The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
74
|
structure length |
74
|
Chain Sequence |
GSSGSSGSTMTVIKDYYALKENEICVSQGEVVQVLAVNQQNMCLVYQPASDHSPAAEGWVPGSILAPFSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Kalirin-9a
|
| publication title |
Solution structure of SH3 domain of mouse Kalirin-9a protein
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
6
|
| structure length |
74
|
| sequence length |
74
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2004-05-27 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KGT A; 3PE0 A; 2RQT A; 2PZ1 A; 1JQQ A; 2KXC A; 2CSI A; 1GRI A; 2HEQ A; 2C0I A; 2E5K A; 2D1X A; 4J9C A; 2EPD A; 2RMO A; 2M51 A; 2KE9 A; 2RQR A; 3UA7 A; 1ARK A; 2FEI A; 2X3W D; 1BU1 A; 1WI7 A; 1WYX A; 1Y0M A; 1U3O A; 1WX6 A; 2J7I A; 2FRW A; 1HJD A; 2BTT A; 2V1R A; 4M4Z A; 4Z8A A; 4CC2 A; 1WXU A; 2GQI A; 2FRY A; 2CUB A; 2C0T A; 1KSW A; 3NPF A; 2O88 A; 2SRC A; 4F14 A; 1ZLM A; 1JXM A; 1T3L A; 2W0Z A; 3JV3 A; 1GBQ A; 4JPB W; 1CKA A; 1AWO A; 2G6F X; 3EG0 A; 4JJC A; 2LJ1 A; 1M27 C; 1YP5 A; 1QKW A; 1M3B A; 2KEA A; 2EQI A; 2KBT A; 2AZS A; 4GLM A; 3VS6 A; 2CRE A; 3QWX X; 1HD3 A; 3TVT A; 2KNB B; 1X6G A; 2RN8 A; 1BB9 A; 1PKS A; 5EC7 A; 2AKL A; 2JM9 A; 2DJQ A; 2DBM A; 2GBQ A; 2KXD A; 1I1J A; 2L3P A; 4RTU A; 1H92 A; 2A36 A; 2O9V A; 1NYF A; 1UJ0 A; 4GBQ A; 1PWT A; 2DNU A; 3EG2 A; 2IIM A; 2GTO A; 1WXB A; 1VYV A; 2RQW A; 1YWP A; 2DM1 A; 1NLO C; 2RQU A; 3NGP A; 4JZ3 A; 1UJY A; 1N5Z A; 2LNH B; 1SPK A; 2RF0 A; 2M0Y A; 2B86 A; 4J9F A; 4RTZ A; 3FJ5 A; 1G2B A; 1YN8 A; 2CSQ A; 2JS2 A; 2RQV A; 4D8K A; 2MOX A; 3H0H A; 4LUE A; 1OEB A; 2AZV A; 4JJD A; 1QKX A; 1CSK A; 4JJB A; 1QWE A; 4ESR A; 1UEC A; 1YCS B; 1ABQ A; 3ULR B; 1RI9 A; 1AWW A; 2J6O A; 2EGE A; 1JU5 C; 3SEM A; 3VS5 A; 2FPD A; 2F2W A; 4A63 B; 2GNC A; 3I9Q A; 1RUW