The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
KKYAKSKYDFVARNSSELSVMKDDVLEILDDRRQWWKVRNASGDSGFVPNNILDIMRTPE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signal transduction
|
| molecule keywords |
EPS8
|
| publication title |
The SH3 domain of Eps8 exists as a novel intertwined dimer.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
6
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-07-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4JZ3 A; 1X2K A; 3NMZ C; 2J6F A; 1J3T A; 1I07 A; 2LJ1 A; 1HSQ A; 1UFF A; 2DBM A; 2JW4 A; 4RTW A; 2BZY A; 4J9C A; 2EPD A; 1UHC A; 1KSW A; 2B86 A; 1WYX A; 2KE9 A; 1YWP A; 1GBR A; 2CRE A; 1WLP B; 1B3Q A; 2DX1 A; 2L3P A; 4AG1 C; 3I9Q A; 1M3C A; 2PZ1 A; 2CUD A; 4J9D A; 1GCP A; 1GFC A; 2A36 A; 2W0Z A; 2JM9 A; 2P4R A; 1TUD A; 1WFW A; 3UA7 A; 2DJQ A; 2XMF A; 2NUZ A; 3U23 A; 3VS0 A; 4CC2 A; 2DA9 A; 2ESW A; 4OMQ A; 4WCI A; 1ABQ A; 1BK2 A; 1X43 A; 2L3S A; 1M30 A; 4EIK A; 1OPK A; 4OMN A; 5IXB A; 3I5R A; 2C0O A; 2MIO A; 3A98 A; 4LNP A; 1CKB A; 1AWX A; 2D1X A; 2RN8 A; 2OJ2 A; 3NGP A; 4M4Z A; 1YP5 A; 3TSZ A; 2RQT A; 4CC3 A; 1UTI A; 1N5Z A; 1B07 A; 1RLQ C; 3SHW A; 1WIE A; 1SEM A; 2F2W A; 2DBK A; 2KRM A; 2M0Y A; 1WX6 A; 2EGA A; 2KNB B; 1WXT A; 2KRN A; 2EYX A; 2O31 A; 2KXD A; 2CDT A; 5GJW B; 3C0C A; 4OML A; 2O88 A; 4ORZ A; 2HSP A; 2KRS A; 3JV3 A; 2GTO A; 4QT7 A; 1PWT A; 2LJ0 A; 2C0T A; 2BZX A; 1ZLM A; 4J9H A; 2EYY A; 2DMO A; 2EYW A; 2K79 A; 1XOV A; 1G83 A; 2C0I A; 2PTK A; 2CSI A; 4JJD A; 4RUG A; 3VS7 A; 4HVU A; 2BZ8 A; 1RLP C; 2D8H A; 4LUD A; 1UJ0 A; 1NM7 A; 1LCK A; 1NLO C; 1KIK A; 2LX7 A; 2AZV A; 1OOT A; 2CH4 A; 3QWY A; 2K6D A; 4AFU C; 1X6B A; 3M0R A; 2J6K A; 2DM1 A; 1AVZ C; 2DNU A; 5FWB A; 2HDA A; 5ECA A; 2DL3 A; 2FPD A; 2YUQ A; 2KGT A; 2HEQ A; 1UJY A; 1Z9Q A; 3EGU A; 2O9S