The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
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sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
SLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Kinase
|
| molecule keywords |
ABL TYROSINE KINASE
|
| publication title |
The solution structure of Abl SH3, and its relationship to SH2 in the SH(32) construct.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
4
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1997-10-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DL3 A; 5FWB A; 2O2O A; 1BK2 A; 1X2Q A; 4ZNX A; 4J9E A; 1GFC A; 1KSW A; 4OMO A; 4RTW A; 3VRY A; 3M0S A; 2KEA A; 1V1C A; 1Y57 A; 1NYF A; 2YUQ A; 2CSI A; 2DMO A; 2GQI A; 3H0F A; 2PTK A; 1YP5 A; 2KRM A; 2O9S A; 1ZSG A; 2KRN A; 1VYU A; 3TVT A; 4EIK A; 2ENM A; 2DBM A; 4HVU A; 2K7A A; 1NM7 A; 2PNI A; 2ROT A; 1MV0 B; 1ZLM A; 1U3O A; 2KR3 A; 1NYG A; 2FPE A; 2C0O A; 2DJQ A; 4RTX A; 3UAT A; 1TUC A; 2K2M A; 5IH2 A; 2DX1 A; 2RF0 A; 2DYB A; 2RNA A; 1YWP A; 2EGA A; 4ESR A; 3ZL7 C; 2CT4 A; 1NEG A; 3UA7 A; 1GBR A; 2JM8 A; 1K0X A; 1QWE A; 2EGC A; 1UGV A; 1OOT A; 3A98 A; 1EFN A; 1RLQ C; 3NGP A; 1M27 C; 4ORZ A; 2J6F A; 1Z9Q A; 1SHF A; 2OJ2 A; 2IIM A; 1RUW A; 1B3Q A; 1ZUK A; 2LMJ A; 3I9Q A; 2YUP A; 2LQN A; 1UTI A; 3NHN A; 4AG1 C; 1G2B A; 2NWM A; 1PHT A; 1AEY A; 2CH4 W; 1OV3 A; 4CC7 A; 4OML A; 1W6X A; 1SPK A; 2CUB A; 2DRM A; 1LCK A; 2KT8 A; 1SRM A; 2RPN A; 3FJ5 A; 1GRI A; 3RBB B; 3EHQ A; 4LUD A; 2DRK A; 3VS3 A; 1PRL C; 2RQW A; 2A28 A; 1ZX6 A; 1M8M A; 1X6G A; 2M51 A; 4AFS C; 3TSW A; 1GCQ C; 2DLP A; 1M3A A; 3U23 A; 4F16 A; 1K1Z A; 4DEX A; 1B07 A; 4RTV A; 2K6D A; 1WXT A; 5I11 A; 2RMO A; 2CSQ A; 1CKB A; 2HDA A; 2JS2 A; 2MIO A; 4D8K A; 2L0A A; 2VKN A; 3EHR A; 2KYM A; 1E7O A; 1E6G A; 4AFQ C; 2ESW A; 1KIK A; 2JMA A; 1GCQ A; 2RQU A; 1K76 A; 2ABL A; 1XOV A; 3VS7 A; 3LH5 A; 5IHN A; 2L3P A; 3REA B; 3CQT A; 4J9B A; 2L3S A; 1AZE A; 2A37 A; 3H41 A; 5IXB A; 2F2W A; 4OMM A; 2BTT A; 2M0Y A; 3JV3 A; 3M0U A; 4HCK A; 4HVW A; 1NEB A; 4AFU C; 2V1Q A; 2EYX A; 2D1X A; 2W0Z A; 1T0J A; 1GFD A; 2CDT A; 1TG0 A; 2EW3 A; 1RLP C; 3VS5 A; 2AKK A; 2JW4 A; 3I35 A; 1PRM C; 4FSS A; 2X3W D; 