The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
106
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structure length |
106
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Chain Sequence |
SSPKRPYLLRAYYDWLVDNSFTPYLVVDATYLGVNVPVEYVKDGQIVLNLSASATGNLQLTNDFIQFNARFKGVSRELYIPMGAALAIYARENGDGVMFEPEEIYD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
De novo protein
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| molecule keywords |
Stringent starvation protein B homolog
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| publication title |
Specificity versus stability in computational protein design.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Haemophilus influenzae
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| total genus |
27
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| structure length |
106
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| sequence length |
106
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-25 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SspB-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1OUL A; 1ZSZ A; 2NYS A; 1OX8 A; 1OX9 A; 1OU9 A; 2QAZ A; 2QAS A; 1ZSZ C; 1TWB A; 1OU8 A; 1YFN A; 1ZSZ B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1M1F A; 1M90 R; 4KUD K; 4M77 E; 1TOV A; 5FRM A; 4LDU A; 1K73 R; 3G71 A; 2J6K A; 1HD3 A; 3INZ A; 4V2S A; 1NPR A; 1VQK A; 1K0X A; 4PK4 A; 5GAO r; 4HVV A; 4E47 A; 3QYH B; 1YIT A; 3OYF A; 2DTH A; 3KFV A; 2FG0 A; 5FU7 B; 1VQ7 A; 1U5S A; 1OEB A; 4N4H A; 4FYW B; 4CI0 C; 2CP0 A; 4OGE A; 4M7A A; 5FW9 A; 1RAA B; 2W0Z A; 2PQW A; 4M78 F; 4M7A G; 3BFM A; 1VQO T; 3RMS A; 1I4K 1; 5KH6 A; 3FJP A; 1U3O A; 3M0Q A; 2LCS A; 4C5E A; 4C8Q D; 2M9U A; 5GAM e; 4OMP A; 3J80 E; 3TVT A; 4PNO A; 2FB7 A; 3EG9 A; 2QDY B; 4HCZ A; 3HP9 A; 2R57 A; 5GAN g; 4JJN K; 2KK4 A; 1RI9 A; 1SRL A; 4AMC A; 3X20 B; 1K9M R; 3VV0 A; 1VQM T; 1R8O B; 4PJO F; 4Y92 A; 4TVR A; 3HHT B; 2Y4Y A; 3NTH A; 2RQU A; 2LZ6 B; 2V8I A; 4M78 D; 3M4G A; 2OTJ A; 5CK9 A; 3I56 A; 5FLX E; 1M2V B; 3DLM A; 1N8R C; 4LDX A; 1M1K U; 2DZ9 