The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
MVLEYGEAIAKFNFNGDTQVEMSFRKGERITLLRQVDENWYEGRIPGTSRQGIFPITYVDVIKRPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Sorbin and SH3 domain-containing protein 1
|
| publication title |
Structural investigation of the interaction between the tandem SH3 domains of c-Cbl-associated protein and vinculin
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
12
|
| structure length |
66
|
| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-07-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1W6X A; 2K79 A; 4OML A; 2VVK A; 4DEX A; 5IXF A; 1RLQ C; 2RMO A; 1M3C A; 2FO0 A; 2GBQ A; 3M0P A; 2KYB A; 1WA7 A; 2EQI A; 1NLP C; 1AZE A; 1AEY A; 1K0S A; 1UE9 A; 1UG1 A; 1AZG B; 2L3Q A; 5IHI A; 4IIM A; 1EFN A; 4F17 A; 2A28 A; 4LNP A; 1AOJ A; 2BZ8 A; 3VS0 A; 2CUD A; 2D1X A; 4JJD A; 2FPD A; 1E7O A; 3LH5 A; 2JM9 A; 1M27 C; 2ED1 A; 2L0A A; 1T3L A; 1KSW A; 3GBQ A; 4D8D A; 2EKH A; 3U23 A; 1AWX A; 1MUZ A; 1TUD A; 1UFF A; 1X2Q A; 4HVW A; 1GCP A; 4FSS A; 3PVL A; 3UA6 A; 3NHN A; 1UEC A; 2QDL A; 1QKX A; 4OMM A; 3REB B; 2YT6 A; 1B07 A; 4F16 A; 3CQT A; 1SSH A; 1HJD A; 2FRW A; 2RN8 A; 1ZBJ A; 2LQN A; 2MOX A; 1M8M A; 4R0K A; 1JXM A; 2EYY A; 2KR3 A; 2I0N A; 2KEA A; 1PHT A; 4GBQ A; 3VS2 A; 2LX7 A; 3I35 A; 1H3H A; 2O9V A; 2DX1 A; 2E5K A; 4CC2 A; 2CH4 W; 3A98 A; 1UDL A; 4JPB W; 2LJ1 A; 2SEM A; 4J9C A; 5ECA A; 1PRL C; 2P4R A; 2ESW A; 2YUQ A; 4HXJ A; 1E6H A; 2C0I A; 1X27 A; 3JV3 A; 1Z9Q A; 5HCK A; 1Y57 A; 1GFC A; 2EGC A; 2O9S A; 2DF6 A; 4OMN A; 3EHQ A; 1RI9 A; 4D8K A; 1OPL A; 1QLY A; 4LN2 A; 1G2B A; 2ECZ A; 2BZY A; 5GJW B; 1NLO C; 2OAW A; 2EVR A; 2LJ3 A; 1VA7 A; 2RQW A; 2DBM A; 1SHF A; 1QCF A; 1NYG A; 1U5S A; 2CH4 A; 2KYM A; 2FRY A; 1QWF A; 1TG0 A; 4AG2 C; 2EYZ A; 4A63 B; 1UUE A; 1AWO A; 1X43 A; 5GJV B; 2D8H