A; 2K9G A; 2VWF A; 2DLP A; 4J9E A; 5IXF A; 2ECZ A; 1KJW A; 1AD5 A; 4AFZ C; 2ENM A; 4HVV A; 4DEX A; 2KBT A; 1VA7 A; 2J06 A; 5GJV B; 3CQT A; 1K4U S; 1M8M A; 1VYT A; 1GRI A; 3M0U A; 4RTU A; 2IIM A; 1ZSG A; 2ED1 A; 1HJD A; 4AFS C; 3ZL7 C; 1PNJ A; 1K76 A; 3H0I A; 1QCF A; 2AK5 A; 2AKK A; 2FPF A; 2MCN A; 2LMJ A; 2NWM A; 2FG0 A; 1IO6 A; 2JS2 A; 1PKS A; 1U06 A; 4F17 A; 1T3L A; 4ZNX A; 1OPL A; 1OV3 A; 1RI9 A; 1X27 A; 2ED0 A; 2KT1 A; 2K2M A; 2JT4 A; 4OMP A; 1M27 C; 3KFV A; 4LN2 A; 1X69 A; 2JTE A; 3PVL A; 3VS5 A; 3EG1 A; 1SHF A; 1W70 A; 3EG3 A; 2JMA A; 4HVW A; 2GTJ A; 3GBQ A; 1AWO A; 1E7O A; 1ZUY A; 1GFD A; 2PNI A; 2EBP A; 2DIL A; 2D0N A; 5FWC A; 1T0H A; 2YUN A; 4Z88 A; 2SRC A; 4GLM A; 2MOX A; 2CUB A; 4LUE A; 1JU5 C; 2BTT A; 2DL7 A; 1W1F A; 1HD3 A; 1V1C A; 3I5S A; 4JJC A; 1AZE A; 2KYB A; 4RTT A; 2EYZ A; 2KXC A; 5IHI A; 3EHQ A; 2M51 A; 1YN8 A; 1UHF A; 2O9V A; 1JEG A; 1H8K A; 3THK A; 2RQR A; 2O2O A; 3LH5 A; 1CSK A; 2OI3 A; 1GCQ C; 1QKX A; 1JXO A; 5IHK A; 1SRL A; 3TSW A; 2YUO A; 1AWW A; 3REB B; 1K0X A; 2RQV A; 1SRM A; 3QWX X; 1G2B A; 4IIO A; 1U5S A; 2YUP A; 1T3S A; 2JXB A; 3VRZ A; 2RNA A; 2AKL A; 1YNZ A; 3H41 A; 1T0J A; 1OEB A; 2ABL A; 1ABO A; 4LE9 A; 2LNH B; 5L23 A; 4KRT A; 4HXJ A; 3VS2 A; 2KEA A; 1UEC A; 1BBZ A; 3PE0 A; 2CT4 A; 2KRO A; 5IH2 A; 1JQQ A; 2J05 A; 1S1N A; 2A28 A; 1PRL C; 2A08 A; 1U3O A; 1QKW A; 1EFN A; 2G6F X; 1AZG B; 1JO8 A; 4J9F A; 1K0S A; 2CH4 W; 3NPF A; 3RBB B; 2LP5 A; 2D8J A; 4J9G A; 1ARK A; 4CC4 B; 1ZUU A; 1PRM C; 4RTZ A; 1NG2 A; 4D8D A; 1ZX6 A; 2DE0 X; 2DRK A; 3EG2 A; 3REA B; 4ESR A; 2GGR A; 2SEM A; 1PHT A; 1AWJ A; 2JS0 A; 1GCQ A; 4X1V A; 1ZBJ A; 4R0K A; 1NYF A; 2H8H A; 2KYM A; 1YWO A; 1Z9Z A; 1I1J A; 2LQW A; 3RNJ A; 1H92 A; 2CT3 A; 4J9I A; 2LJ3 A; 1I0C A; 2FEI A; 4AG2 C; 1QLY A; 1VYU A; 1WI7 A; 2FO0 A; 1TUC