2K79 A; 3SHW A; 4F17 A; 1BB9 A; 1YCS B; 2EKH A; 2KGT A; 4QT7 A; 1I0C A; 1VYT A; 4LUE A; 4J9I A; 1X69 A; 4J9D A; 1UG1 A; 1KJW A; 2X3X D; 4IIO A; 2J7I A; 1U5S A; 2KT1 A; 1T3S A; 2K9G A; 4JZ3 A; 5L23 A; 2KRO A; 2J6O A; 2RQR A; 4RTU A; 1UHC A; 1VYV A; 2D8H A; 1UDL A; 2HSP A; 1WLP B; 4F14 A; 2LJ1 A; 2JT4 A; 1X27 A; 3UA6 A; 2DM1 A; 3EG3 A; 1J3T A; 1SSH A; 2C0T A; 2EPD A; 5FWC A; 2DL8 A; 1HSQ A; 1FYN A; 2FPD A; 4Z89 A; 1Y0M A; 2AKL A; 1U06 A; 5HCK A; 1NG2 A; 2EYY A; 2L3Q A; 2P4R A; 5IXF A; 1TUD A; 4AG2 C; 1T0H A; 1KFZ A; 1QWF A; 2KRS A; 4GLM A; 1Z9Z A; 1YNZ A; 3VS6 A; 4J9F A; 3M0P A; 2JM9 A; 2DIL A; 2LZ6 B; 4A63 B; 2J05 A; 2O31 A; 1NLP C; 4HVV A; 1WA7 A; 4AFZ C; 4E6R A; 4KRT A; 1QKW A; 1JQQ A; 1SHG A; 2EQI A; 5IHK A; 1AVZ C; 2ECZ A; 4OMN A; 1ABQ A; 4Z8A A; 2EYZ A; 2DNU A; 1AD5 A; 1N5Z A; 2KNB B; 2BZ8 A; 1UUE A; 1OEB A; 2DL7 A; 2DL5 A; 4RTT A; 2DBK A; 2VWF A; 1S1N A; 1ZUY A; 2CT3 A; 4JJD A; 2GTO A; 2C0I A; 4DEY A; 2PZ1 A; 2YDL A; 2OI3 A; 2KE9 A; 2JTE A; 3QWX X; 1QKX A; 1AZG B; 2DF6 A; 1QCF A; 2RQT A; 3H0H A; 2ED1 A; 5I22 A; 4JJC A; 2MOX A; 3EGU A; 1H3H A; 3I5S A; 1AWW A; 4RTY A; 1UHF A; 3VS2 A; 1WXB A; 4M4Z A; 4IIM A; 1H92 A; 1A0N B; 3C0C A; 3M0T A; 2MCN A; 2LP5 A; 3PVL A; 3H0I A; 2W10 A; 1FMK A; 4X1V A; 2LJ0 A; 2HBW A; 1M3B A; 2CRE A; 4JJB A; 3SEM A; 1OPL A; 1UJY A; 1QLY A; 2FRY A; 3KFV A; 2AZS A; 2EVR A; 2F2X A; 1BU1 A; 2LQW A; 1WYX A; 4LNP A; 2V1R A; 3M0Q A; 1W1F A; 1PWT A; 2JMC A; 2KXD A; 1ZBJ A; 1VA7 A; 2KYB A; 1JO8 A; 3EG1 A; 2RQV A; 1PKT A; 1GCP A; 2AZV A; 2LJ3 A; 2RN8 A; 2E5K A; 3EG2 A; 1JU5 C; 3M0R A; 2VVK A; 3REB B; 1BBZ A; 1UJ0 A; 3UF4 A; 1CKA A; 1MV3 A; 1UEC A; 4CC3 A; 1JEG A; 2YUO A; 1WXU A; 2O88 A; 1ABO A; 1JXO A; 2YSQ A; 3IQL A; 2LX7 A; 3THK A; 2ED0 A; 2XMF A; 2EYW A; 1CSK A; 3O5Z A; 3TSZ A; 4HXJ A; 2FEI A; 2H8H A; 3NMZ C; 1H8K A; 2D8J A; 2FPF A; 2JS0 A; 2FRW A; 2O9V A; 1X2K A; 1SRL A; 1HD3 A; 3VS0 A; 2A36 A; 5GJW B; 5IHI A; 4Z88 A; 1W70 A; 2BZX A; 2EBP A; 5ECA A; 3PE0 A; 2CUD A; 2HEQ A; 2OAW A; 2SEM A; 1WIE A; 3EG0 A; 1E6H A; 2J6K A; 1AWX A; 2CH4 A; 2NUZ A; 1SEM A; 1K9A A; 3QWY A; 2GGR A; 1AOJ A; 1IO6 A; 2I0N A; 2LNH B; 2GBQ A; 1I1J A; 2GNC A; 4RTZ A; 2YT6 A; 3ULR