The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
70
|
structure length |
70
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Chain Sequence |
GSSGSSGGHCVAIYHFEGSSEGTISMAEGEDLSLMEEDKGDGWTRVRRKEGGEGYVPTSYLRVTSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Cdc42-interacting protein 4
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| publication title |
Solution Strutcure of the SH3 domain of the Cdc42-interacting protein 4
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
6
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| structure length |
70
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| sequence length |
70
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4HVW A; 2ABL A; 2KEA A; 1ZLM A; 2GTO A; 2F2X A; 1GBR A; 1JQQ A; 1SHF A; 2A28 A; 2YUQ A; 2DA9 A; 1UG1 A; 3C0C A; 4F14 A; 1JO8 A; 4RTV A; 2JS2 A; 4J9G A; 2EYW A; 5FWB A; 2YUP A; 1WXB A; 3UA6 A; 3NPF A; 4DEY A; 4RUG A; 1CKA A; 3NMZ C; 1UFF A; 2DIL A; 2L0A A; 2L3P A; 1SHG A; 1HJD A; 1PRL C; 3REB B; 2MOX A; 1WFW A; 1I0C A; 1IO6 A; 1GL5 A; 1WA7 A; 3H0F A; 4LUE A; 2ROL A; 2RQW A; 2FEI A; 4Y92 A; 2M51 A; 1WLP B; 1ARK A; 4JZ4 A; 3R6N A; 4E6R A; 1RLP C; 2DLP A; 3GBQ A; 2W10 A; 3H41 A; 2VKN A; 3EHR A; 1G83 A; 1YCS B; 2O9S A; 2BTT A; 5I22 A; 1WX6 A; 2K2M A; 1WXU A; 4OMP A; 1QCF A; 2EBP A; 3I35 A; 3SHW A; 4CC2 A; 2RQV A; 2DL4 A; 4AFU C; 1Y0M A; 2EYX A; 4J9F A; 2YDL A; 3VS7 A; 2LJ3 A; 1QKX A; 1ZUK A; 2KNB B; 1ABQ A; 1U3O A; 2RF0 A; 2FG0 A; 2A08 A; 2PNI A; 3JV3 A; 3IQL A; 4AFQ C; 3PVQ A; 2OAW A; 3NHN A; 4ORZ A; 4FSS A; 2KRO A; 2KGT A; 5IHI A; 4Z8A A; 1PHT A; 4J9B A; 1X2Q A; 3EG2 A; 1NYF A; 1WIE A; 4OMM A; 2O31 A; 4CC3 A; 2KE9 A; 3I9Q A; 4Z88 A; 2ED1 A; 4DEX A; 2MIO A; 1AWJ A; 5I11 A; 2KXD A; 5GJW B; 1RLQ C; 2OJ2 A; 2AZS A; 1PNJ A; 1UJY A; 2KRN A; 2LNH B; 4RTW A; 2J6F A; 1MV3 A; 2HSP A; 3H0H A; 2ESW A; 1I07 A; 4OMO A; 5ECA A; 1VA7 A; 2NUZ A; 3VRY A; 1M30 A; 2K9G A; 2VWF A; 5IHN A; 2LX7 A; 3VS3 A; 1KFZ A; 1VYU A; 2JXB A; 2A37 A; 