The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
DPKFEAAYDFPGSGSSSELPLKKGDIVFISRDEPSGWSLAKLLDGSKEGWVPTAYMTPYKDTRNTVPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Contractile protein
|
| molecule keywords |
Myosin-3 isoform
|
| publication title |
High-throughput structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
12
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| structure length |
68
|
| sequence length |
68
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4JJC A; 4JJB A; 1Z9Q A; 3ULR B; 1WLP B; 1AWJ A; 2P4R A; 2HSP A; 1PHT A; 2M0Y A; 5IHK A; 1WFW A; 1CKB A; 4RTY A; 4HVU A; 1SRM A; 1GFC A; 1J3T A; 1PRM C; 1WXU A; 1AZE A; 2ENM A; 3M0Q A; 2V1Q A; 2OJ2 A; 1B3Q A; 2CRE A; 4CC2 A; 1YCS B; 4AFQ C; 2MOX A; 1I1J A; 2L0A A; 1VYV A; 2C0O A; 2C0T A; 3I5R A; 5IXF A; 1UFF A; 2EGE A; 2DIL A; 2FRW A; 2DL4 A; 2RF0 A; 1SHG A; 4AFZ C; 4CC7 A; 2HCK A; 1X2Q A; 1MV3 A; 2SEM A; 2J06 A; 2J05 A; 2DNU A; 1H3H A; 1PKS A; 1M3B A; 1RUW A; 2J6F A; 3GBQ A; 3UF4 A; 1YP5 A; 4RTT A; 2GBQ A; 1W6X A; 2FG0 A; 3SHW A; 1W1F A; 3IQL A; 1ZBJ A; 3I35 A; 2DVJ A; 1AEY A; 2PNI A; 1M3A A; 1FMK A; 4HVW A; 2E5K A; 1G83 A; 2L3Q A; 2HEQ A; 1VYT A; 2GGR A; 1UE9 A; 2NWM A; 2DL8 A; 2F2W A; 2OI3 A; 3I5S A; 2MCN A; 1VA7 A; 2ESW A; 3PE0 A; 2AK5 A; 1QLY A; 4A63 B; 2RQV A; 4CC4 B; 1JQQ A; 3VS5 A; 1AWX A; 2JT4 A; 4OMQ A; 1HSQ A; 1E7O A; 4LN2 A; 4OML A; 2YT6 A; 1UGV A; 3H0F A; 1GBR A; 1PKT A; 4KRT A; 3U23 A; 4J9E A; 1KSW A; 1MV0 B; 2RNA A; 1AWO A; 1G2B A; 5FWC A; 2X3W D; 2V1R A; 1UUE A; 1ARK A; 2KYM A; 2CT4 A; 4JZ4 A; 1U3O A; 2CH4 W; 2QDL A; 1X27 A; 3TSW A; 1K76 A; 2JS2 A; 3A98 A; 1PNJ A; 3VRY A; 1OPK A; 2SRC A; 4J9F A; 2HBW A; 2GTJ A; 3TSZ A; 4DEY A; 2DA9 A; 2BZX A; 1QWF A; 4F14 A; 2DL7 A; 1AWW A; 4IIM A; 5L23 A; 2DL3 A; 3M0T A; 2DL5 A; 4F17 A; 1BB9 A; 2DRM A; 2YUP A; 1T0J A; 3H0I A; 4CC3 A; 1K9A A; 4OMP A; 1EFN A; 4OMN A; 5EC7 A; 1X6B A; 2AKK A; 2EBP A; 1PRL C; 1RI9 A; 2JMC A; 3VS6 A; 3M0P A; 3VS3 