The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
STLFEALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEVRSLTTGETGYIPSPYLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Fyn
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| publication title |
Structure of an intermediate state in protein folding and aggregation.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
14
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2010-08-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1OEB A; 3VRZ A; 2O88 A; 1JEG A; 2L2P A; 1WIE A; 2NUZ A; 2EGE A; 1TG0 A; 3EG3 A; 1I1J A; 1RLQ C; 2KRN A; 2EVR A; 1WA7 A; 1Y57 A; 2MCN A; 1JQQ A; 2SEM A; 2GQI A; 1ABO A; 4Z8A A; 1NM7 A; 2A37 A; 1X27 A; 2RN8 A; 3TVT A; 1XOV A; 1X6B A; 4RTY A; 2EYX A; 3U23 A; 2CSI A; 1QKW A; 2F2W A; 2LJ1 A; 3VS0 A; 4IIM A; 2ECZ A; 1NLO C; 1E6H A; 3VS4 A; 3KFV A; 4IIO A; 4RTT A; 3ZL7 C; 1T3L A; 3IQL A; 3NGP A; 1AWJ A; 2M51 A; 2W0Z A; 1X43 A; 1H8K A; 2A36 A; 1SSH A; 2FRY A; 2CT4 A; 2LQN A; 1RUW A; 2P4R A; 2EKH A; 1YN8 A; 3PVL A; 1QKX A; 4RTX A; 2D0N A; 2HCK A; 2LP5 A; 4X1V A; 2OJ2 A; 2YUP A; 3EGU A; 1KSW A; 1I0C A; 2KYB A; 2AKK A; 3REB B; 2LJ3 A; 1RLP C; 2YSQ A; 4AFU C; 2ROT A; 2DVJ A; 4AFQ C; 1B07 A; 2A08 A; 4F17 A; 3VS7 A; 1FYN A; 1YCS B; 1VYT A; 2LZ6 B; 2CDT A; 2D1X A; 2RQT A; 2GTJ A; 2YDL A; 2YUN A; 1CKB A; 1SPK A; 2KT8 A; 1TUC A; 1AEY A; 1Y0M A; 1PRL C; 2JW4 A; 3EG0 A; 3PE0 A; 1YWP A; 4J9G A; 2JS2 A; 2GTO A; 2EGC A; 1SHG A; 1M27 C; 2J6O A; 2DF6 A; 4J9E A; 1JU5 C; 1GCQ A; 2DJQ A; 2KT1 A; 2CT3 A; 1H92 A; 3EHR A; 3ULR B; 1AWW A; 1GFC A; 4ORZ A; 1K0X A; 5EC7 A; 3H0I A; 4D8K A; 5IHK A; 1PHT A; 2JM8 A; 2ED1 A; 2EYW A; 2ENM A; 4DEX A; 1M8M A; 1M3C A; 3QWX X; 4RTV A; 3PVQ A; 2C0T A; 2DMO A; 2DL7 A; 2KRO A; 3CQT A; 5HCK A; 1WXT A; 4ESR A; 3M0T A; 4JZ4 A; 3EG1 A; 2DNU A; 4R0K A; 5GJV B; 3TSZ A; 4CC2 A; 1M30 A; 2V1R A; 1CKA A; 2DBM A; 4Y92 A; 4AG1 C; 2EW3 A; 1W6X A; 4AFZ C; 2DM1 A; 4LN2 A; 2EGA A; 2ED0 A; 1AZE