1G83A

Crystal structure of fyn sh3-sh2
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSERAAGLSSRLVVP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords PROTO-ONCOGENE TYROSINE-PROTEIN KINASE FYN
publication title The role of the Src homology 3-Src homology 2 interface in the regulation of Src kinases.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 161
sequence length 161
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2000-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1g83A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1g83A02
1W1FA 4F5AA 2KT8A 1O4PA 4HVWA 4FBNA 1O4AA 4OMQA 2DYBA 2AZVA 1O4FA 1BLJA 1Y1UA 2MOXA 2PNIA 1QKWA 4AFUC 2A08A 1FBZA 1AWOA 3VRPA 1GHUA 1UUEA 2YUOA 5DF6A 4ESRA 1VA7A 4F14A 1LKLA 1QWFA 1GCQA 4AFQC 1PWTA 3IQLA 2AOAA 2C0IA 1SEMA 3THKA 1E7OA 2L3QA 1YCSB 1R1QA 1A1AA 1R1PA 1I1JA 1XOVA 1PRLC 1YVLA 3GXWA 1H8KA 1HCSB 3EG2A 3QWYA 1BF5A 2DCRA 4ZNXA 2GSBA 2OJ2A 1SHAA 1JYQA 3H41A 4J9IA 2NUZA 4Z8AA 1OO3A 1QG1E 1XA6A 1NYGA 1JEGA 1BKMA 1RPYA 3EHRA 1UURA 1U3OA 2YSXA 4NWGA 2K7AB 1O4EA 1E6HA 2DLPA 2RQTA 1AD5A 1CWDL 1MV3A 2V1QA 1KIKA 4HXJA 4A4CA 3VS6A 2DBKA 2DLZA 2F2WA 3H0HA 1NEBA 3HIZB 1UTIA 2M0YA 5GJHA 1M3CA 1RLPC 2FPDA 1BK2A 1RLQC 1UDLA 2RN8A 2D0NA 3VS4A 1MW4A 3BUOB 3EACA 1BLKA 4JJBA 2LJ3A 1YWOA 3FJ5A 1NYFA 4DEYA 4NWFA 3REAB 2HMHA 3S8LA 1PNJA 1H3HA 4K44A 2DRKA 2FRWA 4D8DA 2KRSA 2W10A 1ZUYA 2JW4A 4OHIA 3NMZC 1BHFA 5CDWA 4Y92A 1A0NB 2CIAA 2K79A 2CI8A 1IO6A 4Z88A 1M30A 2RQWA 2O88A 1SPRA 3EG3A 5EHPA 1NG2A 2MK2A 1I0CA 2YUNA 1ZX6A 2DM0A 1WA7A 1RQQC 1V1CA 1OOTA 3VS2A 4J9BA 1GCPA 1T0HA 1FBVA 3S9KA 1X6BA 2AKKA 2PZ1A 1SHDA 2EQIA 3VRZA 3VROA 5IH2A 2IUGA 2IUIA 1AYBA 2J06A 4RTZA 2RSYA 2SEMA 3U23A 1UG1A 1HJDA 2EYXA 2HUWA 1CKBA 2FG0A 4E6RA 2LNWA 3C7IA 1OPKA 2DL3A 2GE9A 1R1SA 2PLDA 1JWOA 5FW9A 1WLPB 4M4ZA 1PICA 5HKYA 3HCKA 1KA6A 4EIHA 2KR3A 4CC2A 2JYQA 