The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
67
|
structure length |
67
|
Chain Sequence |
GSHMKKQKVKTIFPHTAGSNKTLLSFAQGDVITLLIPEEKDGWLYGEHDVSKARGWFPSSYTKLLEE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2
|
| publication title |
Recognition of tandem PxxP motifs as a unique Src homology 3-binding mode triggers pathogen-driven actin assembly
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
|
| structure length |
67
|
| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-04-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4Z88 A; 3VS6 A; 4F16 A; 2RQT A; 2EW3 A; 2KBT A; 1X43 A; 1HJD A; 2CUD A; 1AOJ A; 1RUW A; 1X2Q A; 1OPL A; 1T3S A; 3O5Z A; 4K11 A; 3SEM A; 2KNB B; 3UA7 A; 1GFC A; 2GBQ A; 1JU5 C; 4ZNX A; 2LJ3 A; 4LUE A; 4IIO A; 2DL4 A; 2J05 A; 1I1J A; 2VWF A; 1VYU A; 3RBB B; 1UE9 A; 2BZY A; 3VS3 A; 3VS1 A; 4RTT A; 1YWP A; 3RNJ A; 4HVW A; 1K76 A; 2AK5 A; 2C0O A; 5IHN A; 3UA6 A; 2FO0 A; 2HCK A; 1WIE A; 1MV3 A; 3IQL A; 1PKS A; 3TSZ A; 5GJW B; 2A28 A; 3QWY A; 3FJ5 A; 4A63 B; 2RQR A; 2ED1 A; 4X1V A; 3PVL A; 4CC3 A; 4FSS A; 4JPB W; 4Z8A A; 1UJY A; 4AG1 C; 2ESW A; 2F2X A; 1VYT A; 2SEM A; 3NGP A; 4J9C A; 1CKA A; 1J3T A; 2KT1 A; 1GFD A; 1K0X A; 2KYB A; 1H3H A; 2F2W A; 1KJW A; 2JMA A; 2KXC A; 2LMJ A; 4JJC A; 1WDX A; 1PRL C; 1ARK A; 1V1C A; 4AFZ C; 2AKK A; 4OMO A; 2HSP A; 1NEG A; 4AFS C; 1FYN A; 4HCK A; 4CC2 A; 1NYG A; 1EFN A; 2KRN A; 3M0R A; 2D0N A; 1QKW A; 2JM8 A; 4IIM A; 2A36 A; 2K3B A; 2RQV A; 1WFW A; 1WXU A; 1AWW A; 2JS2 A; 2M51 A; 3EG1 A; 4GLM A; 2DBM A; 2JW4 A; 4QT7 A; 2ROL A; 2X3W D; 3M0T A; 1VYV A; 4AG2 C; 1NLO C; 4HVV A; 2CDT A; 3H0F A; 2KT8 A; 1UUE A; 2KR3 A; 1TUC A; 1TG0 A; 3I35 A; 2J7I A; 2FRW A; 1UHC A; 2EYW A; 1ZLM A; 4J9H A; 1AWO A; 2DVJ A; 3QWX X; 1TUD A; 3PVQ A; 1GBR A; 1OPK A; 2DM1 A; 3VS2 A; 5IXF