The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
TFVALYDYESRTETDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGQTGYIPSNYVAPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| molecule keywords |
SRC TYROSINE KINASE SH3 DOMAIN
|
| publication title |
1H and 15N assignments and secondary structure of the Src SH3 domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
4
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1994-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2W0Z A; 4OMQ A; 2JW4 A; 4GLM A; 4LN2 A; 4E6R A; 1ZSG A; 1KFZ A; 1PRL C; 4RUG A; 4JJC A; 1NYF A; 2YUQ A; 1RLQ C; 1OPK A; 1UE9 A; 2HSP A; 4ORZ A; 1AZE A; 2XMF A; 4Y92 A; 3TSW A; 2LJ0 A; 2SEM A; 2K6D A; 3M0R A; 4JZ4 A; 1UJ0 A; 4RTU A; 1U3O A; 1QWE A; 5HCK A; 1U06 A; 5FWB A; 2RPN A; 1X27 A; 3VS5 A; 2C0T A; 4J9F A; 2A08 A; 3IQL A; 4FSS A; 1AD5 A; 1WI7 A; 1TUD A; 2H8H A; 2YUO A; 4CC3 A; 4CC7 A; 2KNB B; 3QWX X; 2FPF A; 2LZ6 B; 1M30 A; 3I9Q A; 3VS6 A; 4DEX A; 2FRY A; 1SRL A; 3H41 A; 1GRI A; 2EYW A; 2IIM A; 1Z9Q A; 2LJ3 A; 1CSK A; 2FPD A; 1OV3 A; 2KBT A; 4EIK A; 4K11 A; 1UEC A; 1VYU A; 3I5R A; 1OEB A; 2HBW A; 1T3S A; 2V1Q A; 2DRM A; 2G6F X; 3EG1 A; 1UFF A; 1UJY A; 3ULR B; 1AWO A; 4OMP A; 4M4Z A; 1GCQ A; 2X3X D; 1VYT A; 5I11 A; 2J6F A; 1B3Q A; 1X43 A; 2LJ1 A; 4F17 A; 1N5Z A; 1AWX A; 1NEB A; 1MUZ A; 2P4R A; 2GQI A; 2DL4 A; 3NMZ C; 4OMO A; 2O2O A; 1KJW A; 2K79 A; 1SHF A; 3UA7 A; 3TSZ A; 2DMO A; 2EGA A; 2EBP A; 3C0C A; 1G83 A; 4AG2 C; 1I07 A; 2ABL A; 2K7A A; 1JU5 C; 3UA6 A; 1H8K A; 1ARK A; 1XOV A; 1X69 A; 1Z9Z A; 4J9G A; 3GBQ A; 3UF4 A; 1JQQ A; 1UTI A; 2ED1 A; 4OML A; 3REA B; 1NYG A; 1QCF A; 2PTK A; 2JM8 A; 1ZX6 A; 2BZ8 A; 2F2X A; 4HVV A; 1BB9 A; 1W1F A; 1X2K A; 1SRM A; 3PVQ A; 1SHG A; 5IHK A; 1EFN A; 1QLY A; 4HVW A; 2JXB A; 4RTX A; 2D8H A; 