 3B46 A; 4A72 A; 3COG A; 1VEF A; 2F8J A; 1W23 A; 3AEL A; 2BI1 A; 1YJS A; 2FN6 A; 4M2K A; 4BMK A; 3ZRP A; 3AEJ C; 3EZS A; 3AOW A; 3HDO A; 3NU7 A; 1X29 A; 3AEP A; 1H1C A; 3E77 A; 2X5D A; 3GJU A; 1QIS A; 4E3R A; 2HUU A; 3E2F A; 1C4K A; 4GSA A; 3UWC A; 3NYT A; 2HZP A; 3NTJ A; 4UHO A; 4ZWV A; 1BJW A; 3HL2 A; 1DFO A; 2ZY4 A; 3NX3 A; 4W1X A; 1W7M A; 5M4B A; 1RVU A; 5EUN A; 4WXB A; 3GSB A; 2W7F A; 1ASN A; 2ZY2 A; 5G4I A; 2VMW A; 3NDN A; 2E7J A; 3BCB A; 1AY8 A; 2AY7 A; 2WKA A; 3CAI A; 3VK4 A; 1GBN A; 3PGY A; 1ECX A; 7AAT A; 1OHV A; 2VGZ A; 3JWA A; 1AMA A; 4JF1 A; 4F5K A; 1LS3 A; 3P6K A; 3GBX A; 4AOA A; 1TPL A; 5DJ9 A; 2JJF A; 3H7F A; 2QB3 A; 4Q31 A; 1ARS A; 1ORD A; 3FFH A; 2EO5 A; 4WLH A; 3WY7 A; 1ASB A; 1OXO A; 4MQR A; 1KAF A; 2OGE A; 2X8U A; 3T32 A; 4GE9 A; 5I92 A; 3DXV A; 3DXW A; 1W7L A; 1GC3 A; 3GZD C; 2TPL A; 1V2D A; 1TAR A; #chains in the Genus database with same CATH homology 1CZE A; 1ASC A; 1IVR A; 4WB0 A; 4ITX A; 3JTX A; 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