The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
MGPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLDSGTGKELVLALYDYQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Cytoskeleton
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| molecule keywords |
ALPHA-SPECTRIN
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| publication title |
The order of secondary structure elements does not determine the structure of a protein but does affect its folding kinetics.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
10
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| structure length |
61
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| sequence length |
61
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1996-02-29 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EGA A; 1U3O A; 4JJB A; 2OI3 A; 2KRM A; 2JMA A; 2RQT A; 1JQQ A; 1NLP C; 4CC3 A; 4ESR A; 2MCN A; 1GL5 A; 1PWT A; 1UJY A; 1XOV A; 2YT6 A; 1LCK A; 4CC7 A; 2EYW A; 2DRK A; 2JXB A; 3QWY A; 1WI7 A; 2DVJ A; 2DYB A; 2DJQ A; 2KR3 A; 3PVQ A; 2FRW A; 3UA7 A; 2RN8 A; 2YUQ A; 2DBM A; 1GCP A; 1RLQ C; 1JXO A; 2EQI A; 2DL7 A; 2DL4 A; 2EYZ A; 1QWE A; 2XMF A; 2BZY A; 5IHN A; 1VA7 A; 1AWW A; 2VKN A; 1NEG A; 3IQL A; 1B3Q A; 1G83 A; 2RQW A; 4R0K A; 1X2Q A; 1K76 A; 4CC2 A; 2K7A A; 3RBB B; 4J9I A; 1UUE A; 4IIO A; 4EIK A; 4QT7 A; 1N5Z A; 2YUP A; 2FEI A; 2LX7 A; 3M0T A; 3A98 A; 2MOX A; 4F17 A; 1JEG A; 1M27 C; 1I0C A; 4F16 A; 1GCQ C; 1AWO A; 2KYM A; 2DF6 A; 4J9C A; 1KJW A; 3NGP A; 2C0O A; 2LMJ A; 3EG2 A; 1ZUY A; 2EW3 A; 3VS2 A; 4ZNX A; 1X6B A; 2DBK A; 3M0S A; 2DLP A; 1RUW A; 2CUD A; 2KEA A; 2V1R A; 2FG0 A; 1E6G A; 4RTY A; 2JS2 A; 1WX6 A; 4LUD A; 1CKA A; 2M51 A; 1YP5 A; 4RTX A; 2D0N A; 4AG2 C; 2F2X A; 1BBZ A; 2YUN A; 1YN8 A; 2LQW A; 4AFZ C; 2B86 A; 1VYU A; 2LJ0 A; 3EG1 A; 1UHC A; 4Y92 A; 4JZ4 A; 1AVZ C; 2VVK A; 2PTK A; 2J7I A; 2CT3 A; 1SHG A; 3VS5 A; 1GRI A; 3R6N A; 2AKL A; 3UF4 A; 4D8D A; 4RUG A; 1AD5 A; 2F2W A; 3UA6 A; 2A08 A; 2LQN A; 2PNI A; 2KXD A; 4JJD A; 1H3H A; 1WA7 A; 1JO8 A; 5GJV B; 1E6H A; 1OV3 A; 1K9A A; 1Y57 A; 2X3W D; 2GQI A; 3REB B; 2DX1 A; 1M8M A; 3M0Q A; 1WDX A; 5IHK A; 2A28 A; 1IO6 A; 1NYF A; 2DE0 X; 2VWF A; 2CUB A; 4J9D A; 2RPN A; 2IIM A; 4GLM A; 1UEC A; 3C0C A; 1Y0M A; 2J6F A; 3VS7 A; 4AFU C; 1WFW A; 5I11 A; 3JV3 A; 4KRT A; 2AKK A; 2HEQ A; 4J9F A; 1UG1 A; 1WXT A; 2KT8 A; 2K79 A; 2CT4 A; 2OAW A; 1T0H A; 1VYV A; 2OJ2 A; 2EYY A; 2O31 A; 2K6D A; 3I5S A; 3VS4 A; 5GJW B; 2DIL A; 2RMO A; 1QCF A; 2FPF A; 1CSK A; 3M0U A; 2JM9 A; 5FW9 A; 4RTZ A; 2JMC A; 3EHQ A; 2CH4 A; 2EKH A; 2CSQ A; 3KFV A; 1QWF A; 3NMZ C; 1WXU A; 3ZL7 C; 2SRC A; 1NG2 A; 3ULR B; 3O5Z A; 1AEY A; 3H41 A; 1ABO A; 2HCK A; 4RTW A; 4OMQ A; 1FMK A; 3I35 A; 2ED0 A; 2YUO A; 1NLO C; 2RQV A; 5ECA A; 2KBT A; 1V1C A; 2BTT A; 4F14 A; 3I9Q A; 1YNZ A; 1T3S A; 2H8H A; 2DL8 A; 4DEY A; 3EHR A; 5HCK A; 3UAT A; 2EBP A; 1ZLM A; 1M3B A; 2RNA A; 1JU5 C; 2M0Y A; 1M3C A; 1GFC A; 4AG1 C; 3CQT A; 1HJD A; 1OPL A; 1AWJ A; 2LJ3 A; 1ARK A; 2J05 A; 2A36 A; 1RI9 A; 2J6K A; 4GBQ A; 4FSS A; 2EGE A; 1KIK A; 4AFS C; 2JM8 A; 4E6R A; 1RLP C; 1AZE A; 1OPK A; 2GNC A; 2W0Z A; 1YWP A; 4JZ3 A; 1ABQ A; 2X3X D; 4A63 B; 2DL5 A; 2ECZ A; 1MUZ A; 1X27 A; 1K0S A; 2O2O A; 4OML A; 2O9S A; 1PNJ A; 2GBQ A; 2ABL A; 1H8K A; 3VS1 A; 2KRS A; 2A37 A; 1BU1 A; 1TG0 A; 3EGU A; 4HXJ A; 4LN2 A; 2EPD A; 2KGT A; 2JW4 A; 2KT1 A; 4M4Z A; 1ZUU A; 4RTT A; 1A0N B; 1GCQ A; 2I0N A; 2K3B A; 2SEM A; 2L3Q A; 4WCI A; 2AK5 A; 2L2P A; 2EVR A; 1WLP B; 1KFZ A; 4OMO A; 2YSQ A; 2ED1 A; 4OMM A; 4Z8A A; 2K2M A; 5EC7 A; 5IXF A; 4J9H A; 2C0T A; 3VS0 A; 3NPF A; 4AFQ C; 1K0X A; 2LJ1 A; 2KE9 A; 1S1N A; 1OOT A; 2J6O A; 2GGR A; 2ROL A; 1UTI A; 2EGC A; 2RF0 A; 1UGV A; 3H0I A; 3THK A; 