The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1N8R R; 1M90 R; 1M1K R; 1Q81 R; 3CMA Q; 3CD6 Q; 1VQ4 Q; 3I55 Q; 2QEX Q; 3OW2 P; 3CC7 Q; 1VQN Q; 3CCE Q; 1Q86 R; 3I56 Q; 1VQ8 Q; 3CC4 Q; 3CCJ Q; 1S72 Q; 1YIJ Q; 2OTL Q; 1W2B P; 1K8A R; 1YJW Q; 1KD1 R; 3CPW P; 1KQS P; 3CME Q; 3CCV Q; 1VQL Q; 1JJ2 P; 1VQK Q; 1VQP Q; 1QVF P; 3CCM Q; 1VQ5 Q; 3CCR Q; 1YJN Q; 1QVG P; 1YIT Q; 1K9M R; 3CC2 Q; 3G6E Q; 3CCQ Q; 3G71 Q; 1VQO Q; 1Q82 R; 2OTJ Q; 1VQM Q; 1K73 R; 1VQ7 Q; 1KC8 R; 3CCL Q; 1YI2 Q; 1YJ9 Q; 3G4S Q; 3CCU Q; 1Q7Y R; 3CXC P; 1YHQ Q; 1NJI R; 1VQ6 Q; 3CCS Q; 1VQ9 Q; 2QA4 Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DE0 X; 5LJ3 e; 4Y91 A; 4JJN K; 2JZ2 A; 3RIR A; 1YI2 T; 1JJ2 S; 2FRY A; 1PKS A; 4M7A F; 1M1K C; 1YJN Q; 2XKO C; 2RJF A; 2HAX A; 1VIE A; 4Q5W A; 1R0B G; 3MEV A; 2DL7 A; 3CME T; 5LJ3 g; 1M30 A; 1M8V A; 3F70 A; 4OMQ A; 2WAC A; 5CO7 A; 3MEA A; 1G3T A; 2RHI A; 1B34 A; 2EQU A; 3EHR A; 3EH1 A; 4C8Q A; 2H3J A; 4L59 A; 1X01 A; 4OML A; 5D6X A; 1YHQ T; 3TCJ A; 4BI8 B; 1DJ7 B; 3QXE B; 2MMP A; 2XI9 A; 1NPR A; 3UAT A; 1U1T A; 1NPP A; 1OEB A; 4ZTF A; 1VQN T; 3S3M A; 1YJW T; 1UUE A; 3BFM A; 1YN8 A; 1NM7 A; 3M59 A; 2O01 E; 2O2O A; 2BKD N; 3JCM X; 2LDM A; 4AFZ C; 1BIA A; 3EFR A; 2JTM A; 2OX7 A; 3JB9 G; 4XTW A; 3VS5 A; 3LX7 A; 4FL6 A; 4OMM A; 3X24 B; 2I0N A; 3IQL A; 5IT9 E; 1BYM A; 1VQM A; 5KYW B; 1K73 R; 3CBP A; 3CEY A; 3NMZ C; 1V29 B; 2EYQ A; 1TG0 A; 2QQ9 A; 3HFN A; 4IUT A; 1WIE A; 3CMA Q; 5LJ5 f; 1V76 A; 4AMC A; 2RK2 A; 2ZPB B; 3CCQ T; 3L2Z A; 3J80 E; 3CBM A; 2QTV A; 3CCJ A; 3UPU A; 2K3Y A; 1RI0 A; 3L42 A; 3HFO A; 1LJO A; 4FSX A; 4F7U A; 2KYB A; 2FYK A; 2C0T A; 2EQJ A; 8ATC B; 2CZ7 B; 5IAY A; 4OB0 B; 2NUT B; 2E70 A; 4A54 A; 2DM1 A; 4FM4 B; 1T3L A; 2MWO A; 2QA4 A; 3NGP A; 4FW2 A; 3GOX A; 4YTL A; 2YRV A; 1KC8 C; 2GFU A; 2VXF A; 1K1Z A; 1UTI A; 1V1C A; 3SB2 A; 1D3B A; 1I0C A; 4XTV A; 1YJN A; 4PJO