The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KELVLVLYDYQEKSPREVTVKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVDDRQGFIPAAYLKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Sh3-domain
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| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN
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| publication title |
Conformational Strain in the Hydrophobic Core and its Implications for Protein Folding and Design
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
6
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-02-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QKX A; 2JTE A; 3VRY A; 4RTT A; 4RTW A; 1QLY A; 1UGV A; 2FRW A; 2PTK A; 1AWW A; 2LQN A; 2CH4 A; 2CT4 A; 2MIO A; 4DEY A; 3REA B; 1E7O A; 1K9A A; 4J9H A; 2EGC A; 1SHF A; 2EVR A; 2QDL A; 1U3O A; 3FJ5 A; 3PE0 A; 4HXJ A; 2YUP A; 2O31 A; 4CC2 A; 4LNP A; 4OMO A; 2CUD A; 2EKH A; 2C0I A; 2RPN A; 2YDL A; 1YN8 A; 3QWY A; 3M0T A; 3M0U A; 1ZUU A; 4CC3 A; 4LUE A; 1H8K A; 1WFW A; 2HBW A; 1TUD A; 4JJD A; 1T0H A; 1WLP B; 2LJ1 A; 1ARK A; 5IH2 A; 4GLM A; 1GBQ A; 1LCK A; 2AKL A; 1AWJ A; 2KGT A; 3RNJ A; 2JW4 A; 1BK2 A; 2DL5 A; 2VVK A; 1UJ0 A; 2F2X A; 2L2P A; 1GFC A; 1RLQ C; 1T0J A; 1WA7 A; 2C0T A; 1UHC A; 1G83 A; 2YUQ A; 3QWX X; 2BZX A; 4ESR A; 1G2B A; 2RF0 A; 1VYT A; 5ECA A; 2ABL A; 2FPD A; 2CSQ A; 1AWX A; 3SHW A; 2KYM A; 2DRK A; 2EPD A; 1X2K A; 2KT8 A; 2O88 A; 2O2O A; 3TSZ A; 2L0A A; 4F16 A; 2W0Z A; 4JJC A; 1JQQ A; 4Z89 A; 2DYB A; 1M3C A; 1QWF A; 1X2Q A; 1JU5 C; 1KSW A; 1Y0M A; 2DJQ A; 2EBP A; 3I5R A; 1PWT A; 1RI9 A; 4HVV A; 4AG1 C; 2CT3 A; 1QWE A; 3CQT A; 4R0K A; 1M30 A; 2CH4 W; 1PNJ A; 1X6B A; 1UEC A; 2EYY A; 2LZ6 B; 2DF6 A; 4OMM A; 2GBQ A; 1GCQ A; 2KXD A; 2M0Y A; 1PKT A; 2W10 A; 1N5Z A; 1AD5 A; 1NM7 A; 1HSQ A; 1TG0 A; 3PVL A; 1JEG A; 1Z9Q A; 1GFD A; 3VS0 A; 3M0P A; 2BZ8 A; 1OPK A; 2X3X D; 1RLP C; 1Z9Z A; 2LX7 A; 1MUZ A; 1WDX A; 1GBR A; 2CUB A; 2FPF A; 2CSI A; 4CC4 B; 2KNB B; 1UE9 A; 