1BBZ A; 2CH4 W; 1RLP C; 2RQV A; 1WXB A; 4IIM A; 2DE0 X; 2L3P A; 2DYB A; 3REB B; 2CH4 A; 4D8D A; 1QKX A; 1SSH A; 3PVL A; 2YUP A; 2DX1 A; 3NGP A; 4D8K A; 2DBK A; 4AFZ C; 2DL8 A; 3RBB B; 1BK2 A; 4R0K A; 4JJD A; 2DJQ A; 2PNI A; 2JMA A; 4J9D A; 1T0H A; 2DF6 A; 1K76 A; 3EG0 A; 3M0Q A; 1QWF A; 1AVZ C; 2MIO A; 2DBM A; 2MOX A; 2DA9 A; 1GCP A; 1ZUY A; 1X2Q A; 2BTT A; 1IO6 A; 2AKK A; 2KXD A; 1NG2 A; 2J7I A; 2ED0 A; 2DM1 A; 2L0A A; 3VS1 A; 4Z89 A; 1YNZ A; 2L3S A; 1X6B A; 2FRW A; 1I0C A; 1M3C A; 1H92 A; 1OOT A; 2KRO A; 1WX6 A; 2VKN A; 2VVK A; 5FW9 A; 4RTY A; 4LUE A; 1PNJ A; 3JV3 A; 4HVU A; 1X6G A; 1KSW A; 1WXU A; 3EG3 A; 2K9G A; 2AZS A; 4RTZ A; 4KRT A; 4J9B A; 1T0J A; 2ROL A; 1YWO A; 1HD3 A; 2ROT A; 2M0Y A; 1RI9 A; 2VWF A; 1ABO A; 1K9A A; 2YUN A; 2CRE A; 3M0S A; 2CT3 A; 2JT4 A; 2LQN A; 2D1X A; 2O9V A; 1J3T A; 1JO8 A; 2EQI A; 3EHQ A; 2CUD A; 1UG1 A; 2EW3 A; 2RMO A; 2CSI A; 3CQT A; 3I35 A; 4RTW A; 2J06 A; 2O9S A; 4AFQ C; 1I1J A; 3VS7 A; 2O31 A; 1ZUU A; 2EPD A; 1AZG B; 2GTJ A; 2LQW A; 2OI3 A; 2RQR A; 3THK A; 1UHF A; 1M27 C; 2CSQ A; 2KE9 A; 1UHC A; 3H0I A; 3TVT A; 2LCS A; 1H3H A; 2LNH B; 3VS0 A; 3VRZ A; 1NM7 A; 4Z8A A; 1TG0 A; 2KYM A; 4J9H A; 1G2B A; 2KT8 A; 1JEG A; 2SRC A; 2QDL A; 1GBQ A; 1K0X A; 1K1Z A; 2DIL A; 1JXM A; 4WCI A; 3VS3 A; 4DEY A; 1MV0 B; 2OAW A; 1TUC A; 5IH2 A; 1HSQ A; 2KT1 A; 2RN8 A; 1WXT A; 4A63 B; 5IXF A; 2ECZ A; 1YWP A; 3M0P A; 1HJD A; 2JM9 A; 1WA7 A; 2OJ2 A; 2X3W D; 1A0N B; 2PZ1 A; 1GFC A; 4F14 A; 3VRY A; 3LH5 A; 5FWC A; 1M3A A; 2F2W A; 3PE0 A; 2RF0 A; 2J05 A; 3KFV A; 2JMC A; 2KXC A; 1UGV A; 2DLP A; 2L2P A; 4IIO A; 1YCS B; 1PKS A; 4Z88 A; 2BZX A; 4RTV A; 1PKT A; 1ZUK A; 2A36 A; 4ESR A; 1GBR A; 2RQU A; 2A28 A; 4ZNX A; 5ECA A; 2LX7 A; 2M51 A; 2C0I A; 2CDT A; 2LMJ A; 1E6H A; 5IHN A; 1K0S A; 2GGR A; 2E5K A; 2RQT A; 2BZY A; 