G; 3M0S A; 4NOY A; 2OI3 A; 4ZNX A; 2JS0 A; 1I07 A; 4QW2 A; 2GTJ A; 1W2B A; 1TXQ A; 2RQV A; 2ATC B; 2DYB A; 4C0Z A; 1GCQ C; 1X6O A; 2BE7 D; 2YWW A; 3NTI A; 1QMC A; 3CC7 Q; 2DZC A; 2CZ6 B; 2LP5 A; 3FLG A; 4M75 A; 3L2U A; 1VQ4 T; 3J81 E; 2LCS A; 5CR2 A; 4C5I A; 4Z8A A; 1S72 T; 2GQV A; 4QQ6 A; 2HQE A; 2MWP A; 1KJW A; 4A4E A; 1AWJ A; 1N8R R; 2EFI A; 7AT1 B; 1YIT T; 2WSE E; 2ZAE A; 1JU5 C; 3RKY A; 2DET A; 2K3B A; 5LJ3 f; 4MDX A; 3ER0 A; 2K79 A; 3QWX X; 4JDS A; 4OF1 A; 1K9M R; 2CYZ B; 1I5O B; 1WHH A; 3OBY A; 4C8Q C; 4DEY A; 5GAM e; 4FW1 A; 5I22 A; 1LOJ A; 2BZX A; 4LD6 A; 1I4K 1; 5KYN A; 2E4H A; 3VS1 A; 2RHY A; 2JTF A; 4UC4 A; 3CCS T; 5LL6 S; 3OYI A; 1RI9 A; 3QDF A; 1AHJ B; 4EMG A; 2QI2 A; 3HRU A; 5GAM g; 2F5T X; 3JCM J; 2XMF A; 4PLI A; 2P4R A; 3OY9 A; 2V8J A; 2DNU A; 1G3Y A; 3QYH B; 2XU8 A; 2VV5 A; 1VQ8 Q; 3CC4 A; 5KYX A; 1X69 A; 4EMK C; 1WDX A; 3OYG A; 4E7I A; 2D6F A; 3G6E Q; 3PMT A; 1EFN A; 4PLL A; 1OU8 A; 2DK3 A; 4J9I A; 2JXB A; 4E7K A; 2EYY A; 3RUX A; 4J7I A; 1YJ9 Q; 3OS5 A; 4BY6 B; 3JCM d; 1XNI A; 1OPL A; 3QJY A; 5ECA A; 1VQ7 T; 2EJG A; 3ASK A; 2ZPH B; 1IZ6 A; 3KBG A; 2DEU A; 3QG1 A; 4Y28 E; 1AWX A; 3SD4 A; 1VQK Q; 3JCM P; 5KYW A; 4CI0 C; 1VQO A; 3VUB A; 1F1B B; 4J9C A; 5GAO r; 1EIF A; 4AG1 C; 3GLX A; 1PD1 A; 2E3H A; 2QEX Q; 3LWH A; 4OB1 B; 3AHU A; 4IUR A; 3MHX A; 3RER A; 1WLP B; 3SWN C; 2KRS A; 4JZ4 A; 3AT1 B; 2D0N A; 3OW2 A; 4XTY A; 4RKU E; 1PRM C; 2AZS A; 1MND A; 5GAN e; 1Q7Y R; 4ZN1 A; 1R0C B; 1E6G A; 2M16 A; 3P8D A; 2J6O A; 4Z89 A; 3DLL A; 2I2L A; 4MML A; 1M1K U; 2KAF A; 1WQW A; 1XTD A; 3PE0 A; 2W10 A; 1D1C A; 5HK3 A; 2JJ9 A; 2LMJ A; 1Q82 R; 4JJD A; 3LWI A; 5FRN A; 2DTO A; 4M77 D; 2VVK A; 1LCK A; 3X25 B; 1TH7 A; 2F2W A; 3M0T A; 2W0Z A; 4BE1 A; 1WXU A; 1K0S A; 3MP1 A; 2XDD A; 1VQ8 A; 1FWZ A; 2K6D A; 3OYA A; 1WGS A; 1QKW A; 2EYX A; 2K5L A; 3H8Z A; 4PFP A; 1D0Z A; 2K9G A; 3OYN A; 3CME Q; 