The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
82
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structure length |
76
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Chain Sequence |
SHMSPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGMTLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
Dynactin-1
|
| publication title |
Key interaction modes of dynamic +TIP networks.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
10
|
| structure length |
76
|
| sequence length |
82
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-07-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01302 | CAP_GLY | CAP-Gly domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | CAP Gly-rich-like domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HL5 C; 1WHM A; 2HL3 A; 2CP0 A; 1WHL A; 2HQH A; 2Z0W A; 2COZ A; 2HKQ B; 2MPX C; 2CP5 A; 3TQ7 P; 1WHJ A; 4B6M A; 2E4H A; 3E2U A; 2CP2 A; 2E3I A; 1WHK A; 1LPL A; 1IXD A; 2HKN A; 2CP3 A; 2COW A; 2E3H A; 1TXQ A; 2CP7 A; 2QK0 A; 2CP6 A; 2M02 A; 3RDV A; 1WHH A; 1WHG A; 1TOV A; 2COY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4CRI A; 4DBH A; 3I5R A; 2D1X A; 2F2W A; 4RKU E; 1AD5 A; 4BI8 B; 4M4Z A; 4J9E A; 1QCO A; 2FVU A; 3FDR A; 2QQ9 A; 1PHT A; 3HPW A; 2DBM A; 3NHN A; 2EIF A; 2RQV A; 3TVT A; 4EMK B; 5DLO A; 4P5N A; 5J3B A; 4DEY A; 4NL3 A; 4HT8 A; 1QVP A; 5GAO r; 3NTI A; 4M78 B; 3JB9 G; 4HKE A; 3M9Q A; 2D9T A; 2HL3 A; 1V76 A; 4RTZ A; 5I22 A; 4QQD A; 3RER A; 2DX1 A; 3LH5 A; 4M75 G; 3I56 T; 1TU0 B; 2BKD N; 3TQ7 P; 2L3Q A; 2ZPH B; 1TH7 A; 4N4H A; 2MK5 A; 3MCA B; 5A0G A; 2K2M A; 2ZPE B; 2QTV A; 1OEB A; 2DM1 A; 2YXY A; 4BE2 A; 2CSQ A; 3CCU Q; 1WHH A; 4FYX B; 4ELY C; 1ZHI A; 4PKC C; 2COY A; 3C94 A; 2VVK A; 1W4S A; 2IG0 A; 3EGX A; 1E6H A; 1BIB A; 4JS5 A; 4LUE A; 4O5V A; 2RNA A; 1BI3 A; 4F7U F; 2EW3 A; 4J5Y A; 3CCM Q; 1N8R C; 3QBY A; 4M77 B; 4ANJ A; 2M9U A; 1M3B A; 2YUO A; 1YJW A; 1D0Y A; 3LWH A; 2LCC A; 3EHR A; 4IKF A; 1MND A; 2DZ9 A; 4EMH A; 3X24 B; 4J9F A; 3SWN C; 1OZ3 A; 1K9M