4IIO A; 1WIE A; 1X6G A; 2YUN A; 1VA7 A; 1NG2 A; 1XOV A; 5IHK A; 5IHI A; 1T3L A; 4GBQ A; 2HCK A; 2J6K A; 2K2M A; 1OV3 A; 2RQU A; 2JMC A; 2A36 A; 3GBQ A; 2EGE A; 4Z8A A; 1ZBJ A; 1W1F A; 2V1Q A; 2J05 A; 1UHF A; 3R6N A; 2BTT A; 4OMN A; 1AZE A; 1S1N A; 2FG0 A; 1T3S A; 1SRL A; 2RQV A; 3U23 A; 2SRC A; 1NLO C; 1UDL A; 2OAW A; 4DEX A; 4F14 A; 3A98 A; 1BU1 A; 1YWO A; 1SRM A; 1YP5 A; 1PKS A; 1SEM A; 2GTJ A; 2OJ2 A; 4J9I A; 3VS7 A; 2BZY A; 2EYZ A; 2YSQ A; 2ED0 A; 2PZ1 A; 2JT4 A; 2I0N A; 1M27 C; 2CDT A; 2FPE A; 4OML A; 2KBT A; 3C0C A; 1H3H A; 1MV0 B; 2KYB A; 2GGR A; 1K1Z A; 1NEG A; 2DX1 A; 1CKA A; 4AFQ C; 1WX6 A; 1ZSG A; 2KRO A; 2YT6 A; 2F2W A; 2M51 A; 1FMK A; 3I35 A; 3SEM A; 2GNC A; 2KR3 A; 3TVT A; 1JXM A; 1JO8 A; 1W70 A; 3VS6 A; 1ABQ A; 2KXC A; 2RQT A; 2DA9 A; 2DBK A; 2J6O A; 2DL4 A; 4CC7 A; 1X69 A; 1EFN A; 1X27 A; 2RN8 A; 1X43 A; 2HSP A; 3I9Q A; 4HVW A; 2DE0 X; 2RMO A; 2JM9 A; 2DM1 A; 5HCK A; 3RBB B; 1ZLM A; 4J9D A; 1GCP A; 4JZ3 A; 4J9C A; 4RUG A; 2E5K A; 3EGU A; 3LH5 A; 2EYW A; 2KRN A; 3JV3 A; 1AVZ C; 2FEI A; 1CKB A; 2LP5 A; 2AZS A; 1VYV A; 2JMA A; 3ULR B; 2J6F A; 1BBZ A; 1ZUY A; 1E6H A; 1J3T A; 1NYG A; 4Z88 A; 1V1C A; 4J9E A; 3H0I A; 3VS4 A; 1K76 A; 3UF4 A; 5I22 A; 4OMQ A; 2ENM A; 1UUE A; 2KEA A; 1BB9 A; 2DNU A; 1SPK A; 2ROT A; 1WXU A; 1FYN A; 4LUD A; 3H41 A; 2KRM A; 4J9G A; 4WCI A; 1QCF A; 2D8H A; 2CRE A; 3H0F A; 4LE9 A; 1AEY A; 2VWF A; 4EIK A; 3H0H A; 4RTX A; 3VS2 A; 1ZX6 A; 1ZUK A; 2F2V A; 1WXB A; 2JS2 A; 2L3Q A; 2NWM A; 1CSK A; 1NYF A; 2FO0 A; 4K11 A; 4JPB W; 2LQW A; 1GL5 A; 4HCK A; 2ECZ A; 3EHQ A; 2H8H A; 2O9V A; 3IQL A; 2DRM A; 1K0X A; 3THK A; 2JM8 A; 3UA7 A; 2DMO A; 1U06 A; 1UFF A; 2K79 A; 4M4Z A; 4QT7 A; 1YNZ A; 4J9B A; 2ED1 A; 1NEB A; 2EGA A; 2EW3 A; 2LJ0 A; 2K3B A; 3PVQ A; 1I0C A; 4X1V A; 1HJD A; 4AFZ C; 2V1R A; 2C0O A; 2D1X A; 4KRT A; 1OPL A; 3NGP A; 4AFS C; 1I1J A; 4RTY A; 2EQI A; 1KFZ A; 5EC7 A; 2K7A A; 4J9F A; 1WI7 A; 2A28 A; 3M0S A; 3NHN A; 1UJY A; 5GJW B; 1Y57 A; 2D8J A; 2O9S A; 1AOJ A; 2HDA A; 5L23 