The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
66
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structure length |
66
|
Chain Sequence |
KKSRLWVDRSGTFKVDAEFIGCAKGKIHLHKANGVKIAVAADKLSNEDLAYVEKITGFSLEKFKAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Endocytosis, protein binding
|
| molecule keywords |
Cytoskeleton assembly control protein SLA1
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| publication title |
Structure of Sla1p homology domain 1 and interaction with the NPFxD endocytic internalization motif.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
15
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-06-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HBP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3L2W A; 2FB7 A; 2CGH A; 2COZ A; 1ZUU A; 3PMT A; 2HCK A; 2EAY A; 2EJF A; 3GP8 A; 3EGX B; 3URG A; 3THK A; 4ME7 A; 1VUB A; 2I0N A; 1UGR B; 2G6F X; 3FB9 A; 2LJ0 A; 4LD9 K; 4ELY C; 4C8Q A; 2RQV A; 1GFC A; 2HAX A; 1NPR A; 2ED1 A; 2DIQ A; 1VQ8 A; 2P0Q A; 3L1A A; 1YBY A; 2A7Y A; 1QCO A; 1YIT Q; 3PT9 A; 2K4Y A; 5I2S A; 4HT9 A; 4N4G A; 1Q82 R; 1UEC A; 3MEV A; 2FPD A; 2OTL A; 1WHJ A; 3E9F A; 3C95 A; 2E5Q A; 4PJO B; 3GF5 A; 3LH0 A; 1CSK A; 2ZPE B; 2VYT A; 3L2V A; 2X4X A; 2EQJ A; 2DIG A; 3OSV A; 5KYY B; 1K9M U; 4Z02 A; 2XHC A; 1M90 C; 2BIV A; 1NE8 A; 3S3N A; 2DL4 A; 1M2V A; 2DL3 A; 1MMG A; 4IUR A; 4HKE A; 2DF6 A; 5GAO r; 1OV3 A; 4C92 A; 4M7A B; 4QVZ A; 2JM8 A; 2LVM A; 2DXT A; 3Q1J A; 2P4R A; 5GAN g; 3VS2 A; 4GY5 A; 3UA6 A; 4M7A D; 1MV3 A; 3OYM A; 4PJL A; 2IPO B; 5IXB A; 1N6A A; 4M78 E; 2JXB A; 3CC2 Q; 3OYE A; 3LWH A; 5FWC A; 3I9Q A; 2XK0 A; 4FM4 B; 2L3R A; 1TSF A; 3DKM A; 5DLO A; 1M4Z A; 2EQM A; 4M75 B; 2HBP A; 1YHQ Q; 4NS5 A; 2QDL A; 2JMA A; 1IGQ A; 2L2P A; 1YJN T; 2LCS A; 3UAT A; 1QKW A; 2RHU A; 1R77 A; 2ZPH B; 2OTJ A; 1VQO Q; 4M78 G; 3OS2 A; 2DFU A; 1HYO A; 4FW2 A; 5GJW B; 1VQM T; 5CAI A; 3CCE T; 2RNA A; 2VV5 A; 2R58 A; 2RH2 A; 3BY7 A; 1NEG A; 3L42 A; 2QA4 Q; 3REA B; 4LDU A; 