The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
MSGARCRTLYPFSGERHGQGLRFAAGELITLLQVPDGGWWEGEKEDGLRGWFPASYVQLL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Growth arrest-specific protein 7
|
| publication title |
Solution NMR structure of SH3 domain of growth arrest-specific protein 7 (GAS7) (fragment 1-60) from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) Target HR8574A
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-08-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KT1 A; 4ORZ A; 3I35 A; 1T0J A; 1OEB A; 1JEG A; 3VS6 A; 2J05 A; 3VS3 A; 1GCQ C; 1PKT A; 1Y57 A; 3RNJ A; 5GJW B; 2AKK A; 2HCK A; 1ZBJ A; 2LQN A; 2LMJ A; 2MIO A; 4J9B A; 2EBP A; 1I07 A; 1KSW A; 2M51 A; 4HVW A; 4RTT A; 4ESR A; 3H41 A; 3VRY A; 2DBM A; 2LP5 A; 2DYB A; 1SHG A; 1ZUK A; 1PRM C; 2JS2 A; 3PE0 A; 4J9E A; 2J6O A; 1OPK A; 3KFV A; 1YN8 A; 1YNZ A; 1A0N B; 2A28 A; 1UHF A; 2EPD A; 2JMC A; 4IIM A; 4FSS A; 1JQQ A; 1GRI A; 4KRT A; 4OMP A; 1AWW A; 1GFC A; 4OMO A; 1Z9Z A; 2CSI A; 3THK A; 1MV3 A; 3NGP A; 3VS2 A; 5IH2 A; 1UTI A; 2C0I A; 3H0I A; 2EYY A; 1KFZ A; 1AOJ A; 2YUN A; 1E6G A; 2K79 A; 2KXC A; 3M0R A; 4J9F A; 2C0O A; 2HBW A; 1FMK A; 2LX7 A; 1X43 A; 4J9I A; 4CC4 B; 2X3W D; 1TUC A; 2GNC A; 1M3A A; 4LN2 A; 1SEM A; 2O88 A; 1GCQ A; 2PZ1 A; 1CSK A; 2ROL A; 1ZSG A; 2KRO A; 1PWT A; 4HXJ A; 1QKX A; 1AWO A; 3R6N A; 3TSW A; 2ED1 A; 2L3Q A; 3SHW A; 1AWX A; 3QWY A; 2LJ3 A; 2FRW A; 3EG0 A; 2DL8 A; 3PVQ A; 2EGA A; 3EG1 A; 1ZUU A; 3M0Q A; 2DX1 A; 1I1J A; 2G6F X; 2O9V A; 2VVK A; 3H0F A; 5FW9 A; 1ABO A; 2FPD A; 2D8J A; 1NM7 A; 2JTE A; 1ZUY A; 2J7I A; 1NYG A; 1HSQ A; 4A63 B; 2CRE A; 1UFF A; 2KT8 A; 4LE9 A; 2H8H A; 3I9Q A; 2V1R A; 4EIK A; 1WA7 A; 1FYN A; 1OV3 A; 1JXM A; 2FO0 A; 3H0H A; 1K0X A; 2K6D A; 1M3B A; 1YWP A; 2FEI A; 2ESW A; 2DRM A; 2YSQ A; 2EW3 A; 2DE0 X; 1RLP C; 4RTX A; 4HVU A; 4J9G A; 2GBQ A; 1CKB A; 2L3S A; 1AEY A; 2J6F A; 1BB9 A; 2D0N A; 2D8H A; 1PNJ A; 2ENM A; 2JT4 A; 4JZ4 A; 4AFU C; 2AKL A; 2BZX A; 2EKH A; 4GLM A; 1AZG B; 2EVR A; 2JS0 A; 4F16 A; 2KE9 A; 2QDL A; 2SEM A; 1SRL A; 3UAT A; 4AG1 C; 4OMM A; 3UF4 A; 4CC2 A; 1AZE A; 1W70 A; 2RPN A; 2HDA A; 3NHN A; 2EYW A; 1NLP C; 3JV3 A; 1WFW A; 3VRZ A; 3VS7 A; 1PKS A; 4LUE A; 2A36 A; 2RQW A; 1NYF A; 1WIE A; 1G2B A; 3REB B; 1U06 A; 5IHN A; 1W1F A; 3NPF A; 2ED0 A; 2FRY A; 5IHK A; 2DL7 A; 1HJD A; 4DEX A; 2OI3 A; 1X6B A; 1TUD A; 1ABQ A; 2L2P A; 1S1N A; 2DA9 A; 1UJY A; 1K4U S; 1JO8 A; 1U3O A; 4WCI A; 2KYB A; 4DEY A; 2CH4 W; 2OJ2 A; 2EGC A; 1NG2 A; 1K76 A; 1SRM A; 4JPB W; 5FWC A; 2BZY A; 2NUZ A; 2YT6 A; 1UEC A; 1PRL C; 1UGV A; 1UE9 A; 1GL5 A; 1YWO A; 1EFN A; 3M0P A; 4OMQ A; 4Z8A A; 1PHT A; 4GBQ A; 1OPL A; 3VS5 A; 2CDT A; 3IQL A; 2DVJ A; 1GFD A; 2W10 A; 3EGU A; 1CKA A; 2BZ8 A; 1QKW A; 1WLP B; 1W6X A; 2YUP A; 5IXF A; 1TG0 A; 2AZV A; 3FJ5 A; 2CT3 A; 1UG1 A; 1RUW A; 4RTU A; 1K1Z A; 3CQT A; 3RBB B; 2HEQ A; 1QCF A; 2K2M A; 1KIK A; 1RLQ C; 1VYU A; 3SEM A; 2EQI A; 4OMN A; 1IO6 A; 5GJV B; 4D8D A; 4J9C A; 4QT7 A; 4HCK A; 2GQI A; 3C0C A; 2RQV A; 1MUZ A; 1SSH A; 4RUG A; 2K9G A; 4AFQ C; 1E6H A; 4F14 A; 1M8M A; 2LJ0 A; 1X69 A; 1AD5 A; 2GTJ A; 2RQT A; 1UUE A; 1I0C A; 3REA B; 1UDL A; 4F17 A; 3EG3 A; 2PNI A; 1UJ0 A; 4ZNX A; 2M0Y A; 4JJD A; 1VA7 A; 2CUB A; 2KXD A; 1WX6 A; 1GBR A; 2D1X A; 2DL4 A; 1OOT A; 3QWX X; 1X2Q A; 1H8K A; 2YUQ A; 5HCK A; 2KR3 A; 4Y92 A; 1H3H A; 2MOX A; 1WDX A; 2IIM A; 2J6K A; 5IHI A; 2CH4 A; 5IXB A; 2C0T A; 2YUO A; 4JJB A; 2I0N A; 1M30 A; 2HSP A; 4OML A; 3M0U A; 2V1Q A; 2F2V A; 4M4Z A; 2RQU A; 2YDL A; 5I11 A; 2JXB A; 1VYT A; 1ARK A; 4RTY A; 4Z89 A; 1KJW A; 2EYZ A; 1WI7 A; 2K7A A; 2DBK A; 3UA6 A; 2DJQ A; 5ECA