A; 2M51 A; 1HD3 A; 1V1C A; 1KJW A; 5I22 A; 2JW4 A; 2CUB A; 2KT1 A; 1YNZ A; 1K76 A; 2K2M A; 1JXO A; 3PVQ A; 2DL5 A; 3FJ5 A; 3VS4 A; 2OI3 A; 2YDL A; 2J06 A; 3ZL7 C; 1X2K A; 1UHC A; 1A0N B; 2KXC A; 2YUO A; 4F14 A; 2GTJ A; 4WCI A; 3VRZ A; 2MIO A; 1ZUU A; 2J05 A; 1YP5 A; 4J9E A; 1QWE A; 2PTK A; 2RQR A; 2SRC A; 2AZV A; 5IXB A; 1E6G A; 1NYF A; 1BBZ A; 1T3S A; 1K0X A; 4RTX A; 2W0Z A; 2DIL A; 1GBQ A; 2XMF A; 1ZX6 A; 4J9D A; 1TUC A; 2O88 A; 2AKL A; 1VYT A; 1X69 A; 4QT7 A; 1WFW A; 4LUE A; 2V1Q A; 1I0C A; 2HDA A; 2JTE A; 2EYW A; 1AWW A; 4JZ4 A; 4RTZ A; 4JJB A; 2DMO A; 2F2V A; 2JS2 A; 1MV3 A; 2D0N A; 3EHR A; 3H41 A; 1U06 A; 1G83 A; 1SEM A; 3R6N A; 4Y92 A; 2AZS A; 1AVZ C; 1X6G A; 3TSZ A; 2ABL A; 2DBK A; 1JQQ A; 1M3A A; 1BK2 A; 2JM8 A; 2PZ1 A; 1OPK A; 4Z89 A; 2YUN A; 1H92 A; 3IQL A; 1WI7 A; 1YN8 A; 4LUD A; 1WIE A; 4HCK A; 2HBW A; 4RTY A; 2LCS A; 2FPF A; 5I11 A; 2EGA A; 3EG1 A; 4Z8A A; 1NG2 A; 1NM7 A; 1I1J A; 1W70 A; 4HVU A; 2CT3 A; 4ZNX A; 3M0Q A; 1GRI A; 3QWX X; 2M0Y A; 2LQW A; 2G6F X; 1PRM C; 1K4U S; 1GBR A; 1ARK A; 1GCQ C; 3EGU A; 3M0R A; 2KBT A; 2DA9 A; 2EGE A; 2KT8 A; 1UGV A; 2NWM A; 4ORZ A; 1GCQ A; 3EG2 A; 4OMQ A; 1WYX A; 2A08 A; 1IO6 A; 2J6O A; 1K9A A; 4IIO A; 3SHW A; 2DL4 A; 4EIK A; 1NEB A; 2FEI A; 2VWF A; 2CT4 A; 2O2O A; 2BTT A; 1WXU A; 2KRS A; 1WDX A; 2F2X A; 3TSW A; 2D8J A; 5IHN A; 4J9H A; 1T0J A; 1UHF A; 3C0C A; 1ZSG A; 4CC7 A; 1J3T A; 1QKW A; 1H8K A; 2DRM A; 3UF4 A; 3I5S A; 2DL3 A; 1YWO A; 2ROT A; 2W10 A; 1OV3 A; 1ABQ A; 2J7I A; 2HEQ A; 3EG0 A; 2LP5 A; 2GGR A; 1PWT A; 2B86 A; 2J6F A; 2KXD A; 4AFU C; 1PKS A; 1SRL A; 1VYV A; 3H0F A; 2DL8 A; 3VS7 A; 3RBB B; 1UTI A; 3UA7 A; 1NEG A; 2ED0 A; 3I5R A; 4RTU A; 1Z9Z A; 2DLP A; 2JT4 A; 2OJ2 A; 4E6R A; 4RTV A; 3UAT A; 2ROL A; 1SPK A; 1WXT A; 1KFZ A; 2FG0 A; 1FYN A; 1M30 A; 4M4Z A; 1CKA A; 1N5Z