3CCM T; 5I22 A; 1V76 A; 2BZX A; 1MND A; 2FPF A; 4RTU A; 3CCU A; 4XTW A; 3CPW S; 2SRC A; 3JSC A; 3E19 A; 3QYH B; 4FYV B; 1PWT A; 1X2K A; 3N5B B; 2DA9 A; 4A4E A; 4ANJ A; 5DY9 A; 2RI3 A; 2FO0 A; 1QP3 A; 2A36 A; 4GLM A; 1KQ1 A; 1RLQ C; 2HD0 A; 3M54 A; 1WI7 A; 2GBQ A; 3JCM V; 2OI3 A; 4BE0 A; 1XNI A; 1VYU A; 2RN8 A; 2A3L A; 2GGR A; 1TUG B; 4CC3 A; 1MMN A; 2E6N A; 3G7Z A; 4XK8 E; 3AHU A; 1JXM A; 1G8X A; 1KK7 A; 3RMQ A; 2E65 A; 2C0T A; 3CEY A; 1CKA A; 4C8Q D; 4C5H A; 2V26 A; 1B34 B; 2RQW A; 4M78 F; 2D0Q B; 2QEX A; 3X20 B; 3QXE B; 4XU3 A; 1KSW A; 4IUV A; 2MPX C; 1U06 A; 3RMS A; 1D0X A; 5GAN 3; 3VS3 A; 1Q7Y C; 1M2O A; 3M0R A; 4BI8 B; 1SPK A; 1GCP A; 2KQW A; 2RO0 A; 1Q82 U; 1VQ9 A; 3V7C A; 2JS0 A; 5KE3 A; 2XDP A; 3G6E T; 5GAN d; 1YFN A; 1SG5 A; 4XU2 A; 3X24 B; 1WXB A; 2EYQ A; 4HA8 A; 4N0A A; 4D6W A; 1WJQ A; 2DE0 X; 2MK5 A; 2BZ8 A; 2VUB A; 1KC8 R; 1AT1 B; 2LQN A; 1YI2 Q; 2X4W A; 5J39 A; 1X2Q A; 3M0Q A; 4C92 D; 2VKN A; 2LT1 A; 3G4S T; 1WHG A; 5J26 A; 2ROL A; 4Q5W A; 2LJ3 A; 2K3Y A; 4QQG A; 3GLX A; 4C0Z A; 1YCY A; 2M0O A; 2MI6 A; 4IIO A; 4MDW A; 5CIU A; 3VS1 A; 3REB B; 2YUN A; 3QDR B; 4F04 B; 2EJ9 A; 3V7S A; 3QWX X; 1YIT T; 2CP2 A; 4PFZ A; 3HRS A; 4BDY A; 2CH4 W; 1YJ9 A; 1E7O A; 2KT8 A; 4N4I A; 2C06 A; 3M53 A; 2YLB A; 2HEQ A; 4A4G A; 3PE0 A; 1AZE A; 1IXD A; 5GAN e; 2YUO A; 1UEB A; 5GMK e; 1YJW Q; 2VAS A; 3CXC S; 2E12 A; 4F16 A; 2EQI A; 1W70 A; 4QT7 A; 3S3M A; 4BI4 A; 1UGP B; 3NFC A; 4RTZ A; 2KK4 A; 1V29 B; 5FW9 A; 2NUP A; 3CCR A; 3RNJ A; 3UDC A; 2EVR A; 2QK0 A; 4JZ3 A; 3OS0 A; 3FDR A; 5A0D A; 3CC7 T; 4BAC A; 1VQ6 A; 5KYU A; 3CCJ A; 3S3O A; 3I56 A; 2CT3 A; 4L5G A; 1ARK A; 1BI0 A; 3QII A; 3CC2 T; 2EGE A; 1WGS A; 3SD4 A; 3VS4 A; 2HKQ B; 3C94 A; 2L3Q A; 4PK4 A; 3VUB A; 2V8K A; 2D8J A; 2IIM A; 3HTR A; 3I55 T; 1YHQ T; 3CCL A; 3UPU A; 1OI1 A; 2KAF A; 4EMK A; 2BE7 D; 3LH5 A; 1VQO T; 1VQ7 T; 2QXF A; 3OYN A; 4B9X A; 2MIO A; 4XQ3 A; 4BB7 A; 2WSE E; 3E1S A; 3I5S A; 2ESW A; 2AK5 A; 2XDB A; 2DVJ A; 3M4G A; 2EQK A; 2JOY A; 2AHJ B; 1PNJ A; 1UJ0 A; 