A; 4E6R A; 1KFZ A; 2DF6 A; 4JZ4 A; 4A63 B; 3TVT A; 2QDL A; 1RUW A; 2HBW A; 2KR3 A; 1NEG A; 2L3Q A; 1E6H A; 2GQI A; 2EGE A; 2ROT A; 2L2P A; 3VS3 A; 1JXM A; 1WXU A; 2RQU A; 2RPN A; 2RQW A; 2K3B A; 2DL5 A; 3EG0 A; 2DL4 A; 1TG0 A; 4OMM A; 1GL5 A; 2X3X D; 1M3A A; 1ZUK A; 1WXB A; 3SEM A; 3NHN A; 2EGC A; 2J7I A; 5IHN A; 3R6N A; 1WDX A; 2RF0 A; 2EKH A; 3UAT A; 3H0F A; 2VKN A; 3I35 A; 2YT6 A; 1MUZ A; 1NLP C; 5HCK A; 1NEB A; 4DEY A; 2GBQ A; 1BB9 A; 2V1Q A; 2F2X A; 1QWF A; 1PKT A; 1MV0 B; 1K9A A; 1K1Z A; 2LZ6 B; 2E5K A; 1X2Q A; 1A0N B; 2AZS A; 4RTY A; 4OMO A; 3VRY A; 1GBQ A; 1UE9 A; 1X6G A; 1Y57 A; 4FSS A; 2A37 A; 2EVR A; 3VS1 A; 1UG1 A; 2KT8 A; 3M0Q A; 2L0A A; 2VVK A; 2GNC A; 4F16 A; 2JM8 A; 1SPK A; 1W6X A; 2LCS A; 4CC7 A; 3M0T A; 3UA6 A; 1FYN A; 1FMK A; 4Z8A A; 5I11 A; 2I0N A; 2CSQ A; 4Y92 A; 2EW3 A; 1QWE A; 1UDL A; 4J9B A; 2X3W D; 4GBQ A; 5I22 A; 2V1R A; 2W10 A; 2YSQ A; 1M3B A; 2FPE A; 4HCK A; 1VYV A; 3ULR B; 1UUE A; 3EHR A; 2FRY A; 4IIM A; 4K11 A; 4AFQ C; 1SSH A; 1UGV A; 1Y0M A; 1E6G A; 2OAW A; 3PVQ A; 1H3H A; 2JMC A; 2HCK A; 1CKA A; 3IQL A; 2YDL A; 3FJ5 A; 4JJB A; 1NYG A; 3M0P A; 2FRW A; 1AOJ A; 2DVJ A; 2DRM A; 2J6O A; 2LQN A; 3O5Z A; 1AEY A; 2DL8 A; 1MV3 A; 4JPB W; 3M0S A; 3VS4 A; 1SHG A; 3H0H A; 3UF4 A; 3VS6 A; 2EQI A; 4D8K A; 2RMO A; 4Z89 A; 1BU1 A; 5FW9 A; 4RTV A; 5EC7 A; 1WA7 A; 4RTX A; 2ROL A; 2DYB A; 1YCS B; 4F14 A; 2K7A A; 2F2V A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4OVA A; 1IGQ A; 2QI2 A; 2DK3 A; 4IUP A; 4M78 F; 1VQ6 Q; 3SD4 A; 5LJ3 d; 2P84 A; 3M55 A; 2LJ1 A; 3A5Z B; 3GLX A; 2EPD A; 3QJ6 A; 2XDP A; 1WYX A; 3BDU A; 1WLP B; 3OSS C; 3I9Q A; 3FDR A; 4PJO C; 3UT1 A; 4J9D A; 2PVG B; 2A36 A; 1TS9 A; 1PD1 A; 3HPW A; 2CZ0 B; 3BFM A; 2BE9 B; 3VS0 A; 3G6E T; 2DER A; 5LJ5 e; 3LH0 A; 2L3S A; 4OMN A; 5FU7 C; 3QBY