The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
86
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structure length |
86
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Chain Sequence |
GSMSAEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEAKPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| molecule keywords |
PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT SH3 DOMAIN
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| publication title |
Solution structure and ligand-binding site of the SH3 domain of the p85 alpha subunit of phosphatidylinositol 3-kinase.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bos taurus
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| total genus |
6
|
| structure length |
86
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| sequence length |
86
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1993-07-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3EG0 A; 1ARK A; 5HCK A; 4F16 A; 1AEY A; 3ULR B; 4ZNX A; 2LQN A; 2C0I A; 3EG1 A; 1KIK A; 1NYF A; 2L2P A; 2LJ1 A; 2EQI A; 1AWJ A; 4AFQ C; 2AKK A; 4A63 B; 1SSH A; 2DMO A; 3QWX X; 2L0A A; 1H92 A; 1HSQ A; 1RLQ C; 2CH4 A; 4J9E A; 1NLO C; 2OJ2 A; 2HSP A; 4J9B A; 2ESW A; 2EBP A; 2CUB A; 1HD3 A; 1A0N B; 1W6X A; 1M3B A; 2FG0 A; 2KXD A; 2PZ1 A; 2M51 A; 1VA7 A; 2V1Q A; 1V1C A; 2LX7 A; 3VS1 A; 1T0J A; 4RTW A; 1UGV A; 1X27 A; 2DYB A; 1UG1 A; 2CH4 W; 4JJB A; 1QKX A; 3M0Q A; 4FSS A; 4CC7 A; 4AG2 C; 2BZX A; 1OPL A; 1RI9 A; 2DRM A; 1UFF A; 1VYT A; 1Z9Q A; 1K1Z A; 2FPF A; 4HVW A; 5EC7 A; 1OPK A; 1WX6 A; 1KSW A; 1YNZ A; 2KE9 A; 1GRI A; 1MV0 B; 2A08 A; 3VS3 A; 1AZE A; 4RTU A; 2LCS A; 2D0N A; 2KRN A; 3VS0 A; 1T3L A; 1WXB A; 1GFD A; 3EHQ A; 1GCQ A; 1G2B A; 1LCK A; 3M0U A; 1ABQ A; 1WFW A; 3NMZ C; 2H8H A; 1QLY A; 1WXU A; 1I0C A; 3UA7 A; 2IIM A; 5IXF A; 4Z88 A; 2DL8 A; 3M0T A; 3CQT A; 1YWO A; 1E7O A; 2B86 A; 2RQR A; 2EGE A; 1AWW A; 1TUC A; 5I11 A; 1B3Q A; 4F17 A; 2SRC A; 3FJ5 A; 2ABL A; 2J06 A; 1B07 A; 3UA6 A; 4J9G A; 1N5Z A; 2AKL A; 1WI7 A; 2KEA A; 1TG0 