The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
VRRVKTIYDCQADNDDELTFIEGEVIIVTGEEDQEWWIGHIEGQPERKGVFPVSFVHILSD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing
|
| publication title |
Structural basis of the recognition of the SAMP motif of adenomatous polyposis coli by the Src-homology 3 domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
13
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| structure length |
61
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| sequence length |
61
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-12-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DJQ A; 1NG2 A; 2LP5 A; 2SRC A; 1ZLM A; 1WXT A; 2FPD A; 2O2O A; 4OMN A; 3UF4 A; 3R6N A; 2KR3 A; 1EFN A; 2YUQ A; 3H0F A; 1UGV A; 1K4U S; 1QKW A; 2H8H A; 4J9C A; 4ZNX A; 1YN8 A; 2HBW A; 1WXB A; 3EGU A; 2JM8 A; 2BZY A; 4F14 A; 4RUG A; 4JZ3 A; 2L3Q A; 2JXB A; 4AFZ C; 4JZ4 A; 4CC4 B; 5IXB A; 1SRL A; 2NWM A; 3TSW A; 3PVQ A; 3UA7 A; 3VS0 A; 3VRY A; 1M27 C; 4D8D A; 1ABO A; 1JEG A; 2RNA A; 2KYB A; 1K0X A; 2KXC A; 2EQI A; 1NEB A; 1GFC A; 2C0I A; 3THK A; 1BK2 A; 1M3C A; 2DA9 A; 1X27 A; 2DIL A; 1E6G A; 2DNU A; 2K9G A; 4A63 B; 3CQT A; 2K2M A; 2PNI A; 2RQV A; 1K1Z A; 1TUD A; 1B07 A; 2GTO A; 2D1X A; 3UAT A; 4EIK A; 2YUO A; 5IHK A; 2D8J A; 4JJC A; 2I0N A; 1SHF A; 2A36 A; 2SEM A; 1NM7 A; 1AEY A; 2PZ1 A; 1AWW A; 2EPD A; 2V1Q A; 2D0N A; 1AD5 A; 2BTT A; 4HVW A; 2DRM A; 4J9H A; 1WLP B; 1OV3 A; 1KFZ A; 1RLP C; 2L3P A; 3EG1 A; 2W10 A; 2OI3 A; 5I11 A; 4J9I A; 4QT7 A; 2K7A A; 3NMZ C; 2LJ3 A; 2ROT A; 2AZS A; 3M0P A; 1XOV A; 3EG0 A; 2J06 A; 5L23 A; 3H0I A; 4DEY A; 1B3Q A; 2EYZ A; 1T3L A; 1WI7 A; 4AFQ C; 1IO6 A; 5ECA A; 2KNB B; 2GGR A; 2JMC A; 1OPK A; 1X6B A; 4LUD A; 1NLO C; 2M51 A; 1GL5 A; 1QLY A; 3QWY A; 2RF0 A; 2RQR A; 3PE0 A; 2RN8 A; 2X3X D; 1MV0 B; 