A; 1PKT A; 1GCQ C; 5IXB A; 4F16 A; 1AOJ A; 2H8H A; 2J6K A; 3C0C A; 2DBK A; 2CUD A; 2JM9 A; 3VS5 A; 2X3W D; 1PRM C; 1JXO A; 1SHF A; 3H0H A; 4J9I A; 1NEB A; 1QLY A; 1VYU A; 2CH4 W; 2LCS A; 1WX6 A; 5FW9 A; 1S1N A; 1SRM A; 1WLP B; 4HVV A; 4LUE A; 2RNA A; 2FRW A; 1GBR A; 2KE9 A; 2BZ8 A; 1UG1 A; 4J9B A; 2E5K A; 2VKN A; 5IHN A; 2ROL A; 4OMM A; 2D8H A; 4RTW A; 3M0U A; 4AG2 C; 3TSW A; 4RTZ A; 4JJB A; 2X3X D; 1MV0 B; 2KXC A; 2RQU A; 1JXM A; 5ECA A; 1VA7 A; 2XMF A; 1V1C A; 3R6N A; 3A98 A; 2DA9 A; 1SRL A; 1ZBJ A; 1M3B A; 2DX1 A; 2L3Q A; 3UF4 A; 4EIK A; 1BBZ A; 2LJ0 A; 1ZX6 A; 2BZY A; 4LUD A; 2O9S A; 4JZ3 A; 1X2K A; 1H3H A; 2LX7 A; 2OAW A; 1GCP A; 2V1Q A; 3RNJ A; 5L23 A; 4E6R A; 4GBQ A; 4J9H A; 2YUO A; 1B3Q A; 1HSQ A; 1NG2 A; 4OMP A; 1GBQ A; 2K3B A; 3UA7 A; 4CC7 A; 1YNZ A; 3SEM A; 3QWY A; 3I5S A; 1UGV A; 1NYF A; 2CH4 A; 1T3S A; 2KXD A; 1FMK A; 1UE9 A; 3REA B; 1G2B A; 2C0I A; 4JJD A; 3M0P A; 4JJC A; 4M4Z A; 1OOT A; 3SHW A; 1G83 A; 2DYB A; 2YUQ A; 2NWM A; 3EG2 A; 2DRM A; 1ZUK A; 2RQV A; 1NYG A; 1Z9Q A; 2VWF A; 2K2M A; 2HSP A; 1BB9 A; 1HD3 A; 5FWB A; 1U06 A; 2L3P A; 2RMO A; 2J06 A; 2O2O A; 1K0S A; 2DL4 A; 2KR3 A; 1J3T A; 3THK A; 2M0Y A; 2K6D A; 4HCK A; 4JPB W; 1HJD A; 1NLP C; 2L3S A; 1X69 A; 4WCI A; 1GRI A; 1WXU A; 1YP5 A; 1E6G A; 1U3O A; 2K9G A; 5I11 A; 1AWO A; 1AWX A; 1YWO A; 1GFD A; 4A63 B; 1UUE A; 2KRS A; 1UHF A; 1UFF A; 2DRK A; 2O9V A; 4OMO A; 1X6G A; 2JMA A; 3I35 A; 2RQW A; 1WXB A; 1JO8 A; 2IIM A; 4RTU A; 1AD5 A; 4LNP A; 2KEA A; 1T0J A; 2VVK A; 4J9D A; 2DLP A; 1KIK A; 1KJW A; 2OI3 A; 2AKL A; 2O31 A; 2BTT A; 2PNI A; 2KRM A; 2D8J A; 1BK2 A; 1ABQ A; 3O5Z A; 1K4U S; 2KGT A; 2RF0 A; 1Z9Z A; 2HEQ A; 2K7A A; 3VRY A; 1NEG A; 2HBW A; 1UDL A; 2L0A A; 1U5S A; 3RBB B; 5I22 A; 2RPN A; 4RUG A; 2A28 A; 1AVZ C; 3GBQ A; 2GNC A; 4KRT A; 4GLM A; 1PKS A; 1OV3 A; 1WI7 A; 2EYZ A; 2JT4 A; 2CSQ A; 2AZV A; 2PTK A; 1K9A A; 3H0F A; 4Z89 A; 4DEY A; 4OML A; 2LNH B; 2FG0 A; 3VS2 A; 4HVW A; 2DL3 A; 3UA6 A; 1UJ0 A; 3LH5 