The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
62
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structure length |
62
|
Chain Sequence |
MDRQGFVPAAYVKKLDSGTGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Metal binding protein
|
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN
|
| publication title |
Atomic resolution structure of a mutant of the spectrin SH3 domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
12
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| structure length |
62
|
| sequence length |
62
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-10-18 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LZ6 B; 2YUO A; 2J06 A; 2DVJ A; 2C0T A; 3RNJ A; 4OML A; 2CRE A; 1MUZ A; 1PHT A; 3VS0 A; 2ED0 A; 2KRN A; 2IIM A; 4ZNX A; 2HBW A; 2DLP A; 2J6K A; 1PRL C; 1UTI A; 2YSQ A; 2M51 A; 2KRO A; 1HSQ A; 3EG1 A; 4AFZ C; 2DBM A; 4FSS A; 4F16 A; 2LQW A; 1KIK A; 1NG2 A; 5HCK A; 3EGU A; 3FJ5 A; 5I22 A; 1G2B A; 2CH4 W; 2FPE A; 1AWW A; 2DF6 A; 2LJ3 A; 1X2Q A; 2LJ0 A; 2E5K A; 2EYZ A; 1BK2 A; 2GBQ A; 2KT8 A; 5IXB A; 2ABL A; 2C0O A; 4LUE A; 2EW3 A; 1PNJ A; 2CT3 A; 4RTX A; 3EG2 A; 4J9I A; 4JJC A; 3PVL A; 1J3T A; 1K0X A; 5IHN A; 1SEM A; 2DIL A; 2FPD A; 1IO6 A; 1H92 A; 2KE9 A; 2RNA A; 2FRY A; 2J7I A; 3JV3 A; 3KFV A; 1FMK A; 2BZX A; 2AK5 A; 2FRW A; 1UHC A; 2A37 A; 1HJD A; 2FG0 A; 3M0T A; 3VRY A; 1I0C A; 1WXU A; 5I11 A; 4RUG A; 5EC7 A; 1FYN A; 2OI3 A; 1QLY A; 3REA B; 3VS3 A; 4CC7 A; 3QWX X; 4J9H A; 1JXO A; 3PE0 A; 4J9E A; 2DE0 X; 2O88 A; 2VKN A; 2JM8 A; 2A08 A; 4R0K A; 2RQT A; 1WFW A; 2RQW A; 2J6F A; 1AEY A; 2RMO A; 5IHI A; 1SHF A; 2RQV A; 3SEM A; 1K0S A; 4OMQ A; 2GQI A; 1RLP C; 1QCF A; 4LNP A; 4RTY A; 1BB9 A; 1VYV A; 2O9V A; 1X43 A; 2C0I A; 2DRK A; 2AKK A; 4JJB A; 3CQT A; 1AWO A; 2KYM A; 1Y57 A; 2K6D A; 3SHW A; 1S1N A; 