A; 1WGS A; 4JRQ A; 3CC2 Q; 4XTZ A; 3UA6 A; 3WVD B; 2HL3 A; 2M02 A; 2ZAE A; 2D0N A; 2NYS A; 1WHK A; 5GMK j; 2FRW A; 5GAN 5; 5CR2 A; 2L0A A; 4J83 A; 4X9D A; 4PJO D; 1D3B A; 1OUL A; 2QQA A; 2KXD A; 3LLR A; 3MEV A; 4C92 F; 3OYJ A; 3JB9 J; 1O9S A; 1XOV A; 2DKG A; 1I5O B; 3CPW P; 2DFU A; 5C0M A; 2E10 A; 1LJO A; 4M75 B; 3GP8 A; 3JB9 G; 1WIE A; 2LX7 A; 4DEY A; 5CCA A; 4KT0 E; 3M0R A; 4E7L A; 2ED1 A; 2GFA A; 4ESR A; 1ZSG A; 3I55 Q; 3HPW A; 3GIB A; 4BDZ A; 1NBE B; 1N8R R; 4J6X A; 2RM4 A; 1JXM A; 2SRC A; 4C92 D; 2O01 E; 5ECA A; 1RAG B; 4ZTJ A; 3CPW A; 3CMA T; 1SHF A; 2JN0 A; 4P5N A; 3CCJ T; 2XI9 A; 2KT1 A; 3V8L A; 5LL6 S; 2VYT A; 3EHR A; 2NUZ A; 4XU3 A; 1NZ9 A; 1X6O A; 2P0K A; 2HQE A; 1WI7 A; 2ROT A; 1MMA A; 2QDL A; 1QMC A; 1WLP B; 3M5A A; 3SDZ A; 3OYB A; 3CC4 A; 1Q81 R; 1Q82 U; 1QKW A; 3TSW A; 2E1H A; 3JV3 A; 5GAN 8; 2NUP B; 3UF4 A; 4OMO A; 1Y7X A; 2P84 A; 3M58 A; 4JS5 A; 3OS5 A; 1VIE A; 3P8B B; 4JPB W; 2QG9 B; 1M2V A; 1VQ8 A; 1UGS B; 2P4R A; 3D7S B; 2JUF A; 5IN1 A; 3O8V A; 2BIV A; 4JLI A; 1I81 A; 2CT3 A; 3KBG A; 4C8Q E; 1WXU A; 3RKX A; 3RUX A; 2FL7 A; 1VQ4 Q; 4JJC A; 4ME7 A; 3CC2 A; 2OTL T; 1X01 A; 3JCM W; 2EWN A; 2YLC A; 3V8J A; 2E70 A; 1YNZ A; 2ZGW A; 2ZPB B; 1KSW A; 1ZUY A; 4ELZ C; 1M2O A; 3LGL A; 1D0Z A; 5FRO A; 3M4Y A; 1W2B P; 1M27 C; 1BI3 A; 1KFZ A; 1Z9Q A; 2Z0W A; 1E7O A; 3M55 A; 1GCQ A; 5FWB A; 4CC4 B; 1YIJ A; 1M3C A; 2CT4 A; 1NYF A; 2ENM A; 2LJ1 A; 3I5S A; 4JUV A; 1VIF A; 4M75 A; 5CIU A; 3H0I A; 4M75 G; 1VQL T; 3JCM X; 1Q86 U; 2K3X A; 2RHU A; 4K11 A; 1W2B A; 3LWH A; 2AKL A; 3FDR A; 3UA7 A; 1Q95 G; 3QUI A; 5D6W A; 1QVG P; 2VGM A; 5IHI A; 3X25 B; 7AT1 B; 5GAN d; 5CKE A; 5GAO n; 4AFU C; 3LWI A; 1NLP C; 2GQV A; 3G7Z A; 3H6Z A; 1N27 A; 3VKI A; 1X2K A; 3PIP A; 2RI2 A; 3HKS A; 1TH7 A; 1ZX6 A; 2RHX A; 3SWN C; 2KMT A; 1LNX A; 2X4J A; 3E1S A; 2E5Q A; 2JOY A; 1W70 A; 2K3B A; 2RMO A; 3QDR B; 2R5M A; 2CP5 A; 2HD0 A; 5IHK A; 2YT6 A; 5GAN j; 2NUP A; 2RHY A; 4R55 A; 1VQM Q; 1PKT A; 3LH0 A; 3VS6 A; 1QVG A; 1OV3 A; 3PMI A; 1Y0M A; 4BAC A; 2XD0 A; 2LDM A; 1WNL A; 2VV5 A; 2ZPH B; 1Q7Y C; 1GCP A; 2M0O A; 3JB9 I; 2KRS