2F2V A; 1UHC A; 1Y57 A; 2OAW A; 1H8K A; 2YDL A; 2OJ2 A; 2DRK A; 1UJY A; 3EHR A; 3EG2 A; 1WDX A; 1RLQ C; 2CT3 A; 1BU1 A; 2DL5 A; 2YSQ A; 2AZV A; 1PKS A; 3NPF A; 4RTZ A; 3RNJ A; 3SEM A; 1S1N A; 3ULR B; 1TUC A; 1NYG A; 1N5Z A; 2XMF A; 1G2B A; 1VYV A; 1UE9 A; 1ARK A; 1WFW A; 2CDT A; 2L2P A; 2EGA A; 1FYN A; 1VYU A; 5FWC A; 2VWF A; 1J3T A; 4RTU A; 1LCK A; 4OMP A; 1PNJ A; 2ECZ A; 1YCS B; 1JO8 A; 1CKB A; 1OEB A; 3NHN A; 2JM9 A; 2KRM A; 2KRO A; 4IIM A; 1PWT A; 1AWJ A; 2F2X A; 1T0H A; 3M0T A; 1GRI A; 2KEA A; 2MCN A; 5IHN A; 4OMQ A; 2A37 A; 3EHQ A; 4HVV A; 4JJD A; 2GQI A; 2C0T A; 3M0R A; 1M3A A; 2L3S A; 4M4Z A; 2QDL A; 4F16 A; 4E6R A; 2EGC A; 2LMJ A; 1UTI A; 2F2W A; 1UG1 A; 2JW4 A; 4CC2 A; 2W0Z A; 1QWF A; 3VS4 A; 2VVK A; 2DMO A; 1A0N B; 2KRN A; 4Z8A A; 3UA6 A; 3I5R A; 2C0O A; 3VS6 A; 2DX1 A; 2LCS A; 2EVR A; 2GBQ A; 2L0A A; 2CRE A; 1WYX A; 2LQN A; 1UFF A; 5IH2 A; 1UDL A; 1ZX6 A; 3IQL A; 4J9G A; 5FWB A; 1TG0 A; 5GJV B; 2FRY A; 1GBR A; 1U3O A; 3RBB B; 2K3B A; 4D8K A; 4OML A; 1AZG B; 3U23 A; 2EGE A; 1BB9 A; 2FRW A; 2HEQ A; 2RQT A; 2DL4 A; 4J9F A; 4FSS A; 2IIM A; 1HSQ A; 2EYW A; 1SHG A; 4HCK A; 3VS1 A; 2O31 A; 2ENM A; 3QWX X; 2FO0 A; 1NEG A; 1UEC A; 2K6D A; 1ZUY A; 2LZ6 B; 1E7O A; 1PHT A; 1GBQ A; 2RPN A; 1AWO A; 4LNP A; 2KT1 A; 2ED0 A; 1Y0M A; 4ORZ A; 3VS5 A; 2DF6 A; 1UJ0 A; 2DLP A; 2E5K A; 4RTW A; 4WCI A; 2HDA A; 2ED1 A; 1WA7 A; 2KYM A; 1I0C A; 2A28 A; 1M8M A; 3EG3 A; 4J9D A; 1CKA A; 1H92 A; 1T0J A; 2FPE A; 4KRT A; 1HJD A; 4AFS C; 4Z88 A; 3FJ5 A; 1X2Q A; 1VYT A; 1MUZ A; 1WX6 A; 4LE9 A; 2LJ0 A; 1X6G A; 2HCK A; 4AFU C; 1YP5 A; 4R0K A; 3TSZ A; 5GJW B; 2JMA A; 1OPL A; 2RQW A; 5IXF A; 1ABQ A; 2V1R A; 1UHF A; 3JV3 A; 2CSI A; 2CUD A; 1I1J A; 2O88 A; 1GFD A; 2GNC A; 3I35 A; 1QCF A; 1VA7 A; 2O9S A; 4Z89 A; 4J9B A; 2DM1 A; 4RTT A; 1M30 A; 2DL7 A; 4Y92 A; 1CSK A; 1Z9Z