The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
GSSGSSGNTYVALYKFVPQENEDLEMRPGDIITLLEDSNEDWWKGKIQDRIGFFPANFVQRLSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Protein Stac
|
| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain of Stac protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
7
|
| structure length |
68
|
| sequence length |
68
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DM1 A; 4J9H A; 2DVJ A; 4J9G A; 3M0U A; 4HVV A; 2DIL A; 2ESW A; 3TSW A; 1K9A A; 2AK5 A; 3VS4 A; 2K9G A; 4AG1 C; 1U3O A; 2A36 A; 4CC3 A; 2DA9 A; 1PRM C; 1PKS A; 1WDX A; 3ZL7 C; 1GRI A; 5GJW B; 1K1Z A; 1PKT A; 1SPK A; 1UE9 A; 2MIO A; 2OJ2 A; 2EYY A; 2K79 A; 4ZNX A; 2C0O A; 2LNH B; 4OMN A; 1G2B A; 3RNJ A; 2J6O A; 4AG2 C; 2CRE A; 2KYM A; 4X1V A; 4J9E A; 3R6N A; 1BK2 A; 5FWB A; 2KR3 A; 1NLP C; 4OMQ A; 2F2W A; 2DRM A; 2EVR A; 2YDL A; 4HVU A; 1XOV A; 2GBQ A; 4J9F A; 2K2M A; 1UHC A; 2DJQ A; 2P4R A; 2RNA A; 1UJY A; 2YUP A; 5ECA A; 1U5S A; 2E5K A; 2L2P A; 3JV3 A; 3QWX X; 2DF6 A; 2DLP A; 2ENM A; 2HEQ A; 1PRL C; 4RTX A; 2LP5 A; 2AZV A; 2C0I A; 2BZ8 A; 4QT7 A; 2JMA A; 2VWF A; 4IIM A; 2IIM A; 4J9C A; 2DL7 A; 3SHW A; 1RLP C; 4RTZ A; 1X43 A; 3VS0 A; 5I22 A; 2BTT A; 2L3S A; 1WX6 A; 4LE9 A; 3VS5 A; 3VS7 A; 3EHR A; 2JTE A; 1U06 A; 5IXF A; 1QLY A; 1M3C A; 2C0T A; 3I5R A; 3EG0 A; 2PTK A; 3H0I A; 1ARK A; 1NYF A; 1SRM A; 2KRO A; 1E6G A; 1ZUU A; 2J06 A; 2MCN A; 2EQI A; 2KNB B; 2O9V A; 4F17 A; 3IQL A; 1JO8 A; 1SSH A; 2F2X A; 1GL5 A; 2ED0 A; 2CSI A; 1FMK A; 1JXO A; 2CDT A; 2F2V A; 2RQW A; 4WCI A; 1NLO C; 1YCS B; 4J9I A; 1B3Q A; 3UAT A; 2DL8 A; 2EBP A; 5IHI A; 1KFZ A; 2JM9 A; 2YUQ A; 2QDL A; 2L0A A; 3NPF A; 2J6F A; 2MOX A; 3M0S A; 2FO0 A; 4ORZ A; 3KFV A; 3UA7 A; 4A63 B; 1GCQ C; 1ZLM A; 4JJC A; 1PHT A; 4OMP A; 1UUE A; 2D8J A; 2L3Q A; 2CT4 A; 1TUD A; 1GCQ A; 2LJ0 A; 4F14 A; 1OEB A; 1M8M A; 2JXB A; 2FRY A; 1UFF A; 2EGE A; 3PE0 A; 1WXT A; 1Y0M A; 4JZ3 A; 2CSQ A; 2CH4 A; 1RUW A; 4JJD A; 2H8H A; 4JPB W; 2HSP A; 1GCP A; 1UG1 A; 1VYU A; 1HD3 A; 1ZUY A; 4LNP A; 2O31 A; 1HSQ A; 5HCK A; 2DYB A; 1H3H A; 4RTY A; 3GBQ A; 1X27 A; 1J3T A; 4M4Z A; 1W70 A; 2J7I A; 1X6G A; 2A37 A; 