5IBMA 2KEAA 2L3SA 3UYOA 2ESWA 2GGRA 1OV3A 2DX1A 3K2MA 2RMXA 4DGXA 1LCJA 1BB9A 2L3PA 2F2VA 5EHRA 4F16A 1X43A 4OMLA 1GL5A 3I9QA 3UATA 4RUGA 2L0AA 3UF4A 3C0CA 2YUQA 4JE4A 2V1RA 1D1ZA 4JZ3A 3ZNIA 2J6KA 2ECDA 3H0FA 1X2KA 1M27C 2BZXA 1OEBA 2A36A 4IIOA 1OO4A 2MRJA 1AWWA 2KXCA 2AZSA 3KFVA 1WXTA 2CT4A 2K79B 2FPFA 2CR4A 1O4KA 3VS5A 3RNJA 1AZEA 3IMDA 1BG1A 1K9AA 1LUMA 1VYVA 4J9DA 4QSYA 1UFFA 2HDAA 2EGCA 4JJDA 4RTUA 1JU5A 2FPEA 2KXDA 1K4US 3PJPA 2EO3A 2RMOA 1LUKA 2EGAA 1AYCA 1JYRA 4CC7A 3BUXB 2O9SA 3PVQA 1O42A 4RTXA 2F2XA 5I11A 1AZGB 2O9VA 2OZOA 2EO6A 1CSKA 3T04A 2EU0A 1E6GA 1N5ZA 2EOBA 1W70A 4ORZA 3VS3A 1AOTF 1F2FA 3KFJA 3BUNB 4X6SA 4GWFA 1W6XA 1K0XA 1FYNA 1A09A 2PLEA 3ZL7C 5GJIA 4Z89A 2KYBA 1ZUUA 3PLFB 1PHTA 2Y3AB 3PVLA 1O45A 4EIKA 2Y1MA 3IMJA 1SPKA 5EELA 4FSSA 4LNPA 3S8OA 1D4WA 2ED0A 2G6FX 2RVFA 1BHHA 4QT7A 2OAWA 4GBQA 4P9ZA 1D4TA 1A81A 1CWEA 2LCTA 5HKWA 2EL8A 4HCKA 1Y0MA 1PKSA 2EYYA 4U1PA 2CSIA 4L1BB 1IS0A 4F59A 3EAZA 1MUZA 1WI7A 2FEIA 3M0PA 2K6DA 1YNZA 1UUSA 3MXCA 2L4KA 2MIOA 1JYUA 1X6GA 2CH4A 1O4JA 1WXUA 2SHPA 4RTVA 2HDVA 1ARKA 4XZ0A 3TL0A 2GQIA 1GBRA 2DL8A 2MRKA 4K45A 1PRMC 1FMKA 5DC9A 1WIEA 3VS7A 3EG0A 1SRLA 1BFJA 1M61A 2K9GA 1JU5C 1O48A 1YP5A 3H0IA 3O5ZA 1CKAA 2LJ0A 4OHDA 3PE0A 3VS0A 1F1WA 2PTKA 2CH4W 1O44A 4J9CA 5BO4A 2LQNA 4H34A 1T0JA 1YVHA 2VWFA 2JTEA 1GBQA 4D8KA 4LE9A 2HCKA 3VRNA 2OI3A 2HBWA 2AUGA 1JXMA 2B3OA 1GCQC 3VGOA 2RQVA 4OHEA 1WFWA 2W0ZA 1T3LA 1HSQA 2CBLA 1RJAA 2CS0A 1BKLA 1NRVA 2EKHA 2IUHA 3WA4A 2JMAA 1Z3KA 2VIFA 1UHFA 4OMMA 1O47A 2JM9A 1QKXA 3BUWB 1BHHB 4AFZC 5D0JA 4DEXA 5IHKA 3ULRB 3N7YA 1EFNA 1AVZC 1UJ0A 2A37A 1NM7A 2K2MA 4RTTA 2CREA 1QWEA 1X69A 3M0RA 4JZ4A 2FO0A 1ZFPE 2JXBA 2RF0A 1O4LA 4ROJA 1ZUKA 2ABLA 4OMOA 1SSHA 3VRYA 3TSWA 2KE9A 1O4GA 1O4IA 3NHNA 1ZBJA 1P13A 2EYVA 1HD3A 3OP0A 1A1BA 2H5KA 4JEGA 4IIMA 2DM1A 2EYZA 3EHQA 5AULA 2E5KA 1BBZA 2FRYA 4OMNA 1GFCA 