2VB6 A; 2QA4 T; 1OZ2 A; 1FMW A; 1W1F A; 2AZV A; 1QVF A; 1NYF A; 4K11 A; 4AMC A; 3TQ7 P; 3FLG A; 3CCV A; 3A8O B; 1RAG B; 3RBB B; 4M7D A; 1ZLM A; 3BDU A; 3QJ6 A; 1JXO A; 4AG2 C; 2QI2 A; 4DEY A; 5CCA A; 2QTX A; 4OGE A; 1D09 B; 1N8R R; 1WHM A; 2F5T X; 5D6X A; 3QSU A; 2BE9 B; 2EKH A; 3JB9 D; 2ABL A; 1T0H A; 1PKT A; 2XIC A; 3EHQ A; 2RB6 A; 2O4X B; 3MO8 A; 3JCM f; 1JO8 A; 4J9G A; 1PSE A; 4RCC A; 1KC8 U; 5CKH A; 2A28 A; 1AD5 A; 1TU0 B; 4DBR A; 1KD1 C; 3V8K A; 2F69 A; 2HDA A; 4V2S A; 1EIF A; 3H0I A; 4B9W A; 2DAQ A; 3ZFJ A; 2YT6 A; 2CP7 A; 2LMJ A; 5HY6 A; 3VV0 A; 2OTJ Q; 1Q81 C; 2FG0 A; 1HK9 A; 3A1P A; 2QQA A; 1RL2 A; 2X4J A; 1WFW A; 2DEU A; 2MAM A; 5LJ3 h; 3OYC A; 5IHN A; 4KH0 B; 2X51 A; 1M8M A; 2Z0W A; 3J81 E; 1DJ7 B; 1TWB A; 2VWF A; 1OX9 A; 2GNC A; 2LP5 A; 3EFS A; 2X9H A; 3CCU Q; 2ROT A; 1FMV A; 3OYY A; 1YI2 T; 1QKX A; 5GAM d; 3ULR B; 2FRY A; 1EZZ B; 2W0Z A; 2L8D A; 5GAM f; 2QAS A; 1RAC B; 3H0F A; 2AKK A; 2DXC A; 5LJ3 j; 3JCM W; 2BZY A; 1EFN A; 2HMA A; 3T9N A; 2ZZD A; 4M7A C; 4J7I A; 1GL5 A; 1M1F A; 2WAC A; 2CS7 A; 2A37 A; 3RES A; 2O2O A; 2CUB A; 5FWB A; 2LQK A; 5IHK A; 1N27 A; 3FC3 A; 4F7U B; 2DD5 A; 3L2Z A; 3SB2 A; 2KI7 A; 1X27 A; 2COW A; 1AOJ A; 4JJC A; 1YJW T; 4FW1 A; 3V7R A; 2KRN A; 3MEW A; 4Z89 A; 1YCS B; 4M75 C; 1A0N B; 5GAM e; 2KE9 A; 2DL5 A; 2D6F A; 2QEX Q; 2RQT A; 2LQW A; 4GBQ A; 1TXQ A; 2RHI A; 1T0J A; 4CRI A; 2NLU A; 1Q7Y R; 1NG2 A; 2J6K A; 4J8O A; 4JRI A; 1VQ9 Q; 3HHT B; 2R57 A; 4DOV A; 1TS9 A; 1UHF A; 1UGQ B; 5CQX A; 2EGA A; 3OBW A; 1MHN A; 3M59 A; 2E3I A; 1LNX A; 4M7D D; 2L5Q A; 1KQS A; 3TSW A; 4M77 D; 2DTH A; 4MZP A; 4PLL A; 4KGV B; 5KE2 A; 1N9R A; 3OW2 A; 2XDD A; 1M1K C; 2D0N A; 4KRT A; 3J7A F; 2CP6 A; 3HL8 A; 3BE3 A; 1XTD A; 1SKU B; 1D1B A; 2K2M A; 1VQ8 T; 1G83 A; 1MMD A; 1N8R U; 4HVW A; 1NLP C; 5CK9 A; 9ATC B; 1M9S A; 2ZGW A; 4C0D B; 1YJ9 Q; 1WJS A; 3PTA A; 3ME9 A; 3A8M B; 1VQL A; 2OTL T; 1UFF A; 3A8G B; 2K5L A; 4EMG A; 2A0F B; 2BKD N; 3QHS A; 3TEE A; 1VIE A; 5KYX A; 1G3S A; 1I0C A; 2EFI A; 8ATC B; 1XJW B; 