A; 2L3Q A; 2VWF A; 1ZX6 A; 4IIO A; 1TG0 A; 2EGA A; 2BZX A; 2PNI A; 1V1C A; 2J6F A; 1SHF A; 2HSP A; 5FWB A; 2DLP A; 3PVQ A; 4AG2 C; 2EKH A; 2YUO A; 1M3A A; 3I35 A; 2F2V A; 2EW3 A; 1NYG A; 1K1Z A; 1TUD A; 3IQL A; 2D8H A; 3EG1 A; 1PRM C; 2KRO A; 2EYZ A; 2P4R A; 2V1Q A; 3A98 A; 2D0N A; 2MIO A; 2DA9 A; 1MV0 B; 2DRK A; 4ORZ A; 3SHW A; 2W10 A; 1QLY A; 2FO0 A; 2DL4 A; 2DVJ A; 4LE9 A; 2ENM A; 1E6G A; 2C0O A; 2CH4 A; 1I07 A; 2DRM A; 3KFV A; 1AEY A; 5FW9 A; 2OI3 A; 2OAW A; 2ROL A; 4RTV A; 3M0S A; 3M0U A; 1W70 A; 1T0H A; 3VRZ A; 4J9H A; 1UDL A; 2KT1 A; 2LZ6 B; 2LCS A; 1Y57 A; 1AZE A; 3REA B; 3EHQ A; 5GJV B; 2ED1 A; 3VS1 A; 2K6D A; 3M0T A; 1K9A A; 4OMP A; 4JZ4 A; 4D8D A; 2AKK A; 2DL5 A; 4E6R A; 2A28 A; 3GBQ A; 1U06 A; 1OV3 A; 4CC4 B; 2GTJ A; 2J6K A; 4CC3 A; 5IHK A; 2K3B A; 1PRL C; 4DEY A; 1PHT A; 4HVU A; 1H3H A; 2JT4 A; 1AWJ A; 2XMF A; 3THK A; 1AD5 A; 2LMJ A; 4Z89 A; 1E7O A; 2KRS A; 4HVW A; 4AFQ C; 2FG0 A; 1X2K A; 4R0K A; 1RLQ C; 3EHR A; 4OMO A; 2JXB A; 2JM8 A; 2DYB A; 2F2X A; 2A37 A; 2A08 A; 2HCK A; 1UUE A; 4F17 A; 4IIM A; 1GCP A; 2I0N A; 1AVZ C; 1AZG B; 2LJ0 A; 4AFS C; 1T3S A; 1EFN A; 4OMM A; 4DEX A; 5IHI A; 1NLP C; 4EIK A; 1UE9 A; 2EYX A; 1ZBJ A; 2LJ3 A; 2BZ8 A; 1ABO A; 2YUQ A; 2JW4 A; 3H0I A; 4AG1 C; 1QCF A; 4Y92 A; 1HSQ A; 2K79 A; 2RPN A; 1SEM A; 1NEB A; 3M0P A; 4LNP A; 2RNA A; 5IXB A; 1WLP B; 2SEM A; 2J06 A; 2DL8 A; 2KYB A; 4CC7 A; 2VVK A; 2J05 A; 2YT6 A; 3TSW A; 2ED0 A; 1VA7 A; 5IHN A; 2HDA A; 1SRM A; 1K0S A; 2K2M A; 1GCQ C; 4J9I A; 1T0J A; 2DF6 A; 1M30 A; 1WIE A; 1K76 A; 1NM7 A; 2KYM A; 1BBZ A; 3I5S A; 3I5R A; 2EYW A; 1UHC A; 2D8J A; 1B3Q A; 2ESW A; 1VYT A; 1PKT A; 3VS0 A; 5I22 A; 1IO6 A; 4J9G A; 1GCQ A; 1GFC A; 2LQN A; 3C0C A; 3RBB B; 1GL5 A; 1KJW A; 1ZUK A; 4KRT A; 2K7A A; 2ABL A; 1X43 A; 1K4U S; 2O2O A; 1E6H A; 1U5S A; 4HCK A; 