A; 2JM8 A; 1RLP C; 2CT3 A; 1BK2 A; 2KNB B; 2A36 A; 3M0P A; 3VS6 A; 5I22 A; 3VS7 A; 3THK A; 2A28 A; 2AZS A; 2HEQ A; 4IIM A; 1GCP A; 2O9S A; 1HJD A; 4LUE A; 2L3P A; 2X3W D; 3O5Z A; 2F2V A; 2EGC A; 2CDT A; 2QDL A; 2F2X A; 2ENM A; 2RQV A; 4RTX A; 4J9I A; 2CT4 A; 1YCS B; 1M30 A; 2M0Y A; 1TUD A; 1ZX6 A; 4LE9 A; 4RTY A; 1ZUK A; 2X3X D; 1FMK A; 1VYV A; 2D1X A; 5FWB A; 2KT1 A; 2LJ0 A; 1JEG A; 1VYU A; 4HXJ A; 1X2K A; 2ECZ A; 4JZ4 A; 3VS5 A; 1NM7 A; 1JU5 C; 1U3O A; 3QWY A; 4ESR A; 4RTZ A; 2DX1 A; 2EW3 A; 2DE0 X; 4E6R A; 2O2O A; 4DEX A; 1AD5 A; 2LMJ A; 2DA9 A; 2CUD A; 2L3Q A; 3I35 A; 3I5R A; 2JS0 A; 3JV3 A; 4F14 A; 2EYY A; 1WIE A; 2ROL A; 4AFS C; 2YUN A; 2NUZ A; 3M0R A; 4ORZ A; 2C0T A; 2RN8 A; 2DRK A; 2RQT A; 1GCQ C; 2HDA A; 1Y57 A; 1AOJ A; 1WXT A; 2K9G A; 4R0K A; 5IXB A; 1UTI A; 5L23 A; 4OMO A; 1H8K A; 1ZUY A; 3NHN A; 2LQW A; 1UDL A; 1T3S A; 4KRT A; 2FRY A; 4J9D A; 1X6G A; 3REB B; 2MIO A; 2JMA A; 4JPB W; 4D8D A; 1J3T A; 1KFZ A; 1WYX A; 1NLP C; 2BZY A; 2VVK A; 3RBB B; 2SEM A; 2RMO A; 2K6D A; 2J7I A; 1EFN A; 2DL5 A; 4AFZ C; 4CC4 B; 1W70 A; 3UF4 A; 1E6H A; 1SEM A; 2GTO A; 2AK5 A; 1UJY A; 2PNI A; 2J6O A; 2ED1 A; 1E6G A; 2D8J A; 1AWO A; 3EG2 A; 1UUE A; 1SRM A; 2KXC A; 2LNH B; 2CRE A; 5IH2 A; 2DBM A; 1I07 A; 3EG3 A; 2DF6 A; 4HVV A; 2HBW A; 2KR3 A; 1PHT A; 2VWF A; 3A98 A; 2RQU A; 3H0I A; 1K4U S; 2KRM A; 1ZUU A; 2FRW A; 3GBQ A; 4CC3 A; 3RNJ A; 1JO8 A; 2K7A A; 2BZ8 A; 4DEY A; 1ZBJ A; 1GFC A; 2JS2 A; 3ZL7 C; 4OML A; 4Y92 A; 3EHR A; 1T0H A; 4J9C A; 3VS2 A; 1QWE A; 1PWT A; 3EGU A; 3I5S A; 3H0H A; 2AZV A; 1NEG A; 2JW4 A; 1JXO A; 4JZ3 A; 1CKA A; 1M8M A; 1CSK A; 1QWF A; 1X2Q A; 1AWX A; 4OMQ A; 2MCN A; 5ECA A; 3PE0 A; 3PVQ A; 5IHI A; 2J05 A; 2V1R A; 1PNJ A; 1K9A A; 2F2W A; 4RUG A; 2MOX A; 4J9H A; 1H3H A; 4JJD A; 2GGR A; 2FPE A; 4CC2 A; 2DNU A; 1BBZ A; 4Z89 A; 3IQL A; 4J9F A; 3TVT A; 4IIO A; 2C0O A; 2K79 A; 2KYM A; 2RQW A; 2JTE A; 3TSZ A; 2JXB A; 2KT8 A; 2YDL A; 2W10 A; 3I9Q A; 3SHW A; 2DBK A; 5GJW B; 3H41 A; 2EYZ A; 5FW9 A; 1UEC A; 2GQI A; 1SHF A; 5FWC A; 2DM1 A; 3M0S A; 1MUZ A; 1UE9 A; 2EVR A; 