A; 2W0Z A; 2KGT A; 1ZX6 A; 2JW4 A; 1J3T A; 4AFZ C; 2EGE A; 1Y0M A; 2BTT A; 2FPE A; 4CC3 A; 2RMO A; 2GTO A; 2KYM A; 1T3L A; 1V1C A; 3A98 A; 2KEA A; 4X1V A; 1K0S A; 1N5Z A; 2DRK A; 2AK5 A; 1QWF A; 2RQR A; 4HVV A; 2CT4 A; 2RN8 A; 2LJ1 A; 4IIO A; 2B86 A; 2DLP A; 2L3P A; 2DM1 A; 2DMO A; 3ZL7 C; 3ULR B; 2DNU A; 1WYX A; 2PTK A; 2RNA A; 2O9S A; 4CC7 A; 4LNP A; 1H92 A; 3UA7 A; 1NLO C; 4J9D A; 3GBQ A; 2KRM A; 1AVZ C; 1GBQ A; 2L0A A; 4K11 A; 2DIL A; 3U23 A; 2NWM A; 4JZ3 A; 1NEG A; 1WXT A; 2MCN A; 2ROT A; 2E5K A; 1WXU A; 2GGR A; 5I22 A; 3EHR A; 1SPK A; 2SRC A; 1LCK A; 3VS1 A; 1VYV A; 1GCP A; 3EG2 A; 3O5Z A; 1RI9 A; 2A37 A; 3PVL A; 2DF6 A; 3M0T A; 2EYX A; 2CUD A; 1UHC A; 2LQW A; 2J06 A; 2ECZ A; 1G83 A; 3TSZ A; 2FPF A; 1B3Q A; 3M0S A; 1QWE A; 1MV0 B; 1T0H A; 1AWJ A; 2F2X A; 4R0K A; 1QLY A; 5FWB A; 2JM8 A; 2LZ6 B; 1B07 A; 2K3B A; 1XOV A; 1YP5 A; 4J9H A; 5EC7 A; 3I5S A; 2P4R A; 4E6R A; 3EHQ A; 2DL5 A; 1SHF A; 2VKN A; 1YCS B; 1U5S A; 2KRN A; 2JM9 A; 1E7O A; 1BBZ A; 3I5R A; 4LUD A; 3LH5 A; 2FG0 A; 2LNH B; 4RTW A; 1JU5 C; 1M3C A; 1X2K A; 2ABL A; 3VS0 A; 3VS4 A; 1BU1 A; 4Z88 A; 1Z9Q A; 3NMZ C; 2AZS A; 4D8K A; 2KRS A; 1NEB A; 1M27 C; 2O2O A; 2KBT A; 2LCS A; 2A08 A; 4AFS C; 2O31 A; 4RTV A; 1T3S A; 4AG2 C; 1HD3 A; 1WXB A; 1ZLM A; 1X6G A; 1X27 A; 2VWF A; 2XMF A; 1JXO A; 4JJC A; 3TVT A; 1BK2 A; 2KNB B; 2JMA A; 2OAW A; 2DL3 A; 5L23 A; 2CSQ A; 1K9A A; 4RTZ A; 2F2W A; 2X3X D; 2RF0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4XTX A; 2RI3 A; 3CC4 Q; 1JB0 E; 2OTL A; 3CCU Q; 5GAN e; 3TCJ A; 2D0Q B; 3G4S T; 1YIT A; 1Y57 A; 2MYS A; 3G71 T; 3HRS A; 1I07 A; 2M51 A; 3A1P A; 2XKO C; 3LGF A; 4ZGE B; 2DD4 A; 2D6F A; 3NTH A; 4FT2 A; 1OX8 A; 3FRN A; 1KHC A; 5KYW A; 2EQK A; 2VB6 A; 1PRM C; 4OF1 A; 2JTM A; 1TU0 B; 5LJ5 h; 3SWN A; 2QQS A; 4Q5W A; 1B34 B; 