C; 4JS4 A; 1UGS B; 2QGF B; 4LE9 A; 3CCR T; 2QXF A; 1ZBJ A; 2MAM A; 1N8R R; 1RAD B; 1HYO A; 4EIK A; 1M2V A; 2XIC A; 3QXE B; 2AKL A; 2DA9 A; 2MF2 A; 3CCJ T; 4M7A G; 3EG3 A; 2K6D A; 2F2X A; 2KGT A; 2CUB A; 4HVW A; 1B34 A; 1D09 B; 3RR6 A; 4J7F A; 4ZN3 A; 4PJO D; 1X2Q A; 2HQE A; 3E9G A; 2LZ6 B; 3QZ5 B; 4RTV A; 5GAN j; 5C6S A; 1UGP B; 3FRN A; 2A08 A; 2HEQ A; 2DTO A; 4RTX A; 2DEQ A; 3OYK A; 5L8R E; 4Y92 A; 1Z9Q A; 1YIJ Q; 3MHX A; 4J6Y A; 3J80 E; 1Z9Z A; 2MYS A; 1KHC A; 5D6W A; 1HXD A; 2SEM A; 3RKY A; 2DYI A; 4C8Q E; 3JAM E; 3KUF A; 1YWP A; 5I2M A; 4RTU A; 3E2U A; 3GPL A; 3FEO A; 5GAN g; 1BCM A; 3M0R A; 2NUP A; 4IUV A; 3MP6 A; 3QWX X; 2DL3 A; 4Q5W A; 2IVW A; 4C92 A; 2DIG A; 1VQO Q; 2DBK A; 4M78 F; 3OS5 A; 3N5B B; 3EH1 A; 5CKF A; 1YI2 Q; 3P8B B; 2D0Q B; 4M7D D; 3I35 A; 2LNV A; 3JSC A; 3CPF A; 3QSU A; 4CC7 A; 3EGD A; 4JJD A; 2FZC B; 3KXT A; 1EZZ B; 3I55 Q; 1NPP A; 1VYT A; 1YWO A; 1EX4 A; 2F69 A; 2Y4Y A; 3HFO A; 5HKC A; 4R55 A; 4E6R A; 2E6N A; 1VQN Q; 1O9S A; 3OYB A; 2CSI A; 3JCM J; 3JCM h; 4KBM B; 2RH2 A; 5IXF A; 2AZV A; 1YJ9 Q; 4M77 F; 5KE3 A; 2QEX Q; 5LJ3 f; 1IGQ A; 1R0B G; 1OX8 A; 3UA6 A; 4QQ6 A; 4YTL A; 1NBE B; 4C0G A; 3BY7 A; 1OZ2 A; 3LGF A; 2HQX A; 2KRN A; 2PUK B; 3CME Q; 1M8M A; 1UTI A; 2DF6 A; 4X9C A; 4M75 E; 2VYT A; 3MPU B; 3PNW C; 2AIR B; 3OYF A; 2H3E B; 4MZM A; 4B9W A; 2CP3 A; 1O75 A; 3G4S T; 1UUE A; 2DER A; 1VQK A; 2ZPG B; 1PCX A; 5KYY A; 1KQS P; 1M90 C; 1D0X A; 3TCJ A; 1N9R A; 2RJC A; 3HL8 A; 3EG1 A; 3MKD A; 1K8A C; 3O8V A; 3PIP A; 4E7J A; 2CKK A; 3CCL A; 3SWN A; 2LVM A; 3SHW A; 4RG2 A; 1D1A A; 5M9O A; 1LNX A; 1Y07 A; 2E65 A; 3CQT A; 3A5Z B; 3QDF A; 3FC3 A; 1WYX A; 4BI3 A; 5FWC A; 1QVF A; 1WA7 A; 5GMK e; 3I56 A; 1M90 R; 2KRM A; 5J39 A; 3EGU A; 2JS0 A; 1VQ8 Q; 3JCM d; 5KYN A; 3UPU A; 4WTO B; 1LVK A; 1TSF A; 1UDL A; 2COW A; 1WJS A; 1PG5 B; 4M7A E; 2OAW A; 4XTU A; 4A54 A; 1Y57 A; 2BIV A; 2HAX A; 2DIL A; 2JM8 A; 2RD1 A; 3GBQ A; 1QKX A; 4FW2 A; 1VQ4 Q; 4BE1 A; 2JXB A; 1R77 A; 4OGE A; 3G6E A; 3PIO A; 4ATO A; 3M53 A; 4D8D A; 5HY6 A; 