The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
GAMGAKEYCRTLFPYTGTNEDELTFREGEIIHLISKETGEAGWWKGELNGKEGVFPDNFAVQIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
CD2-associated protein
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| publication title |
The high resolution NMR structure of the third SH3 domain of CD2AP.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
14
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-07-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3TVT A; 2LQW A; 4AFU C; 1MV3 A; 2YT6 A; 3I5R A; 1QCF A; 4RTZ A; 3U23 A; 2EGA A; 2HSP A; 2C0I A; 3JV3 A; 1NG2 A; 2FPD A; 2CT3 A; 3UA6 A; 1NYG A; 2JS0 A; 1UUE A; 1I07 A; 4OMM A; 1K76 A; 1QKW A; 1M8M A; 3EHR A; 1NYF A; 4RTW A; 4F14 A; 1ABQ A; 2CSQ A; 4OMN A; 3VS4 A; 1PWT A; 2H8H A; 4LNP A; 3NPF A; 3REB B; 4IIM A; 4EIK A; 3M0P A; 2EYY A; 2AK5 A; 3NGP A; 1WLP B; 2EYZ A; 4ESR A; 1JO8 A; 2EW3 A; 2RQW A; 2HBW A; 4JJC A; 1Y0M A; 4AG1 C; 3VS2 A; 2ECZ A; 1H8K A; 1AWX A; 3TSZ A; 1CSK A; 2GGR A; 4RTT A; 4AG2 C; 2JMA A; 2J7I A; 2FPF A; 1UHC A; 1A0N B; 4CC3 A; 1K1Z A; 2JM8 A; 2DA9 A; 1QWF A; 2DL8 A; 1VYV A; 4J9B A; 4CC4 B; 1FMK A; 1OPK A; 4J9D A; 1VYU A; 4GLM A; 1HJD A; 1GFC A; 4AFZ C; 2YUN A; 1NLP C; 1B07 A; 1S1N A; 4F16 A; 2DBK A; 2JW4 A; 2DLP A; 2RQV A; 3VS0 A; 1ZLM A; 2FG0 A; 3M0R A; 3UA7 A; 3M0S A; 2KBT A; 4J9F A; 5ECA A; 5FWB A; 1K0S A; 2KR3 A; 1NM7 A; 1V1C A; 2EKH A; 1M30 A; 3UAT A; 2KNB B; 1HSQ A; 2DL4 A; 1WXB A; 1PRM C; 1U3O A; 2JT4 A; 2GBQ A; 2ROT A; 1M3A A; 3EG3 A; 3GBQ A; 2CDT A; 1MV0 B; 1W6X A; 2G6F X; 3NMZ C; 1TG0 A; 2VVK A; 2RQU A; 4OML A; 2ED0 A; 5IHN A; 4OMQ A; 2J06 A; 4K11 A; 1UE9 A; 2D8H A; 3VRY A; 1RI9 A; 4J9G A; 2CRE A; 4RTX A; 2D0N A; 2EGE A; 2PTK A; 4GBQ A; 2NWM A; 1NEG A; 3C0C A; 1G83 A; 3ULR B; 1GL5 A; 4Z8A A; 4ZNX A; 2KRM A; 3M0T A; 1CKA A; 2E5K A; 1TUD A; 1LCK A; 4DEX A; 4FSS A; 4M4Z A; 2LJ1 A; 4LUE A; 4CC7 A; 2PNI A; 2EVR A; 4HVV A; 3RBB B; 1JQQ A; 1Z9Z A; 4RUG A; 4E6R