2LZ6 B; 2RN8 A; 1WXU A; 2FRW A; 2EGC A; 2YUN A; 4K11 A; 3VS1 A; 1B07 A; 2KT1 A; 4JJB A; 1T0J A; 3VS3 A; 1SRL A; 1BU1 A; 2KRN A; 4OML A; 3PVL A; 3THK A; 2RPN A; 2D1X A; 1Z9Q A; 1X69 A; 1YWO A; 2RF0 A; 1N5Z A; 2RMO A; 4E6R A; 3UF4 A; 3U23 A; 2EKH A; 2A08 A; 1TUC A; 1G83 A; 2DBM A; 4RUG A; 1UDL A; 1A0N B; 4HXJ A; 2L3P A; 2EYZ A; 1GBQ A; 1KIK A; 2LJ1 A; 2RQR A; 4Z89 A; 1JXM A; 1K4U S; 2SEM A; 3EGU A; 1X2Q A; 1QWF A; 2RQT A; 1UTI A; 3REB B; 3EG1 A; 1S1N A; 1RI9 A; 2W10 A; 1K0S A; 4OMO A; 3I5S A; 4JZ4 A; 2M0Y A; 2HBW A; 2K3B A; 5IHK A; 1T3S A; 3SEM A; 2KEA A; 3C0C A; 4F16 A; 1ZBJ A; 3EHQ A; 2FPF A; 4RTW A; 1CSK A; 2ED1 A; 2LQW A; 1I0C A; 2K7A A; 1RLQ C; 2LCS A; 4LUE A; 2GQI A; 4CC4 B; 5IHN A; 1AD5 A; 2XMF A; 1I07 A; 1YNZ A; 2ROT A; 1TG0 A; 1W6X A; 1H92 A; 1H8K A; 2NUZ A; 2YUO A; 3M0T A; 2FPE A; 5I11 A; 4OMM A; 1MUZ A; 2O9S A; 1NG2 A; 3LH5 A; 2DL5 A; 1M3A A; 1GBR A; 2KE9 A; 2ROL A; 1AEY A; 1M27 C; 2V1Q A; 1WI7 A; 3H0F A; 1YP5 A; 1YWP A; 4IIO A; 1AWJ A; 2LJ3 A; 2K6D A; 2EPD A; 2I0N A; 2PZ1 A; 3NGP A; 4D8D A; 3REA B; 4LN2 A; 2DE0 X; 2DX1 A; 4FSS A; 1AOJ A; 4Z8A A; 1K76 A; 2J05 A; 2ABL A; 2O2O A; 1ZUK A; 1X6B A; 4EIK A; 2D8H A; 1OV3 A; 1PWT A; 1WXB A; 2FPD A; 2KGT A; 1AZG B; 4AFS C; 1KSW A; 2DL3 A; 3A98 A; 1M30 A; 1KJW A; 5IH2 A; 1NEG A; 2HDA A; 2D0N A; 2EYW A; 3TVT A; 5FWC A; 1VYV A; 1ZX6 A; 1QCF A; 4AFU C; 2KT8 A; 5IXB A; 3O5Z A; 4DEY A; 2CUB A; 2LMJ A; 1AZE A; 2AZS A; 2CUD A; 2GTO A; 1OPL A; 2A28 A; 1JEG A; 1E7O A; 1SHF A; 1WA7 A; 2RQU A; 2GGR A; 2VVK A; 2KRS A; 3NHN A; 1ABQ A; 1EFN A; 1T0H A; 1BB9 A; 3I35 A; 1ZSG A; 1QWE A; 1CKA A; 4AFZ C; 1E6H A; 2W0Z A; 1VYT A; 1NM7 A; 2BZY A; 3H41 A; 4RTU A; 1K0X A; 3I9Q A; 1JU5 C; 2CH4 W; 1AWW A; 2RQV A; 1NEB A; 1V1C A; 4HVW A; 2DMO A; 1SHG A; 2V1R A; 1UGV A; 2SRC A; 3M0Q A; 2FEI A; 4Z88 A; 2VKN A; 2JT4 A; 1AVZ C; 2EW3 A; 4KRT A; 1IO6 A; 4HCK A; 2JS0 A; 1WLP B; 2YT6 A; 1QKW A; 1YN8 A; 2KBT A; 5EC7 A; 3PVQ A; 1GFC A; 1AWX A; 4J9B A; 3FJ5 A; 2EYX A; 5FW9 A; 2BZX A; 2X3W D; 4ESR A; 4R0K A; 4DEX A; 2AKL A; 2NWM A; 2ECZ A; 4GBQ A; 1JQQ A; 1GFD A; 2KXD A; 1OOT A; 3RBB B; 4CC7 A; 1Z9Z A; 1WYX A; 5L23 A; 3EG2 A; 2OAW A; 2YSQ A; 1Y57 A; 2G6F X; 3EG3 A; 3M0R A; 5GJV B; 2M51 A; 2FG0 A; 2O88 A; 2B86 A; 2J6K A; 1ABO A; 4J9D A; 2DBK A; 1LCK A; 1I1J A; 1OPK A; 2AKK A; 4GLM A; 3QWY A; 1MV3 A; 1CKB A; 1BBZ A; 3CQT A; 1VA7 A; 1NYG A; 2DL4 A; 2HCK A; 1MV0 B; 1PNJ A; 3H0H A; 4D8K A; 2LQN A; 2DNU A; 1X2K A; 1M3B A; 1T3L A; 1FYN A; 2EGA A; 2JW4 A; 1WFW A; 2CT3 A; 2JM8 A; 2KYB A; 3VRZ A; 4LUD A; 2LX7 A; 2JMC A; 3ULR B; 1SEM A; 1UJ0 A; 3VS6 A; 1UEC A; 1AWO A; 1QKX A; 2KRM A; 3VS2 A; 3M0P A; 2GNC A; 1W1F A; 1UHF A; 4AFQ C; 1HJD A; 4RTT A; 2PNI A; 2OI3 A; 3UA6 A; 3TSZ A; 3NMZ C; 4Y92 A; 3VRY A; 4CC2 A; 1WIE A; 2DRK A; 2JS2 A; 2X3X D; 4RTV A; 2KXC A; 2GTJ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JB0 E; 2EQJ A; 1VQM A; 4J9H A; 4MML A; 2DVJ A; 4PFZ A; 3M0U A; 4HVV A; 2JNG A; 2RJE A; 1ZSZ A; 1Q86 C; 4M75 B; 3VKI A; 4CC3 A; 3OYF A; 1M2V A; 1PRM C; 2KDS A; 1WGS A; 2PU9 B; 1WDX A; 2V8I A; 3CCQ T; 1K1Z A; 2QXF A; 1PKT A; 1SPK A; 2ZZD A; 2BUD A; 2MIO A; 2ZPB B; 1PSE A; 2LNH B; 1G2B A; 1YJW T; 3M57 A; 1IRE B; 2HNI A; 4X1V A; 1YIT A; 5GAN h; 1NLP C; 1Q81 C; 3EH2 A; 2CZ6 B; 2DPP B; 4C92 C; 1N9S A; 2DJQ A; 3JCM h; 2RNA A; 4ZGD B; 1UJY A; 2YUP A; 2VGN A; 4EPC A; 3CCU A; 5ECA A; 4C92 D; 4A4H A; 4PLL A; 4J83 A; 2CYZ B; 2DEU A; 3CCS A; 3I55 Q; 3C12 A; 1PRL C; 1VQ5 Q; 3J81 E; 3PIO A; 4RMO A; 4QT7 A; 2VWF A; 1B34 B; 2IIM A; 4C92 G; 3RR6 A; 4MDW A; 5CKF A; 4X9C A; 2X51 A; 3VS0 A; 5I22 A; 1QVF P; 4A54 A; 2BTT A; 3OYE A; 3VUZ A; 4LE9 A; 2JTE A; 5CKH A; 1U06 A; 1NJI R; 2C0T A; 3H0I A; 3WVE B; 4N4H A; 5KYN A; 5DLO A; 1NYF A; 3JB9 H; 5I2M A; 2KRO A; 3HTR A; 4OGC A; 4M7D F; 1VQ6 T; 2NUP A; 4L6V 5; 3CC4 Q; 3FDR A; 2F2X A; 1VQO T; 4FYX B; 1XNI A; 3KUF A; 7AT1 B; 1JXO A; 2CDT A; 2O4X B; 3OY9 A; 4PK4 A; 3EGX A; 2YRD A; 1YJN T; 3X28 B; 2ZPF B; 4JRP A; 4J9I A; 3H6Z A; 2E65 A; 3OA6 A; 3FRN A; 5IHI A; 2YUQ A; 1QMC A; 5FU7 C; 1K73 C; 3CXC P; 3SDZ A; 2L0A A; 3NPF A; 1G5V A; 2FZC B; 2J6F A; 2FO0 A; 4ELY C; 1VQ9 T; 4C0D C; 2WSC E; 2LJ0 A; 3P8D A; 4F14 A; 1NPP A; 3GNG A; 1M8M A; 2JXB A; 4XTU A; 2XHC A; 2FRY A; 4M7A F; 1UFF A; 2EGE A; 1YIJ T; 5FRM A; 4E2F B; 3E9G A; 4BB7 A; 1RUW A; 1M1G A; 2H8H A; 4JPB W; 1GCP A; 