A; 3M0R A; 4HVU A; 3H41 A; 4F14 A; 3VS3 A; 1K76 A; 2YT6 A; 4FSS A; 2JXB A; 5IH2 A; 4OMN A; 3JV3 A; 1UTI A; 2JS0 A; 2KNB B; 3M0Q A; 4AFS C; 4ZNX A; 2FEI A; 2CRE A; 2DL5 A; 4J9F A; 5GJW B; 1VYV A; 4CC3 A; 1E7O A; 2I0N A; 2HDA A; 4D8D A; 1OPK A; 1WYX A; 1UJY A; 1CSK A; 1AZG B; 1W1F A; 2J7I A; 3VS1 A; 5FWC A; 4OMQ A; 1PNJ A; 2G6F X; 4CC4 B; 1T0H A; 1UEC A; 2F2V A; 2MOX A; 1ZUU A; 3I5R A; 1IO6 A; 2LQW A; 2GGR A; 1I07 A; 1KFZ A; 2SRC A; 3EHQ A; 2ESW A; 2PZ1 A; 2F2X A; 2ABL A; 1TUD A; 2W10 A; 4LE9 A; 2KYM A; 5IXF A; 1M3A A; 1QWF A; 2J6F A; 1UHC A; 2JMC A; 1N5Z A; 1X2Q A; 3NPF A; 1ZUY A; 3NMZ C; 1RI9 A; 1WDX A; 1LCK A; 1SEM A; 1EFN A; 1ZLM A; 2EYY A; 2DE0 X; 2GBQ A; 1GL5 A; 3UAT A; 2EQI A; 1QCF A; 2DL8 A; 3FJ5 A; 2EPD A; 1MV3 A; 2QDL A; 1ZSG A; 3NHN A; 2BZX A; 3I9Q A; 2J05 A; 2FO0 A; 2JTE A; 5IHI A; 2KBT A; 4J9C A; 2FPF A; 1W70 A; 1QWE A; 2MIO A; 1MUZ A; 4Z88 A; 2LMJ A; 2C0O A; 2K79 A; 4K11 A; 2CUB A; 2FPD A; 2DIL A; 2EBP A; 1BU1 A; 2B86 A; 3M0S A; 1WFW A; 2AK5 A; 1OPL A; 1ARK A; 1PWT A; 4HXJ A; 3VS6 A; 2FPE A; 2AZS A; 1K1Z A; 4QT7 A; 2RQR A; 1A0N B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2JTM A; 4N0A C; 3VRZ A; 2HZY A; 2E3I A; 2KI7 A; 5J39 A; 4RCC A; 3OQ5 A; 3EG3 A; 1VQO Q; 1VQ8 Q; 5HY6 A; 2EVR A; 5CCA A; 2MCN A; 4M77 D; 2SEM A; 1ABO A; 2PVD B; 1NM7 A; 4IUV A; 2LX9 A; 3CC2 Q; 3TVT A; 1WJR A; 2CSI A; 4RKU E; 3S6W A; 3VS0 A; 1HXD A; 3G4S T; 1X6O A; 1C6V X; 3R6O A; 4A4G A; 1VQ9 A; 3DLL A; 3JAM E; 1WJS A; 4RTT A; 1D0Z A; 1M5Q 1; 3VV0 A; 5D6W A; 3OS1 A; 2QDY B; 5CVI A; 5KYX B; 3NGP A; 1AWJ A; 5LJ5 j; 4LDU A; 2QQS A; 4QVC A; 1H8K A; 1SSH A; 2FRY A; 2OAU A; 2RD1 A; 1RUW A; 1UGS B; 3PVL A; 4PJO F; 4C5I A; 2QK0 A; 4E7J A; 2E3H A; 1VQO A; 1YIJ Q; 2HQE A; 1KSW A; 1LNX A; 5CQX A; 4M78 B; 2LJ3 A; 3HRS A; 2YSQ A; 5KE3 A; 5GAN 3; 3CC2 A; 4AFQ C; 3VUZ A; 2RK1 A; 4R55 A; 4E2F B; 4ZN3 A; 1N6A A; 2P0Q A; 2BIV A; 2D1X A; 2OX7 A; 2K3Y A; 3M57 A; 3QHS A; 3EFR A; 1OU9 A; 4LD6 A; 5GAM e; 1N9S A; 