A; 2LJ0 A; 1VA7 A; 1AEY A; 2EPD A; 1KSW A; 2O9V A; 1H8K A; 2JMC A; 5ECA A; 1QWF A; 3VS4 A; 1GBQ A; 2ENM A; 2YSQ A; 4HXJ A; 1YCS B; 4CC4 B; 4J9G A; 2K7A A; 4R0K A; 2D1X A; 1MV0 B; 2LQN A; 4ORZ A; 3VRZ A; 1X69 A; 3R6N A; 3EG3 A; 2L3Q A; 1CSK A; 1BU1 A; 1W70 A; 1T0H A; 2J06 A; 5IH2 A; 5I11 A; 5L23 A; 1B07 A; 3H41 A; 1M8M A; 2HEQ A; 2DX1 A; 1RLQ C; 5IHK A; 4JJB A; 4JJD A; 2AKL A; 3KFV A; 3NHN A; 4DEX A; 2A08 A; 4CC7 A; 1GCQ A; 3TSW A; 4OML A; 2DRK A; 1SHF A; 3H0I A; 5HCK A; 5IHI A; 2V1Q A; 1SHG A; 2BTT A; 1ZBJ A; 1M30 A; 1SSH A; 2GTO A; 2G6F X; 1A0N B; 2DLP A; 1ABO A; 4LN2 A; 4GBQ A; 1M27 C; 4D8K A; 1W1F A; 2EGE A; 3UAT A; 4LUD A; 1BK2 A; 1KFZ A; 2VKN A; 1W6X A; 2YUN A; 2EKH A; 2NUZ A; 1G2B A; 2DE0 X; 2F2V A; 4OMN A; 2CH4 W; 4J9I A; 1G83 A; 1M3C A; 2SRC A; 1JXO A; 1ZUY A; 2DRM A; 1YN8 A; 1K4U S; 2D8H A; 2KRO A; 3I5R A; 2XMF A; 3JV3 A; 1QCF A; 1AWX A; 2PTK A; 2ABL A; 1PRM C; 3C0C A; 1ABQ A; 5EC7 A; 2PNI A; 2L2P A; 2PZ1 A; 2A37 A; 3M0P A; 1PWT A; 2OJ2 A; 2V1R A; 1OEB A; 3M0S A; 2YT6 A; 4RTY A; 1Z9Q A; 4OMM A; 2C0I A; 1GCQ C; 2JTE A; 1JQQ A; 1N5Z A; 3REA B; 2CRE A; 2J6F A; 4LE9 A; 2K6D A; 1UHF A; 2KE9 A; 2OI3 A; 1KIK A; 2DYB A; 1JEG A; 2RNA A; 2C0T A; 2RF0 A; 2GGR A; 3EHQ A; 4J9D A; 1OOT A; 4OMP A; 2CUB A; 2M0Y A; 2LQW A; 2K79 A; 1WXB A; 2CH4 A; 2FPD A; 2ROT A; 1AZE A; 3EG2 A; 3NMZ C; 1S1N A; 2CSQ A; 2EYZ A; 4Z89 A; 2RN8 A; 3M0Q A; 2JT4 A; 4RTW A; 2O9S A; 2LP5 A; 3ULR B; 3NPF A; 2AZV A; 2K2M A; 1X27 A; 3VS5 A; 2DF6 A; 4KRT A; 2AZS A; 2E5K A; 2FG0 A; 4ESR A; 3PE0 A; 3LH5 A; 1E7O A; 5I22 A; 2DL7 A; 3SHW A; 1GCP A; 1ZUU A; 2P4R A; 2EGC A; 1X2K A; 1GL5 A; 3U23 A; 2DNU A; 2ECZ A; 2KXD A; 4OMQ A; 2MCN A; 1XOV A; 3M0U A; 3VS7 A; 1AWJ A; 1UG1 A; 4RTX A; 2EYX A; 1RI9 A; 1M3B A; 2CT3 A; 1MUZ A; 1WXT A; 2L0A A; 2DA9 A; 4Y92 A; 2H8H A; 2KRS A; 