5FWB A; 2J06 A; 3TSZ A; 2C0I A; 1W6X A; 1TUD A; 2AZV A; 1OEB A; 2AZS A; 1UE9 A; 2FPE A; 3SEM A; 4Z89 A; 1QKW A; 1SHF A; 4J9B A; 4X1V A; 2KXC A; 2O88 A; 1W70 A; 3VS3 A; 1NYG A; 1ZSG A; 1VYT A; 4OMN A; 5IXB A; 4HVU A; 2CSI A; 2KRN A; 2RQU A; 1U06 A; 1QKX A; 4LUE A; 2GTO A; 1K4U S; 3VRY A; 2D8H A; 3I5R A; 1BB9 A; 2LNH B; 2DL3 A; 3EG3 A; 4JJC A; 1K1Z A; 2L3P A; 5IHI A; 1GBQ A; 1ZUK A; 1J3T A; 3LH5 A; 3EG0 A; 2L3S A; 2K9G A; 1UDL A; 5L23 A; 2NWM A; 1WXB A; 1G2B A; 2BZ8 A; 2ENM A; 1W1F A; 2DA9 A; 2O9V A; 3SHW A; 2P4R A; 2HBW A; 3TSW A; 1UFF A; 1WIE A; 2KYB A; 3U23 A; 4HVW A; 1T0J A; 2JS0 A; 2GTJ A; 2MIO A; 2DNU A; 1GBR A; 1B07 A; 1PKT A; 1TUC A; 1M30 A; 5FWC A; 1KSW A; 1SRM A; 4ORZ A; 1NM7 A; 1AZG B; 4J9E A; 1SPK A; 1PRL C; 1YCS B; 2D1X A; 2DM1 A; 2L0A A; 1X69 A; 4D8K A; 2KNB B; 3M0R A; 4LE9 A; 1NEB A; 2BZX A; 3VS6 A; 5I22 A; 1EFN A; 1I1J A; 1T3L A; 1AWX A; 2ESW A; 1PRM C; 1E7O A; 2YDL A; 1HD3 A; 2CRE A; 4IIM A; 1ZBJ A; 1UJ0 A; 1Z9Q A; 1I07 A; 2FO0 A; 1X2K A; 5IH2 A; 1U5S A; 1GFD A; 2LCS A; 1UHF A; 1X6G A; 2E5K A; 2QDL A; 1YWO A; 2CH4 W; 3VRZ A; 4CC4 B; 1M3A A; 1HSQ A; 2DMO A; 4J9G A; 2W10 A; 2LP5 A; 2V1Q A; 4DEX A; 2JT4 A; 4RTV A; 1BK2 A; 2JTE A; 3H0F A; 2NUZ A; 2RQR A; 3REA B; 1SRL A; 1MV0 B; 1WYX A; 1X43 A; 1AOJ A; 1JXM A; 4JPB W; 2FRY A; 1QLY A; 1ZX6 A; 3NHN A; 4HVV A; 2ROT A; 3TVT A; 1PHT A; 3PE0 A; 2DRM A; 2LZ6 B; 2HSP A; 3H0H A; 4LNP A; 2KRO A; 2PZ1 A; 4HCK A; 3QWX X; 1MV3 A; 3PVL A; 1PKS A; 3GBQ A; 1CKB A; 2F2V A; 1FYN A; 4OMP A; 4Z88 A; 2CDT A; 2FPD A; 3M0P A; 1SSH A; 4RTU A; 2G6F X; 4K11 A; 1Z9Z A; 2EYX A; 2HDA A; 1H92 A; 1SEM A; 3RNJ A; 2D8J A; 3FJ5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4JJB A; 2P84 A; 4MZT A; 2EJG A; 2ZZD A; 1HXD A; 1NLP C; 3UT1 A; 1YI2 A; 2QQ9 A; 2X4X A; 1OZ2 A; 4ESR A; 5HK3 A; 2YT6 A; 4FU6 A; 1VUB A; 2B8A A; 2NUT B; 2MWO A; 3BFM A; 