2NWM A; 2E5K A; 4RTX A; 2O9V A; 2JMA A; 2X3W D; 4ZNX A; 1K76 A; 3ULR B; 1K0X A; 4RTZ A; 3RNJ A; 1TG0 A; 1AOJ A; 1RI9 A; 2O88 A; 4JJC A; 5HCK A; 1V1C A; 1QKW A; 1BK2 A; 2DNU A; 3VS1 A; 2J6O A; 1YN8 A; 1AVZ C; 2YT6 A; 2KR3 A; 3O5Z A; 1NEB A; 4D8K A; 2DF6 A; 2EYZ A; 1Z9Q A; 2YUO A; 1NYG A; 3VS6 A; 1K0S A; 2AK5 A; 3TSZ A; 4GBQ A; 2ECZ A; 2L3Q A; 4LNP A; 4CC4 B; 2CSI A; 2X3X D; 1EFN A; 2RQT A; 2OI3 A; 5FWC A; 1NLO C; 4JZ3 A; 3EG3 A; 4HVU A; 4J9E A; 2C0T A; 1SRM A; 1E6G A; 2PTK A; 2RQR A; 4AFZ C; 1AWX A; 2EPD A; 2K3B A; 2P4R A; 5FW9 A; 1E6H A; 2I0N A; 4HXJ A; 1H92 A; 1YNZ A; 1N5Z A; 1T0H A; 4LUD A; 2FPF A; 2M0Y A; 2F2V A; 1MV0 B; 2HCK A; 3I5R A; 4K11 A; 3M0P A; 4D8D A; 1TUD A; 1BU1 A; 1AZG B; 1UDL A; 1KSW A; 2FPD A; 1SRL A; 1WYX A; 2D8J A; 3H0I A; 3NGP A; 4WCI A; 2RMO A; 5EC7 A; 1M27 C; 1B07 A; 2JW4 A; 1GCQ A; 3KFV A; 1X2K A; 1GCQ C; 1UHF A; 4JJB A; 1CSK A; 1PKS A; 4EIK A; 1MUZ A; 3REA B; 4F17 A; 2BZX A; 2CDT A; 4F16 A; 2IIM A; 4JJD A; 2JMC A; 4KRT A; 2EVR A; 1ABO A; 1ZBJ A; 2K7A A; 1AWW A; 1ZSG A; 1UTI A; 4RTU A; 1AWO A; 2V1Q A; 4X1V A; 1ZUY A; 3PVL A; 1Z9Z A; 1KIK A; 4AFS C; 2CSQ A; 1KJW A; 2DJQ A; 2CUD A; 1QWE A; 1VYV A; 2KT1 A; 2HBW A; 1T3L A; 4J9D A; 2DL3 A; 2MCN A; 4ESR A; 4OML A; 2LCS A; 2GBQ A; 5IH2 A; 2JT4 A; 3M0R A; 5IXB A; 3U23 A; 2EGA A; 3UA7 A; 2G6F X; 2DRK A; 2BZ8 A; 2JS0 A; 4HCK A; 1FYN A; 1T3S A; 1X27 A; 1X43 A; 2EGE A; 2JTE A; 2EGC A; 2JM9 A; 3I5S A; 2JM8 A; 3ZL7 C; 4Z89 A; 2GTJ A; 1WDX A; 3VS4 A; 1SEM A; 1JXM A; 2DL5 A; 1T0J A; 2FRY A; 4GLM A; 1UGV A; 2SRC A; 5GJV B; 1YWP A; 1YWO A; 2CH4 W; 1UUE A; 1AEY A; 3M0Q A; 4IIM A; 1H8K A; 1JXO A; 3LH5 A; 1OOT A; 2CRE A; 2AKL A; 2DVJ A; 1SPK A; 2HDA A; 3FJ5 A; 4LN2 A; 4CC7 A; 2ED0 A; 2RNA A; 1WXT A; 2KYM A; 4AG1 C; 1X6B A; 1M3A A; 1X6G A; 1XOV A; 1UJ0 A; 1HD3 A; 3EGU A; 1E7O A; 1YP5 A; 3RBB B; 1GFC A; 1I1J A; 4OMQ A; 2CT3 A; 1ZX6 A; 1TUC A; 2YUN A; 3QWY A; 1GFD A; 2KYB A; 2K6D A; 2DMO A; 1NG2 A; 3TVT A; 3EHQ A; 1Y57 A; 2SEM A; 2BZY A; 4J9I A; 2GGR A; 3VS2 