B; 3GBQ A; 1GBQ A; 1M30 A; 4WCI A; 2G6F X; 1T3L A; 2ROL A; 1PNJ A; 5EC7 A; 1WDX A; 2DA9 A; 4LN2 A; 1K0S A; 1RI9 A; 2GTJ A; 1K4U S; 4Y92 A; 1UFF A; 2HCK A; 2AK5 A; 1M3C A; 2DL4 A; 1GL5 A; 3I5R A; 5GJV B; 3PVQ A; 1ZUU A; 2LCS A; 1PKS A; 3R6N A; 1AWO A; 1HJD A; 1I07 A; 2FG0 A; 1OPK A; 1AWJ A; 1YN8 A; 2FO0 A; 4J9H A; 2A08 A; 2B86 A; 2J06 A; 1WI7 A; 4JZ4 A; 1ARK A; 4D8D A; 2QDL A; 2EGE A; 4JPB W; 1WX6 A; 2DE0 X; 3VS1 A; 1G83 A; 2F2V A; 2K3B A; 4J9C A; 1YWO A; 2JXB A; 4K11 A; 4J9G A; 1NLO C; 2KXC A; 1JXM A; 2D0N A; 4OMQ A; 3VS4 A; 5FW9 A; 4R0K A; 1X43 A; 2KBT A; 1MUZ A; 2YUN A; 2L2P A; 3NPF A; 4CC4 B; 4OMP A; 2DVJ A; 4LE9 A; 4CC2 A; 1WFW A; 1X6B A; 4RUG A; 4GBQ A; 3RNJ A; 3VRZ A; 1UE9 A; 2SRC A; 2BZY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2EKO A; 2LRQ A; 3GNF B; 2O2O A; 1OUL A; 1BI1 A; 4RCC A; 1GFC A; 5CKD A; 1YHQ Q; 1KSW A; 3CC7 T; 4RTW A; 1U1T A; 3VRY A; 3PFS A; 2YUQ A; 1YFN A; 3EGD A; 2KRM A; 1QP3 A; 5D6X A; 2KRN A; 3OBW A; 3FDR A; 5CKH A; 3RER A; 4MZP A; 1VQ6 T; 1YJW A; 2CZ7 B; 2KK4 A; 3VU3 C; 3QYH B; 1MV0 B; 2FPE A; 4A54 A; 5FRM A; 3OW2 S; 2O4X A; 1TUC A; 5C6S A; 4M7A C; 5IH2 A; 2DX1 A; 1N27 A; 4IUT A; 4C8Q G; 5LJ5 d; 2JN0 A; 2ZPH B; 3ZL7 C; 2EJF A; 5I21 A; 3FJP A; 4TVR A; 1K73 U; 1GBR A; 1YIJ T; 1VQO A; 1UGV A; 2E6N A; 3MEA A; 1MMA A; 2K5F A; 1MMD A; 2BE9 B; 2E3I A; 4KH0 B; 1RLQ C; 3NGP A; 4ORZ A; 2J6F A; 1VQK Q; 2OJ2 A; 3G6E Q; 1RUW A; 3OYY A; 2JVV A; 5IN1 A; 3GOX A; 3BY7 A; 3HL8 A; 3JCM f; 3NHN A; 4AG1 C; 1I5O B; 4F7U A; 3OYL A; 2QEX Q; 5GAN j; 4C8Q C; 4FYX B; 1OV3 A; 1TTH B; 3HRS A; 1SPK A; 2DRM A; 2KT8 A; 2FYK A; 1SRM A; 2RPN A; 3FJ5 A; 4A4K A; 3G4S T; 1YBY A; 1UGQ B; 4IUR A; 1G3W A; 2XIC A; 3HTR A; 1WQW A; 1PRL C; 2RQW A; 1MGQ A; 3PMI A; 1ZX6 A; 1K1Z A; 1ZSZ A; 4DEX A; 4RTV A; 2VXF A; 3V8L A; 5I11 A; 1N9R A; 5GAO r; 2V8J A; 4BI8 B; 4XTX A; 4M7D G; 2HDA A; 4D8K A; 1RAG B; 3EHR A; 4OB3 B; 3I56 T; 3WXM B; 3CCQ Q; 4C92 E; 2XDB A; 2RQU A; 3RR6 A; 4JDS A; 3S3M A; 1H3Z A; 2O01 E; 3C94 A; 5IHN A; 1VQ4 A; 2H3J A; 4PJO E; 2E64 A; 1PM3 A; 1OX8 A; 2GQV A; 2M0Y A; 5LJ3 d; 3M0U A; 1NEB A; 2E4H A; 3X20 B; 1WHM A; 1H64 1; 4C92 D; 2XG8 D; 4E7J A; 4A4H A; 2EYX A; 3LWI A; 