3I9Q A; 2CSI A; 2YUQ A; 1WI7 A; 1QKX A; 1HSQ A; 2GQI A; 3VRY A; 1AVZ C; 2LZ6 B; 1AD5 A; 4WCI A; 1NLP C; 2DL3 A; 1IO6 A; 4JZ4 A; 1WA7 A; 4AFU C; 3TVT A; 2EBP A; 4E6R A; 3EHR A; 2KGT A; 1U3O A; 2DL8 A; 1B3Q A; 2EYY A; 3REB B; 2JM9 A; 2D8J A; 4JZ3 A; 4RTU A; 1NEB A; 2MOX A; 3THK A; 2FRY A; 1UJ0 A; 2KEA A; 2I0N A; 2DJQ A; 1QLY A; 1T3L A; 2O88 A; 1UTI A; 4EIK A; 1NM7 A; 1K0S A; 1E6G A; 4M4Z A; 1WX6 A; 2KRM A; 2J6O A; 5FWB A; 1YP5 A; 2W0Z A; 1H92 A; 1PKT A; 2GTJ A; 2LJ1 A; 5FWC A; 1E6H A; 1U06 A; 2HDA A; 1WYX A; 1ZSG A; 1WLP B; 1LCK A; 2B86 A; 4F14 A; 3CQT A; 2EVR A; 2HBW A; 5IXB A; 2RPN A; 4DEY A; 1YWO A; 2W10 A; 4J9F A; 1CKB A; 2DBK A; 1QWE A; 1X6B A; 3ZL7 C; 2ED0 A; 1UDL A; 2DL5 A; 2FEI A; 2LCS A; 1GRI A; 4J9E A; 2QDL A; 1Z9Z A; 1M3A A; 1I0C A; 2YUO A; 1HD3 A; 1UFF A; 4RUG A; 1U5S A; 1Y57 A; 2J6K A; 2EGA A; 1PHT A; 3VS0 A; 2LNH B; 1FMK A; 2L3P A; 2OAW A; 3I5S A; 2L3S A; 1RLP C; 2NWM A; 2RMO A; 1ZUK A; 1BB9 A; 4J9B A; 5GJV B; 1SPK A; 1SRM A; 3H0H A; 2FPE A; 3UF4 A; 1OV3 A; 1BBZ A; 2RQU A; 1ZX6 A; 1UGV A; 4F17 A; 2CT4 A; 1NYF A; 2YUP A; 1YNZ A; 4LNP A; 2DIL A; 2O31 A; 2O2O A; 2BZX A; 2DMO A; 2VVK A; 1JO8 A; 1SEM A; 1UEC A; 1X6G A; 1T0J A; 4HVU A; 2EQI A; 1PNJ A; 1Y0M A; 1K9A A; 2GNC A; 3EG0 A; 1I07 A; 4AFQ C; 2JXB A; 2FPF A; 1SRL A; 1K1Z A; 5FW9 A; 2JS0 A; 2MIO A; 4RTV A; 1JXM A; 3A98 A; 4D8D A; 2K9G A; 1NG2 A; 2YDL A; 2X3X D; 3EGU A; 2KYM A; 2BZ8 A; 4RTZ A; 2IIM A; 2LX7 A; 2RQW A; 3GBQ A; 1AZG B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KQS A; 4Z88 A; 4F16 A; 4RG8 A; 4X9D A; 2CUD A; 4M78 B; 1AOJ A; 4M7D B; 1X2Q A; 1G3T A; 5D6W A; 3O5Z A; 3SEM A; 3UA7 A; 5A0D A; 1GFC A; 2LCC A; 5GMK e; 2B8A A; 3FJP A; 4ZNX A; 4C0G A; 3G4S T; 3QG1 A; 4LUE A; 5HY6 A; 2XHC A; 3E2U A; 4C5H A; 1VYU A; 1UE9 A; 2NUT B; 2BZY A; 1WQ7 A; 1K8A R; 2DYI A; 