2AZV A; 2HCK A; 1CKA A; 2YSQ A; 3EGU A; 3U23 A; 3R6N A; 2B86 A; 1LCK A; 2CT4 A; 2MCN A; 2EKH A; 1UUE A; 2LP5 A; 4AFU C; 2I0N A; 2JS2 A; 1ABQ A; 1WFW A; 2KRN A; 1PRM C; 5IHI A; 1T3L A; 1AEY A; 2FPE A; 3O5Z A; 2DL5 A; 1NLP C; 1V1C A; 2RNA A; 4J9E A; 5EC7 A; 3FJ5 A; 2JTE A; 1W6X A; 2EYX A; 2CUB A; 2AKL A; 2DRK A; 2DL7 A; 3VS4 A; 2FO0 A; 1WDX A; 3SEM A; 3I5S A; 1WLP B; 2GTO A; 4OMM A; 5I22 A; 2FEI A; 5GJW B; 2DVJ A; 1M8M A; 2KR3 A; 3A98 A; 3ZL7 C; 1ZLM A; 1KIK A; 4CC2 A; 1GL5 A; 3EHR A; 4F16 A; 2W10 A; 1UDL A; 1AWW A; 5L23 A; 2NUZ A; 1RUW A; 1OPL A; 1AOJ A; 1MV3 A; 2EYZ A; 2D8J A; 2DNU A; 2NWM A; 2EYY A; 3QWY A; 1VA7 A; 2D0N A; 1W70 A; 2C0O A; 2GNC A; 3M0T A; 4LNP A; 1Y0M A; 2KEA A; 2L3Q A; 4AG1 C; 2ESW A; 1SEM A; 2J6O A; 1K4U S; 1PWT A; 2ENM A; 4RTT A; 3RNJ A; 2HDA A; 3NHN A; 4X1V A; 3H0H A; 2HEQ A; 3H0F A; 5IXB A; 5GJV B; 2KGT A; 2A37 A; 2KRM A; 2EVR A; 3EG2 A; 2J6K A; 2JS0 A; 3NPF A; 1VYV A; 1E6G A; 1E7O A; 4QT7 A; 4J9C A; 1PHT A; 4GBQ A; 1GCQ C; 2AK5 A; 2FG0 A; 1FMK A; 2V1R A; 1NLO C; 1BU1 A; 4LE9 A; 3VS2 A; 1YP5 A; 3UAT A; 1ZBJ A; 4HCK A; 4J9I A; 1S1N A; 3SHW A; 1Y57 A; 4JZ3 A; 1SPK A; 4LUD A; 2RQW A; 1M3B A; 1B07 A; 2GBQ A; 4JJB A; 2YDL A; 3M0U A; 2O88 A; 1FYN A; 4JPB W; 1QKW A; 2EGC A; 1AWJ A; 2YT6 A; 2KYB A; 1U5S A; 1WIE A; 2EGE A; 4HXJ A; 2K3B A; 1GFD A; 1WYX A; 4CC4 B; 2KRS A; 1JXO A; 2DL3 A; 4OMN A; 2K2M A; 1NEG A; 1CKB A; 4AFS C; 1YN8 A; 2F2V A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4OMQ A; 2JW4 A; 1JRI A; 1KFZ A; 1PRL C; 3JCM f; 2IPO B; 1S72 T; 1QVG S; 2OTL A; 4ORZ A; 3RIR A; 1G3T A; 2QQS A; 1ZA2 B; 3PNW C; 5HK3 A; 3R6O A; 4J6X A; 2X4X A; 3EAE A; 4F7U G; 3JSC A; 3HRS A; 3OY9 A; 3VS5 A; 2YRD A; 2A08 A; 2E1H A; 3CCU Q; 3CCE A; 2KNB B; 2MYS A; 1IRE B; 5CKF A; 2E6N A; 5GAN j; 3VS6 A; 4DEX A; 2VYT A; 3H41 