A; 3RKW A; 3V8K A; 4ZN1 A; 2MIO A; 1IRE B; 2K2V A; 2IG0 A; 4PJL A; 1EFN A; 2AKK A; 2J7I A; 3ER0 A; 2ABL A; 1JJ2 P; 3CBO A; 2XU8 A; 1I8F A; 3SFM A; 2MF2 A; 2JZ2 A; 1YJ9 Q; 4AG1 C; 3OW2 S; 1X75 C; 3O5Z A; 5KCH A; 3NHN A; 1S72 A; 2X4W A; 4C0D C; 4FL6 A; 1OQK A; 2EIF A; 3A5Z B; 1OX9 A; 1ZSZ C; 2A37 A; 1YP5 A; 1YHQ Q; 9ATC B; 3G4S Q; 2RK1 A; 1YJW Q; 2YXY A; 2HZY A; 1KC8 U; 3OYM A; 3J81 E; 2OI3 A; 3G6E A; 4EDU A; 3CCL T; 2KRN A; 3EH1 A; 3AHU A; 2XKO C; 2EQJ A; 3KUF A; 2K5L A; 4A4E A; 2DAQ A; 4ELY C; 2VXE A; 4EPC A; 4XTX A; 4CC3 A; 1GBR A; 2YDL A; 1CKB A; 2DIQ A; 2M1H A; 3JCM g; 1Q7Y R; 3MCA B; 3DB4 A; 2XDP A; 4CRI A; 2IVW A; 5HK0 A; 2LNV A; 2C06 A; 1BI2 A; 1KK7 A; 2VVK A; 2L3Q A; 1X27 A; 2AZS A; 4Z88 A; 1JQQ A; 1C0M A; 3M0S A; 2O31 A; 3VUB A; 4KGV B; 1VYT A; 4FM4 B; 2DE0 X; 1AOJ A; 2E65 A; 2PVD B; 3X28 B; 3OY9 A; 1NYG A; 4HCK A; 4RTV A; 3CME Q; 3NFC A; 1NEG A; 3CCJ Q; 3CCM Q; 5KYW A; 1M1K C; 2HKQ B; 2BZ8 A; 2QGF B; 2RN8 A; 1ARK A; 3IQL A; 5M9O A; 3OMG A; 3MJX A; 2CUD A; 1X2Q A; 2DJQ A; 5DLQ E; 2RQV A; 3JCM Q; 2E4H A; 3JSC A; 2YUO A; 1TSF A; 1I1J A; 3HTR A; 3OMC A; 4J7F A; 1MV0 B; 2LNH B; 5I22 A; 1N6A A; 4RTX A; 3S6W A; 4ZGE B; 2V1Q A; 5GAM f; 3M0U A; 1RLQ C; 4KH1 B; 2PUO B; 1HXD A; 5KE3 A; 3C0C A; 4O6J A; 1LCK A; 2CRE A; 2F5K A; 1E6G A; 2KEA A; 1RAC B; 4M7D B; 5FWC A; 4BI3 A; 4Y91 A; 3I9Q A; 1I5L A; 1ACM B; 1D0X A; 1GXI E; 4RG2 A; 4BE1 A; 3CCR T; 2DA9 A; 2KBT A; 3UT1 A; 1YJ9 A; 3EFO B; 2RO0 A; 2HCK A; 2JS0 A; 3BE3 A; 1RUW A; 2HMA A; 2QQB A; 3M59 A; 3OYY A; 3H0H A; 4B9X A; 1AEY A; 4M7A F; 3CCE A; 1PKS A; 1YHQ A; 1IHW A; 4M77 B; 3G4S A; 4F7U E; 1YJW A; 1JU5 C; 2NWM A; 1UE9 A; 1MMN A; 2WSE E; 1X69 A; 1JBM A; 4J5Y A; 4FYV B; 4ZGJ B; 1VQL Q; 2HL5 C; 2QTX A; 2JNG A; 3EH2 A; 3V7S A; 4DBH A; 1ABO A; 1IHV A; 3N5B B; 2XMF A; 2BE9 B; 5HCK A; 2EGE A; 2ZZD A; 4RTZ A; 2FZK B; 2E3H A; 1M5Q 1; 1NM7 A; 2VAS A; 4QVD A; 3PMT A; 3JCM P; 3OYD A; 1VYV A; 2ROL A; 4M78 C; 1PD0 A; 1VQ6 T; 4M7A D; 1OZ3 A; 4LE9 A; 1DJ7 B; 3JB9 H; 2O9S A; 2K5F A; 1WJR A; 1VQ9 A; 5GAN 6; 2OJ2 A; 3CCM A; 2K57 A; 1VQ5 T; 1B3Q A; 4QQ6 A; 3PNW C; 4HCB