3PTA A; 2R57 A; 3JB9 F; 1W2B S; 1EX4 A; 2VXE A; 4LDV A; 3MPU B; 1K73 R; 1VQN T; 4QQD A; 3UA7 A; 4BI3 A; 2JVV A; 2EYZ A; 1NEG A; 3IQL A; 2LCC A; 4R0K A; 3CXC S; 2DAQ A; 4CC2 A; 1VQ5 T; 1VIE A; 3G71 Q; 4F7U F; 3JCM J; 1UUE A; 3CCE Q; 2M0O A; 4IIO A; 3A5Z B; 1VQ8 T; 3RIR A; 3A98 A; 5GAN h; 5GAM j; 1VQ4 Q; 3JB9 G; 3VKI A; 2DD4 A; 3MHX A; 2F69 A; 1M90 C; 3TU4 K; 2DK3 A; 1W2B P; 4A54 A; 2M02 A; 1RAA B; 1ZSZ B; 2P0P A; 2DLP A; 1BCM A; 2QQS A; 2KEA A; 4RTY A; 2JS2 A; 4RTX A; 2QTV A; 2F2X A; 2O4X B; 1BI0 A; 2EJF A; 1YN8 A; 4GLK A; 3CCU Q; 4ZTF A; 2LJ0 A; 2LC4 A; 1UGS B; 4M7A D; 2V8K A; 1IHW A; 4JZ4 A; 1AVZ C; 2PTK A; 3QBY A; 3CXC P; 2J7I A; 4JJN K; 2CT3 A; 2M9U A; 3VS5 A; 3CC2 Q; 5KYU A; 5HY6 A; 2YXY A; 2F2W A; 3QHS A; 1H64 1; 4JRP A; 4MDW A; 3CCV A; 1VQO Q; 2G3R A; 2IPO B; 1M8M A; 1WDX A; 3V7S A; 3GNG A; 2DIG A; 1IO6 A; 2E70 A; 1M1K U; 4AMC A; 2QTX A; 2DE0 X; 1YI2 Q; 4J9D A; 4ZGJ B; 2RHY A; 1X6O A; 1UEC A; 4FT2 A; 2J6F A; 3VS7 A; 4AFU C; 3PMI A; 4XU2 A; 2MI6 A; 3E19 A; 2AKK A; 2E12 A; 2HEQ A; 1YFN A; 2K5I A; 2E41 A; 4LDW A; 2OAW A; 4OF1 A; 2QA4 A; 1V76 A; 2OJ2 A; 2EYY A; 2O31 A; 2K6D A; 2DIL A; 4KGX B; 2RMO A; 1QCF A; 2RHI A; 3M0U A; 5FW9 A; 1IRE B; 5C0M A; 3EHQ A; 4PFO A; 1IHV A; 3LWH A; 3G71 T; 2EKH A; 2CP3 A; 1K9M C; 4X9C A; 2CSQ A; 1NJI U; 3CCE T; 4DBQ A; 4LD9 K; 5LJ3 f; 5D6W A; 3E1S A; 1S72 T; 4JS5 A; 2E6Z A; 3O5Z A; 1AEY A; 3L2Q A; 4FYY B; 5LJ3 e; 2HCK A; 2K3X A; 4OMQ A; 4M78 D; 1FMK A; 2YUO A; 2BE7 D; 1Q82 R; 2RQV A; 5CO7 A; 3X25 B; 5IAY A; 2DYI A; 2KBT A; 4PL6 A; 4WTO B; 1V1C A; 3OS0 A; 2X51 A; 1TUG B; 3HHT B; 4JRI A; 4J6X A; 1G8X A; 3WVE B; 3EAE A; 2OTL A; 1R77 A; 3OYI A; 2E1H A; 2R5M A; 5KYW B; 3M4G A; 2H8H A; 4DEY A; 5HCK A; 2YRD A; 3CCU T; 2M0Y A; 4AG1 C; 3OSV A; 3CQT A; 2JTF A; 1HJD A; 1AWJ A; 1ACM B; 3EFS A; 2J05 A; 4BI8 B; 3OY9 A; 2DPP B; 4OP0 A; 2MF2 A; 4C92 F; 