A; 3REB B; 2DBK A; 1W6X A; 1E6H A; 1YWO A; 2EBP A; 4LN2 A; 4HVU A; 4J9E A; 2CH4 A; 1YWP A; 2HSP A; 3M0S A; 1K0S A; 2FPF A; 1QKX A; 1SSH A; 2LNH B; 2MIO A; 2DL3 A; 1AWX A; 1SPK A; 2BZ8 A; 2LQW A; 2KBT A; 3SHW A; 2YUP A; 3TVT A; 2O9V A; 3REA B; 2LJ1 A; 1X43 A; 2JTE A; 1AZE A; 1H3H A; 1BBZ A; 1JQQ A; 3M0U A; 2KXD A; 2KE9 A; 2RMO A; 1M3B A; 1K76 A; 1V1C A; 1Z9Q A; 3LH5 A; 4JJB A; 1FMK A; 4IIO A; 3NGP A; 2JS2 A; 3A98 A; 2GTJ A; 2FEI A; 4CC7 A; 1W70 A; 4GLM A; 1NYF A; 1SEM A; 2K79 A; 1WXU A; 2CSQ A; 1U5S A; 1WIE A; 4OMO A; 2KT8 A; 2AK5 A; 2EW3 A; 2FG0 A; 1MV3 A; 3I5S A; 1K9A A; 5FW9 A; 4DEX A; 1U06 A; 3VRZ A; 2P4R A; 4ESR A; 2LX7 A; 3H0H A; 3VS3 A; 1KSW A; 5IHI A; 5EC7 A; 2DYB A; 4F17 A; 2CH4 W; 2J05 A; 1AVZ C; 1ZUK A; 1X2K A; 4AG2 C; 2MOX A; 1GCQ C; 2CT4 A; 2CUB A; 4RTX A; 2BZX A; 2X3W D; 2A08 A; 4RTY A; 3M0Q A; 1JXM A; 2KRS A; 3ZL7 C; 3C0C A; 2AKL A; 2YUN A; 3PVL A; 2ROL A; 1RUW A; 2JS0 A; 1KJW A; 2YT6 A; 1PRM C; 3VS7 A; 4OMM A; 3O5Z A; 1W1F A; 1YNZ A; 1RI9 A; 1GCP A; 2D8H A; 1JXO A; 2DBM A; 1QWE A; 2J6F A; 1UUE A; 2B86 A; 2J7I A; 2J6O A; 1NLP C; 4HXJ A; 1SRM A; 2JT4 A; 2G6F X; 1GCQ A; 1X69 A; 1PKT A; 4CC3 A; 2RQU A; 1ZBJ A; 1T3S A; 3KFV A; 4RTV A; 2NUZ A; 1OOT A; 2DVJ A; 4GBQ A; 2EKH A; 4K11 A; 4X1V A; 1PRL C; 5I22 A; 1ZUU A; 1AOJ A; 1ZSG A; 2DL8 A; 3VS2 A; 4JPB W; 1JU5 C; 2AKK A; 3I9Q A; 2M0Y A; 2J6K A; 2VKN A; 1HD3 A; 4AG1 C; 2PTK A; 4LUE A; 2DE0 X; 3H41 A; 3GBQ A; 5HCK A; 1G83 A; 2EYX A; 2KGT A; 1KIK A; 1I07 A; 2EYY A; 2ABL A; 2ESW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2XK0 A; 4BY6 B; 1NG2 A; 3WXM B; 4GLK A; 3OYL A; 4XAX B; 4M78 A; 3UF4 A; 4C92 F; 3VYH B; 1EFN A; 2YRV A; 2YUQ A; 4HCC A; 2K3Y A; 3PIO A; 4E7J A; 1K4U S; 2H8H A; 4J9C A; 2P4T A; 2LT4 A; 1I5O B; 2HBW A; 2LCL A; 1C1A A; 4QQ6 A; 4Y91 A; 4ZTF A; 4JZ3 A; 2L3Q A; 2JXB