1W1F A; 1MMN A; 4PFO A; 4QVZ A; 3URG A; 1X43 A; 5GAN 6; 2RHY A; 4KUI A; 2LQK A; 1T0H A; 1PD0 A; 3LX7 A; 4XAX B; 3VS7 A; 5HK0 A; 3A8M B; 5GAO l; 2RQR A; 4ME7 A; 3OY9 A; 2RHX A; 4UC4 A; 2K3B A; 4PNO A; 5KCH A; 3CCR A; 4PJO C; 1AOJ A; 3HP9 A; 2LRQ A; 1HSQ A; 2EJG A; 3CPW P; 3CCV Q; 2DZC A; 4JRQ A; 5GMK i; 1AT1 B; 4NOY A; 1AEY A; 2XMF A; 2QTX A; 3SD4 A; 1U5S A; 4NL2 A; 3G71 Q; 4C92 B; 2B86 A; 2DXT A; 2PNI A; 2JNG A; 1FWZ A; 4JZ3 A; 3OBY A; 1F1B B; 1CSK A; 1WXT A; 2VAS A; 3FJP A; 4KRT A; 1S1N A; 1JB0 E; 5CKB A; 4DBF A; 1Y7X A; 3EGD B; 2BZX A; 2J6K A; 1R0C B; 2QDY B; 2V1R A; 3OYE A; 2CT4 A; 4PJN A; 1QCF A; 2L3R A; 2EYW A; 1WXB A; 2O01 E; 4M7A C; 4F04 B; 3H6Z A; 1ZSG A; 3A98 A; 2NLU A; 1Q86 U; 2E4H A; 3WVD B; 2Y90 A; 4AG2 C; 2Y4X A; 1P92 A; 1KQS S; 3CCQ Q; 2JTM A; 2W10 A; 4J6X A; 2X4Y A; 4FSS A; 4KGV B; 3VRY A; 4M7D C; 1XJW B; 1X69 A; 3TU4 K; 2QA4 A; 4BDZ A; 1KQ1 A; 1PKS A; 3CCE A; 2A0F B; 2DFU A; 4RCC A; 1BYM A; 1K9A A; 1S72 T; 3VKI A; 4F7U G; 2ATC B; 1WQ7 A; 2KBT A; 1D3B B; 1WIE A; 2CZ7 B; 1JXM A; 1YBY A; 1EFN A; 1Q81 C; 1D1B A; 4C0D B; 1SKU B; 1UEC A; 1WPY A; 5IN1 A; 3UAT A; 1K73 C; 4IUU A; 3JCM g; 3KFV A; 4LUD A; 1PRL C; 3TRE A; 1V29 B; 2MOX A; 3PT9 A; 5GAN e; 3EG2 A; 3OS0 A; 2RI5 A; 1JU5 C; 2CS7 A; 1XTD A; 2AK5 A; 2M51 A; 4FYV B; 1M1F A; 2K79 A; 4F16 A; 1H8K A; 2L8D A; 4BD3 A; 1YHQ T; 1Q81 R; 4JJB A; 4N0A C; 1TUG B; 2OTJ T; 1K73 R; 1WXU A; 1ZX6 A; 4KH0 B; 1UGV A; 2X35 A; 5FU6 B; 2FPD A; 9ATC B; 4X34 A; 1VQP Q; 1VQL Q; 5FU7 B; 2JZ2 A; 2KMT A; 3OYD A; 2K9G A; 2NUT B; 2X9H A; 3A8G B; 3D7S B; 4HCB A; 1UHC A; 2KNB B; 2R57 A; 1VQM A; 1M2O A; 2EQI A; 2DD5 A; 3CPW S; 1W70 A; 4KT0 E; 1SHG A; 2HQH A; 2L3P A; 2OTL Q; 3QG1 A; 3PTA A; 1GL5 A; 3GNF B; 2HCK A; 5I11 A; 4JUV A; 2M0Y A; 4C92 F; 1R8O B; 3E19 A; 3QHS A; 1M30 A; 4WF2 A; 2DMO A; 2E6Z A; 4PJO A; 1BI1 A; 2E5K A; 1M1K U; 4OP0 A; 1RAF B; 1MMG A; 1I07 A; 4E7H A; 4FU6 A; 2LJ0 A; 3J7A F; 3VS5 A; 3CXC A; 1PKT A; 4CC2 A; 3CC4 A; 4Y28 E; 2ECZ A; 4FCY A; 1KG1 A; 5LJ5 d; 1QWF A; 2LQ8 A; 2YT6 A; 4FL6 