A; 1WXT A; 3VS2 A; 1YWP A; 1KIK A; 4OMM A; 2CUD A; 4GLM A; 2D1X A; 2D8H A; 2FO0 A; 3LH5 A; 4JPB W; 1M27 C; 2K7A A; 2PZ1 A; 2X3X D; 2K79 A; 1UHC A; 4F16 A; 4GBQ A; 1W70 A; 4ORZ A; 1K4U S; 2CT3 A; 3SEM A; 1GRI A; 4WCI A; 1ZX6 A; 2F2V A; 2A08 A; 3C0C A; 2D8J A; 2EVR A; 1SHF A; 4Y92 A; 3R6N A; 2W10 A; 2LP5 A; 4J9I A; 1QKW A; 2KXD A; 2GQI A; 1X6G A; 2OAW A; 2AKL A; 2DM1 A; 2FPE A; 5GJW B; 1OOT A; 2KGT A; 1QKX A; 1FYN A; 4JJD A; 2DX1 A; 4LUD A; 2KRS A; 1KFZ A; 3NMZ C; 1M8M A; 3THK A; 1VYU A; 1NEG A; 1ZUY A; 2A37 A; 2A36 A; 1MUZ A; 3JV3 A; 1UTI A; 1BU1 A; 1S1N A; 1NLO C; 2J6K A; 1A0N B; 4FSS A; 2VVK A; 1UJ0 A; 1XOV A; 2EGA A; 5I11 A; 3VS0 A; 2FRY A; 4D8D A; 2JTE A; 3NGP A; 1HJD A; 2NUZ A; 4LE9 A; 2EYX A; 2C0I A; 2JW4 A; 2LQN A; 1E6H A; 5IHN A; 2GNC A; 2DBM A; 1E6G A; 1NM7 A; 3PVQ A; 1NYG A; 1GBQ A; 2EYY A; 1U5S A; 2EPD A; 2HDA A; 4OMO A; 3TVT A; 4EIK A; 2KE9 A; 1AVZ C; 1NYF A; 2G6F X; 2H8H A; 2DE0 X; 3ZL7 C; 1ZSG A; 3EG1 A; 1I0C A; 3FJ5 A; 1OV3 A; 2YUO A; 1T0H A; 2VKN A; 4ZNX A; 4Z8A A; 1H92 A; 1UHF A; 3NPF A; 3UA6 A; 1YN8 A; 1AZG B; 2EW3 A; 1UEC A; 2DRK A; 2CSI A; 3M0R A; 1ABO A; 4J9C A; 4HCK A; 4JZ3 A; 3M0S A; 1NG2 A; 2LQW A; 3PVL A; 4Z88 A; 4RTX A; 2KNB B; 1JEG A; 1H8K A; 4E6R A; 3RBB B; 3VRZ A; 1WYX A; 2FPF A; 1JXO A; 1PWT A; 2EGC A; 1UG1 A; 2ROT A; 1TG0 A; 4LUE A; 4X1V A; 3EGU A; 1YNZ A; 1OEB A; 2RQU A; 1ABQ A; 4HVV A; 1GL5 A; 2K3B A; 2KBT A; 1GFD A; 2PTK A; 2B86 A; 2EYW A; 4RTV A; 4K11 A; 2O9V A; 1K1Z A; 2L3S A; 2ECZ A; 3EG3 A; 2RQW A; 5IXB A; 2EYZ A; 2LJ0 A; 2ABL A; 3NHN A; 2MIO A; 2IIM A; 5ECA A; 4HXJ A; 2J6O A; 1WI7 A; 2KR3 A; 1QWE A; 2CH4 A; 5IH2 A; 2JM9 A; 4DEX A; 1YWO A; 1BK2 A; 1T3L A; 1B07 A; 2KRM A; 2F2X A; 3REA B; 4Z89 A; 1WIE A; 1KJW A; 1V1C A; 4R0K A; 1ZLM A; 2BZY A; 2EQI A; 1Y0M A; 1K0X A; 1UDL A; 2ROL A; 4J9D A; 1RLP C; 2DYB A; 2YDL A; 5GJV B; 2BZ8 A; 2DF6 A; 2XMF A; 2W0Z A; 1Y57 A; 2GTO A; 2I0N A; 2YSQ A; 1CKA A; 2DLP A; 2EKH A; 2LJ1 A; 1M3C A; 4LNP A; 4RTU A; 3QWY