3VS3 A; 5HKC A; 2XKO C; 2R58 A; 3RNJ A; 3QYG B; 2C0O A; 2JVV A; 2COY A; 4C8Q B; 3IQL A; 2EQK A; 3JCM e; 1I81 A; 3J80 E; 2CZ1 B; 3JCM d; 1X01 A; 4Z8A A; 1MMD A; 2CS7 A; 2ESW A; 2F2X A; 1VYT A; 1CKA A; 3N5B B; 2CP5 A; 1J3T A; 1PM3 A; 2KT1 A; 3OQ5 A; 2QXF A; 1Q7Y C; 1K0X A; 3EGX B; 1TH7 A; 1YCY A; 3M56 A; 2KYB A; 1IZ6 A; 2E1H A; 1H3H A; 3G1J A; 3CPF A; 2E10 A; 2ZPE B; 1V1C A; 4JS4 A; 4AFZ C; 4OMO A; 5D6X A; 1UB4 A; 1EFN A; 2CGH A; 1O75 A; 2OTJ T; 2D0N A; 2JM8 A; 4R56 A; 2M9U A; 1PSF A; 2K3B A; 5LJ3 e; 2PUO B; 1WXU A; 2ATC B; 2AHJ B; 3R6O A; 1FXX A; 4GLM A; 1AWW A; 4QT7 A; 3VUZ A; 1QQJ A; 1VYV A; 5LJ3 d; 4XTV A; 4AG2 C; 3CCU Q; 2KT8 A; 1UUE A; 3CXC S; 1TG0 A; 3I35 A; 1OUL A; 1WHG A; 4FYW B; 1Y7X A; 2DVJ A; 2L5Q A; 5FU6 C; 5KYX B; 5GAM d; 3G4S Q; 1VA7 A; 1N8R C; 2EPD A; 4PLI A; 2OTL A; 2JMC A; 5ECA A; 1PG5 B; 3OMG A; 3G71 A; 4C0D B; 3RUX A; 2MPX C; 1UGS B; 2YSQ A; 3OYC A; 4HXJ A; 1N9S A; 1YCS B; 2FZC B; 3S3M A; 3VYH B; 4CC4 B; 4M78 A; 1NPP A; 4M7D A; 4OVA A; 2VYT A; 2RJE A; 3VRZ A; 1X69 A; 1CSK A; 2XU8 A; 3H8Z A; 1K73 C; 3HFN A; 3OYN A; 3M53 A; 4UC4 A; 2QA4 A; 2E3H A; 3JCM Q; 5AT1 B; 5M9O A; 2NUT A; 1M8M A; 3LGL A; 2HEQ A; 1FMW A; 1IRE B; 4ME7 A; 5IHK A; 4JJD A; 2CP2 A; 2M02 A; 3EFO A; 3CXC P; 4C8Q A; 4CC7 A; 4OP0 A; 4OML A; 3CCS T; 2Z0W A; 1SHF A; 5HCK A; 1VQ9 T; 2PUK B; 5IHI A; 5IN1 A; 1OZ2 A; 1SHG A; 3SD4 A; 2LT1 A; 1GXI E; 1M30 A; 2GTO A; 1A0N B; 2LNV A; 1BIA A; 5AYF A; 1W1F A; 5C0M A; 3EGX A; 3SDZ A; 1TSF A; 2EFI A; 2QTX A; 4HKE A; 2K5F A; 4M77 B; 2XI9 A; 4ZN1 A; 1BK2 A; 3QZ5 B; 2VKN A; 1W6X A; 2ZPB B; 1KFZ A; 2EKH A; 4IUQ A; 4EMG A; 2EJF A; 2KY9 A; 4PJL A; 2CZ7 B; 4J9I A; 2CKK A; 1M3C A; 4PJO G; 2VGM A; 2RK1 A; 2PTK A; 1Y71 A; 1ABQ A; 4B9X A; 2PNI A; 4M7A A; 1W2B S; 5LJ5 g; 1YJ9 Q; 4JRI A; 4BI8 B; 5J26 A; 3E9G A; 1H64 1; 3M0S A; 