A; 1B3Q A; 3SEM A; 4AFQ C; 4ESR A; 4J9I A; 2BZX A; 1XOV A; 3M0T A; 1KIK A; 1GFD A; 2CRE A; 2RF0 A; 1RLP C; 2X3W D; 4RUG A; 1LCK A; 2KNB B; 2EYX A; 3NMZ C; 4AFS C; 1SRM A; 1BU1 A; 2JMA A; 2AK5 A; 2CSQ A; 2K7A A; 4AFZ C; 1JU5 C; 4DEY A; 3VS5 A; 3REA B; 5EC7 A; 2GQI A; 1AD5 A; 3M0U A; 4OMP A; 4K11 A; 1U3O A; 1HSQ A; 1ZUY A; 2KRN A; 3EG3 A; 2RQT A; 2A36 A; 1Y0M A; 2RQV A; 2LMJ A; 4RTW A; 1CSK A; 2CDT A; 2LJ0 A; 2H8H A; 1WX6 A; 3VRY A; 4J9G A; 2A37 A; 2HCK A; 1S1N A; 1JEG A; 4JJC A; 2FPE A; 2GNC A; 1PKT A; 3VS6 A; 3QWY A; 3PE0 A; 2DVJ A; 1AWJ A; 1ABO A; 2ENM A; 4J9B A; 3VS1 A; 2K6D A; 1YWP A; 3RNJ A; 2DL7 A; 4OMO A; 2HSP A; 3M0S A; 1UJ0 A; 1UJY A; 3THK A; 2L3P A; 2O31 A; 1T0H A; 2DM1 A; 2DYB A; 5IH2 A; 4KRT A; 3NGP A; 2DNU A; 1JO8 A; 1K1Z A; 1RUW A; 1W1F A; 2RNA A; 2DE0 X; 4AG1 C; 1GL5 A; 2IIM A; 3KFV A; 4Z88 A; 4JZ3 A; 5L23 A; 2NUZ A; 2L3S A; 2KE9 A; 2KRO A; 4GLM A; 2JS0 A; 2GTO A; 2RPN A; 3TVT A; 2EBP A; 3VS3 A; 3H0I A; 3ULR B; 1X6B A; 2X3X D; 2AKK A; 4CC3 A; 5FWC A; 4CC4 B; 2DJQ A; 2V1R A; 2MCN A; 1PNJ A; 2EW3 A; 4X1V A; 2KRM A; 1BB9 A; 2C0O A; 2PNI A; 2EPD A; 5IHK A; 1ZLM A; 2C0T A; 5FW9 A; 1MV0 B; 1CKB A; 5FWB A; 1FMK A; 1ZUK A; 3O5Z A; 1M3B A; 1OOT A; 2JXB A; 2VKN A; 2JMC A; 4HVV A; 2YSQ A; 2K3B A; 2RQU A; 1OEB A; 1WLP B; 4RTT A; 2KGT A; 1YCS B; 1I07 A; 2J6K A; 2YUP A; 4J9F A; 1WXB A; 3NPF A; 3I9Q A; 2CSI A; 2F2W A; 3H0H A; 2LZ6 B; 2L2P A; 4LE9 A; 2LNH B; 2K9G A; 2DRK A; 1SHG A; 1VYU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5FU6 B; 2NLU A; 4HKE A; 2RI3 A; 5GMK i; 5IXF A; 2GQV A; 2I2L A; 2RMO A; 2DXB A; 1OU9 A; 4C5G A; 3M0P A; 2KYB A; 4E2F B; 2EQI A; 1HXD A; 1IGU A; 1U8R A; 4DBH A; 2LX9 A; 2QK0 A; 4Y91 A; 2D6F A; 1AOJ A; 3LH0 A; 2BZ8 A; 3VS0 A; 1K9M R; 4JJD A; 5FU7 C; 2JTM A; 4ANJ A; 2KDS A; 4F7U E; 1MUZ A; 4FSS A; 