A; 1WHJ A; 1D3B A; 4PJO G; 4F7U E; 1C0M A; 4ZGE B; 4M4Z A; 1I5L A; 2RQT A; 4F7U A; 1ACM B; 4C0F A; 3MEV A; 1WIE A; 1OYX A; 1JBM A; 3ME9 A; 3E19 A; 1N8R C; 2KDS A; 1QVF P; 5D7U A; 8ATC B; 2KNB B; 1N9R A; 1M4Z A; 1WXT A; 3TU4 K; 4DBQ A; 4JLI A; 3A8G B; 5LJ3 g; 2KSS A; 3MP8 A; 4J6X A; 4BI3 A; 1YJN A; 4C0D C; 3L42 A; 4XQ3 A; 4O6J A; 2GTO A; 4E7J A; 3QKJ A; 1SSF A; 2C0T A; 1IB8 A; 3CCJ T; 3X26 B; 2K79 A; 2VGM A; 3OYN A; 4IUV A; 3SDZ A; 4X34 A; 2P4T A; 4J8O A; 2JTF A; 4HVU A; 2BZ8 A; 3MKD A; 3SB2 A; 3RUX A; 1YI2 A; 4WF2 A; 1QVG S; 2RO0 A; 3M57 A; 1LCK A; 3PNW C; 5CR2 A; 1WQ7 A; 1OOT A; 2CH4 A; 3WVD B; 3CCE T; 3O8V A; 4QKU A; 3OYL A; 4XTY A; 4C8Q B; 2RJE A; 1D09 B; 1VQK A; 2VUB A; 2YUQ A; 1O9S A; 4JRP A; 3CPW A; 1VQ9 Q; 4C8Q F; 3J7A F; 2X4X A; 2DET A; 2ECZ A; 1KJW A; 1AD5 A; 2YWW A; 1Q95 G; 2PVD B; 3JCM d; 5GJV B; 1I81 A; 4BE0 A; 2H3J A; 5I21 A; 2ED1 A; 2RHY A; 1HJD A; 4AFS C; 3CMA T; 1R0C B; 1YIJ A; 2AKK A; 2FPF A; 2OTJ Q; 2RI3 A; 2E64 A; 2DJZ A; 2FYK A; 3OMC A; 4ELZ C; 1W2B A; 1VQ7 T; 3SWN A; 1OV3 A; 3QDF A; 3H8Z A; 4FIB A; 3PVL A; 3EG1 A; 4VUB A; 3OYM A; 1SHF A; 1QCN A; 3EG3 A; 2JMA A; 4EMK B; 2GTJ A; 1WHL A; 3JCM J; 3PGG A; 5HKC A; 2PNI A; 3P8B B; 4A54 A; 5A0G A; 2XKO C; 3OBW A; 4OGC A; 2SRC A; 1QVF A; 2CUB A; 4L6V 5; 4LDW A; 1TTH B; 4L59 A; 3QSU A; 1VQL T; 2KXC A; 4M77 C; 5CKF A; 2O9V A; 2RM4 A; 5I2M A; 3T9N A; 3OYG A; 4DA4 A; 1H8K A; 2HKN A; 2QQA A; 3THK A; 3VV0 A; 2MK5 A; 2V8J A; 3M56 A; 3JCM g; 4J83 A; 5IHK A; 2RI5 A; 2YRV A; 1G3Y A; 1SRL A; 3TSW A; 2K3Y A; 1AWW A; 3REB B; 1K0X A; 2RQV A; 1SRM A; 2M02 A; 3L2V A; 2YUP A; 4CI0 C; 2RNA A; 5KYN A; 1OU9 A; 5CVI A; 2CT4 A; 2M1H A; 1VQN Q; 2JVV A; 2A28 A; 1XJW B; 4MMK A; 2ZPB B; 1D3B B; 3LLR A; 3FLG A; 2QA4 Q; 4A4K A; 1EFN A; 4F7U B; 1AZG B; 2IVW A; 2DXC A; 4PFP A; 3G6E