2H8H A; 1GL5 A; 3A98 A; 1M3A A; 1GCQ A; 2CUD A; 3VS7 A; 1WIE A; 2LX7 A; 1RI9 A; 4JZ4 A; 1T0H A; 2D1X A; 5IXF A; 4J9G A; 4K11 A; 2JTE A; 1W70 A; 1M3B A; 1M30 A; 3QWY A; 3RBB B; 2D8J A; 2GTJ A; 1H8K A; 2HCK A; 1V1C A; 2YUP A; 2M0Y A; 2EBP A; 1UJY A; 4D8D A; 4LE9 A; 4LUD A; 1A0N B; 3NPF A; 1UDL A; 1K76 A; 2EVR A; 2CUB A; 1KJW A; 1OV3 A; 1ABQ A; 1CKA A; 1UJ0 A; 2K3B A; 4JZ3 A; 1QWE A; 5FWB A; 2AKL A; 2LCS A; 1ZUU A; 2KRM A; 3VS2 A; 4RTV A; 2ENM A; 1UGV A; 1Y0M A; 1YN8 A; 1W6X A; 2KXC A; 1E6H A; 2MCN A; 3IQL A; 3M0R A; 2KBT A; 2J6O A; 1CKB A; 2EQI A; 3ULR B; 2DBK A; 2DA9 A; 4HVU A; 1UG1 A; 1ZUK A; 4D8K A; 2EPD A; 1ZUY A; 4DEY A; 3EG0 A; 2AZS A; 1AWX A; 2MOX A; 3EG3 A; 1I1J A; 4CC3 A; 1GRI A; 1U5S A; 4Z89 A; 1JEG A; 2JXB A; 2W0Z A; 2SEM A; 1YP5 A; 2EYW A; 1I07 A; 3TSW A; 1LCK A; 1WYX A; 1WXT A; 1WXB A; 2O2O A; 2X3X D; 1YNZ A; 2YUQ A; 1WLP B; 1SPK A; 4AFS C; 4OMO A; 3I5R A; 2YUN A; 2ROT A; 2GTO A; 4HVW A; 3UA7 A; 2L3Q A; 3VS5 A; 1KFZ A; 3M0Q A; 4OMP A; 2JMA A; 2K7A A; 2DL5 A; 1ZBJ A; 2HSP A; 2LNH B; 4E6R A; 2K2M A; 3I9Q A; 2D8H A; 3U23 A; 2CT4 A; 3I5S A; 1T0J A; 2RF0 A; 2OJ2 A; 4WCI A; 2KEA A; 2NUZ A; 4JPB W; 2KR3 A; 1ZSG A; 1NEG A; 3H41 A; 2FO0 A; 2J05 A; 2EYY A; 3O5Z A; 4GLM A; 2DMO A; 3H0H A; 2PZ1 A; 2JS0 A; 2LQN A; 1ABO A; 2DNU A; 4J9D A; 4RTT A; 4M4Z A; 1M8M A; 4RTW A; 3VS1 A; 2VWF A; 2ESW A; 2X3W D; 2YT6 A; 1H3H A; 1JXM A; 2O31 A; 2D0N A; 2CSI A; 2A36 A; 2DRM A; 1TG0 A; 1K1Z A; 4RTU A; 2V1Q A; 4ESR A; 1UEC A; 3UA6 A; 1PRM C; 1QWF A; 2HEQ A; 2DL4 A; 1NLO C; 1OPL A; 2KGT A; 1X27 A; 4QT7 A; 2RQR A; 3C0C A; 2DX1 A; 2JT4 A; 2O9S A; 5GJV B; 2BZY A; 1SHG A; 4F17 A; 1JQQ A; 1W1F A; 1GCQ C; 1E7O A; 1XOV A; 1WDX A; 1KSW A; 2ED1 A; 4AG2 C; 4OMM A; 1G83 A; 1AOJ A; 4Z8A A; 2QDL A; 1X6G A; 1AZG B; 2GNC A; 2KNB B; 2V1R A; 1M3C A; 3VRZ A; 2RN8 A; 1VYU A; 2B86 A; 