2V8K A; 4X9C A; 3UA6 A; 1KG1 A; 1FXX A; 4OMM A; 2YT6 A; 2DVE A; 4N4G A; 5LJ5 e; 1MND A; 2YRC A; 2EYY A; 2KR3 A; 2I0N A; 1YJ9 Q; 1YJN A; 2MWO A; 2HMA A; 2O9V A; 2E5K A; 1M5Q 1; 2CH4 W; 2O01 E; 1UDL A; 1VQN Q; 2SEM A; 2LTO A; 1R8O B; 1UB4 A; 5ECA A; 2P4R A; 1E6H A; 1MMN A; 3CCJ T; 1Y57 A; 1GFC A; 2EGC A; 2DF6 A; 3CCM T; 5HK3 A; 1RAF B; 1M8V A; 1RI9 A; 2QTV A; 1WQ7 A; 2QI2 A; 8AT1 B; 2LRQ A; 4A4F A; 3CC2 A; 1OPL A; 1TSF A; 4MDW A; 2JTF A; 3CD6 A; 4VUB A; 1VQO Q; 1VQ8 Q; 4C92 G; 3EH1 A; 1WHK A; 2EVR A; 2MI6 A; 1VA7 A; 2RQW A; 3GOX A; 2CH4 A; 4XTZ A; 2FRY A; 1XQH A; 3PTA A; 2D8H A; 5AT1 B; 1Q82 R; 3OS5 A; 1K9M C; 2KT1 A; 2K2M A; 3PVQ A; 1JRI A; 3A8L B; 2DL5 A; 3L2W A; 4M7D G; 3ZL7 C; 4C8Q G; 4M75 E; 2YXY A; 4JLI A; 4E7H A; 3VRZ A; 2MIO A; 2G3R A; 4P5N A; 3G4S T; 2J05 A; 4J9E A; 3D7S B; 1YIT T; 3CME A; 3PNW C; 1T3S A; 2PVD B; 2W0Z A; 2DIL A; 3S3O A; 5LJ5 g; 1TUC A; 4KH0 B; 1X69 A; 1Q86 C; 2FHD A; 2FYK A; 3M54 A; 2K5I A; 4QT7 A; 2E12 A; 1I0C A; 3MCA B; 1UEB A; 5LJ3 g; 2HDA A; 2CP0 A; 4RTZ A; 1Q82 U; 1QVF P; 3EGX A; 2JS2 A; 3CPW S; 1MV3 A; 6AT1 B; 1Q81 C; 1KK7 A; 3I56 A; 3ME9 A; 2AZS A; 3BW1 A; 2EJF A; 3LGL A; 5IN1 A; 2R57 A; 1M9S A; 1KQ2 A; 4Z89 A; 2DET A; 2X4X A; 2DYI A; 4KBM B; 1YJW T; 1D3B B; 1WIE A; 2HBW A; 2ATC B; 2V26 A; 5I11 A; 1D0Z A; 1I1J A; 3C94 A; 1X75 C; 2YHT A; 4OGC A; 4EMK A; 3CCJ Q; 2XDD A; 4HCC A; 3M0Q A; 1M2V A; 3RUX A; 1GRI A; 3QKJ A; 3RIR A; 2CZ7 B; 3CCM Q; 2M0Y A; 1X01 A; 2OAU A; 1PRM C; 3JCM g; 3FC3 A; 4CRI A; 4WF2 A; 3EGU A; 3M0R A; 3C4S A; 1XNI A; 2DA9 A; 2KT8 A; 3E1S A; 5CK9 A; 3OYG A; 1IO6 A; 3I55 A; 1K9A A; 1PG5 B; 2DPP B; 4RG2 A; 2OX7 A; 2VWF A; 2BTT A; 5CKB A; 3N5B B; 4M75 D; 1WDX A; 3JB9 F; 4XK8 E; 3LGF A; 3BE3 A; 5LJ5 h; 4IUU A; 3OSS C; 2CP6 A; 2K3X A; 1K73 U; 2VUB A; 3UPU A; 5CAI A; 2HKQ B; 1B7T A; 3CCE A; 