A; 1G2B A; 2E64 A; 4N0A C; 3NTK A; 2RD1 A; 3P8D A; 3EG3 A; 4PJO C; 2B8A A; 3CEY A; 1GRI A; 1BIB A; 1IO6 A; 3EFS A; 1RAF B; 1EX4 A; 5CO7 A; 1VOM A; 2QA4 Q; 2FPE A; 4RKU E; 1Y57 A; 2IIM A; 1I0C A; 2KGT A; 3QZ5 B; 4M7D A; 1QCN A; 2G6F X; 1K8A U; 2DD4 A; 2PU9 B; 5C6S A; 2F2X A; 1Q86 C; 1G3T A; 1UEB A; 4A4G A; 5KYX B; 4NS5 A; 2KNB B; 2LT1 A; 3EGD A; 3EFO A; 3OYH A; 3CCV Q; 2JTF A; 1QWF A; 4KUI A; 4A4K A; 1AT1 B; 2PNI A; 2L3S A; 1SPK A; 4C92 C; 2CH4 W; 1UDL A; 4D8K A; 3MET A; 4M77 A; 3CCL Q; 4M77 G; 1NJI C; 2FO0 A; 1M4Z A; 3JCM d; 3FRN A; 2FYK A; 1YCY A; 2L5Q A; 5KE2 A; 4CC7 A; 3OB9 A; 1FYN A; 3V7R A; 1NG2 A; 3JB9 D; 4NL3 A; 4ZTF A; 1IGU A; 3L2V A; 5LJ5 h; 3KXT A; 3MHX A; 1OPL A; 2MOX A; 3NPF A; 1TG0 A; 4FU6 A; 1K9A A; 4OF1 A; 4XTU A; 3DLL A; 4MDX A; 1KQS S; 2CP6 A; 4L6V 5; 4PLI A; 3OBY A; 3BY7 A; 2CZ6 B; 2B86 A; 3QJ6 A; 5FU6 C; 4FW1 A; 2XHC A; 3TEE A; 1ZUU A; 2JJ9 A; 1VQP T; 2MWO A; 3RMQ A; 2MPX C; 2RQR A; 2H3E B; 2LCL A; 4J6W A; 4A53 A; 3GNG A; 2LJ3 A; 3MEA A; 3QXE B; 3FIF A; 1NJI R; 1H3Z A; 2DM1 A; 3GNF B; 4O5V A; 4EMK B; 3L2Q A; 1TTH B; 1QCF A; 1R0B G; 1UEC A; 2CSI A; 4AFZ C; 4A4H A; 4PFP A; 2DVE A; 1U8R A; 3UDC A; 1D1A A; 1ZBJ A; 2NUT A; 3CD6 T; 2ZCF B; 1K1Z A; 3E19 A; 2QA4 A; 4MMK A; 5GJW B; 3CCU Q; 2VWF A; 1LPL A; 3RR6 A; 4C8Q B; 4QT7 A; 3EG2 A; 4M75 F; 2V26 A; 1G3Y A; 2F69 A; 2A0F B; 2YRD A; 4ZN3 A; 1TUG B; 3U23 A; 1SSF A; 3OYK A; 3CCR Q; 2R58 A; 2YSQ A; 5KYY B; 2ZPE B; 4PL6 A; 2K4Y A; 1CKA A; 4IUT A; 3F70 A; 1VQN A; 3CCV A; 3GF5 A; 2HQH A; 2LT4 A; 4XK8 E; 3ZBD A; 4F04 B; 3CCS T; 4N4I A; 3A1P A; 3EGU A; 3QDF A; 1WHM A; 4J9B A; 4LXC A; 4N4G A; 3L2U A; 1UB4 A; 2X3W D; 4HVW A; 2F5T X; 2EYY A; 1IXD A; 1U1S A; 1KD1 U; 5CVI A; 2HBW A; 3S3N A; 4M75 D; 4QQG A; 2EYW A; 2JM9 A; 2HBP A; 5GMK m; 3CCE T; 2RI5 A; 2X3X D; 5LJ3 e; 3CC7 T; 1MHN A; 1RLP C; 2YUP A; 1M3B A; 5I2M A; 3M9Q A; 3R6N A; 2AZV A; 1VQ6 Q; 3TSZ A; 2DZC A; 4UC4 A; 4MDW A; 2I2L A; 1W4S A; 4J9G A; 2L3P A; 2LJ0 A; 3OYN A; 1YI2 T; 1H64 1; 2LRQ A; 1JRI A; 2BTT A; 3CCQ T; 5LJ5 f; 2LCC A; 1VQ5 Q; 2QQ9 A; 1H3H A; 2BKD N; 2RPN A; 4XU2 A; 2D1X A; 5EC7 