2E12 A; 2P0P A; 3CBP A; 3AHU A; 1JJ2 P; 3WXM B; 1YI2 Q; 1H3H A; 3UWN A; 1X27 A; 4MMK A; 1W70 A; 4RG2 A; 4M7A A; 1VQL Q; 3N5B B; 2YUN A; 3VS1 A; 1SRL A; 4RG8 A; 3THK A; 2A7Y A; 3CC7 T; 1IZ6 A; 2RMO A; 1QCN A; 1G3W A; 2A08 A; 1M5Q 1; 4N0A A; 1G83 A; 1MMN A; 2FHD A; 1M1K R; 5CQX A; 5FRO A; 1KIK A; 4ZGE B; 2RJD A; 1M90 C; 1MND A; 1K4U S; 2L3R A; 2WSE E; 3EGU A; 3PFS A; 4CI0 C; 1UTI A; 4PFO A; 3EG9 A; 3NFC A; 3OYC A; 5IHK A; 4F7U E; 4KUL A; 4F7U F; 1IXD A; 2FPF A; 5LJ3 g; 4EDU A; 5J3B A; 3X26 B; 2EJF A; 3QXE B; 4ANJ A; 2RI3 A; 1U1T A; 4XTZ A; 4C8Q A; 2LCS A; 4Q5W A; 4PL6 A; 5CR2 A; 3QUI A; 1YNZ A; 3E2U A; 4JRQ A; 1H92 A; 3VYH B; 1H8K A; 1FXX A; 3PT9 A; 1VQN T; 3DLM A; 4OMM A; 2HZY A; 3LH5 A; 2EYQ A; 1RAA B; 3OW2 P; 4KGZ B; 2EQU A; 5HKC A; 4HCZ A; 5DY9 A; 1TS9 A; 1U1S A; 3FJP A; 1NBE B; 3FB9 A; 2RO0 A; 2CGH A; 4IIO A; 2LJ3 A; 5LJ5 g; 2M02 A; 2I0N A; 3S3O A; 3OSV A; 1VQP A; 3GF5 A; 2XID A; 1AOJ A; 5GAN 6; 3O8V A; 2QQ9 A; 1VQ7 A; 1VQK A; 4IKF A; 1K76 A; 2J05 A; 1RAC B; 2EQK A; 2D8H A; 4M78 C; 2ZPE B; 2KK4 A; 1NJI U; 2L5Q A; 4M75 E; 4M78 D; 3ER0 A; 1NEG A; 2HDA A; 3TVT A; 5FWC A; 1VYV A; 4FL6 A; 1R8O B; 3V7C A; 1ZSZ B; 1R0C B; 3H9N A; 2KT8 A; 1OYX A; 5IXB A; 1M2V B; 3SFM A; 3OSS C; 3PIP A; 2CUB A; 3EAE A; 4M78 G; 3CD6 Q; 3GP8 A; 2GTO A; 2A28 A; 2DTO A; 2DKG A; 5KH6 A; 2HKQ B; 5A0L A; 4LDW A; 2PVD B; 1BIB A; 2RQU A; 1VQ8 T; 2BE9 B; 2GGR A; 3JSC A; 4DBQ A; 1KQ2 A; 4PJO F; 4OVA A; 1YJW Q; 2MPX C; 3CBM A; 3T9N A; 4BY6 C; 1WHG A; 5CCA A; 1HYO A; 3CCJ A; 1M1F A; 4AFZ C; 1E6H A; 4N0A C; 4RTU A; 2LT4 A; 3I9Q A; 3G71 T; 4LDY A; 1V1C A; 5CIU A; 1SHG A; 2EW3 A; 4PJO A; 2YLB A; 2JS0 A; 1PSF A; 3TQ7 P; 2K5I A; 3CCM T; 2E3H A; 3A5Z B; 5CKB A; 2WSF E; 1KQS S; 4BI4 A; 4RCC A; 1IRX A; 5FW9 A; 4C8Q C; 1WHJ A; 1UGS B; 2BZX A; 2DD5 A; 2ZPG B; 2NWM A; 1BI3 A; 3OBY A; 1P92 A; 2ECZ A; 1YJ9 T; 4GBQ A; 4BE0 A; 4PFP A; 1XQH A; 1GFD A; 4C8Q D; 2RJC A; 2Y90 A; 1I81 A; 4CC7 A; 3GLX A; 2RHY A; 3R6O A; 1VQ4 A; 1Y57 A; 5GAN 7; 3HSB A; 1VQ6 Q; 1N8R C; 2NUP B; 2J6K A; 5A0D A; 4J9D A; 4C8Q G; 1RAF B; 1I4K 1; 5GAN 8; 3JB9 I; 1YFN A; 1Q81 R; 1RAI B; 2RB6 A; 3EGX B; 4GLM A; 2ATC B; 3CCR T; 