A; 3CCM T; 4JZ4 A; 2KY9 A; 1SRL A; 5FU6 C; 4KT0 E; 4BY6 C; 3UA7 A; 2QQB A; 3CBP A; 3OQ5 A; 1ABO A; 1K0X A; 2KYB A; 1PM3 A; 4C92 E; 4FIB A; 2XDB A; 3CCQ A; 2MAM A; 3V7C A; 3KBG A; 4R56 A; 1BK2 A; 3MJX A; 1M3C A; 5IN1 A; 4IUT A; 4A63 B; 2C06 A; 3JB9 F; 3M59 A; 1G8X A; 2PNI A; 1K1Z A; 4A4H A; 1AT1 B; 1QP3 A; 5IHK A; 3OYH A; 3CCL Q; 1Q82 U; 4NS5 A; 1P92 A; 2GQV A; 2I0N A; 1SHF A; 3CCR A; 1NM7 A; 2NUT A; 1WJR A; 1AD5 A; 4HVW A; 4C92 D; 1WLP B; 2DZC A; 2P84 A; 5LJ3 j; 1KFZ A; 2W10 A; 1DJ7 B; 4J9I A; 2Y90 A; 4QT7 A; 2RJC A; 3H6Z A; 3JCM d; 3NMZ C; 1MGQ A; 2ROT A; 2AZS A; 4FW2 A; 1MMN A; 3CC4 Q; 2QEX Q; 3QJY A; 1YIT A; 1WI7 A; 1BIA A; 3HRU A; 1KG1 A; 4EPC A; 3L42 A; 5LJ5 h; 2JMC A; 1NLO C; 1GL5 A; 1WHK A; 2HBP A; 1QLY A; 3QWY A; 5AT1 B; 2BUD A; 2WSF E; 3PE0 A; 3LLR A; 1O9S A; 1VQM T; 1VQ5 Q; 2EIF A; 1D1B A; 1UHC A; 3L1A A; 4IKF A; 3JB9 D; 2YDL A; 2DRK A; 3EHR A; 3GLX A; 1X01 A; 2PVG B; 3V7S A; 2YSQ A; 2KK4 A; 2DEQ A; 4FT2 A; 2FL7 A; 3OYC A; 3FIF A; 4JS5 A; 1Q82 C; 1JRI A; 3SEM A; 5CCA A; 3ULR B; 1YJ9 T; 2X9H A; 2KQW A; 4KGX B; 3QG1 A; 2EQM A; 5C0M A; 1YJN T; 1FYN A; 5CO7 A; 5CR2 A; 1VYU A; 3OYG A; 4RTU A; 2ZAE A; 5D6W A; 2P0K A; 4J6X A; 4OMP A; 2CYZ B; 4PFZ A; 4XTW A; 3JAM E; 4Z02 A; 1VQK T; 4GY5 A; 1JO8 A; 2K5F A; 3CC2 T; 4DQ2 A; 3NHN A; 3OMC A; 1FMW A; 2JM9 A; 2KRM A; 3A5Z B; 3OYI A; 2VV5 A; 1YJN Q; 3G1J A; 1VQ8 A; 3RES A; 1D0X A; 3M0T A; 2YXY A; 2KEA A; 2DXT A; 1WGS A; 4OMQ A; 5IHN A; 1VQK Q; 1VQ6 A; 4HVV A; 1M1K R; 2HAX A; 3X24 B; 4JJD A; 2VGN A; 4PNO A; 4M4Z A; 5GAN h; 3QO3 A; 4NL3 A; 2W0Z A; 2CGH A; 3HFN A; 2LQ8 A; 1M9S A; 1A0N B; 3UDC A; 4HT8 A; 3I5R A; 2DX1 A; 3L2W A; 2QTV A; 4F7U F; 3JCM h; 2EWN A; 1UDL A; 4A54 A; 5FRM A; 4Y28 E; 4FCY A; 3RBB B; 2K3B A; 3M53 A; 4D8K A; 1AZG B; 1N27 A; 2EGE A; 5KYN A; 1ZHI A; 2QA4 T; 1R0B G; 4FSS A; 3P8H A; 