A; 1SG5 A; 4FSS A; 4EMK A; 3ASK A; 3L42 A; 3QYG B; 2YHT A; 3S3M A; 2BE7 D; 3REB B; 1D1C A; 2OAW A; 3NGP A; 4C0Z A; 1VQ9 T; 1U06 A; 3G1J A; 5I21 A; 1D0Y A; 1WA7 A; 4VUB A; 1XQH A; 3ZFJ A; 2Y4X A; 3A8H B; 3HRS A; 1WJQ A; 1YN8 A; 4KGZ B; 2SEM A; 2CZ0 B; 1W6X A; 4X9C A; 1M8M A; 2ATC B; 2EBP A; 2MYS A; 5GAN 4; 1VUB A; 2BZY A; 5KYY A; 1MMD A; 1B07 A; 4HT8 A; 4J9F A; 1H8K A; 1BKB A; 4PLL A; 2X4Y A; 2A08 A; 4C0F A; 3FEO A; 3VS1 A; 4QVC A; 2JVV A; 3R6O A; 2QGG A; 3LGF A; 1TS9 A; 4Y28 E; 1XJW B; 1BI1 A; 1AHJ B; 2HSP A; 3JCM e; 2EQU A; 4LNP A; 1MV3 A; 4J8O A; 4BE0 A; 3GBQ A; 4L59 A; 2L3R A; 1WZO A; 1Z9Z A; 2DBK A; 5FU6 B; 3MO8 A; 3TQ7 P; 4M78 E; 3A8L B; 1M90 U; 1LOJ A; 4XTW A; 2HNI A; 3JAM E; 4C0G A; 4E7H A; 1K73 U; 4AFS C; 2LMJ A; 2QEX T; 1YJN T; 4LUE A; 2Y90 A; 3C4S A; 3OA6 A; 2J06 A; 2LX9 A; 2X51 A; 2EKH A; 5GAN 3; 2DXC A; 3I55 A; 3QBY A; 4LD6 A; 3WVE B; 1AVZ C; 3G71 T; 4PJO E; 1VQO Q; 2AHJ B; 3PE0 A; 4GLK A; 3L2Z A; 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3X24 B; 2CP3 A; 3CMA Q; 2A7Y A; 2HAX A; 1WQW A; 1QVF S; 2OAU A; 2GBQ A; 1PD1 A; 2MI6 A; 2AT1 B; 3LW5 E; 4PJM A; 1OU8 A; 1PG5 B; 3VS0 A; 1SEM A; 3J7A F; 2BUD A; 3QSU A; 1V76 A; 2JM8 A; 1AD5 A; 4M77 F; 2CS7 A; 3H0F A; 1Q81 U; 1RAI B; 1VQM A; 1U1T A; 4DQ2 A; 4IUR A; 4KRT A; 2G3R A; 4XTY A; 1PC0 A; 1AZE A; 1AZG B; 2DVJ A; 1GFC A; 4FT4 A; 5A2Q E; 1WDX A; 1UTI A; 3CC4 T; 4J9H A; 2YUN A; 3SHW A; 5FU7 C; 2ECZ A; 2CKK A; 2JMC A; 2OTL Q; 4OP0 A; 3FJ5 A; 1VQ8 T; 4F7U A; 1PM3 A; 5GAM j; 2GFU A; 4WCI A; 2DL7 A; 4F7U G; 4M77 D; 5A0L A; 1BIA A; 1M1K R; 3RBB B; 4NOY A; 3UPU A; 1EIF A; 1OYX A; 1MND A; 3CC2 T; 1FXX A; 1Y07 A; 1TUD A; 2K7A A; 2DL4 A; 1I07 A; 1IZ6 A; 4CC2 A; 2CZ7 B; 4RMO A; 1N9R A; 1ZHI A; 2E12 A; 4JJD A; 4E7I A; 3SWN B; 3VRZ A; 1E6H A; 2YRC A; 5AYF A; 2GTO A; 4D6W A; 1Q82 C; 2LQW A; 3M56 A; 2A28 A; 1G3W A; 2KT8 A; 4B9W A; 2V8J A; 2KAF A; 3OYE A; 2RH2 A; 3G71 Q; 1QWE A; 5GAN e; 1YIJ T; 2FZC B; 2EYQ A; 2LC4 A; 2DRK A; 1VQK Q; 2EJG A; 5IT9 E; 4E6R A; 1T0H A; 2DD5 A; 2GQI A; 1YIT Q; 3JCM J; 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