1NBE B; 3CC2 T; 4N0A C; 4FSS A; 1Y7X A; 5C6S A; 3V8K A; 1Q7Y C; 1VQO T; 1NZ9 A; 1FXX A; 2E64 A; 4A63 B; 2DL5 A; 2E5Q A; 3EG9 A; 3GNF B; 1UGP B; 4C8Q F; 2GFA A; 5GAN 3; 5IN1 A; 3OSS C; 3CCV Q; 3CPF A; 4OML A; 2PQW A; 2L3R A; 1H8K A; 4PJO A; 3EGU A; 3OYH A; 1X01 A; 2RJE A; 4LN2 A; 3OYM A; 4M4Z A; 1YIJ T; 1D09 B; 1OU9 A; 2FHD A; 4BE1 A; 4II1 A; 4N0A A; 1WLP B; 4C92 G; 1KFZ A; 3OYK A; 2LQ8 A; 2YSQ A; 4M75 D; 1R0C B; 1BIA A; 5A2Q E; 3PIO A; 4J9H A; 2C0T A; 3VS0 A; 4PJO E; 2LJ1 A; 2QAS A; 1S1N A; 2M16 A; 2LNV A; 2FZG B; 3MP1 A; 3FLG A; 5FU7 B; 3OYG A; 2RF0 A; 1BCO A; 1KK7 A; 5GAN d; 3TSZ A; 2C0I A; 2L8D A; 5KYY B; 3H6Z A; 3I55 T; 1W6X A; 4XTW A; 1TUD A; 4F7U E; 2A7Y A; 3RES A; 2A3L A; 3M59 A; 4Z89 A; 4XTV A; 1Q86 U; 4M77 B; 4BDZ A; 3JB9 J; 4X1V A; 4A4E A; 3GIB A; 2OTJ T; 3M57 A; 1NYG A; 4RG8 A; 5A0D A; 8AT1 B; 4HVU A; 2OTL Q; 2RQU A; 1U06 A; 4PNO A; 2Z0W A; 1AT1 B; 3CCS Q; 1IGU A; 2LNH B; 5DLQ E; 5IHI A; 1K1Z A; 1D0X A; 1ZUK A; 1J3T A; 1M9S A; 3FJP A; 3LH5 A; 1SF9 A; 3EG0 A; 2K9G A; 3GP8 A; 1N6A A; 3EGD A; 1YJW A; 1I8F A; 1KC8 C; 3CCV T; 2ENM A; 2JTM A; 3C95 A; 4M7A A; 3SHW A; 1N8R U; 2FZC B; 1C0M A; 1WIE A; 1Q81 C; 2KYB A; 3FEO A; 3LGF A; 5GAN 2; 1MGQ A; 5J26 A; 3UWN A; 4ZN1 A; 3LX7 A; 2DNU A; 5GAM h; 2V8J A; 2XDP A; 1Q7Y R; 1PKT A; 5LJ5 h; 3CCL Q; 1MMG A; 1M1G A; 4QQG A; 4LE9 A; 4M7A E; 4M78 C; 4V2S A; 5I22 A; 3VU3 C; 3L2V A; 1EFN A; 3RKW A; 3JB9 H; 3RER A; 3S3N A; 1B7T A; 1Z9Q A; 1TXQ A; 3J7A F; 3MO8 A; 4C0F A; 4CRI A; 3A8O B; 2EJ9 A; 4C8Q C; 1D0Z A; 3URG A; 4M7D F; 1X6G A; 2E5K A; 3D7S B; 2WSC E; 2CH4 W; 1JJ2 A; 3OYD A; 2JT4 A; 4PK4 A; 1D1B A; 3MKD A; 1VQM A; 2JTE A; 2OTL T; 2NUZ A; 1WZO A; 3SWN C; 2CZ1 B; 4UC4 A; 3E9F A; 1SRL A; 4R56 A; 3CCM Q; 3P8H A; 1B34 A; 3OBY A; 1AOJ A; 1YJ9 A; 2QEX Q; 3CCS T; 1QLY A; 1ZX6 A; 4M78 A; 2X9H A; 1KQS S; 4HVV A; 1PD0 A; 1PHT A; 2LZ6 B; 2EQK