1PKS A; 2K9G A; 3UAT A; 1TUC A; 1GBQ A; 2ROL A; 2KRS A; 2K79 A; 1T3S A; 1TUD A; 2LMJ A; 5FWC A; 2AZV A; 1B07 A; 1MV3 A; 1U06 A; 2F2V A; 4X1V A; 1SSH A; 1AWJ A; 4J9F A; 2EKH A; 4CC4 B; 3M0U A; 4Y92 A; 2DL8 A; 1K4U S; 4RTZ A; 2KT1 A; 2L0A A; 2EYX A; 1JO8 A; 1RUW A; 2NWM A; 3NGP A; 1JU5 C; 1OEB A; 2LP5 A; 1WX6 A; 3EHR A; 2HDA A; 4AG1 C; 2CSQ A; 2FPF A; 4JJD A; 3ZL7 C; 2EGC A; 2MIO A; 2P4R A; 1UUE A; 2JS2 A; 1GCP A; 2I0N A; 1ZLM A; 2F2W A; 4KRT A; 3H0F A; 1T3L A; 1AZE A; 2CH4 A; 1GFD A; 5L23 A; 4A63 B; 3GBQ A; 2JW4 A; 1X69 A; 3LH5 A; 1CSK A; 1E6G A; 2LJ1 A; 2RQU A; 2BTT A; 1YCS B; 2PNI A; 1UHF A; 1PWT A; 1K9A A; 1U3O A; 5IH2 A; 1NYG A; 1WI7 A; 2A28 A; 2DL3 A; 2XMF A; 1Z9Z A; 4IIM A; 2PTK A; 2RPN A; 2SRC A; 4ORZ A; 3R6N A; 2DL7 A; 2YDL A; 4J9B A; 3H0I A; 4J9C A; 4F14 A; 1YWO A; 5GJW B; 3REB B; 5IHK A; 3EHQ A; 4CC2 A; 1QKW A; 3NHN A; 1HD3 A; 2JMC A; 1SRL A; 2KXD A; 2L2P A; 5FW9 A; 4DEX A; 1AD5 A; 3TSZ A; 1X6B A; 1VYT A; 1BBZ A; 3THK A; 4HVV A; 3VS4 A; 1SRM A; 3M0S A; 1Z9Q A; 1UE9 A; 1ARK A; 2FEI A; 4HXJ A; 4IIO A; 2L3P A; 1WA7 A; 1GBR A; 1OPK A; 1NLP C; 1N5Z A; 3I35 A; 1PKT A; 4OMN A; 1ZX6 A; 2L3S A; 2W10 A; 1EFN A; 2VVK A; 1X2K A; 1M27 C; 2KYB A; 1NM7 A; 3UF4 A; 1NYF A; 3PVQ A; 4EIK A; 1OOT A; 2DM1 A; 1RLQ C; 2EGA A; 4HCK A; 4AFQ C; 1BU1 A; 1NEB A; 4LN2 A; 1MV0 B; 1AVZ C; 3NMZ C; 3M0P A; 2GGR A; 3TVT A; 1QKX A; 4AFU C; 2OAW A; 2DYB A; 2ECZ A; 1VA7 A; 4GBQ A; 2F2X A; 1B3Q A; 2JM9 A; 2DJQ A; 5ECA A; 1YWP A; 1UFF A; 4Z88 A; 3VS6 A; 1GFC A; 2BZ8 A; 2EGE A; 2G6F X; 2CDT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1RAB B; 2JNG A; 5GAN 6; 1NPR A; 4L59 A; 2DVJ A; 1WQW A; 3F70 A; 3CCM Q; 3V7R A; 1JB0 E; 1OX8 A; 1KD1 U; 1MUZ A; 1PHT A; 3VS0 A; 1NJI C; 2VGN A; 5FU6 C; 2KRN A; 3JB9 F; 2IIM A; 2HBW A; 2DLP A; 5CO7 A; 1PRL C; 4RCB A; 2KRO A; 1ZHI A; 1H3Z A; 