2ROT A; 1JO8 A; 1WXT A; 3UA6 A; 2JMC A; 2KT8 A; 2YSQ A; 2LQW A; 3NHN A; 1XOV A; 2ECZ A; 4FSS A; 3EG3 A; 1LCK A; 3VS3 A; 3M0R A; 2BZY A; 1SHG A; 2EGC A; 1X6B A; 4RTW A; 1SSH A; 3PVL A; 3O5Z A; 2KRN A; 1M8M A; 5ECA A; 3H0F A; 1JXO A; 3QWY A; 3R6N A; 4OMN A; 4WCI A; 1GFD A; 3UAT A; 2X3X D; 3VS7 A; 2JTE A; 1OPL A; 4HVV A; 1UFF A; 1UG1 A; 4LN2 A; 2HBW A; 1OPK A; 4ZNX A; 1M3C A; 1AWX A; 2O31 A; 2L3S A; 1A0N B; 2KRM A; 2O9S A; 1FMK A; 1CKB A; 2DBK A; 2L0A A; 1B07 A; 2CDT A; 2EBP A; 2AK5 A; 1WA7 A; 1W1F A; 1X27 A; 2OJ2 A; 3VS4 A; 3REB B; 1YWO A; 2YUP A; 2DMO A; 2VKN A; 2DIL A; 5L23 A; 3LH5 A; 3ZL7 C; 4J9E A; 1W6X A; 2PTK A; 4J9B A; 4OML A; 4AFU C; 4RTY A; 3VS2 A; 1NG2 A; 2NWM A; 5I11 A; 1RLP C; 1VYU A; 2CT4 A; 1X69 A; 1UTI A; 1PNJ A; 2YUN A; 4OMQ A; 3CQT A; 2LX7 A; 1FYN A; 1KIK A; 1QWF A; 1H8K A; 4X1V A; 2CT3 A; 4Z88 A; 5IH2 A; 1GBR A; 1K0X A; 2K9G A; 2EYY A; 4AFZ C; 1S1N A; 3M0Q A; 1TUC A; 3VRY A; 2DL3 A; 2GGR A; 1ZSG A; 2NUZ A; 1UGV A; 3RNJ A; 1MV3 A; 2CUD A; 4QT7 A; 1JEG A; 1ZUU A; 3H41 A; 5GJW B; 2L2P A; 3TSZ A; 5IXF A; 1Z9Z A; 2LP5 A; 2QDL A; 1KFZ A; 3EGU A; 1YNZ A; 4HXJ A; 2CH4 W; 4LUD A; 2KR3 A; 2DX1 A; 2FPF A; 1J3T A; 1OOT A; 3UF4 A; 4F16 A; 2JMA A; 1BK2 A; 4K11 A; 2H8H A; 1WDX A; 1WFW A; 2DL7 A; 4RTT A; 4RUG A; 5FWC A; 2JS0 A; 1AOJ A; 1I0C A; 1SRL A; 2EVR A; 1MUZ A; 2YDL A; 4RTX A; 3NMZ C; 1NEG A; 2DE0 X; 1G83 A; 4J9D A; 1X2Q A; 2FPE A; 1Z9Q A; 1UHF A; 2MCN A; 3U23 A; 5HCK A; 1ZUY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4E7Z A; 3PE0 A; 5CKE A; 2PZ1 A; 2RJC A; 2KXC A; 4XU0 A; 1VQ9 Q; 4BD3 A; 4X34 A; 2E12 A; 4D6W A; 1WNL A; 4RKU E; 2FEI A; 4OB0 B; 1G3W A; 1BU1 A; 1VQ6 T; 4QVD A; 2MK5 A; 4ATO A; 2DIQ A; 4RG8 A; 1WX6 A; 2FRW A; 3VYG A; 1YJW T; 4E7J A; 1VQO T; 3PTA A; 2CS7 A; 2GQI A; 2LT4 A; 2XI9 A; 2DET A; 5D6X A; 2DYI