2E1H A; 2M0Y A; 1RLP C; 1OOT A; 1VQP A; 2E6Z A; 3WVD B; 1PC0 A; 5EG2 A; 2RPN A; 4OML A; 1YP5 A; 3JCM c; 3CCR Q; 4Y92 A; 1X43 A; 2AIR B; 3GIB A; 1VQ6 Q; 3CME A; 3G4S Q; 4PJO E; 4C0G A; 3CCJ Q; 4RG8 A; 4WTO B; 1WZO A; 2QTV A; 1I5L A; 5CKF A; 2DBM A; 1X6O A; 3QKJ A; 3EGU A; 3NHN A; 4DBF A; 2JS2 A; 5D6Y A; 1BU1 A; 3MET A; 4M7A E; 4LN2 A; 4PJO G; 3H9N A; 3RER A; 2CZ1 B; 4JS4 A; 1VQ5 A; 2OTJ T; 4E6R A; 1PRM C; 2JTF A; 2YRD A; 5GAN h; 1ZA1 B; 2AT1 B; 5GMK h; 5IT9 E; 1Q86 R; 3VYH B; 3KFV A; 2IVW A; 3CXC P; 1WHH A; 4M75 E; 5M9O A; 5GMK m; 5IAY A; 4RUG A; 3R6N A; 3RKW A; 3HP9 A; 1K4U S; 1N8R C; 3CCV Q; 3CCU T; 5CKD A; 3CC7 Q; 4ELZ C; 3UA7 A; 3FIF A; 1WHK A; 1W2B A; 1D3B B; 5GAN j; 4HCC A; 2XI9 A; 4CC4 B; 5GMK j; 1SSH A; 4II1 A; 3UWN A; 2NUT A; 3E2U A; 2K5I A; 3VU3 C; 4OMO A; 1H3H A; 3MP1 A; 1UUE A; 4M75 G; 1AVZ C; 3GNG A; 1Y57 A; 1SHF A; 8AT1 B; 5GAO p; 2CT4 A; 1Q7Y U; 3V8J A; 1PD0 A; 1RAI B; 1AHJ B; 3I55 Q; 1ABO A; 2MMP A; 4NOY A; 2D9T A; 3FRN A; 1IZ6 A; 2D8H A; 3CBO A; 4RCB A; 2W10 A; 1AWW A; 3EFR A; 1VQ7 Q; 2P0P A; 2LC4 A; 4PJO F; 1SEM A; 5HCK A; 2EW3 A; 4J6Y A; 4MZM A; 1D0Z A; 4JRK A; 1KD1 R; 2EYX A; 3VYG A; 4QVD A; 2JJ9 A; 1VA7 A; 2FPE A; 1LVK A; 2QEX T; 4LDV A; 3M0T A; 1WQW A; 1Q81 R; 1UGV A; 4O6J A; 3P8H A; 4A4H A; 5HKC A; 4PFO A; 3HFN A; 2HBW A; 3NTK A; 1Q95 G; 2YUQ A; 2DTI A; 2M16 A; 5LJ5 f; 3J80 E; 1QMC A; 2F5K A; 2LJ1 A; 1YWP A; 4RMO A; 1YIJ A; 1VQ9 T; 1K8A R; 5I21 A; 2P4T A; 4JRP A; 3PNW C; 3JCM b; 1R8O B; 1OPK A; 4ZTF A; 2GQV A; 4L59 A; 2EIF A; 2CZ7 B; 1X69 A; 4M78 D; 3JB9 I; 4AT1 B; 3CCQ A; 1LJO A; 2ZPI B; 2YLC A; 3PVL A; 2LX9 A; 4RTT A; 1ZHI A; 1F1B B; 4CI0 C; 3VRY A; 4M75 F; 1VQN A; 2PU9 B; 4WCI A; 3QO3 A; 4C8Q B; 3M5A A; 5DLQ E; 2YHT A; 3A98 A; 4AFU C; 1OYX A; 1PG5 B; 3L2R A; 2QAZ A; 3EFO A; 1YJ9 T; 5L23 A; 2DX1 A; 2HSE B; 1BI2 A; 1KG1 A; 3JCM P; 3F70 A; 3MJX A; 3MCA B; 4RKU E; 4XAX B; 2F1L A; 3MKD A; 1Z9Q A; 2MWO A; 4JJN K; 2K7A A; 2KEA A; 4RTW A; 1FWZ A; 1B3Q A; 3CCE A; 3CPF A; 1HSQ A; 3OYG A; 2CYZ B; 1IRX A; 