4BY6 B; 5GAN h; 5A2Q E; 3LYI A; 2MF2 A; 2BKD N; 1JQQ A; 3V7R A; 3CCR Q; 2FYK A; 1K9M U; 2C0T A; 2RF0 A; 2GGR A; 3EHQ A; 4J9D A; 4FU6 A; 2HL5 C; 2AT1 B; 4OMP A; 3M4Y A; 5KYX A; 1XTD A; 1YIJ T; 2RHU A; 3JCM c; 3CMA T; 3CCU A; 3V8J A; 3M0Q A; 2O9S A; 2CZ6 B; 3E9F A; 2LP5 A; 1M8V A; 1ZSZ B; 2GQV A; 4FW1 A; 2LDM A; 1RAH B; 3OW2 S; 2JJ9 A; 2K2M A; 3VS5 A; 4IUR A; 2DF6 A; 3BW1 A; 2AZS A; 2P0Q A; 3LH5 A; 3CCS Q; 3G4S A; 4C5E A; 1RAD B; 2E6Z A; 5FU7 B; 1W2B P; 1GCP A; 4A53 A; 4C92 D; 1X2K A; 2DFU A; 2FZK B; 3KBG A; 3M0U A; 3VS7 A; 1EIF A; 2FHD A; 3NTK A; 2EYX A; 1RI9 A; 1M3B A; 2CT3 A; 1K9M R; 4E7H A; 1IGQ A; 4Y92 A; 3QHS A; 1YHQ T; 5GAN 2; 4MZM A; 3VV0 A; 1QKX A; 4DQ2 A; 2JZ2 A; 4A4E A; 4LDU A; 3NTH A; 1VOM A; 3FC3 A; 4IKF A; 4WCI A; 1VQO A; 1G3W A; 2DL3 A; 3UWN A; 1WJQ A; 5KYY B; 1ZQ1 A; 1IO6 A; 1EZZ B; 1IRX A; 4NS5 A; 3TVT A; 2V8I A; 2QYZ A; 2EBP A; 4E6R A; 1XNI A; 4M77 A; 2WSF E; 4M75 D; 1U3O A; 2ZZD A; 1MHN A; 4EMK C; 4JRP A; 4M7A E; 2D8J A; 2MOX A; 1Q7Y U; 3MKD A; 3THK A; 2KEA A; 4DA4 A; 3UT1 A; 4FL6 A; 4FT2 A; 3LLR A; 3E19 A; 3SB2 A; 1RI0 A; 2EQJ A; 3MP1 A; 2K5L A; 3OSS C; 1VQN T; 2DPP B; 2KRM A; 5DLO A; 1H92 A; 2LJ1 A; 5FWC A; 1VQ5 T; 1YIJ Q; 1U06 A; 5GMK j; 3CMA Q; 3AT1 B; 2COW A; 6AT1 B; 4M7A F; 3O8V A; 3C12 A; 3CC4 A; 2DTH A; 3HRT A; 2GFU A; 2B86 A; 2IG0 A; 1YJ9 A; 3CQT A; 2EVR A; 2HBW A; 4M75 C; 4DEY A; 3TRE A; 3MHX A; 2KK4 A; 4M7D G; 3MEA A; 1BI1 A; 3CCR A; 4KGV B; 1RAB B; 3CCV T; 1ZSZ A; 4QVD A; 5C6S A; 1XQH A; 3X25 B; 3VS0 A; 3A8L B; 1Q7Y R; 4XU3 A; 2K5I A; 4ZGE B; 3DB4 A; 2L3S A; 2NWM A; 4C5G A; 3M58 A; 2QEX T; 1BB9 A; 3CPW A; 3X28 B; 1YHQ Q; 1SRM A; 4RKU E; 3H0H A; 1ACM B; 1VQL T; 2X4W A; 4XTY A; 2ZPG B; 1K73 U; 1UGV A; 2YWW A; 1N27 A; 1OU8 A; 1OX9 A; 4LNP A; 2JNG A; 2QQR A; 2O31 A; 2BZX A; 4KUL A; 3CCS A; 2M0O A; 5GMK