A; 2M1H A; 1SSF A; 2OTL T; 2O88 A; 4F14 A; 1ZLM A; 2PU9 B; 5KYW B; 1VQL A; 1AWO A; 4IUU A; 3CCL A; 1D1B A; 5GAN g; 4NL2 A; 1M27 C; 1YP5 A; 1BIA A; 3CBO A; 4PNO A; 2KEA A; 2LJ1 A; 2CZ7 B; 2AZS A; 1HK9 A; 1VIF A; 4FM4 B; 4GLM A; 1VQP T; 4J7I A; 3HFO A; 1X6G A; 2L3R A; 1PKS A; 1TOV A; 1VOM A; 2DBM A; 3V8J A; 2PVG B; 1H92 A; 4RMO A; 2QEX T; 1BI2 A; 2O9V A; 1VQM A; 3EG9 A; 4M78 A; 1IGU A; 1NYF A; 1UJ0 A; 2DTO A; 4GBQ A; 2RJE A; 5GAM g; 5GAO n; 2X4Y A; 1PWT A; 2QGG A; 2GTO A; 1WXB A; 2RQW A; 2XDP A; 2DM1 A; 1NLO C; 1NBE B; 4JZ3 A; 1UJY A; 4J83 A; 2Y90 A; 1VQ5 Q; 5C0M A; 1SPK A; 2RF0 A; 1D09 B; 4PJM A; 4C8Q A; 3CME Q; 2E6Z A; 1RAD B; 4OF1 A; 4B9W A; 2MOX A; 4JJB A; 1ABQ A; 2E70 A; 1YIT T; 3CCU T; 3CC7 A; 1VQ6 Q; 2ZPI B; 3ME9 A; 1Q81 U; 2ZPH B; 5I2M A; 3SEM A; 1YJW Q; 3SFM A; 4E47 A; 2FPD A; 4KGZ B; 2F2W A; 2GNC A; 2M0O A; 2LCC A; 3I9Q A; 1RUW A; 2DK3 A; 2L3Q A; 4MML A; 2EQK A; 5CAI A; 4C92 B; 1MMA A; 3OBW A; 3MP8 A; 4M75 G; 3FDR A; 1V1C A; 2J6F A; 4F04 B; 1IHV A; 2HSP A; 3A8M B; 3E19 A; 4AG2 C; 3H9N A; 2BUD A; 5I2S A; 3JCM g; 2EW3 A; 4M75 E; 1TH7 A; 3I56 A; 1VQP Q; 1KQ1 A; 1M1K U; 2EYZ A; 3F70 A; 1JJ2 P; 4M78 E; 4O6J A; 2DA9 A; 2QEX Q; 3ZBD A; 3KXT A; 2FO0 A; 2DZ9 A; 1E6G A; 3HKS A; 1AEY A; 1PD0 A; 4LDW A; 3GP8 A; 2OI3 A; 4BY6 C; 2OAW A; 2ROL A; 3MEU A; 5FU6 B; 1W70 A; 4NOY A; 4A54 A; 4V2S A; 4LD6 A; 1LOJ A; 2COY A; 1D1C A; 2QGF B; 1AZE A; 4EMK C; 3CCS T; 2K5F A; 5GJV B; 5KYW A; 2HAX A; 2K6D A; 4BY6 B; 5FRN A; 1JJ2 A; 3CCM Q; 4KBM B; 4PK4 A; 3S6W A; 3DB4 A; 3VYH B; 4E6R A; 2A28 A; 4O5V A; 3D7S B; 2VAS A; 4CC4 B; 2DEU A; 3A8O B; 4OVA A; 2GTJ A; 3H6Z A; 1K8A C; 3OSV A; 2KY9 A; 4DEY A; 1VQL T; 4HVU A; 4MZT A; 3GF5 A; 3CCL T; 4JLG A; 1AD5 A; 2MMP A; 2LMJ A; 4KGX B; 3QSU A; 3VUZ A; 2I2L A; 2DAQ A; 4HVW A; 3CC4 A; 1X2K A; 2DXU A; 1RLQ C; 4KT0 