2RF0 A; 3AT1 B; 3SWN C; 1SHG A; 1M2V B; 4Y28 E; 5GAO n; 1UE9 A; 4DOW A; 3PGG A; 4C92 B; 2CSQ A; 3LYI A; 2J6F A; 3JCM Q; 2RHX A; 1ACM B; 4FCY A; 4E7L A; 1RAB B; 4JLG A; 3CCR T; 4OB3 B; 3SDZ A; 1LOJ A; 3V8L A; 1VQK Q; 1Y7X A; 1ZSZ C; 4JLI A; 4FYY B; 5A0L A; 2EYY A; 1VQ6 T; 1ZX6 A; 3CCJ T; 4NL3 A; 5D7U A; 5LL6 S; 3I56 T; 2KXC A; 3TCJ A; 5L8R E; 1I4K 1; 4DQ2 A; 1AZG B; 1K9A A; 1JB0 E; 4BE2 A; 2RJD A; 3LX7 A; 2PVG B; 1KQ2 A; 3FJP A; 1AWO A; 3G71 A; 5FU6 B; 1RAE B; 1M1K R; 4KUL A; 4J7F A; 4LDX A; 4JJB A; 2O4X A; 3PIO A; 3X26 B; 2DER A; 1JU5 C; 4EPC A; 4QQ6 A; 1GBR A; 2MWP A; 3CCS A; 2K79 A; 3UT1 A; 2GFU A; 2J05 A; 2E70 A; 1VQL Q; 1J3T A; 1ZSG A; 3PIP A; 2GTO A; 1PM3 A; 2BTT A; 2FZG B; 1PSF A; 3ER0 A; 4MML A; 2DNU A; 4EMK C; 2L89 A; 3CCV T; 4C5E A; 2LT4 A; 1KD1 U; 3IQL A; 3OYF A; 4BDZ A; 4ESR A; 3RDV A; 1PKS A; 3G6E A; 2VVK A; 2M51 A; 1Q81 U; 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3JCM J; 1HJD A; 1K73 R; 4J9F A; 4RTX A; 5FRO A; 1H64 1; 5A2Q E; 1K8A C; 5GAN 5; 1KQS S; 1BKB A; 1M1K U; 3QZ5 B; 1P92 A; 5KCO A; 2D1X A; 4D8K A; 3TSZ A; 3OW2 S; 4LE9 A; 2PNI A; 1C0M A; 2NUP B; 2CZ0 B; 3JCM e; 2Y4Y A; 3R6O A; 4KUI A; 4F7U E; 3VRZ A; 4KT0 E; 4LNP A; 4KUD K; 2C0I A; 4LXC A; 1VQK T; 2HQX A; 2H3J A; 4JZ4 A; 5KYW A; 1YIJ Q; 2KYB A; 4X1V A; 4XTX A; 5KYU B; 2CP0 A; 4ZN3 A; 4O5V A; 3EGD B; 2PUK B; 4UC4 A; 1SRM A; 1NEB A; 3HPW A; 1WPY A; 2DRM A; 3QJY A; 4WF2 A; 3VS5 A; 1M30 A; 2LNV A; 2RQU A; 2DJQ A; 1WDX A; 3CCQ Q; 2KXD A; 1I1J A; 2O01 E; 3NTH A; 1G2B A; 4F7U G; 2RHY A; 1ZUK A; 4PFP A; 1G3T A; 2DL8 A; 2JTM A; 2OAW A; 2LX7 A; 3LLR A; 2HL5 C; 1VQN Q; 3EGX A; 2HZY A; 2V1Q A; 2WSC E; 3M57 A; 1K0X A; 2DZC A; 1TH7 A; 2P84 A; 4EMK B; 2CUD A; 3BW1 A; 3QBY A; 1M3A A; 4J9H A; 1GCQ C; 4IIM A; 1WNL A; 4ORZ A; 1OU8 A; 2E10 A; 2J06 A; 4Z88 A; 7AT1 B; 2LDM A; 3MEU A; 1VQL T; 4LD6 A; 3RKY A; 2QGF B; 4PL6 A; 3NGP A; 4PJM A; 2DJZ A; 4PJO A; 3A5Z B; 2F2X A; 5FU7 B; 3EG2 A; 3WXM B; 1X6G A; 4R56 A; 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