A; 2LJ3 A; 5FRN A; 3LYI A; 4M7A A; 3ER0 A; 2DO3 A; 4EIK A; 1UEC A; 1RAC B; 3OYB A; 2HBW A; 1T3S A; 2DRM A; 3CC2 A; 2HAX A; 4OMP A; 2RB6 A; 1PD1 A; 4QW2 A; 1VQM A; 3OYL A; 2BKD N; 3RKY A; 1GCQ A; 2D9T A; 3JCM d; 1JJ2 P; 2J6F A; 4M75 G; 1NJI R; 2PUO B; 4QVC A; 4QVD A; 4MDW A; 1VQK T; 3LX7 A; 2R58 A; 1VQL T; 2EQU A; 1XQH A; 1WJQ A; 2M16 A; 2PVO B; 3V8J A; 4OGC A; 1KJW A; 1VIE A; 2DVE A; 2CP6 A; 2EJ9 A; 3UA7 A; 5CCA A; 3VYG A; 3L2Q A; 2QEX A; 2EWN A; 1VQN A; 1TTH B; 1I07 A; 2E64 A; 4RMO A; 3SD4 A; 2M1H A; 3GBQ A; 3JB9 H; 2ED1 A; 4OML A; 2E41 A; 3JB9 D; 4JRQ A; 3LGF A; 2BZ8 A; 2F2X A; 5KYW A; 2P0Q A; 1X2K A; 1YJN T; 5J39 A; 4BDZ A; 4XK8 E; 1RAA B; 4ZGJ B; 2QQ9 A; 3I56 A; 1QLY A; 2BIV A; 3M56 A; 3CCQ A; 4AT1 B; 4M78 E; 3OYC A; 3P8D A; 2K2V A; 1VOM A; 4IUP A; 4C0D C; 1K8A C; 3OA6 A; 3PVL A; 3QKJ A; 4YTL A; 2DBK A; 4FYY B; 2D0Q B; 4F7U A; 4J6W A; 1ACM B; 3RBB B; 3EG9 A; 1BK2 A; 2DJQ A; 1VQ5 Q; 2XI9 A; 2HNI A; 4XQ3 A; 5KYX A; 3EG0 A; 2ZAE A; 1VQ7 Q; 1OX8 A; 2FVU A; 2MIO A; 1N9R A; 1KC8 U; 4C92 B; 2DA9 A; 2XD0 A; 2F69 A; 3LH0 A; 4QQD A; 1IRX A; 2ED0 A; 5A0G A; 5GAM j; 1SSF A; 2XIC A; 3GOX A; 3FLG A; 2FRW A; 1N9S A; 1TOV A; 4R55 A; 4PJO C; 1Y7X A; 1OOT A; 2GF7 A; 2VKN A; 4JRI A; 3URG A; 3CPW S; 1PNJ A; 2WSF E; 1M1K R; 1KSW A; 2KDS A; 3I55 T; 2EQM A; 3JB9 F; 3PMI A; 1YIJ T; 4RTZ A; 1YIT T; 1T0J A; 3CBP A; 2ROT A; 2VWF A; 1M2V B; 4JRK A; 3MEA A; 2YUN A; 2CRE A; 2VC8 A; 2JT4 A; 2LQN A; 1IHW A; 2D1X A; 1J3T A; 1JO8 A; 5GMK i; 3P8B B; 1TWB A; 3E9G A; 2CSI A; 3CC7 T; 2L3R A; 3VS7 A; 3GNG A; 2O31 A; 1ZUU A; 2EPD A; 1AZG B; 2GTJ A; 2LQW A; 2JTM A; 5CKB A; 1K9M U; 1RAG B; 4M78 G; 1SG5 A; 3M53 A; 4Z8A A; 1TG0 A; 9ATC B; 2E10 A; 2QDL A; 1VQK Q; 2X4J A; 1PG5 B; 2LVM A; 1VQL Q; 2ZPB B; 3SB2 A; 2NLU A; 4WCI A; 1MV0 B; 3JCM h; 4A4E A; 2HMA A; 