E; 2JM8 A; 1OU8 A; 2A08 A; 2ZPG B; 3QHS A; 1GCP A; 1AVZ C; 2P0Q A; 1AZG B; 4PFO A; 3QDF A; 4AFS C; 1EFN A; 3MCA B; 5CQY A; 3VUB A; 1Q7Y U; 1BKB A; 1WHM A; 1ZBJ A; 1ABO A; 3H0I A; 2CP7 A; 4ELY C; 2XU8 A; 4RG2 A; 4AG1 C; 2PVO B; 4Y92 A; 1HSQ A; 2HKN A; 3EGX A; 1XTD A; 4C92 A; 2DL8 A; 3CPW A; 2KYB A; 2E41 A; 5IHN A; 1NZ9 A; 3CCS Q; 1GCQ C; 5GAM f; 3OMG A; 1K76 A; 4B9X A; 2XD0 A; 2EYW A; 1JJ2 S; 3L2W A; 3M4G A; 4BE2 A; 2XG8 D; 1N8R R; 1I8F A; 3ZEH A; 1PKT A; 1IO6 A; 2E1H A; 1GFC A; 4M7A D; 3PT9 A; 1ZUK A; 1M9S A; 4PFP A; 3JCM W; 1K4U S; 3DB3 A; 4MDX A; 4PJO B; 1UGQ B; 4FT4 A; 3CCL Q; 4DBR A; 3JCM P; 5GAN 2; 3OYB A; 1WXT A; 1VIE A; 2JMC A; 3NHN A; 4FSS A; 3CCQ T; 3P8H A; 4QW2 A; 4QKU A; 3V8K A; 3BY7 A; 2BZY A; 2LCL A; 1SHG A; 2DVE A; 1YCY A; 3Q1J A; 2EGC A; 2ATC B; 1X6B A; 4M77 A; 4OGC A; 5C6S A; 1SSH A; 2KRN A; 4XU1 A; 1M8M A; 2D6F A; 1JXO A; 3N5B B; 1M2O A; 2X4X A; 1BI1 A; 1OPL A; 3JCM e; 2R58 A; 4FU6 A; 2HBW A; 2JOY A; 3SWN A; 3A8H B; 4FYV B; 4M7A F; 2DBK A; 4C92 E; 5LJ5 d; 4ZN3 A; 2EBP A; 3QII A; 3QZ9 B; 3V7S A; 1X27 A; 5FU7 C; 1VQ8 A; 1D0Y A; 1Q86 U; 3CPW S; 5GMK i; 2YLB A; 3ZL7 C; 4J9E A; 1W6X A; 4J9B A; 4AFU C; 4HCZ A; 4MZM A; 5GMK l; 4AMC A; 4HCC A; 1NJI U; 1W2B P; 4HCB A; 1JB0 E; 1PD1 A; 1FMV A; 5GAO q; 1PNJ A; 5FU7 B; 1Q81 C; 1FMW A; 2YUN A; 3KUF A; 5CKF A; 1KC8 U; 4ZGJ B; 4PJN A; 1QVG A; 3UWN A; 3CCE A; 1H8K A; 1RL2 A; 4X1V A; 2QYZ A; 2CGH A; 3CC4 T; 1K0X A; 2L89 A; 2EYY A; 4AFZ C; 1KG1 A; 1S1N A; 1TSF A; 1O75 A; 3VRY A; 4JRK A; 3CCQ Q; 1UGV A; 3RNJ A; 1M1K C; 2COZ A; 1ZQ1 A; 1W2B A; 2AIR B; 4Y28 E; 5KYX B; 5GMK h; 1Z9Z A; 1YIJ Q; 5GAN 8; 4DBF A; 2QDL A; 2RM4 A; 3X26 B; 1KFZ A; 1VQK A; 3G6E T; 1YHQ A; 3OYH A; 2IVW A; 4HXJ A; 2HQH A; 2DX1 A; 1J3T A; 2MWP A; 1OOT A; 3UF4 A; 1PSF A; 4ANJ A; 1WJR A; 5GAN 7; 1M2V B; 2JS0 A; 