1RI0 A; 1NE8 A; 2D1X A; 3JCM W; 3V7C A; 4MZM A; 4PJO D; 1KC8 U; 3OBY A; 2E70 A; 3VS5 A; 4ME7 A; 2AKK A; 4MML A; 4F7U G; 1KHC A; 3OYI A; 3M58 A; 1JRI A; 2LT1 A; 4BAC A; 4FSS A; 1BCM A; 2RI2 A; 2RM4 A; 2E41 A; 5CKE A; 3CME A; 1VYT A; 1KD1 C; 1X69 A; 1KJW A; 2VB6 A; 1VQP A; 5KYN A; 2WSF E; 3LX7 A; 1VQ5 A; 3FLG A; 1N6A A; 5FLX E; 4JZ3 A; 1RAI B; 3RMQ A; 2RJE A; 2RQR A; 1WQ7 A; 3KXT A; 2D8H A; 1WLP B; 2LJ1 A; 2ZZD A; 3WVE B; 2DD4 A; 2RI5 A; 3NTK A; 5KYU A; 1QMC A; 2AHJ B; 4M75 A; 4BY6 B; 2FZC B; 2RH2 A; 5GAM h; 3OS1 A; 2OTL A; 2IVW A; 3CCU Q; 1IRX A; 3FEO A; 5KE2 A; 4M78 F; 2P4R A; 4X9D A; 4OGC A; 3BE3 A; 1T0H A; 1QWF A; 5HK0 A; 4E7K A; 3JB9 F; 2PVD B; 2EIF A; 1KQS P; 4YTL A; 3CCR Q; 3VUB A; 2R58 A; 2O31 A; 3H9N A; 4HVV A; 4AFZ C; 4EPC A; 4E6R A; 2FVU A; 1RAF B; 3DB4 A; 2QQB A; 3URG A; 1QKW A; 4HCB A; 1JQQ A; 1YJ9 T; 2EQI A; 5FU6 C; 2BE7 D; 1AVZ C; 2HKQ B; 4QVD A; 2EYZ A; 1AD5 A; 1IRE B; 3DLM A; 3O8V A; 1FMV A; 2RO0 A; 2JTM A; 1OEB A; 2DL7 A; 4QQ6 A; 5FU6 B; 2Y4Y A; 3SWN A; 1S1N A; 2GTO A; 2C0I A; 3SFM A; 2KE9 A; 3QWX X; 2VAS A; 3JCM g; 1G3T A; 2DF6 A; 3H0H A; 3OYB A; 2DO3 A; 2OAU A; 3AT1 B; 1PCX A; 5L8R E; 4F04 B; 5GMK j; 1H92 A; 3MCA B; 4M75 G; 2OX7 A; 1Q95 G; 4PJJ A; 5CR2 A; 3OB9 A; 1YHQ A; 3H0I A; 4X1V A; 2L5Q A; 4A4G A; 1R0B G; 1VOM A; 1TWB A; 4MZT A; 4OB0 B; 3SEM A; 4C5H A; 5GAN 6; 3CPF A; 1Q86 U; 1W1F A; 1B34 A; 1K73 C; 2OTJ T; 1FWZ A; 2KYB A; 1JO8 A; 3G71 Q; 4BD3 A; 1R8O B; 1WNL A; 2X4J A; 2MPX C; 3BDU A; 2RHU A; 2VVK A; 3REB B; 2HBP A; 2HKN A; 3HHT B; 2YUO A; 4PJN A; 2AT1 B; 3IQL A; 1WJS A; 2LX7 A; 2ED0 A; 3X24 B; 1K73 R; 3CD6 Q; 4JUV A; 4HXJ A; 2FEI A; 2D8J A; 3J7A F; 1WPY A; 2FRW A; 1NZ9 A; 1HD3 A; 1VQK A; 5IHI A; 2BZX A; 2EBP A; 1YI2 T; 2CUD A; 3E19 A; 2SEM A; 1X6O A; 1E6H A; 2QEX A; 2J6K A; 3QWY A; 3OS2 A; 1AOJ A; 1QCO A; 2X9H A; 2I0N A; 1JJ2 P; 2GNC A; 4OB1 B; 3ULR B; 2PUK B; 1RAE B; 1M30 A; 2WAC A; 4BI4 A; 1T3L A; 1KQS A; 2K57 A; 4LN2 A; 1BIB A; 2QQS A; 2DIQ A; 2GTJ A; 2P84 A; 2G3R A; 4Y92 A; 4WF2 A; 3M59 A; 3NTH A; 2DD5 A; 2DL4 A; 1GL5 A; 3CPW A; 2BUD A; 2F5T X; 2RI3 A; 6AT1 B; 3CCQ A; 4P5N A; 1Q81 U; 2FO0 A; 1SF9 A; 4XU3 A; 2PVO B; 2NUP A; 3CMA A; 2B86 A; 2CP3 A; 