A; 2LJ3 A; 3TSW A; 2L3S A; 2DL8 A; 2KE9 A; 4E6R A; 1OEB A; 2LMJ A; 1TUC A; 2FRY A; 4JZ4 A; 2X3W D; 2DIL A; 1JXO A; 3VS5 A; 4IIM A; 4AFU C; 5FWC A; 1B07 A; 2MCN A; 1QKW A; 1ABO A; 1M3B A; 3EG3 A; 3M0R A; 3VS3 A; 4ZNX A; 3VRZ A; 1UTI A; 2KRS A; 4LN2 A; 2XMF A; 2AKK A; 2DL7 A; 2D0N A; 1OOT A; 2A37 A; 1KIK A; 1HD3 A; 1KJW A; 1NLP C; 4D8K A; 3EG2 A; 3UA6 A; 2B86 A; 5IXF A; 5GJV B; 1I07 A; 4RTU A; 3ZL7 C; 1PRM C; 2MOX A; 2HEQ A; 3O5Z A; 4AG2 C; 2YUO A; 5I11 A; 1AZG B; 1B3Q A; 1VYU A; 2KT1 A; 2RNA A; 2G6F X; 5IHN A; 1U5S A; 3M0Q A; 2EYX A; 2JXB A; 1WXT A; 4A63 B; 1YWP A; 2LNH B; 4RTV A; 2SEM A; 4D8D A; 2VKN A; 3REB B; 3KFV A; 2ESW A; 1AWO A; 2L3P A; 2DVJ A; 3I5S A; 2K9G A; 1H92 A; 2AK5 A; 2LCS A; 1K4U S; 1PHT A; 1YCS B; 2DLP A; 1WYX A; 1SHG A; 2IIM A; 4OMP A; 2J7I A; 2GTO A; 1PRL C; 4Y92 A; 1E6G A; 1M3A A; 3NMZ C; 2DL3 A; 2A08 A; 4F17 A; 2NUZ A; 1W6X A; 2GQI A; 2AZV A; 5IXB A; 1GRI A; 5FW9 A; 1SSH A; 1MV3 A; 4RTZ A; 3NPF A; 3VS1 A; 2PNI A; 2OI3 A; 2JS0 A; 1IO6 A; 2DBM A; 5FWB A; 2P4R A; 2ROL A; 2J06 A; 1RUW A; 3EG1 A; 3EG0 A; 1M8M A; 4HVU A; 3EHR A; 2K6D A; 1UG1 A; 2RQW A; 3UAT A; 1K0S A; 1GCQ C; 4JJB A; 1A0N B; 4FSS A; 4ORZ A; 2RQR A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2PVD B; 2YXY A; 1OUL A; 2OX7 A; 1UGV A; 3HFO A; 3MHX A; 5CKB A; 2LQN A; 3H8Z A; 2MMP A; 2O4X B; 4DEY A; 3REA B; 1K9A A; 2EGC A; 1WHJ A; 2RA2 A; 1SHF A; 2VXF A; 4ANJ A; 4HXJ A; 5GMK e; 1X01 A; 2PUK B; 1YHQ A; 1C1A A; 4OP0 A; 1YJ9 T; 4N4G A; 3A1P A; 3ASK A; 1UGR B; 4N4H A; 3QWY A; 3M0U A; 4XTW A; 4EMH A; 4LUE A; 1H8K A; 5KH6 A; 1WFW A; 4YTL A; 3M58 A; 1GBQ A; 2Y4Y A; 3LW5 E; 1AWJ A; 1IB8 A; 3CMA T; 5CIU A; 2M0O A; 1RAI B; 3BFM A; 1UHC A; 1G83 A; 4ESR A; 1NPR A; 3S3N A; 2OTL Q; 2CSQ A; 2COZ A; 1PCX A; 2EPD A; 3CCR Q; 2LTO A; 5CQY A; 2HQE A; 2RI3 A; 2X9H A; 3L2W A; 2O88 A; 3QBY A; 2M1H A; 4AT1 B; 3RDV A; 4KT0 E; 2O4X A; 1Q86 U; 3PIP A; 1LVK A; 2DAQ A; 2RO0 A; 1Y0M A; 3I5R A; 2K5I A; 1QWE A; 2CH4 W; 1QW1 A; 1PNJ A; 1OX8 A; 1GCQ A; 3OYH A; 