A; 1LCK A; 2KT1 A; 2ED1 A; 4J9G A; 1AOJ A; 1AD5 A; 2A28 A; 2ED0 A; 2RQT A; 3O5Z A; 3EG2 A; 2JM8 A; 2JXB A; 2RMO A; 2KRO A; 2DBK A; 2J7I A; 5I22 A; 4QT7 A; 2FPD A; 1GCQ C; 3REB B; 1WDX A; 4J9B A; 1I07 A; 4RTZ A; 2LCS A; 3VS1 A; 2KYB A; 4RUG A; 4IIO A; 1JU5 C; 2LX7 A; 4D8K A; 1N5Z A; 2K9G A; 2AZV A; 1TUD A; 5FW9 A; 3EHR A; 2VWF A; 2KXC A; 2O9S A; 1IO6 A; 1SEM A; 3I9Q A; 2LNH B; 2CUB A; 3VS4 A; 4RTW A; 3RNJ A; 2L3P A; 3KFV A; 2RQR A; 2RN8 A; 2LZ6 B; 3M0U A; 2LJ3 A; 1RLQ C; 1JXM A; 3H0H A; 4AG2 C; 1OPL A; 1GCQ A; 1X43 A; 1Z9Z A; 1ZUK A; 1X2K A; 4AFU C; 3UA7 A; 1TUC A; 2YUN A; 4M4Z A; 1T3S A; 3EG0 A; 4AG1 C; 2O88 A; 1WX6 A; 1X69 A; 1WA7 A; 1U06 A; 2KRN A; 2CSQ A; 3QWX X; 1SRL A; 3CQT A; 3EHQ A; 2CDT A; 2KT8 A; 1M30 A; 1JO8 A; 4ESR A; 2O2O A; 1NEB A; 1K0S A; 1SSH A; 1SPK A; 1HD3 A; 1GCP A; 1UJY A; 2BTT A; 1QCF A; 2D0N A; 2RPN A; 5HCK A; 1ZUU A; 5FWB A; 4J9H A; 2K2M A; 2KEA A; 2AZS A; 4AFS C; 2M51 A; 2K6D A; 3H41 A; 2L2P A; 2DJQ A; 1NLP C; 2DMO A; 2O31 A; 2FEI A; 2JMA A; 2JS0 A; 3VS7 A; 1CSK A; 1BBZ A; 5IHI A; 3UAT A; 2YUQ A; 2LMJ A; 1WXB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4JJC A; 4JJB A; 4VUB A; 3OS5 A; 2K3X A; 3PFS A; 2RI2 A; 1AWJ A; 4IUR A; 1PHT A; 2M1H A; 3CPW S; 1I8F A; 3JCM f; 2G3R A; 4XTX A; 5KE3 A; 1CKB A; 1MNE A; 4HVU A; 5A2Q E; 1WGS A; 1PRM C; 1WXU A; 2QQB A; 4BI4 A; 5KCH A; 3G4S A; 2C06 A; 4J6Y A; 3NTK A; 1H64 1; 1YHQ T; 4QQ6 A; 2LCL A; 1B3Q A; 1W2B P; 4AFQ C; 2MOX A; 2R5M A; 4OB0 B; 4PFZ A; 2XD0 A; 5LJ5 e; 4NS5 A; 2C0T A; 2DK3 A; 4A4F A; 2FRW A; 2MPX C; 2EQM A; 2J6F A; 5GAN d; 1KQS P; 3GBQ A; 3HKS A; 4EMK A; 4RTT A; 3I55 T; 3SHW A; 1W1F A; 2DPP B; 1ZHI A; 1VQ5 Q; 1WZO A; 4XU1 A; 3CD6 T; 1ZSZ A; 1M4Z A; 1AEY A; 2RHX A; 1VQ4 Q; 4HVW A; 3VUZ A; 2HEQ A; 3J80 E; 3CMA A; 1YI2 T; 4V2S A; 1M2V A; 2QQA A; 1VA7 A; 2ESW A; 3PE0 A; 5J26 A; 4BE2 A; 2AK5 A; 3OS0 A; 4CC4 B; 4M78 G; 4A63 B; 1JQQ A; 4C5G A; 2V26 A; 3MP8 A; 4C8Q D; 1PKT A; 3BFM A; 1BIB A; 1KSW A; 1MV0 B; 