3CCV A; 1VQ5 T; 2NUP B; 3G6E A; 5FU6 B; 2DRK A; 4E2F B; 3EFO A; 1VIF A; 1YHQ Q; 2R57 A; 5HKC A; 2PQW A; 4KH1 B; 2KT1 A; 5GAM f; 1AZE A; 1VQN Q; 1JBM A; 2FZG B; 3GNG A; 4R0K A; 2DER A; 4F14 A; 3CC2 A; 2XDB A; 4M7D D; 1AT1 B; 4PJO A; 1ACM B; 3G1J A; 1E6H A; 3EG9 A; 1ABQ A; 2FZC B; 2KBT A; 2MAM A; 3I35 A; 1PWT A; 1JEG A; 1NLP C; 1K73 C; 2QEX A; 4OVA A; 5CKH A; 2LX9 A; 1QCO A; 4ELZ C; 2GCX A; 4PFZ A; 3OYJ A; 1SKU B; 2R5M A; 1YWP A; 1TUD A; 1XJW B; 1NE8 A; 1SEM A; 5CCA A; 2EAY A; 4M77 B; 1WZO A; 1MNE A; 3CCQ Q; 2OTJ A; 1W70 A; 1MMD A; 4QQG A; 3X26 B; 3D7S B; 1MMG A; 3H0H A; 1VOM A; 3CPF A; 3QZ9 B; 2CT4 A; 3JV3 A; 3RR6 A; 5I21 A; 3A8M B; 2CDT A; 4EPC A; 4N0A A; 1JB0 E; 2CRE A; 4MZP A; 1Q81 C; 5J26 A; 4M77 E; 4M78 D; 1YIJ T; 3V8K A; 3SHW A; 1ARK A; 1GBQ A; 1HJD A; 5LJ5 d; 1M1G A; 1RAH B; 2A28 A; 4C0D B; 4M7A D; 1K8A R; 4J8O A; 2A7Y A; 4LDV A; 4M7D B; 3G7Z A; 5GJV B; 1VQP T; 3FRN A; 1D09 B; 1WJR A; 2K5I A; 2JNG A; 2RA2 A; 2CH4 A; 1G3W A; 1D0X A; 3WXM B; 1VQL T; 2LCL A; 1WHG A; 5GAN f; 1KFZ A; 1VQ4 Q; 1OX9 A; 1VQN A; 3I5R A; 2GBQ A; 3VS3 A; 1OI1 A; 4L5G A; 4OGC A; 2EKO A; 1M90 U; 1NJI C; 4M7D E; 1PSF A; 1N8R C; 2YSQ A; 5DY9 A; 1BI1 A; 1RL2 A; 1RAA B; 1YIT Q; 2O88 A; 2V26 A; 2PNI A; 4A63 B; 2NLU A; 2CGH A; 2KI7 A; 1K9M C; 2QAZ A; 1TS9 A; 2YXY A; 3Q1J A; 4OGE A; 2DD5 A; 1TUC A; 2HDA A; 2L3P A; 4BUG A; 5CVI A; 1H64 1; 1SHG A; 4M78 B; 2CP7 A; 1R8O B; 2KQW A; 3I55 T; 2LVM A; 4DBF A; 2DJQ A; 4RTX A; 1Y0M A; 2B86 A; 2ED0 A; 2COZ A; 3THK A; 4X34 A; 4D8K A; 1I1J A; 1WXB A; 1IO6 A; 3JCM W; 2QQA A; 4M7A B; 3A8O B; 1UE9 A; 4RTY A; 4JZ3 A; 5CKB A; 2YRD A; 1QVF S; 1H8K A; 2GGR A; 1W2B P; 1Q95 G; 2MOX A; 3PT9 A; 4M78 E; 4C5E A; 4GBQ A; 1KHI A; 5LJ3 d; 1IRX A; 4DBH A; 2RQU A; 1M1F A; 1BK2 A; 1ZUY A; 5FU7 B; 4A4K A; 3S3N A; 1IB8 A; 1M9S A; 4EDU A; 3V7S A; 3JCM V; 3VS2 A; 4M7A E; 4IIM A; 3E1S A; 1JXM A; 3G71 T; 4LDX A; 