2KT1 A; 4MZM A; 1KHC A; 4A63 B; 5IXF A; 4OMF B; 5GAN 5; 3M0P A; 2CZ0 B; 6AT1 B; 1ZA1 B; 2NUT B; 1WA7 A; 2X3W D; 1A0N B; 2VB6 A; 3CMA A; 5FWC A; 2RH2 A; 2EYQ A; 4JUV A; 2RF0 A; 4M7D D; 3G1J A; 1OI1 A; 2KXC A; 3BY7 A; 3C12 A; 3DB3 A; 1M2O A; 3JB9 I; 2KK4 A; 3CD6 T; 1YJN Q; 2A28 A; 1Q7Y U; 2G3R A; 3QZ9 B; 3CPF A; 1YJ9 A; 2M51 A; 3X20 B; 3CCJ A; 4HT9 A; 2C0I A; 4PLL A; 2QG9 B; 3CCV A; 2GCX A; 3LW5 E; 5L8R E; 1VQ6 Q; 2E5K A; 2RQT A; 4TVR A; 1NJI U; 2MI6 A; 2BZY A; 4C8Q D; 2HCK A; 3HP9 A; 4B6M A; 1CKA A; 1FMW A; 3EGU A; 3G6E T; 1KC8 C; 4A4H A; 1KD1 U; 3V7C A; 1O9S A; 2EKH A; 2JS2 A; 1ABQ A; 2KY9 A; 2KRN A; 3PIP A; 3LWH A; 4PJN A; 1U1S A; 8AT1 B; 3M57 A; 4HT8 A; 2JTE A; 4EMG A; 4M7D B; 1RAE B; 1ZHI A; 2AKL A; 2DL7 A; 2YXY A; 2FO0 A; 4IUR A; 2GTO A; 1KK7 A; 2VXE A; 1Q82 U; 3FIF A; 1GL5 A; 2PQW A; 1U8R A; 2IG0 A; 4M7D F; 2FL7 A; 1ZSZ B; 3RMS A; 4XTU A; 4ZGD B; 3M54 A; 2NUZ A; 3I55 Q; 3CXC A; 1HYO A; 2DPP B; 4HCZ A; 1YJW A; 1RUW A; 1Y07 A; 2BE9 B; 3L2R A; 1PC0 A; 1AOJ A; 1YIJ Q; 1MV3 A; 4J83 A; 2D8J A; 4ZTJ A; 2CZ1 B; 1W2B A; 1M90 U; 2K5I A; 1N8R C; 3SWN C; 2C0O A; 5C6S A; 3OYG A; 3JB9 J; 1BIB A; 2ESW A; 4PJJ A; 4C8Q F; 2ENM A; 4EDU A; 1RL2 A; 3RNJ A; 2A3L A; 3CC7 Q; 4QKU A; 3RUX A; 1M2V A; 1K9M C; 4X1V A; 3QZ5 B; 4KGZ B; 2E65 A; 2M9U A; 4C92 C; 4WF2 A; 1KQ1 A; 2RO0 A; 4QQ6 A; 3EG2 A; 2A37 A; 2JS0 A; 1E6G A; 1B34 B; 3V7S A; 1E7O A; 1N6A A; 4C0G A; 4QT7 A; 1PHT A; 4M77 E; 3EFS A; 3OSV A; 4X9C A; 4LE9 A; 2NUP B; 4J9I A; 1SF9 A; 3G71 T; 3HFN A; 1N27 A; 1M1K U; 5GAN 6; 1SPK A; 4LUD A; 2VGM A; 4DBQ A; 1B07 A; 1WHL A; 1KQS A; 2YT6 A; 2JZ2 A; 3KXT A; 1WIE A; 2L89 A; 4HXJ A; 3DLL A; 1UGS B; 4IUV A; 2LQK A; 4KT0 E; 5M9O A; 4VUB A; 2RHY A; 1Q7Y C; 2CZ6 B; 1VQP T; 2FZG B; 2NUT A; 2W0Z A; 4E6R A; 4BAC A; 3CD6 Q; 1YHQ T; 1RLQ C; 1UE9 A; 1AZE A; 