1HSQ A; 3TCJ A; 1FWZ A; 2EYW A; 3INZ A; 5A0D A; 5I2S A; 4ZN1 A; 2M1H A; 5CKH A; 2JNG A; 4VUB A; 4BE0 A; 1OZ2 A; 1ZUY A; 2LZ6 B; 2YWW A; 4F7U E; 1RAD B; 5DM7 R; 3M9Q A; 5KE2 A; 2HZY A; 2KT1 A; 1Y0M A; 3BDU A; 4ORZ A; 2RK2 A; 4WCI A; 5I21 A; 5DLQ E; 1KD1 U; 2XKO C; 1I0C A; 2A28 A; 2E5Q A; 2MWO A; 5HKC A; 3M4G A; 3TU4 K; 3BFM A; 3I55 A; 2RB6 A; 3LX7 A; 1T0J A; 2FPE A; 2ZPH B; 3PGG A; 1BCO A; 1X2Q A; 1VYT A; 2DO3 A; 3MEV A; 4F04 B; 2XD0 A; 3KUF A; 3CCQ Q; 1WX6 A; 2FZC B; 2JN0 A; 4AFU C; 1YP5 A; 2KI7 A; 1M1G A; 1PSF A; 3JV3 A; 2CSI A; 1IXD A; 1K9M U; 1I1J A; 1B7T A; 5GAM j; 1GFD A; 2GNC A; 2K4Y A; 4RG8 A; 3CCR Q; 2A7Y A; 3DLM A; 3JCM e; 2VUB A; 3SWN B; 1V76 A; 3FDR A; 4Y92 A; 3V8L A; 1Z9Z A; 3REB B; 2DBK A; 1W6X A; 5KH6 A; 1E6H A; 1M4Z A; 3VYG A; 2EKO A; 1YIT T; 3AHU A; 1SG5 A; 2EBP A; 4LN2 A; 2CH4 A; 2BE9 B; 3M0S A; 1PD0 A; 2VGM A; 3WVE B; 3BW1 A; 1QKX A; 3TRE A; 1SSH A; 2L8D A; 3MP6 A; 1KC8 C; 4PJO G; 2PUO B; 4LD9 K; 4X34 A; 2MIO A; 1YIT Q; 1QCO A; 5KYX B; 3GP8 A; 2GFU A; 4LDX A; 1Q86 C; 3ZBD A; 2O9V A; 2LJ1 A; 1X43 A; 1AZE A; 4L6V 5; 1BBZ A; 1JQQ A; 4B6M A; 2NUP B; 4OVA A; 4C5G A; 1Q7Y U; 2KXD A; 1BIB A; 5LL6 S; 1M3B A; 1KQ1 A; 1R8O B; 5CKE A; 4C0D B; 3OBW A; 1VIF A; 1HK9 A; 4KH1 B; 3LH5 A; 4JJB A; 1FMK A; 3A98 A; 1BKB A; 2GTJ A; 5LJ3 g; 2EQK A; 4GLM A; 4XTV A; 3UWN A; 2K79 A; 1YIJ Q; 4M7D F; 2YRC A; 2KT8 A; 2AK5 A; 3CXC P; 2RHI A; 1UEB A; 4ANJ A; 3SWN A; 1Y96 B; 4DEX A; 3OSV A; 1U06 A; 3EH2 A; 3VRZ A; 2MPX C; 2L3R A; 4OF1 A; 2CZ0 B; 5CKF A; 2HNI A; 3VS3 A; 1VQ8 T; 2DYB A; 4F17 A; 2VXE A; 2DER A; 3QYG B; 1TTH B; 4ZGD B; 4F7U G; 1RAH B; 1KHI A; 1H64 1; 3M54 A; 2RI3 A; 8ATC B; 2QAZ A; 5GAN 3; 4RTX A; 2XDD A; 1VQ8 Q; 4M7D E; 2X3W D; 5KYX A; 2DKG A; 3ZL7 C; 1RI0 A; 2YUN A; 1BI1 A; 2ROL A; 1VQ6 Q; 1RUW A; 1PRM C; 3A8G B; 1Q7Y C; 1D0Z A; 4CI0 C; 