2L3S A; 1PKS A; 2EYW A; 3SEM A; 2ED0 A; 2J6K A; 4AFU C; 2KYB A; 2DIL A; 2PTK A; 5IHK A; 2J6F A; 4HCK A; 4OMM A; 1K0X A; 3VS4 A; 2RNA A; 1Y0M A; 2JM9 A; 1S1N A; 2DLP A; 3C0C A; 1K76 A; 2K3B A; 4LNP A; 4Z8A A; 4AG1 C; 2O9V A; 2I0N A; 1GBR A; 2YUO A; 3VRY A; 1X43 A; 2YUP A; 1OEB A; 3VRZ A; 1ZSG A; 2EYX A; 1M3A A; 1PRM C; 1SPK A; 2P4R A; 4RTV A; 4GBQ A; 2FO0 A; 1FYN A; 2EKH A; 4EIK A; 1ABO A; 2OI3 A; 1U06 A; 1UJ0 A; 2GTJ A; 1IO6 A; 1X69 A; 1SRL A; 1UHF A; 2JMC A; 2KRO A; 4JJC A; 3TSW A; 2K2M A; 2A37 A; 2DL3 A; 1CKB A; 1YWP A; 2EPD A; 2XMF A; 4RTT A; 2YUQ A; 2YSQ A; 2HCK A; 1RUW A; 1U5S A; 4WCI A; 2GNC A; 4D8K A; 2EGA A; 2JT4 A; 2KBT A; 4QT7 A; 1NEB A; 1I1J A; 1OOT A; 3PVL A; 5GJV B; 1BB9 A; 2DL4 A; 3KFV A; 3R6N A; 1BU1 A; 1G83 A; 2CSI A; 4M4Z A; 4K11 A; 1MV3 A; 1AVZ C; 1NYG A; 1M27 C; 2G6F X; 2OAW A; 4LN2 A; 1GBQ A; 3REA B; 2LJ3 A; 3NGP A; 4X1V A; 2VKN A; 1Z9Z A; 1JQQ A; 1W1F A; 1ZLM A; 2KGT A; 1PRL C; 2DJQ A; 2BTT A; 4GLM A; 1PKT A; 1X6B A; 3UAT A; 1M3C A; 4LUD A; 2FEI A; 2DL7 A; 1WDX A; 2O31 A; 2FPD A; 1K0S A; 3U23 A; 1OV3 A; 4OMN A; 1UHC A; 3LH5 A; 4HVU A; 2O88 A; 1KJW A; 1QCF A; 2KRS A; 3H0F A; 2YT6 A; 2D8H A; 2RPN A; 1YP5 A; 2NWM A; 1YN8 A; 1JXM A; 2CSQ A; 1NG2 A; 2LP5 A; 1QKW A; 2W0Z A; 1XOV A; 1WLP B; 2RF0 A; 2GBQ A; 5IHN A; 3NPF A; 1WA7 A; 2E5K A; 1SHG A; 2ROT A; 1GL5 A; 2DVJ A; 4OMP A; 1AZG B; 2LZ6 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4BI4 A; 2QA4 Q; 4KUD K; 5J3B A; 1ARK A; 1AEY A; 4M77 F; 2RHZ A; 2C0I A; 1KHC A; 2L2P A; 2P0P A; 2OTL T; 2DMO A; 3CBM A; 3CCL Q; 4OP0 A; 1HSQ A; 1RLQ C; 4MZP A; 3UT1 A; 4E7Z A; 3OSS C; 5J26 A; 5KYY A; 4M77 C; 3RIR A; 1YIJ A; 2KXD A; 1MMG A; 1WHJ A; 1BKB A; 3VS1 A; 2CKK A; 1T0J A; 4IUT A; 3V7C A; 4E7I A; 4JLI A; 1UG1 A; 2NUP B; 1BYM A; 4C0G A; 2RHX A; 1RAE B; 5CQX A; 3FEO A; 4C92 E; 3M4G A; 4IKF A; 2AHJ B; 1VQ6 A; 1EX4 A; 2COZ A; 2FPF A; 5EC7 A; 4O6J A; 1WX6 A; 3QSU A; 1YNZ A; 2KE9 A; 3MHX A; 4E7K A; 1QVF S; 2YWW A; 4RTU A; 2LCS A; 5GAN e; 4PJL A; 1GCQ A; 1RAH B; 3TCJ A; 2EYQ A; 2PUO B; 1N8R C; 1ABQ A; 1VQM T; 1JB0 E; 