1NJI C; 1WHM A; 2XMF A; 2DJZ A; 3CCQ T; 4LD9 K; 4RTU A; 1KD1 C; 1U3O A; 1QWE A; 3DLM A; 1QQJ A; 1U06 A; 3RER A; 3G6E Q; 5DM7 R; 2DYI A; 1V76 A; 3IQL A; 2KSS A; 4CC3 A; 5DLQ E; 3QWX X; 4OVA A; 4IUT A; 2LZ6 B; 5GAN f; 5KYU A; 1R8O B; 2KMT A; 2FRY A; 2QQR A; 3CCM A; 4BY6 B; 4BE0 A; 5GMK h; 1OV3 A; 1Q82 C; 1QVP A; 3SDZ A; 3OQ5 A; 2XK0 A; 3I5R A; 3CCL A; 4PJO E; 1UFF A; 2P84 A; 1WGS A; 2HL5 C; 4M4Z A; 4M7D A; 2JVV A; 1KC8 R; 2Y4Y A; 3SFM A; 1M90 C; 2K5L A; 5I11 A; 5AT1 B; 5KYW B; 1NEB A; 1LOJ A; 2ZZD A; 1BIA A; 1EX4 A; 2KI7 A; 1MUZ A; 1K73 U; 1JJ2 A; 2DL4 A; 5IAY A; 4GLK A; 1UEB A; 1M1F A; 4B9X A; 2K79 A; 1SHF A; 4L6V 5; 2OAU A; 4M75 D; 2DMO A; 3J81 E; 5I2S A; 3GP8 A; 4C8Q A; 3CCR Q; 2EBP A; 4KGX B; 4F7U B; 3OS0 A; 2K7A A; 3UA6 A; 1H8K A; 2I2L A; 2YWW A; 2Z0W A; 3OYN A; 3M9Q A; 1OX9 A; 1X69 A; 3G4S A; 4J9G A; 5GAN d; 1JQQ A; 3REA B; 1D0X A; 1QCF A; 5GAM g; 2DD5 A; 1ZX6 A; 2LRQ A; 4HVV A; 1XJW B; 3PVQ A; 5AYF A; 1VQO A; 2LQ8 A; 4FT4 A; 4ZN3 A; 2VXF A; 1EFN A; 4HVW A; 4PFO A; 2MPX C; 3EFR A; 1M1K C; 1D1C A; 1WXB A; 2DE0 X; 3REB B; 3G71 Q; 5KCO A; 1QKX A; 2QTV A; 2QXF A; 4XU3 A; 2DXU A; 5LJ5 g; 4FYX B; 1ZSZ C; 4JJD A; 3QG1 A; 2NUP A; 2VGN A; 3QJY A; 4FW1 A; 1K9M R; 1T0H A; 2DF6 A; 4C0Z A; 3M0Q A; 1QWF A; 4FCY A; 1AVZ C; 2MAM A; 1QVG P; 2MOX A; 5IT9 E; 1GCP A; 3PGG A; 1VQP Q; 4JLI A; 1ZUY A; 2DD4 A; 2FZC B; 3MET A; 5GAM f; 1YHQ Q; 1PSE A; 4M75 F; 4PJO G; 3BFM A; 4BI3 A; 5CKH A; 3CCJ T; 5FW9 A; 1WQ7 A; 4RTY A; 1YI2 A; 3JV3 A; 5LJ3 g; 1QMC A; 4HVU A; 1KHI A; 1X6G A; 1OQK A; 3QII A; 2RA2 A; 3GPL A; 1TXQ A; 3EG3 A; 2K9G A; 3QYH B; 2A7Y A; 3MHX A; 2K5F A; 3VU3 C; 1WJR A; 2ROL A; 5FU7 C; 3VUB A; 1Q7Y R; 1TUG B; 3CCS T; 2M0Y A; 1RI9 A; 1RAI B; 1RAB B; 3T9N A; 1K9A A; 2LT1 A; 3UT1 A; 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