1CSYA 3N84A 4F17A 2D8HA 2KNOA 5FWBA 2EBPA 3HHMB 2K3BA 3OV1A 2LNHB 2KRMA 1SHFA 2EYWA 3MAZA 3BKBA 2DL5A 3QWXX 1WDXA 3LH5A 4RTYA 1SKJA 2D1XA 2RNAA 5AXIA 4F5BA 3TVTA 2CUBA 2YU7A 3IN7A 3PSKA 2LMJA 1K0SA 2GTJA 1LUNA 1WXBA 1LCKA 3IN8A 4FL2A 2J6FA 1G2BA 5GJWB 3SHWA 1UJYA 3OVEA 4AG2C 3SEMA 5J3XA 1SRMA 4K11A 1O4CA 4WCIA 2KRNA 1KA7A 2DE0X 1Z9QA 2DMOA 3CQTA 1QADA 1CJ1A 1OPLA 2DLYA 2HSPA 1O4RA 1O4QA 1GRIA 1ZLMA 5EC7A 1KC2A 1AWXA 1U5SA 4DGPA 1NLOC 4P9VA 1TUCA 2ROLA 1JXOA 3GQIB 4A63B 3PSJA 2DX0A 2KT1A 1B3QA 2DF6A 4AG1C 1TZEE 4JJCA 1Y57A 1X6CA 3A98A 3TSZA 2KGTA 3EG1A 2J7IA 2DVJA 4EY0A 3M0UA 2J6OA 5IXBA 3US4A 3CWGA 2LNXA 3NPFA 5DC0B 2QDLA 2JMCA 3I5RA 2CDTA 2H46E 2EPDA 1HCTB 4R0KA 2C0TA 1AOUF 1SHGA 5HKZA 5IBSA 3I5SA 2O31A 4JPBW 5GJVB 1I07A 2CUDA 1KSWA 4J9HA 3R6NA 1CSZA 1UE9A 2ETZA 2EW3A 2MQIA 1A07A 3OB1B 1O41A 3UA6A 2H8HA 4LUEA 2DNUA 1YN8A 3M0TA 1O43A 3REBB 2BZYA 4GPLB 2JS0A 5EEQA 4AFSC 4E68A 3I35A 2GTOA 1UGVA 1J3TA 2XP1A 2P4RA 2X3WD 2EKXA 3GXXA 2CI9A 4JGHA 3BUMB 1T3SA 5I22A 1JQQA 1O49A 2ECZA 2KNBB 1NLPC 2C9WA 1VYTA 2PNAA 3EGUA 3M7FA 2LP5A 2C0OA 2LX7A 1AEYA 3GBQA 4OHHA 4E93A 3PQZA 3UA7A 3M0SA 1A08A 1AOJA 2DL4A 2YT6A 2MC1A 1X0NA 2I0NA 1RUWA 1PKTA 2DILA 1GFDA 2LCSA 2LJ1A 2L2PA 4OMPA 1MILA 2AOBA 1G83A 2KK6A 1O4DA 3CXLA 1M3BA 5FWCA 3CD3A 4LUDA 2BBUA 2BZ8A 2BTTA 1I3ZA 2CRHA 1ABQA 1NEGA 1MV0B 4X1VA 1Z9ZA 1UECA 5DC4A 2IZVA 1O4BA 4FL3A 4KRTA 1IJRA 1FU6A 1M27A 2PNBA 2HDXA 1RI9A 4RTWA 1SPSA 4LN2A 1BM2A 2VKNA 1AB2A 2OQ1A 2M51A 1FYRA 2KROA 1KFZA 3CBLA 2RPNA 2RQUA 5ECAA 2EGEA 1TCEA 1AWJA 2ENMA 2X3XD 3PFVA 4OHLA 1YWPA 1X27A 1S1NA 3M0QA 4HVUA 1BMBA 1O4OA 2NWMA 3TKZA 3S8NA 2RQRA 2LZ6B 2L3TA 1ABOA 2HEQA 4XZ1A 1ZSGA 2MCNA 2SRCA 2IIMA 1UHCA 4WWQA 2GNCA 4TZIA 5L23A 3N8MA 1BU1A 2ROTA 4K2RA 1WX6A 1A1CA 1FHSA 1TG0A 1U06A 3RBBB 2JM8A 2KYMA 1M3AA 2YSQA 5IXFA 1O46A 1B07A 1SHBA 4GLMA 5I6VA 2JT4A 1LUIA 2D8JA 4A4BA 2FCIA 