A; 2FRW A; 1WI7 A; 3VS0 A; 1UHC A; 4J9C A; 2L2P A; 2XMF A; 1W1F A; 2ROT A; 1W6X A; 3EG1 A; 1VYT A; 2EW3 A; 1BBZ A; 1GBQ A; 4HVV A; 1QWF A; 3PE0 A; 1JEG A; 1BB9 A; 2FPE A; 2B86 A; 2LZ6 B; 3QWX X; 2CUB A; 2DBM A; 2KXC A; 2F2W A; 2D8H A; 4R0K A; 1AD5 A; 1PRM C; 3CQT A; 1A0N B; 1QLY A; 2LP5 A; 2O2O A; 1RUW A; 2A36 A; 1UE9 A; 2AKK A; 4OMN A; 1GRI A; 3M0T A; 2PZ1 A; 1SSH A; 2DRM A; 2W0Z A; 2J6K A; 2J06 A; 2CT4 A; 2H8H A; 1GCP A; 1K9A A; 1UEC A; 4QT7 A; 1CKB A; 1K1Z A; 2VVK A; 3EG0 A; 2GNC A; 3UF4 A; 2LQN A; 1LCK A; 2J05 A; 1U06 A; 2DBK A; 3TSW A; 1PKT A; 2EKH A; 1G2B A; 1ZUU A; 2YSQ A; 1JU5 C; 3UAT A; 2GQI A; 1M3C A; 3M0U A; 4JPB W; 2D0N A; 2KRS A; 4RTY A; 2FO0 A; 1W70 A; 2RPN A; 3THK A; 4AG2 C; 1FMK A; 2RN8 A; 1S1N A; 3M0S A; 2L3S A; 2K79 A; 2V1R A; 1H3H A; 2DM1 A; 1B3Q A; 2KRM A; 4RTT A; 2EYY A; 2RQU A; 5IHK A; 1X69 A; 2QDL A; 2DYB A; 2KBT A; 1U5S A; 1NLP C; 2DX1 A; 2HEQ A; 1J3T A; 1NM7 A; 5L23 A; 2C0O A; 4LE9 A; 2CH4 A; 2D1X A; 1OEB A; 1OPL A; 1OV3 A; 2EQI A; 2DL7 A; 5IXF A; 4M4Z A; 3VS5 A; 2ENM A; 2LJ1 A; 1NEG A; 1M3B A; 2C0I A; 2AZV A; 2J7I A; 3VRZ A; 2LJ0 A; 3A98 A; 1M8M A; 1AZE A; 1HSQ A; 2LMJ A; 4A63 B; 2DE0 X; 1K4U S; 4J9H A; 1OPK A; 4IIO A; 2KT8 A; 1PWT A; 2DL8 A; 3SEM A; 2LQW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4HVW A; 3G6E A; 1NZ9 A; 1MMG A; 2GTO A; 2ZPI B; 2F2X A; 2DPP B; 2YLC A; 4F7U F; 5C6S A; 2CP2 A; 2DA9 A; 1S72 T; 3ER0 A; 2EYW A; 2MWO A; 5GAO r; 3V8K A; 4FT4 A; 5KCH A; 2CZ0 B; 3NPF A; 1W2B P; 1C6V X; 2C06 A; 3KXT A; 4N4H A; 2JTF A; 1RAC B; 1SHG A; 1PRL C; 1R8O B; 2F69 A; 2WAC A; 5GMK j; 1IXD A; 1GL5 A; 1Q7Y C; 3JAM E; 3H0F A; 4WF2 A; 2X4Y A; 1KQS S; 1D1B A; 3L2Q A; 1G3S A; 3R6N A; 5GAN 2; 3CXC S; 1WGS A; 1N6A A; 3EFO A; 3GBQ A; 1KHI A; 3H41 A; 3EHR A; 1YCS B; 3JCM b; 1RAG B; 5I22 A; 5KYN A; 1WX6 A; 4M75 C; 5GMK i; 3CMA Q; 3VU3 C; 1U1S A; 2Y4Y A; 2D0Q B; 3OYI A; 3VV0 A; 3I35 A; 2PUO B; 3NFC A; 1K9M U; 1RI0 A; 5GAN 5; 4AFU C; 3OYH A; 2RHY A; 2XG8 D; 1Y0M A; 2VYT A; 2DD4 A; 1QW1 A; 