4F7U F; 1Q82 R; 1WGS A; 3M53 A; 2R5M A; 2P0K A; 1JQQ A; 2JUF A; 4JS5 A; 4PJO F; 1PM3 A; 3QKJ A; 4FCY A; 3SFM A; 3G71 A; 2GCX A; 4PJO D; 2FB7 A; 2C0I A; 2DXU A; 1FWZ A; 5LJ5 d; 1D1B A; 3S3M A; 2LTO A; 1M4Z A; 1D3B A; 2KXC A; 5J26 A; 3OSS C; 3CCJ Q; 4J9F A; 2P4T A; 3OS2 A; 2QA4 T; 2C0O A; 2V8K A; 1RAH B; 1FMK A; 1KQS P; 4OB2 B; 4CC4 B; 5GMK l; 1ZSZ B; 3M55 A; 5GAN 3; 1PG5 B; 2CZ6 B; 2RHU A; 4M77 B; 1QKX A; 1DJ7 B; 3R6N A; 1PCX A; 1YJ9 Q; 2L3Q A; 2DD5 A; 3QWY A; 3EG0 A; 4RKU E; 1ZUU A; 1I1J A; 3P8D A; 4DOV A; 1QCN A; 5LJ3 h; 5FW9 A; 3QUI A; 4ZTF A; 5D6X A; 1VQ9 Q; 2QA4 A; 3QDF A; 1TXQ A; 4PFO A; 4A63 B; 1UFF A; 3JB9 J; 1M2V B; 1SF9 A; 5CKF A; 2XHC A; 5GAO r; 1YJN Q; 4ZN1 A; 1M8V A; 4N4I A; 1OX9 A; 1JRI A; 2DE0 X; 2IPO B; 1RLP C; 4PL6 A; 3CME Q; 1MMD A; 1CKB A; 2Y90 A; 1Q81 R; 3C12 A; 2J6F A; 1BB9 A; 1K9M R; 2D8H A; 1B7T A; 2JZ2 A; 4HT8 A; 1QW1 A; 3CD6 A; 2K3X A; 2JT4 A; 4AFU C; 2BZX A; 5CIU A; 4GLM A; 1LJO A; 3M57 A; 2EVR A; 1JJ2 A; 3D7S B; 1WQ7 A; 3I56 A; 1OU8 A; 1ZA1 B; 4M7A E; 3R6O A; 2QAZ A; 1W70 A; 4HCZ A; 3NHN A; 1PSF A; 1QVP A; 5HK0 A; 2O4X A; 4FU6 A; 3CPF A; 4M7A C; 2WSE E; 1TSF A; 3REB B; 2EJ9 A; 1TWB A; 2FRY A; 5D7U A; 4IUV A; 1NZ9 A; 2E6N A; 4DEX A; 2L89 A; 1ABQ A; 4E7H A; 1UJY A; 2DKG A; 4IKF A; 2P0P A; 1G5V A; 1K4U S; 1SG5 A; 3L1A A; 4M77 F; 2KYB A; 3T9N A; 2OTJ T; 2EGC A; 3SWN B; 1Y96 A; 1VOM A; 1KD1 U; 1SRM A; 3RMS A; 3OYI A; 3CC2 T; 3EGX B; 3OYD A; 3WXM B; 1BI0 A; 4KUD K; 4LDV A; 4ME7 A; 1UEC A; 1UGV A; 4LD6 A; 5GAN 8; 1EFN A; 4OGE A; 1UEB A; 3V8L A; 4JS4 A; 2VV5 A; 3VS5 A; 3IQL A; 2E3I A; 1YFN A; 3MCA B; 1D09 B; 3OYK A; 5KYX A; 1M1F A; 4DBH A; 5IT9 E; 3EG9 A; 5GAN h; 5IXF A; 2AZV A; 2GF7 A; 3FJ5 A; 1N9S A; 3S3N A; 2X4X A; 2HKN A; 4OVA A; 2OTJ A; 5LJ3 g; 3CQT A; 1EZZ B; 3G7Z A; 4N0A A; 1RLQ C; 5D6W A; 3SEM A; 