1QLY A; 1WXU A; 3UA7 A; 2IIM A; 5FU7 B; 5IXF A; 1PC0 A; 4Z88 A; 2JN0 A; 2DL8 A; 3QG1 A; 1WHG A; 1G3W A; 4PJO D; 2D6F A; 3RES A; 3TRE A; 4EMK C; 1BCO A; 1BI0 A; 5LJ3 h; 2H3E B; 5I11 A; 2RK2 A; 2EIF A; 4M75 G; 2E6Z A; 2OTL A; 3G4S T; 3PGG A; 2ABL A; 2HSE B; 2AKL A; 5CKD A; 2CT3 A; 4PJJ A; 2WSE E; 1BIB A; 2LRQ A; 3THK A; 3G6E A; 2VV5 A; 4A4H A; 3L2Q A; 1NBE B; 2L3P A; 2M16 A; 4M7D D; 2EGC A; 1Q86 R; 3E9F A; 2F2X A; 4ELY C; 2RQV A; 4XU0 A; 4J9I A; 1YIT Q; 2M0Y A; 2K5F A; 3LYI A; 1ZX6 A; 4LE9 A; 3CBP A; 2X3X D; 5LJ5 f; 1FMK A; 1VYV A; 2D1X A; 5FWB A; 2C06 A; 3E1S A; 1JEG A; 1VYU A; 4HXJ A; 1D0Z A; 1X2K A; 5CVI A; 3VS5 A; 1U3O A; 3CCV T; 4ESR A; 1D1A A; 2DX1 A; 3CBO A; 2X4X A; 4V2S A; 1KC8 U; 3OYA A; 1AD5 A; 4A4F A; 3MPU B; 5CIU A; 4MML A; 3I5R A; 1VQM A; 1M1K C; 5GMK e; 4J8O A; 3JV3 A; 2DYI A; 2GFU A; 4AFS C; 5KYU A; 5GAN 3; 3CD6 A; 4M75 F; 2DRK A; 2RQT A; 4Q5W A; 1WXT A; 2K9G A; 5IXB A; 5L23 A; 1M2O A; 4OMO A; 1ZUY A; 4XU1 A; 3NHN A; 1MMN A; 4UC4 A; 4A4E A; 3A8G B; 4PJO E; 3HKS A; 5D6Y A; 4E7S A; 2B8A A; 4D8D A; 2E70 A; 4NOY A; 2HMA A; 4QVD A; 3SFM A; 1NLP C; 1H64 1; 1EFN A; 4M75 C; 2O01 E; 2Z0W A; 1E6H A; 1WJR A; 3C4S A; 1UJY A; 2ED1 A; 1AWO A; 3JAM E; 1N8R R; 1UUE A; 1WQ7 A; 4L59 A; 3E9G A; 3PIP A; 2DBM A; 1NJI U; 3JCM f; 3EG3 A; 4M7D E; 5IN1 A; 1PHT A; 1RAF B; 2M9U A; 1BI2 A; 2RQU A; 3G71 T; 2FRW A; 2K2V A; 3V8K A; 1FX7 A; 2KQW A; 3ZEH A; 1YIJ Q; 1NPP A; 4Y92 A; 3EHR A; 3P8D A; 4J9C A; 1OZ2 A; 3L2W A; 4M78 B; 4OB3 B; 2ZCF B; 1FMW A; 4QQD A; 4A4K A; 4M7A A; 1RI0 A; 4M77 B; 1NEG A; 5GMK i; 2K4Y A; 2Y90 A; 2WSC E; 4OMQ A; 2XHC A; 1WQW A; 1PNJ A; 1K9A A; 4XU3 A; 3JB9 H; 2HBP A; 5LJ5 j; 1H3H A; 2ZPH B; 2XK0 A; 2DK3 A; 4J9F A; 1Q7Y U; 4IIO A; 2RQW A; 2V8J A; 3M9Q A; 2JXB A; 2YDL A; 3GNF B; 2IG0 A; 1SG5 A; 2L8D A; 2DBK A; 2RD1 A; 3CCM T; 1IGU A; 5FW9 A; 4BDY A; 2QEX A; 1SHF A; 1M1K R; 2QA4 T; 3N5B B; 5A2Q E; 3QZ9 B; 5GAN h; 3DB3 A; 2EVR A; 4J6W A; 2EQU A; 3S3M A; 2O4X B; 2FZC B; 2J6K A; 3TQ7 P; 4EMK B; 3G71 A; 2KYB A; 3G6E Q; 2M0O A; 2XI9 A; 5I21 A; 2PTK A; 2AT1 B; 1S72 A; 