4F7U G; 1ZUK A; 4J83 A; 2KNB B; 3JV3 A; 2A08 A; 1QQJ A; 4QW2 A; 2OAW A; 4XU1 A; 1YIJ A; 3OYC A; 2XDD A; 1OX8 A; 2EFI A; 3HRS A; 2CS7 A; 1OU9 A; 1OQK A; 4CC3 A; 2KE9 A; 2M9U A; 5CCA A; 5LJ5 h; 2ED1 A; 2M02 A; 3L2Z A; 1BI2 A; 1UJY A; 2KRN A; 1VIF A; 1IHW A; 2J6F A; 3CCV A; 1MV3 A; 3SWN C; 3CCJ T; 1W2B A; 3OS2 A; 3TQ7 P; 3ZFJ A; 1I07 A; 4OP0 A; 3G71 T; 5CVI A; 1VA7 A; 4DOW A; 3VRY A; 5FRN A; 3QJ6 A; 2VWF A; 1VYU A; 4MZP A; 1Q81 U; 1VQK A; 2CP6 A; 4B6M A; 3E19 A; 4EMH A; 2A37 A; 2A3L A; 2NWM A; 3RKY A; 3RMS A; 1KC8 C; 1VQO Q; 1K76 A; 3OYM A; 2LTO A; 2XIC A; 1PCX A; 1ZQ1 A; 1TG0 A; 3GF5 A; 1AOJ A; 3QO3 A; 2O88 A; 2MPX C; 4JJC A; 1VQ4 Q; 3CD6 Q; 4M77 D; 1QKW A; 1XNI A; 1BK2 A; 2KI7 A; 4J6Y A; 7AT1 B; 3RKW A; 1K8A C; 3CPW A; 2GF7 A; 2RA2 A; 3MEA A; 2R5A A; 4D8K A; 1G8X A; 5CKD A; 1OX9 A; 4FIB A; 1M90 U; 2YUO A; 3Q1J A; 3V7R A; 1TWB A; 3SDZ A; 4IUP A; 4LNP A; 2CSI A; 3BDU A; 4F7U B; 4N4G A; 5GMK m; 3J81 E; 4C0Z A; 1QVF S; 3EG3 A; 4L6V 5; 2KK4 A; 4C8Q C; 4E7K A; 4AFZ C; 1AWX A; 2K3B A; 5FW9 A; 1IGQ A; 4HXJ A; 1WJQ A; 3P8H A; 1T0H A; 4LUD A; 1D0Z A; 4JS5 A; 2M0Y A; 2HCK A; 3G6E Q; 4JDS A; 1VQP T; 1UDL A; 3FDR A; 4J5Y A; 3OS1 A; 4QKU A; 1WYX A; 3NGP A; 1P92 A; 3E1S A; 2EAY A; 2JW4 A; 3OYJ A; 1GCQ A; 1D0Y A; 4RKU E; 1X2K A; 2E10 A; 4P5N A; 4FYX B; 3WXM B; 1CSK A; 4BY6 C; 4EIK A; 3EGX B; 3REA B; 4IUU A; 3FEO A; 4ELY C; 1SF9 A; 3OBW A; 1YJ9 T; 1FX7 A; 3DLM A; 2K7A A; 1M1K R; 5LJ3 j; 4RTU A; 4II1 A; 3RR6 A; 2V1Q A; 4X1V A; 4E47 A; 4KGX B; 4M7D C; 4AFS C; 2CSQ A; 4E7H A; 4FL6 A; 4IKF A; 3GPL A; 2F5T X; 1EZZ B; 5DY9 A; 3ZEH A; 2P0K A; 3R6O A; 5GAN 8; 1QWE A; 1U1T A; 2HL3 A; 2LRQ A; 1YJN A; 3JCM f; 1QVG P; 5IH2 A; 1N8R R; 2BZ8 A; 4HCK A; 5FU7 C; 1FYN A; 1K9M C; 3JCM J; 2JM8 A; 2GTJ A; 2X4J A; 1WDX A; 3GNG A; 3I55 A; 1BI1 A; 1WHJ A; 2DL5 A; 3S3O A; 2SRC A; 2E3I A; 3MP8 A; 5GJV B; 1YWP A; 1VQ8 A; 1UUE A; 2QQ9 A; 1JXO A; 5GAN h; 2DVJ A; 2F1L A; 3L2R A; 4ZGJ B; 4LN2 A; 3WVE B; 4CC7 A; 1WXT A; 1FMV A; 2KYM A; 4M78 D; 4F7U A; 3CCV Q; 