A; 4L5G A; 1VUB A; 1ZSZ A; 2DFU A; 2GF7 A; 4IKF A; 1WGS A; 3ASK A; 2QTX A; 3A8M B; 2QGF B; 3R6O A; 2DE0 X; 1KC8 R; 4BI8 B; 1NBE B; 1UGR B; 1M90 R; 2JZ2 A; 3CPF A; 4WTO B; 2H8H A; 1KG1 A; 1O75 A; 2CP3 A; 2LQW A; 3RNJ A; 4BD3 A; 1H92 A; 2LNV A; 4OB2 B; 4RG8 A; 3CCR T; 2E6N A; 2YRC A; 4E6R A; 5LJ5 d; 4M7D E; 4KBM B; 2E10 A; 2RB6 A; 4M7D A; 2E70 A; 1EIF A; 2L3Q A; 3QO3 A; 1TU0 B; 3G71 Q; 3E1S A; 1BCO A; 2EJG A; 2E1H A; 2RQW A; 5GAN g; 3JB9 G; 3EG0 A; 3JB9 D; 2BE7 D; 1ZUK A; 3CCJ A; 1G3S A; 4QQD A; 2EGC A; 4UC4 A; 5GAN 3; 2RF0 A; 3BW1 A; 1VQ6 A; 2V8K A; 1RAD B; 4XU2 A; 3QYG B; 3CC4 Q; 1Y96 B; 1MUZ A; 5HCK A; 3I55 Q; 2GBQ A; 2K4Y A; 3VYG A; 2F2X A; 4N4I A; 4BDZ A; 1KQS P; 3MJX A; 1K1Z A; 2LZ6 B; 4MZP A; 1A0N B; 2WSE E; 2F1L A; 1Y57 A; 3UPU A; 1VQN T; 3VS1 A; 2VYT A; 2JN0 A; 3RKY A; 1QVG A; 2QQR A; 3LW5 E; 5AYF A; 5FU6 C; 4JLG A; 5GAO n; 1FYN A; 2P0P A; 2HNI A; 3HL8 A; 4C92 G; 3ZFJ A; 4LDU A; 2DTI A; 4C92 D; 4QW2 A; 3GP8 A; 3P8D A; 3CC7 Q; 2V1R A; 4E7Z A; 2YSQ A; 3GNG A; 5LJ5 g; 3EFO B; 5CAI A; 4E7H A; 3HFN A; 3OYF A; 3SWN B; 1B7T A; 3S3O A; 2RHX A; 2X51 A; 4PJO A; 4B6M A; 1XQH A; 2D6F A; 1VQO Q; 2JJ9 A; 1Y0M A; 4X9D A; 1E6G A; 2OAW A; 3N5B B; 3PVQ A; 1H3H A; 2HCK A; 5GAN j; 3EFR A; 2XK0 A; 2QAS A; 3G4S Q; 1WJQ A; 3EG9 A; 4JRK A; 4JJB A; 5GAN 4; 1NYG A; 2QXF A; 3F70 A; 2J6O A; 3QZ5 B; 3GPL A; 1MV3 A; 1G5V A; 2LVM A; 3OMG A; 3CCM Q; 5A2Q E; 3CCL Q; 1YFN A; 1YJN T; 5FLX E; 3D7S B; 5EC7 A; 3A8O B; 2ROL A; 3VU3 C; 4M75 G; 2K7A A; 2F2V A; 5CKB A; 2LRQ A; 4JZ3 A; 4M75 D; 3I55 T; 1U8R A; 4QVD A; 1I07 A; 3EGX A; 1HSQ A; 2DBM A; 2JW4 A; 2YLB A; 1YI2 T; 3OYJ A; 1QP3 A; 1UHC A; 1F1B B; 1KSW A; 2B86 A; 2KE9 A; 3HRU A; 3I56 Q; 1YWP A; 1B3Q A; 1S72 Q; 1VQ9 A; 2RJF A; 5J3B A; 2L3P A; 1OZ3 A; 4AG1 C; 5LJ5 j; 2PZ1 A; 2CUD A; 2MF2 A; 1DJ7 