2RNA A; 3JCM W; 2V1R A; 1YJN T; 4M77 D; 2EJG A; 4Y28 E; 1S72 Q; 4XTU A; 3TSW A; 3EGX B; 3OYF A; 1WQW A; 5GAN 2; 5KYW A; 2JS2 A; 3A98 A; 3I56 Q; 5LJ3 f; 5HKC A; 1OPK A; 1SSF A; 2DZ9 A; 5GAN f; 1K9M C; 3ZBD A; 4PJJ A; 2LTO A; 3Q1J A; 3TSZ A; 4DEY A; 2XKO C; 4F14 A; 1AWW A; 3M0T A; 2CP7 A; 1BB9 A; 1RAC B; 1EFN A; 1R8O B; 3QKJ A; 4DBQ A; 2M02 A; 2AKK A; 1M90 R; 2FVU A; 3LWH A; 3CCS Q; 5A0G A; 4PJO C; 2E3H A; 4EDU A; 3JAM E; 4IUT A; 2EJ9 A; 1YIT Q; 1IB8 A; 2FO0 A; 1B7T A; 3MHX A; 4JPB W; 1VQ5 A; 4MZP A; 5C0M A; 1HXD A; 2K7A A; 5J3B A; 4PK4 A; 2DZC A; 3N5B B; 1VQ4 A; 3CCV T; 1N9R A; 4ORZ A; 1K4U S; 4C0Z A; 4LDX A; 3L2W A; 1VQO T; 4PKC C; 1V76 A; 3A8H B; 2EVR A; 1SHF A; 1WHJ A; 3R6N A; 4JS4 A; 1QKW A; 1MMD A; 2VYT A; 1X6G A; 1K73 R; 4C0D B; 1NPP A; 3MEV A; 4M7A B; 1OOT A; 1QKX A; 4PLL A; 1Q81 R; 2F5T X; 1KFZ A; 1PSE A; 3VYH B; 4FIB A; 1YIJ Q; 1NEG A; 2A37 A; 2EFI A; 2QQ9 A; 3WXM B; 2H3J A; 4X34 A; 5I2S A; 3HL8 A; 2J6K A; 3M9Q A; 3JCM X; 1XOV A; 2EGA A; 1JB0 E; 1R77 A; 3JB9 H; 4X9D A; 2JTE A; 1MMN A; 1HJD A; 1PG5 B; 2NUZ A; 4LE9 A; 1IRX A; 1VQ6 Q; 3MP1 A; 1VQK Q; 5GAN 3; 1F1B B; 3F70 A; 3OYM A; 3C12 A; 4WF2 A; 1WHM A; 1JJ2 A; 2KMT A; 4M7D B; 3V8J A; 1M1F A; 4FYY B; 5CKH A; 4M78 C; 4JS5 A; 5CAI A; 1K9M U; 3TVT A; 1NYF A; 2HAX A; 2H8H A; 3M53 A; 2Y90 A; 1WJQ A; 3FJ5 A; 2YUO A; 2EWN A; 1T0H A; 3FIF A; 4ZNX A; 4Z8A A; 1YJ9 A; 4JLI A; 2E65 A; 1C6V X; 3UA6 A; 2E5Q A; 1BI1 A; 1ABO A; 1G5V A; 4ANJ A; 4MML A; 2K3Y A; 4FYW B; 2LQW A; 1M1G A; 4Z88 A; 4RTX A; 3CCJ T; 2KNB B; 2MK5 A; 4A4H A; 2L3R A; 4NL2 A; 2OTJ Q; 3G6E A; 1WYX A; 1JXO A; 1PM3 A; 3LWI A; 5CKD A; 3LW5 E; 3NTH A; 4X1V A; 2HL5 C; 1Q7Y R; 1YNZ A; 4XAX B; 1ABQ A; 2RI3 A; 4L6V 5; 1B34 B; 1I5L A; 4HVV A; 4F7U B; 4WTO B; 2DXU A; 2KBT A; 3G1J A; 5GAN 7; 1GFD A; 1BI2 A; 4FL6 A; 4RTV A; 1VQM T; 4K11 A; 4ZN1 A; 1K1Z A; 4NOY A; 1LNX A; 1D0Y A; 2ECZ A; 4XTW A; 2ABL A; 3NHN A; 2KAF A; 2YRD A; 4B9W A; 1YIJ A; 3DB3 A; 1VQN A; 3SWN B; 1WI7 A; 1ZQ1 