4FT2 A; 3UF4 A; 3MJX A; 5LJ3 h; 2CGH A; 2DL3 A; 4ZGJ B; 5FRM A; 1YWO A; 3RMQ A; 4M78 A; 1N9S A; 1AHJ B; 2J7I A; 3M9Q A; 3R6O A; 5KE3 A; 3G4S Q; 5GAN j; 2GGR A; 1YIT Q; 1YIJ T; 4QQ6 A; 2CZ6 B; 1KQS S; 2K2V A; 3VS7 A; 3F70 A; 4XTY A; 5D7U A; 4OB0 B; 3EH2 A; 4NL3 A; 3DB3 A; 1M1K R; 3S3N A; 2DJZ A; 1IXD A; 3MEW A; 4RTV A; 3CBM A; 3LW5 E; 2NYS A; 1SPK A; 3G6E T; 4MMK A; 5D6W A; 1KHI A; 3JCM h; 4N4H A; 4C8Q C; 4M4Z A; 1N5Z A; 3AT1 B; 4ESR A; 4J9I A; 2RF0 A; 3HFO A; 2X3W D; 4RUG A; 3H6Z A; 2HQH A; 5KCO A; 3QII A; 4XQ3 A; 2WAC A; 2E3I A; 3A8O B; 3GF5 A; 1YJW Q; 3REA B; 2MPX C; 1AD5 A; 2DZC A; 4OMP A; 2MWP A; 2XIC A; 4J6W A; 1ZUY A; 3EG3 A; 3FDR A; 3QO3 A; 4LD6 A; 2MAM A; 1H3Z A; 4LDV A; 1ZBX A; 1NJI U; 3T9N A; 2QA4 A; 4RTW A; 5GAN 5; 3LWI A; 1C6V X; 3OQ5 A; 4Z02 A; 2FZG B; 2H8H A; 1WGS A; 1WX6 A; 5GAN f; 3QZ9 B; 2HCK A; 2QQS A; 3P8B B; 2BE7 D; 2GNC A; 4JJC A; 3QWY A; 1WHH A; 2RJC A; 3AHU A; 2OTL A; 3X24 B; 2HSP A; 3EGD B; 1KHC A; 4RMO A; 4HT9 A; 1BKB A; 1T0H A; 1PSF A; 3OS0 A; 3NGP A; 4IUP A; 3OYL A; 1K1Z A; 2RNA A; 2CP7 A; 2XDP A; 4HA8 A; 3V8J A; 2AHJ B; 4JZ3 A; 4ZN1 A; 3CCS T; 2RI5 A; 4BUG A; 4OMF B; 3M53 A; 3OW2 A; 2JS0 A; 1ZHI A; 4ME7 A; 2RPN A; 2EBP A; 3H0I A; 3ULR B; 4J5Y A; 4LDW A; 2QEX A; 1TUG B; 4GY5 A; 2EAY A; 4BI8 B; 4CC4 B; 4XU1 A; 2JOY A; 3FIF A; 2D0Q B; 1M2O A; 3MHX A; 4BAC A; 2YLB A; 4PJO G; 4O6J A; 5FW9 A; 3GP8 A; 1N8R R; 1MV0 B; 5FU6 C; 4B9W A; 1QCN A; 4C5I A; 1FMK A; 2EQU A; 2VKN A; 4HVV A; 2YSQ A; 2BUD A; 2RQU A; 2B8A A; 1BI3 A; 1WLP B; 4RTT A; 1WJR A; 2XID A; 3G6E Q; 4QVZ A; 3M4Y A; 3NPF A; 3I9Q A; 3UWN A; 3QHS A; 4E7S A; 3M59 A; 2DZ9 A; 2CSI A; 3L1A A; 2E6Z A; 2F2W A; 2L5Q A; 4IUV A; 3OS1 A; 4C92 F; 2DRK A; 4C92 B; 2HKN A; 3PT9 A; 1VQ4 A; 4L59 A; 1KD1 C; 3QDR B; 4BDZ A; 2L3R A; 2VVK A; 4DEX A; 3GIB A; 3CC7 A; 1M3C