2FL7 A; 4ANJ A; 5GMK j; 4JRQ A; 1C1A A; 4BI3 A; 4B9W A; 1GCQ A; 3OS0 A; 4R55 A; 4P5N A; 1P92 A; 3U23 A; 3FEO A; 4J9G A; 1VQ7 Q; 3CCE T; 4AT1 B; 4M78 F; 3CPW A; 3OSV A; 4NS5 A; 4N0A C; 1QVF A; 1NZ9 A; 3CCM T; 2DBM A; 1VQ4 A; 5GAO l; 3LGF A; 2COY A; 1CKB A; 2L8D A; 1KHC A; 5GMK l; 3CXC A; 4C92 D; 2JM9 A; 3PMI A; 3ZFJ A; 4M77 A; 4X1V A; 1YIT A; 4BY6 C; 3I5S A; 3VYG A; 1VUB A; 4QKU A; 5KCH A; 5GJW B; 5L8R E; 4DQ2 A; 2QQB A; 2KY9 A; 1OU9 A; 5GAN 6; 5IHI A; 1O75 A; 2RHX A; 1QCF A; 3REA B; 1Q7Y C; 5GMK h; 2LNV A; 4JRP A; 2JTE A; 1ZLM A; 2X35 A; 4ZGE B; 3I56 T; 3VKI A; 4FT4 A; 4IUQ A; 2O9S A; 2HKN A; 2JT4 A; 2K3X A; 4CC4 B; 2EQM A; 2X4X A; 1Q82 C; 2E65 A; 1MGQ A; 3M0Q A; 2VWF A; 1PHT A; 4J9B A; 2RH2 A; 4M7D A; 2DXC A; 1AOJ A; 3G4S T; 4RTT A; 1BU1 A; 2ENM A; 2RQR A; 4E7J A; 3ZBD A; 2J05 A; 2VXE A; 2FHD A; 4FU6 A; 3JCM h; 4ATO A; 1H92 A; 2M51 A; 2QDY B; 4XK8 E; 4EMK A; 3QYG B; 3M54 A; 1VQ5 Q; 2RJE A; 5J3B A; 3TEE A; 1MMN A; 3PNW C; 1IRE B; 2DL5 A; 4C92 B; 1W2B S; 3WVD B; 3CCL T; 2HMA A; 5IH2 A; 3CCU T; 3OYC A; 2RN8 A; 3JB9 J; 5KYY A; 2X9H A; 1VQ9 T; 2ABL A; 1Q86 U; 4BDY A; 1R77 A; 5GAO n; 1ZUU A; 2DRM A; 1HXD A; 1N6A A; 3VRY A; 5C6S A; 5CKD A; 1OZ2 A; 3H0I A; 2HL3 A; 4EIK A; 3HL8 A; 4FCY A; 2CS7 A; 2XHC A; 3HRT A; 4GY5 A; 4C92 E; 1UJY A; 2VAS A; 3GIB A; 5FU6 C; 3OW2 P; 3E2U A; 1VA7 A; 1M2O A; 3X28 B; 1JO8 A; 2DXU A; 2HNI A; 1YWO A; 1MUZ A; 1YNZ A; 1WHJ A; 4XU0 A; 1FMK A; 4L6V 5; 1T3S A; 4OMO A; 2C06 A; 3NHN A; 3LH0 A; 3SWN A; 4C0G A; 2CZ0 B; 4LUD A; 2C0I A; 3PVL A; 1KK7 A; 2AKL A; 3ZL7 C; 3OYL A; 4C5G A; 2JMC A; 1ZSG A; 5FW9 A; 5GAM d; 1LNX A; 4DEX A; 3EGD B; 1Q81 U; 5IXB A; 2ZCF B; 5M9O A; 1MMA A; 4C92 F; 2DIL A; 3FJP A; 2AZV A; 2KT8 A; 5IHN A; 4J5Y A; 3OYE A; 2PUO B; 2RM4 A; 4ZGD B; 1K76 A; 3FC3 A; 3UA7 A; 4HA8 A; 4M77 C; 2OJ2 A; 2DVE A; 4FIB A; 3BY7 A; 1YIJ Q; 3VU3 C; 1VQ6 T; 1HSQ A; 2E6Z A; 1X43 