B; 3GIB A; 2P4R A; 1VQK T; 3TEE A; 2DJQ A; 1TOV A; 4PK4 A; 4OMQ A; 3OYB A; 1BK2 A; 1M30 A; 4EIK A; 1ZSZ B; 2C0O A; 2DTO A; 5KYU A; 3A98 A; 1OX9 A; 2RN8 A; 1M2O A; 4Y28 E; 1YP5 A; 2OTJ A; 5FRO A; 4B9X A; 3L2W A; 4PJN A; 2LT4 A; 1JJ2 S; 1SEM A; 5GMK i; 2DBK A; 4QQG A; 2O31 A; 5DLQ E; 1OUL A; 4XU1 A; 1M90 C; 1QQJ A; 4KUD K; 1AHJ B; 4X9C A; 1MND A; 3QPH A; 4M7D B; 2E3I A; 1WJR A; 3CCM T; 1RAA B; 1PG5 B; 2COZ A; 4QT7 A; 1PWT A; 3OQ5 A; 2LJ0 A; 4ME7 A; 3C94 A; 2BZX A; 3LGF A; 3MEU A; 4J9H A; 3URG A; 4M7D F; 1PM3 A; 2HQX A; 2DMO A; 4BY6 C; 1XOV A; 3KUF A; 1M1K R; 1G83 A; 2C0I A; 1BI3 A; 2PTK A; 2CSI A; 3MHX A; 8AT1 B; 4RUG A; 2D8H A; 2QYZ A; 4LUD A; 3RR6 A; 3BY7 A; 1PCX A; 1NJI R; 1YJW Q; 5HK3 A; 4RMO A; 1NLO C; 2H3E B; 3V8K A; 2Y4X A; 4CRI A; 4AFU C; 3M0R A; 2J6K A; 2DM1 A; 2CZ7 B; 3H9N A; 2DNU A; 5FWB A; 4N0A C; 2DL3 A; 4PFO A; 5KYW B; 5IT9 E; 2KGT A; 4JS5 A; 1K9M R; 3S6W A; 2HEQ A; 4M7A C; 1Z9Q A; 3EGU A; 4AT1 B; 4J9E A; 1ZA2 B; 3ZEH A; 5GMK e; 4BB7 A; 1KC8 U; 2K3X A; 1UB4 A; 1VQN A; 3JB9 H; 4E47 A; 1M90 U; 1K4U S; 1M8M A; 2QA4 A; 1WPY A; 2HL5 C; 4M7A G; 4M78 C; 4C5H A; 2QGG A; 4HCZ A; 3LWH A; 1PNJ A; 3RES A; 1QCF A; 2AK5 A; 2OX7 A; 4QVC A; 3JB9 I; 3OS1 A; 3M53 A; 4HCC A; 1IO6 A; 1PKS A; 1U06 A; 5GAM e; 1SKU B; 5EG2 A; 5LL6 S; 1W2B P; 3EG9 B; 4OMP A; 1M27 C; 5CIU A; 3TQ7 P; 1Q81 R; 3HHT B; 1W70 A; 4A4H A; 1VQP Q; 2CS7 A; 2MI6 A; 2E12 A; 4PJO D; 2DIL A; 2D0N A; 2M9U A; 1D1B A; 3J80 E; 1T0H A; 3NTI A; 5M9O A; 1JU5 C; 2DL7 A; 2LTO A; 2PU9 B; 3G71 A; 4JJC A; 3FRN A; 4MZT A; 4RTT A; 2QQB A; 4XTU A; 3EHQ A; 3CBP A; 3CME Q; 4DBH A; 3EGX B; 4HKE A; 3BDL A; 2LQ8 A; 4OP0 A; 4XU0 A; 3V7R A; 4RCB A; 2OI3 A; 3CC4 A; 1M1F A; 3PMI A; 3I55 A; 1JRI A; 1VQ6 T; 1KQ1 A; 1OZ2 A; 2EQU A; 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