2FB7 A; 4Y91 A; 1B34 A; 3G71 A; 3CXC P; 4PJO A; 2RD1 A; 3ASK A; 2HD0 A; 2BE9 B; 3VJP A; 3CCJ Q; 1QW1 A; 1IRX A; 3OYL A; 2CSI A; 2HEQ A; 2C0I A; 1WPY A; 4J9C A; 4FYW B; 3A8L B; 3EFS A; 1YJN Q; 3BFM A; 1U8R A; 2KE9 A; 2LQK A; 3UA7 A; 2X3W D; 1WYX A; 2K5I A; 2OAU A; 2QA4 Q; 4M4Z A; 3G4S A; 1H3Z A; 4Z8A A; 3CXC A; 3QXE B; 2LRQ A; 2YRC A; 3CC4 Q; 2L5Q A; 4EMG A; 2DO3 A; 2CUB A; 5CK9 A; 2CZ1 B; 1JXM A; 1XNI A; 4Z02 A; 1CKA A; 3MPU B; 3NTI A; 5CKH A; 4JJC A; 1ZSZ C; 1IRE B; 4VUB A; 2FL7 A; 2HMA A; 2EQI A; 2QQB A; 1VQ7 T; 2RHY A; 3VS6 A; 4M78 C; 1HD3 A; 1W2B S; 1Q7Y C; 2KNB B; 1BB9 A; 2H3E B; 2IPO B; 3RES A; 1D0X A; 2AKL A; 2JM9 A; 1D3B B; 4X9C A; 2GBQ A; 1I1J A; 3G6E Q; 1ZSZ B; 2KMT A; 2L3P A; 3MP6 A; 4RTU A; 3S3N A; 2QQR A; 4FT2 A; 4JS5 A; 3A1P A; 3EG9 B; 4C8Q C; 4FYX B; 1VQ8 T; 2IIM A; 5FRO A; 1VYV A; 4HT8 A; 2RQU A; 3X20 B; 2LNH B; 2VUB A; 1NPR A; 3WVE B; 2B86 A; 1GXI E; 3E2U A; 4C8Q B; 1WHK A; 1M90 U; 4L59 A; 1G2B A; 2P84 A; 4LD9 K; 3PIO A; 2CSQ A; 2JS2 A; 4C0Z A; 1DJ7 B; 3CCE T; 2NUP B; 2AZV A; 4JJD A; 1G8X A; 1QWE A; 1OQK A; 4E7I A; 2WAC A; 5KYX A; 1KK7 A; 3MO8 A; 4ME7 A; 3VV0 A; 3DLL A; 3ULR B; 1R8O B; 1XQH A; 2X4W A; 1AWW A; 2G3R A; 2M9U A; 2K4Y A; 1JU5 C; 3VS5 A; 3QZ5 B; 2A7Y A; 3CXC S; 2YLC A; 1UB4 A; 5LL6 S; 4M75 D; 1U1T A; 3HTR A; 2BZX A; 3QO3 A; 4M7D B; 2ZGW A; 1SHF A; 2DLP A; 4L5G A; 1Q82 U; 2EKH A; 4M78 D; 2YUO A; 1M3A A; 2FZG B; 1VQK T; 1VQ7 Q; 3JCM J; 1NYG A; 1K1Z A; 1TUD A; 5LJ5 h; 1YHQ T; 2RK1 A; 2E64 A; 3EG1 A; 2KRO A; 2P4R A; 3CCR A; 3BDU A; 3A98 A; 1EX4 A; 2QQ9 A; 4FW2 A; 4BAC A; 4DQ2 A; 2MIO A; 4OB2 B; 1WHH A; 2DRK A; 4ORZ A; 1YI2 A; 3SHW A; 1QLY A; 2DVJ A; 2E3H A; 5IT9 E; 1N27 A; 3KFV A; 4A4H A; 2AHJ B; 1VQ8 Q; 5LJ5 f; 1Q86 C; 3MP1 A; 4RTV A; 3M0S A; 4MZP A; 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