A; 2K7A A; 2CH4 A; 4OMO A; 2V1Q A; 1W70 A; 1M3B A; 4IIO A; 2A28 A; 1AEY A; 3VS7 A; 4HVW A; 1TUC A; 1SEM A; 2FEI A; 1AZG B; 2BZY A; 2KRO A; 2SRC A; 1X2Q A; 2JM9 A; 2O9S A; 1QWE A; 1MUZ A; 1H92 A; 1SHG A; 1T3S A; 1NLO C; 2LNH B; 1OOT A; 2K3B A; 1GCQ A; 1U5S A; 1FYN A; 1JXO A; 4X1V A; 3QWY A; 1WA7 A; 1UGV A; 5IH2 A; 1YWO A; 1E6G A; 2V1R A; 2KGT A; 3I9Q A; 1WXU A; 1X43 A; 2O9V A; 3I35 A; 4Y92 A; 1OV3 A; 4Z88 A; 2LP5 A; 2O2O A; 2DBM A; 1SRL A; 4LE9 A; 2EGC A; 2OAW A; 4HCK A; 2M0Y A; 5IHI A; 3THK A; 2CSI A; 2F2X A; 4F17 A; 4AFS C; 3I5S A; 4RTV A; 1ZSG A; 1X69 A; 2AZS A; 1UJ0 A; 2J6O A; 5GJV B; 2DL3 A; 2LJ0 A; 1WDX A; 2KXD A; 4J9E A; 2YDL A; 1EFN A; 1W1F A; 3TSW A; 1E6H A; 1UDL A; 2D8J A; 4AFQ C; 3VRZ A; 3ZL7 C; 1YP5 A; 1RUW A; 2RPN A; 3EGU A; 4JZ3 A; 4RTU A; 1WXT A; 1AZE A; 1ZUU A; 3M0U A; 1PHT A; 1BU1 A; 1OEB A; 1YCS B; 3O5Z A; 4D8D A; 1X2K A; 3PVL A; 2YSQ A; 2BZX A; 2D1X A; 2VWF A; 1ZBJ A; 2C0O A; 1AWW A; 2GQI A; 2K6D A; 2EBP A; 4J9C A; 4KRT A; 2J6K A; 2J05 A; 2L3S A; 1OPL A; 1JXM A; 4JJB A; 5IHK A; 1UG1 A; 2DRK A; 1J3T A; 3H0H A; 2L2P A; 2L3Q A; 3UF4 A; 2NUZ A; 2HDA A; 3LH5 A; 2AKL A; 2HCK A; 1VYT A; 1GBR A; 2VKN A; 2O88 A; 2P4R A; 2GTO A; 1BK2 A; 2FRW A; 5HCK A; 1JU5 C; 2A36 A; 2IIM A; 2LJ3 A; 2X3X D; 2DJQ A; 1M3C A; 2SEM A; 2MIO A; 1T0J A; 1UJY A; 2FRY A; 1BB9 A; 1G2B A; 1CKB A; 1U06 A; 1QKX A; 3FJ5 A; 4Z89 A; 1YN8 A; 3H41 A; 1UEC A; 5EC7 A; 2EYW A; 3KFV A; 2M51 A; 2F2W A; 3RNJ A; 3NHN A; 1QLY A; 2DVJ A; 4HVU A; 1E7O A; 3EG2 A; 1ABO A; 2KXC A; 2PZ1 A; 2C0T A; 1KFZ A; 1SPK A; 2RN8 A; 2FO0 A; 1GCQ C; 1PRL C; 2MCN A; 1ZX6 A; 1K9A A; 1AWJ A; 1KIK A; 1M27 C; 1X6B A; 2AZV A; 1IO6 A; 1VA7 A; 3PVQ A; 2AKK A; 2K9G A; 2KE9 A; 4QT7 A; 1T3L A; 2W10 A; 2XMF A; 2I0N A; 1RLQ C; 2B86 A; 1WIE A; 1ARK A; 3M0Q A; 2DX1 A; 2KYM A; 2OJ2 A; 1I0C A; 2YUQ A; 2DIL A; 1ZUY A; 3SEM A; 4A63 B; 2LQN A; 1BBZ A; 5FWC A; 2MOX A; 2RMO A; 2LX7 A; 2J6F A; 1HD3 A; 1KJW A; 1H3H A; 2QDL A; 1WI7 A; 1UHF A; 2CUD A; 2LMJ A; 