2PUO B; 1SPK A; 2O01 E; 3JB9 G; 1YJW Q; 5DM7 R; 1YI2 Q; 1B34 B; 1D0X A; 2CP7 A; 1ZHI A; 2COZ A; 2QA4 A; 3M58 A; 3PE0 A; 1MMG A; 3GLX A; 4PFP A; 1VQ5 T; 4A54 A; 2DJQ A; 2CT3 A; 4HA8 A; 4II1 A; 4PJJ A; 2YLC A; 2H3J A; 4N4H A; 1YIJ A; 3PIP A; 1M3C A; 3QWX X; 5LJ3 f; 3PVQ A; 5GMK l; 2DMO A; 2RHX A; 4PL6 A; 2KRO A; 1WXT A; 1JRI A; 5GAN j; 4XQ3 A; 3WVD B; 1PD0 A; 5LJ5 d; 4A4E A; 1Q82 U; 1CKA A; 4Y92 A; 2EW3 A; 1TU0 B; 1W6X A; 2DM1 A; 5GAN 4; 1YJW A; 1N27 A; 2CZ1 B; 1PKT A; 4B9X A; 4QQG A; 3I56 T; 2XID A; 3NTH A; 1AOJ A; 2KY9 A; 3M53 A; 2DBK A; 3JCM f; 1VQN T; 3VS5 A; 2X3W D; 3G4S Q; 4J9I A; 1NEB A; 3ASK A; 3AT1 B; 2LCS A; 1WX6 A; 1OZ2 A; 2F5T X; 1VOM A; 4C92 A; 2P0P A; 4M7D A; 1U1S A; 2FRW A; 5HKC A; 2PVO B; 3RKY A; 2DTO A; 3OBW A; 4J9B A; 4XTZ A; 2M0O A; 5A0G A; 5IHN A; 4A4K A; 1VQ7 T; 4M77 F; 4AG2 C; 3TSW A; 2RI3 A; 5C0M A; 2OTL T; 2XMF A; 1V1C A; 2DA9 A; 4ELY C; 3LWI A; 2CGH A; 2E6N A; 4MZM A; 4PJO B; 2LJ0 A; 4BE0 A; 1ZX6 A; 3M4Y A; 5D7U A; 3OW2 S; 3CCR T; 2DD4 A; 4C92 C; 4PNO A; 4M7D C; 2A0F B; 2E65 A; 2V1Q A; 2O4X B; 2YUO A; 5A0L A; 1HSQ A; 4Y91 A; 1NG2 A; 4JS5 A; 4OMP A; 2XU8 A; 4CC7 A; 1M8V A; 4BY6 B; 2YRC A; 2FHD A; 1ZA1 B; 2CH4 A; 2FYK A; 5GAN d; 4L5G A; 1T3S A; 3RUX A; 5LJ5 e; 5KYU B; 1PCX A; 2KMT A; 1M1F A; 1VQ5 Q; 1KQS A; 4JJD A; 4KH1 B; 4M4Z A; 2D9T A; 2RB6 A; 2NWM A; 2HQH A; 3EH2 A; 3A8H B; 4F7U F; 1IB8 A; 5D6X A; 4QKU A; 2EYQ A; 1KQ2 A; 2L8D A; 4MZP A; 2K2M A; 2L3P A; 2HKQ B; 3THK A; 4RCB A; 3JCM J; 2M0Y A; 2D0Q B; 3J81 E; 5GAO p; 5M9O A; 4JPB W; 5KYN A; 2L3S A; 4WCI A; 1BCO A; 2R5M A; 4IUR A; 1VQL T; 1WXU A; 1YP5 A; 1R0B G; 1E6G A; 3QSU A; 3OS2 A; 3MP1 A; 1OX9 A; 1Y96 B; 4M78 G; 2LC4 A; 4X9C A; 4E7S A; 5FRN A; 1AWO A; 3GPL A; 3M5A A; 4B6M A; 5GAO l; 1N8R C; 1UHF A; 1B34 A; 1VQN Q; 1WQ7 A; 2DO3 A; 1SKU B; 2DRK A; 2O9V A; 4OMO A; 1FXX A; 4MZT A; 3L2V A; 1RAB B; 4BI8 B; 3LLR A; 1UGQ B; 2VVK A; 4EMK B; 2CP5 A; 2DLP A; 1KIK A; 2OI3 A; 2LTO A; 2MMP A; 1M90 U; 3PNW C; 4BUG A; 