2YUPA 2AKLA 1K76A 4H1OA 1TUDA 1QCFA 5IHNA 3MXYA 2AK5A 5EG3B 2DL7A 2EVRA 1H9OA 4J9FA 1FU5A 3VRRA 2LQWA 2VVKA 1A1EA 1LKKA 3VRQA 5HCKA 1O4NA 1NZVA 1JO8A 1O4HA 2Y1NA 4HVVA 1WYXA 4U17A 1QLYA 1B47A 2RORA 2L6KA 2QMSA 3PS5A 1H92A 5KAZA 4GL9E 3OB2B 4J9GA 3NGPA 1M8MA 1VYUA 1AYDA 2CSQA 4J9EA 2ED1A 1WQUA 2KBTA 2DJQA 2DA9A 3JV3A 2K7AA 2A28A 1KJWA 2XMFA 2DBMA 4CC4B 2CT3A 2B86A 2J05A 1X2QA 1NZLA 3VS1A 4CC3A 2DRMA 2YDLA 2GBQA 1K1ZA 1O4MA 2JS2A 1BFIA 2O2OA 5IHIA 1AYAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FZKB 4F5AA 3G1JA 3S3OA 2E3HA 1O4AA 3QJYA 1KK7A 2DYBA 1JBMA 1O4FA 2E6NA 1Y71A 2NUPB 1FBZA 3VRPA 5FROA 2YUOA 3NTIA 2AT1B 1QCNA 3FC3A 1QWFA 3JB9I 3IQLA 4NS5A 1EX4A 3O8VA 1SEMA 2JJ9A 1Q82C 1W2BA 5GANe 1PRLC 3M5AA 1YVLA 2ZPIB 1HCSB 3QWYA 2MYSA 1TXQA 3CCST 4N0AC 2XKOC 4ZNXA 1H3ZA 1OO3A 1LJOA 1NYGA 3VUZA 5HK0A 4HT8A 1JEGA 3EHRA 4LDUA 1U3OA 2YSXA 2F1LA 2QASA 4M75D 1MV3A 3TREA 3VS6A 5GJHA 4M77C 5KCHA 3FB9A 2RN8A 4Q5WA 3OYCA 4JJBA 2LJ3A 1YWOA 1OZ2A 4DEYA 3GLXA 3FDRA 2HMHA 2VC8A 3RUXA 2JW4A 3CCJA 1KQ1A 1A0NB 1M1KC 2XDBA 2RQWA 1NG2A 1RABB 2EIFA 2MK2A 1RQQC 4KBMB 1V1CA 3OYIA 4J9BA 4FCYA 1GCPA 5LJ3j 4BDZA 1Q7YC 2H3EB 3S9KA 2AKKA 4PKCC 2ZPEB 3U23A 5A0LA 2K3XA 3C7IA 4BY6C 2QA4T 3V8JA 1NPPA 4EIHA 2KR3A 5CIUA 2KEAA 3UYOA 1YIJA 1OV3A 1HXDA 2X4XA 2LRQA 3K2MA 4F7UB 5EHRA 3MP1A 5LJ5j 2VGNA 4OMLA 3VKIA 3AHUA 3UATA 2L0AA 3C0CA 1PG5B 1H641 4JE4A 2V1RA 3ZNIA 2J6KA 2BZXA 2DXTA 2YLCA 2KXCA 2CT4A 4ELYC 2FPFA 1O4KA 1AZEA 4P5NA 4EMKA 4OB0B 4M75C 1VYVA 1MMDA 2X51A 1UFFA 4QSYA 1JU5A 2FPEA 3OYGA 1K4US 1EIFA 2EGAA 3EG9A 1AYCA 4CC7A 3PVQA 2MWOA 4FYXB 2HKQB 1AZGB 4LXCA 2OZOA 2EO6A 3M58A 3CC2T 3T04A 3INZA 1E6GA 1N5ZA 1K73C 3P8BB 1FYNA 1M90R 3VUBA 5GJIA 4F04B 3CEYA 4KGVB 3JB9J 1ZUUA 2RI2A 4M7DB 3PLFB 1PHTA 2Y3AB 3OYEA 1O45A 4ANJA 3M59A 5GAMj 2RK2A 3IMJA 1Y96A 4O5VA 4QQGA 2ZPFB 3CCSQ 4LDWA 3M54A 1VQ7T 2RVFA 4IUPA 