2EQI A; 4OMN A; 2K57 A; 4FW1 A; 2KAF A; 4M77 D; 4HCK A; 3JCM e; 2RQV A; 2HQH A; 4RUG A; 2K9G A; 4M7A A; 1M8M A; 2YRV A; 1AD5 A; 2VUB A; 5KE3 A; 5GAN d; 2RQT A; 1UUE A; 1I0C A; 3LH0 A; 4E7I A; 4M78 D; 3REA B; 4C92 B; 2CZ7 B; 1N9R A; 4PJO C; 2PNI A; 3RKY A; 1RAE B; 4EMG A; 3JCM W; 3G6E T; 3QPH A; 4A54 A; 2VGM A; 3ASK A; 7AT1 B; 4M78 G; 1X2Q A; 2K4Y A; 2KDS A; 9ATC B; 1H8K A; 2MWP A; 1VQ4 Q; 2DPP B; 5IHI A; 2CH4 A; 5IXB A; 4KBM B; 2RO0 A; 2YUO A; 4JJB A; 4ELZ C; 1M30 A; 5HY6 A; 8AT1 B; 4IUP A; 1I81 A; 2F2V A; 2ZPB B; 1WHJ A; 2NYS A; 1KD1 C; 2K5I A; 1C1A A; 1MMN A; 5FRO A; 2CP2 A; 2D9T A; 5GAM e; 5LJ5 j; 4DA4 A; 1LOJ A; 5GAO l; 1YHQ Q; 4DQ2 A; 2DJQ A; 3G6E A; 2FPE A; 3QZ5 B; 3HL8 A; 3OBY A; 1K0S A; 3CXC A; 1OZ3 A; 2ZPE B; 2RQR A; 4IUR A; 2CT4 A; 3WVE B; 1TOV A; 2DLP A; 1HYO A; 5IAY A; 3CCR Q; 3RES A; 2DMO A; 4PJO A; 2QEX Q; 3FJP A; 4BY6 C; 3CBM A; 1WYX A; 3M4G A; 3MET A; 4CC7 A; 1H92 A; 4C92 F; 3UA7 A; 4J8O A; 1NLO C; 3JCM X; 4PKC C; 3HRU A; 1AVZ C; 1VQO A; 5FU7 C; 2NWM A; 2M02 A; 2MCN A; 3J7A F; 2LX9 A; 2ROT A; 2XG8 D; 2GGR A; 1QVF A; 2SRC A; 1BIB A; 2PVG B; 1LPL A; 3MEW A; 3GP8 A; 1RI9 A; 2DYI A; 4Y91 A; 4C0D B; 4E7K A; 1KC8 R; 1UHC A; 2LQW A; 1Y7X A; 2DZC A; 5DLO A; 3LWI A; 1RAC B; 3LX7 A; 5HK3 A; 2QYZ A; 4R0K A; 4OB0 B; 5FWB A; 5CKD A; 2BE9 B; 4VUB A; 3A8H B; 4IUQ A; 3I55 Q; 1Q7Y U; 4BD3 A; 1LNX A; 4FYV B; 4OB1 B; 1YCS B; 1U5S A; 2KRN A; 2EJF A; 2KK4 A; 3M59 A; 2ZAE A; 3EH1 A; 1M3C A; 2ABL A; 2LQ8 A; 3VS4 A; 1RAA B; 3OSV A; 1YI2 Q; 2PUK B; 2YWW A; 4MZT A; 1JJ2 S; 4D8K A; 1M27 C; 2O2O A; 4RMO A; 3CCL Q; 2A08 A; 4RTV A; 1T3S A; 2QG9 B; 3H9N A; 3OMC A; 3CEY A; 1ZLM A; 3X20 B; 2LCL A; 1ZSZ C; 3CCQ A; 4LDX A; 2OAW A; 1VQ7 A; 4J5Y A; 1JJ2 P; 2R57 A; 4RTZ A; 4EDU A; 2CZ0 B; 4M77 C; 1TTH B; 1OEB A; 4XU3 A; 3VS6 A; 1UGS B; 1VQ5 