A; 1OX9 A; 3DB3 A; 2PTK A; 4D6W A; 4ZN1 A; 1UGQ B; 3GIB A; 4JJC A; 4B6M A; 4OMN A; 2JT4 A; 3H0I A; 1OYX A; 1Y96 B; 1KJW A; 3NFC A; 2DLP A; 4DOV A; 2DET A; 2YWW A; 2DKG A; 2LQN A; 4M7A A; 1TOV A; 3PMT A; 3CCU T; 5CAI A; 4A63 B; 1QVG S; 1HJD A; 3BFM A; 2XD0 A; 4OB0 B; 3X20 B; 4GLK A; 3CD6 A; 5CO7 A; 5AYF A; 3QPH A; 2A3L A; 2EGA A; 4MDW A; 4DQ2 A; 4EMG A; 3CCM T; 2QQA A; 2K4Y A; 4J83 A; 1YIT A; 4M7D A; 3P8H A; 2X3X D; 4HCK A; 2RK2 A; 2KXD A; 2QI2 A; 2EJF A; 2HSP A; 4M78 D; 1WNL A; 2VXF A; 4QKU A; 2YRV A; 1U06 A; 1ZSZ B; 2P0P A; 2RQU A; 1VQ6 A; 3REA B; 3JV3 A; 4C8Q B; 3OYG A; 2VXE A; 4A4F A; 2FO0 A; 1WDX A; 1RAA B; 3FJ5 A; 1BIA A; 4F7U E; 5CKD A; 5GMK m; 4VUB A; 4PJO G; 4IUR A; 4WCI A; 3RKX A; 2KI7 A; 2HBP A; 3EG9 A; 2SRC A; 1VQ7 A; 5FW9 A; 5KYW A; 1RAC B; 4XQ3 A; 1QVG A; 4M77 D; 5A2Q E; 4BY6 C; 3QWY A; 3VJP A; 3F70 A; 2ZPB B; 3S3N A; 1VQ5 T; 3MP8 A; 4AT1 B; 3CBO A; 1BCO A; 2O9V A; 1X6B A; 3E1S A; 2LX7 A; 5CCA A; 4FT4 A; 1B3Q A; 1OPL A; 4N0A A; 1QWE A; 2YUQ A; 1IZ6 A; 3HSB A; 2DRK A; 3JRZ A; 4JJN K; 5CR2 A; 5LL6 S; 2WSC E; 1YIJ T; 2F1L A; 1NJI U; 4OMP A; 1BB9 A; 3MO8 A; 3QYG B; 5KH6 A; 1NLO C; 3MEU A; 1VA7 A; 1S72 A; 4AFU C; 1Q7Y C; 2HDA A; 3RUX A; 3CCL Q; 1LJO A; 4A4G A; 2CP2 A; 3RMS A; 2L89 A; 1KC8 U; 5KYU A; 3HRS A; 4J6W A; 2G6F X; 2K5I A; 1M1G A; 2HSE B; 1WFW A; 5KE2 A; 5GJW B; 2ZAE A; 3I56 Q; 3VV0 A; 4V2S A; 3M0P A; 2RJF A; 3JCM f; 3MEW A; 4LNP A; 3VYG A; 4M7D G; 4XK8 E; 4R56 A; 4FYW B; 3CMA A; 1VOM A; 1Q7Y R; 5DY9 A; 1VQO T; 2LDM A; 4QVC A; 4XU1 A; 4FSX A; 2JOY A; 4M75 B; 1T3L A; 2X51 A; 1YI2 T; 2CP7 A; 3RKW A; 5LJ5 g; 1GCQ A; 2YDL A; 2DXB A; 3VS0 A; 5FRO A; 2LP5 A; 2DXC A; 2O31 A; 2O2O A; 3G6E Q; 2HZY A; 3LYI A; 3I55 T; 2OTJ A; 2MWO A; 2X4J A; 1RI9 A; 1QP3 A; 2DVE A; 2ABL A; 2LT4 A; 5IHI A; 1W2B A; 4MDX A; 4DOW A; 4OVA A; 1SRL A; 2BZ8 A; 2FEI A; 3M56 A; 2KQW A; 4A53 A; 3UT1 A; 1KD1 C; 4DA4 A; 3M59 A; 1WZO A; 1YJ9 T; 1NYG A; 3L2Z A; 2XU8 A; 1HK9 A; 2QEX T; 4IUT A; 3QUI A; 3REB B; 5ECA A; 3JCM e; 4PLI A; 1ZBX A; 4C5I A; 3AHU A; 2QAS