A; 8AT1 B; 3RDV A; 1M2V B; 1U5S A; 2MI6 A; 4BI4 A; 4HCZ A; 2XDP A; 1K8A C; 4NL2 A; 2KRM A; 5D6W A; 3EG3 A; 2LZ6 B; 1Y57 A; 2YUO A; 3GBQ A; 3OYB A; 2EGA A; 2F69 A; 1SHF A; 3CMA A; 1U06 A; 1NJI U; 4BD3 A; 1FMV A; 3C12 A; 1U3O A; 5I2S A; 2X4W A; 1ZBX A; 1X27 A; 4RCC A; 5FWB A; 2P0K A; 3REB B; 1OPK A; 4CRI A; 2ZZD A; 2KVQ G; 1UFF A; 1UB4 A; 4C0D C; 2YDL A; 1N9R A; 1ZSZ B; 2L3S A; 4M7D C; 3CQT A; 1IHV A; 1M3B A; 3JCM b; 3BDL A; 2DXT A; 2LCC A; 4EMH A; 4QVD A; 4A53 A; 2COW A; 5HY6 A; 4FYW B; 3FDR A; 2E41 A; 2LQW A; 1RAI B; 2RD1 A; 4O6J A; 4N4I A; 1WJQ A; 4KUD K; 2HBP A; 1QCN A; 4LUE A; 4DBR A; 1Z9Q A; 4ESR A; 3OW2 S; 2YUP A; 1TU0 B; 4TVR A; 3TRE A; 3I55 Q; 1VQM T; 1Z9Z A; 2YUQ A; 2A0F B; 5GAN d; 3CC7 A; 3P8B B; 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1Q82 U; 5FRO A; 1KQS A; 2BZY A; 3JCM Q; 5IN1 A; 3I55 A; 2XK0 A; 1QP2 A; 2DO3 A; 3I56 Q; 1YJW Q; 3DB4 A; 4JRI A; 3MKD A; 2CP2 A; 1M2V A; 1VQK A; 3ULR B; 4C8Q D; 3PFS A; 5AYF A; 2M1H A; 3G4S Q; 4QVC A; 1YBY A; 3NTH A; 4PFO A; 4M7D G; 1X6B A; 5KYU B; 2K2V A; 1N9S A; 1H3Z A; 1ZA2 B; 1GXI E; 1UGQ B; 4FYX B; 3CPW P; 2RK1 A; 1QVF P; 2PTK A; 2MYS A; 3G71 A; 2DPP B; 1YCY A; 3CCL Q; 2ZGW A; 2Z0W A; 3CC4 T; 4OB2 B; 4E7Z A; 3CCU Q; 1JQQ A; 1PKT A; 3CXC P; 5CKE A; 2JMA A; 2FPF A; 1VQ9 Q; 5GAN 4; 1KC8 U; 2YUN A; 1JXO A; 1GRI A; 1NYF A; 1QVP A; 4N4G A; 1ZQ1 A; 3EH2 A; 3PVQ A; 2DAQ A; 2P0P A; 4C0F A; 2E10 A; 2ED1 A; 1AD5 A; 3KFV A; 4C92 C; 3EAE A; 2L2P A; 1YI2 A; 5DLQ E; 3E9G A; 1AZG B; 3QJ6 A; 3OSS C; 3UT1 A; 3I9Q A; 3RKW A; 2AIR B; 2HQH A; 1Y71 A; 5L23 A; 3VS6 A; 4RCB A; 5A0L A; 1BCO A; 2KRN A; 1WI7 A; 2AT1 B; 3EGX B; 1VQO T; 4M78 G; 1G5V A; 2LNH B; 2RHU A; 1B34 B; 2MPX C; 5IXF A; 1W1F A; 3JB9 I; 1W6X A; 1NEB A; 1PC0 A; 2EQI A; 3CME A; 3O5Z A; 3BE3 A; 2FPE A; 1PNJ A; 1NYG A; 2EIF A; 4AFU C; 2DBK A; 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