A; 1OUL A; 1QWE A; 3OYE A; 2ZCF B; 1YJW Q; 3JCM J; 2VXE A; 1BK2 A; 3OW2 A; 4M7A G; 4Z89 A; 1VQ8 A; 1MMG A; 5DY9 A; 2QEX A; 2D0Q B; 1UGP B; 1ZLM A; 2BZY A; 2EQI A; 1Y96 B; 2DET A; 1Q82 R; 3CCL A; 3RMS A; 3VYG A; 1UDL A; 2RJE A; 4J9D A; 2DYB A; 3QZ9 B; 4BI3 A; 4QVC A; 2WAC A; 1Y57 A; 2GTO A; 2YSQ A; 1CKA A; 2DLP A; 1RAB B; 3CCQ Q; 3L42 A; 2E6Z A; 1LCK A; 4J9G A; 1AOJ A; 4ZGJ B; 3WVD B; 3L2V A; 4Q5W A; 3CBM A; 1VQL A; 2KRO A; 1EX4 A; 2DBK A; 2J7I A; 5IN1 A; 3RDV A; 4IIO A; 2LX7 A; 4C8Q G; 5GAN 4; 3CCR Q; 1XJW B; 4FT4 A; 4IUU A; 3CC7 T; 4DA4 A; 5GAO l; 4BE0 A; 1VQP Q; 2CZ1 B; 1RAI B; 1TUD A; 2EQU A; 2JNG A; 2VWF A; 2KXC A; 1KC8 C; 2PQW A; 1IO6 A; 4M77 G; 3VS4 A; 4M75 C; 2OTJ A; 1PD0 A; 1N27 A; 3EG9 A; 2LZ6 B; 4M78 D; 2X4J A; 1GCQ A; 2L89 A; 2CP0 A; 3D7S B; 5GAM g; 1BIA A; 4M4Z A; 3KBG A; 8ATC B; 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2DEQ A; 2QQR A; 4RMO A; 4Y91 A; 3MP6 A; 1ZBJ A; 3I56 T; 1M2V B; 2DVJ A; 2O4X B; 3ZFJ A; 4A54 A; 1GXI E; 4RCC A; 2ZZD A; 3A8L B; 3OY9 A; 1G83 A; 2L5Q A; 2L3Q A; 2E64 A; 2DL8 A; 5LJ5 f; 1NE8 A; 3ZEH A; 4C92 E; 2HNI A; 2DVE A; 1R0B G; 1QLY A; 4C8Q C; 3M54 A; 2XI9 A; 1OZ3 A; 4HA8 A; 1E7O A; 4OML A; 1UGV A; 3OMC A; 5CVI A; 1GBR A; 3CCS T; 4M77 C; 3URG A; 2Y4Y A; 3V7S A; 2QGF B; 5KYW B; 1M1K R; 1AWO A; 4OF1 A; 2K2V A; 2FZK B; 5FWC A; 1UUE A; 1YIT T; 2KYM A; 2QXF A; 3M55 A; 4OMF B; 2E10 A; 3CMA Q; 1U3O A; 2QDL A; 4QW2 A; 3ER0 A; 4PNO A; 4C0F A; 3SD4 A; 1PNJ A; 1M90 U; 4J9F A; 5FRO A; 2GTJ A; 5I2M A; 4C92 F; 3LLR A; 2OAU A; 4QVD A; 1LVK A; 4IIM A; 2BUD A; 2DL3 A; 2RHI A; 4J8O A; 2CYZ B; 1K9A A; 3OSV A; 1IZ6 A; 2HZY A; 1Q7Y C; 3OYK A; 1X6B A; 2EBP A; 1PRL C; 3RKY A; 2CP2 A; 2V8I A; 3VS6 A; 3S3M A; 5KYY A; 3M0P A; 1WXT A; 5A0L A; 2QQS A; 1MMA A; 1IRE B; 2B8A A; 1KIK A; 4OMM A; 3OS2 A; 3OYN A; 5HK0 A; 3QDF A; 1K73 U; 1D0X A; 2XDP A; 3LH5 A; 3QBY A; 1Q86 R; 1VQ6 T; 3JCM P; 2X3X D; 2K79 A; 1PD1 A; 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