3QKJ A; 3CPW P; 1PG5 B; 1NG2 A; 3FJ5 A; 5I22 A; 1ZSZ A; 2FPE A; 3CCL Q; 2DF6 A; 4HCB A; 3ZBD A; 1BK2 A; 2KT8 A; 3X25 B; 2PUO B; 2EW3 A; 2F5T X; 3EG2 A; 4J9I A; 4JJC A; 5LJ3 j; 3PVL A; 2E64 A; 3S6W A; 1K0X A; 1KK7 A; 1WHM A; 1W2B S; 4M78 D; 3QSU A; 2J7I A; 3JV3 A; 5KYU A; 4M77 B; 3VKI A; 3CC2 A; 1HJD A; 5GAO r; 2LT1 A; 1WJR A; 3VRY A; 5I11 A; 4A53 A; 5EC7 A; 2VYT A; 1ZA1 B; 1OU9 A; 4J5Y A; 5GAN 7; 3REA B; 4PJO B; 2QDY B; 3QWX X; 3PE0 A; 1YJ9 T; 4WF2 A; 4J9E A; 9ATC B; 1VQ7 T; 2DE0 X; 2O88 A; 1V29 B; 3OS1 A; 1LVK A; 5KE2 A; 2H3J A; 2RQW A; 1PSE A; 3UT1 A; 2RMO A; 3SEM A; 3X28 B; 2GQI A; 4M7D D; 1EZZ B; 1VQO A; 5GAN f; 2V8I A; 1F1B B; 2ATC B; 2RJF A; 4OGE A; 1BB9 A; 2ZPF B; 4YTL A; 5KYU B; 4JJB A; 3ASK A; 3MEU A; 4X34 A; 2X51 A; 1WHG A; 3JCM Q; 2KY9 A; 1WQ7 A; 3L42 A; 4EMK B; 4PNO A; 1M3A A; 1GCQ A; 4F7U A; 2DZC A; 3L2U A; 4E7S A; 5GAN d; 3CC2 Q; 1RI9 A; 2QI2 A; 2Z0W A; 2GF7 A; 1VQK A; 4ZGD B; 3M58 A; 4J9G A; 2JTE A; 1M30 A; 4KGX B; 2D8J A; 2IPO B; 2KI7 A; 1Q86 R; 2HCK A; 4N4G A; 4F7U G; 2EBP A; 3E9F A; 2XIC A; 4D8D A; 1A0N B; 1UDL A; 1C6V X; 1YJN A; 1VQN T; 3OYE A; 3JCM X; 5AYF A; 2GFU A; 4E7I A; 2PUK B; 3PIO A; 2ZGW A; 3RES A; 4M75 B; 4LDW A; 1MMA A; 1OYX A; 1KC8 U; 3TU4 K; 4KUL A; 2DJZ A; 4M77 D; 2LQ8 A; 2CZ6 B; 1YN8 A; 4M7A A; 2NUT B; 3BY7 A; 3V7C A; 1TSF A; 2EQI A; 4M78 C; 4EMG A; 4MMK A; 3PGG A; 1OX9 A; 2DA9 A; 2ZPE B; 2HL3 A; 3MEV A; 1MGQ A; 3EGX B; 4M7A G; 4AMC A; 1XQH A; 3CCL T; 3BDL A; 2XHC A; 4FT4 A; 4CC3 A; 1K9M C; 1U5S A; 4B9X A; 1JEG A; 2SEM A; 3D7S B; 1IXD A; 2EYW A; 4DOW A; 3T9N A; 3GNG A; 1TH7 A; 2D0Q B; 2P4T A; 2YRD A; 3EG9 A; 2O2O A; 4BI3 A; 3I56 A; 3CBO A; 2YUQ A; 1SPK A; 4LDU A; 4OMO A; 1YI2 A; 2GTO A; 1M90 R; 4C8Q B; 3CMA T; 3M0Q A; 4M7D C; 2DZ9 A; 2DL5 A; 1NZ9 A; 5CQX A; 4EPC A; 2KMT A; 2LNH B; 3OW2 S; 3X20 B; 4C5E A; 5HK0 A; 5GAN