1KC8 R; 4OMM A; 3O5Z A; 1RI9 A; 1IB8 A; 4E2F B; 5GAM f; 1GCP A; 3JRZ A; 4FYW B; 2J6F A; 1W2B P; 5FU7 B; 2J6O A; 1NLP C; 4HXJ A; 2DJZ A; 1WHG A; 2JT4 A; 2X4X A; 1UGQ B; 3TEE A; 4M7D D; 1M5Q 1; 1JB0 E; 1V29 B; 2M02 A; 4GBQ A; 2COZ A; 3CD6 A; 4J5Y A; 5I22 A; 1K8A C; 1ZSG A; 5DLO A; 4A4F A; 3VUZ A; 2V26 A; 3MKD A; 1B34 B; 1Y96 A; 1BCM A; 3QZ9 B; 3H41 A; 1UGP B; 3GBQ A; 5HCK A; 2LCC A; 2NLU A; 2KGT A; 4EMK C; 2ABL A; 4J6Y A; 5FU7 C; 1ACM B; 2SRC A; 3JCM b; 3DKM A; 1WXT A; 2FPD A; 2O2O A; 4OMN A; 2FB7 A; 1M90 U; 1PCX A; 2E65 A; 3CPW P; 1QKW A; 3RIR A; 1VQ5 A; 1WHL A; 2E3H A; 2I2L A; 1HXD A; 3EGU A; 3O8V A; 4F14 A; 2A0F B; 2D6F A; 1IHW A; 4EMK A; 2NWM A; 2DTO A; 3TQ7 P; 4D8D A; 1M27 C; 5DY9 A; 5D6Y A; 4DOV A; 1JEG A; 4C92 B; 1WQW A; 2KXC A; 2COW A; 1NJI C; 3I55 Q; 1NEB A; 2V8K A; 5GAO l; 1D1C A; 3THK A; 6AT1 B; 2DA9 A; 1X27 A; 4E7K A; 2DIL A; 1PC0 A; 3MET A; 3CQT A; 4LDW A; 2RQV A; 2KAF A; 5C6S A; 1TUD A; 3CEY A; 1B07 A; 1PG5 B; 3HRS A; 5GAO q; 1ZSZ B; 5L8R E; 4JJC A; 2VB6 A; 2SEM A; 2RI2 A; 1FMV A; 3CME T; 2KDS A; 2FZK B; 1AWW A; 3N5B B; 3L2U A; 2B8A A; 3QYH B; 2DRM A; 3JCM X; 4J9H A; 3H8Z A; 4C92 C; 3EG1 A; 3GOX A; 2FYK A; 5I11 A; 5CKB A; 3MP1 A; 2LJ3 A; 3RUX A; 4J83 A; 1RAG B; 2DPP B; 1XOV A; 2J06 A; 4FYV B; 3CC7 A; 2LTO A; 4R55 A; 5GAM d; 4DEY A; 3CXC A; 4M7D G; 1ZSZ C; 1RL2 A; 1Q81 R; 1VQ4 A; 3MHX A; 1OPK A; 1X6B A; 2P0Q A; 4OB0 B; 3HKS A; 3OSS C; 1NPR A; 2OTL A; 3R6O A; 2QGF B; 2X3X D; 3I56 T; 2F2V A; 4C92 A; 1QMC A; 1I81 A; 4BUG A; 3J80 E; 1Y57 A; 1UJY A; 3DB3 A; 1D1A A; 2E41 A; 2QGG A; 1S72 A; 2FHD A; 4LD6 A; 1VQ7 Q; 4A4E A; 1FX7 A; 2DEU A; 1RLQ C; 1WZO A; 3GPL A; 4HKE A; 1ZSZ A; 4XTU A; 4PFO A; 3RNJ A; 2K57 A; 4E7H A; 1WNL A; 1S1N A; 4M77 F; 1NYG A; 1M1F A; 3MEA A; 4N4G A; 2HMA A; 1U1S A; 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