3D7S B; 1YJN Q; 3JCM V; 1MV0 B; 1PNJ A; 2H3J A; 3H0H A; 4FYY B; 2XI9 A; 2XDD A; 1FYN A; 2JM8 A; 2CT3 A; 2M0O A; 1S72 T; 3VRZ A; 1IB8 A; 5GAO q; 1M8V A; 2XU8 A; 3QPH A; 2A3L A; 1MHN A; 4KH0 B; 1VQ9 Q; 2OI3 A; 4Y92 A; 3VRY A; 2MAM A; 4RTV A; 2EIF A; 1B7T A; 5CVI A; 2E10 A; 2HL3 A; 4IUV A; 2GTJ A; 1WPY A; 1V76 A; 4J9G A; 5I21 A; 3OS2 A; 2DIL A; 1VOM A; 4PKC C; 2K9G A; 4AG1 C; 1RAH B; 3QDR B; 5KYY A; 3I55 A; 2DA9 A; 1VQ5 A; 3KXT A; 3DKM A; 4M7A B; 3RUX A; 3OB9 A; 2RK1 A; 1EIF A; 2FL7 A; 1D0Z A; 2QGF B; 5LL6 S; 4JS5 A; 5CAI A; 1VQL T; 2KYM A; 2YXY A; 2DVE A; 4J9E A; 3R6N A; 1G3Y A; 1BK2 A; 1MGQ A; 1JJ2 S; 4OMQ A; 3MJX A; 3M53 A; 3CC4 A; 2QA4 Q; 2JN0 A; 2F2W A; 2EVR A; 1M2O A; 1WNL A; 3TEE A; 3EG9 B; 4Y28 E; 1UHC A; 2GCX A; 4C92 A; 3QZ5 B; 2CP2 A; 3MKD A; 5GAM d; 4A4G A; 3L2Z A; 2HAX A; 2E5K A; 1OU9 A; 2IG0 A; 4B9X A; 4GY5 A; 3VV0 A; 3X25 B; 4C8Q B; 1QVG P; 1Q95 G; 2P4T A; 4EMH A; 2E64 A; 2LP5 A; 4B9W A; 4JLG A; 2DK3 A; 4N4I A; 2AZV A; 5KCO A; 2F1L A; 3GOX A; 2JMA A; 4HCB A; 4IIM A; 3M59 A; 4J5Y A; 2MF2 A; 3CPF A; 4RTZ A; 3RKY A; 1X43 A; 3QHS A; 1VQN Q; 4KUI A; 3CME Q; 3VS5 A; 3EHR A; 4FW1 A; 4J8O A; 3JCM X; 3SWN C; 5IN1 A; 3EG0 A; 4UC4 A; 2F5K A; 2CKK A; 1PG5 B; 1E6G A; 1ZUU A; 2J06 A; 1IGU A; 2O9V A; 3MET A; 2F5T X; 4BUG A; 1WHM A; 1JO8 A; 1Q86 U; 3LYI A; 1YHQ Q; 4ZTF A; 2M1H A; 1YI2 A; 4DOV A; 3A8H B; 2RHZ A; 3JCM P; 1I8F A; 2RI2 A; 1NLO C; 4LD6 A; 3CCV T; 3CMA A; 5J26 A; 3UAT A; 3G6E T; 3NTK A; 3LW5 E; 2DIG A; 2QDL A; 1D0X A; 3M0S A; 4OB1 B; 4ORZ A; 1TWB A; 4A63 B; 1GCQ C; 1ZLM A; 2GF7 A; 1PHT A; 2E4H A; 4OMP A; 1Q81 U; 1UUE A; 3PNW C; 1D1C A; 2L3Q A; 5KE3 A; 1TUD A; 5AYF A; 3RDV A; 3ZBD A; 2E5Q A; 1WHK A; 3MCA B; 1F1B B; 2CP7 A; 5GAN e; 2JJ9 A; 2K3X A; 1VQ8 Q; 1Y0M A; 2CSQ A; 2QTX A; 3CD6 T; 2VV5 A; 4ELZ C; 1JBM A; 3JCM e; 1UG1 A; 2WAC A; 3NTH A; 3EH1 A; 4LNP A; 1HSQ A; 1J3T A; 3G71 Q; 3MP8 A; 1X6G A; 2JTF A; 4PJJ A; 3HL8 A; 2A37 A; 2LZ6 B; 2FRW A; 1ZBX A; 2QDY B; 2KI7 A; 2PQW A; 4PJO B; 2X4J A; 3JB9 F; 3L2W A; 2RF0 A; 1N5Z A; 3CCM Q; 3LLR A; 4ZGJ B; 2EKH A; 1TUG B; 3A8G B; 3CBO A; 4HA8 A; 4E7J A; 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