1PM3 A; 4Z02 A; 3C94 A; 1RAC B; 3CEY A; 2JM9 A; 2DLP A; 4II1 A; 1OX9 A; 4LNP A; 3QBY A; 2M02 A; 4N4I A; 3L2R A; 4JRP A; 1GBR A; 2VUB A; 1Y07 A; 4ZN1 A; 5I2S A; 1V76 A; 2EYX A; 1W4S A; 1M3A A; 2ZPE B; 2RB6 A; 2CP7 A; 3LGL A; 2NLU A; 3JCM J; 1Y71 A; 2FO0 A; 4GBQ A; 3FJP A; 4EIK A; 1GXI E; 2HQH A; 4FT4 A; 1X69 A; 4JJC A; 3EH1 A; 3TSW A; 4F7U A; 2A37 A; 1CKB A; 1ZQ1 A; 2DXU A; 5GAM f; 2JOY A; 3M56 A; 1Q81 R; 3CD6 Q; 2DEQ A; 2YSQ A; 3PTA A; 4JLG A; 3JB9 D; 4BUG A; 5HK3 A; 1YJ9 A; 2GNC A; 2JUF A; 4D8K A; 3QZ5 B; 4BB7 A; 1U1S A; 4QT7 A; 4PLI A; 1I1J A; 2DO3 A; 1YJN A; 1RAI B; 4R56 A; 4PJN A; 2E1H A; 3R6N A; 1BU1 A; 5GMK h; 4WF2 A; 4M4Z A; 4FYX B; 4C5E A; 1B34 B; 2H3J A; 3OYB A; 1NYG A; 2GQV A; 2XIC A; 3CCL A; 1GBQ A; 3REA B; 4C8Q A; 4PJM A; 1Z9Z A; 4MMK A; 3LLR A; 4QVZ A; 2BTT A; 3OYY A; 1X6B A; 3UAT A; 5LJ5 d; 1M3C A; 3MCA B; 4IUR A; 4LUD A; 4X9D A; 1R77 A; 1OV3 A; 3I56 A; 1KJW A; 3H8Z A; 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3H6Z A; 1PSE A; 1B07 A; 3UA6 A; 3EG9 B; 1WI7 A; 4M7A G; 2JM8 A; 3GF5 A; 1RLP C; 2LQ8 A; 2KNB B; 3M0P A; 2KMT A; 2A28 A; 4RMO A; 2WAC A; 2AZS A; 2VYT A; 2ZPF B; 2NUT B; 2RHY A; 1HJD A; 2G3R A; 2D9T A; 3ME9 A; 4M78 E; 3CC4 A; 2E6N A; 2LT1 A; 5IT9 E; 3O5Z A; 2F2V A; 2K5L A; 2MAM A; 2CDT A; 4M77 E; 2QDL A; 4PNO A; 2ENM A; 1Q86 C; 1M9S A; 2DZC A; 5GAN 4; 2XDP A; 2QQB A; 1YJ9 Q; 1VQO Q; 3QHS A; 3OW2 P; 5LJ3 g; 2KT1 A; 2LJ0 A; 4DBR A; 3H9N A; 4JZ4 A; 2EQK A; 4E7H A; 4NS5 A; 1JU5 C; 3VYG A; 5GAO l; 1YJN Q; 1BI3 A; 4RTZ A; 2EW3 A; 1M1K U; 5M9O A; 1UGP B; 2HKQ B; 4E6R A; 2O2O A; 4DEX A; 2X9H A; 2LMJ A; 1Q82 C; 2K57 A; 3I35 A; 3BW1 A; 1C6V X; 4J7I A; 2EYY A; 1RAB B; 4M78 C; 1WIE A; 3G6E T; 2YUN A; 3EGD A; 3M0R A; 4ORZ A; 3OA6 A; 1Y57 A; 4R0K A; 5CAI A; 4M7A F; 3I56 Q; 1X6O A; 2AIR B; 3EFS A; 5DLO A; 5FRN A; 1YBY A; 2LQW A; 1D1B A; 3M5A A; 2E3I A; 3FLG A; 1N6A A; 4M75 D; 1KG1 A; 2GCX A; 4JPB W; 3I55 Q; 2KK4 A; 1YCY A; 1YI2 A; 2BZY A; 2VVK A; 2SEM A; 5GAM d; 2K6D A; 4HT8 A; 2J7I A; 2DL5 A; 4CC4 B; 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