1RAG B; 2XI9 A; 3FIF A; 4OF1 A; 4FCY A; 2KI7 A; 2W10 A; 1NM7 A; 1TG0 A; 3PVL A; 3OYJ A; 5L8R E; 3GIB A; 4AMC A; 2XID A; 3VS0 A; 2HKQ B; 3V8L A; 3TRE A; 1Z9Z A; 2GFU A; 1WDX A; 2OTJ T; 2OTL A; 5I2M A; 4DQ2 A; 2DTO A; 1X6G A; 1ACM B; 3QYH B; 3JSC A; 3JB9 D; 1VQ6 T; 4BI3 A; 4GBQ A; 1VQL Q; 1RAC B; 3CCR A; 4J6W A; 2JMC A; 2EQU A; 4X34 A; 8ATC B; 2HSE B; 1M1F A; 3GBQ A; 2EGE A; 2I2L A; 4BB7 A; 1X75 C; 1YJN Q; 4CI0 C; 5A0D A; 2DTH A; 2K3Y A; 3BY7 A; 4X9D A; 1UHF A; 1MMD A; 4II1 A; 1UGS B; 4J7I A; 5CKF A; 4B9X A; 3L2V A; 3EFS A; 2BTT A; 2COW A; 2SRC A; 1NLO C; 2NUP B; 1QQJ A; 5GAM g; 4Y28 E; 1VUB A; 3T9N A; 3JCM X; 2O01 E; 3JCM d; 3OYD A; 4M75 B; 1PKS A; 4J9I A; 2GTJ A; 2CP0 A; 2V26 A; 2V8J A; 2EYZ A; 4A54 A; 1WZO A; 2I0N A; 4BY6 C; 8AT1 B; 3S3M A; 2CDT A; 4PLL A; 3MCA B; 2DD5 A; 3C0C A; 3GPL A; 3MKD A; 2QQA A; 1H3H A; 2V8K A; 1O9S A; 4XQ3 A; 2KK4 A; 1G3W A; 2GGR A; 4WF2 A; 1OU8 A; 1RL2 A; 3QG1 A; 5GAN 6; 4JJN K; 5FRO A; 2ZPG B; 5D7U A; 1Y07 A; 1G3T A; 1NEG A; 1IHV A; 1VQL A; 1CKA A; 1RI0 A; 4FYV B; 1Q82 U; 4B6M A; 3CD6 T; 2HBP A; 1YJN A; 2KAF A; 1MMN A; 1FMK A; 2QQB A; 2C06 A; 2RJE A; 3CCE T; 2GNC A; 2KR3 A; 3TVT A; 1YJ9 Q; 4FL6 A; 2DBK A; 2J6O A; 2DL4 A; 4C92 C; 1EFN A; 1X27 A; 3O8V A; 2RN8 A; 3OW2 P; 5GAM f; 5FRM A; 3I9Q A; 1KQS P; 2P84 A; 1MMG A; 2JM9 A; 1VQ7 T; 2XKO C; 4JLG A; 3OYC A; 1ZHI A; 2E5K A; 2MWO A; 2NUP A; 2EYW A; 2DYI A; 4M77 A; 3CMA Q; 1JBM A; 3M53 A; 4N0A A; 2YHT A; 2MF2 A; 4M75 A; 4M7A C; 4B9W A; 1BBZ A; 5LJ5 f; 3OW2 S; 1K8A C; 2IPO B; 1J3T A; 1KQS S; 4OVA A; 3EGX B; 2BUD A; 4PJO G; 1FX7 A; 1K76 A; 3TU4 K; 2AIR B; 2VGN A; 2ENM A; 1AHJ B; 2HD0 A; 2BIV A; 3L42 A; 1QCF A; 2CYZ B; 3CCQ T; 1YI2 T; 1YJ9 A; 3RMQ A; 2PU9 B; 1KK7 A; 2R5M A; 5CCA A; 2ZAE A; 4RTX A; 2XDP A; 4JUV A; 1TSF A; 2JTF A; 1ZUK A; 2L3Q A; 1CSK A; 5DLO A; 4C92 G; 3CBO A; 4FW1 A; 1Q7Y C; 3DB4 A; 2FL7 A; 4XTZ A; 1MND A; 1M1K C; 3C12 A; 3CMA A; 1KQS A; 4JDS A; 2NUT B; 3THK A; 3L2R A; 3UA7 A; 1U06 A; 1NPP A; 4J9B A; 2OTJ Q; 2EGA A; 4KUD