3M58 A; 2KDS A; 2E5Q A; 3JCM c; 2LDM A; 4XAX B; 5CKB A; 1MGQ A; 2KYB A; 2F5K A; 5CIU A; 2DAQ A; 1K73 U; 1FWZ A; 5D6W A; 2M1H A; 2BZY A; 4J9I A; 2RI3 A; 1M9S A; 2FRW A; 1VQK Q; 1YJW Q; 3HSB A; 4EMK A; 3CBO A; 1W1F A; 3TEE A; 4NS5 A; 1Q81 C; 3H6Z A; 1W6X A; 4HVV A; 2QTX A; 3CMA T; 2FPE A; 1PSE A; 2RK1 A; 2LZ6 B; 3PTA A; 4KUD K; 1OYX A; 2CUB A; 2DBM A; 1IRX A; 1JRI A; 2DXB A; 3EGX A; 2ZPH B; 1QVG A; 1NE8 A; 3QDF A; 4RCC A; 2LP5 A; 2CZ1 B; 2PZ1 A; 1I8F A; 4RG8 A; 5A0L A; 5M9O A; 2H8H A; 3A8G B; 1K9A A; 4AT1 B; 4PLI A; 5CAI A; 1VQ7 A; 1Q95 G; 2ZZD A; 4QVC A; 3EG0 A; 1M90 C; 1Q82 U; 4BD3 A; 2GNC A; 4FSX A; 2LQN A; 4PFP A; 4VUB A; 3TSW A; 2P4T A; 1G2B A; 5IT9 E; 1RAI B; 3JB9 D; 2DZ9 A; 4B9W A; 5J26 A; 1M3C A; 3M0U A; 4RG2 A; 3THK A; 2MYS A; 3HL8 A; 1FMK A; 3CCU Q; 4ZTJ A; 1MHN A; 2V1R A; 3M56 A; 5HK0 A; 2RQU A; 3VYH B; 1K9M R; 2DEU A; 4IUT A; 3G7Z A; 2HEQ A; 1QP3 A; 1NM7 A; 5L23 A; 9ATC B; 3JCM g; 1OV3 A; 4BDY A; 1VQO T; 2K57 A; 2DL7 A; 3M4Y A; 3X26 B; 5IXF A; 3MEU A; 1OUL A; 5D6X A; 1ZHI A; 2VV5 A; 2QGF B; 1B34 B; 2OTJ A; 1VQ4 T; 3GOX A; 1WHL A; 2DIG A; 3CD6 T; 8AT1 B; 3RKX A; 1ZBX A; 4BB7 A; 2LJ0 A; 3OA6 A; 3A98 A; 4XTU A; 2L5Q A; 2L3R A; 2LMJ A; 2ZGW A; 1B7T A; 2Y4X A; 1OPK A; 5A0G A; 5GAO m; 3PFS A; 2DL8 A; 3V8L A; 3QYH B; 2ABL A; 1GBR A; 1JQQ A; 2A28 A; 1YJN Q; 2YUQ A; 1Y7X A; 3SD4 A; 2X51 A; 5LJ5 d; 3CCR A; 3X25 B; 4C0F A; 4J9G A; 4N4I A; 1UEB A; 4PJO F; 5FWB A; 1WXB A; 4Z02 A; 1W2B S; 1TUG B; 4RUG A; 3CME Q; 1KD1 U; 1JJ2 P; 1VQM Q; 4XTV A; 1Q81 R; 3I55 Q; 1HJD A; 2LT1 A; 3MJX A; 2QEX A; 2WSC E; 4Y91 A; 4M7A D; 5LJ3 f; 4E7L A; 3G6E T; 2ZPF B; 1WFW A; 2D9T A; 4HCC A; 2RI5 A; 1VQ8 Q; 1QVP A; 2MWP A; 4Y92 A; 1X75 C; 5LJ5 j; 4JRP A; 2DKG A; 3OY9 A; 4XQ3 A; 1D09 B; 5DLQ E; 1LNX A; 4C5E A; 4DBQ A; 3RER A; 4JZ4 A; 5D7U A; 2DLP A; 1WZO A; 2FZG B; 1TXQ A; 5CQX A; 2VKN A; 3JCM W; 2FB7 A; 3EAE A; 2O9S A; 2BTT A; 2IG0 A; 3CCE A; 1VQL Q; 2HKN A; 3BDL A; 4OMP A; 5AT1 B; 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