1OUL A; 3ZBD A; 2D8J A; 2FZG B; 1VQ7 Q; 3JB9 H; 4Q5W A; 4C92 E; 5KYW A; 3CPW A; 1YHQ A; 1IHV A; 2K5F A; 3OYL A; 1IRX A; 4IUP A; 3BE3 A; 2P0K A; 2HEQ A; 1KD1 U; 2OTL Q; 2K7A A; 2CZ6 B; 5GMK i; 1TOV A; 1UDL A; 3RBB B; 2DAQ A; 4RUG A; 3GBQ A; 4KRT A; 3CPF A; 1Y07 A; 1LOJ A; 3QZ9 B; 1PKS A; 3G6E T; 1WPY A; 2FZC B; 4FW2 A; 1FX7 A; 2EAY A; 2EYZ A; 3V7S A; 2JT4 A; 4DBF A; 3CCR Q; 2PTK A; 4Z89 A; 3H0F A; 1D1B A; 1PG5 B; 5KYY A; 3OYG A; 3QYH B; 1YJN Q; 2QAZ A; 3C12 A; 4FT2 A; 1UJ0 A; 3LH5 A; 2JUF A; 4IUT A; 1MMD A; 3H41 A; 1BIA A; 1IGU A; 5GAM g; 3X20 B; 2YT6 A; 4FSS A; 1VQ7 A; 2NUT B; 2JXB A; 2X35 A; 2IG0 A; 3TCJ A; 1G3S A; 4MMK A; 3QUI A; 2K4Y A; 4F04 B; 2P4T A; 3GNG A; 2HQX A; 5CQY A; 1TWB A; 4J9F A; 3CD6 T; 4J7I A; 1V29 B; 1VYV A; 3JB9 F; 3A8O B; 3JCM W; 4D8D A; 3CCR A; 4JRP A; 1OPK A; 3E19 A; 1WYX A; 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3CD6 Q; 2YRD A; 2F2W A; 3TEE A; 3GP8 A; 1E6H A; 4C8Q D; 2XDB A; 3VS4 A; 3KFV A; 3HKS A; 4IIO A; 1VQO T; 1M90 R; 2DEQ A; 5GMK h; 4FIB A; 5CO7 A; 5LJ3 j; 3S3M A; 3BDL A; 2LNV A; 1T3L A; 4PJO E; 3CC2 T; 2DZC A; 3IQL A; 6AT1 B; 3EG9 A; 2RI2 A; 2W0Z A; 2HL5 C; 3CCL Q; 2MI6 A; 1JJ2 P; 2F5K A; 2ZAE A; 2GQV A; 3JCM Q; 2D0N A; 3MO8 A; 3MP8 A; 4M77 C; 4X1V A; 1D09 B; 3CBP A; 2QA4 T; 3FJP A; 1RLP C; 3QXE B; 3J80 E; 2ROT A; 2A08 A; 3OMG A; 4F17 A; 3VS7 A; 2CDT A; 3CXC S; 4F7U A; 3PTA A; 4M78 F; 3A8M B; 1CKB A; 1HYO A; 3URG A; 3HSB A; 2NLU A; 1EIF A; 1V76 A; 1XJW B; 1AEY A; 5FRM A; 1M90 C; 2VC8 A; 5CAI A; 1YWP A; 4GY5 A; 2GTO A; 1IGQ A; 1M27 C; 2KT1 A; 4HKE A; 4PFO A; 3CCL A; 5IT9 E; 1GFC A; 1AHJ B; 2DFU A; 3H0I A; 3EFS A; 3UWN A; 1PHT A; 2LDM A; 1UGP B; 4DEX A; 1K8A R; 1M8M A; 1QP2 A; 2E6Z A; 3CC7 T; 3JCM b; 1QP3 A; 5HCK A; 3M0T A; 2OTJ A; 3RMQ A; 3EG1 A; 1QVG P; 1VQ9 Q; 2DNU A; 4R0K A; 3TSZ A; 1WQW A; 4E47 A; 2HAX A; 3H9N A; 4AFZ C; 4LN2 A; 2EGA A; 2ED0 A; 2DJZ A; 1Q7Y R; 4XTW A; 2X4Y A; 1RL2 A; 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