K; 2CZ7 B; 2D0Q B; 1LJO A; 1ZBX A; 1VQ6 Q; 1D1C A; 4BI4 A; 1BI0 A; 4NL3 A; 1R0C B; 2R5A A; 3NGP A; 3PIO A; 2JVV A; 5EC7 A; 2K7A A; 4J9F A; 3EGX A; 2P4T A; 4FIB A; 1I8F A; 2ZZD A; 3CBP A; 1UJY A; 1BIA A; 2HDA A; 5C0M A; 4O6J A; 3TSW A; 2H3J A; 2KE9 A; 2QGG A; 1VQP T; 3SWN C; 4BDY A; 3GF5 A; 2X3W D; 3VS5 A; 1VIF A; 2QA4 T; 5FWC A; 3VUZ A; 2VV5 A; 3QO3 A; 1ABO A; 2EQM A; 2FYK A; 1RAE B; 2YRD A; 3UPU A; 3WXM B; 2OTJ A; 5CVI A; 4XTY A; 5LJ5 j; 5CKD A; 2DZC A; 2NUT A; 1VQ6 A; 3UA6 A; 1Q86 R; 5GJV B; 1OQK A; 1TH7 A; 2BE7 D; 3CD6 Q; 4BE2 A; 5I11 A; 3JB9 I; 3CCE Q; 1B3Q A; 2RM4 A; 2G6F X; 5IHN A; 4RCB A; 1VOM A; 3OS0 A; 4JRQ A; 2QAZ A; 2QK0 A; 5D6X A; 2ZPB B; 2KVQ G; 4IKF A; 1Y7X A; 2L3P A; 1FMV A; 3CXC P; 3I5S A; 1K73 U; 1VQ7 Q; 1H92 A; 1UEB A; 5HK3 A; 4C8Q G; 5CAI A; 1SHG A; 3C95 A; 4PJJ A; 2J7I A; 3KBG A; 3NMZ C; 5GAN 4; 1ZA2 B; 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5DY9 A; 3EG9 B; 2X4Y A; 3M59 A; 2EBP A; 1N8R U; 1RI9 A; 4AG1 C; 3CQT A; 1Q81 U; 1M30 A; 1X6B A; 4XU2 A; 1UEC A; 2EYY A; 2PQW A; 4OMM A; 2DKG A; 3LH0 A; 3OYM A; 1M90 C; 4E7H A; 3JCM g; 3X26 B; 3PGG A; 5A2Q E; 4C92 B; 1N5Z A; 1HSQ A; 1G3Y A; 1JEG A; 4C5H A; 5GAN 8; 1KD1 C; 3P8D A; 1VQP A; 4C0D B; 4JS4 A; 2FPF A; 2CSI A; 3CCS T; 1RAA B; 2QA4 A; 2H3E B; 4IIO A; 1WIE A; 2PUO B; 1O75 A; 5IHI A; 2EAY A; 1KG1 A; 1V76 A; 2K2M A; 3VYH B; 1HK9 A; 2K2V A; 4Z8A A; 1NZ9 A; 1ZBJ A; 3N5B B; 5CQX A; 4QKU A; 1W1F A; 2ZPH B; 4EMK B; 4E7S A; 2V1Q A; 2J05 A; 3R6N A; 4QVC A; 1I4K 1; 1T3S A; 2RQV A; 4PJO A; 1UDL A; 2OAW A; 3G1J A; 3CCJ Q; 2IVW A; 1IGQ A; 2HNI A; 1RAD B; 2BZY A; 3EG9 A; 2YSQ A; 1VQO Q; 2RHU A; 4OMF B; 2FPE A; 2MAM A; 3TCJ A; 3M55 A; 5LJ3 j; 3I56 T; 5GAN f; 4FT2 A; 3BDL A; 1MV0 B; 4C92 A; 2KYB A; 4IUR A; 2EQJ A; 3BW1 A; 2HZY A; 3CCV Q; 4AFQ C; 1WX6 A; 5KYX B; 1ZSG A; 2LC4 A; 2F2W A; 2M51 A; 3SEM A; 3RES A; 4JLI A; 4OGE A; 1SG5 A; 4HT8 A; 3OYB A; 5DM7 R; 1FMW A; 2RI5 A; 2RB6 A; 4CC7 A; 3V8K A; 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