A; 3CME T; 1G3S A; 1MUZ A; 2NWM A; 5GAO p; 1MGQ A; 2FRY A; 4C8Q F; 4PLL A; 2CRE A; 1KD1 R; 1K0S A; 4M7A B; 3CCS A; 1K4U S; 4HT9 A; 1BU1 A; 1VQ9 A; 2A28 A; 5GAM d; 4XTZ A; 2DVJ A; 2YRD A; 1Q82 C; 1AHJ B; 2GBQ A; 3OYN A; 2M1H A; 2MWP A; 2XDP A; 1C6V X; 5GAN 7; 3WVE B; 2VWF A; 2MCN A; 4E7K A; 3M0Q A; 2EKO A; 2BE7 D; 1ZA2 B; 2K2V A; 2EWN A; 2JW4 A; 3M58 A; 4LDV A; 2DO3 A; 1MMA A; 3CC2 Q; 1QVF S; 1LCK A; 1Q82 R; 1I1J A; 2XKO C; 3DKM A; 4BB7 A; 1SHF A; 3H41 A; 2VV5 A; 2OX7 A; 4HVU A; 2LT1 A; 1M9S A; 5L23 A; 1VQ8 T; 1WGS A; 1UEB A; 2ESW A; 2QA4 Q; 3CBP A; 3EHQ A; 3CCE Q; 2RHI A; 4FIB A; 1GCP A; 4EMK C; 1M3C A; 3BDL A; 2QAZ A; 4PJO E; 5AT1 B; 2O88 A; 2RO0 A; 3EGX B; 1N8R U; 5KYW B; 2PUO B; 4M78 C; 4RCB A; 1QW1 A; 5HK3 A; 2DXU A; 1VQ4 T; 1BKB A; 3HTR A; 4E47 A; 2PU9 B; 1FX7 A; 1WJQ A; 3CCM A; 4ELZ C; 1OV3 A; 3CEY A; 1RAI B; 1RL2 A; 4PK4 A; 3JCM b; 1K9M U; 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5GAN f; 5DM7 R; 2YUP A; 2DPP B; 1MV3 A; 2EQU A; 4A4H A; 2A7Y A; 1QP2 A; 4C5G A; 4L6V 5; 1JBM A; 1OU8 A; 3CD6 Q; 5LJ3 d; 2CP0 A; 4EPC A; 3OYL A; 3QYH B; 2DL5 A; 3A1P A; 1C0M A; 3C12 A; 4RTW A; 1YIT Q; 4IIO A; 4OMO A; 3VS3 A; 2XID A; 4MZP A; 2KT1 A; 3CME A; 1FMW A; 3VS1 A; 1ABQ A; 2E3H A; 4XTV A; 3OS1 A; 2PVD B; 5LJ5 e; 1VQP T; 2GGR A; 2M02 A; 1VQL T; 1MHN A; 1IGU A; 4PJL A; 1QVG P; 2QG9 B; 1M90 U; 1VQ6 Q; 2CH4 A; 4O6J A; 1IRE B; 5KYY B; 2YLB A; 3BW1 A; 2RJD A; 2KYM A; 5FWB A; 2R5A A; 3ASK A; 1K8A U; 1OOT A; 3P8D A; 2DL8 A; 4E7S A; 4OB2 B; 3IQL A; 2OTL T; 2E12 A; 3V7R A; 2HKN A; 1VQ7 Q; 3SWN B; 3RDV A; 4IUQ A; 2LC4 A; 2FHD A; 3LW5 E; 5A0D A; 5LJ5 h; 1X6G A; 1NM7 A; 1KHI A; 2EKH A; 3JCM V; 4M77 A; 1YJW Q; 1YCY A; 2F2V A; 4L5G A; 2W0Z A; 4J7I A; 3TSZ A; 3CXC S; 2YHT A; 1NYF A; 5A0L A; 1JRI A; 4XU0 A; 1M3A A; 3GP8 A; 5D6Y A; 3X26 B; 2KXC A; 2RQW A; 3M5A A; 3G4S A; 3CC7 T; 2FZG B; 4NS5 A; 4F14 A; 2QQS A; 1X2K A; 3OW2 S; 1AWX A; 2C06 A; 5FRM A; 3RMQ A; 1JQQ A; 1VQ4 A; 3V8L A; 3ZBD A; 3INZ A; 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