i; 4DBH A; 2DET A; 5LJ3 j; 1WNL A; 2JOY A; 4PJO B; 3A8H B; 1HK9 A; 5KYY A; 2YXY A; 2MWO A; 5CK9 A; 1VQN Q; 2MIO A; 4RTV A; 1OQK A; 1PC0 A; 4BDY A; 1NG2 A; 1VUB A; 3NFC A; 2KYM A; 5GAM j; 2IIM A; 1VQ5 Q; 5DLQ E; 2RQW A; 2JUF A; 3GBQ A; 1AZG B; 3EH2 A; 3FB9 A; 2M16 A; 4QKU A; 3HL8 A; 4VUB A; 1RUW A; 1WHL A; 1WHH A; 2QAS A; 2LJ3 A; 4IIO A; 2EJG A; 3L2W A; 1K73 R; 1IGU A; 2MK5 A; 3RBB B; 3OYG A; 2DK3 A; 2F5T X; 3BY7 A; 4HVW A; 3CCV Q; 3PIO A; 2HCK A; 1WIE A; 3M4G A; 4XTU A; 2YRV A; 1SSF A; 3TSZ A; 3QWY A; 4A63 B; 4X1V A; 4CC3 A; 2QEX Q; 1G5V A; 1I5O B; 1YIJ A; 5CO7 A; 4AG1 C; 2KI7 A; 1VQL Q; 3A5Z B; 3NGP A; 4DBF A; 3CD6 Q; 1G8X A; 1QVG A; 1R77 A; 4OB1 B; 4ELY C; 1IB8 A; 3CCJ A; 3QYH B; 2DXC A; 1RAI B; 2F2W A; 1KJW A; 2LMJ A; 1NJI C; 1RAE B; 4JJC A; 1PRL C; 3WXM B; 1YJW T; 1NEG A; 4HCK A; 2CP7 A; 3JAM E; 2V8J A; 2MAM A; 2E6N A; 3CC7 A; 3CC2 A; 3M0R A; 2A36 A; 2RI2 A; 3A8G B; 3ME9 A; 2XG8 D; 3V8L A; 3EG1 A; 1TS9 A; 2ROL A; 3M0T A; 1H3Z A; 1YHQ A; 2XIC A; 2CDT A; 1QP2 A; 1M2V B; 4PJO A; 2YLB A; 3RKW A; 7AT1 B; 3JB9 G; 2FRW A; 1VQP T; 1UHC A; 2EYW A; 3H6Z A; 3HSB A; 3V7C A; 1AWO A; 1M9S A; 5GAO r; 3QWX X; 4OMF B; 3MO8 A; 2K2V A; 4C0Z A; 3MCA B; 3QJY A; 4OGE A; 3VS4 A; 1GBQ A; 3H9N A; 4EMH A; 3BDU A; 2K7A A; 4R0K A; 3I55 T; 2LQN A; 4OB0 B; 1VQN A; 2LTO A; 3EG3 A; 5IH2 A; 1B07 A; 1MMA A; 1VQ5 A; 4TVR A; 3H41 A; 3HPW A; 3QII A; 4FYV B; 3VUB A; 5GAN 6; 5GAN f; 1KHC A; 3I56 T; 3CBO A; 2HD0 A; 1QCN A; 1IHW A; 3LGF A; 3NHN A; 1KQS S; 4L5G A; 1TWB A; 1OX8 A; 2DRK A; 4ANJ A; 2C06 A; 2A3L A; 3MP6 A; 3D7S B; 2V1Q A; 3EGD B; 2VXF A; 1YJW Q; 1SSH A; 2DLP A; 4LN2 A; 4J7F A; 3CCV A; 3BE3 A; 3FDR A; 1VQ8 T; 2DD4 A; 2FL7 A; 5CKH A; 3UAT A; 4KUD K; 4M78 C; 2LC4 A; 3A1P A; 3M59 A; 3VU3 C; 2QEX A; 2XDD A; 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