e; 1T0J A; 2RF0 A; 1NJI U; 4WCI A; 3FRN A; 4JPB W; 3WVD B; 3O8V A; 1ZSG A; 2QG9 B; 2HMA A; 1C1A A; 5J3B A; 1D3B B; 4A54 A; 1WHL A; 3VUZ A; 1R8O B; 1UGQ B; 3S3N A; 4BB7 A; 2M9U A; 2JS0 A; 4HT9 A; 2FB7 A; 1ABO A; 2VGM A; 4RTT A; 3OQ5 A; 2X3W D; 2HBP A; 1H3H A; 1JXM A; 4QQ6 A; 2A36 A; 4PJJ A; 2A0F B; 2DRM A; 4C5G A; 2X4Y A; 1TG0 A; 2DXC A; 1K1Z A; 1IB8 A; 1K73 R; 4ESR A; 3UA6 A; 1PRM C; 3PT9 A; 4P5N A; 1YI2 Q; 3OYC A; 2HEQ A; 2DL4 A; 2KGT A; 2EQJ A; 1WGS A; 4QT7 A; 3JCM c; 4JRP A; 2K5I A; 2O9S A; 2BZY A; 4MZP A; 2P0P A; 4F17 A; 1W1F A; 2Y90 A; 1PC0 A; 1WDX A; 1KSW A; 2L89 A; 1G83 A; 1KQS A; 3EFS A; 4LD6 A; 2QDL A; 2QA4 A; 4PJO C; 5LJ5 h; 2XDP A; 2RJC A; 2CP0 A; 3G6E A; 2K57 A; 2K9G A; 5HK3 A; 1QW1 A; 4C8Q D; 1T3S A; 2XG8 D; 3J7A F; 4C92 C; 2R5A A; 1SG5 A; 3CCJ A; 1U06 A; 1QCN A; 3SFM A; 1AWJ A; 2RHU A; 4CC4 B; 3M0U A; 1K4U S; 4RTZ A; 2KT1 A; 4JUV A; 1WZO A; 1RUW A; 3KUF A; 2EKO A; 5GAM f; 2MI6 A; 4EMK C; 3OS2 A; 4J6X A; 5J26 A; 2RHZ A; 3OYH A; 5KYX A; 2FPF A; 3ZL7 C; 1MMG A; 2WSE E; 3QJY A; 5GMK i; 2M16 A; 1TU0 B; 2IG0 A; 4QQG A; 3RMQ A; 2QA4 Q; 1ZLM A; 4UC4 A; 5GAM d; 1BI3 A; 1T3L A; 1AZE A; 1N8R R; 4XTV A; 2CH4 A; 1GFD A; 3H9N A; 3BW1 A; 5L23 A; 4A63 B; 2ZZD A; 2LVM A; 2EYQ A; 3BDU A; 1CSK A; 5KYW A; 4KH0 B; 1TUG B; 2RQU A; 2BTT A; 2PNI A; 1RAI B; 2EJF A; 1K9A A; 3CCJ Q; 2DL3 A; 4RCC A; 1Z9Z A; 4M75 C; 2PTK A; 3OMG A; 3OBW A; 2QK0 A; 4ORZ A; 5HY6 A; 3H0I A; 4F14 A; 5GJW B; 1FX7 A; 4PLL A; 4IUT A; 5DLQ E; 4XTX A; 4D6W A; 2MF2 A; 4ME7 A; 4PJM A; 2YWW A; 1AD5 A; 5GAN h; 1YIJ Q; 4FYY B; 4FM4 B; 4II1 A; 4HCC A; 4N0A C; 1MMD A; 3M0S A; 2LDM A; 1K9M U; 1Q86 C; 1PM3 A; 2FEI A; 3QXE B; 5KYY B; 2HL5 C; 1GBR A; 3G71 Q; 2COZ A; 3UPU A; 1N5Z A; 3I35 A; 3MPU B; 4OMN A; 4LDY A; 2L3S A; 3V8J A; 3CXC S; 2W10 A; 2MWP A; 3OB9 A; 5LJ5 g; 1M27 C; 3OYD A; 1TTH B; 4IKF