3JB9G 4BE2A 4N4HA 3CC7A 1CWEA 3OYBA 1Y0MA 2LTOA 2F5KA 4ZTFA 4HA8A 2QI2A 3QXEB 2QDYB 1IS0A 2RM4A 1BI1A 1UUSA 1YNZA 2LDMA 2X4WA 5KYUB 2X9HA 2DKGA 4EMKB 1PD0A 2EQKA 1O4JA 2O4XA 4E7JA 3EG9B 7AT1B 5DC9A 2JTFA 2CP6A 1BI2A 4OGCA 2K9GA 2Z0WA 1TWBA 4OHDA 3LWIA 4M7AF 3QSUA 1O44A 4J9CA 3EFRA 5LJ3e 5J3BA 2VWFA 2JTEA 1I4K1 4M7DD 4E2FB 1BCOA 2HCKA 2OI3A 2GCXA 2G3RA 2PVDB 3R6OA 3JCMV 5GMKi 1W4SA 1Y96B 3VGOA 1T3LA 2EKHA 2VIFA 1Z3KA 3CMAT 3NTHA 4OMMA 4PJNA 1GXIE 1UJ0A 1NM7A 2K2MA 2ZPHB 2CREA 4RTTA 1X69A 2P4TA 4JZ4A 4PNOA 2A0FB 5LJ5h 2RF0A 4ROJA 3VRYA 4FYYB 4R55A 4DOVA 1O4GA 1O4IA 3OS2A 1P13A 3QG1A 4PJOF 4JEGA 4IIMA 2EYZA 3EHQA 4C5GA 1MNEA 4LDYA 2E5KA 3N84A 4F17A 2D8HA 3FRNA 1VIEA 2JUFA 5FU6B 3A8MB 4E7HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1W1F A;  4F5A A;  2KT8 A;  1O4P A;  4HVW A;  4FBN A;  1O4A A;  4OMQ A;  2DYB A;  2AZV A;  1O4F A;  1BLJ A;  1Y1U A;  2MOX A;  2PNI A;  1QKW A;  4AFU C;  2A08 A;  1FBZ A;  1AWO A;  3VRP A;  1GHU A;  1UUE A;  2YUO A;  5DF6 A;  4ESR A;  1VA7 A;  4F14 A;  1LKL A;  1QWF A;  1GCQ A;  4AFQ C;  1PWT A;  3IQL A;  2AOA A;  2C0I A;  1SEM A;  3THK A;  1E7O A;  2L3Q A;  1YCS B;  1R1Q A;  1A1A A;  1R1P A;  1I1J A;  1XOV A;  1PRL C;  1YVL A;  3GXW A;  1H8K A;  1HCS B;  3EG2 A;  3QWY A;  1BF5 A;  2DCR A;  4ZNX A;  2GSB A;  2OJ2 A;  1SHA A;  1JYQ A;  3H41 A;  4J9I A;  2NUZ A;  4Z8A A;  1OO3 A;  1QG1 E;  1XA6 A;  1NYG A;  1JEG A;  1BKM A;  1RPY A;  3EHR A;  1UUR A;  1U3O A;  2YSX A;  4NWG A;  2K7A B;  1O4E A;  1E6H A;  2DLP A;  2RQT A;  1AD5 A;  1CWD L;  1MV3 A;  2V1Q A;  1KIK A;  4HXJ A;  4A4C A;  3VS6 A;  2DBK A;  2DLZ A;  2F2W A;  3H0H A;  1NEB A;  3HIZ B;  1UTI A;  2M0Y A;  5GJH A;  1M3C A;  1RLP C;  2FPD A;  1BK2 A;  1RLQ C;  1UDL A;  2RN8 A;  2D0N A;  3VS4 A;  1MW4 A;  3BUO B;  3EAC A;  1BLK A;  4JJB A; 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