A; 3H0H A; 4VUB A; 4XU1 A; 5GMK j; 3HFN A; 1MND A; 2FPD A; 3M0P A; 2YLB A; 1SSH A; 2VV5 A; 4K11 A; 4M78 E; 4J6Y A; 4M77 A; 4CI0 C; 3UDC A; 4E2F B; 3RNJ A; 4RTV A; 3I9Q A; 2EGA A; 4JLI A; 1U3O A; 3RR6 A; 1WPY A; 1IB8 A; 2OI3 A; 2QXF A; 3NFC A; 4A53 A; 2JMA A; 2RQT A; 3M9Q A; 1VQ6 T; 4M75 C; 2MCN A; 1PWT A; 1XOV A; 2RO0 A; 1LCK A; 3CCL T; 4ATO A; 5GAO m; 4BAC A; 2LX9 A; 2EYW A; 2DRK A; 3CD6 T; 1WI7 A; 2DVJ A; 2XU8 A; 2DYB A; 4AT1 B; 4KUL A; 3KBG A; 1KC8 R; 1KQS P; 3OBW A; 2KR3 A; 2LDM A; 2RN8 A; 2YUQ A; 1GCP A; 3N5B B; 1WJQ A; 2DXU A; 2EQI A; 4PFP A; 3CMA Q; 2YWW A; 2FL7 A; 3BDU A; 1Q81 R; 1QWE A; 3ER0 A; 1WNL A; 2DKG A; 1G3Y A; 1U1T A; 2X4W A; 1AWW A; 3WVD B; 4XU0 A; 4N4I A; 5GAO p; 1X2Q A; 1K76 A; 3CC7 T; 3RBB B; 4M75 A; 1KG1 A; 4J9I A; 2VGN A; 3CC4 A; 4C5H A; 2RI2 A; 5CVI A; 4JRQ A; 3VJP A; 3CCR A; 1JEG A; 1M27 C; 1OX9 A; 4F16 A; 1WJS A; 2D0Q B; 1AWO A; 2KYM A; 3CCM T; 4J9C A; 2QEX T; 2HZY A; 2LMJ A; 3EG2 A; 2EW3 A; 3FDR A; 2R5A A; 3M0S A; 3JCM d; 4M75 E; 2LVM A; 2E3I A; 4KH0 B; 4BY6 C; 5KYN A; 4LUD A; 1CKA A; 1M2O A; 4HKE A; 2YUN A; 4AFZ C; 4XQ3 A; 5FLX E; 4IUP A; 1VYU A; 2IG0 A; 1BI3 A; 5KYU B; 1PM3 A; 2VVK A; 4M7D C; 1MMN A; 1PSF A; 4B9W A; 4D8D A; 3UA6 A; 2A08 A; 3CME T; 2LQN A; 1K8A R; 3LYI A; 5GJV B; 3LWI A; 1E6H A; 1OV3 A; 1Y57 A; 3DB4 A; 2GQI A; 3GF5 A; 3JB9 D; 2K57 A; 5GAM d; 2VXF A; 5LJ5 d; 4GLM A; 1N27 A; 1WFW A; 5I11 A; 3JV3 A; 3CMA T; 1K73 U; 1VQL T; 2RHU A; 3CPW A; 1UG1 A; 2JN0 A; 3MEA A; 1RAC B; 1T0H A; 4Q5W A; 3OYY A; 1YIT T; 2F5K A; 2HNI A; 2E65 A; 1KHI A; 1CSK A; 1HK9 A; 3HRT A; 1LOJ A; 5GAN g; 4C0G A; 3KFV A; 4EDU A; 3QO3 A; 2XI9 A; 1GXI E; 1TOV A; 3ZL7 C; 1SKU B; 1NG2 A; 2XKO C; 3JB9 I; 2KAF A; 3ULR B; 3L2U A; 5I2S A; 3CCJ T; 2Y4Y A; 2ED0 A; 1G5V A; 3CC4 Q; 5ECA A; 3QPH A; 5J3B A; 1Q82 C; 2EKO A; 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