A; 1NYF A; 3PVQ A; 3JB9 G; 5LJ3 d; 2EGA A; 1X6O A; 2CZ0 B; 1BCO A; 2F5K A; 3SWN A; 5C6S A; 3TVT A; 5FRO A; 1B34 B; 1QKX A; 3KBG A; 2OAW A; 4RKU E; 3UWN A; 2ECZ A; 3AHU A; 3SDZ A; 2F2X A; 3HRU A; 2LNV A; 1PD1 A; 1YWP A; 4C8Q G; 3V8K A; 3VS6 A; 3MP8 A; 5GAM e; 4OB2 B; 2RHI A; 4DBH A; 3CC4 A; 4OB0 B; 3BE3 A; 2C0T A; 3ER0 A; 3OA6 A; 3I55 T; 4LD9 K; 3A8H B; 3M54 A; 3OS5 A; 3PFS A; 5AT1 B; 3OY9 A; 3WVE B; 1VQ4 A; 4ZNX A; 2RJE A; 2JOY A; 2J6K A; 2FYK A; 2EIF A; 2DO3 A; 5GMK h; 2DIG A; 2QTX A; 2RHX A; 4AFZ C; 2DBM A; 4F16 A; 2LQW A; 4OB1 B; 1VQP A; 3EGU A; 1G2B A; 4DA4 A; 2E5K A; 2GBQ A; 4M77 F; 1JJ2 S; 2OTL Q; 2ABL A; 2C0O A; 1PNJ A; 5CAI A; 2RI2 A; 5CKE A; 1J3T A; 3PTA A; 2Y4Y A; 3JCM W; 1QP3 A; 1IO6 A; 1H92 A; 2RNA A; 2FRY A; 2E6N A; 5IT9 E; 3HTR A; 1P92 A; 2BZX A; 5FLX E; 1UHC A; 2A37 A; 2JUF A; 2L8D A; 4QVZ A; 2DAQ A; 2QQA A; 1K73 C; 3CBM A; 2PVD B; 1VQ4 Q; 1QVG S; 2RH2 A; 2X4W A; 2MMP A; 1TS9 A; 4J9H A; 2E5Q A; 1YBY A; 3CBP A; 4FSX A; 1HK9 A; 1Q7Y U; 1WFW A; 5FRM A; 3CPW A; 4N4I A; 3V7S A; 1D1A A; 3OYB A; 3C95 A; 1AEY A; 4IUQ A; 5IHI A; 1YIJ T; 4M77 E; 1K0S A; 2ZCF B; 1MNE A; 3ZEH A; 1RLP C; 2CZ7 B; 1IRE B; 1OZ3 A; 1Q81 C; 2O9V A; 2C0I A; 2DRK A; 3G71 T; 2XDD A; 4LDV A; 2K6D A; 3CCS A; 3SHW A; 3SD4 A; 3JCM V; 1GL5 A; 5GAM j; 2MK5 A; 2CUD A; 3VS7 A; 5KE3 A; 3C94 A; 3TRE A; 2GTJ A; 1V1C A; 5CIU A; 4PJL A; 5CVI A; 3NPF A; 4ZGJ B; 4BY6 B; 2CUB A; 1AT1 B; 1MHN A; 2FL7 A; 1ABQ A; 3M57 A; 1C0M A; 1CKA A; 2E4H A; 3HHT B; 5D6X A; 1Y07 A; 1EIF A; 4QKU A; 3GOX A; 1M9S A; 5FWB A; 1N27 A; 1D0Z A; 2KRM A; 3JB9 J; 4RTV A; 2ENM A; 4PKC C; 5CKH A; 2CGH A; 3CCS Q; 1FWZ A; 1Y0M A; 2KXC A; 3M0R A; 3E19 A; 4MML A; 1PD0 A; 1CKB A; 2DBK A; 1ZUK A; 2HSE B; 2BE7 D; 4J7F A; 4D8K A; 3H8Z A; 2EPD A; 2X4X A; 4FW2 A; 2EFI A; 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