1N5Z A; 3H0F A; 4JPB W; 2KRN A; 1ZUK A; 4R0K A; 1KSW A; 1Y57 A; 2O31 A; 2DMO A; 4JZ4 A; 2LCS A; 5L23 A; 2KRS A; 2EQI A; 2OI3 A; 1SSH A; 2CT4 A; 2RNA A; 2K79 A; 4RTY A; 1GRI A; 2ESW A; 1K4U S; 3EG0 A; 4J9H A; 2A37 A; 4JJD A; 5IXF A; 3SHW A; 1AOJ A; 3VS1 A; 1AWO A; 2RF0 A; 1RLP C; 2RQT A; 4D8K A; 3R6N A; 1I1J A; 1Z9Q A; 2ED1 A; 1NEB A; 2DRM A; 2L0A A; 4ORZ A; 1K0X A; 1WFW A; 1X27 A; 2GTJ A; 2YUO A; 1XOV A; 2KT1 A; 2DL5 A; 2BTT A; 4LUD A; 2K2M A; 2BZ8 A; 4OMP A; 1WYX A; 2ABL A; 5I11 A; 2JS2 A; 2YUP A; 2DNU A; 2HEQ A; 1B3Q A; 3A98 A; 2JTE A; 2EPD A; 2CH4 W; 2GNC A; 3VS5 A; 3CQT A; 2FPE A; 3VS6 A; 1X6G A; 3H0I A; 2KYB A; 2JMC A; 4WCI A; 1SRM A; 1JEG A; 1SHF A; 2DM1 A; 1GCP A; 3IQL A; 5GJW B; 1AD5 A; 1T0H A; 3EG1 A; 5FW9 A; 2LZ6 B; 5I22 A; 3PE0 A; 4HXJ A; 5IXB A; 2DE0 X; 2A08 A; 1UTI A; 1YNZ A; 4DEY A; 2DF6 A; 2DL7 A; 2ENM A; 3EHQ A; 4CC2 A; 1PKS A; 2F2V A; 2KT8 A; 1GFD A; 3VS3 A; 1PNJ A; 1WX6 A; 2DYB A; 1YWP A; 2ROL A; 2W0Z A; 1UFF A; 1PKT A; 2X3W D; 2KEA A; 4LN2 A; 1GBQ A; 4J9I A; 2EYX A; 3QWX X; 2RQR A; 2CUB A; 2L3P A; 3REA B; 2JXB A; 1AVZ C; #chains in the Genus database with same CATH topology 4AFU C; 3JB9 G; 3L2U A; 4KUL A; 3SWN B; 2HSP A; 3MEW A; 2C0I A; 3JV3 A; 4QW2 A; 4UC4 A; 2FPD A; 1RAE B; 2PVG B; 1OX8 A; 1M1K U; 2FB7 A; 3OYA A; 5FRM A; 2OX7 A; 3EHR A; 1WJS A; 4A54 A; 5HY6 A; 2CSQ A; 4OMN A; 1QVG S; 3A8G B; 2DAQ A; 2FZK B; 4JRQ A; 2DIQ A; 5GAN e; 1ZSZ A; 1QVP A; 2VB6 A; 3REB B; 5KYW B; 1KQ1 A; 2HL5 C; 4FW1 A; 4RKU E; 2EYY A; 2AK5 A; 3NGP A; 3HPW A; 4RG8 A; 1TTH B; 2VC8 A; 3OMC A; 4C92 E; 2RQW A; 1YJ9 T; 2MYS A; 5A0L A; 2ECZ A; 3OYC A; 1AWX A; 1TXQ A; 5GAM g; 3TSZ A; 1VOM A; 4RTT A; 1JRI A; 3CD6 A; 3JCM c; 3I56 A; 2J7I A; 1VQ8 T; 1YJ9 Q; 2XG8 D; 2EQJ A; 3VUB A; 1QCN A; 4C92 C; 2YLB A; 1K1Z A; 1Y96 B; 2RHZ A; 1VQ8 Q; 5C6S A; 2JJ9 A; 1IZ6 A; 2KVQ G; 2HQX A; 4CC4 B; 1TSF A; 1FMK A; 1OPK A; 4MDX A; 2YRD A; 4J9D A; 3A8O B; 1U1T A; 1VYU A; 4GLM A; 1VQO Q; 1WQW A; 5KYY B; 3SWN A; 