1VQ8 Q; 3CEY A; 3OYK A; 3MO8 A; 1YIT Q; 4C8Q F; 3HP9 A; 2EGE A; 4A53 A; 1WX6 A; 2QQ9 A; 2DE0 X; 2DPP B; 2F2V A; 3EG9 B; 3EH1 A; 2K3B A; 4M78 E; 2K5I A; 4QKU A; 4FYW B; 4J9G A; 2DET A; 5DLO A; 2X4X A; 2V8K A; 3VS4 A; 4OMQ A; 2BKD N; 3E9F A; 1VQN Q; 4FYV B; 1RAD B; 3CCS A; 2COY A; 4DA4 A; 3FC3 A; 2YUN A; 3ER0 A; 1M90 U; 3WVD B; 1X6B A; 4M78 D; 3CC7 Q; 3OA6 A; 1X01 A; 2RHY A; 3M56 A; 3I55 T; 1QVG S; 1X2Q A; 4ZNX A; 3OSV A; 4OMO A; 3JB9 D; 5DM7 R; 2DMO A; 2M9U A; 1ZA1 B; 3JCM J; 4EIK A; 4PKC C; 2ENM A; 1I5L A; 4C0D B; 1NM7 A; 2Y4X A; 2ROT A; 2K2V A; 2DJQ A; 4M7D F; 4ZN1 A; 5CQY A; 3NTI A; 2DYB A; 1YWP A; 2D9T A; 2EGA A; 1M2O A; 1PSF A; 3OYG A; 1YIJ Q; 1UGR B; 1FXX A; 3OYE A; 3F70 A; 3CC2 A; 3CCU A; 1KD1 U; 3UA7 A; 3CXC A; 3GLX A; 2JM8 A; 5GAN e; 2EGC A; 4E7S A; 2ATC B; 1EFN A; 3D7S B; 3JCM e; 1BCO A; 4QW2 A; 3JCM V; 2D6F A; 1SHF A; 2XK0 A; 5FU7 C; 1K8A U; 1WHG A; 1PC0 A; 2VGM A; 4CRI A; 2KMT A; 1G2B A; 3OW2 P; 5GMK i; 2FHD A; 5CVI A; 1NPR A; 4JLI A; 3G4S Q; 5GAO m; 1LOJ A; 1VQO T; 4FYY B; 4F7U F; 1C6V X; 2CUB A; 1GRI A; 3RBB B; 3EHQ A; 1IXD A; 3MP1 A; 4IUV A; 2DRK A; 2VC8 A; 2YLC A; 2A28 A; 4GLK A; 4DBQ A; 3OS5 A; 5GAN 8; 4EMH A; 1M8M A; 1WGS A; 2ZPI B; 2DLP A; 1M3A A; 3U23 A; 4F16 A; 2MF2 A; 2A0F B; 3LWH A; 4N4H A; 1PSE A; 2K6D A; 3UT1 A; 1WXT A; 3I56 Q; 2PQW A; 2RB6 A; 3OYA A; 3EFO B; 1UGS B; 3QYG B; 1VQL Q; 4C5I A; 4PFP A; 1QVF A; 2LQK A; 3QJY A; 3VUZ A; 2ABL A; 3LH5 A; 2L3P A; 3CQT A; 4J9B A; 1AZE A; 4XQ3 A; 4KGV B; 1W2B S; 5GAO q; 4N4I A; 2L3R A; 4HCK A; 4DBH A; 4M7A G; 4M77 C; 2YRC A; 3SDZ A; 2RD1 A; 1WHK A; 2MK5 A; 1Q86 R; 1T0J A; 1GFD A; 3P8B B; 2GFU A; 2HNI A; 2EW3 A; 4M77 B; 1VQ4 T; 2VYT A; 3H8Z A; 3C95 A; 4NS5 A; 2DKG A; 4J7I A; 3SHW A; 4F17 A; 1MNE A; 2YRD A; 4JRK A; 3TEE A; 2JTF A; 4QT7 A; 4LUE A; 3JCM b; 4J9D A; 1XJW B; 2A3L A; 3CBP A; 1D0Z A; 1IB8 A; 4C8Q E; 3CD6 A; 3MJX A; 2DTO A; 4JRQ A; 5L23 A; 4NOY A; 2J6O A; 3QZ9 B; 1VYV A; 2COW A; 4EDU A; 4QVZ A; 2HSP A; 3CME T; 1LPL A; 4C8Q D; 2QTV A; 1C0M A; 5CO7 A; 1VQP T; 2DM1 A; 3LW5 E; 3LGL A; 5LJ5 f; 2QGG A; 3OQ5 A; 2EPD A; 1VQ5 T; 2E3H A; 3FIF A; 1HSQ A; 1QVP A; 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