A; 2GBQ A; 1WA7 A; 1NLP C; 2AT1 B; 1AEY A; 2CKK A; 1UG1 A; 1N8R U; 2CZ1 B; 2L3Q A; 1VQM A; 1D3B A; 3EFO B; 4F17 A; 3OS2 A; 1IB8 A; 1X6O A; 1RI0 A; 2VC8 A; 3GNG A; 3P8D A; 1M1F A; 1M27 C; 2ED1 A; 1S72 A; 3CCQ A; 1UGP B; 1D1B A; 1I5O B; 4C8Q F; 1OYX A; 4D8D A; 4C8Q B; 5I21 A; 2RK2 A; 1X2Q A; 1QP3 A; 2KVQ G; 1UEC A; 1OZ3 A; 1QKX A; 2K5L A; 2LDM A; 2LQ8 A; 2R5M A; 1B07 A; 4F16 A; 2E1H A; 3RKW A; 1SSH A; 2QDY B; 2ZPF B; 5GAN 3; 5GAO n; 5CQY A; 1NBE B; 2RN8 A; 2MOX A; 4R0K A; 4LDY A; 1M90 C; 3VS2 A; 3CC2 T; 2YRV A; 3I35 A; 3M58 A; 3CCU T; 1H3H A; 1PM3 A; 3A98 A; 5GAN 6; 1VQ7 A; 4JPB W; 1VQP T; 1Y07 A; 1KQS A; 1I4K 1; 3SB2 A; 1PRL C; 5KH6 A; 1RAH B; 2ESW A; 1QCO A; 2FZC B; 2C0I A; 4A4E A; 3QUI A; 3CCS Q; 3PFS A; 5I2S A; 5GMK l; 2K57 A; 1PD1 A; 2E10 A; 3VU3 C; 3X28 B; 4C0D B; 2KQW A; 2EWN A; 4EMG A; 4LN2 A; 1KC8 C; 2X35 A; 5KYU B; 5C0M A; 2BZY A; 3CCL A; 1WQW A; 1Q7Y C; 2LJ3 A; 5KCH A; 3SD4 A; 2DBM A; 2DEU A; 2QXF A; 4OB3 B; 1U5S A; 2KYM A; 1QVP A; 4XTU A; 1QWF A; 1TG0 A; 4AG2 C; 4A63 B; 1QVF S; 4BB7 A; 4C0Z A; 1X43 A; 2YRD A; 5GJV B; 2WSF E; 4FW2 A; 4M7A G; 2RHZ A; 4PLL A; 5I22 A; 4WTO B; 2CUB A; 1YNZ A; 1IGQ A; 3OYE A; 1JXO A; 3C12 A; 1VQ5 T; 2HAX A; 4PJM A; 3FJ5 A; 3CBO A; 1K8A U; 3G71 A; 3OBW A; 1JB0 E; 4M77 G; 2OI3 A; 3VS4 A; 1UHC A; 1VQK A; 2V8J A; 2HBP A; 2R58 A; 2YUO A; 3TQ7 P; 4WCI A; 4LDX A; 4NOY A; 2PTK A; 2SRC A; 5I2M A; 1E6G A; 1NYF A; 3OYF A; 3I56 T; 1GBQ A; 2XMF A; 2O88 A; 2AKL A; 3X20 B; 3INZ A; 2IPO B; 2RJD A; 4PFO A; 2VB6 A; 2Y90 A; 2JTE A; 5IAY A; 3HHT B; 3EFR A; 4JJB A; 4NL2 A; 4Q5W A; 2DMO A; 2F2V A; 3RMS A; 4KH1 B; 2P4T A; 5CKD A; 1U06 A; 1G83 A; 1SEM A; 3R6N A; 3OA6 A; 1AVZ C; 2VV5 A; 3TSZ A; 2ABL A; 4M78 E; 1SKU B; 1JQQ A; 4MDX A; 2JM8 A; 1V29 B; 1OPK A; 3CCU Q; 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