1VIF A; 1S1N A; 3PFS A; 3GNG A; 4NOY A; 4F16 A; 1WGS A; 2DLP A; 2RQV A; 5GAN f; 2WAC A; 2QDY B; 5GAM j; 2EQM A; 1K0S A; 4PKC C; 4QQD A; 1MND A; 3HFO A; 1BIB A; 2AT1 B; 1WXB A; 3GNF B; 2GBQ A; 1QVF P; 1X75 C; 5CKD A; 1RAG B; 3CCM A; 5KYW A; 1KD1 R; 4HCZ A; 3CCU A; 1MV0 B; 4LDU A; 3L1A A; 1M5Q 1; 2ZCF B; 1WNL A; 1TG0 A; 1Q81 R; 2KMT A; 3CC4 T; 2HSE B; 3EG9 B; 4OMQ A; 4XTW A; 3EFR A; 2D8H A; 4DBF A; 3CC4 Q; 2CRE A; 1PG5 B; 3CCS A; 2KQW A; 3ULR B; 3JCM J; 1GL5 A; 2ZZD A; 1CKA A; 3M0T A; 1TUD A; 3M55 A; 1LCK A; 1VQM T; 3S6W A; 2EVR A; 2CH4 A; 2V1Q A; 3MEV A; 3QKJ A; 1VQM Q; 3RUX A; 2EFI A; 3EH1 A; 5KYY A; 1BI3 A; 4FT2 A; 1X2Q A; 2JM9 A; 1SKU B; 1QWE A; 1D3B B; 4C5I A; 2WSC E; 4M77 E; 1GCQ A; 3E9G A; 2BIV A; 2MWP A; 1IRX A; 3L2Q A; 3WVE B; 1ZSZ C; 4FYX B; 1WA7 A; 5D6Y A; 4C0Z A; 4PJO E; 5KYU B; 3R6O A; 1E6G A; 4MZM A; 1RAC B; 1TU0 B; 3OBW A; 1U8R A; 2FZG B; 5CAI A; 4Y92 A; 1M1G A; 3D7S B; 3QXE B; 3CCE T; 2O2O A; 2RHY A; 3BFM A; 4PJO C; 1X6O A; 1K8A U; 2OAW A; 4PLI A; 3PMI A; 2COZ A; 1BCM A; 3EG9 A; 3FLG A; 3CCE Q; 4XAX B; 1LJO A; 4GY5 A; 1BIA A; 3HSB A; 4FU6 A; 1FMW A; 4RTV A; 3M58 A; 1ZSG A; 2AIR B; 5GAM h; 1I8F A; 1BI1 A; 3H9N A; 2J6O A; 5GJV B; 1Q82 R; 4ME7 A; 2DL3 A; 2LJ0 A; 3MP6 A; 4XTU A; 1RAH B; 3PGG A; 4DOW A; 1QCO A; 3CCV A; 8ATC B; 5KCH A; 2GFU A; 3JCM e; 3EFO B; 5HKC A; 5LJ3 g; 2MPX C; 2KAF A; 4KH0 B; 1YP5 A; 3JCM d; 2DXB A; 2P4T A; 2MAM A; 1B7T A; 2LNV A; 2D9T A; 4D8D A; 1C6V X; 3PVL A; 1NPR A; 1LNX A; 1D3B A; 2BZX A; 3CC7 A; 4HA8 A; 2C0O A; 2E4H A; 2K6D A; 4E7K A; 2XDP A; 2O4X B; 1RAA B; 5KYU A; 1JXM A; 3V7R A; 3MEA A; 2K5F A; 4CRI A; 1VQ4 A; 3JRZ A; 2M02 A; 5LJ3 j; 1J3T A; 3JB9 D; 2L3Q A; 5J3B A; 2M1H A; 2G3R A; 4JUV A; 3NTI A; 4M75 E; 1EIF A; 1VQP A; 1VQK T; 4X34 A; 3MCA B; 4JRK A; 2ZAE A; 3TEE A; 1VQK Q; 2CZ7 B; 2FL7 A; 4F7U E; 4PL6 A; 2FRY A; 1G2B A; 3FJ5 A; 1QVG A; 1YHQ Q; 2XID A; 3JB9 I; 3EFO A; 3RNJ A; 2K5I A; 2V8K A; 4A4G A; 1E7O A; 2ATC B; 4J83 A; 3OYF A; 1KFZ A; 