Q; 2VYT A; 4E7S A; 2LQN A; 3PMT A; 4C5I A; 4E2F B; 2MIO A; 2EBP A; 2ZPG B; 3JCM h; 3LWH A; 2COZ A; 4LDY A; 3VUZ A; 4FM4 B; 5HKC A; 3QDR B; 3RUX A; 4IUT A; 1VQN T; 4JRQ A; 2PVO B; 5LL6 S; 2E3H A; 3JSC A; 2DBM A; 1B34 A; 2DEQ A; 2CZ1 B; 2HD0 A; 1VQK A; 1ZQ1 A; 2J6O A; 3KFV A; 4OMF B; 1YN8 A; 3G71 Q; 1A0N B; 2A28 A; 5GAN j; 3OS5 A; 4IIM A; 1Q7Y C; 3JCM d; 1XNI A; 2MI6 A; 5EG2 A; 2A7Y A; 4OMP A; 4OMO A; 2FHD A; 2ZZD A; 2B8A A; 1VQM T; 4X9C A; 1UTI A; 2FYK A; 3H0I A; 1H3Z A; 3QYH B; 1AOJ A; 2YUN A; 1E6G A; 1ACM B; 4BAC A; 1WJS A; 1HXD A; 1ZSZ A; 4MZP A; 5GAM h; 3FB9 A; 2VGN A; 3SD4 A; 3ZBD A; 4HCC A; 1X43 A; 3H8Z A; 4M77 A; 1AT1 B; 3V7S A; 1TUC A; 2GNC A; 2IG0 A; 3ER0 A; 3MJX A; 3QII A; 1VQ6 T; 2QI2 A; 1CSK A; 4F04 B; 1IHV A; 3L2V A; 4QQG A; 2PUO B; 1G8X A; 1AWO A; 4PFP A; 3OYE A; 2QA4 Q; 1VQM A; 4WTO B; 2LNV A; 3PNW C; 3SWN C; 2E6Z A; 2OTL T; 3J81 E; 4M7A D; 4PNO A; 2DL8 A; 3JCM c; 1YIT T; 3L2R A; 1M2V A; 2G6F X; 1ABO A; 2D8J A; 3QJY A; 3BY7 A; 2RA2 A; 1ZUY A; 2DIG A; 2QTX A; 1BI2 A; 1NYG A; 1FMV A; 1HSQ A; 3X26 B; 4LXC A; 3M4Y A; 1R0B G; 4M7A G; 3I9Q A; 4EIK A; 1WA7 A; 1W2B P; 1VQ6 A; 2YXY A; 1K0X A; 1M3B A; 2FEI A; 3VU3 C; 1PD1 A; 2ESW A; 2DRM A; 2YSQ A; 4KUI A; 1YIJ A; 2EW3 A; 1MGQ A; 2HL5 C; 2GBQ A; 4DBR A; 5GAO n; 1PNJ A; 2EJG A; 4C8Q E; 4KGV B; 2RB6 A; 1V29 B; 4JZ4 A; 3CXC S; 4CRI A; 1AZG B; 2KMT A; 4F16 A; 4OP0 A; 2KE9 A; 2QDL A; 2SEM A; 4BDY A; 4Z02 A; 4C92 E; 2HL3 A; 1SRL A; 4AG1 C; 2QQ9 A; 3X25 B; 4OMM A; 3UF4 A; 3PFS A; 1AZE A; 2VXE A; 3CPW A; 2RPN A; 1NLP C; 1WFW A; 4C92 C; 4II1 A; 3CXC P; 3MEU A; 3OMG A; 1RAD B; 4M75 B; 5FU6 B; 1YJW T; 1RAB B; 5IHK A; 3L2Q A; 2XIC A; 4O6J A; 3P8H A; 4JLI A; 5CK9 A; 1X6B A; 1TUD A; 2L2P A; 5C6S A; 3QJ6 A; 4FYW B; 2RH2 A; 3CCM T; 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