2DIG A; 3CCQ A; 1GCQ C; 2QQB A; 5A0D A; 3M5A A; 4IUP A; 1IRE B; 1I5L A; 1AWJ A; 4FYY B; 2HZY A; 2DTO A; 3PVQ A; 3M54 A; 5CKE A; 1O9S A; 2KE9 A; 2O4X A; 4M7D A; 4QT7 A; 2HQH A; 2W10 A; 3M0Q A; 3C4S A; 1N8R U; 2OJ2 A; 1YJW A; 1VQL A; 2DIL A; 3SEM A; 4ELZ C; 1RAF B; 4A63 B; 2LQN A; 1P92 A; 2LT4 A; 4FIB A; 4LXC A; 1BBZ A; 2RMO A; 3OSV A; 3G71 A; 3A8M B; 2E3I A; 2IPO B; 2QYZ A; 2QDL A; 1UHF A; 3C12 A; 4YTL A; 3CMA T; 5GMK h; 1YIT T; 1I5O B; 2VGM A; 3VYH B; 5D7U A; 2KRS A; 1XJW B; 4N4G A; 4A53 A; 3OYY A; 1SSH A; 2RNA A; 3QYH B; 4RTY A; 1YIT Q; 4FYV B; 2QI2 A; 1YIJ A; 3G6E Q; 2XI9 A; 5IXF A; 1WQ7 A; 3SHW A; 3MHX A; 1AWO A; 3S3O A; 3RKY A; 5LJ3 h; 1NEB A; 3C94 A; 3AT1 B; 3V7C A; 1K0X A; 5GAO l; 4NS5 A; 1D1C A; 2RD1 A; 3J7A F; 4J6W A; 1VQ7 A; 3OYI A; 2KT1 A; 2DL5 A; 2BTT A; 4LUD A; 1NPP A; 2GQV A; 2YLC A; 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1VUB A; 2JM8 A; 1N6A A; 1VYV A; 5FU7 C; 4C92 A; 2Z0W A; 2MF2 A; 2QEX T; 4C0G A; 2YUN A; 1NLP C; 2E70 A; 2QEX Q; 4DBR A; 4F04 B; 2DBK A; 5CKF A; 1ZA1 B; 1D0Z A; 1H3Z A; 3KUF A; 5ECA A; 5FWB A; 1FX7 A; 1NM7 A; 3QO3 A; 1V1C A; 2EKH A; 1M30 A; 3UAT A; 2KNB B; 4II1 A; 2DL4 A; 2DJZ A; 1WPY A; 1ZSZ B; 5GAN 2; 1KC8 R; 1MGQ A; 4M7A E; 1RI0 A; 2CDT A; 3GBQ A; 1WHK A; 3OW2 P; 3NMZ C; 5LJ3 e; 5CIU A; 2GCX A; 4OML A; 3M9Q A; 3OSS C; 4K11 A; 5LJ3 d; 4J9G A; 4PJM A; 4RTX A; 3OBY A; 4GBQ A; 2M16 A; 2R58 A; 3C0C A; 3P8B B; 1G83 A; 2X35 A; 1M8V A; 1WJQ A; 2E3H A; 4HT9 A; 1VQ9 A; 3RMQ A; 4CC7 A; 5DY9 A; 1G3T A; 1HK9 A; 4HVV A; 1JQQ A; 3RBB B; 4RUG A; 4VUB A; 4E6R A; 2K7A A; 4OMO A; 1W70 A; 5LL6 S; 1M3B A; 4IIO A; 2ZPF B; 1N9R A; 2RHX A; 1AZG B; 2KRO A; 4M78 C; 1OI1 A; 3JCM h; 4PFO A; 4C8Q E; 5GMK m; 1IHV A; 4C92 F; 3HP9 A; 1SHG A; 1NLO C; 3RES A; 4Q5W A; 2X4W A; 2K3B A; 1JXO A; 4ZGE B; 4JS4 A; 1UGV A; 5IH2 A; 5LJ3 f; 3CD6 Q; 3V8K A; 3I9Q A; 1VQN T; 4J7F A; 3I35 A; 2OTJ A; 2HKQ B; 5HK3 A; 5CO7 A; 2DTH A; 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